PCEM1 CAHIER D'EXERCICES de BIOCHIMIE 4. Biologie ...

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Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 22 2 La synthèse du brin retardé par l'ADN polymérase se distingue de celle du brin rapide par toutes les différences suivantes, sauf une, indiquer laquelle : a. elle consomme moins de désoxyribonucléosides triphosphates b. elle fait intervenir beaucoup plus souvent les enzymes ADN-primase et ADN-ligase c. elle engendre la production des fragments d'Okazaki d. elle fait appel à des amorces plus nombreuses e elle se fait à contre-sens du déplacement de l'enzyme sur l'ADN 3 L'ADN polymérase humaine est capable de toutes les activités enzymatiques suivantes, sauf une, indiquer laquelle : a.Condensation du phosphate d'un désoxyribonucléotide sur la fonction 3' alcool libre d'un brin d'ADN hybridé à un autre brin servant de modèle b. Hydrolyse de la liaison anhydride entre le premier et les deux autres phosphates d'un désoxyribonucléoside triphosphate c. Condensation du phosphate du désoxyribonucléotide 5' initial d'un brin d'ADN avec le désoxyribonucléotide 3' terminal d'un autre brin d'ADN d. Hydrolyse du désoxyribonucléotide 3' terminal d'un brin d'ADN e. Hydrolyse du ribonucléotide 5' initial d'un ARN 4 L'ADN polymérase catalyse toutes les réactions suivantes, sauf une, indiquer laquelle : a. réparation d'une brèche étendue sur un ADN double brin lésé. b. synthèse d'une liaison ester entre un nucléoside triphosphate et l'extrémité 3'-OH d'un brin d'ADN c. hydrolyse de la liaison ester entre le dernier et l'avant-dernier nucléotides à l'extrémité 3'-OH d'un brin d'ADN d. hydrolyse de la liaison ester entre le premier et le deuxième nucléotides à l'extrémité 5'-phosphate d'un ARN e. synthèse de la liaison ester entre l'extrémité 3'- OH d'un brin d'ADN et l'extrémité 5'-phosphate d'un autre brin d'ADN 5 Au cours de la réplication de l’ADN, l’incorporation d’un désoxyribonucléotide a. est catalysée par une ADN polymérase b. consomme l’énergie fournie par l’hydrolyse de deux liaisons riches en énergie c. peut avoir lieu à l’extrémité 3’-OH ou 5’-OH d’un brin amorce d’ADN d. peut avoir lieu à l’extrémité 3’-OH ou 5’-OH d’un brin amorce d’ARN synthétisé par une primase e. peut avoir lieu à l’extrémité 3’-OH d’un brin amorce d’ARN synthétisé par une télomérase 6 Les ARN polymérases et les ADN polymérases ont en commun les caractéristiques suivantes a. catalysent l’addition d’unités nucléotidiques dans le sens 5’ 3’ b. catalysent la formation de liaisons « phosphodiester » c. nécessitent une chaîne polynucléo-tidique matrice d. nécessitent une chaîne polynucléo-tidique amorce e. possèdent une activité exonucléasique 3’ 5’ 7 Les principes et mécanismes généraux de la réplication a. Il est nécessaire d'ouvrir la molécule d'ADN en un point précis pour procéder enzymatiquement à sa réplication in vivo. b La synthèse d'un brin nouveau d'ADN nécessite toujours la fabrication préalable d'une amorce d'ARN. c. Il existe au niveau d'une fourche de réplication, deux molécules d'ADN polymérases à fonctionnement simultané mais différent, l'une allongeant un brin d'ADN dans le sens 5' --->3' et l'autre allongeant l'autre brin dans le sens 3'--->5'. d. Le brin dit "précoce" est celui à synthèse discontinue et le brin dit "tardif" est celui à synthèse continue. e. Dans une boucle de réplication, les deux fourches progressent en direction opposée, à la même vitesse. 8 L'enzymologie de la réplication a. La primase est une catégorie d'ARN polymérase spécialisée dans la synthèse des amorces d'ARN sur le brin à synthèse discontinue. b. La destruction des amorces d'ARN sur le brin retardé est effectuée par l'enzyme nommée ligase. c. On appelle "ADN hélicase" la protéine séparant les deux brins appariés de la molécule d'ADN à répliquer, au niveau de la pointe de chaque fourche. d. Les enzymes de relaxation, fonctionnant en amont des fourches, suppriment les contraintes mécaniques induites par la progression de la réplication le long de l'ADN. e. Les protéines dites de "stabilisation" se fixent sur les deux double hélices récemment synthétisées pour les protéger de l'action des nucléases. 9 Quelle est l'activité enzymatique, retrouvée chez la plupart des ADN polymérases, qui leur permet d'assurer une très grande fidélité de la réplication a. Activité d'exonucléase 3' ----> 5' b. Activité d'exonucléase 5' ----> 3' c. Activité de polymérase d. Activité d'endonucléase e. Activité de synthèse d'amorce 10 La réplication de l'ADN des eucaryotes a. utilise des désoxyribonucléotides triphosphates. b. fait intervenir de l'ARN. c. débute en un seul site. d. met en jeu des ADN polymérases bidirectionnelles. e. est semi-conservative. 11 Au cours de la réplication a. la croissance de la chaîne se fait toujours dans le sens 5' ----->3' b. les deux brins de l'ADN se séparent grâce à des protéines. c. les précurseurs sont les désoxyribonucléotides pour un brin et les ribonucléotides pour l'autre. d. il y a un épissage de l' ADN néoformé. e.la synthèse est continue pour un brin d'ADN et discontinue pour l'autre. Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 23 12 On rencontre des acides nucléiques hybrides (brins de ribonucléotides et de désoxyribonucléotides liés de façon antiparallèle et complémentaire) dans toutes les circonstances suivantes sauf une, indiquer laquelle : a. entre l'amorce et le brin avancé de DNA au cours de la réplication b. au cours de la transcription inverse du RNA viral c. entre un élément cis-régulateur et un facteur trans-régulateur d. entre l'amorce et le brin retardé de DNA au cours de la réplication e. dans le site catalytique d'une RNA polymérase 13 Toutes ces affirmations concernant la réplication sont vraies sauf une, laquelle : a Les 2 brins de l’ADN parental servent chacun de modèle pour la synthèse d’un nouveau brin au cours de la réplication b. L’hélicase sert à stabiliser les brins séparés c. Les ADN Polymérases ont une activité exonucléasique d. Le Mg++ est essentiel pour l’activité des ADN polymérases e. L’ADN Polymérase est associée à la primase et L’ADN Polymérase est la principale enzyme de réplication en synthétisant sur le brin direct aussi bien que sur le brin retardé 14 Toutes les affirmations concernant la réplication et la réparation ci-dessous sont vraies sauf une, laquelle : a. La télomérase est une ADN polymérase qui peut continuer la synthèse d’un ADN simple brin ; b. Une structure avec entrecroisement de brins de 2 ADN homologues est appelée structure Holliday c. Le remplacement d’un A par un G est une transition d. Le remplacement d’un C par un T est une transversion e. Une mutation somatique n’est pas transmissible à la descendance d’un sujet 5. Altération du matériel génétique et outils de biologie moléculaire 1 Dans la séquence suivante du gène d’une protéine CAGGCCGAGGCCAAAGTAAATCTCA correspondant à l’extrémité 3’ de l’exon 3, qui se traduit par Gln Ala Glu Ala Lys, indiquer quelle transition G A (nucléotides soulignés) est susceptible d’entraîner un empêchement de l’excision épissage de l’intron 3 de cette protéine : a. CAAGCCGAGGCCAAAGTAAATCTCA b. CAGGCCGAGGCCAAAATAAATCTCA c. CAGACCGAGGCCAAAGTAAATCTCA d. CAGGCCGAGACCAAAGTAAATCTCA e. CAGGCCGAAGCCAAAGTAAATCTCA 2 Toutes les lésions moléculaires suivantes peuvent se traduire par un caractère ou une maladie chez l’enfant qui les reçoit dans son patrimoine génétique, sauf une, indiquer laquelle : a. transition GA dans un codon de terminaison b. insertion d’un C dans le codon CCC d’une proline c. délétion de la boîte TATA d. transversion dans le codon d’un acide aspartique e. délétion du site receveur du dernier intron 3 Parmi les mutations nucléotidiques lesquelles vont changer la séquence en acides aminés de la protéine a. mutation silencieuse b. mutation faux sens c. mutation non sens d. mutation somatique e. mutation conservatrice 4 Parmi les propositions suivantes concernant le séquençage de l'ADN par la méthode de Sanger, lesquelles sont exactes a. les réactions parallèles de séquençage ne diffèrent entre elles que par la nature du didéoxynucléotide b. l'ADN à séquencer doit être sous forme double brin c. les réactions de séquence sont des réactions de polycondensation de l'ADN d. chacune des 4 réactions parallèles de séquence se fait en présence d'un seul nucléotide e. la région séquencée est déterminée par la matrice d'ADN et non l'amorce 5 Classer dans l’ordre les étapes de la méthode du « Southern blot » 1 - Electrophorèse 2 - Hybridation 3 - Transfert sur membrane 4 - Digestion de l’ADN par une enzyme de restriction 5 - Autoradiographie a. 4 – 3 – 1 – 2 – 5 b. 1 – 4 – 3 – 5 – 2 c. 4 – 1 – 3 – 2 – 5 d. 2 – 5 – 3 – 4 – 1 e. 1 – 4 – 5 – 3 – 2 6 L’ADN complémentaire a. l’ADN complémentaire est synthétisé par transcriptase inverse à partir d’ARN messager b. les banques d’ADN complémentaire sont identiques quel que soit le tissu humain (foie, poumon, cœur, rein…) à partir duquel elles sont préparées c. les banques d’ADN complémentaire préparées à partir de différents tissus humains (foie, poumon, cœur, rein…) ont en commun les séquences correspondant aux gènes domestiques d. la séquence en acides aminés d’une protéine peut être déterminée à partir d’une séquence d’ADN complémentaire e. la séquence d’un intron peut être déterminée à partir d’une séquence ADN complémentaire 7 Parmi les enzymes suivantes, laquelle ou lesquelles sont utilisées dans la technique de RT-PCR a. ligase b. ADN polymérase thermostable c. transcriptase inverse d. ARN polymérase e. hélicase Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
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