PCEM1 CAHIER D'EXERCICES de BIOCHIMIE 4. Biologie ...

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Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 20 3. Traduction 1 Au cours du cycle d’initiation de la traduction, toutes les liaisons suivantes sont essentielles pour déterminer le cadre de lecture exact, sauf une, indiquer laquelle : a. Fixation d’un Met-ARNt Met dans le site peptidique b. Liaison du l’uracile du codon AUG avec le deuxième nucléotide de l’anticodon c. Liaison de la guanine du codon AUG avec le troisième nucléotide de l’anticodon d. Présence des trois nucléotides suivants (en 3’ du codon AUG) dans le site acide aminé du ribosome e. Liaison du fragment 5’-non-codant de l’ARNm avec les ARNr et protéines du ribosome 2 La lysyl-tRNA synthétase reconnaît spécifiquement tous les ligands suivants, sauf un, indiquer lequel : a. ARNt dont la boucle centrale porte l’anticodon UUU b. ATP c. ion Mg ++ d. Lysine e. ARNt dont la boucle centrale porte l’anticodon AAA 3 La tryptophanyl-tRNA synthétase possède toutes les propriétés suivantes sauf une, indiquer laquelle : a. elle possède un site de liaison spécifique du tryptophane b. elle reçoit de l’énergie lors de l’hydrolyse de l’ATP c. elle transfère spécifiquement le tryptophane sur le peptide au cours de la traduction d. elle active le tryptophane en le liant à un ARNt e. elle n’est active qu’en présence d’un ARN comprenant deux séquences 5’CCA 3’, à deux endroits différents de sa structure primaire 4 Toutes les liaisons suivantes sont hydrolysées ou rompues au cours de l’élongation d’une protéine, à chaque acide aminé incorporé, sauf une, indiquer laquelle : a. Liaison ester à l’extrémité 3’-OH de l’ARNt du site peptidique b. Liaison anhydride d’acides entre les phosphates du GTP lié au ribosome et au facteur eEF2 lors de la translocation du messager c. Liaisons hydrogène entre l’anticodon de l’ARNt devenu libre du site peptidique et le codon de l’acide aminé incorporé à l’étape précédente d. Liaison anhydride d’acides entre les phosphates du GTP fixé sur le facteur eEF1 e. Liaison amide entre l’extrémité COOH-terminale du peptide en cours de synthèse et la fonction amine de l’acide aminé incorporé 5 Au cours de l’élongation, du début d’une protéine, un ribosome se trouve successivement dans les deux états ci-dessous a. site P : ARNt~Val-COOH; site A : ARNt~Leu-Phe-Leu-Ala-Met-NH 2 b. site P : ARNt non chargé ; site A : ARNt~Val- Met -Ala- Leu-Phe-Leu -NH 2 c. site P : ARNt~Val- NH 2; site A : ARNt~Leu-Phe-Leu-Ala-Met -COOH d. site P : ARNt non chargé; site A : ARNt~Val-Leu-Phe-Leu-Ala-Met-NH 2 e. site P : ARNt~Val-Leu-Phe-Leu-Ala-Met- NH 2; site A : ARNt non chargé 6 Au cours de la traduction de l'extrémité 5'- terminale d'un messager dans un polyribosome lié, une ribonucléoprotéine du cytoplasme (Signal Recognition Particle = SRP) provoque tous les effets suivants, sauf un, indiquer lequel a. Transport et fixation du ribosome sur la ribophorine b. Arrêt de l'élongation de la protéine traduite c. Liaison spécifique de cette ribonucléoprotéine avec un récepteur du reticulum endoplasmique. d. Synthèse d'un chaînon d'acides aminés hydrophobes à l'extrémité NH 2-terminale de la protéine traduite. e. Liaison spécifique de cette ribonucléo-protéine avec les acides aminés hydrophobes de l'extrémité NH 2-terminale de la protéine traduite. 7 L'incorporation d'un acide aminé libre comme la leucine, dans la structure primaire d'une protéine en cours d'élongation requiert l'hydrolyse des liaisons riches en énergie suivantes, sauf une, indiquer laquelle : a. ATP AMP + pyrophosphate b. peptidyl-tARN tARN + peptide transféré sur la leucine c. GTP-eEF1 GDP-eEF1 d. GTP GDP + phosphate e. ATP ADP + phosphate 8 Le méthionyl-ARNt a. est nécessaire à l’initiation de la traduction b. comprend l’ARNt dont l’anticodon est 5’ CAU 3’ c. est synthétisé par une réaction enzymatique couplée à l’hydrolyse de 4 liaisons riches en énergie d. est synthétisée par une aminoacyl-ARNt synthétase spécifique de la méthionine e. comporte une liaison ester riche en énergie nécessaire à la formation d’une liaison peptidique entre la méthionine et un autre acide aminé Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
Cahier d'Exercices en Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 21 9 Les ARN de transfert (ARNt) a. représentent le type d’ARN le plus abondant de la cellule b. sont au nombre de 20 c. chacun d’entre eux se lie à un seul aminé d. chacun d’entre eux se lie à un seul codon e. se lient aux acides aminés par l’intermédiaire d’une liaison riche en énergie 10 Quel est (ou quels sont) le(s) triplet(s) nucléotidique(s) du (ou des) anti-codon(s) du (ou des) ARNt Glu s'appariant avec les codons de l'acide glutamique GAA et GAG a. CUU b. CUC c. UUC c. TTC c. CTC 11 Indiquez la ou les propositions exactes a. La fixation du complexe acide aminé ARNt sur l'ARN messager se fait par l'acide aminé. b. Il existe trois triplets différents codant la fin de la synthèse d'une chaîne peptidique. c. Le codon initiateur de la traduction code toujours pour la méthionine. d. Chez les eucaryotes, la transcription et la traduction ont lieu dans le même compartiment cellulaire. e. La transcription d'un gène se fait dans le sens 5' -------> 3'. 12 Parmi les codons suivants quels sont les 2 qui correspondent au codon d'initiation de la traduction d'une part et à l'un des codons de terminaison de chaîne protéique d'autre part a. AUC b. AUG c. UAG d. GAU e. UAC e. La mobilisation du peptidyl-tRNA du site A au site P sur le ribosome est rendue possible par l'hydrolyse de L'ATP 15 Toutes les affirmations concernant la traduction ci-dessous sont vraies sauf une, laquelle a. L’ARN messager mature est toujours traduit dans sa totalité b. Le codon de terminaison de la traduction est UGA c. Le code génétique est fondé sur des mots de 3 lettres les codons d. Le codon de l’ARN m AUG est complémentaire de l’anticodon CAU de l’ARNt e. Le bilan énergétique de la traduction est fonction du nombre d’acides aminés incorporés dans la protéine. 16. Toutes les affirmations concernant la traduction ci-dessous sont vraies sauf une, laquelle a. Le signal peptide est un peptide d’adressage situé à l’extrémité NH2-terminale des protéines à excréter b. L’acylation du peptide néosynthétisé est une modification post– transcriptionnelle du peptide c. Le ribosome catalyse le transfert du peptide situé sur l’ARNt du site P sur la fonction amine de l’acide aminé de l’ARNt du site A. Il utilise l’énergie de la liaison riche en énergie entre le peptide et l’ARNt du site P d. Le complexe ribosomique qui se dissocie de l’ARN messager, nécessite un cofacteur eRF lorsque le site A se trouve en regard d’un codon non sens e. La séquence 5’ non traduite de l’ARN messager est reconnue par des cofacteurs eIF4A, eIF4B et eIF4F qui s’y fixent 13 La séquence nucléotidique de l'anticodon d'un ARNt est 5' -CCU - 3' quelle est dans la séquence suivante d'un ARN messager le triplet nucléotidique qui pourra s'apparier à l'anticodon a. d. b. e. c. 14 Synthèse protéique : a. La synthèse protéique débute par l'aa N terminal et se termine par l'aa C terminal b. Les acides aminés sont activés par une liaison ester aux molécules d'ARN t c.La terminaison d'une synthèse protéique requiert la liaison d'un t RNA terminateurs à un codon stop du mRNA d. On trouve de la thymine dans la majorité des tRNA 4. Réplication et réparation 1 La DNA-polymérase a toutes les activités suivantes au cours de la réplication d'un fragment de chromosome sauf une, indiquer laquelle : a. elle ajoute un nucléotide en liant son phosphate à la fonction alcool en 3' d'un brin d'ADN qu'elle synthétise b. elle hydrolyse les amorces du brin "retardé" en commençant par leur côté 5' c. elle ajoute un nucléotide en liant sa fonction alcool en 3' au phosphate 5' terminal d'un brin d'ADN qu'elle synthétise d. elle hydrolyse l'ARN des amorces du brin "avancé" en commençant par leur côté 5' e. elle ajoute un nucléotide en liant le phosphate à la fonction alcool en 3' d'une amorce d'ARN créée par la DNA-primase Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
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