Laboratoire Régional de Suivi de la Faune Sauvage - ANCGG

LRSFS
Laboratoire Régional de
Suivi de la Faune Sauvage
Bulletin n°1 Juin 2012
Laboratoire Régional de Suivi de la Faune Sauvage
LRSFS Laboratoire Régional de Suivi de la Faune Sauvage
40 Chemin des 3 Noyers Le Mée-sur-Seine 77350
Tel : 01 64 14 44 30 Fax : 01 64 14 44 39 Email : lrsfs.labo@gmail.com
www.laboratoirefaunesauvage.com
SIRET 519 526 438 00014 - APE 9499Z

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Suivi de la Faune Sauvage
Sommaire
I-Etudes et analyses
A. Etude 2012 de recherche de l’Echinococcus multinocularis sur
renards roux/ Veille sanitaire sur le département de l’Essonne
II-Projets
B. Etude chytridiomycose/ranavirose 2011 (résultats)
C. Description des analyses demandées
D. Synthèse des résultats
-Projet de déménagement du LRSFS à l’IRD de Bondy sur le
département de la Seine Saint Denis
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40 Chemin des 3 Noyers Le Mée-sur-Seine 77350
Tel : 01 64 14 44 30 Fax : 01 64 14 44 39 Email : lrsfs.labo@gmail.com
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EDITORIAL
Le 1 er semestre de cette année 2012 a été riche en évènements. Tout d’abord, le LRSFS fidèle à ses thématiques et
vocations en matière de veille sanitaire et d’études épidémiologiques est heureux de vous présenter la synthèse et
résultats des 2 études réalisées. D’une part, l’étude de recherche chez le renard de l’échinocoque multiloculaire
réalisé sur le département de l’Essonne pour le compte du Conseil Général, et d’autre part, la première étude
francilienne de recherche de la chytridiomycose des amphibiens.
Résolument tourné vers la Biologie vétérinaire dont il est le seul et unique laboratoire d’Ile de France, le LRSFS est
toujours soucieux de l’importance du monde animal dans la thématique de la biosphère sans oublier la protection des
populations vis-à-vis des risques zoonotiques.
Récemment, le Laboratoire Régional de Suivi de la Faune Sauvage a reçu une proposition d’hébergement définitive
par l’Institut de Recherche pour le Développement (IRD de Bondy). Les membres du Conseil d’Administration du
LRSFS se réjouissent de cette proposition et de collaborations futures avec l’IRD sur des thématiques communes.
Les locaux proposés par l’IRD nécessitent des travaux de mise en conformité en fonction de l’activité du LRSFS et
des exigences réglementaires. Des plans d’aménagement des locaux ainsi qu’un manuel qualité ont été réalisés avant
le début des travaux prévu mi-juillet et seront achevés en octobre 2012.
Karim DAOUD
Directeur du LRSFS

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I-Etudes et analyses
A- Etude de recherche de l’échinocoque sur renards roux/ Veille
sanitaire sur le département de l’Essonne pour l’année 2012
Cette étude a débuté le premier trimestre 2011 et prévue sur un programme de trois années.
Elle permettra de connaitre l’état sanitaire des renards sur tout le département vis-à-vis de l’Echinoccocus
multilocularis et le cas échéant d’instaurer une veille sanitaire sur les sites sondés si ceux-ci se révèlent positifs.
L’importance de l’échinococcose multiloculaire ne réside pas dans la pathologie de la maladie mais plutôt dans la
possibilité de transmission de l’animal à l’Homme.
Le LRSFS a effectué des analyses pour le compte du Conseil Général 91 (gracieusement puisqu’il est adhérent au
laboratoire en versant une cotisation annuelle). L’analyse et l’interprétation des résultats sont communiqués ensuite
aux partenaires. L’étude de cette année concerne 12 sites du département à raison d’un prélèvement par site.
Les échantillons de renards ont été prélevés du 26 Janvier au 11 Avril 2012.
1. Déroulement de l’étude :
L’Entente interdépartementale de lutte contre la rage et autres zoonoses a mis en place un quadrillage précis
du département de l’Essonne et a attribué à chaque renard prélevé et envoyé au LRSFS un numéro dit « de placette »
correspondant à la zone géographique dans laquelle on a retrouvé chaque sujet.
La démarche se décompose en 5 parties distinctes :
prélèvement des renards
transfert au LRSFS
dissection et ablation des intestins
décontamination et analyse
diffusion des résultats.
2. Résultats :
Sur les 12 intestins analysés, 3 se sont avérés positifs à la recherche de l’Echinococcus multilocularis. Sur les trois
zones où l’étude précédente avait révélé des cas positifs, on a retrouvé dans ces mêmes zones des renards contaminés
ainsi que dans de nouvelles zones.

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Les renards retrouvés contaminés par ce parasite l’ont été sur les communes suivantes : Lisses, La Norvile et
Palaiseau.
.
Tableau d'étude portant sur la recherche d'Echinococcus multilocularis sur 12 renards

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Carte : Résultats de recherche d’échinocoque sur renard du département de l’Essonne en 2012

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B- Etude de recherche de la chytridiomycose/ranavirose 2011 (résultats)
Le LRSFS en collaboration avec le MNHN* a initié cette étude régionale avec la participation de toutes les
collectivités franciliennes, l’ONF***, le Laboratoire d’Ecologie Alpine de l’Université de Savoie, et Naturparif.
Cette étude a débuté le premier trimestre 2011 et s’est achevée au premier trimestre 2012.
Elle a permis de connaitre l’état sanitaire des amphibiens de toute la région d’Ile de France vis-à-vis du
Batrachochytrium dendrobatidis et le cas échéant d’instaurer une veille sanitaire sur les sites prospectés car certains
sites se sont révélés positifs. Une recherche de ranavirus sera également faite ultérieurement sur les mêmes
prélèvements étant donné que d’après les connaissances actuelles, ces deux maladies sont les seuls pathogènes à
l’origine de mortalités massives potentielles chez les amphibiens.
Le rôle du LRSFS a été de coordonner, l’étude au niveau régional ainsi que d’effectuer l’analyse et
l’interprétation des résultats qu’il communique aux partenaires.
Par ailleurs des prélèvements buccaux ont étés effectués conjointement à ceux de la recherche de la chytridiomycose,
afin d’alimenter la banque ADN faune sauvage du LRSFS.
Cette banque ADN faune sauvage servira pour des recherches ultérieures.
L’étude concerne 22 sites de la région d’Ile de France à raison d’environ 30 prélèvements par site. Le total des
prélèvements effectués sur les 22 sites est de 632 prélèvements.
DEPARTEMENT
SITES
TOTAL
PRELEVEMENTS
77 Seine et Marne 6 180
94 Val de Marne 1 30
78 Yvelines 4 120
92 Hauts de Seine 2 62
91 Essonne 3 90
93 Seine Saint Denis 2 60
95 Val d'Oise 1 20
75 Paris 3 70
TOTAL 22 632
1. L’étude s’est déroulée de la manière suivante :
‣ Mise au point du protocole de prélèvement et du plan d’échantillonnage par le LRSFS
‣ Recueil et envoi des échantillons
‣ Transmission des données brutes au LRSFS pour analyse et interprétation des résultats

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2. Résultats
Sur les 632 amphibiens analysés, 9 se sont avérés positifs à la recherche de le Batrachochytrium dendrobatidis, et 8
douteux.

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Département Site Code Site
Seine et Marne 77
Espèce prospectée
ENS Sorques Sorques 1 Bufo bufo 30 LECA -
RN La Bassée Bassée 1 Bufo bufo 30 LECA -
FD Villefermoy Villefermoy 1 Lissotriton helveticus 30 LECA -
Aven du Grand Voyeux
(AEV)
Grand voyeux 1 30 MNHN
Erratum : Jardin sauvage St-Vincent 75018 est remplacé par jardin naturel, rue de la réunion 75020
1 douteux, bruit de
fond 1 / 2
Bordes et Chalonges Bordes 1 Lissotriton helveticus 30 LECA -
FD Malvoisine Malvoisine 1 Lissotriton helveticus 30 LECA -
Val de Marne 94 FD Notre Dame Notre Dame 1 Bufo bufo 30 LECA -
FR Rosny Rosny 1 Bufo bufo et Rana dalmatina Oui LECA -
Rambouillet1 1 Bufo bufo 30 LECA -
Rambouillet 2 (La clage) 1 Bufo cufo 30 MNHN
Yvelines 78 FD Rambouillet(3 sites)
Rambouillet 2 (Etang
1 douteux, bruit de
1 Bufo bufo 30 MNHN
des Vallées)
fond 2 / 2
FD Marly Marly 0 ANNULE ANNULE ANNULE
Pas de
prélevements
4 positif et 1
Triturus cristatus, Lissotriton
FD Verrières Verrières 1
32 MNHN douteux, bruit de
Yvelines-Hauts de Seine 78-
helveticus et Rana dalmatina
fond 1 / 2
92
1 douteux, bruit de
FD Meudon Meudon 1 Lissotriton helveticus 30 MNHN
fond 1 / 2
1 positif et 1
Misery Misery 1 Pelophylax ridibundus et
Grenouille verte
30 MNHN douteux, bruit de
fond 2 / 2
Essonne 91 Dourdan (crapauduc) Dourdan 0 ANNULE ANNULE ANNULE
Pas de
prélevements
FD Sénart Sénart 1 Bufo bufo 30 -
FD Angervilliers Angervillers 1 Lissotriton helveticus Oui MNHN
5 douteux, bruit de
fond 1 / 2
Bondy Bondy 1 Salamandra salamandra 30 -
Seine Saint Denis 93 Parc départemetnal
Bufo calamita et Lissotriton
Valbon 1
Georges valbon
vulgaris
30 MNHN -
Val d'Oise 95 Bois de Morval Morval 1 Bufo bufo 20 MNHN
analyses
impossible
Parc Floral de Paris (Bois
de Vincennes)
Vincennes 1 Bufo bufo et Rana temporaria 20 LECA -
Paris 75
Jardin sauvage St-
Vincent, Butte
Montmartre, 18e
Rivière Serpentine (Bois
de Boulogne)
Nombre de
Sites
Prélèvement Chytride
Laboratoires
Saint Vincent 1 Lissotriton vulgaris 20 LECA
4 positifs 2♂ et
2 ♀
Boulogne 1 Bufo bufo 30 LECA -
Résultats
22 632 9+ et 8 douteux
Conclusion
Ce projet a permis de connaitre l’état sanitaire des amphibiens de la région d’Ile de France vis-à-vis du
Batrachochytrium dendrobatidis et d’instaurer/ justifier une veille sanitaire sur les sites prospectés et révélés
positifs. Une réunion de travail est prévue avec des spécialistes en fin d’année 2012 pour définir la marche à suivre
avec les différents acteurs de la biodiversité.
Une première idée de la prévalence constitue-t-elle une bonne base préventive car le risque est « objectivement »
mesuré.

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La sensibilité des espèces n’est pas uniforme, certaines espèces meurent rapidement des suites de l’infection et
d’autres peuvent survivre sans difficulté à une forte contamination. Ces espèces favorisent la propagation de la
maladie et constituent des réservoirs.
Ces réservoirs « asymptomatiques » sont très importants d’un point de vue épidémiologique. Ayant maintenant
connaissance de « positifs » dans la région Ile de France, cette notion de réservoirs doit être prise sérieusement en
considération.
La prise de conscience peut déjà par exemple passer par une éducation et sensibilisation spécifiques et ciblées.
Les herpétologistes amateurs représentent des vecteurs potentiels de propagation de l’agent pathogène. Pour éviter de
transporter des zoospores d’un étang à l’autre, un protocole d’hygiène après chaque visite d’un étang serait justifié.
Cette étude représente un exemple vertueux d’une collaboration fructueuse, multidisciplinaire, multi-institutionnelle,
alliant sympathie, cordialité et rigueur scientifique. Elle souligne clairement l’intérêt que portent tous les partenaires
à la conservation et la santé de leur environnement. Elle donne la base à des études ultérieures et à une conduite
encore plus responsable.
*Musée National d’Histoire Naturelle
***Office National des Forêt
C .Description des analyses demandées
Du 1 er janvier 2012 au 31 juin 2012, le LRSFS a reçu 57 prélèvements pour des analyses de natures variées :
1. Types de prélèvements
Les différents types de prélèvements
0% 3% 5%
mamifères
insectes
40%
50%
oiseaux
poissons
amphibiens
2%
autre prélèvements
(fientes)

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2. Espèces
Durant ce semestre, les 23 espèces analysées se différencient de la manière suivante :
Détail des espèces analysées au cours du premier semestre
Pie vert
Poules
abeilles

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3. Types d’analyses
D. Synthèse des résultats
1. Pathologies générales (hors études)
Les différentes pathologies
Traumatisme
18
infection
15
intoxication
2
parasitaire
11
mycose
métabolique
1
1
Indéterminée
0

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Maladies à déclaration obligatoire DDPP
2 cas déclarés DDPP77 (tularémie chez un lièvre et botulisme chez un cygne)
2. Principaux faits par département
Demandeurs/ Nombre de
Départements prélèvements
Paris (75) 13
Mairie
de Paris
Museum Paris
10
2
Recherches /Causes de la mort
Traumatisme : 1 renard (bois de Vincennes)
et 2 canards (bois de Boulogne) ; 1 fouine (bois de
Vincennes) ;1 hérisson (bois de Vincennes) ;1 cygne
(bois de Vincennes) ; 1 oie (17 ème arrondissement) ; 1
oie bernache (bois de Vincennes)
Echinoccocus : 1 renard positif (bois de Vincennes)
Intoxication au Temik : 1 pie vert
Pseudomonose : 1 xenopus tropicalis positif
Chytridiomycose : 1 xenopus tropicalis positif
Les Abeilles 1 Varroatose : abeilles positives
Essonne (91) 12
CG91/ERZ
12
Seine et Marne (77) 31
FDC 77
(RESEAU SAGIR)
DDPP77
15
2
Echinococcus multilocularis: 3 positifs à Lisse, La
Norvile et Palaiseau
Intoxication aux anti-coagulants : 1 faisan et 1 lièvre
Tularémie : 1 lièvre
Présence d’échinocoques multiloculaires et une gale
sarcoptique sur un renard
Traumatisme : 6 lièvres (trichurose digestive en plus
sur un sujet) et 1 perdrix grise
Démodécie généralisée: 1 chevreuil
Hémorragie interne: 1 lièvre (résultats toxicologie en
cours)
Yersiniose : 1 lièvre
EBHS : 1 lièvre
Botulisme et polyparasitisme : 1 cygne (RESEAU
SAGIR)
Insuffisance cardiopulmonaire : 1 cygne (stress
important)
FAUNA FILM
PARTICULIERS
Association de
défense des cygnes
7
7
1
Salmonellose : 1moineau
Collibacilose : 1 moineau
Yersiniose : 1 singe saïmiri
Traumatisme : 1 vautour fauve
Tuberculose : 2 poules domestiques
Paramyxovirose : 2 pigeons
Entérite nécrotique et septicémie : 1 canard de
barbarie et 1canard mandarin
Maladie de Marek : 1 poule naine
Trombus cardiopulmonaire (énorme bouchon
œsophagien) : 1cygne

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3. Etudes réseau SAGIR
1 perdrix grise : étude PEGASE
2 lièvres: étude toxico-vigilance colza
4. Stagiaires
1 stagiaire en licence à Créteil, du 2 Avril au 31 Mai 2012
2 stagiaires en BTS ANABIOTEC Reims du 11 juin au 6 juillet 2012
II-Projets
Projet de déménagement du LRSFS à l’IRD de Bondy sur le département de la
Seine Saint Denis
La direction de l’IRD a proposé d’héberger définitivement le LRSFS à Bondy.
Les locaux proposés nécessitent une réfection de l’ensemble des pièces pour mettre en conformité le laboratoire en
appliquant la réglementation de l’arrêté du 16 juillet 2007.
Le LRSFS apportera certainement à l’IRD des connaissances indéniables en matière de Biologie vétérinaire et l’IRD
enrichira de par son savoir-faire le LRSFS dans le domaine de la biodiversité.
Ce projet verra le jour grâce au soutien financier des partenaires mais aussi à la volonté du Conseil Général
93 pour accueillir sur son département le LRSFS.
Répartition de l’investissement pour les travaux à l’IRD de Bondy
Membres
Taux de financement
Région 50%
Partenaires (CG91, CG93, IRD, ERZ) 30%
LRSFS 20%

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Les deux plans ci-dessous illustrent partiellement l’état des locaux avant et après travaux.
Etat des locaux avant travaux
Locaux aménagés après travaux
Salles prévues pour l’aménagement des locaux :
1. Salle d’autopsie
2. Laboratoire de bactériologie vétérinaire
3. Laboratoire de parasitologie et de
mycologie
4. bureau pour collaborateurs et stagiaires
5. Bureau du directeur
6. Salle de réunion
7. SAS
8. Abri
a)Vestiaire
b) Sortie de secours

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