La métabolomique, outil de génomique fonctionnelle ... - Biogenouest

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La métabolomique,
outil de génomique g
fonctionnelle et de
phénotypage
pour traiter des relations plante /
environnement et de la résistance r
aux stress
Alain Bouchereau,
Institut de Génétique, Environnement
et Protection des Plantes,
UMR 1349, Rennes-Le Rheu

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La
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Plan :
La métabolomique
: outil de génomique g
fonctionnelle et de phénotypage
pour traiter
des relations plante/environnement et de la
résistance aux stress
• 1. La métabolomique à l’échelle de « l’ome »
Définitions, concepts, méthodologies, performances,…
• 2. La métabolomique au chevet de la plante
Relations plante/environnement, résistance aux stress
• 3. Exemples de métabolomique comparative
Bases métaboliques et biomarqueurs de tolérance
• 4. Métabotypage et métabolomique fonctionnelle
Déterminants génétiques et moléculaires de la résistance

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
Définition de Fiehn et al. (Nat. Biotechnol., 18, 1157-61 (2000))
Identification et quantification exhaustives et non sélectives de tous les
métabolites d’un système biologique
La Métabolomique
Synonymes
Metabonomique, Profilage métabolomique,
Profilage métabolique
Définition
La science de l’analyse intégrative et
fonctionnelle du phénotype métabolique
d’un système biologique
L’analyse du métabolome
< 1500 Da
1000 – 200000
métabolites primaires et secondaires
Amplitudes extrèmes de concentrations
Grande diversité de propriétés physico-chimiques
Adapté d’après Kopka et al., 2004

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ...seul le sommet de l‘iceberg est accessible“
Métabolome de levure (560 métabolites)
Adapté d’après Kopka et al., 2004
Règne végétal : entre 50 000 et 200 000 métabolites

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ...un compromis analytique entre qualité et profondeur“
Métabolomique
Empreinte métabolique
Profilage métabolique
Analyse ciblée
Métabolite unique
Trethewey, 2004

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OSiOSiSiSi
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(qt_ms ri_id_eigtms 102) EIRO E_150002-101-9_METB_1500.54_Ery thritol (4TMS)
133
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163
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217
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293
307
320
Design
expérimental,
échantillonnage
1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ...la métabolomique, pas une technique, une démarche analytique et
chimiométrique“
Acquisition des
données, analyse
Epuration,
Traitement des
données
Analyses
statistiques
Visualisation,
interprétation
biologique
Hagel and Facchini, 2008

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ...à chaque étape, des choix, des outils, des difficultés et des besoins
de développement “
Bhalla et al., 2005
Bino et al., 2004
ArMet

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ...la métabolomique, une orientation à définir, une finalité à prévoir“
Health sciences
Nutritional sciences
Food science
Microbiology
Animal, plant production
Biotechnology
System biology
Environmental sciences
Cevallos-Cevallos et al., 2009
Samples sorting
Screening
Phenotyping
Diagnostic - Prevention
Quality testing
Control
Functional analysis
Post-genomics
Physiology
Analytical
objective
Scope of
application

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ... pas une, mais des plateformes analytiques dédiées à la métabolomique“
Dunn and Ellis, 2004

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ... la performance dans le couplage“
Last et al., 2005
„ ... avec des configurations diversifiées
en GC ou LC/MS “

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ... la performance dans le couplage, adaptable à du haut débit“
Fruits de tomate
Feuilles d’Arabidopsis
Fraise
180 RILs d’Arabidopsis thaliana
5780 ions
Profilage par LC-QTof MS
α-tomatine
Glucoiberine
Rutine
De Vos et al., 2007

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ... la performance dans le bidimensionnel à partir d‘extraits bruts “
Spectroscopie de RMN,
HSQC ( 1 H/ 13 C)
Kim et al., 2011

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ... des moyens bioinformatiques de plus en plus puissants pour
traiter l‘information initiale “
Fiehn et al., 2011

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1. La métabolomique
à l’échelle de « l’ome
»
„ ... après traitement des données
brutes, une analyse statistique adaptée “

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... la démarche de métabolomique mise au
service de la plante et de sa biologie “
Roessner and Bowne ., 2009
Finalités s multiples :
- fonctionnement, évolution, adaptation des organismes photosynthétiques
- sélection, amélioration génétique ( productions alimentaires et non alimentaires)
- biotechnologies, ingenierie métabolique, chimie verte, OGM, biologie synthétique
- biodiversité, écologie, protection, rémédiation

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... une énorme diversité
phytochimique “
dérivée des métabolismes
primaires et secondaires
Métabolisme secondaire
d’Arabidopsis thaliana
Matsuda et al., 2010

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
Kooke and Keurentjes, 2012
„ ... une grande flexibilité
métabolique “
Sous contrôle :
• génétique,
• développemental
• spatial
• environnemental

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... des variations au rhythme circadien“
Lugan et al., 2010
Evolutions
nycthémérales
des teneurs en
métabolites
primaires dans
des feuilles
d’Arabidopsis
thaliana

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... des variations au gré des organes et des tissus
et de leur âge“
Jeune feuille / Limbe
“Pétiole” / Limbe
Lugan et al., 2010
Succinate Succinate
Malate
Diaminoprop Diaminopropane
Fumarate Fumarate
Mannose
[Ascorbate] [Ascorbate]
Saccharose Saccharose
Citrate
Glycerate Glycerate
Beta-Alanine Beta-Alanine
Glycine
Glutamate Glutamate
Aspartate Aspartate
Ornithine
Ammonium Ammonium
Serine
Alpha-Alanine
Methionine Methionine
Threonine Threonine
Galactinol Galactinol
Phenylalanin Phenylalanine
Valine
Isoleucine Isoleucine
Leucine
Raffinose Raffinose
Agmatine Agmatine
Histidine
Tryptophane Tryptophane
Quinate
Myoinositol Myoinositol
Tyrosine
Maltose
Phenethyla Phenethylamine
Putrescine Putrescine
Tyramine Tyramine
Spermidine Spermidine
Spermine Spermine
Lactose
Tryptamine Tryptamine
Fructose
Galactose Galactose
Proline
Trehalose Trehalose
GABA
Glucose
Cadaverine Cadaverine
Asparagine Asparagine
Glutamine Glutamine
Arginine Arginine
[Sorbitol] [Sorbitol]
Melibiose Melibiose
Lysine
-2.0 -1.0 0.0 1.0
-2.0 -1.0 0.0 1.0
Profils métaboliques
comparés de différents
organes et tissus foliaires
d’Arabidopsis thaliana

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... des profils métaboliques différenciés entre
compartiments sub-cellulaires “
Cytosol
chloroplastes
Krueger Krueger et al., et al., 2010 2011
Vacuole
Cartographie métabolique de
différents compartiments
cellulaires de feuilles
d’Arabidopsis thaliana

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... des dispositions à répondre à des contraintes
environnementales de natures variées“
Jahangir et al., 2009
„ ... un arsenal particulièrement sophistiqué“

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... des enjeux importants à décrypter les modalités moléculaires
de tolérance / résistance aux stress“
Des cascades de régulation de
mieux en mieux décrites mais de
plus en plus complexes (cross-talks)
Cramer et al., 2011
Des effecteurs de réponses aux stress
qui mobilisent de multiples pans du
métabolisme (osmorégulation, énergie,
redox, défenses, nutrition, …)
Vinocur and Altman., 2005

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2. La métabolomique
au chevet de la plante
„ ... problématiques de recherche“
Optimiser/régulariser le rendement dans un contexte de réduction
des intrants azotés et d’aléas climatiques, tout en assurant la
qualité des produits finaux (huile/tourteau de colza)
• Améliorer l’efficience d’utilisation des nutriments et de l’eau par la
plante
• Rechercher les déterminants génétiques et physiologiques de la
tolérance aux stress nutritionnels, hydriques, thermiques et de la
résistance aux maladies
Démarches intégratives de génétique quantitative, de génomique fonctionnelle, de
transcriptomique et de métabolomique.
Exploitation de ressources génétiques variées intra-spécifiques (RILs, TILLING,
PGM,…) et inter-spécifiques (espèces modèles)
Schranz et al., 2007

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3. Métabolomique
comparative et tolérance aux
stress
Profilage métabolique m
comparé d’Arabidopsis
thaliana et de
Thellungiella salsuginea (halophila) ( 1 H-NMR ) : sous stress salin mod
sous stress salin modéré
Thellungiella
0 mM NaCl
Arabidopsis
100 mM NaCl
Lugan et al., Metabolomics, 2006
Ghars et al., J. Plant Physiol., 2008
Lugan et al., Plant J., 2010

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A
8
6
3. Métabolomique
comparative et tolérance aux
stress
Phénotypes métaboliques divergents entre les
deux espèces, génétiquement proches mais
contrastées quant à leur tolérance à la salinité
4
PC3 (11%)
2
0
-2
-4
-6
63
-10 -8 -6 -4 -2 0 2 4 6 8 10
44
PC1 (43%) Putrescine
27
0.2
80
Glutamate 25
Control
NaCl
105 métabolites
GC-MS,
UPLC-DAD
ACP
B
PC3 Fact. (11%) 3
Fumarate
1.0
0.8
0.6
0.4
0.0
-0.2
-0.4
Lugan et al., Metabolomics, 2006
Ghars et al., J. Plant Physiol., 2008
Lugan et al., Plant J., 2010
Urate
66
Putrescine 35 87
Sinapate
70
74
15
56
Fumarate
12
3967
Spermidine
72
62
71
69
Galactinol
93
Raffinose
102
Sucrose
82
52
Spermidine
Galactinol
2
96
4 1
[Digalactosylglycerol]
101
Melibiose 91
14
32
47
13
23 22 38
Sucrose17
28
76
50 33
9
64
Raffinose
92
58
20
73
98
Fructose
46
Proline
8
61
21 85
Glutamine
40
3
GABA
18
103 65 Galactose
48
84
34
86
37
60
6 97 78
31
530Asparagine
57
54 8836
745
55 75 Quinate
10
16
2451
29
90 11 95 Trans caffeoylquinic acid
53
100
79
26
Glucose 94
49 83 89Gentiobiose
1943
99 81
42
59
41
Proline
Trans caffeic acid
68
77Shikimate
-0.6
OH
-1.2 -1.0 -0.8 -0.6 -0.4 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.6 0.8 1.0 1.2
PC1 (43%) Caffeate
NH 3
GABA
Caffeoylquinate
HO
O
COOH
OH
OH
Shikimate

2600000
3.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
3. Métabolomique
comparative et tolérance aux
stress
At- 0
At- 25
At- 50
At- 75
At-120
Th- 0
Th- 25
Th- 50
Th- 75
Th-120
Th-240
Th-360
Th-480
At- 240
At- 360
At- 480
A
Tryptophane 0.00 0.04 0.08 0.17 0.17 -0.23 -0.37 -0.34 -0.32 -0.39 -0.23 -0.47 0.85 0.23 0.87 0.12
Phenylalanine 0.00 0.03 0.03 ### ### ### -0.20 -0.19 -0.20 -0.25 ### -0.38 0.06 0.86 0.97 1.45
Lysine 0.00 0.19 0.15 0.20 0.29 ### ### ### ### ### 0.14 ### 0.50 0.93 1.12 1.17
Arginine 0.00 0.24 0.12 0.03 0.06 ### ### ### 0.03 ### 0.03 0.04 1.12 0.73 0.89 1.15
Histidine 0.00 0.17 0.12 0.10 0.16 ### ### ### ### ### ### 0.13 0.80 0.27 0.66 0.61
GABA 0.00 ### -0.25 -0.40 -0.28 ### -0.41 0.09 -0.23 0.25 0.70 0.37 0.73 1.26 1.40 1.44
Leucine 0.00 0.14 0.23 0.20 0.30 0.19 0.00 0.05 0.06 0.06 0.36 ### 0.61 1.49 1.60 1.99
Glycine 0.00 ### 0.04 ### 0.15 0.01 ### ### 0.01 ### 0.17 0.18 0.45 1.26 1.60 1.77
Beta-Alanine 0.00 0.14 ### ### -0.30 0.52 0.52 0.58 0.66 0.48 0.07 0.25 0.36 1.24 1.50 1.40
Isoleucine 0.00 0.12 0.15 0.17 0.24 0.39 0.34 0.37 0.38 0.27 0.37 0.11 0.83 1.29 1.42 1.77
Maltose 0.00 0.46 0.43 0.57 0.70 0.43 0.10 0.46 0.40 0.43 0.38 0.40 1.00 1.16 1.12 1.76
Saccharose 0.00 0.11 0.07 0.23 0.48 0.25 0.25 0.19 0.24 0.28 0.51 0.72 0.97 0.57 0.79 0.87
Valine 0.00 0.16 0.13 0.10 0.15 0.27 0.22 0.22 0.24 0.09 0.21 0.15 0.43 0.86 1.03 1.30
Galactose 0.00 ### 0.05 0.50 0.48 0.26 0.02 ### 0.12 0.21 0.45 0.39 0.44 0.96 0.87 1.63
Fructose 0.00 0.11 0.10 0.09 0.14 0.59 0.54 0.09 0.37 0.34 0.61 0.61 0.66 0.91 0.85 1.54
Hydroxyproline 0.00 0.44 0.64 0.86 0.89 0.71 0.83 0.89 1.01 1.02 1.14 1.19 1.21 0.50 0.83 1.03
Proline 0.00 0.32 0.54 0.90 1.13 0.92 1.00 1.09 1.23 1.22 1.41 1.37 1.59 1.23 1.46 1.54
Cellobiose 0.00 0.22 0.29 0.34 0.08 0.94 0.99 0.30 0.24 1.26 1.14 0.64 0.36 0.05 0.02 0.94
Citrate 0.00 -0.18 -0.20 -0.31 -0.36 0.34 0.37 0.53 0.57 0.60 0.75 0.68 0.48 -0.30 ### 0.04
Quinate 0.00 ### ### -0.57 ### 0.82 0.77 0.79 0.69 0.80 0.89 1.07 0.90 0.63 0.46 1.35
Malate 0.00 ### ### 0.00 0.04 0.78 0.79 0.77 0.79 0.81 0.83 0.87 0.80 0.07 0.27 0.59
Raffinose 0.00 -0.18 0.10 0.60 0.82 -0.53 -0.57 -0.22 -0.35 -0.53 -0.49 ### -0.59 -1.25 -1.15 -0.74
Galactinol 0.00 -0.30 ### 0.57 0.62 -0.51 -0.62 ### ### ### -0.32 ### ### -1.52 -1.84 -1.11
Shoots growth rate 0.00 ### ### -0.21 -0.46 -0.34 -0.31 -0.36 -0.29 -0.42 -0.47 -0.68 -0.90 -0.86 -1.03 -1.01
Spermidine 0.00 ### -0.24 -0.39 -0.59 -0.40 -0.46 -0.54 -0.65 -0.63 -0.74 -0.85 -0.83 -1.05 -1.17 -1.63
[Ascorbate] 0.00 -0.58 -0.35 -0.37 -0.44 ### ### -0.42 -0.35 ### ### ### -0.25 -1.77 -1.86 -1.30
Ornithine 0.00 ### ### ### -0.26 -0.21 -0.41 -0.45 -0.47 -0.45 -0.44 -0.73 -0.36 0.34 0.50 0.64
Alanine Alpha-Alanine 0.00 0.06 ### ### ### ### ### ### ### -0.37 -0.34 -0.55 -0.57 0.30 0.48 0.58
Ammonium 0.00 0.05 ### -0.23 -0.26 ### ### -0.27 -0.36 -0.49 -0.39 -0.60 -0.49 0.22 0.27 0.40
Tyrosine 0.00 -0.26 ### 0.15 0.12 -0.47 -0.69 -0.60 -0.63 -0.64 -0.50 -0.63 ### 0.31 0.49 0.89
Trehalose 0.00 -0.37 -0.52 ### -0.19 -0.52 -0.74 -0.46 -0.81 -0.87 -0.65 -0.86 -0.91 0.10 -0.21 0.44
Fumarate 0.00 -0.29 -0.22 ### 0.03 -1.41 -1.57 -1.70 -1.80 -1.98 -1.75 -2.09 -1.94 -0.43 -0.38 0.11
Methionine 0.00 0.07 ### 0.03 ### 0.23 0.18 0.26 0.28 0.19 0.32 0.10 0.18 -0.84 -0.20 -0.54
Glutamate 0.00 0.06 0.04 0.00 0.01 0.06 0.08 0.06 0.08 ### ### ### -0.39 -0.74 -0.62 -0.62
Aspartate 0.00 0.06 0.06 ### ### 0.17 0.20 0.17 0.14 0.02 ### -0.20 -0.44 -0.49 -0.41 -0.37
Glutamine 0.00 0.14 ### ### -0.24 0.10 0.08 0.11 0.13 0.00 0.06 ### -0.42 -0.77 -0.51 -0.27
Spermine 0.00 ### ### -0.21 ### ### ### ### ### ### ### -0.23 ### ### -0.23 -1.04
Putrescine 0.00 ### 0.06 0.12 ### ### -0.30 ### 0.05 ### 0.04 -0.31 0.45 0.17 0.06 -0.40
Agmatine 0.00 0.16 0.27 0.34 0.22 -0.22 ### -0.21 ### -0.20 ### -0.33 -0.55 0.33 0.12 -0.33
Homoserine 0.00 -0.46 -0.38 -0.50 -0.54 0.01 -0.25 ### -0.25 -0.21 ### -0.44 0.00 0.07 0.30 0.51
Melibiose 0.00 ### -0.26 0.41 0.47 ### ### ### -0.22 -0.52 -0.20 -0.29 ### ### -0.26 0.42
Glucose 0.00 ### ### 0.39 0.34 0.09 0.04 ### 0.08 ### 0.25 -0.54 0.39 0.43 0.34 1.11
Total metabolites 0.00 ### ### 0.02 0.08 0.07 0.09 0.13 0.17 0.17 0.28 0.24 0.25 0.04 0.18 0.48
Myoinositol 0.00 ### 0.03 0.16 0.24 ### 0.01 0.06 0.10 0.12 0.23 0.17 0.08 ### ### 0.44
Threonine 0.00 0.13 0.21 0.18 0.10 0.09 0.10 0.11 0.10 ### 0.09 ### ### 0.14 0.31 0.52
Serine 0.00 0.12 0.14 0.07 0.07 0.18 0.20 0.16 0.17 0.09 0.14 0.02 -0.19 0.36 0.34 0.69
Glycerate 0.00 ### ### ### ### 0.13 0.13 0.19 0.14 0.12 0.23 0.10 0.01 0.55 0.44 1.04
Asparagine 0.00 0.15 ### ### ### 0.12 0.07 0.09 0.10 ### ### -0.25 -0.39 ### 0.08 0.23
Succinate 0.00 ### ### 0.04 -0.20 0.02 0.07 0.15 0.11 ### ### -0.25 -0.24 0.24 0.28 0.90
-1.26
-0.78
-0.48
-0.18
0.00
0.18
0.48
0.78
1.26
1.56
B
NaCl (mM) 0 75 120 240 480
Metabolic modules
responsive to NaCl
Arabidopsis signature
Shoot growth rate
reduction indicator
Analyse hiérarchique des ajustements
métaboliques observés chez Thellungiella et
Arabidopsis en réponse à des traitements
salins d’amplitudes croissantes
Lugan et al., Plant J., 2010

2600000
3.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
3. Métabolomique
comparative et tolérance aux
stress
Propriétés physico-chimiques
du métabolome
Lugan et al., Metabolomics, 2006
Lugan et al., Plant J., 2010
Molar mass
Solubility (mg.ml -1 )
N to C ratio (N/C)
Gibbs free energy of formation(∆ f G 0’ )
Octanol:Water partition coefficient (logP)
Carbon oxidation number n°(C)
Adaptation du métabolome de Thellungiella à la déshydratation

2600000
3.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
3. Métabolomique
comparative et tolérance aux
stress
Thellungiella halophila
Profilage métabolique (métabolisme azoté et carboné)
des organes foliaires de trois espèces de Brassicacées
apparentées exposées 4 jours à 21 ou 4°C
Arabis alpina
Arabidopsis thaliana Thellungiella halophila Arabis alpina
2 populations d’Arabis alpina
Arabidopsis thaliana
Sordet et al., unpublished
Lugan et al., unpublished

2600000
4.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Recherche des caractéristiques
métaboliques des organes sources
(remobilisateurs) et des organes puits
(importateurs)
Albert et al., Planta, 2012
Feuille source
Feuille puits

2600000
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
N+ W+ N- W+ N+ W-W
N- W-
Profilage métabolique (métabolisme azoté et carboné)
des organes foliaires de colza exposé à un stress azoté
combiné ou non à un stress hydrique
PC2 (21.26%)
-12
-10
-8
-6
-4
-2
0
2
4
6
8
Scores plot
Rehydration 14
10 14
17 2217
17
22 14 22
10
N-W+
4
4
N+W-
N-W-
10
-8 -6 -4 -2 0 2 4 6 8 10 12
17
PC1 (34.92%)
Rehydration
Albert et al., Plant Physiol., submitted
22
10
0
10
4
4
14
N+W+
0
PC2 (20.08%)
1.0
0.5
0.0
-0.5
Suc
y22
Trp y2 Xyl x16
y7
Pro
Leu
GABA Phe
x18
x2 HyPro Val
y11 HisTot_N_met
Gly
y29
y14 Myo Gluc
x19 Ile
y27y8
y19 Tyr
y24
Malt y25
x8
y26 Lys
Orn
x10
x17Tot_C_met
x13
x7
y5
y18
x14
y9
Fum Thr
x3
x12
y23 Mala
y30 MetCys y21
Arg
x6
Fruc
x9
x15
y6
x5
Cit
y12
Succ ß-Ala
HSer
y13 Met
x1 Asn Gln Asp
a-Ala
Glyce y28 y20
Cys
y15 Ser x4
x11y4
y1 y17
y3 y10 Glu Qui
y16
-1.0
-1.0 -0.5 0.0 0.5 1.0
PC1 (31.07%)
Les plantes carencées en azote sont
métaboliquement moins perturbées
par le stress hydrique

2600000
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Profilage métabolique (métabolisme azoté et carboné)
des organes foliaires de colza exposé à un stress azoté
combiné ou non à un stress hydrique
N+ W+ N- W+ N+ W-W
N- W-
Albert et al., Plant Physiol., submitted
Repérage de marqueurs
d’exposition aux stress

2600000
4.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Profilage métabolique (métabotypage) des
racines de variétés de colza plus ou moins
résistantes à la hernie des crucifères
Marqueurs de sensibilité
RILs et mQTLs
Wagner et al., MPMI, 2012

2600000
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Wild type
Profilage métabolique m
du mutant Eskimo d’Arabidopsis
thaliana :
Constitutivement acclimaté au froid
Accumulateur constitutif de proline
Mutant
Shoots (94 analytes)
Roots (112 analytes)
At3g55990 (esk1)
DUF231 family : 45 proteines
Fonctions inconnues
Absent des microarrays
Profils métaboliques comparés
(ICA) de WT et esk1 dans les
racines et les rosettes en
conditions contrôlées
Lugan et al., Metabolomics, 2006
Lugan et al., Plant Cell Env, 2009

2600000
4.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Contrôle 6°C Déshydratation NaCl
WT
esk1
Ajustements métaboliques
observés chez le WT et le
mutant au cours de l’exposition
à différents stress abiotiques
Water status
Control
Déshydration
NaCl
Froid
Transpiration rate
RWC
Water stress phenotype
Lugan et al., Metabolomics, 2006
Lugan et al., Plant Cell Env, 2009

2600000
4.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Columbia
Methionine
Methionine
Control
GB
Pro
Salt
Salt + GB
Salt + Pro
Lysine
Control
GB
Pro
Salt
Salt + GB
Salt + Pro
Lysine
Lysine and methionine amounts exhibited
strong correlation through all the individuals
under investigation. This could be expected
because lysine and methionine biosynthesis
result from aspartate as a common precursor
Asp AsnSer Glu Gly Gln ArgThr Ala Prol Tyr Val Met Lys Ile Leu Phe Trp A B C D Fru E Gal Glc F Myo G H I Suc Tre Mal J K L Galol M N Raff
Asp 1.0
AsnSer 0.3 1.0
Glu 0.4 0.3 1.0
Pearson coefficients
Gly -0.2 0.3 -0.1 1.0
Control
Gln 0.3 0.6 0.4 0.3 1.0
GB
ArgThr 0.1 0.3 0.2 0.3 0.5 1.0
> 0.95
Pro
Ala 0.1 0.4 -0.2 0.7 0.1 0.0 1.0
Salt
> 0.9
Prol 0.0 0.2 -0.6 0.3 -0.1 0.1 0.5 1.0
Salt + GB
Tyr 0.2 0.5 -0.2 0.3 0.3 0.0 0.4 0.5 1.0
> 0.8
Salt + Pro
Val -0.1 0.4 -0.5 0.3 -0.1 -0.1 0.5 0.8 0.6 1.0
> 0.7
Met 0.1 0.1 -0.5 0.2 0.1 -0.1 0.4 0.6 0.9 0.5 1.0
Lys 0.2 0.2 -0.4 0.2 0.2 0.0 0.3 0.7 0.8 0.5 0.9 1.0
> 0.6
Ile 0.0 0.5 -0.3 0.3 -0.1 -0.1 0.5 0.7 0.5 0.9 0.4 0.5 1.0
Leu -0.1 0.4 -0.4 0.4 -0.1 -0.1 0.6 0.8 0.6 1.0 0.5 0.5 1.0 1.0
Phe -0.1 0.5 -0.3 0.4 -0.1 0.0 0.6 0.7 0.6 0.9 0.4 0.4 0.9 0.9 1.0
Trp -0.3 0.2 -0.5 0.5 -0.2 0.0 0.5 0.8 0.5 0.9 0.5 0.4 0.8 0.8 0.9 1.0
A 0.4 0.7 0.2 0.1 0.6 0.2 0.3 0.3 0.6 0.4 0.4 0.4 0.5 0.4 0.5 0.2 1.0
B 0.2 0.5 0.7 0.1 0.5 0.3 0.1 -0.4 0.0 -0.1 -0.4 -0.3 0.0 -0.1 0.1 -0.2 0.5 1.0
C 0.2 0.0 0.1 -0.1 0.1 -0.1 0.0 -0.2 0.0 0.0 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.1 -0.1 0.0 0.2 1.0
D 0.2 0.5 0.6 0.0 0.5 0.3 0.0 -0.4 -0.1 -0.2 -0.4 -0.3 0.0 -0.2 0.0 -0.3 0.5 1.0 0.2 1.0
Fru -0.1 0.2 -0.6 0.3 -0.1 0.0 0.4 0.9 0.7 0.9 0.7 0.7 0.8 0.8 0.8 0.9 0.4 -0.3 -0.1 -0.3 1.0
E 0.3 -0.1 0.0 0.2 0.3 0.3 0.1 0.2 0.1 -0.2 0.3 0.4 -0.3 -0.3 -0.3 -0.2 0.0 -0.2 -0.3 -0.1 0.0 1.0
Gal 0.2 0.0 -0.3 0.0 0.1 0.0 0.1 0.5 0.6 0.2 0.7 0.8 0.1 0.1 0.0 0.1 0.2 -0.4 -0.3 -0.4 0.4 0.6 1.0
Glc 0.3 0.1 -0.1 0.0 0.3 0.0 0.2 0.4 0.5 0.1 0.6 0.7 0.0 0.0 -0.1 0.0 0.3 -0.3 -0.3 -0.3 0.3 0.7 0.9 1.0
F 0.3 0.2 -0.1 0.1 0.2 0.0 0.3 0.4 0.4 0.2 0.4 0.5 0.1 0.1 0.0 0.1 0.2 -0.2 -0.2 -0.2 0.3 0.6 0.7 0.9 1.0
Myo -0.1 0.1 -0.7 0.1 -0.2 -0.1 0.3 0.9 0.5 0.8 0.6 0.7 0.7 0.7 0.7 0.7 0.3 -0.4 -0.1 -0.3 0.9 0.0 0.3 0.2 0.2 1.0
G -0.3 -0.5 -0.2 0.0 -0.2 -0.1 -0.1 -0.2 -0.3 -0.3 -0.1 -0.2 -0.4 -0.3 -0.4 -0.1 -0.7 -0.6 -0.1 -0.6 -0.2 0.2 0.0 0.0 -0.1 -0.2 1.0
H 0.3 0.4 0.6 0.0 0.2 0.3 0.0 -0.2 0.0 0.1 -0.2 -0.2 0.2 0.1 0.2 -0.1 0.4 0.5 0.1 0.6 -0.1 -0.2 -0.2 -0.2 -0.1 -0.1 -0.5 1.0
I -0.5 -0.2 0.0 0.3 -0.4 0.1 0.0 -0.3 -0.5 -0.3 -0.4 -0.5 -0.3 -0.3 -0.2 0.0 -0.6 -0.2 -0.3 -0.2 -0.3 -0.2 -0.4 -0.4 -0.3 -0.3 0.5 -0.3 1.0
Suc -0.6 0.1 -0.5 0.4 -0.3 0.1 0.2 0.6 0.2 0.6 0.3 0.2 0.5 0.5 0.6 0.8 0.0 -0.3 -0.2 -0.3 0.6 -0.2 0.0 -0.2 -0.1 0.6 0.0 -0.2 0.3 1.0
Tre -0.4 -0.2 -0.2 0.4 -0.3 0.2 0.1 0.1 -0.2 -0.1 0.0 0.0 -0.2 -0.1 -0.1 0.1 -0.4 -0.4 -0.3 -0.4 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.4 -0.4 0.8 0.5 1.0
Mal 0.3 0.1 -0.3 0.1 0.2 0.0 0.3 0.5 0.7 0.2 0.8 0.9 0.2 0.2 0.1 0.1 0.3 -0.3 -0.2 -0.3 0.4 0.5 0.8 0.8 0.6 0.4 -0.1 -0.3 -0.4 0.0 0.1 1.0
J 0.3 0.1 -0.3 0.0 0.2 -0.1 0.3 0.4 0.6 0.2 0.7 0.7 0.1 0.2 0.0 0.0 0.3 -0.3 -0.1 -0.3 0.3 0.4 0.8 0.8 0.6 0.3 0.0 -0.2 -0.4 -0.1 0.0 0.9 1.0
K 0.1 -0.1 -0.3 -0.1 0.1 0.0 -0.1 0.3 0.4 0.0 0.6 0.7 -0.1 0.0 -0.2 -0.1 0.1 -0.4 -0.2 -0.4 0.2 0.4 0.8 0.8 0.6 0.2 0.0 -0.3 -0.2 -0.1 0.2 0.8 0.8 1.0
L 0.5 0.1 -0.2 -0.1 0.2 -0.2 0.2 0.4 0.5 0.2 0.6 0.7 0.2 0.3 0.1 0.0 0.2 -0.3 0.3 -0.4 0.3 0.3 0.7 0.7 0.6 0.3 -0.1 -0.2 -0.5 -0.2 -0.1 0.8 0.9 0.7 1.0
Galol -0.1 -0.2 -0.2 -0.3 -0.1 -0.1 -0.4 0.1 0.1 -0.1 0.3 0.4 -0.2 -0.2 -0.3 -0.1 -0.2 -0.5 -0.2 -0.4 -0.1 0.3 0.6 0.5 0.4 0.0 0.1 -0.3 0.0 0.1 0.3 0.5 0.5 0.8 0.5 1.0
M 0.0 -0.4 -0.1 -0.4 0.0 0.1 -0.5 -0.2 -0.2 -0.5 0.0 0.1 -0.5 -0.5 -0.6 -0.4 -0.5 -0.6 -0.1 -0.4 -0.2 0.5 0.3 0.3 0.2 -0.1 0.6 -0.2 0.0 -0.2 0.1 0.2 0.2 0.4 0.2 0.5 1.0
N 0.3 0.2 -0.5 0.1 0.1 -0.1 0.5 0.7 0.7 0.6 0.8 0.8 0.5 0.5 0.4 0.3 0.4 -0.3 0.0 -0.3 0.6 0.3 0.7 0.6 0.6 0.6 -0.2 -0.2 -0.6 0.1 -0.1 0.9 0.8 0.6 0.8 0.2 0.0 1.0
Raff 0.2 0.0 -0.4 -0.1 0.0 -0.2 0.1 0.4 0.5 0.2 0.6 0.7 0.3 0.3 0.1 0.1 0.2 -0.4 0.2 -0.4 0.3 0.2 0.7 0.6 0.5 0.3 -0.1 -0.2 -0.4 0.0 0.0 0.8 0.8 0.8 0.9 0.6 0.2 0.8 1.0
Eskimo
Asp AsnSer Glu Gly Gln ArgThr Ala Prol Tyr Val Met Lys Ile Leu Phe Trp A B C D Fru E Gal Glc F Myo G H I Suc Tre Mal J K L Galol M N Raff
Asp 1.0
AsnSer 0.0 1.0
Glu 0.6 0.2 1.0
Gly -0.2 0.4 -0.3 1.0
Gln 0.1 0.7 0.3 0.3 1.0
ArgThr 0.3 0.7 0.3 0.3 0.6 1.0
Ala 0.0 0.5 -0.1 0.5 0.3 0.2 1.0
Prol -0.3 0.2 -0.3 0.4 -0.1 0.0 0.4 1.0
Tyr -0.1 0.1 -0.4 0.1 -0.1 0.0 0.3 0.2 1.0
Val -0.4 0.4 -0.5 0.5 0.1 0.2 0.5 0.7 0.3 1.0
Met 0.1 -0.1 -0.3 0.2 -0.1 -0.1 0.3 0.5 0.4 0.3 1.0
Lys 0.2 0.0 -0.3 0.2 0.0 0.1 0.3 0.4 0.3 0.3 0.9 1.0
Ile -0.4 0.2 -0.6 0.4 -0.1 0.1 0.2 0.6 0.3 0.8 0.5 0.5 1.0
Leu -0.3 0.0 -0.7 0.4 -0.2 0.1 0.2 0.5 0.6 0.7 0.7 0.7 0.9 1.0
Phe -0.5 0.3 -0.6 0.5 0.0 0.1 0.4 0.7 0.3 0.9 0.4 0.3 0.8 0.8 1.0
Trp -0.6 0.1 -0.5 0.4 -0.2 -0.1 0.1 0.6 0.1 0.7 0.3 0.2 0.8 0.6 0.7 1.0
A 0.0 0.5 0.1 0.4 0.5 0.5 0.2 0.2 -0.1 0.3 0.3 0.4 0.3 0.3 0.3 0.1 1.0
B -0.1 0.4 0.1 -0.1 0.5 0.3 0.1 -0.4 -0.3 -0.1 -0.5 -0.4 -0.2 -0.3 0.0 -0.2 0.1 1.0
C -0.1 0.3 0.1 -0.1 0.2 0.1 0.1 0.0 -0.3 0.1 -0.4 -0.3 -0.1 -0.2 0.1 -0.1 0.1 0.8 1.0
D 0.2 0.4 0.4 0.0 0.6 0.5 0.1 -0.4 -0.3 -0.2 -0.5 -0.3 -0.3 -0.3 -0.1 -0.3 0.4 0.8 0.6 1.0
Fru -0.5 0.1 -0.5 0.5 -0.2 0.0 0.3 0.8 0.4 0.8 0.4 0.4 0.8 0.7 0.7 0.7 0.2 -0.3 -0.2 -0.4 1.0
E 0.2 -0.2 0.1 -0.1 -0.1 -0.1 0.1 0.0 -0.2 -0.3 0.1 0.2 -0.3 -0.1 -0.2 -0.2 0.0 0.0 0.2 0.2 -0.2 1.0
Gal -0.1 -0.1 -0.4 0.2 -0.2 -0.1 0.3 0.3 0.5 0.1 0.6 0.6 0.3 0.4 0.1 0.3 0.0 -0.5 -0.4 -0.4 0.4 0.5 1.0
Glc 0.1 -0.1 -0.2 0.2 0.0 -0.1 0.3 0.2 0.3 0.0 0.7 0.7 0.1 0.3 0.0 0.1 0.2 -0.5 -0.4 -0.3 0.2 0.4 0.9 1.0
F 0.2 0.0 -0.1 0.2 0.1 0.1 0.4 0.3 0.3 0.1 0.7 0.7 0.2 0.4 0.1 0.0 0.3 -0.3 -0.2 0.0 0.3 0.5 0.7 0.8 1.0
Myo -0.1 -0.1 -0.1 0.1 -0.4 -0.2 0.1 0.4 0.3 0.1 0.3 0.3 0.2 0.3 0.1 0.2 -0.1 -0.3 -0.2 -0.4 0.4 0.2 0.6 0.3 0.3 1.0
G -0.1 0.0 -0.1 -0.1 -0.1 0.0 -0.1 0.1 -0.2 0.0 0.0 0.1 0.2 0.1 0.1 0.3 -0.1 -0.1 0.1 -0.1 0.0 0.2 0.2 0.0 -0.1 0.1 1.0
H 0.2 0.2 0.3 0.0 0.3 0.3 0.1 -0.4 -0.1 0.0 -0.4 -0.5 -0.2 -0.3 0.0 -0.2 0.1 0.6 0.3 0.5 -0.2 -0.3 -0.5 -0.4 -0.2 -0.4 -0.5 1.0
I -0.3 0.0 0.0 0.1 -0.2 -0.3 0.0 0.2 0.1 0.0 -0.2 -0.3 -0.1 -0.2 0.0 0.0 -0.4 -0.2 -0.2 -0.4 0.1 -0.1 0.0 -0.1 -0.2 0.3 -0.1 -0.2 1.0
Suc -0.5 0.1 -0.2 0.2 -0.2 -0.1 0.2 0.7 0.0 0.7 0.2 0.0 0.5 0.4 0.6 0.6 0.2 0.0 0.2 -0.2 0.7 -0.3 -0.1 -0.1 0.0 0.2 -0.2 0.1 0.2 1.0
Tre -0.2 -0.2 0.0 0.1 -0.3 -0.4 -0.1 0.2 0.0 -0.1 0.1 0.0 -0.1 -0.1 -0.1 0.0 -0.4 -0.4 -0.3 -0.6 0.1 -0.1 0.1 0.1 0.0 0.4 0.0 -0.4 0.9 0.1 1.0
Mal 0.2 -0.1 -0.3 0.1 0.0 0.1 0.2 0.1 0.2 0.1 0.7 0.8 0.4 0.5 0.2 0.1 0.3 -0.3 -0.3 -0.2 0.1 0.2 0.5 0.6 0.5 0.1 0.2 -0.4 -0.3 -0.2 0.0 1.0
J 0.2 0.2 -0.1 0.0 0.0 0.1 0.2 0.3 0.1 0.1 0.6 0.6 0.4 0.3 0.1 0.2 0.2 -0.4 -0.2 -0.3 0.1 0.1 0.4 0.5 0.4 0.2 0.5 -0.5 -0.3 -0.1 0.0 0.7 1.0
K 0.1 0.1 0.0 -0.1 0.0 0.1 0.0 0.1 -0.2 -0.1 0.2 0.4 0.1 0.0 -0.1 0.1 0.1 -0.3 -0.2 -0.2 0.0 0.2 0.4 0.4 0.2 0.0 0.6 -0.4 -0.2 -0.2 0.1 0.5 0.7 1.0
L 0.2 0.1 -0.1 0.0 0.0 0.3 0.1 0.1 -0.1 0.0 0.4 0.6 0.2 0.2 0.0 0.1 0.2 -0.2 -0.1 0.0 0.0 0.3 0.4 0.4 0.3 -0.1 0.6 -0.4 -0.4 -0.3 -0.1 0.8 0.8 0.8 1.0
Galol 0.1 -0.1 0.1 -0.2 -0.1 0.1 -0.2 -0.2 -0.4 -0.3 0.0 0.2 -0.1 -0.2 -0.3 0.1 0.1 -0.1 -0.1 0.0 -0.2 0.4 0.2 0.2 0.0 -0.1 0.6 -0.3 -0.2 -0.3 0.1 0.4 0.5 0.9 0.8 1.0
M 0.4 0.0 0.4 -0.2 0.0 0.3 0.1 -0.3 -0.2 -0.4 0.0 0.1 -0.2 -0.3 -0.3 -0.2 0.0 0.1 0.0 0.3 -0.3 0.2 0.1 0.2 0.1 -0.1 0.2 0.3 -0.2 -0.4 -0.1 0.3 0.2 0.4 0.5 0.5 1.0
N 0.1 -0.1 -0.4 0.2 -0.1 0.0 0.2 0.3 0.4 0.3 0.8 0.8 0.5 0.7 0.4 0.1 0.3 -0.4 -0.3 -0.3 0.4 -0.1 0.4 0.6 0.5 0.3 -0.1 -0.3 -0.3 0.1 -0.1 0.7 0.5 0.1 0.3 -0.1 0.0 1.0
Raff 0.1 -0.1 -0.2 -0.1 0.0 0.0 0.1 0.3 0.1 0.1 0.7 0.7 0.4 0.4 0.2 0.1 0.3 -0.3 -0.2 -0.3 0.2 0.0 0.4 0.5 0.4 0.2 0.1 -0.4 -0.3 0.1 -0.1 0.6 0.6 0.4 0.4 0.1 0.1 0.8 1.0
Myo-inositol
Myo-inositol
Proline
In the WT Columbia, the proline level
correlated with that of myo-inositol,
although the metabolic pathways
involved does not seem to be
directely connected.
Control
GB
Pro
Salt
Salt + GB
Salt + Pro
Proline
In the mutant Eskimo, the relationship
between proline and myo-inositol was
not confirmed. This could result from
deregulation of proline accumulation.
Lugan et al., Metabolomics, 2006
Conséquences métaboliques corrélatives de la mutation

2600000
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Profilage métabolique m
du mutant pop2 d’Arabidopsis
thaliana :
Catabolisme du Gaba, métabolite m
de stress
Actions régulatrices, r
fonction anaplérotique
0 50 100 150
NaCl (mM)
Plus grande sensibilité du mutant :
- au NaCl
- au Gaba
Renault et al., BMC Plant Biol., 2010
Renault et al., Plant Cell Physiol., 2011
Renault et al., Plant Cell Env., 2012
Ler pop2-
Ler pop2-
Ler pop2-
Ler pop2-
1
2 5 1 1 4 4 1 81 13 1 47
6
pop2-
4
Ler
Col-0
GABA 1 mM
pop2-
1
Catma arrays
Roles régulateurs du Gaba

2600000
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Phénotypage
métabolique du mutant pop2 d’Arabidopsis
thaliana :
Action racinaire du métabolisme m
du Gaba
Activité régulatrice du rapport C/N
Renault et al., Plant Cell Env., 20112

2600000
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Phénotypage
métabolique de lignées transformées (35S-OE)
d’Arabidopsis
thaliana exprimant le gène g
CodA d’Arthrobacter
globiformis impliqué dans la
synthèse se de glycine bétaïne
:
Action osmoprotectrice de la GB
Alia et al., Plant Mol. Biol., 1999
Voies de biosynthèse de la glycine
bétaïne chez différents organismes
36 cycles
36 cycles
WT
ANT5
ANT7
A/A20
A/A2
A20
M
GB
(µmol/g MS) 0 6 0 10.6 9.1 0
avec Cho 0 6.1 0 13.2 12.7 0
Expression du transgène et teneurs en GB dans
différentes lignées transformées
Lugan et al., unpublished

2600000
4.
2400000
2200000
2000000
1800000
1600000
1400000
1200000
1000000
800000
600000
400000
200000
0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
4. Métabotypage
et métabolomique
fonctionnelle
Phénotypage
métabolique de lignées transformées (35S-OE)
d’Arabidopsis
thaliana exprimant le gène g
CodA d’Arthrobacter
globiformis impliqué dans la
synthèse se de glycine bétaïne
:
Action osmoprotectrice de la GB
Log (codA control / WT control) Log (WT NaCl / WT control) Log (codA NaCl / WT control)
Hierarchical classification (Ward) of metabolite levels in WT and codA
transformants of Arabidopsis after Nacl treatment
Lugan et al., unpublished

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400000
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0
15.00 20.00 25.00 30.00 35.00 40.00 45.00 50.00 55.00
Eléments de conclusion
2600000
2400000
L’investigation des ajustements métaboliques mis en oeuvre par les plantes exposées aux
stress a largement été encouragée ces dernières années grace au développement des
techniques et des outils de métabolomique.
Des expériences récentes de profilage métabolique comparé d’espèces modèles
apparentées à Arabidopsis ont contribué à la mise en évidence de configurations
métaboliques adaptées à des environnements osmotiquement ou thermiquement
contraignants.
………………………..
Dans un futur très proche, davantage d’études intégreront la métabolomique comme
moyen d’appréhension de la biologie systémique appliquée à la compréhension des
moyens d’adaptation des plantes aux stress.
La sélection et l’amélioration génétique pour une agriculture performante et durable,
adaptée à l’évolution prévisible du climat, encourage également à renforcer le
développement des outils de phénotypage métabolique à haut débit apropriés à des
environnements biotiques et abiotiques contraignants et à la combinaison de stress.

2200000
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Remerciements
2600000
2400000
Carole Deleu,
Antoine Gravot,
François Larher,
Laurent Leport,
Françoise Le Cahérec,
Maria Manzanares-Dauleux,
Marie-Françoise Niogret,
Chantal Monnier,
Solenne Berardocco,
Christine Lariagon
Nathalie Marnet
Dany Saligaut
Benjamin Albert
Raphaël Lugan
Geoffrey Wagner
Elise Sorin
Institut de Génétique, G
Environnement et
Protection des Plantes,
Rennes, Le Rheu
Collaborateurs : D. Renault (Rennes) ; A. Savouré (Paris VI) : M. Herzog (Grenoble) ;
Y. Gibon (Bordeaux) ; JC Avice (Caen) ; R. Sulpice (Golm, Germany) ; J. Kopka (Golm,
Germany)

Plateau de profilage métabolique
et de métabolomique (P2M2)