MR thèse 2006-21 - Bibliothèque Ecole Centrale Lyon

Chapitre V – Interface BSA/métal
Les protéines présentent quatre niveaux de structuration :
Feuillet β
Structure primaire
Acides aminés
Structure secondaire
Hélice α
Structure tertiaire
Feuillet β
Hélice α
Structure quaternaire
- La structure primaire : il s’agit de la
séquence linéaire des acides aminés ;
- La structure secondaire : elle décrit la
conformation des protéines c’est-à-dire
l’organisation spatiale et locale de la
séquence primaire. Deux
conformations stabilisées par des
liaisons hydrogènes sont connues. Ce
sont les hélices α et les structures β ;
- La structure tertiaire : elle décrit la
conformation native des protéines dans
l’espace tridimensionnel. Cette
structure est considérée comme la
forme biologiquement active des
protéines. La stabilité
conformationnelle de la structure
tertiaire dépend des conditions
environnementales telles que la force
ionique, le pH, la concentration… ;
- La structure quaternaire : elle est
rencontrée dans les protéines
multimériques. Elle est obtenue par
l’association d’au moins deux chaînes
polypeptidiques, identiques ou
différentes. L’hémoglobine, constituée
de 4 sous-unités, est un exemple de
structure quaternaire.
Figure V-4 : Niveaux de structuration des
protéines
La stabilité conformationnelle des protéines est assurée par plusieurs interactions [Haynes et Norde
1994] :
- Les interactions ioniques s’établissent entre les chaînes latérales chargées des acides aminés. Ces
interactions sont attractives lorsque les charges sont de signes opposées et répulsives dans le cas
de charges de même signe. Au point isoélectrique, les protéines portant autant de charges
positives que de charges négatives ; les interactions ioniques sont nettement attractives et
favorisent la structure compacte des protéines.
- Les liaisons hydrogène s’établissent par le partage d’un atome d’hydrogène entre deux atomes
électronégatifs. La formation d’une liaison hydrogène nécessite :
Un atome électronégatif lié à l’atome d’hydrogène par une liaison covalente polarisée ;
Un second atome électronégatif possédant un doublet électronique libre.
L’énergie de la liaison hydrogène (10 à 40 kJ/mol) est maximale lorsque l’atome d’hydrogène et
ses deux partenaires électronégatifs sont colinéaires, comme dans le cas de l’eau et de la glace.
- Les interactions hydrophobes réfèrent à la déshydratation et l’assemblage consécutif des
groupements apolaires dans un environnement aqueux ;
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