ANATOMIE CYTOLOGIE PATHOLOGIQUES - AFAQAP

ANATOMIE CYTOLOGIE PATHOLOGIQUES
pièces opératoires (organe complet ou partie) sont fixées, disséquées, décrites, mesurées,
échantillonnées selon des protocoles spécifiques (étape médicale importante de la macroscopie).
Les fragments de tissus sont transformés par des manipulations longues (de plusieurs heures ou
plusieurs jours), aboutissent à la création de blocs en paraffine dans lesquels les tissus sont inclus.
On en produit ensuite des coupes microscopiques sur lames qui sont alors colorées, et prêtes à
être observées au microscope.
Certains examens sont simples d'autres très complexes, nécessitent le recours à des protocoles et
techniques sophistiqués. Les examens réceptionnés par une structure sont de fait hétérogènes en
contrainte, typologie et objectif de délais. Il y a peu ou pas d’automatisation de la prise en charge.
Des automates remplacent les gestes du technicien à quelques étapes du processus. Les
organisations médicales et techniques sont intriquées, raisonnées, adaptées et contrôlées par le ou
les médecins responsables de la structure (projet médical).
Techniques complémentaires
Lors de l’examen microscopique, le médecin pathologiste peut compléter son examen par la
demande de préparations supplémentaires, dites techniques spéciales, qui reposent sur des
principes de chimie, histochimie, histoenzymologie, immunohistochimie, cytogénétique et biologie
moléculaire, selon des protocoles validés et contrôlés.
L’indication et la réalisation de ces techniques sont sous l’autorité du pathologiste ; elles sont utiles
pour identifier la présence ou non de certains éléments in situ (dépôts, corps étrangers, constituants
chimiques, protéines, agents infectieux, protéines cytoplasmiques, nucléaires ou membranaires).
La visualisation est possible par marquage fluorescent ou chromogénique, après réactions
immunologiques, chimiques ou d’hybridation.
Les examens moléculaires
L’identification de molécules dans les tissus et les cellules est le prolongement naturel de
l’histologie et de la cytologie classiques. Ce mouvement a débuté il y a une quarantaine d’années
en néphro-pathologie avec l’immunofluorescence sur coupes histologiques en congélation ; il a pris
depuis les années 90 un essor considérable avec l’immuno-peroxydase sur coupes histologiques
en paraffine pour affiner les diagnostics en pathologie tumorale ou infectieuse, puis s’est élargi ces
dix dernières années aux techniques de biologie moléculaire sur extraits cellulaires ou tissulaires.
Tous ces examens se sont déployés dans le domaine du soin de manière courante et journalière, et
bien entendu, dans celui plus restreint des activités de recherche et de développement.
Les cibles sont les protéines, les acides nucléiques (ADN et ARN) et les métabolites aux moyens
d’outils variés comme l’immunohistochimie (IHC), l’immuno-cytochimie (ICC), l’hybridation in situ
(par méthodes FISH, SISH ou CISH) qui sont toutes des techniques morphologiques, ou comme la
PCR, la RT-PCR, les puces pour analyses ARN à haut débit, les techniques de spectrométries, etc.,
non morphologiques.
Système de gestion de laboratoire
Toutes les étapes du parcours de réalisation d’un examen sont gérées, du début de la filière à la
création du compte rendu, par les systèmes de gestion de laboratoire (SGL) spécifiques à la
spécialité, qui sont aussi le support de l’archivage et du dossier patient ACP. Le SGL est l’ossature
du fonctionnement et sert d’archivage des dossiers patients, des comptes rendus et de la trace des
actions techniques, ainsi que du répertoire des inventaires de lames et blocs.
Des images numériques peuvent être acquises lors de la macroscopie ou des étapes ultérieures de
microscopie ; elles sont indexées et sauvegardées dans le SGL ou dans un système en lien, dit
Système de Gestion d’Image.
Le compte-rendu d’examen ACP
Les éléments clés de l’observation sont décrits et reportés dans un compte-rendu textuel : critères
séméiologiques, macroscopiques ou microscopiques, quel que soit le support d’observation (lames
objet ou image) ; les synthèses syndromique et lésionnelle sont la base du diagnostic ou non de
maladie, auxquels seront adjoints et intégrés les constatations et résultats des techniques
complémentaires utiles et nécessaires.
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15/04/2012