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PCEM1 CAHIER D'EXERCICES de BIOCHIMIE 4. Biologie ...

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Cahier d'Exercices en Biochimie / <strong>PCEM1</strong> <strong>Biologie</strong> Moléculaire / 27<br />

1<strong>4.</strong> Les <strong>de</strong>ux séquences <strong>de</strong> 3 nucléoti<strong>de</strong>s en<br />

caractères gras comprennent :<br />

a. un site d’initiation <strong>de</strong> la transcription du gène <strong>de</strong><br />

l’apoA-II<br />

b. un signal <strong>de</strong> fin <strong>de</strong> traduction <strong>de</strong> la protéine<br />

apoA-II<br />

c. un site d’épissage du transcrit primaire <strong>de</strong><br />

l’apoA-II<br />

d. un signal <strong>de</strong> polyadénylation du transcrit<br />

primaire <strong>de</strong> l’apoA-II<br />

e. un élément cis-régulateur d’expression du gène<br />

<strong>de</strong> l’apoA-II<br />

15. Sachant que le gène <strong>de</strong> l’apoA-II comporte 4<br />

exons et que le 1 er exon n’est pas traduit, cet<br />

ADNc :<br />

a. a la même longueur que le gène <strong>de</strong> l’apoA-II<br />

b. a la même longueur que la séquence du gène<br />

<strong>de</strong> l’apoA-II située entre les sites d’initiation et <strong>de</strong><br />

terminaison <strong>de</strong> la transcription<br />

c. a la même longueur que le transcrit primaire <strong>de</strong><br />

l’apoA-II<br />

d. a la même longueur que la séquence codante<br />

du gène <strong>de</strong> l’apoA-II<br />

e. a la même longueur que l’ARNm <strong>de</strong> l’apoA-II<br />

(hors mis la coiffe et la queue polyA)<br />

16. Vous souhaitez à partir <strong>de</strong> ce cDNA, synthétiser<br />

par réaction <strong>de</strong> polymérisation en chaîne (PCR), le<br />

fragment situé entre les <strong>de</strong>ux séquences en<br />

caractères gras. Parmi les constituants suivants,<br />

quels sont ceux que vous utiliserez pour cette<br />

synthèse :<br />

a. l’oligonucléoti<strong>de</strong> : 5’-<br />

ATGAAGCTGCTCGCAGC-3’<br />

b. l’oligonucléoti<strong>de</strong> : 5’-<br />

CAGCCTGCCACCCAGTGA-3’<br />

c. l’oligonucléoti<strong>de</strong> : 5’-<br />

TCACTGGGTGGCAGGCTG-3’<br />

d. les didésoxyribonucléosi<strong>de</strong>s triphosphates :<br />

ddATP, ddTTP, ddGTP, ddCTP<br />

e. une ADN polymérase<br />

17. La température <strong>de</strong> fusion du produit <strong>de</strong> PCR<br />

ainsi obtenu :<br />

a. est i<strong>de</strong>ntique à celle d’un fragment <strong>de</strong> même<br />

taille, constitué uniquement <strong>de</strong> désoxythymidylate<br />

(polydT)<br />

b. est supérieure à celle d’un fragment <strong>de</strong> même<br />

taille, constitué uniquement <strong>de</strong> désoxythymidylate<br />

(polydT)<br />

c. est supérieure à celle d’un fragment <strong>de</strong> même<br />

taille, constitué uniquement <strong>de</strong> désoxyadénylate<br />

(polydA)<br />

d. est supérieure à celle d’un fragment <strong>de</strong> même<br />

taille, constitué uniquement <strong>de</strong> désoxyguanylate<br />

(polydG)<br />

e. est supérieure à celle d’un fragment <strong>de</strong> même<br />

taille, constitué uniquement <strong>de</strong> désoxycytidylate<br />

(polydC)<br />

18. Le produit <strong>de</strong> PCR ainsi obtenu, est soumis à une<br />

digestion par l’enzyme <strong>de</strong> restriction HypCH4 V<br />

pour laquelle il n’existe qu’un site <strong>de</strong> restriction<br />

dans l’ADNc <strong>de</strong> l’apoA-II (situé aux nucléoti<strong>de</strong>s 98-<br />

101), puis à une électrophorèse en gel d’agarose.<br />

Sachant que l’enzyme HypCH4 V hydrolyse l’ADN<br />

<strong>de</strong> la façon suivante :<br />

5’…TG CA…3’<br />

3’…AC GT…5’<br />

vous observerez à l’électrophorèse :<br />

a. <strong>de</strong>ux fragments <strong>de</strong> 41 pb et 262 pb<br />

b. <strong>de</strong>ux fragments <strong>de</strong> 99 pb et 342 pb<br />

c. quatre fragments <strong>de</strong> 41 pb, 99 pb, 262 pb et 342<br />

pb.<br />

d. trois fragments <strong>de</strong> 99 pb, 342 pb et 473 pb.<br />

e. trois fragments <strong>de</strong> 41 pb, 303 pb et 473 pb.<br />

19. Une délétion <strong>de</strong>s <strong>de</strong>ux nucléoti<strong>de</strong>s numérotés<br />

100-101 dans la séquence d’ADNc sera<br />

accompagnée :<br />

a. d’un décalage du cadre <strong>de</strong> lecture<br />

b. <strong>de</strong> la synthèse d’une protéine tronquée (plus<br />

courte que la protéine normale)<br />

c. d’un défaut d’épissage du transcrit primaire<br />

d. d’un changement du 14 ème aci<strong>de</strong> aminé <strong>de</strong><br />

l’apoA-II (le 1 er étant la méthionine)<br />

e. <strong>de</strong> la disparition du site <strong>de</strong> restriction <strong>de</strong> l’enzyme<br />

<strong>de</strong> restriction HypCH4 V dans l’ADNc<br />

20. La séquence d’ADNc d’un sujet homozygote pour<br />

la délétion <strong>de</strong>s nucléoti<strong>de</strong>s numérotés 100-101 est<br />

soumise comme dans la question 4 à une<br />

amplification du fragment situé entre les <strong>de</strong>ux<br />

séquences en caractères gras, puis à une digestion<br />

par l’enzyme <strong>de</strong> restriction HypCH4 V.<br />

Vous observerez à l’electrophorèse en gel<br />

d’agarose :<br />

a. trois fragments <strong>de</strong> 41 pb, 262 pb et 303 pb<br />

b. un fragment <strong>de</strong> 301 pb<br />

c. un fragment <strong>de</strong> 473 pb<br />

d. <strong>de</strong>ux fragments <strong>de</strong> 41 pb et 262 pb<br />

e. <strong>de</strong>ux fragments <strong>de</strong> 99 pb et 342 pb<br />

Faculté <strong>de</strong> Mé<strong>de</strong>cine Pierre & Marie Curie

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