Fonction et régulation de la protéine ICAP-1alpha dans la ...
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tel-00435843, version 1 - 24 Nov 2009 II. L’action négative de la protéine ICAP-1α sur la fonction adhésive de l’intégrine β1 implique une voie de signalisation dépendante de la kinase CaMKII 86 II.1. Introduction 86 II.1.1. Régulation de l’adhérence cellulaire par le calcium 86 II.1.2. La CaMKII : structure et activation 87 II.1.3. La CaMKII dans l’adhérence des cellules dépendante des intégrines 89 II.1.4. L’activité régulatrice de la CaMKII sur l’adhérence cellulaire requiert ICAP-1α 91 II.2. Résultats 92 II.2.1. La CaMKII régule négativement Les adhérences focales à intégrine β1 selon une voie dépendante de la protéine ICAP-1α 92 II.2.2. L’action négative de la CaMKII sur la croissance des adhérences focales à intégrine β1 requiert la phosphorylation d’ICAP-1α 94 II.2.3. L’interaction d’ICAP-1α sur β1 requiert sa phosphorylation sur la thréonine 38 et est requise pour l’action négative de la CaMKII sur les adhérences focales 96 II.2.4. La CaMKII régule négativement l’état d’affinité de l’intégrine β1 de façon similaire à ICAP-1α 98 II.2.5. La CaMKII régule négativement la dynamique des adhérences focales selon une voie dépendante de la phosphorylation d’ICAP-1α et de l’interaction d’ICAP-1α avec l’intégrine β1 100 II.3. Discussion 102 DISCUSSION GENERALE ET PERSPECTIVES 105 I. Discussion générale 106 II. Perspectives 108 MATERIEL ET METHODES 111 I. Matériels 112 I.1. Protéines, réactifs et anticorps 112 I.1.1. Protéines 112 I.1.2. Réactifs et anticorps 112 I.2. Bactéries 113 I.3. Lignées cellulaires 113 I.4. ADN plasmidiques 114 II. Méthodes 114 II.1. Technique de biologie moléculaire 114 II.1.1. Mutagénèse dirigée par PCR II.2. Génération de cultures primaires de fibroblastes embryonnaires murins Icap-1 114 -/- et Icap-1 +/+ II.2.1. Isolements des cultures primaires 115 II.2.2. Génotypage 115 II.2.2.1. Extraction de l’ADN génomique à partir des sacs vitellins 115 II.2.2.2. PCR génomique 115 II.3. Techniques de biologie cellulaire 115 II.3.1. Tranfection et infection rétrovirale 115 II.3.2. Immunofluorescence 116 115
tel-00435843, version 1 - 24 Nov 2009 II.3.3. Test d’adhérence cellulaire 116 II.3.4. Test de migration cellulaire 117 II.3.4.1. En chambres de Boyden modifiées 117 II.3.4.2. Par vidéomicroscopie 117 II.3.5. Mesure de l’affinité des récepteurs à la fibronectine et mesure de l’expression de surface en intégrines β1 et β3 par une analyse au FACS 118 II.3.6. Test de contractilité cellulaire sur gel de silicone déformable 118 II.3.7. Désassemblage des adhérences focales par un test au nocodazole 118 II.3.8. Caractérisation de la fonction de la CaMKII dans l’adhérence cellulaire 119 II.4. Microscopie et analyse quantitative 119 II.4.1. Technique de FRAP 119 II.4.2. Etude quantitative de la dynamique des adhérences focales 120 II.4.3. Mesure de la morphométrie des adhérences focales 120 II.5. Techniques de biochimie 121 II.5.1. Test de l’interaction ICAP-1α/intégrine β1 sur résine 121 II.5.2. Western-blot 121 II.5.3. Déplétion de la fibronectine du sérum de veau fœtal 122 II.5.4. Purification de la fibronectine bovine 122 II.5.5. Purification de la vitronectine bovine 122 BIBLIOGRAPHIE 125
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II. L’action négative <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>protéine</strong> <strong>ICAP</strong>-1α sur <strong>la</strong> fonction adhésive <strong>de</strong> l’intégrine β1<br />
implique une voie <strong>de</strong> signalisation dépendante <strong>de</strong> <strong>la</strong> kinase CaMKII 86<br />
II.1. Introduction 86<br />
II.1.1. Régu<strong>la</strong>tion <strong>de</strong> l’adhérence cellu<strong>la</strong>ire par le calcium 86<br />
II.1.2. La CaMKII : structure <strong>et</strong> activation 87<br />
II.1.3. La CaMKII <strong>dans</strong> l’adhérence <strong>de</strong>s cellules dépendante <strong>de</strong>s intégrines 89<br />
II.1.4. L’activité régu<strong>la</strong>trice <strong>de</strong> <strong>la</strong> CaMKII sur l’adhérence cellu<strong>la</strong>ire requiert <strong>ICAP</strong>-1α 91<br />
II.2. Résultats 92<br />
II.2.1. La CaMKII régule négativement Les adhérences focales à intégrine β1 selon<br />
une voie dépendante <strong>de</strong> <strong>la</strong> <strong>protéine</strong> <strong>ICAP</strong>-1α 92<br />
II.2.2. L’action négative <strong>de</strong> <strong>la</strong> CaMKII sur <strong>la</strong> croissance <strong>de</strong>s adhérences focales à<br />
intégrine β1 requiert <strong>la</strong> phosphory<strong>la</strong>tion d’<strong>ICAP</strong>-1α 94<br />
II.2.3. L’interaction d’<strong>ICAP</strong>-1α sur β1 requiert sa phosphory<strong>la</strong>tion sur <strong>la</strong> thréonine 38<br />
<strong>et</strong> est requise pour l’action négative <strong>de</strong> <strong>la</strong> CaMKII sur les adhérences focales 96<br />
II.2.4. La CaMKII régule négativement l’état d’affinité <strong>de</strong> l’intégrine β1 <strong>de</strong> façon<br />
simi<strong>la</strong>ire à <strong>ICAP</strong>-1α 98<br />
II.2.5. La CaMKII régule négativement <strong>la</strong> dynamique <strong>de</strong>s adhérences focales selon une<br />
voie dépendante <strong>de</strong> <strong>la</strong> phosphory<strong>la</strong>tion d’<strong>ICAP</strong>-1α <strong>et</strong> <strong>de</strong> l’interaction d’<strong>ICAP</strong>-1α avec<br />
l’intégrine β1 100<br />
II.3. Discussion 102<br />
DISCUSSION GENERALE ET PERSPECTIVES 105<br />
I. Discussion générale 106<br />
II. Perspectives 108<br />
MATERIEL ET METHODES 111<br />
I. Matériels 112<br />
I.1. Protéines, réactifs <strong>et</strong> anticorps 112<br />
I.1.1. Protéines 112<br />
I.1.2. Réactifs <strong>et</strong> anticorps 112<br />
I.2. Bactéries 113<br />
I.3. Lignées cellu<strong>la</strong>ires 113<br />
I.4. ADN p<strong>la</strong>smidiques 114<br />
II. Métho<strong>de</strong>s 114<br />
II.1. Technique <strong>de</strong> biologie molécu<strong>la</strong>ire 114<br />
II.1.1. Mutagénèse dirigée par PCR<br />
II.2. Génération <strong>de</strong> cultures primaires <strong>de</strong> fibrob<strong>la</strong>stes embryonnaires murins Icap-1<br />
114<br />
-/- <strong>et</strong><br />
Icap-1 +/+<br />
II.2.1. Isolements <strong>de</strong>s cultures primaires 115<br />
II.2.2. Génotypage 115<br />
II.2.2.1. Extraction <strong>de</strong> l’ADN génomique à partir <strong>de</strong>s sacs vitellins 115<br />
II.2.2.2. PCR génomique 115<br />
II.3. Techniques <strong>de</strong> biologie cellu<strong>la</strong>ire 115<br />
II.3.1. Tranfection <strong>et</strong> infection rétrovirale 115<br />
II.3.2. Immunofluorescence 116<br />
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