PCEM1 CAHIER D'EXERCICES de BIOCHIMIE 4. Biologie ...

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Cahier d'Exercices de Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 6 3.2 Soit le schéma ci-contre représentant un ARNt (avec son anticodon). a. Quel est le nom de l'acide aminé transporté par cet ARNt b. Quel est le nom du nucléotide situé à l'extrémité 3' de cet ARNt c. Par quel type de liaison l'acide aminé sera-t-il lié à cet ARNt 3.3 Combien de liaisons phosphates riches en énergie sont consommées dans la synthèse d'une protéine de 75 résidus d’acide aminé Commenter votre réponse. 3.4. 3.4.1 Soit une séquence de bases présente sur un brin d’ADN (brin 1) ....-G-A-C-T-T-A-C-A-C-G-C-G-A-T-T-T-T-A-T-A-T-A-G-C-.... a. Recopiez cette séquence et écrivez la séquence du brin d’ADN complémentaire (brin 2) b. Sachant que l’ARNm issu de la transcription de ce fragment d’ADN code le début d’une protéine: - déterminez quel est le brin matrice (justifiez votre réponse) et écrivez la séquence de l’ARNm. - orientez toutes les séquences des acides nucléiques; - écrivez la séquence du polypeptide traduit à partir de cet ARNm. c. A la suite d’une mutation, la 10 ème base (G) du brin 1 représenté ci-dessus, a été remplacée par une adénine. Dans un autre mutant, cette même base G a été remplacée par une cytosine. Chez un troisième mutant, la même base G a été remplacée par une thymine. Enfin, chez un quatrième mutant, ce même nucléotide G a été perdu. Ecrivez pour chaque cas les modifications introduites dans les séquences. Qu’advient-il de la protéine dans chaque cas 3.4.2 Le code génétique est dit redondant ou dégénéré. Comment s’exprime cette dégénérescence et quelle remarque peut-on faire à son sujet 3.4.3 On estime que l’ensemble des molécules d’ADN présentes dans le noyau d’une cellule humaine (avant la phase de réplication) représente 6 x 10 9 paires de nucléotides. Quelle longueur totale d’ADN cela représente-t-il Justifiez vos calculs en présentant votre raisonnement. 3.4.4 Quels sont les différents types d’ARN matures présents dans une cellule eucaryote Précisez en 2 lignes maximum (pour chaque type) leur fonction respective. 3.5 PROBLEME SUR LA SEQUENCE, LA TRANSCRIPTION ET LA TRADUCTION DU GENE SPO II G. Cet exercice est organisé autour de l’exploitation d’une séquence nucléotidique. On se propose d’analyser cette séquence en vue d’étudier successivement: - le sens de transcription, - le cadre de lecture - l’enchaînement des acides aminés - une propriété biologique de la protéine, - les nucléotides modifiés chez quelques mutants. Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
Cahier d'Exercices de Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 7 La séquence d’ADN représentée ci-dessous est celle d’un fragment de 120 paires de bases entièrement contenu dans la partie traduite du gène spo II G de la bactérie Bacillus subtilis. 5’P 1 11 21 31 G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71 C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111 A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A 3’ OH 3.5.1 Le sens de transcription a. Sachant que la séquence donnée est celle du brin sens, indiquer par une flèche sur la séquence ci-dessous le sens de progression de la transcription. Justifier. G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T...............G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A 1 11 101 111 3.5.2 Le cadre de lecture a. Théoriquement l’information génétique portée par l’ARN m peut être traduite de trois façons différentes. Pourquoi b. Donner dans le tableau I ci-dessous les différentes séquences prises par les trois codons stop au niveau des trois brins d’acide nucléique. TABLEAU I 5’ P 3’ OH Séquences des codons non-sens ARNm brin d’ADN sens brin d’ADN transcrit 1er type 2ème type 3ème type c. Avec des barres verticales, définir les trois cadres de lecture potentiels de la séquence étudiée. Dans chaque cas encadrer les codons stop. 1er CADRE DE LECTURE POTENTIEL 1 11 21 31 G A A A A A A C T G A A A T T A C G G T T G A C G C A C C T C T G G T A T A A G 41 51 61 71 C T G C T G A T G A A A C T T G G G C T G A A A A G T G A T G A A G T C T A T T 81 91 101 111 A C A T A G G C G G G A G T G A A G C C C T G C C G C C T C C A T T A T C T A A Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
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