PCEM1 CAHIER D'EXERCICES de BIOCHIMIE 4. Biologie ...

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Cahier d'Exercices de Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 8 2ème CADRE DE LECTURE POTENTIEL 1 11 21 31 G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71 C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111 A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A 3ème CADRE DE LECTURE POTENTIEL 1 11 21 31 G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71 C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111 A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A d. Quel est le cadre de lecture effectivement utilisé pour la synthèse de la protéine e. Si au cours d’une expérience préliminaire on établit la séquence d’un seul brin d’un fragment d’ADN que l’on sait être interne à un gène, il est possible, au moins en théorie de déterminer le sens de la transcription. Comment 3.5.3 L’enchaînement des acides aminés a. Identifier sur la séquence ci-dessous l’extrémité qui code pour la région N-terminale du fragment protéique. Justifier. 1 11 111 GAAAAAACTG AAAT ................................CCTC CATTATCTAA b. Donner dans le tableau II la composition en acides aminés du fragment protéique analysé. TABLEAU II Acide aminé Nombre Acide aminé Nombre ala Alanine leu Leucine arg Arginine lys Lysine asn Asparagine met Méthionine asp Acide Aspartique phe Phénylalanine cys Cystéine pro Proline gln Glutamine ser Sérine glu Acide Glutamique thr Thréonine gly Glycocolle trp Tryptophane his Histidine tyr Tyrosine ile Isoleucine val Valine 3.5.4 Une propriété biologique de la protéine La protéine codée par le gène spo II G interagit avec l’ADN. Ce fait est-il compatible avec la composition en acides aminés du fragment analyse Pourquoi Faculté dedecine Pierre & Marie Curie

Cahier d'Exercices de Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 9 3.5.5 Les nucléotides modifiés chez quelques mutants. Cette protéine peut-être purifiée à partir de la souche sauvage et de 3 mutants affectés dans le gène spo II G. Elle est soumise à une électrophorèse en conditions non dénaturantes; dans ces conditions la migration s’effectue selon la charge électrique. a. Quel nucléotide doit-on trouver en position 71 chez les mutants pour obtenir les profils d’électrophorèse présentés dans le figure I FIGURE I Sauvage Mutant 1 Mutant 2 Mutant 3 + - + Nucléotide G n°71 3.5.6 En résumé : Le tableau III concerne 18 des 120 nucléotides de la séquence TABLEAU III ADN . . . CAT ATA . . . DOUBLE -BRIN . . . GAA . . . ARNm . . . GUC . . . ANTICODON des ARNt ACIDE AMINE CAG lys trp a. Déterminer le sens de transcription. Justifier. b. Orienter l’ARNm, les deux brins de la molécule d’ADN et compléter le tableau III. c. Schématiser par un trait la chaîne polypeptidique en l’orientant et en donnant la position relative des acides aminés déterminés. Faculté dedecine Pierre & Marie Curie

Cahier d'Exercices <strong>de</strong> Biochimie / <strong>PCEM1</strong> <strong>Biologie</strong> Moléculaire / 9<br />

3.5.5 Les nucléoti<strong>de</strong>s modifiés chez quelques mutants.<br />

Cette protéine peut-être purifiée à partir <strong>de</strong> la souche sauvage et <strong>de</strong> 3 mutants affectés dans<br />

le gène spo II G. Elle est soumise à une électrophorèse en conditions non dénaturantes;<br />

dans ces conditions la migration s’effectue selon la charge électrique.<br />

a. Quel nucléoti<strong>de</strong> doit-on trouver en position 71 chez les mutants pour obtenir les profils<br />

d’électrophorèse présentés dans le figure I <br />

FIGURE I<br />

Sauvage Mutant 1 Mutant 2 Mutant 3<br />

+<br />

- +<br />

Nucléoti<strong>de</strong><br />

G<br />

n°71<br />

3.5.6 En résumé :<br />

Le tableau III concerne 18 <strong>de</strong>s 120 nucléoti<strong>de</strong>s <strong>de</strong> la séquence<br />

TABLEAU III<br />

ADN . . . CAT ATA . . .<br />

DOUBLE<br />

-BRIN . . . GAA . . .<br />

ARNm . . . GUC . . .<br />

ANTICODON<br />

<strong>de</strong>s ARNt<br />

ACIDE<br />

AMINE<br />

CAG<br />

lys<br />

trp<br />

a. Déterminer le sens <strong>de</strong> transcription. Justifier.<br />

b. Orienter l’ARNm, les <strong>de</strong>ux brins <strong>de</strong> la molécule d’ADN et compléter le tableau III.<br />

c. Schématiser par un trait la chaîne polypeptidique en l’orientant et en donnant la<br />

position relative <strong>de</strong>s aci<strong>de</strong>s aminés déterminés.<br />

Faculté <strong>de</strong> Mé<strong>de</strong>cine Pierre & Marie Curie

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