Manuel Qualité Plateforme Transcriptomique - URGV - Inra
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<strong>Manuel</strong> Qualité<br />
<strong>Plateforme</strong> <strong>Transcriptomique</strong><br />
Selon la norme ISO 9001 version 2008<br />
14 décembre 2011<br />
Contact :<br />
Equipe Génomique Fonctionnelle d’Arabidopsis<br />
<strong>Plateforme</strong> Analyse Du Transcriptome<br />
Sandrine Balzergue<br />
Unité de Recherche en Génomique Végétale (<strong>URGV</strong>)<br />
2 rue Gaston Crémieux<br />
CP 5708<br />
91057 Evry cedex<br />
FRANCE<br />
Tel: +33 1 60 87 45 28<br />
balzerg@evry.inra.fr<br />
http://www.versailles.inra.fr/urgv/microarray.htm
La plateforme <strong>Transcriptomique</strong>, créée en 2003, réalise des<br />
projets d’étude du transcriptome en collaboration avec des<br />
équipes de recherche. Notre mission est de mettre à la<br />
disposition de la communauté scientifique le savoir-faire et<br />
l’expertise d’une équipe pluridisciplinaire pour réaliser les<br />
expériences et analyser les résultats produits.<br />
Des milliers de données sont accessibles via la base de données<br />
publique CATdb. Le transfert de données est facilité vers la base<br />
de données internationale GEO.<br />
Notre Equipe<br />
Sandrine Balzergue / Etienne Delannoy<br />
CATMA v5 & v6<br />
Ludivine Soubigou-Taconnat<br />
Stéphanie Pateyron (mi-temps)<br />
Affymetrix<br />
Stéphanie Huguet<br />
José Caïus (mi-temps)<br />
+ 2 CDD en moyenne / an<br />
RNA seq<br />
Nous développons actuellement notre expertise<br />
dans l’analyse transcriptomique par séquençage<br />
à haut débit sur séquenceurs Illumina<br />
Roche-NimbleGen<br />
- Tiling array Arabidopsis<br />
- Puces à façon plantes cultivées<br />
En moyenne (CATMA et Affymetrix)<br />
800 hybridations / an<br />
50 projets / an<br />
11 publications / an, IF moyen de 5.<br />
La caractérisation et la quantification des différents transcrits d’ un organisme ou d’un tissu donné, dans des<br />
conditions déterminées, permettent d'identifier les gènes actifs, de caractériser les mécanismes de régulation<br />
d'expression des gènes, de définir ces réseaux ou de découvrir de nouveaux gènes. Selon votre question biologique,<br />
nous vous conseillerons au mieux sur la solution technologique la plus pertinente pour y répondre.
Accès à la plateforme<br />
•Mise à disposition d’équipement : accès environné ou non<br />
•Projets en collaboration (à financement propre au laboratoire)<br />
•Projets en partenariat (ANR, Région, Européen, etc.)<br />
•Formations des étudiants (écoles doctorales, master Pro et<br />
Recherche, écoles d’ingénieurs, universités)<br />
Nos Technologies<br />
•CATMA (Complete Arabidopsis Transcriptome MicroArray)<br />
•Affymetrix (plantes cultivées)<br />
•NimbleGen (plantes cultivées (puces à façon) et Arabidopsis)<br />
•RNA seq (en développement)<br />
Le déroulement de votre projet<br />
•Expertise de votre projet transcriptome<br />
•Conceptiond’oligos pour les puces NimbleGen à façon<br />
•Contrôle qualité et quantification des ARN<br />
•Marquage des ARN<br />
•Hybridation, acquisition des résultats bruts<br />
•Analyses statistiques des résultats<br />
•Soumission dans 2 bases de données<br />
•Formation des utilisateurs sur demande<br />
Afin de garantir le niveau de qualité des analyses transcriptomes, la<br />
plateforme a mis en place un Système de Management de la Qualité<br />
selon l'intégralité des exigences de la norme ISO9001:2008.
Domaine d’application<br />
Le système de management de la qualité s’applique à toutes les activités de la plateforme transcriptome.<br />
Il concerne les 4 technologies proposées sur la plateforme.<br />
Nos atouts<br />
Aide à l’élaboration des projets<br />
Analyses statistiques des résultats<br />
Aide à l’interprétation des données<br />
Aide à la rédaction d’articles (M&M, figures …)<br />
Prise en charge des soumissions dans les bases de données<br />
Support Statistique<br />
Support bioinformatique<br />
Veille technologique<br />
Possibilité d’accueil des collaborateurs<br />
La qualité technique de nos prestations<br />
Nos engagements<br />
L’amélioration de la communication avec nos clients<br />
La capacité d’offrir une solution complète de l’élaboration<br />
des projets aux résultats analysés statistiquement
Mesure de la satisfaction clients<br />
Réalisée grâce à des études de satisfaction<br />
ciblées et périodiques. L’écoute client s’appuie<br />
également sur les échanges, les discussions et<br />
les rencontres notamment dans le cadre du<br />
suivi des projets et également lors des journées<br />
utilisateurs.<br />
Revue de direction<br />
Réagir<br />
Planifier<br />
Maîtrise de la documentation<br />
Le système management qualité s'appuie sur la<br />
traçabilité documentaire. Tous les documents<br />
du SMQ suivent les règles de création,<br />
d'approbation, de mise à jour et de diffusion<br />
définies dans la procédure PRO-01 de<br />
Gestion documentaire nous permettant de<br />
garantir la disponibilité des bons documents au<br />
bon endroit.<br />
Planification générale<br />
Réunions<br />
Journées des utilisateurs<br />
Métrologie<br />
Audits<br />
Revues de direction<br />
L’évaluation périodique du<br />
système de management de la<br />
qualité par l’équipe de direction<br />
Vérifier Faire<br />
Envoie des enquêtes<br />
permet de s’assurer qu’il demeure<br />
pertinent, adéquat et efficace.<br />
Les 6 procédures exigées par la norme ISO 9001.<br />
Audits internes<br />
Le suivi et l’amélioration du système de<br />
management de la qualité de la plateforme sont<br />
assurés par la réalisation régulière d’audits<br />
qualité internes selon la procédure PRO-03<br />
de gestion d’audit interne.<br />
Non Conformités<br />
La détection d’un dysfonctionnement ou d’un incident (avéré ou potentiel) est gérée selon la procédure<br />
PRO-02 de gestion des anomalies et des actions préventives et correctives.<br />
Maîtrise des enregistrements<br />
Le tableau Inventaire des Enregistrements définit les modes d’identification, d’utilisation,<br />
de classement et d’archivage des enregistrements de la plateforme.<br />
Hygiène et Sécurité<br />
Gestion des compétences<br />
Le tableau de Suivi des compétences permet de connaître et d'optimiser les<br />
compétences disponibles sur la plateforme.<br />
Tout nouvel arrivant reçoit une formation en matière d’hygiène et de sécurité dispensé par notre Agent Chargé de la Prévention. La<br />
plateforme et ses infrastructures dépendent du bâtiment d'accueil et de ses tutelles : le règlement intérieur et les procédures y sont<br />
donc appliqués. L’évaluation des risques est retranscrite dans le document de l’Outils de Pilotage de la Prévention à l’INRA.
Notre équipe<br />
De gauche à droite et de bas en haut:<br />
•Claire Lurin<br />
Responsable équipe,<br />
Directrice de recherche<br />
•Delphine Gey *<br />
CDD Ingénieur<br />
•Etienne Delannoy<br />
Chercheur,<br />
Responsable Scientifique<br />
•Stephanie Huguet<br />
Technicienne<br />
•Eddy Blondet *<br />
CDD Ingénieur<br />
•Sandrine Arribat *<br />
CDD Ingénieur<br />
•Stephanie Pateyron<br />
Technicienne (mi-temps)<br />
•Ludivine Soubigou<br />
Assistant ingénieur - RMQ<br />
•Sandrine Balzergue<br />
Responsible technique et<br />
projets, Ingénieur<br />
•José Caius<br />
Adjoint technique (mi-temps)<br />
* membres ayant quittés la plateforme en 2011