PCEM1 CAHIER D'EXERCICES de BIOCHIMIE 4. Biologie ...

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Cahier d'Exercices de Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 10 3.6 TRADUCTION 3.6.1 Compléter directement sur le schéma ci-dessous (Figure 1) les légendes qui doivent indiquer : - les sous-unités ribosomales et le principal type d’ARN ribosomal (ARNr) dont elles sont constituées - les sites de fixation peptidique (site P) et acide aminé (site A) du ribosome - les molécules d’ARN messager (ARNm) et d’ARN de transfert (ARNt) - les extrémités N - terminale et C - terminale de la chaîne peptidique en cours de synthèse 3.6.2 Ajouter directement sur le schéma ci-dessous (Figure 2) - le résidu 7-méthylguanosine triphosphate (Gppp) à l’emplacement correct. - la séquence nucléotidique du premier codon de l’ARN messager. - la séquence nucléotidique de l’extrémité 3’ de l’ARN messager. Déduire des informations dont vous disposez sur la séquence d’ARN messager: - la séquence des huit premiers acides aminés du peptide. - la séquence du gène codant ces huit premiers acides aminés. 3.6.3 - Citer quatre étapes nécessaires à l’incorporation du quatrième acide aminé à partir de cet acide aminé libre. Indiquer pour chacune des quatre étapes, si elle est directement couplée à l’hydrolyse de liaison(s) riche(s) en énergie, en précisant le cas échéant, le nombre de liaison(s) riche(s) en énergie hydrolysées. - Citer le nom de l’enzyme et le numéro des étapes qui permettent d’assurer la spécificité du quatrième acide aminé incorporé. 3.6.4 - Dans quel(s) compartiment(s) de la cellule a lieu la synthèse de cette chaîne peptidique - Dans quel(s) compartiment(s) de la cellule a eu lieu la synthèse du ribosome et quel est son devenir immédiat une fois que la synthèse de la chaîne peptidique sera achevée - Dans quel(s) compartiment(s) de la cellule a eu lieu la synthèse de l’ARN messager et quel est son devenir immédiat une fois que la synthèse de la chaîne peptidique sera achevée 3.6.5 Le tableau suivant illustre trois mutations différentes des codons 6 et 7 telles qu’elles apparaissent dans la séquence nucléotidique de l’ARN messager. Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
Cahier d'Exercices de Biochimie / PCEM1 Biologie Moléculaire / 11 Position du codon 1 2 3 4 5 6 7 8 ARNm Normal --- GCU GUU GCU AAU AUC UUU GGU ARNm avec Mutation X Suppression de 3 nucléotides ARNm avec Mutation Y Remplacement de 2 nucléotides ARNm avec Mutation Z Remplacement d’1 nucléotide --- GCU GUU GCU AAU AU U GGU --- GCU GUU GCU AAU AUC UAG GGU --- GCU GUU GCU AAU AUC UUC GGU Citer pour chacune des mutation X, Y et Z: - le type de mutation : - ses conséquences éventuelles sur le cadre de lecture: - ses conséquences éventuelles sur le peptide synthétisé: 4. REPLICATION ET REPARATION 4.1 On incube des extraits solubles de colibacilles contenant de l’ADN avec un mélange de dATP, dTTP, dGTP et dCTP marqués tous avec du 32 P sur le phosphore . Après une période d’incubation, le mélange est traité à l’acide trichloracétique qui précipite l’ADN et laisse en solution les petites molécules. a. Si un des quatre précurseurs manque, on ne trouve pas de radioactivité dans le précipité. Commenter. b. Aurait-on trouvé de la radioactivité si c’était le phosphore ou qui avait été marqué c. Dans la chaîne synthétisée de manière continue suivante, où est l’erreur Comment cette erreur sera-t-elle corrigée Matrice (3’) C - G - T - A - C - A - A - A- C - C - T - G - G - T - T - ...... (5’) Néosynthètisé (5’) G - C - A - T - G - T - T- T- G - G - A - A - ...... (3’) d. Cette chaîne, sous l’influence des UV, peut présenter d’autres altérations. Lesquelles Comment seront-elles réparées 4.2 Quelles sont les caractéristiques principales de la télomérase 4.3 Compléter les propositions suivantes. a. L’enzyme responsable de la synthèse d’ADN dans la réplication comme dans la réparation est l’___________________. b. Lors de la réplication, la région active du chromosome est une structure en forme d’Y appelé une ______________________. c. L’enzyme qui scelle les brèches dans l’hélice lors de la synthèse et de la réparation de l’ADN s’appelle: l’_____________________ . d. Lors de la réplication de l’ADN, le brin fils synthétisé en continu s’appelle:___________, et le brin synthétisé de manière discontinue est appelé_______________ . e. Si l’ADN polymérase positionne un nucléotide incorrect à l’extrémité 3’, un domaine catalytique distinct possédant une activité_________________ enlève la base mal appariée. f. L’initiation de la synthèse d’ADN sur le brin à réplication discontinue requiert de petites_________________ fabriquées par une enzyme appelée__________________, qui a pour substrat des _______________________ . g. La séparation de 2 brins d’ADN au niveau de la fourche de réplication est catalysée par l’__________________, qui se déplace unidirectionnellemment le long de l’ADN grâce à l’énergie fournie par l’hydrolyse d’ATP; Faculté de Médecine Pierre & Marie Curie
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