RA2007 version finale - Institut Louis Malardé

Sommaire
Conseil d’administration -------------------------------------------------- 3
Ressources de l’Institut---------------------------------------------------- 4
Direction générale ------------------------------------------------------------------------------------ 4
Ressources humaines --------------------------------------------------------------------------------- 4
Service financier -------------------------------------------------------------------------------------- 6
Compte financier-------------------------------------------------------------------------------------- 7
Service informatique --------------------------------------------------------------------------------14
Centre de documentation --------------------------------------------------------------------------19
Service technique ------------------------------------------------------------------------------------21
Activités de recherche----------------------------------------------------22
Direction de la recherche---------------------------------------------------------------------------22
Laboratoire de recherche en entomologie médicale ------------------------------------------25
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale------------------------------------------33
Laboratoire de recherche en virologie médicale -----------------------------------------------36
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques--------------------------------------46
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles --------------------------------------50
Activités de santé publique ----------------------------------------------54
Laboratoire d’analyses de biologie médicale ---------------------------------------------------54
Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments----------------------------71
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique ---------------------75
Centre de distribution biomédicale---------------------------------------------------------------77
Collaborations--------------------------------------------------------------84
Formation professionnelle------------------------------------------------86
Congrès et séminaires ----------------------------------------------------87
Communications orales ou posters--------------------------------------88
Publications scientifiques ------------------------------------------------89
Missions ---------------------------------------------------------------------91
Activités d’enseignement/Stages/CVD ---------------------------------94
Manifestations--------------------------------------------------------------96
Rapport annuel 2007 2

Le conseil d’Administration
De janvier à août 2007
Administrateurs
Dr Jules IENFA, Ministre de la Santé, chargé de la prévention, Président
M. Tearii ALPHA, Ministre de l’Education, chargé de l’enseignement supérieur et de la recherche
Mlle Priscille FROGIER, Déléguée à la Recherche ou son représentant
Dr Mareva TOURNEUX, Directrice de la Santé ou son représentant
Mme Maryse OLLIVIER, Représentant à l’Assemblée de la Polynésie française ou son représentant
Mme Louise PELTZER, Présidente de l’Université de la Polynésie française ou son représentant
Mme Kathia ESTALL, Représentant du personnel au Conseil d’Administration
Dr Ngoc Lam NGUYEN, Représentant du personnel au Conseil d’Administration
Participant de droit
M. Jacques ILTIS, Représentant de l’Institut de Recherche pour le Développement en Polynésie française
ou son représentant
Mme Yolande VERNAUDON, Chef du service de l’Inspection Générale de l’Administration ou son
représentant
Mme Nancy MAO CHE, Commissaire du Gouvernement
M. André BRUSON, Trésorier des Etablissements Publics
Dr René CHANSIN, Directeur Général de l’Institut Louis Malardé
Sur invitation
M. Rémy TEYSSOU, Directeur de la Recherche, Institut Louis Malardé
M. François HERMIER, Chef du service financier, Institut Louis Malardé
De août à décembre 2007
Administrateurs
Dr Charles TETARIA, Ministre de la Santé, chargé de la prévention, de la sécurité alimentaire et de la
médecine traditionnelle, Président
M. Jean-Marius RAAPOTO, Ministre de l’Education, de l’Enseignement supérieur et de la recherche, chargé du
plurilinguisme et de la promotion des langues polynésiennes
Mlle Priscille FROGIER, Déléguée à la Recherche ou son représentant
Dr Mareva TOURNEUX, Directrice de la Santé ou son représentant
Mme Fabiola TAATA, Représentant à l’Assemblée de la Polynésie française ou son représentant
Mme Louise PELTZER, Présidente de l’Université de la Polynésie française ou son représentant
Mme Kathia ESTALL, Représentant du personnel au Conseil d’Administration
Dr Ngoc Lam NGUYEN, Représentant du personnel au Conseil d’Administration
Participant de droit
M. Jacques ILTIS, Représentant de l’Institut de Recherche pour le Développement en Polynésie française
ou son représentant
Mme Yolande VERNAUDON, Chef du service de l’Inspection Générale de l’Administration ou son
représentant
Mme Nancy MAO CHE, Commissaire du Gouvernement
M. André BRUSON, Trésorier des Etablissements Publics
Pr Rémy TEYSSOU, Directeur Général par intérim de l’Institut Louis Malardé
Sur invitation
M. François HERMIER, Chef du service financier, Institut Louis Malardé
Rapport annuel 2007 3

Les ressources de l’Institut
Direction générale
L’équipe
René CHANSIN, directeur général (jusqu’au 15 août 2007)
Rémy TEYSSOU, directeur général par intérim (à compter du 15 août 2007)
Aurélie SUNARA, directeur général adjoint (jusqu’au 31 octobre 2007)
Francis DENGREMONT, attaché de direction (jusqu’au 15 septembre 2007)
Michèle MOURLON, responsable qualité (jusqu’au 31 août 2007)
Dorothéa PONS, secrétaire
Marie-Claude RENARD, secrétaire
Débora TUTAIRI, planton
Les ressources humaines
L’organigramme
Direction générale
(1 pers)
Direction de la recherche
(2 pers)
Département de la recherche
Département administratif
Virologie médicale
(3 pers)
Parasitologie médicale
(2 pers)
Entomologie médicale
(7 pers)
Micro-algues toxiques
(6 pers)
Substances naturelles
(2 pers)
Analyses de biologie médicale
(32 pers)
Analyses de la salubrité des eaux et des aliments
(11 pers)
Consultation médicale et investigation épidémiologique
(2 pers + 1 poste à pourvoir début 2008)
Distribution biomédicale
(3 pers)
Secrétariat de direction
(3 pers)
Ressources humaines
(1 pers)
Finances
(15 pers)
Informatique
(3 pers)
Centre de documentation
(1 pers)
Service technique
(7 pers)
Service qualité
(1 poste à pourvoir début 2008)
Effectif au 31 décembre 2007 : 101
Rapport annuel 2007 4

La structure du personnel
L’effectif au 31 décembre 2007 fait apparaître une baisse par rapport à décembre 2006. Celle-ci
s’explique par le départ, au cours du second semestre, de plusieurs salariés. Elle devrait s’infléchir début
2008 avec les recrutements prévus sur les postes vacants.
L’effectif se compose comme suit : 13 fonctionnaires détachés de la Fonction publique et 88 salariés
relevant du droit privé (ANFA et assimilés), parmi lesquels 5 en contrat à durée déterminée.
S’ajoutent également 3 salariés recrutés en remplacement de salariés temporairement absents, non
comptabilisés dans l’effectif.
ILM Salariés relevant du droit privé FPT Divers
Au
31.12.06
Au
31.12.07
CC1 CC2 CC3 CC4 CC5 Total A B Total Total
Effectif
total
20 35 17 13 5 90 6 8 14 1 1 105
18 34 18 13 5 88 6 7 13 0 0 101
Les mouvements de personnel
Les recrutements
L’équipe du Laboratoire de recherche en entomologie médicale s’est étoffée grâce à l’embauche d’un
entomologiste senior, pour une durée de trois ans, et d’un aide-technicien à mi-temps (CDD d’un an) pour
la mise en œuvre du programme de recherche mené en collaboration avec l’Université du Kentucky. On
retiendra également le recrutement d’une infirmière (CDD de 2 mois) dans le cadre des recherches sur la
Transition alimentaire en Polynésie française et d’un technicien (CDD de 6 mois et 4 mois) chargé de
l’évaluation du programme de lutte biologique contre le miconia aux Iles-sous-le-Vent et aux Marquises.
Par ailleurs, un bioinformaticien (CDD d’1 an) s’est vu confier une mission de transfert de compétences en
bioinformatique et phylogénie appliquée à la recherche biomédicale au profit des scientifiques de l’ILM.
Au LABM, deux techniciennes supérieures de laboratoire ont été recrutées (CDD de 5 mois et 2 mois) pour
la réalisation des analyses de biologie médicale dans le cadre de la convention de veille sanitaire conclue
avec la Direction de la santé. Enfin, au LASEA, un agent administratif (CDD 2,5 mois) a mis en place la
logistique relative à l’exportation de produits végétaux vers la Nouvelle-Zélande suite à la signature de
contrats d’analyses concernant la présence de pesticides dans les fruits et légumes.
Les conditions de recrutement et de rémunérations imposées à l’ILM n’ont pas permis de négocier le
recrutement envisagé d’un épidémiologiste confirmé mais le Conseil d’administration, en sa séance du
18 octobre 2007, a validé la création d’un poste budgétaire de catégorie 2, à compter du 1 er janvier 2008,
afin de permettre au LABM de développer des outils de biologie moléculaire au profit du diagnostic et des
activités de santé publique et pérenniser les activités de routine.
S’agissant des recrutements, la Direction souligne sa volonté de prioriser l’emploi local, conformément à
la réglementation, mais au-delà de favoriser l’embauche et la formation de jeunes diplômés d’origine
polynésienne encore inexpérimentés.
En parallèle, trois étudiants bénéficiaires de contrat de volontaire au développement (CVD) ont été
accueillis dans les laboratoires de recherche.
Les départs
Deux contrats à durée déterminée conclus grâce à un financement de l’Etablissement pour la prévention
(EPAP) sont arrivés à leur terme : celui du chargé de mission responsable du programme de prévention de
la maladie d’Alport et celui de l’ingénieur de recherche affecté au LSN dont la mission se poursuit dans le
cadre d’une convention d’accueil en stage doctoral.
Le second semestre a été marqué par plusieurs démissions au sein de l’équipe de Direction : Directeur
général, Directeur général adjoint, chargée des ressources humaines et responsable qualité. L’attaché de
direction a également négocié la rupture anticipée de son CDD et l’infirmière du LABM sollicité la fin de
son détachement au sein de l’établissement. Le Pr Rémy TEYSSOU, Directeur de la recherche et Directeur
général adjoint par intérim depuis le 18 avril 2007 a été nommé Directeur général par intérim par arrêté
n°1100/CM du 02 août 2007. La priorité a alors été donnée à l’embauche d’une chargée des ressources
humaines, en novembre 2007. Ainsi, le recrutement sur certains postes permanents ne sera finalisé qu’au
premier semestre 2008.
Quatre salariés ont fait valoir leur droit aux congés de longue durée (congé sabbatique ou de formation,
congé sans solde et congé parental). Trois des postes ont fait l’objet d’un remplacement temporaire. Dans
le même temps, un agent du CIE a réintégré ses fonctions à l’issue d’une disponibilité d’un an.
Rapport annuel 2007 5

Enfin, un adjoint administratif du service de la recette et un agent d’entretien du service technique ont
bénéficié du dispositif de départ anticipé à la retraite prévu par l’annexe XI de la Convention collective
des ANFA et ont quitté leur poste le 31 décembre 2007. Leur départ ouvre une réflexion sur les possibilités
de redéploiement de leurs fonctions en interne ou de négociation d’un contrat de prestations de services.
Les changements d’affectation
La Direction générale s’est engagée à encourager, dans la mesure du possible, le développement des
compétences et la mobilité des personnels en interne. Un agent de saisie du LABM a ainsi renforcé l’équipe
de recherche sur la Transition alimentaire, à l’occasion de ses missions à Papeete et Tubuai, puis été
détaché, pour une durée indéterminée, au LASEA en qualité d’agent de prélèvements. A sa demande,
l’infirmière du CIE a été affectée au LABM en décembre. De la même manière, une technicienne
supérieure de laboratoire du LABM devrait être affectée début 2008 au LASEA puis au LSN.
L’évolution de fonctions
Le chargé de recherche du LVM s’est vu confier la responsabilité du laboratoire. Le responsable de l’unité
de microbiologie du LASEA a été nommé directeur du laboratoire pour une durée de deux ans tandis que le
responsable de l’unité de chimie analytique a été nommé directeur adjoint.
L’équipe
Emmanuelle BOUSQUIE, chargée des Ressources humaines (jusqu’au 23 août 2007)
Tauareva GUYVET, chargée des Ressources humaines (depuis le 2 novembre 2007)
L’activité du service
Composé d’une unique personne, le service a la responsabilité de l’intégralité de la gestion des ressources
humaines : réalisation de la paie, procédures de recrutement ou de départ, gestion des avancements, des
congés, maladies, maternités, dialogue social, médecine du travail, etc., en relation étroite avec les
services référents (Inspection du Travail, Caisse de Prévoyance Sociale, Service des Contributions, Service
de l’Emploi, de la Formation et de l’Insertion Professionnelle…) et en application des exigences
réglementaires et conventionnelles.
Il convient de noter que cette charge de travail a laissé peu de disponibilité à la chargée des RH pour
l’élaboration d’une véritable politique de gestion du personnel (plan de formation notamment). De même,
la Direction générale a subordonné les travaux préparatoires sur l’accord visant à harmoniser les statuts
des personnels à l’obtention d’une lettre de mission du Ministre de la santé qui en dicterait les grandes
orientations. Dans cette attente, le projet a été ajourné.
La démission, en août, de la chargée des ressources humaines et la vacance consécutive du poste pendant
plusieurs semaines ont été partiellement compensées par le chef du Centre de documentation qui assurait
auparavant ces fonctions. Au mois de novembre, le poste était de nouveau pourvu. Le chef du Centre de
documentation s’est vu confier, pendant trois mois, une mission d’encadrement auprès de la chargée des
RH s’agissant de la formation aux procédures de travail et aux outils informatiques et de la transmission
des dossiers.
En fin d’année, les élections des délégués du personnel et des représentants du personnel au Comité
d’entreprise ont été organisées. Les représentants ont été élus au 1 er tour, le 13 novembre 2007.
Enfin, le règlement intérieur, adopté par le Conseil d’administration, en sa séance du 20 février 2007, qui
n’avait pas été déposé au greffe du tribunal en raison d’un climat social jugé peu propice par la
précédente Direction, a été rendu applicable à la date du 5 décembre 2007.
Le service financier
L’équipe
François HERMIER, chef de service
Brigitte CHANE, chargée de la Dépense
Moeata LAUSAN, chargée de la Recette
Marie-France BOURGEOIS, adjoint - chargée Recette
Geoffrey VIDAL, adjoint - chargée Dépense
Rodrigue AH MIN, adjoint administratif
Nicole BENNETT, adjoint administratif
Marcelle ESTALL, adjoint administratif
Wilfrid GUILLOUX, adjoint administratif
Guy JACQUET, adjoint administratif
Ghislaine LICHENG, adjoint
administratif
Vaea RICHMOND, régisseur
Guy TERIA, adjoint administratif
Pascale TIMIONA, adjoint administratif
Walter TIMIONA, adjoint administratif
Rapport annuel 2007 6

Le compte financier
Le bilan financier
Les moyens financiers
Les moyens financiers mis à la disposition de l’établissement au cours des trois derniers exercices ont
évolué comme suit :
D é s i g n a t i o n
2 0 0 5 2 0 0 6 2 0 0 7
Valeur % Valeur % Valeur %
Subvention Pays 441 108 917 35,50% 354 700 000 30,26% 344 000 000 28,70%
Subvention Etat 60 103 966 4,84% 0 0,00% 1 789 976 0,15%
Ressources propres 718 188 385 57,79% 773 685 434 66,01% 821 029 268 68,51%
Autres ressources 23 266 231 1,87% 43 621 754 3,73% 31 603 268 2,64%
TOTAL 1 242 667 499 1 172 007 188 1 198 422 512
Les ressources propres proviennent des activités de laboratoire et des produits de la vente des sérums et
vaccins.
1 400
1 200
1 000
800
600
400
Autres ressources
Ressources propres
Subvention de l’Etat
Subvention du Pays
200
0
2005 2006 2007
Les moyens financiers (en millions de Fcfp)
Les faits marquants de l’exercice
La section fonctionnement
Le budget exécuté en 2007 constate des recettes à hauteur de 1 198 422 512 Fcfp et des dépenses nettes
de 1 349 864 928 Fcfp. Au terme de l’exercice, le résultat comptable est déficitaire à hauteur de
151 442 416 Fcfp.
Rapport annuel 2007 7

Charges financières,
exceptionnelles, impot
et taxe (63, 66, 67)
Dotation aux
amortissements (68)
Charges de
personnels (64)
Produits financiers &
exceptionnels (76,77)
Subvention
d'exploitation
(74)
Services extérieurs
(61, 62)
Produits - Ventes
(70)
Achats (60)
CHARGES
PRODUITS
1 349 Millions Fcfp 1 198 Millions Fcfp
Les produits
Les recettes de l’exercice 2007 s’élèvent à 1 198 422 512 Fcfp, soit une hausse de 26 415 324 Fcfp (2%)
par rapport à celles de 2006.
Nature des Produits 2005 2006 2007 Variat°2007/ 2006
Valeurs des prestations de service,
des ventes de marchandises
718 188 385 773 685 434 821 029 268 47 343 834 6%
Subventions d'exploitation 1 501 212 883 354 700 000 345 789 976 -8 910 024 -3%
Produits financiers 88 138 376 763 204 157 -172 606 -46%
Produits exceptionnels 23 178 093 43 244 991 31 399 111 -11 845 880 -27%
Reprises sur amortissements et
provisions
0 0 0 0
Total 1 242 667 499 1 172 007 188 1 198 422 512 26 415 324 2%
Cette hausse des recettes s’explique par :
une hausse de l’activité du LABM avec entre autre, en matière de veille sanitaire, l’épidémie de
dengue ;
un accroissement sensible de l’activité du LASEA ;
un maintien du DBM ;
la baisse des produits exceptionnels de 11 845 880 Fcfp par rapport à 2006 est due à de plus faibles
remboursements (CPS, clients, entreprises).
Les dépenses de fonctionnement
Ecarts avec l’autorisation budgétaire
En section de fonctionnement, le montant total des charges est de 1 349 864 928 Fcfp pour une
autorisation budgétaire de dépenses votée à hauteur de 1 432 284 000 Fcfp, soit une exécution du budget
à hauteur de 94 %.
L’écart entre les prévisions et les réalisations s’élève à 82 419 072 Fcfp. Les volumes budgétaires non
exécutés se concentrent principalement sur les points suivants :
Chapitre 60 - Achats : 21 860 940 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, la subvention prévue n’ayant pas été versée dans les délais, il ne nous a pas été
permis de régler certaines dépenses ou engager de nouvelles actions. Ceci explique le montant de
crédits disponibles.
Chapitre 61 - Services extérieurs : 2 807 404 Fcfp de crédits disponibles.
1
Les subventions intègrent la subvention d’exploitation versée par le Pays, les financements sur le Contrat de
Développement, les financements EPAP et sur les Contrats d’Objectifs Santé Etat-Territoire.
Rapport annuel 2007 8

Au sein de ce chapitre, le volume budgétaire non exécuté touche plus précisément les frais d’entretien
et réparation sur matériels de transport et informatique.
Chapitre 62 - Autres services extérieurs : 8 544 469 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, le volume budgétaire non exécuté touche plus précisément les frais
poste/communication (626), les frais divers (628).
Chapitre 64 - Charges de personnel : 5 480 371 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, le très faible volume budgétaire non exécuté tient du fait qu’il n’y a pas eu tous
les départs à la retraite prévus.
Chapitre 69 – Charges exceptionnelles : 41 724 000 Fcfp de crédits disponibles.
Evolution par rapport à l’exercice précédent
Les évolutions des dépenses par rapport à l'exercice 2006 sont données ci-après :
Nature des Dépenses Compte 2006 2007 Variat°2007/ 2006
Achats et variation de stocks 60 338 057 974 382 299 060 28% 44 241 086 13%
Achats de sous-traitance et services
extérieurs
Autres services extérieurs
(en relation avec l'activité)
Autres impôts, taxes et versements
assimilés
61 24 566 565 22 242 596 2% -2 323 969 -9%
62 77 264 506 91 185 631 7% 13 921 125 18%
63 148 560 153 801 0% 5 241 4%
Charges de personnel 64 635 749 214 719 169 529 53% 83 420 315 13%
Autres charges de gestion 65 13 370 794 1% 13 370 794
Charges financières 66 1 175 309 3 079 756 0% 1 904 447 162%
Charges exceptionnelles 67 38 439 131 28 665 476 2% -9 773 655 -25%
Dotations aux amortissements
et aux provisions
68 74 222 117 84 098 285 6% 9 876 168 13%
Impôt sur les bénéfices 69 61 700 013 5 600 000 0% -56 100 013 -91%
Total 1 251 323 389 1 349 864 928 100% 98 541 539 8%
Les principaux postes de dépenses sont :
Les charges de personnel - chapitre 64 - (soit 719 169 529 FCFP) : 53 % du total des charges en 2007.
La masse salariale connaît une croissance structurelle de l’ordre de 13% liée à de nombreux
recrutements dans le cadre de programme (DOBSON, Transition alimentaire), mais aussi par la prise en
charge de stagiaires (thésarde, CVD, allocation de recherche).
Les achats - chapitre 60 - (soit 382 299 060 Fcfp) : 28 % du total des charges.
La hausse de ce chapitre s’élève à 44 241 086 Fcfp. Elle est due :
- A la hausse de l’activité du LABM (épidémie de dengue), du DBM et à moindre échelle du LASEA,
- à la hausse de l’activité et à la réalisation de projets de recherche (programme DOBSON, ERANET,
Transition alimentaire).
Les autres charges externes - chapitres 61 et 62 - (soit 113 428 227 Fcfp) : 9 % des dépenses de
fonctionnement ;
La hausse des dépenses sur le chapitre 62 (13 921 125 Fcfp) est liée à une augmentation des frais de
mission (programme de recherche), à une augmentation des frais de sous-traitance ainsi qu’à la
maintenance des matériels de laboratoire et informatique.
Les charges exceptionnelles – chapitre 67 – (soit 28 665 476 Fcfp) : 2% du total.
La baisse s’explique par le non rappel de la TVA sur 2007.
Les dotations aux amortissements et provisions - chapitre 68 - (soit 84 098 285 Fcfp) : 6 % du total.
Les impôts sur les bénéfices - chapitre 69 - (soit 5 600 000 Fcfp) : 1% du total.
Les opérations en capital
Les recettes de la section II
Au titre des opérations en capital, 85 003 399 Fcfp ont été réalisés sur une prévision budgétaire de
75 000 000 Fcfp, soit un montant réalisé en plus de 10 003 399 Fcfp.
Rapport annuel 2007 9

Les dépenses de la section II
Au titre des opérations en capital, 87 169 118 Fcfp ont été consommés sur l’autorisation budgétaire de
164 750 447 Fcfp soit un taux de réalisation de 52,9 %.
Les immobilisations incorporelles
Concernant les immobilisations incorporelles (chapitre 20), les crédits non utilisés (6 919 506 Fcfp)
concernent en grande partie le report sur 2007 d’acquisitions de logiciels informatiques et des licences
d’exploitation. Seulement 931 491 Fcfp ont été consommé sur l’exercice 2007, soit un taux de réalisation
de 13,4%.
Les immobilisations corporelles
S’agissant des constructions (compte 213), 17 953 928 Fcfp ont été réalisés sur une autorisation
budgétaire de 17 983 927 Fcfp, soit un taux de réalisation de 99,8 %.
S’agissant des installations et des matériels techniques (compte 215), 29 703 954 Fcfp ont été réalisés
sur une autorisation budgétaire de 47 702 048 Fcfp, soit un taux de réalisation de 62,2 %.
S’agissant des autres immobilisations corporelles (compte 218), 8 995 977 Fcfp ont été réalisés sur une
autorisation budgétaire de 15 432 043 Fcfp, soit un taux de réalisation de 58,2 %.
S’agissant des autres immobilisations corporelles en cours (compte 231), 5 211 841 Fcfp ont été
réalisés sur une autorisation budgétaire de 40 000 000 Fcfp, soit un taux de réalisation de 13,1 %.
L’examen du compte financier
L’exécution du budget de l’exercice
Les éléments déterminants du résultat
Tableau simplifié des soldes intermédiaires de gestion
PRODUITS CHARGES SOLDES INTERMEDIAIRES
Ventes et Production 821 029 268 Achats & Serv. Ext. 495 727 287 Valeur Ajoutée 325 301 981
+ Subvention 345 789 976 + Impôt et Taxes 153 801
d'exploitation + Charges de pers. 719 169 529
Total 1 166 819 244 Total 1 215 050 617 Excéd. brut d'exploit. -48 231 373
+ Autres produits
d'exploit
0
+ Dot. amort
et autres charges
97 469 079 -97 469 079
Produits d'Exploit. 1 166 819 244 Charges d'Exploit. 1 312 519 696 Résultat d'Exploit. -145 700 452
Produits Financiers 204 157 Charges Financ. 3 079 756 Résultat Financier -2 875 599
Produits Except. 31 399 111 Charges Except. 28 665 476 Résultat Except. 2 733 635
Impôts 5 600 000 Impôts -5 600 000
Solde débiteur Solde créditeur -151 442 416 Résultat -151 442 416
Evolution par rapport aux exercices précédents
Désignation 2005 2006 2007
Résultats d’exploitation 151 522 501 -21 623 502 -145 700 452
Résultat financier -2 350 456 -798 546 -2 875 599
Résultat exceptionnel 21 633 085 4 805 860 2 733 635
Impôt / Sociétés -12 679 300 -61 700 013 -5 600 000
Total 151 522 501 -79 316 201 -151 442 416
Rapport annuel 2007 10

Impôt / Sociétés
200
150
100
50
Résultat exceptionnel
Résultat financier
Résultats
d’exploitation
0
-50
-100
-150
-200
2005 2006 2007
Tel qu’il apparaît au compte de résultat simplifié ci-dessus, le déficit est surtout composé du résultat
d’exploitation et de l’impôt.
La baisse du résultat d’exploitation repose sur :
la baisse de la subvention d’exploitation suite à des financements moindres de la part d’organismes
extérieurs (EPAP, Contrats de développements, etc.),
la hausse des charges de personnels qui est due à des recrutements temporaires dans le cadre de
programme de recherche,
la hausse des amortissements suite à de nombreux investissements.
L’Impôts/Sociétés est de 5 600 000 Fcfp puisque l’exercice 2006 avait un résultat déficitaire.
Retraitement du résultat et analyse complémentaire
Le résultat de l’exercice peut être retraité en retirant les éléments exceptionnels ou ponctuels de
l’exercice 2007. Il se présente comme suit :
Le versement des subventions liées au Contrat de Développement, EPAP et
- 17 781 091
autres
Les créances irrécouvrables (FIDES, FED, Philippon) +18 848 882
Les pénalités de retard de paiement de la TVA et de l’IS,
+ 4 499 542
Les charges exceptionnelles sur le procès Tavanae, +4 027 205
9 594 538
+ Résultat de l’exercice - 151 442 416
+ Résultat retraité - 141 847 878
Le résultat retraité est déficitaire de - 141 847 878 FCFP.
L’évolution de la structure financière de l’établissement
La situation patrimoniale
ACTIF 2005 2006 2007
Actif Immobilisé 495 212 423 498 553 686 478 479 877
o Brut 1 492 468 564 1 569 126 830 1 109 042 480
o Amortissements 997 256 141 1 070 573 144 630 562 603
Actif circulant 746 604 718 655 718 088 525 488 080
o Brut 767 813 751 676 927 121 546 697 113
o Provisions 21 209 033 21 209 033 21 209 033
Total 1 241 817 141 1 154 271 774 1 003 957 967
Rapport annuel 2007 11

P a s s i f 2005 2006 2007
Capitaux propres 1 115 442 771 1 027 997 965 868 641 936
Provisions
Dettes 126 374 370 126 270 725 135 326 021
o Dont DMLT (emprunt) 29 107 066 24 607 200 10 281 285
o Dettes d’exploitation 97 267 304 101 666 609 125 044 736
Régularisation 0 0
Total 1 241 817 141 1 154 271 774 1 003 957 967
La valeur patrimoniale est en baisse de 150 313 807 Fcfp (- 13 %).
A l’actif, cette baisse notable s’explique par une forte diminution de notre trésorerie mais dans une
moindre mesure de nos créances.
Au passif, ce sont les capitaux propres qui baissent (car résultat déficitaire).
Le fonds de roulement
Le fonds de roulement s’établit à 575 263 596 Fcfp. Son évolution sur les derniers exercices est donnée
ci-après :
2005 : 670 546 447 Fcfp,
2006 : 575 260 512 Fcfp,
2007 : 421 652 377 Fcfp,
Par rapport à l’exercice précédent, le fonds de roulement est en baisse de 153 611 219 Fcfp sur une
diminution prévue de 178 540 731 Fcfp. La décomposition de son calcul est donnée ci-après.
2005 2006 2007 Variations 2007/ 2006
+ Capitaux propres 1 115 442 771 1 027 997 965 868 641 936 -159 359 113 -16%
+ Emprunts 29 107 066 24 607 200 10 281 285 -14 325 915 -58%
+ Provisions pour dépréciations
des créances
21 209 033 21 209 033 21 209 033 0 0%
Ressources stables 1 165 758 870 1 073 814 198 900 132 254 -173 685 028 -16%
Emplois durables : Actif
Immobilisé
495 212 423 498 553 686 478 479 877 -20 073 809 -4%
Fonds de roulement 670 546 447 575 260 512 421 652 377 -153 611 219 -27%
Fonds de roulement net 649 337 414 554 051 479 400 443 344 -153 611 219 -28%
Trésorerie 282 305 707 214 442 719 48 610 143 -233 695 564 -83%
Le diagramme ci-dessous met en évidence :
les évolutions du fonds de roulement (FR) et de la trésorerie,
la part des provisions pour dépréciation des créances dans le fonds de roulement.
Rapport annuel 2007 12

700
Nb de jour FdR
600
500
400
Trésorerie
300
200
100
-
Provisions pour
dépréciations
des créances
Nb de jour FdR 2005
Trésorerie 2005
FR 2005
Nb de jour FdR 2006
Trésorerie 2006
FR 2006
Nb de jour FdR 2007
Trésorerie 2007
FR 2007
Fonds de
Roulement Net
La trésorerie de l’établissement en fin d’exercice s’élève à 48 610 143 Fcfp. Ce montant qui reste
exceptionnel, dû à une situation particulière (versement tardif de la subvention), ne nous permettrait pas
de fonctionner. Cette situation fâcheuse et temporaire n’a pu être réglée que par un étalement de notre
règlement sur plusieurs mois, avec pour résultat de pénaliser nos fournisseurs locaux.
C’est pourquoi, un montant plancher de trésorerie devra être respecté afin de pallier toute éventualité et
surtout contribuer au maintien (à notre niveau) de l’activité économique du Pays.
L’endettement
Le taux d’endettement et le ratio d'indépendance financière sont donnés dans le tableau ci-dessous.
2 0 0 4 2 0 0 5 2 0 0 6
Taux d'endettement
(Somme des dettes/Capitaux
propres)
Ratio d'indépendance financière
(Capitaux propres / Emprunt)
13,5% 11,3% 15,6%
25,27 38,32 84,49
Taux d'endettement
Ratio d'indépendance financière
20%
15%
10%
5%
100
80
60
40
20
0%
2 005 2 006 2 007
-
2 005 2 006 2 007
Rapport annuel 2007 13

L’affectation des résultats
Le compte financier de l’Institut Louis Malardé est arrêté pour l’exercice 2007 :
pour les produits, à la somme de :
1 198 422 512 Fcfp,
pour les charges, à la somme de :
1 349 864 928 Fcfp,
pour les recettes en capital, à la somme de :
85 003 399 Fcfp,
pour les dépenses en capital, à la somme de :
87 169 118 Fcfp.
Le résultat est déficitaire et ainsi arrêté à la somme
de 151 442 416 Fcfp et la perte des recettes sur les
dépenses, en capital, à la somme de 2 165 719 Fcfp.
Le résultat budgétaire de la section de
fonctionnement et de la section d’investissement
consolidé de 2007est arrêté :
en dépenses à 1 437 034 046 Fcfp,
en recettes à 1 283 425 911 Fcfp.
L’ensemble des activités de l’Institut Louis Malardé
menées en 2007 a dégagé un résultat budgétaire
consolidé déficitaire de 153 608 135 Fcfp.
Résultat budgétaire
2005 2006 2007
167 560 283 - 95 285 935 -153 608 135
En Fcfp
200
150
100
50
0
-50
Il convient d’affecter la somme de 151 442
416 Fcfp au compte 110 (report à nouveau
débiteur).
Le service informatique
-100
-150
-200
2005 2006 2007
en Millions Fcfp
L’équipe
Denis MARIN, chef de service (disponibilité à compter du 31 août 2007)
Frank LEMASSON, chef de service (depuis le 30 mai 2007)
Christian HUGUES, technicien
Joël MOUX, technicien
L’activité du service
Le service informatique a pour principales missions :
la maintenance et l’exploitation du système d’information et du réseau téléphonique,
la fourniture d’un service de « hot-line » auprès des utilisateurs,
la mise en place et l’exploitation de nouveaux logiciels ou progiciels,
le suivi et la gestion du parc informatique (matériels et logiciels),
le développement de nouveaux applicatifs clients à la demande des différents services de l’ILM.
Optimisation et disponibilités du système d’information
Messagerie
Pour garantir l’acheminement des messages, gérer les priorités (les messages les plus importants doivent
être acheminés et traités en premier), permettre le chiffrement et la signature des messages, nous avons
décidé après étude de migrer notre messagerie anciennement sous NT sous PostFix. L’étude préalable à
démontrée que cette opération permettrait de réduire notre TCO et de maintenir une disponibilité accrue
des systèmes e-mail, ainsi que la productivité des utilisateurs (gestion des RDV, tâches,..). Cette étude à
permis aussi de déterminer les systèmes et machines pré-requis pour déployer et installer le nouvel
environnement de messagerie, vérifier les compatibilités matérielles et logicielles ou encore effectuer le
choix de différents services de messagerie en fonction des besoins recensés (messagerie, calendrier,
Rapport annuel 2007 14

forums, news, chat...). De même, un audit de la topologie réseau a permis de comprendre quels sont les
besoins en communication (authentification et accès aux données), notion si importante dans le cadre
d´une entreprise délocalisée ou travaillant avec de nombreux collaborateurs mobiles.
Cette migration s’est réalisée en plusieurs phases :
1) Assurer la continuité de service
Lors de projets de migration dans une structure, la garantie de qualité de service apportée aux
utilisateurs est primordiale, voire vitale. Les opérations de migration doivent se réaliser de manière
totalement transparente pour l´utilisateur final qui ne doit pas se soucier de savoir comment le
nouveau système va être configuré.
2) Réduire la coexistence des systèmes de messagerie
L´objectif est de réduire au maximum la coexistence entre les deux infrastructures N et N+1 de
messagerie, en disposant par exemple d´une base de données commune, en automatisant la création
des boîtes aux lettres sur les serveurs, en veillant enfin à ne pas modifier les applications qui
dépendent de la messagerie, avant l´étape de conversion des boîtes aux lettres.
3) Automatiser la préparation des postes de travail
L´une des étapes les plus importantes dans un contexte de migration concerne la préparation des
postes de travail : désinstallation des anciens modules et installation des nouveaux logiciels clients de
messagerie, d´anti-virus, d´annuaire, préparation et alignement des procédures de logins, de
référencement des objets dans le futur annuaire... Ce travail a été simplifié via la création de scripts
d´installation automatique des nouveaux modules clients.
4) Effectuer un planning de migration
Tout projet de migration doit nécessairement comporter des étapes clés : la première concerne la
synchronisation des annuaires, puis la migration des boîtes aux lettres utilisateurs et des données, le
déploiement des clients de messagerie, pour finir par l´automatisation et la planification du projet de
messagerie. Cette démarche iteractive permet, d´une part, de réduire les coûts, de réduire les
risques liés à la migration et, d’autre part, d´optimiser le déploiement de la nouvelle architecture de
messagerie.
5) Fiabiliser son environnement de messagerie
Plus que tout autre, l´environnement de messagerie est très vulnérable aux attaques virales et ce,
même si au gré des versions les aspects sécuritaires ont été considérablement renforcés (IPsec,
Kerberos, API anti spams et anti virus...). Nous avons donc introduit deux niveaux de protection virale
différents, l´un à celui des systèmes de fichiers et l´autre à celui de la messagerie. De même, pour se
protéger à 99,8% des attaques virales, un antivirus qui offre au moins cinq moteurs d´analyses et qui
est capable d´analyser les fichiers en amont du connecteur SMTP afin d´éradiquer les virus avant
qu´ils n´atteignent les boîtes aux lettres des utilisateurs a été installé.
Pourquoi le choix de PostFix ? Avantage de cette solution dans notre architecture
Performance : Postfix est jusqu'à trois fois plus rapide que son concurrent le plus proche. Un PC de
bureau utilisant Postfix peut recevoir et envoyer un million de messages différents par jour. Postfix
utilise les techniques des serveurs web pour réduire la charge de création de processus et utilise
d'autres techniques pour réduire les charges sur le système de fichiers, sans compromettre la fiabilité.
Rapport annuel 2007 15

Compatibilité : Postfix est conçu pour être compatible avec sendmail afin de rendre aisée la
migration et il est également facile à administrer.
Sûreté et robustesse : Postfix est conçu pour se comporter rationnellement en cas de « stress ».
Lorsque le système local manque d'espace disque ou de mémoire, le logiciel Postfix se retire, au lieu
d'aggraver la situation. Par conséquent, aucun programme de Postfix ne continue à croître à mesure
que le nombre de messages croît. Postfix est conçu pour rester sous contrôle.
Flexibilité : Postfix est architecturé autour d’environ une douzaine de programmes accomplissant
chacun une tâche spécifique. Les sites ayant des règles particulières peuvent remplacer un ou
plusieurs de ces programmes par des versions alternatives. Il est également aisé de désactiver une
fonctionnalité : les firewalls et stations clientes n'ont pas besoin de délivrer du courrier localement.
Sécurité : Postfix utilise plusieurs niveaux de défense pour protéger le système local contre les intrus.
Presque tous les « démons » de Postfix fonctionnent en cage (chroot) avec peu de privilèges. Il n'y a
aucun chemin direct entre le réseau et le programme, sensible, de livraison locale - un intrus devra
tenter de traverser plusieurs programmes. Postfix filtre les informations fournies par l'expéditeur
avant d'exporter via ses variables d'environnement. Enfin, dernier point et non des moindres, aucun
programme de Postfix ne dispose du privilège set-uid.
GroupWare : Dynamiser le travail collaboratif
L’évolution constante de nos communications, le besoin d’échange de données et de partage de
documents en équipe de projet, nous ont incités à mettre en place fin 2007 une solution de GroupWare. Le
travail en équipe peut se concrétiser par le partage d'information, ou bien la création et l'échange de
données informatisées. Il s'agit pour la plupart du temps d'outils de messagerie, ainsi que d'applications
diverses telles que :
agenda partagé
espace de documents partagés
outils d'échange d'information (forums)
outil de gestion de contacts
outils de workflow
Cette évolution implique donc un remaniement des modes de communication et d'organisation, ainsi que
du système d'information. Un des outils clé de ce changement est le GroupWare qui dote l’Institut de
moyens simples et efficaces pour permettre à l'ensemble de ses collaborateurs d'y parvenir : partage de
l'information à travers de multiples calendriers privés ou non, de forums, d'outils collaboratifs (de type
wiki), de gestionnaire de contacts...
Les personnes qui travaillent ensemble et partagent les mêmes objectifs ont chacune une approche, un
savoir-faire et des sources d´informations différentes. Cette diversité fait la richesse du groupe de travail.
Nous exploitons cette richesse au travers du GroupWare mis en place en permettant à des utilisateurs
reliés en réseau de travailler en collaboration sur un même projet. Ils aident les individus à se coordonner,
à coopérer et à communiquer plus efficacement entre eux.
A la clé : productivité des participants, rapidité et qualité des travaux.
Rapport annuel 2007 16

Site web
Afin de refléter au mieux la dynamique projet interne de l’Institut Louis Malardé, il a fallu repenser notre
site web, pour que chaque collaborateur puisse activement contribuer à l’élaboration du contenu de sa
rubrique tout au long de son projet scientifique et ce, indépendamment du SI ou d’un webmaster. La
solution dite de site dynamique a donc été choisie et mise en place.
La notion de site web dynamique s'oppose à celle de site statique. Un site statique est composé
uniquement de pages HTML, créées une par une par un webmaster. Dans ce cadre, chaque modification de
page demande la réédition de cette dernière et une nouvelle mise en place sur le serveur. Dans le cadre
d'un site dynamique, le contenu et la présentation des pages peuvent être gérés indépendamment. Ainsi,
le webmaster ou le graphiste définit un modèle de présentation dans lequel peut s'afficher
"dynamiquement" un contenu, extrait le plus souvent d'une base de données. Les modifications à apporter
au site sont ainsi plus légères puisqu'elles ne nécessitent l'accès qu'à un seul fichier ou au texte présent
dans une base.
Autre grand avantage des sites dynamiques, les contenus affichés dans chacune des pages peuvent être
sélectionnés en fonction de différents paramètres : numéro d'article, heure de la journée, etc. Il est
également possible que ce contenu soit créé en direct par différents utilisateurs du site. Enfin, les sites
dynamiques permettent la gestion d'une communauté d'utilisateurs, le profil de chacun d'eux pouvant être
considéré comme un élément à afficher ou un paramètre à utiliser pour personnaliser le contenu des
pages.
La construction d’un tel site dynamique repose sur des technologies connues et éprouvées à savoir,
APACHE, PHP, MySQL et ASP.
Plate-forme d’échange ILM/Bioserveur
Afin d’optimiser au mieux nos échanges de données avec les prescripteurs, nous avons, fin 2007, développé
et mis en place une plate-forme de distribution de résultats d’analyses entre le LABM de l’Institut qui émet
et les médecins prescripteurs qui reçoivent les résultats. Concrètement, nous déposons les résultats au
format « standard » du laboratoire sur notre plate-forme d’échange et elle les restitue immédiatement au
médecin dans le format demandé et avec le protocole de transport souhaité par celui-ci.
Ce service nous permet d’envoyer les résultats à n'importe quel médecin sans nous soucier ni du format ni
du protocole souhaité par le médecin. Qualifié par plus d’une cinquantaine de logiciels de gestion de
cabinet médical, cette solution permet au médecin de récupérer l’analyse de son patient à travers son
logiciel métier et d’intégrer celle-ci de manière automatique à son dossier. Dans le cas où le médecin n’a
pas de logiciel métier, il peut néanmoins utiliser notre plate-forme et obtenir ces résultats aux formats
standards, Windows ou Mac, pdf, txt, csv (Excel).
Ce système est particulièrement utile pour les médecins itinérants qui peuvent, dès qu’une liaison Internet
est disponible, se connecter à notre plate-forme afin de récupérer leurs résultats à distance.
Rapport annuel 2007 17

Médecin avec logiciel médical
Avantages pour le laboratoire
Rapidité et facilité d’utilisation
Sécurité et confidentialité
Traçabilité avancée
Disponibilité 24x7
Plus de résultats imprimés
Données structurées stockées au niveau de la plate-forme
Partage des données
Economies
Avantages pour les médecins
Un seul point d’accès au service (serveur de résultats)
Choix du protocole (TLS, SSL, SMIME, WSS…)
Choix du format (HL7, pdf, txt, csv (Excel), HPRIM…)
Disponibilité 24x7
Architecture réseau
Afin d’augmenter notre débit et de répondre à la demande sans cesse croissante d’applications de plus en
plus gourmandes en bande passante, nous sommes passés du câblage réseau traditionnel de catégorie 5, à
la fibre optique.
La fibre optique est à la base de l'explosion des communications planétaires modernes qu'il s'agisse de
téléphonie, d'Internet ou de réseau d’entreprise.
Les intérêts de ce procédé de transmission par fibre optique, sont nombreux : Perte de signal sur une
grande distance bien plus faible que lors d'une transmission électrique dans un conducteur métallique,
vitesses de transmission très élevées, et surtout poids au mètre faible (c'est important, aussi bien pour
réduire le poids qu'exercent les installations complexes dans les bâtiments, que pour réduire la traction
des longs câbles à leurs extrémités), insensibilité aux interférences extérieures (proximité d'un néon ou
d'un câble à haute tension, par exemple), pas d'échauffement (à haute fréquence le cuivre chauffe, il faut
le refroidir pour obtenir des débits très élevés).
Rapport annuel 2007 18

Lorsque le trafic devient important les liaisons cuivre sont insuffisantes et il faut passer à la fibre optique.
Citons les liaisons : entre les étages ou les services, entre les commutateurs, vers les serveurs, entre les
bâtiments.
A cette occasion, nous avons profité de segmenter notre réseau via le déploiement de switchs optiques, et
ne plus avoir des connexions point à point directes entre le PC du collaborateur et notre salle serveur mais
via des baies secondaires, plus facilement administrables et permettant la mise en place de VLANs
efficaces et sécurisés. Cette nouvelle topologie va nous permettre maintenant d’envisager de relier notre
site de Paea au siège de Papeete.
Autre intérêt majeur, le changement des solutions métiers du LASEA et du LABM, les nouvelles applications
serveur, s’utiliseront à travers le réseau et réclameront une importante bande passante.
Les objectifs 2008
L’objectif 2008, entrepris pour partie fin 2007 (audit), est le remplacement du logiciel Galaxie du LABM
par un soft métier dédié à son activité croissante ainsi qu’aux nouvelles exigences qualité. Changement
également pour le LASEA par la mise en place d’un LIMs approprié à ses besoins et exigences métier.
La démarche de sécurisation du système d’information sera poursuivie par la mise en place d’un routeur
Cisco beaucoup plus puissant, capable de supporter nos différentes communications, ADSL, RNIS, VPN,… et
d’un Firewall.
Le centre de documentation
L’équipe
Marie SOLIGNAC, chef de service
La documentation
Les abonnements
En 2007, le centre de documentation a souscrit un abonnement annuel à 30 revues scientifiques, juridiques
et informatiques, pour un montant total de 1,3 million FCFP. La baisse régulière du budget d’abonnement
que l’on peut constater depuis quelques années est le signe de restrictions imposées par mesure
d’économie. Elle doit cependant être relativisée face à l’augmentation constante du budget consacré à
l’achat d’articles correspondant aux besoins les plus pointus des utilisateurs.
Si les abonnements en format papier restent majoritaires, les souscriptions aux abonnements électroniques
sont privilégiées lorsqu’elles ne représentent pas un surcoût prohibitif comparé aux avantages dont
bénéficient les lecteurs (rapidité et facilité de la consultation).
Les acquisitions de documents
Hors de toute politique globale d’achats permettant la réhabilitation du fonds vieillissant du centre de
documentation, les acquisitions réalisées en 2007 répondent aux demandes ponctuelles des utilisateurs.
Plus de 350 articles ont été commandés auprès de l’Institut de l’information scientifique et technique
(INIST) ou téléchargés sur le site ScienceDirect des Editions Elsevier. Ces deux fournisseurs offrent des
services performants (réseau de bibliothèques associées, système de livraison électronique de documents,
possibilité d’une veille personnalisée sur les nouvelles publications, etc.) permettant de satisfaire la quasi
intégralité des demandes.
En parallèle, une vingtaine d’ouvrages ont été achetés. Pour des raisons financières, certaines commandes
ont été différées à l’année 2008.
La communication
Le conseil scientifique
A l’occasion du Conseil scientifique qui s’est tenu en juin, le centre de documentation a réalisé la
compilation et la mise en page des fiches-programmes, en concertation avec le Directeur de la recherche.
Le séminaire en entomologie médicale
Le centre de documentation a collaboré avec le LEM à la réalisation du dossier de présentation du
2 nd Séminaire en entomologie médicale qui s’est tenu en février.
Rapport annuel 2007 19

Les dossiers de presse
Un dossier de presse a été réalisé dans le cadre de la médiatisation du programme de Transition
alimentaire et sanitaire en Polynésie française, en marge des missions menées à Papeete et Tubuai.
Le site web
Le projet de refonte du site web de l’ILM s’est poursuivi. De nouveaux outils ont été proposés par le
service informatique dans le but de concevoir un site plus dynamique en favorisant l’autonomie des
laboratoires sur la réalisation des pages les concernant.
La définition de l’architecture, la charte graphique et la réalisation initiale du site sont confiées au centre
de documentation en collaboration avec le comité de pilotage et avec le soutien technique du service
informatique. L’animation du site et l’actualisation des pages devrait ainsi partiellement relever des
scientifiques.
La mise en ligne du site web devrait intervenir au cours du premier semestre 2008.
Les posters
Le centre de documentation a participé à la conception de plusieurs posters présentés par le LSN lors de
congrès :
ISEO 2007 - 38 th International symposium on essential oils, Graz (Autriche)
Chemical composition of essential oils of leaves of Psidium cattleyanum Sabine and P. guajava L.
from Tahiti Island (French Polynesia)
Chemical composition of the essential oil of leaves of Eucalyptus citriodora L. from Tahiti Island
(French Polynesia)
12 th Asian chemical congress – Natural products and medicinal chemistry 2007, Kuala Lumpur (Malaisie)
Ecdysteroids from the medicinal fern Microsorum scolopendria (Burm. F)
4 ème Colloque International COSM’ING 2007 (Ingrédients cosmétiques et biotechnologies) (Saint-Malo,
France) Chemical composition of essential oils of Ocimum basilicum L. from Tahiti Island (French
Polynesia).
Un poster, intitulé Les instruments de la santé au service de la qualité des eaux, a également été édité
pour le LASEA dans le cadre de la Fête de la science.
Ve’a Malardé
Une nouvelle publication destinée à promouvoir les activités d’analyses ou de recherche de l’ILM a été
créée en fin d’année. Celle-ci se présente sous la forme d’une lettre d’information, dont la périodicité
devrait être biannuelle. Chaque numéro abordera une actualité et sera rédigé par un scientifique de
l’établissement, la mise en page étant assurée par le centre de documentation et la diffusion ciblée en
fonction du thème choisi.
Le premier numéro du Ve’a Malardé a été rédigé par le Dr Stéphane LASTERE, biologiste au LABM, et
consacré au virus Chikungunya. Il a fait l’objet d’une diffusion, en novembre, auprès des prescripteurs en
relation avec le laboratoire.
Le manuel qualité et dossier d’agrément du LASEA
Dans la perspective de l’audit de suivi du Comité français d’accréditation (COFRAC) au LASEA, en mars
2007, le responsable qualité a sollicité le centre de documentation afin de réaliser la maquette du Manuel
qualité. Ce document a été finalisé début 2007.
Cette collaboration s’est étendue ensuite à la conception du dossier de demande d’agrément présenté par
le LASEA auprès du Service d’hygiène et de salubrité publique afin d’effectuer les contrôles officiels.
Dixit
A des fins promotionnelles, un publi-reportage ainsi que deux fenêtres rédactionnelles sur les analyses
réalisées au LASEA ont fait l’objet d’une insertion au sein d’un dossier intitulé L’eau, au cœur du
développement durable dans l’édition 2007-2008 du magazine DIXIT, édité par Créaprint.
Les présentations de l’ILM
Le centre de documentation a réalisé les supports de présentation de l’établissement en diverses
occasions :
Fête de la science
Visite du Directeur de l’Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Visite de M. ROUSSEL, Secrétaire permanent du Pacifique.
Rapport annuel 2007 20

Les rapports
Le service a enfin réalisé le Rapport annuel, le Rapport d’activité de santé publique et le Rapport IGA pour
2006, en partenariat avec les chefs de service et la Direction générale.
Les activités annexes
En raison de ses fonctions antérieures au sein du Service des ressources humaines, le chef du Centre de
documentation a effectué le contrôle mensuel de la paie en collaboration avec le chargé des ressources
humaines, et assuré ses intérims en cas d’absence.
Au mois de novembre, la Direction générale a confié au chef du Centre de documentation une mission de
formation auprès du chargé des ressources humaines nouvellement recruté aux procédures administratives
de gestion du personnel, à la réalisation de la paie mensuelle et à la pratique des logiciels de ressources
humaines et de la rémunération. Cette mission s’est achevée en février 2008.
Le service technique
L’équipe
Alexandre KECK, chef de service
Léon COLOMBANI, aide-technicien
Laurent MOILON, animalier
Karl PUTOA, aide-technicien
Fleury TAVAE, manœuvre
Pomateao TEARIKI, agent d’entretien
Tu TETAURU, manœuvre
L’activité du service
La mission du service technique consiste à fournir un support logistique aux services et laboratoires de
l’ILM. Son effectif est resté constant.
Le Service technique a ainsi supervisé divers travaux d’investissement réalisés par les entreprises
extérieures :
mise en place de nouveaux climatiseurs ou remplacement d’équipements défectueux,
élagage d’un arbre Maru maru dans la cour de l’ancien LAC présentant un danger pour la sécurité du
personnel,
dossier de demande de permis de construire pour l’extension d’un bâtiment, d’une clôture et de
l’animalerie,
mise en place d’une clôture pour sécuriser la propriété de Paea,
construction d’une extension du bâtiment principal de l’insectarium pour y aménager un local de
stockage destiné aux produits de laboratoire et un local réservé aux archives,
travaux d’électricité à Paea,
rénovation du plafond du laboratoire d’immunologie,
remise en état des fenêtres et plafonds endommagés par des cambrioleurs,
travaux de carrelage et remplacement du plafond du laboratoire de bactériologie.
Divers travaux ont par ailleurs été effectués en régie par les agents du service technique :
entretien périodique des climatiseurs,
travaux de remise à niveau de la cour intérieure pour éviter l’accumulation d’eau pluviale,
mise en place du plafond et pose de luminaires dans la salle des frigos au 1 er étage,
expulsion des squatters sur le terrain de Paea conformément à la décision de justice,
aménagement, peintures et paillasses du laboratoire de virologie,
déménagement des activités de la bactériologie avant rénovation de la salle,
destruction des paillasses et peintures du laboratoire de bactériologie,
dépose et repose des luminaires en immunologie.
Rapport annuel 2007 21

Les activités de recherche
La Direction de la recherche
L’équipe
Rémy TEYSSOU, directeur de la recherche
Edouard SUHAS, chargé de recherche
Nicolas GOFFARD, bioinformaticien (depuis le 3 septembre 2007)
Les orientations stratégiques de la recherche
Recruté fin 2006 avec pour objectifs de diriger, animer et promouvoir le département de la recherche, le
Pr Teyssou a défini, pour les cinq ans à venir, les principales orientations stratégiques de la recherche avec
la volonté d’impliquer l’ILM dans les grandes thématiques clés de ce début du 21 ème siècle, tout en restant
fidèle à sa mission en faveur de la population polynésienne.
Ces orientations stratégiques s’intègrent dans les grands enjeux actuels de santé publique et prennent en
compte les spécificités polynésiennes (océan, insularité, culture, environnement socio-économique et
démographique). Elles se déclinent selon la problématique des changements globaux (climatiques,
environnementaux, socioculturels, etc.).
Comprendre, détecter et s’adapter aux grands changements globaux qui représentent des risques
potentiels pour la santé publique est en effet un des défis majeurs pour les décideurs politiques en ce
début de siècle. En Polynésie française, répondre à ce défi par des moyens adaptés permettra de préserver
et améliorer à long terme l’état de santé de la population, et favorisera un développement durable.
Les risques « santé » en Polynésie française liés aux changements globaux s’organisent autour de trois
axes :
Changements climatiques et santé
Ces changements vont modifier la présence et la qualité des vecteurs de maladies telles que la filariose, la
dengue ainsi que l’incidence des maladies dues aux biotoxines marines, parmi lesquelles la ciguatéra.
Il apparaît ainsi essentiel (i) de développer de nouveaux moyens de surveillance des changements
d’incidence de maladies (veille sanitaire), d’émergence de maladies nouvelles à transmission vectorielle
(Chikungunya, West Nile) ou autre (grippe aviaire), de répartition des vecteurs (moustiques) et
d’évaluation du risque lié aux biotoxines marines dans les archipels de Polynésie française, et (ii) de
définir de nouvelles techniques de lutte adaptées à l’environnement polynésien.
Dans le contexte particulier de l’entomologie médicale, l’Institut a déjà commencé à développer des
techniques alternatives de lutte anti-vectorielle, qui si elles montrent leur efficacité, permettront de
réduire l’utilisation des insecticides et donc leur impact écologique sur l’environnement et la santé
humaine. Par ailleurs, un projet de pôle international sur les biotoxines marines, piloté par le Laboratoire
des microalgues toxiques, est en cours d’élaboration.
Changements environnementaux et santé
La modification de notre environnement se caractérise par l’émergence de nouveaux problèmes. La
présence de métaux lourds toxiques dans les poissons du large et les espèces lagonaires représente une
menace pour la santé publique autant qu’un frein à l’exportation d’espèces à valeur commerciale élevée.
Des pratiques agricoles inadaptées sont également responsables de la présence de résidus toxiques de
pesticides dans certains légumes cultivés localement. Enfin, le développement démographique côtier
menace la qualité des eaux de baignade autant que de l’eau de consommation.
Des programmes adaptés devront donc être développés entre le LASEA et les unités de recherche. Le
LASEA s’est d’ores et déjà engagé dans un processus de détection et caractérisation de la présence de
résidus de pesticides dans les aliments.
Changements sociaux reliés à la modernisation et santé
La société polynésienne est en pleine mutation et comme toute société en transition épidémiologique, elle
voit émerger à grande vitesse des maladies dites de civilisation telles que le diabète, l’obésité et les
maladies cardiovasculaires. Les changements alimentaires sont bien entendu au cœur de cette mutation.
Une augmentation de la consommation des sucres et un remplacement progressif des « bons gras »
(poissons) par des graisses saturées et hydrogénées (aliments industriels) représentent le cocktail idéal
Rapport annuel 2007 22

pour voir exploser l’incidence de ces maladies chroniques. S’ajoutent à cela d’autres facteurs de risques
liés au mode de vie (tabac, sédentarité etc.).
Il est urgent d’investiguer ces changements, c’est la raison pour laquelle il est envisagé la création d’une
unité nouvelle au sein de l’ILM, l’unité des maladies non transmissibles, regroupant les programmes
concernant les maladies dites de civilisation.
Ces thématiques doivent intégrer les aspects thérapeutiques et de prévention par le biais des recherches
sur les substances naturelles issues de la biodiversité de la Polynésie française.
Le conseil scientifique
Le Conseil scientifique s’est réuni du 25 au 28 juin 2007. Présidé pour la première fois par le Pr Vincent
MARECHAL (Université Pierre et Marie Curie, Paris), il a réuni :
le Pr Pierre MERY, délégué régional à la Recherche et à la Technologie,
le Dr Taivini TEAI, maître de conférence à l’Université de la Polynésie française,
le Dr Priscille FROGIER, déléguée à la Recherche,
le Dr Mareva TOURNEUX, directrice de la Santé,
le Dr René CHANSIN, directeur général de l’ILM,
le Pr Rémy TEYSSOU, directeur de la recherche de l’ILM.
Les programmes suivants lui ont été soumis :
Pour le LABM
Épidémiologie moléculaire de la leptospirose en Polynésie française (Chef de projet : C. COUDERT)
Étude de la prévalence et de la distribution génotypique des papillomavirus en Polynésie française
(Chef de projet : S.LASTERE)
Département de la recherche et CIE
Détection pharmacologique des ciguatoxines : validation et amélioration de l’outil « interaction
ligand-récepteur » sur diverses matrices biologiques (Chef de projet : T. DARIUS)
Caractérisation moléculaire du dinoflagellé ciguatérigène Gambierdiscus. Application à la détection
des différentes lignées cellulaires de la microalgue in natura (Chef de projet : M. CHINAIN)
Évaluation du risque ciguatérique dans les archipels de Polynésie française (Chef de projet :
M. CHINAIN)
Évaluation de l’implication du système immunitaire dans les manifestations chroniques dues aux
intoxications par des biotoxines marines en Polynésie française (Chef de projet : C. GATTI)
La transition alimentaire et sanitaire en Polynésie française (Chef de projet : E. SUHAS)
Élimination d’une population isolée d’Aedes polynesiensis, vecteur principal de la filariose
lymphatique dans une zone de forte endémie de Polynésie française (Chef de projet : H. BOSSIN)
Programme de lutte contre la filariose lymphatique : essai thérapeutique ciblant la bactérie
Wolbachia endosymbiote de la filaire Wuchereria bancrofti (Chef de projet : AM. LEGRAND)
Participation à une étude multicentrique pour la validation d’outils de surveillance dans le cadre du
programme mondial d’élimination de la filariose lymphatique de Bancroft (Chef de projet :
C. PLICHART)
Intégration d’une lutte antivectorielle appropriée requise pour l’élimination de la filariose
lymphatique dans le Pacifique sud (Chef de projet : H. BOSSIN)
Identification de marqueurs moléculaires corrélés à la virulence et à l’atténuation des souches virales
de dengue 3 isolées en Polynésie française (Chef de projet : C. ROCHE)
Etude de la variabilité génétique des souches virales de dengue 1 circulant en Polynésie française de
2001 à 2006 (Chef de projet : M. CAO-LORMEAU)
Dynamique des populations virales chez l’homme et le vecteur (Chef de projet : M. CAO-LORMEAU)
Caractérisation des protéines se liant au virus de la dengue dans les glandes salivaires des moustiques
vecteurs (Chef de projet : M. CAO-LORMEAU)
Surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en Polynésie française
(Chefs de projet : M. CAO-LORMEAU et J. MARIE)
Évaluation du risque d’introduction et du potentiel épidémique des arboviroses autres que la dengue
en Polynésie française (Chef de projet : M. CAO-LORMEAU)
Rapport annuel 2007 23

Recherche dans la biodiversité de la Polynésie française de substances naturelles possédant une
activité répulsive/attractive vis-à-vis des moustiques du genre Aedes et Culex (Chefs de projet :
J. MARIE et F. ADAM)
Développement et application d’une stratégie de lutte durable contre le moucheron piqueur
Leptoconops albiventris dans l’archipel des Marquises (Chef de projet : H. BOSSIN)
Étude des substances naturelles bioactives de Polynésie française (Chef de projet : I. VAHIRUA-
LECHAT)
Le conseil a validé l’ensemble des programmes et des projets présentés. Il a par ailleurs émis des
recommandations vouées à renforcer des positions déjà bien établies sur le plan national, régional et
international de l’ILM. Par exemple, une politique de publication plus active ou l’acquisition par les
chercheurs seniors d’une « habilitation à diriger les recherches » qui devraient permettre d’attirer plus de
compétences vers l’institut. Un renforcement des collaborations avec l’Université de la Polynésie française
est également souhaitable.
La stratégie de l’Institut doit s’inscrire dans les nouveaux défis du XXI ème siècle : impact de la dégradation
de l’environnement et des changements socioculturels sur la santé des populations, maladies émergentes
et développement durable.
Le programme de transition alimentaire et sanitaire en Polynésie française
Le Dr Edouard SUHAS a été missionné, en octobre 2006, pour coordonner les programmes de recherche
menés conjointement par l’Institut Louis Malardé et l’équipe du Pr Eric DEWAILLY, de l’Université de Laval
(Québec, Canada) et notamment le programme sur la Transition alimentaire et sanitaire en Polynésie
française.
Ce programme fait écho à un constat préoccupant en terme de santé publique en Polynésie :
l’augmentation des maladies dites de civilisation (diabète, maladies cardiovasculaires) dont le changement
des habitudes alimentaires est l’un des facteurs de risque identifié.
On assiste en effet à un glissement de la consommation vers des produits industriels importés aux teneurs
élevées en sucres et graisses saturées au détriment des produits traditionnels (fruits, légumes et poisson)
de meilleure qualité nutritive.
L’objectif de ce programme est de mettre en évidence cette transition alimentaire et épidémiologique,
d’en décrire les variations (âge, sexe), d’en observer les effets sur l’organisme et d’émettre des
recommandations qui poseraient les bases d’une politique publique de prévention adaptée.
Devant la diversité des conditions de vie au sein des cinq archipels et les difficultés à réunir un échantillon
représentatif au niveau de la Polynésie française, il est convenu de procéder en deux étapes : un projetpilote
mené aux îles Australes suivi d’une étude de cohorte de grande envergure, sur le thème des
changements alimentaires, sociaux et environnementaux et leurs impacts sur l’émergence des maladies
chroniques.
Pour ce projet-pilote, 300 participants, pour moitié recrutés parmi les Austra-îliens vivant à Papeete
depuis au moins 10 ans (exposée à une alimentation moderne) et pour moitié parmi les habitants des
Australes (supposés avoir une alimentation plus traditionnelle) seront ainsi comparés. Des analyses
biologiques seront pratiquées (dosage lipidique, métaux lourds), des mesures biométriques et une série de
questionnaires concernant les habitudes alimentaires et les modes de vie seront soumis aux participants.
Début 2007, ce programme a été évalué à un coût de 42 millions FCFP. Le préalable à ces recherches a été
le dépôt de demande de financement pour 50% auprès de l’Agence nationale de la recherche (ANR) et 50%
auprès des autorités du Pays.
Le programme a par ailleurs fait l’objet d’une présentation au Comité d’éthique de la Polynésie française
qui l’a validé.
Les enquêtes sur le terrain ont été organisées. En avril, au terme d’une mission de prospection aux
Australes, l’île de Tubuai a été sélectionnée comme site d’étude. La capitale, Mataura, abrite en effet les
infrastructures nécessaires : un centre médical dont une partie du personnel pourrait être mis à disposition
temporairement et une pension de famille permettant de loger l’équipe.
L’équipe a également sollicité auprès de M. Daniel PONIA, directeur de l’Institut en soins infirmiers
Mathilde Frébault, la mise à disposition de six élèves infirmiers de fin de deuxième année pour la durée
des enquêtes in situ. Cette demande a reçu un avis favorable.
Deux missions se sont déroulées du 27 août au 6 septembre à Papeete et du 10 au 22 septembre à Tubuai,
réunissant près de 20 personnes :
Eric DEWAILLY, chef de mission
Edouard SUHAS, référent du programme pour l’ILM,
Suzanne COTE, infirmière épidémiologiste – chargée de la mise en place de la logistique clinique
Rapport annuel 2007 24

Emilie COUNIL, épidémiologiste nutritionniste – chargée de la mise en place du questionnaire
alimentaire,
Frédéric DAIGLE, technicien en échographie – chargé de la réalisation des échographies de la carotide
des participants
Myrna PIEHI, infirmière - chargée du recrutement des participants
Benjamin TAUPUA, aide technicien - chargé du conditionnement des échantillons après prélèvements,
Jérôme VIALLON, technicien supérieur de laboratoire - chargé du conditionnement des échantillons
après prélèvements,
Elèves infirmiers qui ont assuré à la fois les actes de prélèvements et de mesures biométriques mais
également la soumission des participants aux questionnaires alimentaires.
Cécile TAMAHU,
Stellio TEHINA,
Deana DROLLET,
Herenui FAAFATUA,
Laura SAQUET,
Rosemonde KAIHA.
Les enquêtes achevées, l’ensemble des prélèvements et questionnaires ont été expédiés à l’Université
Laval pour analyses.
Il est prévu pour le second semestre 2008, la collecte de toutes les données qui feront l’objet d’une
restitution aux participants de l’étude.
Le laboratoire de recherche en entomologie médicale
L’équipe
Jérôme MARIE, chef de service par intérim
Hervé BOSSIN, chargé de mission (depuis le 22 janvier 2007)
Marc FAARUIA, technicien
Michel CHEONG SANG, aide-technicien (depuis le 4 juin 2007)
Henri FROGIER, manœuvre captureur
Michel GERMAIN, aide-technicien
Albert TETUANUI, aide-technicien
Les activités de recherche
L‘année 2007 a été une année de transition importante pour le Laboratoire de recherche en entomologie
médicale (LEM) tant structurelle que scientifique. Des activités de recherche ont été initiées dans le cadre
de deux programmes internationaux d’envergure, l’un financé par le National Institute of Health
(collaboration avec l’Université du Kentucky), l’autre par la Fondation Bill et Melinda Gates (collaboration
avec l’Université Emory en association avec le LPM et le CIE).
La gestion scientifique et logistique de ces activités a été placée sous la responsabilité du Dr Hervé BOSSIN
qui a intégré le LEM en qualité de chargé de mission en début d’année. L’unité a par ailleurs travaillé à la
rédaction de plusieurs projets de recherche dans le cadre de consortium internationaux. Certains de ces
projets ont d’ores et déjà été retenus et le début des activités est prévu courant 2008. D’autres
propositions sont encore en cours d’évaluation par l’administration polynésienne.
Le LEM développe trois thématiques principales qui s’inscrivent dans les préoccupations de santé publique
de la Polynésie française et visent sur le long terme à la mise en place d’une lutte anti-vectorielle intégrée
et durable pour le territoire :
bio-écologie des vecteurs et insectes nuisibles,
développement et validation de stratégies de lutte anti-vectorielle innovantes et durables,
contribution à l’étude du risque vectoriel et des problèmes de nuisance entomologique.
Un résumé succinct des activités réalisées dans le cadre des programmes et missions du LEM pendant
l’année 2007 est proposé ci-dessous.
Elimination d’une population isolée d’Aedes polynesiensis, vecteur principal de la
filariose lymphatique dans une zone de forte endémie de la Polynésie française
Durée : 2007-2012
Financement : ILM, Université du Kentucky (Etats-Unis), National Institute of Health (Etats-Unis)
Rapport annuel 2007 25

Ce programme a pour but de tester sur le terrain (motu d’une île de la Société) une stratégie innovante et
durable d’élimination de populations du moustique Aedes polynesiensis, principal vecteur de la filariose
lymphatique en Polynésie. La méthode en cours d’évaluation, préalablement élaborée et modélisée en
laboratoire, repose sur le lâcher de moustiques mâles stérilisant sur le terrain. En s’accouplant avec les
femelles sauvages, ces mâles rendus préalablement incompatibles grâce à une bactérie endosymbionte de
type Wolbachia commune en Polynésie conduisent à la stérilisation et donc à la réduction durable voire à
l’élimination du moustique vecteur.
Activités réalisées
Objectif 1 – Évaluation de la stratégie de lutte en laboratoire
Une grande partie de cette première année du projet a été consacrée à la mise en place d’une convention
de recherche adéquate entre l’ILM et l’Université du Kentucky (UKY) partenaire. Malgré des retards de
nature administrative, des progrès significatifs ont été réalisés dans les deux institutions. Les étapes qui
ont été accomplies incluent :
- Avril 2007 : Protocole de prélèvement de sang humain approuvé par le comité d’éthique polynésien et
par le NIH.
- Octobre 2007 : Convention de recherche signée par l’ILM et l’UKY.
- Octobre 2007 : Publication de l’arrêté ministériel autorisant l‘importation en Polynésie française (PF)
de la souche Aedes polynesiensis biologiquement modifiée.
- Novembre 2007 : Autorisation finale du ministère de l’Agriculture pour l’importation de la souche.
- Décembre 2007 : Réception du premier lot d’œufs de moustiques modifiés à la station de recherche
de Paea.
Précédent la réception de la souche modifiée, un protocole d’élevage spécifique et la mise aux normes
de la salle d’élevage ont été mis en place pour assurer le confinement de la colonie.
Un assistant technique a été recruté à mi-temps et formé à la caractérisation entomologique et au suivi
météorologique des sites pilotes (motu) sur l’île de Raiatea.
Trois stagiaires polynésiens (license UPF) et une stagiaire anglaise (master II) ont contribué à la réalisation
des activités de recherche.
Objectif 2 – Préparation du site d’étude en vue des futurs lâchers de mâles stérilisants
La caractérisation des trois sites pilotes sélectionnés le long de la côte Sud-Ouest de Raiatea (motu
Toamaro, Tiano, et Horea, voir Fig. 1) est en cours et inclue la détermination de la biodiversité
entomologique présente sur ces îlots.
Fig. 1 - Localisation des sites pilotes sélectionnés sur l’île de Raiatea
Rapport annuel 2007 26

Pour ce faire, un protocole d’échantillonnage adapté, basé sur l’emploi de pièges de type BG Sentinel, a
été mis en œuvre. La collecte de moustiques à l’aide de ces pièges est réalisée deux fois par mois sur
chacun des trois motu ainsi que sur l’île principale. Les gîtes de production larvaire font également l’objet
d’une surveillance régulière. Les relevés réalisés depuis juillet 2007 indiquent la présence sur les motu
sélectionnés d’une population dominante d’Ae. polynesiensis (97% des spécimens collectés) et de quelques
spécimens de Culex quinquefaciatus.
Aucun spécimen d’Ae. aegypti n’a été identifié à ce jour sur les 3 sites pilotes. Le suivi de la dynamique de
ces populations de moustiques au cours de l’année permettra d’identifier les fluctuations saisonnières
éventuelles et de définir la meilleure période pour procéder au lâcher de mâles stérilisant (lorsque la
population cible est naturellement basse). Par ailleurs une station météorologique a été mise en place dès
juillet 2007 sur le motu Tiano. Les données collectées seront intégrées dans un modèle conçu pour faciliter
la prise de décision vis-à-vis de ces lâchers.
Contribution à la lutte anti-vectorielle et à la prévention des maladies
transmissibles : recherche dans la biodiversité de la Polynésie française de
nouvelles substances naturelles aux propriétés insecticides, répulsives ou
attractives vis-à-vis des moustiques Ae. aegyti et Ae. polynesiensis
Coordination du programme assurée par le Laboratoire de recherche sur les substances naturelles (LSN)
Durée : 2006-2008
Financement : ILM et Etablissement public pour la prévention (EPAP)
Activités réalisées
Objectif : Tests d'activité insecticide, attractive, et répulsive
Depuis plusieurs années, l’usage des répulsifs et insecticides chimiques est en augmentation. Or, ces
produits peuvent entraîner des résistances chez les moustiques (certains pyréthrinoïdes) mais également
se révéler préjudiciables à fortes doses pour la santé humaine (DEET). Une partie de nos recherches est
actuellement consacrée à la mise au point d’une technique de criblage appropriée pour identifier
rapidement parmi les huiles essentielles testées celles présentant des propriétés répulsives, insecticides
ou attractives éventuelles. Cette technique appelée « test en tunnel » permet d’étudier les effets d’un
contact forcé entre les femelles moustiques et un tulle moustiquaire imprégné derrière lequel se situe un
appât vivant. Des milliers de moustiques femelles à jeun de 5 à 7 jours ont servi aux expérimentations.
Une vingtaine de composés naturels préparés par le LSN ont ainsi été passés au crible parmi lesquels le
basilic ou miri tahiti a démontré sous différentes fractions une forte activité répulsive vis-à-vis des
femelles d’Ae. aegypti.
Ce projet s’inscrit dans une voie de contrôle plus écologique et se poursuivra en 2007.
Une collaboration a été mise en place avec un laboratoire américain (USDA, Gainesville) pour réaliser des
analyses supplémentaires pour lesquelles le LEM ne dispose ni équipement approprié ni compétence
suffisante. Ces tests de validation plus élaborés, basés sur l’utilisation d’un olfactomètre et d’une
approche par application dermique, ont confirmé l’existence de substances prometteuses parmi celles
étudiées. La collaboration avec le laboratoire partenaire se poursuivra en 2008 pour compléter et finaliser
l’analyse des extraits retenus.
Surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en
Polynésie française
Coordination du programme assurée par le Laboratoire de recherche en virologie médicale (LVM)
Durée : 2006-2007
Financement : ILM et Ministère de l'Outre-Mer (MOM)
Activités réalisées
Objectif 1 – Mise au point d’un test de diagnostic de la dengue par suivi de la prévalence dans la
population de moustiques vecteur
Des prélèvements de moustiques femelles dans les foyers de dengue déclarés ont été réalisés au début de
l’année 2007 pour le compte du LVM dans le but de mettre au point un test moléculaire de diagnostic
indirect de la dengue (xéno-surveillance).
Objectif 2 – Amélioration des méthodes de captures de moustiques
Dans le cadre de différentes missions d’échantillonnage, le LEM a eu l’occasion d’évaluer l’efficacité de
pièges (BG Sentinel, Biogent) pour la capture d’Ae. aegypti. En avril 2007, grâce aux données du
Laboratoire d’analyses de biologie médicale (LABM), une mission d’échantillonnage de moustiques
sauvages a été organisée par le LEM en collaboration avec le Centre d’hygiène et de salubrité publique
Rapport annuel 2007 27

(CHSP) dans des quartiers où une transmission active de DEN1 avait été constatée. Par ailleurs, une
campagne d’évaluation de la capacité de deux types de pièges (BG Sentinel et pièges à femelles gravides)
à capturer des spécimens des espèces vecteurs de la dengue (Ae. aegypti et Ae. polynesiensis) a été
menée sur l’île de Moorea. Les résultats obtenus permettront une optimisation des méthodes
d’échantillonnage lors de la prochaine épidémie de dengue.
Resolving the Critical Challenges Now Facing the Global Programme to Eliminate
Lymphatic Filariasis
Coordination du programme assurée par le Laboratoire de recherche en parasitologie médicale (LPM)
Durée : 4 ans
Financement : ILM, Université d’Emory et Fondation Bill & Melinda GATES
Activités réalisées
Objectif – Sélection de l’outil de diagnostic de la filariose lymphatique le plus adapté (performance et
faisabilité) pour suivre l’évolution du programme GPELF dans tous les pays endémiques
Cette étude multicentrique se propose de résoudre les principaux enjeux auquel le programme mondial
d’élimination de la filariose lymphatique (GPELF) est aujourd’hui confronté. L’un des huit objectifs de ce
programme de recherche est la validation d’outils de diagnostic de la maladie. Pour la Polynésie française,
l’expertise de trois laboratoires de l’ILM a été mise en œuvre (LPM, CIE, LEM) pour la réalisation des
activités de recherche.
Le LEM a procédé à la collecte de plusieurs milliers de moustiques Ae. polynesiensis et Culex
quinquefaciatus au cours de la campagne de prélèvements organisée fin 2007 dans la commune d’Afareaitu
sur l’île de Moorea. Ces spécimens font actuellement l’objet d’analyses qui permettront de déterminer la
prévalence du parasite de la filariose dans ces deux espèces.
Rédaction de propositions de recherche
Une part non négligeable des activités du LEM a été consacrée à la rédaction de propositions de recherche
en réponse à des sollicitations externes ou dans le cadre de consortium de recherche préexistants. Une
description des propositions qui ont été soumises ainsi que du statut de leur évaluation est présenté cidessous
:
Projet « Vers une lutte anti-vectorielle intégrée et complémentaire pour
l’élimination de la filariose lymphatique dans le Pacifique Sud », soumis auprès de
la fondation Bill & Melinda GATES
Contexte régional et scientifique
La filariose lymphatique est une maladie parasitaire douloureuse et handicapante qui endommage le
système lymphatique et les organes internes. Le sérieux handicap causé par « l’Eléphantiasis » induit de
profonds stigmas psychologiques et sociaux. Endémique dans plus de 80 pays, cette maladie affecte plus
120 millions de personnes à travers le monde, et menace d’infection près de 1.2 milliard de personnes.
Dans le Pacifique Sud, la filariose est une cause majeure de handicap avec près de 40% de la population
infectée dans certaines îles. Près de 96% des 8.5 millions de personnes qui vivent dans cette région sont
menacés.
Un traitement à la diéthylcarbamazine (DEC ou Notézine®) délivrée seule ou en association, et selon
diverses stratégies médicamenteuses communautaires a été recommandé depuis 1949, ce qui a permis une
réduction spectaculaire des formes graves et handicapantes (hydrocèles et éléphantiasis). Cependant
l’action partiellement macrofilaricide de la DEC ne permet qu’un contrôle transitoire du parasitisme. C’est
pourquoi l’endémie filarienne, même si elle est relativement contrôlée, reste toujours présente et difficile
à éliminer dans les conditions actuelles de surveillance et de prise en charge. La filariose lymphatique
demeure donc un problème de santé publique, particulièrement en Polynésie française dans les Iles de la
Société et des Marquises, avec un risque de forte ré-émergence si la vigilance venait à se relâcher, comme
on l’a constaté par le passé.
La persistance de patients porteurs de microfilaires sur le territoire après plus de 20 ans de traitement
communautaire souligne le manque d’efficacité du traitement dans cette région du Pacifique.
L’observation de cohortes sur les îles de Maupiti et de Moorea suggère que la seule prolongation du
traitement au-delà des 5 années initialement prescrites ne suffit pas à éliminer la filariose dans des
régions ou Aedes polynesiensis est le principal vecteur. Ae. polynesiensis est un vecteur particulièrement
efficace dans des régions à faible endémicité comme la Polynésie. Contrairement à d’autres moustiques
vecteurs son efficacité vectorielle augmente au fur et à mesure que la charge en microfilaire diminue.
Cette relation inversement proportionnelle à la densité, limite l’efficacité du traitement thérapeutique et
Rapport annuel 2007 28

constitue un argument fort pour la mise au point de moyens complémentaires incluant des stratégies de
lutte antivectorielle adaptées.
Objectifs et perspectives du programme
Devant l’incapacité des méthodes conventionnelles à contrôler les moustiques Aedes vecteurs de la
filariose lymphatique, le présent programme vise au développement de plusieurs outils innovants basés
notamment sur une stratégie de lutte biologique. La figure 2 ci-dessous liste ces outils et la façon dont ils
s’intègrent dans une lutte cohérente contre les populations de moustiques vecteurs de la filariose.
Fig. 2 - Stratégie de lutte intégrée et durable contre Ae. polynesiensis,
principal vecteur de la filariose lymphatique en complément du traitement communautaire
Ce programme se propose ainsi d’évaluer sur le terrain l’efficacité de ces nouvelles méthodes de lutte
antivectorielle plus respectueuses de la santé et de l’environnement.
Une fois validée dans les sites sélectionnés, cette technologie pourra être mise en œuvre dans d’autres îles
des archipels polynésiens et appliquée à d’autres régions du Pacifique où Ae. polynesiensis est le principal
vecteur de la filariose.
La technologie pourra enfin être appliquée à l’élimination de populations de moustiques (Aedes aegypti,
Aedes albopictus) vecteurs d’autres maladies (Dengue, Chikungunya) dans d’autres régions à travers le
monde.
Les bénéfices attendus de cette étude de faisabilité résideront dans la mise à disposition d’outils
supplémentaires ouvrant la voie à l’élimination de la filariose dans les régions du Pacifique Sud où le
traitement thérapeutique seul est insuffisant.
Ces bénéfices anticipés feront l’objet d’une évaluation dans le cadre du programme intitulé « Resolving
the Critical Challenges Now Facing the Global Programme to Eliminate Lymphatic Filariasis” (2006-2010)
financé par la fondation Bill & Melinda Gates auquel l’Institut Louis Malardé participe.
Statut
La fondation Bill et Melinda Gates a annoncé en novembre 2007 le financement effectif de ce programme
de recherche. L’établissement de conventions de recherche entre l’Université du Kentucky (institution
coordinatrice) et les autres membres du consortium de recherche (dont l’ILM) est en cours. Les activités
de recherche démarreront au LEM dès l’année prochaine.
Rapport annuel 2007 29

Projet Contrat de développement État-Pays – « Intégrer un Système d’Information
Géographique (SIG) aux activités de recherche de l’Institut Louis Malardé
Objectif
Acquérir les équipements et le savoir-faire nécessaires à la mise en place d’un système d’exploitation de
données de surveillance épidémiologique et d’entomologie vectorielle pour pouvoir effectuer la saisie et
l’exploitation de données de terrain qui permettront l’amélioration de la surveillance des risques
sanitaires, notamment :
En matière de surveillance des risques épidémiques liés aux arbovirus (dengue et autres) comme
système d’alerte précoce des épidémies de dengue.
En matière de surveillance des risques sanitaires liés aux efflorescences de micro-algues toxiques
(ciguatéra et autres intoxications par bio-toxines marines) sur l’ensemble des archipels de la
Polynésie.
Statut
Ce document, soumis auprès du Ministère de la Santé en février 2007, est en attente d’une décision finale.
Projet Contrat de développement État-Pays – « Lutte contre le nono blanc des
plages Leptoconops abiventris aux Marquises »
Contexte
Le nono blanc, frein majeur au développement socio-économique des Marquises
Source de revenus importants, le développement du tourisme constitue l’une des priorités du
Gouvernement de la Polynésie française. Le développement harmonieux des archipels constitue également
une volonté affichée par les responsables politiques du Pays.
Le tourisme, comme d’autres activités économiques, est tributaire des conditions environnementales dans
lesquelles il s’inscrit. Dans l’archipel des Marquises, les nuisances causées par les petits moucherons
suceurs de sang sont souvent citées, à juste titre, comme un frein majeur au développement touristique
local. Quatre espèces de moucherons piqueurs sont répertoriées dans notre Pays. Toutes infligent des
milliers de piqûres douloureuses aux hommes et aux animaux et peuvent occasionnellement constituer des
problèmes de santé publique en raison de l’infection des lésions liée au grattage.
Le moucheron piqueur Leptoconops albiventris (ou nono blanc des plages) ne sévit actuellement que dans
l’archipel des Marquises où il colonise aujourd’hui la totalité des plages de sable. Son contrôle constitue
donc une condition essentielle et indispensable au bien-être et à la santé des populations mais aussi au
développement de l’archipel. Le contrôle de ce moucheron doit en particulier permettre le
développement des activités en bord de mer qui sont, pour le moment, totalement proscrites. Par ailleurs,
l’élimination des populations de L. albiventris dans l’archipel éliminerait à terme le risque de
dissémination de cette espèce (notamment par le biais des liaisons aériennes ou par le transport de sable
contaminé) vers d’autres îles polynésiennes. De nombreux biotopes existent en effet en dehors des
Marquises qui sont propices à l’implantation et au développement de ce moucheron piqueur.
Le présent projet vise à développer et à mettre en œuvre une stratégie de contrôle durable, voire
d’élimination des populations du moucheron piqueur Leptoconops albiventris, sur les îles de Ua Pou et de
Ua Huka.
Une fois développée et validée sur le terrain, cette stratégie de lutte respectueuse de l’environnement
pourra être étendue à l’ensemble de l’archipel et permettra d’envisager son développement touristique
avec plus d’optimisme.
Objectifs
La planification présentée en Figure 1 établit une stratégie de recherche appliquée à la lutte contre
L. albiventris sur quatre ans (2008-2012) et situe ce plan d’action dans le contexte des projets de
recherche actuellement menés par le laboratoire d’entomologie médicale de l’ILM.
Un plan d’action de cinq ans (2008-2012) composé des quatre phases est décrit ci-dessous :
Phase I - Détermination du statut des populations de L. albiventris suivie de l’organisation d’une
réunion d’experts chargée de la mise au point d'une stratégie de lutte à long terme.
Phase II - Etude de faisabilité des moyens proposés de lutte intégrée. Étude d’impact environnemental
des moyens de lutte retenus.
Phase III - Mise en œuvre du programme d’élimination séléctionné : recrutement et formation du
personnel temporaire, application du traitement de lutte intégrée et surveillance des populations
cibles.
Phase IV - Confirmation du statut d’élimination, et maintien d’un système de surveillance allégé pour
prévenir tout risque de réinfestation.
Rapport annuel 2007 30

Statut
Ce document soumis auprès du Ministère de la Santé, en février 2007, est en attente d’une décision finale.
Projet Contrat de développement État-Pays – « Vers une lutte anti-vectorielle
durable »
Les enjeux épidémiologiques et entomologiques à laquelle la région océanienne fait face ont été
clairement identifiés par la Commission du Pacifique Sud (CPS). Pour répondre à ces enjeux, la CPS
procède peu à peu à la mise en place d’un réseau régional de Surveillance, d’Enseignement et d'Étude
entomologique dont l’objectif est d’assurer l’étude de la distribution des moustiques vecteurs de maladies
(compétence vectorielle, résistance aux insecticides), la formation régionale de personnels spécialisés, et
le développement d’une lutte antivectorielle adaptée et durable. Ce programme très large doit être
financé par l’Union Européenne, le Fonds Pacifique et l’Agence Française de Développement.
Ce projet de réseau repose pour l’essentiel sur des structures existantes telles que le réseau océanien de
surveillance de la santé publique (ROSSP) de la CPS, et l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie (IPNC). A
terme, l’efficacité et la fiabilité d’un tel réseau dépendra pour une grande part de la capacité des
partenaires régionaux (ILM en particulier) à répondre aux sollicitations dans le domaine de la recherche,
du développement et de la formation en entomologie médicale.
Le projet soumis par l’ILM vise spécifiquement à renforcer la structure et la capacité en Entomologie
médicale en Polynésie française pour répondre de façon adaptée :
à la forte demande régionale en terme de soutien scientifique, logistique et de formation dans le
domaine de l’entomologie médicale.
aux besoins en infrastructure des multiples programmes de recherche de lutte contre les vecteurs de
maladies infectieuses (filariose, dengue) récemment initiés au sein du LEM.
Objectifs
Le présent projet se décline en trois objectifs principaux :
Développer un centre d’excellence en Entomologie médicale sur la station de recherche ILM de Paea
qui soit capable de relever les défis technologiques requis pour le contrôle efficace voire l’élimination
des populations de vecteurs et des maladies qu’ils transmettent.
Assurer la formation des futurs agents de terrain qui seront impliqués dans les cinq à dix prochaines
années à la mise en œuvre de méthodes de lutte antivectorielle intégrée et durable sur le territoire et
au niveau régional.
Développer une structure permettant l’accueil temporaire sur le site de Paea de chercheurs français
et étrangers, ainsi que des étudiants et stagiaires locaux et régionaux.
Ce projet dont les premiers bénéficiaires seront le Pays et sa population est en droite ligne avec la mission
et les axes prioritaires définis en matière de Santé (filariose, dengue) par l’Etat et le Ministère et la
Direction de la Santé polynésiens.
Statut
Ce document soumis auprès du ministère de la Santé en février 2007 est en attente d’une décision finale.
Projet de recherche en coordination – « Développement de systèmes standardisés
d’élevage de moustiques mâles en masse »
La mise au point de méthodes innovantes de lutte antivectorielle représente des défis scientifiques et
technologiques conséquents. En particulier, la stratégie de lutte biologique dont la faisabilité sur le terrain
est en cours d’étude au LEM repose sur le lâcher en grand nombre de moustiques mâles stérilisants. Cette
approche implique le développement et la maîtrise d’une technologie appropriée de production de
moustiques en masse.
L’unité d’entomologie de l’Agence Internationale de l’Energie Atomique (AIEA) travaille depuis plusieurs
décennies à la mise en œuvre à travers le monde de programmes d’élimination d’espèces nuisibles ayant
un impact agronomique, vétérinaire ou médical. Ces programmes reposent tous sur la technique dite de
l’insecte stérile (TIS), dont le principe similaire à la méthode testée par le LEM repose également sur la
production en masse d’individus mâles de l’insecte cible.
L’AIEA a initié récemment un programme de recherche en coordination dont l’objectif est le
développement de systèmes d’élevage de masse de moustiques mâles. Le LEM a déposé une proposition de
recherche pour intégrer ce réseau de travail en coordination.
Objectif
Tester une cage d’élevage prototype mise au point par l’unité d’entomologie de l’AIEA pour la production
en masse du moustique Aedes polynesiensis.
Rapport annuel 2007 31

Statut
La proposition de recherche soumise à l’AIEA a été acceptée et une convention de recherche entre l’ILM et
l’AIEA a été établie en fin d’année. Les activités relatives à ce programme de recherche en coordination
débuteront dès juin 2008.
Les activités de santé publique
Comité dengue
De janvier à avril 2007, le LEM, aux côtés du LABM, du LVM et de la Direction générale de l’ILM, a participé
aux réunions du Comité Dengue organisées dans les locaux de la Direction de la Santé. La présence du LEM
à ces réunions a permis d’échanger des informations quant à la situation épidémiologique et
entomologique relative à la dengue en Polynésie française.
Comité filariose
Le LEM a également participé à certaines des réunions du comité filariose organisées par la Direction de la
Santé afin de rencontrer, d’informer et de discuter avec les acteurs du service public impliqués dans la
surveillance et la lutte contre la filariose lymphatique sur le territoire. A cette occasion, les programmes
de recherche appliquée du LEM visant à l’élimination de la filariose ont été évoqués.
Les missions d’expertise en entomologie médicale
Missions sur le territoire...
Expertise entomologique sur l’atoll de Tetiaroa
Le LEM a effectué une mission conjointe avec la station de recherche GUMP sur l’atoll de Tetiaroa, du 13
au 18 mai 2007. Cette mission, réalisée pour le compte de l’entreprise Tahiti Beachcomber Société
Anonyme (TBSA), avait pour objectif l’établissement d’un inventaire des moustiques vecteurs (Culicidae)
et des insectes nuisibles (Ceratopogonidae) présents sur les principaux motu de Tetiaroa et d’une
cartographie des gîtes. Cette mission a permis d’évaluer le degré d’infestation de l’atoll et de définir les
risques entomologiques et épidémiologiques (notamment l’introduction de nouvelles espèces de
moustiques vecteurs et de maladies infectieuses qu’ils transmettent) associés à la réalisation d’une
structure hôtelière sur le motu Onetahi.
Dans son rapport d’expertise, le LEM dresse une liste de recommandations et d’actions prioritaires (charte
de protection destinée aux sociétés chargées de la réalisation des travaux sur le site, mise en place d’un
suivi entomologique régulier des espèces nuisantes) dont l’application à court et à moyen terme limitera le
risque épidémiologique.
Cette mission a également confirmé l’intérêt que représente le futur programme de recherche intitulé
« Intégration d’une lutte antivectorielle appropriée requise pour l’élimination de la filariose lymphatique
dans le Pacifique Sud » pour l’atoll de Tetiaroa, si ce dernier venait à être sélectionné comme site
d’étude.
Ce programme financé pour une durée de 5 ans par la Fondation Bill & Melinda Gates permettrait de faire
bénéficier l’atoll de Tetiaroa de méthodes de lutte biologique innovantes, respectueuses de
l’environnement, dont l’objectif est la réduction voire l’élimination d’Aedes polynesiensis, principal
vecteur de la filariose lymphatique.
Ce programme de recherche serait donc en parfaite adéquation avec les impératifs de protection de
l’environnement d’un atoll qui fait actuellement l’objet d’une demande de protection et de classement
comme site naturel protégé.
Missions scientifiques de terrain
Par ailleurs, le LEM a réalisé 4 missions de terrain dans le cadre de ses programmes de recherche :
Raiatea : Evaluation de la faune culicidienne sur trois motu de Raiatea (progr. ILM-UKY-NIH)
Raiatea : Information, communication et poursuite de l’évaluation de faune culicidienne (programme
NIH)
Raiatea : Poursuite de la surveillance culicidienne dans le cadre du programme NIH, communication
avec le propriétaire du motu Tiano et installation et paramétrage de la station météorologique.
Moorea : Etude multicentrique de la filariose, évaluation des outils de diagnostic à partir de
moustiques collectés dans la vallée d’Afareaitu, Moorea.
Rapport annuel 2007 32

...et en Outre-Mer
Vers une lutte antivectorielle durable sur l’île de La Réunion
En qualité de membre du comité de pilotage scientifique, le Dr BOSSIN a été convié à la réunion de
finalisation du projet d’étude de faisabilité de la technique de l’insecte stérile. Cette réunion était
organisée du 13-15 février 2008 à Saint-Denis de La Réunion, dans le tout nouveau Centre de Recherche et
de Veille sur les Maladies Emergentes dans l'Océan Indien (CRVOI). Un panel d’experts dans les domaines
de l’entomologie médicale, de l’épidémiologie infectieuse et des sciences sociales était présent pour
finaliser la proposition de recherche destinée à la lutte durable contre les moustiques (Aedes albopictus,
Anopheles arabiensis), vecteurs de maladies tropicales infectieuses (Chikungunya, paludisme) à la
Réunion.
La problématique des maladies infectieuses transmises par moustiques vecteurs en Polynésie française
ainsi que les travaux du LEM réalisés en partenariat avec l’Université du Kentucky et visant au
développement d’une lutte intégrée et durable contre le vecteur de la filariose lymphatique ont été
présentés.
A travers cette rencontre, des contacts nouveaux ont pu être noués avec les divers acteurs réunionnais et
nationaux impliqués dans la recherche en entomologie médicale (IRD Montpellier, CIRAD, CRVOI) et dans la
lutte antivectorielle (DRASS Réunion-Mayotte).
La communication scientifique
Organisation de séminaires
Second séminaire en entomologie médicale associée à la Polynésie
Deuxième atelier de recherche après un précédent en 2005, ce séminaire organisé par l’ILM du 19 au
23 février 2007, était centré sur les moustiques vecteurs de maladies infectieuses en Polynésie française,
en particulier la filariose lymphatique. Cet atelier a rassemblé sur Tahiti les compétences de nombreux
experts et des partenaires scientifiques internationaux.
Présentation des travaux du LEM à des congrès internationaux
Congrès annuel de l’association américaine de lutte antivectorielle (AMCA)
Ce congrès qui s’est tenu du 1 er au avril 2007 à Orlando (Floride), comprenait des présentations, des
stands et la démonstration d’équipements illustrant les derniers développements scientifiques, techniques
et méthodologiques dans le domaine de la lutte antivectorielle. Cette conférence a offert une excellente
opportunité pour interagir avec les professionnels de la lutte antivectorielle, les scientifiques et les
formateurs venus de par le monde.
Conférence annuelle de l’association européenne de lutte antivectorielle (EMCA)
Cette conférence, organisée du 11 au 14 septembre 2007 à Prague (République tchèque), réunissait un
grand nombre de collègues français et européens directement impliqués dans :
la lutte anti-vectorielle contre moustiques et moucherons suceurs de sang,
les activités parallèles telles que l’intégration de systèmes d’information géographique (SIG) dans les
programmes de contrôle, dans les plans d’action de lutte contre les moustiques sévissant dans des
écosystèmes particuliers et dans les méthodes de lutte innovantes.
Une conférence (15 min) intitulée « Toward a sustainable vector control strategy » a été présentée
soulignant la nécessité d’une lutte antivectorielle innovante au soutien de la campagne d’éradication de la
filariose dans le Pacifique Sud. La possibilité d’une application future de la technologie en cours
d’évaluation à l’ILM dans d’autres systèmes insulaires et contre d’autres moustiques vecteurs a également
été évoquée.
Le laboratoire de recherche en parasitologie médicale
L’équipe
Anne-Marie LEGRAND, chef de service
Catherine PLICHART, ingénieur de recherche
Rapport annuel 2007 33

Les activités de recherche
Participation à une étude multicentrique internationale pour la validation d’outils
de surveillance dans le cadre du programme mondial d’élimination de la filariose
lymphatique
La filariose lymphatique de Bancroft, variété pacifica, demeure un problème de santé publique
principalement dans les archipels de la Société et des Marquises. Si les formes extrêmement invalidantes
comme l'éléphantiasis ou l'hydrocèle ont pratiquement disparu grâce à divers essais de chimioprotection de
masse (actuellement il s’agit d’une bithérapie communautaire Notézine-Albendazole une fois par an), la
prévalence des formes courantes de l’infection est mal estimée car celles-ci passent souvent inaperçues.
La recherche d’antigènes du ver adulte dans le sang (par un test ELISA de laboratoire quantitatif et un test
de terrain qualitatif) permet d’évaluer le niveau du parasitisme dans la population, la détection des IgG4
anti-parasitaire dans le sang et les urines donne une estimation du niveau d’exposition aux larves
infectantes tandis que la recherche de microfilaires circulantes dans le sang capillaire conduit à estimer le
niveau de transmission possible dans la population.
Sur le site d’étude retenu, situé à Moorea, district d’Afareaitu, une population de plus de 1000 personnes
habitant 343 maisons du district et un groupe d’enfants scolarisés (365 enfants de 6-7 ans et 9-10 ans de
5 écoles différentes) ont fait l’objet d’une enquête avec questionnaire, prélèvement de sang capillaire au
bout du doigt et recueil des urines.
Les deux principaux objectifs de cette étude étaient :
étudier et comparer la validité des tests de laboratoire disponibles afin d’identifier le ou les
meilleur(s) outil(s) de suivi de l’élimination de la filariose au plan mondial,
estimer la prévalence de l’infection, le niveau d’exposition aux piqûres de moustiques infectantes et
le niveau de transmission dans la population humaine du site étudié.
Les résultats actuels qui portent sur le deuxième objectif et ne sont que partiels montrent une prévalence
du parasitisme filarien de l’ordre de 12% dans la population générale du site étudié, avec près de 3% de
porteurs de microfilaires. Dans le groupe d’enfants, près de 2% sont porteurs de vers adultes mais sans
microfilaires circulantes. Les analyses complémentaires se poursuivent, les données globales ne seront
disponibles que dans plusieurs mois. Ces éléments d’information présentées récemment à la Direction d la
Santé ont été prises en compte pour la mise en place d’un sondage du niveau de prévalence de l’endémie
dans les 5 archipels en vue de l’élaboration d’une nouvelle étape dans la stratégie de lutte contre
l’endémie filarienne.
Surveillance biologique et entomologique de la filariose : mise au point et validation
de la détection de larves de Wuchereria bancrofti dans le sang des patients par PCR
en temps réel
En 1993, une technique permettant la détection du parasite Wuchereria bancrofti dans le moustique Aedes
polynesiensis par amplification spécifique de son ADN (PCR) a été développée au laboratoire. Les
amplicons étaient détectés par électrophorèse sur gel d’agarose. En 2006, nous avons adapté cette
technique sur un appareil (Icycler iQ, Biorad) qui permet de réaliser une PCR en temps réel, grâce à une
détection des amplicons par fluorescence.
En 2007, nous avons pris la même approche pour la détection des microfilaires dans le sang des patients. A
ce jour, la microfilarémie, est déterminée par comptage direct des microfilaires, après coloration d’une
membrane nucléopore sur laquelle 1 ml de sang a été filtré. Cette technique nécessite beaucoup de petit
matériel et de manipulations. Le travail de mise au point d’une PCR quantitative pour permettre d’obtenir
la microfilarémie à partir du dosage de l’ADN spécifique de W. bancrofti dans le sang a porté sur les points
suivants :
matériel biologique : sang veineux total (frais ou congelé), quantité à traiter, déhémoglobinisation
des hématies,
extraction de l’ADN total : comparaison de 3 kits commercialisés, optimisation du dépôt, des lavages
et de l’élution de l’ADN total,
amplification de l’ADN spécifique : optimisation du kit réactionnel, des amorces et de la
température d’hybridation,
établissement d’une courbe de référence (Ct /Mf par mL) : quantification à partir d’une gamme de
prélèvements (extraits de différents lots d’un nombre croissant de microfilaires de 1 à 1000),
détection quantitative par fluorescence : essais des deux approches possibles.
1) utilisation d’un marqueur fluorescent (SYBR Green) mis dans le milieu réactionnel, (non stimulé à
l’état libre, il devient fluorescent lorsqu’il se fixe sur de l’ADN double brin au fur et à mesure de
la réplication de celui-ci),
Rapport annuel 2007 34

2) utilisation d’une sonde fluorescente (sonde Taqman porteuse d’un fluorochrome non stimulé à
l’état libre ; elle s’hybride à l’ADN mono brin dénaturé en même temps que les amorces et
devient fluorescente après sa libération par hydrolyse sous l’action de la polymérase, au fur et à
mesure de la réplication de l’ADN).
L’optimisation des différentes procédures est terminée ; le travail en vue de l’établissement d’une courbe
de référence est à poursuivre.
La doxycycline dans la chimiothérapie individuelle contre la filariose lymphatique
de Bancroft ; essai thérapeutique ciblant la bactérie Wolbachia (Rickettsiae),
endosymbiote de la filaire Wuchereria bancrofti var. pacifica.
Depuis quelques années, de nouvelles voies de recherche se sont ouvertes dans la communauté
scientifique filarienne grâce à la re-découverte des bactéries Wolbachia, bactéries endocellulaires
présentes dans un certain nombre de parasites nématodes. Ces bactéries semblent jouer un rôle important
dans la biologie du parasite et contribuer à la pathogenèse. Chez plusieurs espèces de filaires disposant
d'un modèle animal, il a été montré qu’un traitement antibiotique adapté entraîne des modifications de
l'embryogenèse, de la fertilité et du développement du parasite. Concernant Wuchereria bancrofti, deux
essais thérapeutiques menés chez l’homme en 2001 et 2003 ont montré que la chimiothérapie des
filarioses par la doxycycline induit une stérilité durable du parasite. En ce qui concerne la pathogenèse,
caractérisée par des réponses inflammatoires aiguës ou chroniques générées soit par le parasite soit par le
système immunitaire du patient, de nombreuses interrogations demeurent mais plusieurs équipes
s’intéressant particulièrement aux mécanismes immuno-pathologiques ont cherché à étudier le rôle des
bactéries Wolbachia.
Dans un précédent programme de recherche mené au cours de la période 2002-2004 (et valorisé en 2005,
voir publications), nous avons démontré la présence d’une lignée de ces bactéries dans la filaire
responsable de la filariose lymphatique en Polynésie, Wuchereria bancrofti var. pacifica. En conséquence,
un essai thérapeutique comprenant un traitement antibiotique à la Doxycycline associé au classique
traitement anti-filarien à la Notézine a été préparé en 2005. Un protocole détaillé a été arrêté en
collaboration avec le Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique (CIE). Le projet a
été soumis à l’avis du Comité d’éthique de Polynésie française (avis favorable n°22 du 8 août 2005).
Le projet, présenté à nouveau à l’occasion du Conseil scientifique de l’établissement, en juin 2007, a été
suspendu, le pré-recrutement des patients pour un suivi de leur situation parasitaire avant traitement et le
lancement de l’essai proprement dit n’ayant pas pu être réalisés au cours du premier semestre 2007 par
manque de disponibilité de l’équipe médicale du CIE.
Données et expérimentations sur les Wolbachia, bactéries endosymbiontes du
moustique-vecteur de la filariose lymphatique de Bancroft dans le cadre de la
recherche de méthodes innovantes de lutte biologiques anti-vectorielles (Clément
FROISSART, Thèse de Pharmacie)
Les mécanismes de contrôle de la reproduction des arthropodes par les bactéries Wolbachia apparaissent
comme une voie tout à fait innovante et intéressante dans de nombreux domaines.
En ce qui concerne la lutte contre la filariose, nous avons montré, à partir de divers lots de moustiques
provenant de divers archipels de Polynésie française, que ce moustique-vecteur contient une souche de
Wolbachia. Conjointement avec le Laboratoire d’Entomologie de l’Université du Kentucky, par séquençage
de gènes wsp et ftsz de cette bactérie, nous avons montré son appartenance stricte au clade A de ces
symbiotes, puis par des essais de traitement du moustique par l’antibiotique Doxycycline nous avons pu
observer l’élimination du symbiote. En outre, par des essais de croisement d’Aedes polynesiensis avec le
moustique Aedes riversi porteur d’une Wolbachia appartenant au clade B, les entomologistes de
l’Université du Kentucky ont prouvé la susceptibilité d’Aedes polynesiensis au phénomène
d’incompatibilité cytoplasmique (IC) conduisant à une dégénérescence des progénitures.
L’IC engendrée lors de la fécondation des œufs par l’association de deux Wolbachia n’appartenant pas à la
même souche serait l’arme à utiliser pour une régulation du vecteur sur le territoire polynésien. Il reste
cependant beaucoup d’aspects à étudier sur les mécanismes interagissant entre Aedes polynesiensis et ses
Wolbachia, mais aussi sur la dissémination du symbiote à travers les générations (transferts horizontaux
possibles) pour envisager une lutte efficace et contrôlée.
Il est important de connaître :
la phylogénie stricte des Wolbachia naturellement présentes chez Aedes polynesiensis et celles
pouvant l’infecter car les cas de mono et de bi-infections ne se comportent pas de la même manière
vis-à-vis de l’incompatibilité cytoplasmique ;
la localisation des Wolbachia dans les tissus du moustique pour envisager le coût de l’infection sur la
propension du vecteur à induire l’IC ;
Rapport annuel 2007 35

sachant que la diversité et la densité des symbiotes sont deux facteurs déterminants de l’évolution
des symbioses intracellulaires mais qu’Aedes polynesiensis n’est pas sujet à des infections multiples,
les paramètres régulant la densité bactérienne au sein de l’hôte sont à prendre en compte et leur
importance relative à déterminer, notamment la température du milieu, la qualité de l’hôte (âge,
poids, taille) et le génotype de la bactérie.
Des études expérimentales ont donc été réalisées sur la localisation, la densité et le typage des Wolbachia
chez les deux moustiques sensibles à la filaire de Bancroft en Polynésie française, Aedes polynesiensis
(mâles et femelles), vecteur principal et Culex quinquefasciatus (femelles seulement), vecteur potentiel,
en traitant séparément les trois parties de l’organisme impliquées dans les phénomènes de transmission
des filaires (tête, thorax et abdomen). La technique utilisée a été l’amplification génique (PCR) en temps
réel qui permet de typer et de quantifier l’ADN du symbiote bactérien dans l’organisme du moustiquevecteur.
Après un travail de mise au point afin d’optimiser les conditions d’extraction, d’amplification et
de quantification de l’ADN (élaboration d’une courbe étalon), les résultats obtenus ont été les suivants :
Tous les modèles testés (Aedes polynesiensis, mâles et femelles, et Culex quinquefasciatus femelles)
possèdent une bactérie endosymbionte ;
Proportionnellement (quantification basée sur 20 individus), les Aedes polynesiensis femelles en
renferment plus que les mâles de la même espèce, et plus que les femelles de l’espèce Culex
quinquefasciatus ;
Pour chaque espèce de moustique, la localisation est prépondérante dans l’abdomen, moindre dans le
thorax et absente dans la tête (absence confirmée après élimination du risque de contamination par
des inhibiteurs de PCR) ;
Le typage, effectué par PCR spécifique sur des lots d’individus femelles seulement, confirme la
présence d’une bactéries du clade A pour Aedes polynesiensis et démontre la présence d’une bactérie
du clade B pour Culex quinquefasciatus.
Ces données sont prises en compte dans la mise en place et la conduite du programme de recherche en
entomologie médicale LEM-Université du Kentucky-National-Institute of Health auquel le LPM participe.
Le laboratoire de recherche en virologie médicale
L’équipe
Rémy TEYSSOU, chef de service (jusqu’au 17 juillet 2007)
Van Mai CAO-LORMEAU, chef de service (à compter du 18 juillet 2007)
Claudine ROCHE, ingénieur de recherche
Jérôme VIALLON, technicien supérieur de laboratoire
Les activités de recherche
2007 a été une nouvelle année de transition pour le LVM, avec la nomination au second semestre du
Dr CAO-LORMEAU au poste de responsable du laboratoire en remplacement du Pr TEYSSOU, appelé à
exercer les fonctions de Directeur général par intérim de l’ILM.
Les activités de recherche se regroupent en quatre grandes thématiques ayant pour objectif commun de
contribuer à l’amélioration des connaissances et des outils, dans une perspective de meilleure prévention
contre la dengue et autres arboviroses à risque épidémiologique pour la Polynésie française :
Le virus de la dengue en Polynésie française et dans le Pacifique ;
Etude des interactions moléculaires « virus de la dengue/salive du vecteur/agents de la réponse
immunitaire humaine » ;
Standardisation d’outils moléculaires pour la surveillance entomologique et biologique de la dengue et
autres arboviroses ;
Etude de la pathogenèse des formes sévères chez l’homme.
Le virus de la dengue en Polynésie française et dans le Pacifique
Identification de marqueurs moléculaires corrélés à la virulence et à l’atténuation de
souches virales de dengue 3 isolées en Polynésie française
Collaborateurs
I. SCHUFFENECKER et H. ZELLER (CNR Lyon)
Objectif
Ce programme a pour objectif l’identification de déterminants génétiques spécifiques du génotype IV
de dengue 3 (DEN-3). Ce génotype, à l’origine des épidémies de 1964 et 1969 en Polynésie française,
Rapport annuel 2007 36

n’a à notre connaissance jamais entraîné de forme clinique sévère. Notre hypothèse est que l’absence
de virulence des souches de DEN-3 de génotype IV est en partie portée par des déterminants
génétiques spécifiques ; dont l‘identification pourraient conduire à celle de variants de virulence et
contribuer à la prédiction du risque de sévérité des épidémies.
Etude
La Polynésie française (PF) a connu trois épidémies de DEN-3, en 1964, 1969 et 1989. Les deux
premières épidémies, au cours desquelles ont été isolées des souches de DEN-3 du génotype IV
(génotype américain), ont entraîné exclusivement des formes cliniques bénignes (DF). Par contre,
l’épidémie de 1989, qui a pour origine des souches de DEN-3 du génotype I (génotype du sud-est
asiatique et du Pacifique Sud), a été qualifiée de sévère en raison de l’observation de nombreux cas
graves (DH/DSC). Les génotypes II et III, isolés respectivement en Thaïlande et dans le sous-continent
indien, ont également été impliqués dans des épidémies sévères. D’après ces observations, le
génotype IV peut être considéré comme celui présentant le potentiel de virulence le moins élevé.
Afin d’étayer cette hypothèse, nous nous proposons d’étudier les différences génétiques de souches
de DEN-3 de génotypes I et IV. Un intérêt majeur à la réalisation de cette étude avec des souches de
PF est que les deux génotypes ont circulé dans le même contexte géographique, éco-biologique
(climat, espèces vectorielles) et humain (faibles flux de population). Cette situation permet de
réduire, au moins en partie, les biais liés au contexte et considérer que la différence épidémiologique
majeure entre ces génotypes réside dans leur capacité à causer ou non des formes cliniques sévères.
La comparaison des séquences de ces souches de DEN-3 devrait conduire à l’identification de
séquences spécifiques du génotype IV, lesquelles pourraient être impliquées dans le potentiel de
moindre virulence de ce génotype.
Etat d’avancement des travaux/Résultats
La séquence complète d’une souche isolée en PF en 1964 (Tahiti64/228771, PF64) a été réalisée et
comparée à la séquence complète de 17 souches de génotype I isolées en PF en 1989 (séquencées lors
d’une précédente étude), ainsi qu’à celles de 56 autres souches de DEN-3 obtenues sur GenBank.
Aucune des séquences complètes disponibles n’appartenait au génotype IV.
La comparaison des séquences a permis d’identifier des différences sur les gènes structuraux et nonstructuraux.
Sur un total de 3390 acides aminés (aa), 70 substitutions spécifiques du génotype IV ont
été identifiées. Le plus grand nombre de substitutions observé se trouve sur le gène E, le taux de
substitution le plus élevé est observé sur le gène NS2a et le plus bas est observé sur le gène NS3. Dans
les régions non codantes (NC), seule la région 3’NC porte des substitutions en nucléotides (nt)
spécifiques du génotype IV, ainsi qu’une insertion d’un nucléotide en position 10433.
L’analyse phylogénétique des séquences a permis d’observer que le génotype IV est le plus éloigné,
avec plus de 10% de divergence (les génotypes I, II ou III divergent entre eux de moins de 8%).
Conclusions et perspectives
De nombreuses substitutions spécifiques du génotype IV ont été observées. Cependant, avant d’établir
un lien entre le potentiel de virulence du virus la dengue et ces changements en nt et/ou aa, nous
souhaitons confirmer nos résultats et vérifier la spécificité des substitutions observées. Nous avons
contacté le CNR de Lyon pour obtenir un nouvel échantillon des souches PF64 et PF69. Ces deux
souches nous sont parvenues à la fin du mois de décembre 2007 et seront entièrement séquencées. Si
de nombreuses différences sont observées entre les souches PF64 et PF69, nous tenterons d’obtenir et
séquencer d’autres souches du génotype IV, notamment des souches de Porto Rico des années 60-70.
Ceci, afin d’augmenter la représentativité du génotype et distinguer les substitutions spécifiques de la
souche de celles liées au génotype.
Etude de la variabilité génomique des souches virales de dengue 1 circulant en
Polynésie française de 2001 à 2006
Collaborateurs
X. de LAMBALLERIE (Unité des virus émergents, UMR 190 IRD-Université Aix-Marseille II), S. LASTERE
(LABM)
Objectif
L’objectif de ce programme était de déterminer l’origine, l’évolution et la variabilité génétique des
virus de DEN-1ayant circulé en Polynésie française de l’épidémie de 2001 à celle de 2006-07.
Etude
La première partie de l’étude a consisté en la comparaison : des séquences du gène codant pour la
protéine d’enveloppe (E) de 181 souches de DEN-1ayant circulé en PF de février 2001 à décembre
2006, ainsi que des séquences de la région codante complète de 12 de ces souches. Il s’agissait dans
un premier temps de déterminer si l’épidémie de 2006 était liée à l’introduction d’un nouveau
génotype ou à la réémergence locale du génotype viral « endémisé » après l’épidémie de 2001.
L’analyse des séquences, en corrélation avec les données temporelles et géographiques associées à
Rapport annuel 2007 37

chaque souche, devait ensuite contribuer à identifier les caractéristiques de l’évolution génétique des
souches de dengue dans le contexte polynésien.
La diversité génétique virale ne s’exprime pas uniquement à l’échelle des populations (inter-hôtes),
elle existe également à l’échelle de l’individu infecté (intra-hôte). Chez l’homme comme chez le
vecteur, l’infection est le fait d’une population de virus génétiquement proches mais différents
appelés « quasi-espèces ». La seconde partie de l’étude a consisté en la comparaison des séquences
partielles du gène E (760 pb) d’une cinquantaine de clones provenant de 12 souches de DEN-1. La
structure des quasi-espèces composant chacune de ces souches virales a ensuite été analysée en
corrélation avec différentes données, notamment cliniques et épidémiologiques.
Etat d’avancement des travaux / Résultats
1. Sélection des souches de DEN-1
Une base de données des patients pour lesquels un diagnostic biologique de dengue a été prescrit et
réalisé à l’ILM, entre le 1 er janvier 2001 et le 1 er janvier 2007, a été constituée. Les données de l’ILM
ont été complétées par celles recueillies auprès de la Direction de la Santé et du Centre Hospitalier de
Polynésie française (CHPf). Sur la base de leur répartition dans le temps, dans l’espace (île ou archipel
d’origine) et selon le statut clinique du patient, 214 sérums ont été présélectionnés. Après révision
des dossiers médicaux de l’ensemble des patients hospitalisés au CHPf, la classification des cas
cliniques a été réalisée selon les critères de l’OMS. Sur cette présélection, 181 souches (150 DF,
19 DHF, 12 DSS dont 1 décès) ont pu être exploitées. L’analyse phylogénétique réalisée sur ces 181
souches a révélé différents groupes, au sein desquels 12 souches ont ensuite été sélectionnées pour
l’analyse des séquences génomiques complètes et des quasi-espèces.
2. Divergence des séquences et analyse phylogénétique
Analyse des séquences du gène E de 181 souches de DEN-1 isolées en PF de 2001 à 2006
La divergence génétique moyenne est de 0,4% au niveau nucléotidique (nt) et de 0,3% au niveau acide
aminé (aa). Les substitutions se situent sur 128 sites nt, 47 ont induit un changement en aa (33 sont
spécifiques aux souches de PF). Les taux de positions mutées et les pourcentages de divergence de
séquences sont globalement plus élevés pendant la période endémique 2002-05 que pendant les
épidémies de 2001 et 2006 : environ la moitié des changements détectés en aa sont survenus pendant
la période endémique. La mutation la plus fréquente, retrouvée chez 88 souches (49%), correspond au
remplacement d’une sérine par une thréonine dans le domaine II de la protéine E. Cette mutation,
inexistante en 2001, est apparue en 2002 et s’est stabilisée au fil des années pour être retrouvée chez
toutes les souches de 2004 à 2006.
D’après l’analyse phylogénétique, toutes les souches PF 2001-06 appartiennent au génotype IV, lequel
comprend également d’autres virus isolés dans le Pacifique, en Asie du Sud Est et dans l’Océan Indien.
Les souches PF 2001-06 partagent un ancêtre commun avec une souche isolée en Indonésie en 1998 et
une plus ancienne isolée en 1988, ceci suggère que l’épidémie de DEN-1 survenue en PF en 2001 serait
liée à l’introduction d’une souche provenant d’Indonésie. Les souches de DEN-1 ayant circulé à Hawaii
en 2001 appartiennent à la même lignée que celles ayant circulé en PF en 2001. Cette observation
conforte l’hypothèse selon laquelle l’épidémie de DEN-1 survenue à Hawaii en 2001 serait liée à
l’introduction de souches virales de PF.
L’évolution du virus DEN-1 en PF de 2001 à 2006 est marquée par un net regroupement temporel en
4 groupes : 2001-2002 ; 2003 ; 2004 ; 2005-2006. Aucun regroupement corrélé à l’origine géographique
ou à la sévérité clinique des cas n’a été mis en évidence. Cependant, un sous-groupe composé de
souches isolées en 2006 à Moorea, Raiatea, Tahaa et les Australes, s’est dégagé. Ces souches portent
toutes la même mutation (domaine III de la protéine E), or celle-ci n’est portée par aucune des
souches isolées à Tahiti en 2006. Cette mutation pourrait être la conséquence d’une sélection exercée
par l’espèce vectorielle. En effet, elle est portée par des souches issues d’îles moins urbanisées que
Tahiti, dans lesquelles le vecteur Aedes polynesiensis (espèce plus rurale) est probablement plus
représenté qu’Aedes aegypti (espèce plus urbaine). Cette hypothèse mérite d’être confortée par des
données entomologiques plus précises sur la répartition des ces deux espèces de moustique dans les
îles.
Analyse des séquences complètes de 12 souches de DEN-1 isolées en PF de 2001 à 2006
La divergence génétique moyenne entre les 12 séquences complètes est de 0,3% au niveau nt et de
0,1% au niveau aa. Sur 10175 sites nt, 117 mutations sont identifiées, dont 23 induisent un
changement en aa. Tous les gènes, à l’exception de NS4a , sont concernés par ces mutations. Quatre
mutations en aa se sont fixées dans le temps sur E, NS4b et NS5. Ces mutations sont nouvellement
décrites, à l’exception de la mutation T3144I sur NS5 déjà présente sur 9 souches impliquées dans des
épidémies antérieures de DEN-1 dans le Pacifique et dans l’Océan Indien.
3. Estimation des pressions de sélection et analyse des quasi-espèces
Le mode d’évolution des virus DEN-1 en PF est évalué par le calcul des ratios de substitutions non
synonymes (dNS) et synonymes (dS) et le rapport dNS/dS par site. Le ratio dNS/dS est de 0,091 pour
Rapport annuel 2007 38

les 181 séquences d’enveloppe et de 0,100 pour les 12 séquences complètes. Ces résultats sont en
faveur d’une sélection négative ou purifying selection (dNS/dS

7) La structure des quasi-espèces virales est différente selon la forme clinique : les ratios dNS/dS et la
proportion de mutants avec des mutations NS est plus faible dans les formes cliniques sévères
(DHF/DSS) que dans les formes classiques (DF). Ces résultats suggèrent l’existence de fortes
pressions de sélection négatives dans le cas de formes cliniques sévères.
Une analyse complémentaire élargie aux quasi-espèces virales de l’ensemble des formes sévères de
DEN-1 répertoriées dans cette étude est nécessaire. De même, l’analyse des quasi-espèces virales
chez les moustiques vecteurs de la dengue en Polynésie française devrait permettre d’approfondir les
hypothèses suggérées par les résultats de cette étude.
Historique et dynamique des épidémies de dengue en Polynésie française
Collaborateurs
A. WIEGANDT (Direction de la Santé) et S. LASTERE (LABM)
Objectif
L’objectif de cette étude est d’identifier les facteurs et les événements sur lesquels repose la
dynamique particulière des épidémies de dengue en Polynésie française. Les résultats de cette étude
contribueront à la mise en place d’une surveillance proactive contre la dengue.
Etude
En PF, la première épidémie de dengue dont le sérotype a été clairement identifié était due au
sérotype 1, en 1944. Depuis, le pays a connu onze épidémies de dengue. A partir du milieu des années
50, les données épidémiologiques, cliniques et virales ont été enregistrées, archivées et parfois
publiées par l’ILM et plus particulièrement le LVM. La réalisation d’un historique de ces épidémies
ainsi que la compilation et le traitement des données enregistrées à l’ILM tout au long de ces années,
en corrélation avec d’autres informations (notamment démographiques – Institut de la statistique de
PF), contribueront à l’identification des facteurs et des événements qui caractérisent l’épidémiologie
de la dengue en PF.
Etat d’avancement des travaux/Résultats
Un important travail de récupération de données a été réalisé dans les archives de l’ILM. Pour chaque
épidémie et période inter-épidémique nous avons tenté de retrouver les informations suivantes : le
nombre de cas suspects, le nombre de cas confirmés, l’âge des cas, l’origine géographique des cas, le
sérotype viral responsable de l’infection, la durée de circulation de chaque sérotype (génotype)
viral,… Ces données ont été traitées en corrélation avec les données démographiques transmises par
l’ISPF, afin de réaliser les profils de taux d’attaque par âge pour les différentes épidémies.
Conclusions et perspectives
L’analyse des profils réalisés à partir de la compilation des données a conduit aux conclusions
suivantes :
1) En PF, les épidémies de dengue peuvent être déclenchées par deux événements distincts :
l’introduction d’une nouvelle souche virale ou la ré-émergence de la souche virale « endémisée »
après la précédente épidémie.
2) Contrairement aux autres régions du monde où la dengue est endémique, il n’y a pas en PF de cocirculation
persistante de plusieurs sérotypes : le sérotype viral nouvellement introduit remplace
rapidement celui circulant précédemment. L’hypothèse d’une compétition entre les sérotypes
viraux pour les hôtes humain et vecteur peut être avancée.
3) Les profils épidémiques sont différents d’une épidémie à l’autre (durée de l’épidémie, tranches
d’âges touchées), ils sont notamment liés à la taille de la population humaine susceptible au
moment de l’introduction de la nouvelle souche virale. La ré-émergence est un phénomène
épidémique particulier, qui survient après une période de 5 à 6 ans de circulation virale à faible
incidence et qui est porté par le renouvellement de la population susceptible par les naissances et,
surtout, les nouveaux résidents.
4) La dynamique des épidémies de dengue en PF suit globalement une séquence cyclique DEN3/2/1/4
avec un renouvellement tous les 20/25 ans. Ce délai semble correspondre à la durée nécessaire pour
que la population susceptible atteigne une taille suffisante pour que l’épidémie s’installe
durablement. L’épidémie de DEN-1 de 1988 n’est survenue que 9 ans après la précédente de même
sérotype, or elle a été furtive et rapidement remplacée par une épidémie de DEN-3 (le sérotype 3
n’avait pas circulé en PF depuis 20 ans). Dans ce modèle cyclique la DEN-4 présente actuellement le
risque épidémique le plus élevé pour la PF.
Un poster résumant le travail réalisé a été présenté lors du Congrès de l’American Society of Tropical
Medicine and Hygiene (Philadelphie, novembre 2007). Une publication sur les résultats de cette étude
sera rédigée en 2008.
Rapport annuel 2007 40

Dynamique des quasi-espèces de dengue: (i) in vivo dans le sang capillaire; (ii) in vitro
sur lignées cellulaires de mammifère et de moustique
Collaborateurs
F. DEVAUD (Laboratoire d’analyses, Hôpital d’Uturoa, Raiatea), X. de LAMBALLERIE (Unité des
virus émergents, UMR 190 IRD-Université Aix-Marseille II)
Objectif
L’objectif de ce projet est d’étudier comment s’exprime et évolue la diversité génétique intra-hôte
(quasi-espèces) du virus de la dengue: (i) chez un patient, dans le sang veineux et le sang capillaire au
cours de l’infection; (ii) dans un modèle cellulaire du cycle de transmission (homme/moustique).
Etude
Chez l’homme comme chez le moustique, l’infection est le fait d’une population de virus présentant
des séquences génomiques différentes mais très proches : les quasi-espèces. La structure de ces quasiespèces
est portée, et évolue, selon des contraintes propres à l’espèce-hôte (homme, moustique) et à
l’individu-hôte (immunité mémoire, facteurs génétiques, …).
Jusqu’à présent, toutes les études génétiques du virus de la dengue ont été réalisées, chez l’homme,
à partir de sang veineux. Or, le prélèvement de sang infectant par le moustique a lieu au niveau des
capillaires sanguins. L’objet de cette étude est de comparer, chez un même patient, les quasi-espèces
circulantes (sang veineux) et celles susceptibles d’être prélevées par le moustique (sang capillaire).
De plus, afin de déterminer comment varie la population virale au cours de la période infectante et
identifier les régions soumises à sélection, les quasi-espèces virales seront analysées dans des
prélèvements séquentiels de sang capillaire du même patient.
En l’absence de modèle animal reproduisant l’infection humaine, les modèles in vitro restent
nécessaires pour étudier comment s’exercent les pressions de sélection au cours du cycle de
transmission. L’étude de la dynamique des quasi-espèces sur lignées cellulaires (mammifère et
moustique) a pour objet d’identifier l’impact des contraintes propres à chaque espèce-hôte et de la
combinaison de ces contraintes. Les quasi-espèces de dengue, issues d’un sérum de patient infecté,
seront analysées après plusieurs passages successifs : (1) sur lignée cellulaire de mammifère ; (2) sur
lignée cellulaire de moustique ; (3) en cultures cellulaires alternées.
Etat d’avancement des travaux/Résultats
1. Etude des quasi-espèces de dengue in vivo chez un patient
Présentation du projet au Comité d’Ethique de la Polynésie française
L’étude impliquant la contribution de patients pour le don de sang capillaire, le projet a été soumis
à l’avis du CEPF. Ce dernier a rendu un avis favorable en date du 6 septembre 2007 (N°37/CEPF -
Avis du 4 octobre 2007).
Recrutement des patients
D’octobre à décembre 2007, près d’une dizaine de patients, pour lesquels une demande de
diagnostic dengue avait été préalablement prescrite, ont accepté de participer à l’étude. Ces
patients ont été recrutés, d’une part, au Laboratoire d’analyse et à l’hôpital d’Uturoa et, d’autre
part, à l’ILM. La contribution des participants consistait ^à accepter : (1) que soient réalisés, au
bout du doigt, trois prélèvements séquentiels (tous les deux jours) de sang capillaire ; (2) que le
surplus de sang veineux prélevé pour la réalisation du diagnostic dengue soit ensuite utilisé pour
l’étude.
Sélection des échantillons et amplification d’une partie du gène E
Un patient, pour lequel le prélèvement de sang veineux et les trois prélèvements de sang capillaire
contenaient du virus circulant (RT-PCR positive), a été sélectionné pour l’étude. Chaque type de
prélèvement a été extrait et une partie du gène E (760 pb) a été amplifiée, puis envoyée à l’UVE
pour la réalisation du clonage et du séquençage des quasi-espèces. L’analyse des séquences sera
réalisée en 2008.
2. Etude des quasi-espèces in vitro sur lignées cellulaires de mammifère et de moustique
Les lignées cellulaires choisies pour l’étude sont C6/36 (issues de larves d’Aedes albopictus) et Véro
(cellules de reins de Singe Vert d’Afrique). Les C6/36 sont maintenues au laboratoire depuis
plusieurs années, la culture des Véro a été relancée en décembre 2007. Les expérimentations se
dérouleront en 2008.
Conclusions et perspectives
L’évolution génétique du virus de la dengue à l’échelle des populations est, non seulement, la
résultante de contraintes définies par le contexte (géographique, social, épidémiologique et écobiologique),
elle est également le fruit de la combinaison de contraintes inhérentes à l’espèce- et à
l’individu-hôte. L’analyse des quasi-espèces de dengue, chez l’homme et sur lignées cellulaires,
contribuera à identifier les régions génomiques virales soumises à sélection : chez un individu donné
au cours de l’infection ; chez chacune des deux espèce-hôtes au cours du cycle de transmission.
Rapport annuel 2007 41

Etude des interactions moléculaires « virus de la dengue/salive du vecteur/agents
de la réponse immunitaire humaine »
Caractérisation des protéines se liant au virus de la dengue dans les glandes salivaires de
moustiques vecteurs
Collaborateurs
D. CHAMPAGNE (University of Georgia)
Objectif
L’objectif du présent programme consiste à identifier les protéines capables de se lier au virus de la
dengue dans des extraits de glandes salivaires des moustiques vecteurs en Polynésie française, Aedes
aegypti et Ae. polynesiensis.
Etude
La dissémination du virus de la dengue dans les glandes salivaires du moustique, puis l’injection de
salive infectante à l’hôte humain, sont des événements clés du cycle de transmission ; ils constituent
de ce fait des niveaux d’action possibles pour rompre le cycle. Dans le cadre d’une précédente étude
(Thèse V.M. Cao-Lormeau, 2006), nous avions démontré la présence de cinq protéines (67, 77, 58, 54
et 37 kDa) capables de se lier aux quatre sérotypes de dengue dans les extraits de glandes salivaires
(EGS) d’Ae. aegypti et cinq autres (67, 56, 54, 50 et 48 kDa) capables de se lier aux sérotypes 1 et 4
dans les EGS d’Ae. polynesiensis. Sur la base de ces premiers résultats, de nouvelles expériences
seront réalisées. Les protéines contenues dans les EGS seront cette fois-ci séparées en plusieurs
fractions par HPLC (anion, cation, gel filtration). Les fractions seront ensuite déposées sur membrane
de nitrocellulose (Dot-Blot) et la présence de protéines capables de se lier au virus sera détectée par
VOPBA. Les protéines contenues dans les fractions positives en VOPBA seront ensuite séquencées et
identifiées.
Etat d’avancement des travaux/Résultats
La réalisation des VOPBA nécessite au préalable la préparation de virus semi-purifié. Une souche virale
de sérotype 1 a ainsi été amplifiée par plusieurs passages sur cellules C6/36. Les particules virales
contenues dans le surnageant de culture ont ensuite été concentrées au Polyéthylène glycol et semipurifiées
par ultracentrifugation en gradient de saccharose. L’opération a ensuite été renouvelée avec
des surnageants de culture non-inoculés qui seront utilisés comme témoins. Le Dr RICHARD du LVM a
commencé à travailler sur le programme en décembre 2007. La réalisation des tests de VOPBA sur les
Dot-Blots portant les fractions d’EGS débutera en 2008.
Conclusions et perspectives
L’identification des protéines capables de se lier au virus de la dengue dans les EGS de moustiques
vecteurs conduit à deux types de perspectives :
1) L’identification des molécules impliquées dans le processus d’entrée du virus dans les GS
contribuerait à l’identification de cibles pour de blocage de la transmission virale chez le vecteur
(des stratégies de ce type sont actuellement à l’étude contre les agents du paludisme).
2) Pour plusieurs espèces de vecteurs, dont Ae. aegypti, l’existence d’interactions entre la salive de
l’insecte et le système immunitaire de l’hôte a été démontrée. Or, ces interactions influent sur
l’infection de l’hôte par de nombreux pathogènes à transmission vectorielle. L’identification de
complexes formés entre le virus de la dengue et des protéines salivaires du moustique contribuerait
à la proposition d'hypothèses sur le rôle de la salive du vecteur sur l’établissement de l’infection.
Dans le concept du « Surface Mosaïc World » la formation de tels complexes pourrait constituer une
stratégie d’échappement viral au système immunitaire de l’hôte.
Standardisation d’outils moléculaires pour la surveillance entomologique et
biologique de la dengue et autres arboviroses
Surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en
Polynésie française (programme financé par le Ministère de l’Outre-Mer)
Collaborateurs
N. GUITARD (LABM), A. TEISSIER (LABM), S. LASTERE (LABM), J. MARIE (LEM), S. LONCKE (Centre
d’hygiène et de salubrité publique), M. GRANDADAM (IMTSSA, Marseille)
Objectif
Ce programme a pour objectif l’amélioration des connaissances et la standardisation d’outils de
détection pour la surveillance biologique et entomologique de la dengue et autres arboviroses en
Polynésie française (PF). Pour la surveillance biologique, ce programme prévoit l’élaboration de
différents protocoles de RT-PCR pour la détection du virus de la dengue et autres d’arbovirus à risque
épidémiologique, chez les patients. Parallèlement, une étude de séroprévalence doit contribuer à
Rapport annuel 2007 42

l’identification d’arbovirus introduits ponctuellement ou circulant à bas bruit en PF. Pour la
surveillance entomologique, ce programme prévoit d’évaluer les méthodes de capture et
d’échantillonnage de moustiques ; et d’adapter les protocoles élaborés pour la détection de la dengue
et autres arbovirus dans le sérum de patients, à des lots de moustiques.
Etude
Plusieurs facteurs, propres à la situation géographique particulière de la PF, contribuent à
l’émergence régulière d’épidémies de dengue et constituent un risque pour l’introduction d’autres
arbovirus ; pour lesquels les espèces vectorielles sont présentes en PF et vis-à-vis desquels la
population ne possède aucune immunité protectrice. Le présent programme de recherche se décline
en quatre volets :
1. Elaboration d’un protocole pour la détection du virus de la dengue par RT-PCR TR dans le sérum de
patients et dans des lots de moustiques : en raison de ses performances en terme de rapidité,
spécificité, sensibilité et quantification, la technique de RT-PCR TR constituera un outil de choix
pour la surveillance biologique (assurée par le LABM de l’ILM) et la mise en place d’une surveillance
entomologique de la dengue.
2. Elaboration d’un protocole de RT-PCR universelles « Flavivirus, Alphavirus, Phlébovirus » et de RT-
PCR spécifiques : l’utilisation de RT-PCR universelles sur des sérums de patients, dont le diagnostic
dengue a été rendu négatif, devrait permettre d’identifier la circulation d’autres arbovirus. Pour
ceux présentant un risque épidémiologique pour la PF (ex. Chikungunya), des RT-PCR spécifiques
seront mise en place. En outre, l’élargissement de ces techniques à la détection d’arbovirus chez
les vecteurs potentiels (moustiques, phlébotomes) contribuera à la mise en place d’une surveillance
entomologique plus large.
3. Etude de séroprévalence d’arboviroses autres que la dengue dans la population humaine de PF :
une recherche d’anticorps dirigés contre les différents arbovirus susceptibles de circuler en PF sera
réalisée, à l’IMTSSA, sur un échantillonnage de sérums provenant des différents archipels.
4. Evaluation des méthodes de capture et d’échantillonnage de moustiques.
Etat d’avancement des travaux/Résultats
1. Détection du virus de la dengue par RT-PCR TR
Différentes paires d’amorces (amplifiant différentes régions du génome viral) et différents
protocoles de détection (SybrGreen ou TaqMan) ont été testés. Les essais ont été réalisés sur un
appareil iCycler iQ (Biorad), en utilisant pour chaque sérotype des gammes de virus titrées (nombre
de copies de génome viral), puis des sérums. Six jeux d’amorces, proposés par différents auteurs,
ont été testés sur les gammes. La sensibilité de chaque jeux d’amorce a été comparée à celle
obtenue avec la technique de RT-PCR semi-nichée conventionnelle jusqu’alors utilisée pour le
sérotypage.
Pour les quatre sérotypes de dengue (DEN), le meilleur résultat a été obtenu avec les paires
d’amorces et les sondes décrites par Johnson et al. (2005). Pour la DEN1, la sensibilité obtenue est
de 3,02.10 2 copies (dans la prise d’essai) en RT-PCR TR Taqman et 3,02.10 3 copies en RT-PCR TR
SybrGreen, quel que soit le protocole de détection, la sensibilité est supérieure à celle de la RT-PCR
semi-nichée (1,51.10 4 copies). Pour les trois autres sérotypes seule la RT-PCR TR SybrGreen a été
testée. Elle est moins sensible que la RT-PCR semi-nichée (6,6.10 4 copies contre 1,32.10 3 pour la
DEN2 ; 6,55.10 3 contre 1,31.10 3 pour la DEN3 ; 7,9.10 4 contre 1,58.10 4 pour la DEN4), mais reste
malgré tout supérieure à celle d’une RT-PCR conventionnelle (>10 5 copies, quel que soit le
sérotype). La purification des amorces et des sondes en HPLC améliore légèrement la sensibilité en
RT-PCR TR Taqman mais n’a pas d’incidence positive avec le protocole SybrGreen.
Les gammes de virus titré ont été préparées avec les souches de référence. Des essais ont été
réalisés avec la souche de DEN1 circulante. Pour les autres sérotypes, des essais seront réalisés en
2008 avec des sérums provenant d’épidémies antérieures de DEN2, DEN3 et DEN4.
Le protocole de RT-PCR TR défini pour la détection du virus de la dengue dans les sérums doit
maintenant être appliqué à des lots de moustiques : (1) moustiques d’élevage sains avec adjonction
de quantités définies d’ARN viral ; (2) moustiques capturés. Un protocole d’extraction de l’ARN viral
sur lots de moustiques doit également être élaboré.
2. Elaboration d’un protocole de RT-PCR universelles et RT-PCR spécifiques
En raison du risque épidémiologique évident posé par la circulation du virus Chikungunya (CHIK)
dans plusieurs régions du monde, un protocole de RT-PCR TR CHIK a été mis en place dès 2006, en
utilisant les amorces et la sonde décrites par Pastorino et al. (2005). Au début de l’année 2007,
grâce à l’obtention d’un plasmide fourni par l’IMTSSA, un ARN transcrit CHIK a pu être produit et
dosé pour la réalisation d’une gamme. Le protocole de RT-PCR TR Taqman CHIK choisi (avec
amorces et sonde HPLC) offre une sensibilité de 300 copies dans 100% des cas et une sensibilité de
30 copies dans 1/3 des cas, soit une sensibilité proche de la celle obtenue par l’équipe de Pastorino
(27 copies).
Rapport annuel 2007 43

Les protocoles de RT-PCR TR Taqman CHIK et RT-PCR TR SybrGreen CHIK testés sur l’ARN transcrit
ont ensuite été validés sur des lysats de sérums positifs en CHIK, inactivés en tampon de lyse et
envoyés par l’IMTSSA. Les six lysats rendus positifs par l’IMTSSA ont été détectés avec le protocole
Taqman, deux lysats ne sont pas sortis en SybrGreen. La spécificité de la technique a été vérifiée
par l’absence d’amplification sur des échantillons positifs en dengue. Le LVM a ensuite été invité
par le LABM à participer à ses côtés au contrôle qualité externe sur le CHIK organisé par l’ENIVD
(réseau européen pour le diagnostic des maladies virales importées) et auquel ont participé 29
autres laboratoires. Sur les 12 échantillons, l’ENIVD en rendaient 9 positifs, dont 5 correspondaient
à des dilutions croissantes d’un même échantillon. Le protocole RT-PCR TR Taqman choisi par le
LVM sur l’IQ a permis la détection de 8 échantillons ; l’échantillon dilué au 1/10 5 a été trouvé à la
limite de la positivité et la dilution au 1/10 6 n’a pas été détectée (seuls 7 sur 30 laboratoires
avaient trouvé cet échantillon positif). Le LVM a également procédé au séquençage des souches
virales et a obtenu des résultats conformes. Le LABM a réalisé son propre protocole de RT-PCR TR
Taqman CHIK sur Light Cycler (Roche).
L’élaboration des protocoles de RT-PCR universelles « Flavivirus, Alphavirus, Phlébovirus » et RT-
PCR spécifiques aura lieu en 2008. Différents jeux d’amorces ont été sélectionnés dans la
bibliographie et doivent être commandés. L’IMTSSA nous a fait parvenir les contrôles positifs fin
décembre 2007.
3. Etude de séroprévalence d’arboviroses autres que la dengue dans la population humaine de PF
Le LABM de l’ILM reçoit de façon régulière des prélèvements de l’ensemble des archipels de PF pour
des demandes de diagnostic biologique. Comme l’impose la réglementation, ces prélèvements sont
conservés par le LABM pendant une durée de 1 an à partir de la date de réception, puis ils sont
détruits. L’étude de séroprévalence est prévue sur le surplus (fonds de tubes) des sérums destinés à
être détruits.
Une présélection des échantillons a été réalisée sur des prélèvements reçus par le LABM, pour un
diagnostic quelconque, sur la période de juin à décembre 2006. Cette présélection comprenait des
prélèvements provenant des 5 archipels de la PF. Au sein de chaque archipel, les îles ont été
choisies selon différents critères : répartition géographique dans l’archipel, présence d’un climat et
d’un écosystème favorables à l’hébergement de vecteurs, démographie (sélection des îles les plus
habitées et les plus fréquentées). La présélection des échantillons a été réalisée par tirage au sort
sur l’ensemble des prélèvements en provenance des îles choisies. Un total de 1800 sérums a ainsi
été présélectionné.
Après vérification du volume de sérum réellement disponible dans les tubes (volume < 200µl), les
sérums sélectionnés seront envoyés à l’IMTSSA pour la recherche d’anticorps dirigés contre un panel
d’antigènes d’arbovirus (West Nile, Encéphalite Japonaise, Chikungunya, Mayaro, groupes Sandfly
Naples et Sicilian). L’utilisation de ces échantillons pour l’étude de séroprévalence doit
préalablement faire l’objet d’une demande d’accord au Comité d’Ethique de la Polynésie française.
4 .Evaluation des méthodes de capture et d’échantillonnage de moustiques
Dans le cadre de différentes missions d’échantillonnage, relatives à ses différents programmes de
recherche, le laboratoire de recherche enentomologie médicale (LEM) a eu l’occasion d’évaluer
l’efficacité des BGtraps pour la capture d’Ae. aegypti.
En avril 2007, grâce aux données du LABM une mission d’échantillonnage de moustiques sauvages a
été organisée par le LEM et le Centre d’hygiène et de salubrité publique dans des quartiers où une
transmission active de DEN1 avait été constatée. Après avoir été élaborés sur des lots de moustiques
sains, additionnés d’ARN viral, les protocoles d’extraction et de RT-PCR TR seront appliqués aux
moustiques sauvages collectés.
Conclusions et perspectives
1) En terme d’outil pour la surveillance, les avantages de la RT-PCR TR sur la technique
conventionnelle sont : un gain de temps et un risque réduit de contaminations, puisqu’il n’y a
qu’une seule étape d’amplification. L’avantage de la RT-PCR TR SybrGreen sur la RT-PCR TR
Taqman est qu’elle ne nécessite pas l’utilisation de sondes. Or, les sondes sont coûteuses et
beaucoup moins stables dans le temps que les amorces. Enfin, en cas de mutation dans la zone
reconnue par la sonde et mésappariement, le protocole Taqman ne permet pas de confirmer la
spécificité de l’amplification ; en SybrGreen, la spécificité est donnée par la courbe de fusion.
2) Un protocole d’RT-PCR TR SybrGreen utilisant les amorces décrites par Johnson et al. (2005) a été
élaboré sur l’IQ.Il permet la détection des quatre sérotypes de dengue avec une sensibilité allant de
7,9.10 4 (DEN4) à 3.02 10 3 copies (DEN1) sur les souches de référence.
3) Le protocole de la RT-PCR TR Taqman CHIK, inspiré du protocole de Pastorino et al., donne une
sensibilité de 30 copies d’ARN transcrit tout à fait satisfaisante et a été validé sur des lysats de
sérums avec succès. La RT-PCR TR SybrGreen CHIK est moins sensible.
4) Les 1800 échantillons destinés à l’étude de séroprévalence des arboviroses ont été identifiés et
conditionnés en attente de leur expédition à l’IMTSSA pour y être traités. L’expédition de ces
Rapport annuel 2007 44

échantillons est assujettie à l’accord du Comité d’Ethique de Polynésie française qui sera saisi à cet
effet en mai 2008.
Etude de la pathogenèse des formes sévères chez l’homme
Ligands peptidiques altérés et immuno-pathogenèse de la dengue
Collaborateurs
A. IMRIE (University of Hawaii at Manoa), I. CAZALENS (CIE), A. BELLEOUD (CIE), J. LEININGER (Cellule
prévention santé - Raiatea)
Objectif
Ce programme a pour objectif la caractérisation de la réponse cellulaire T mémoire anti-dengue vis-àvis
de sérotypes homo et hétérologues. Les réponses des lymphocytes T (cytolyse et profil cytokinique)
de patients, dont l’historique d’infection par différents sérotypes de dengue est connu, seront
étudiées in vitro en présence de peptides correspondant à un sérotype identique ou différant de ceux
précédemment rencontrés par le patient.
Etude
L’altération de la réponse cellulaire T mémoire au cours d’infections secondaires par un sérotype de
dengue différent de la primo-infection est l’une des hypothèses avancées pour expliquer l’apparition
de formes cliniques sévères. L’étude de la réponse cellulaire T mémoire anti-dengue, vis-à-vis de
sérotypes hétérologues, implique l’utilisation des lymphocytes T de personnes dont la chronologie des
infections par les différents sérotypes de dengue est connue.
En Polynésie française, la co-circulation de différents sérotypes de dengue n’a jamais été détectée
au-delà de quelques semaines. Cette situation épidémiologique particulière permet d’étudier les
réponses immunitaires consécutives à une infection par un sérotype donné, sans que cet effet soit
masqué par des infections endémiques par les 3 autres sérotypes de dengue.
La réactivité des lymphocytes T de patients dont l’historique de dengue est connu, ainsi que le profil
des cytokines produites, seront mesurés in vitro après stimulation par des antigènes viraux de
sérotype identique ou différent des infections antérieures. Cette étude complète des résultats
préliminaires obtenus sur quelques patients hawaiiens originaires de Tahiti.
Etat d’avancement des travaux / Résultats
Une vingtaine de patients, pour lesquels un historique des infections par le virus de la dengue a pu
être retracé à partir de la base de données de l’ILM, avait été contactée en 2006 par le médecin du
CIE. Quatorze de ces patients ont accepté de participer à l’étude et sont venus se faire prélever à
l’ILM en janvier 2007.
Les cellules mononuclées du sang périphérique (PBMC, Peripheral Blood Mononuclear Cells) ont été
isolées à partir d’un prélèvement de 100 ml de sang, puis congelées en azote liquide pour être
acheminées jusqu’à l’Université de Hawaii. Le Dr IMRIE y a ensuite réalisé une série de tests in vitro :
(1) réponse IFNγ à une stimulation des PBMC par des peptides correspondant à des régions de la
protéine NS5 de différents sérotypes (ELISpot) ; (2) établissement de lignées et de clones T ; (3)
immortalisation de lymphocytes B pour l’étude de cytolyse ; (4) typage des molécules CMH présentant
les peptides donnant la meilleure réponse.
Le plasma des patients a par également été récupéré, congelé et expédié à l’Université de Hawaii
pour des tests de séroneutralisation, destinés à déterminer la présence d’anticorps spécifiques de
sérotype et confirmer l’historique présumé d’infection par les différents sérotypes de dengue. Deux
types de tests ont été réalisés, la neutralisation par réduction des plaques (PRNT) ou par réduction
des foyers (FRNT).
Les premiers tests ELISpot ont montré des réponses intéressantes pour 5 patients de PF. Deux de ces
patients montrent une stimulation de leurs lymphocytes par un peptide de 9 acides aminés
(KPWDVIPMV) sur la protéine virale NS5. Ce même peptide avait également entraîné une activation
des lymphocytes de 3 patients hawaiiens lors d’une étude préliminaire. Cet épitope (peptide) est
restreint à la même molécule HLA, B*5502 que ce soit dans le groupe de patients de PF ou de Hawaii.
L’étude a également révélé d’autres épitopes sur NS5, pour des patients de Hawaii comme de PF.
L’étude se poursuit à Hawaii en 2008.
Conclusions et perspectives
1) Une réponse mémoire similaire est observée dans les groupes de patients de PF et de Hawaii.
2) Certaines des réponses sont nouvellement décrites et pourraient être spécifiques des populations
des îles du Pacifique.
Rapport annuel 2007 45

3) De nouveaux prélèvements chez les mêmes patients permettraient d’approfondir davantage l’étude
des réponses cellulaires T mémoires. De plus, l’inclusion de nouveaux patients polynésiens ayant eu
au moins une infection de dengue connue permettrait de confirmer ces résultats.
Les activités de santé publique
Comité dengue
De janvier à avril 2007, le LVM, aux côtés du LABM, du LEM et de la Direction générale de l’ILM, a participé
aux réunions du Comité Dengue, organisées dans les locaux de la Direction de la Santé. La présence du LVM
à ces réuniong avait pour objet d’apporter un éclairage scientifique sur la situation épidémiologique de la
dengue en Polynésie française. A partir du mois d’avril, la présence du LVM n’a plus été jugée nécessaire,
d’autant que la surveillance biologique de la dengue ne relevait plus de sa compétence depuis le second
semestre de l’année 2006, mais de celle du LABM.
Les activités annexes
Sélection d’échantillons pour un laboratoire pharmaceutique
Dans le cadre d’une requête exprimée par un important laboratoire pharmaceutique, le LVM a accepté le
transfert d’un certain nombre d’échantillons conservés dans sa sérothèque (souches virales, sérums de
patients rendus positifs au diagnostic dengue). Ces échantillons seront utilisés pour la mise au point de
nouveaux tests de diagnostic et de pronostic de la dengue. Beaucoup de temps a dû être consacré au tri
des échantillons et à la recherche des informations associées aux prélèvements. En échange de ces
échantillons, le laboratoire pharmaceutique a accepté de mettre à disposition du département Recherche
de l’ILM un appareil extrêmement coûteux, qui sera utilisé dans le cadre de différents programmes
scientifiques. Le contrat signé avec le laboratoire pharmaceutique doit faire l’objet d’une demande d’avis
au Comité d’Ethique de la Polynésie française.
Le laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
L’équipe
Mireille CHINAIN, chef de service
Taiana DARIUS, chargée de recherche
Philippe CRUCHET, technicien supérieur de laboratoire
Taina REVEL, technicien supérieur de laboratoire
André UNG, technicien supérieur de laboratoire
Mote TCHOU FOUC, aide-technicien/plongeur
Les activités de recherche
Les programmes de recherche du LMT ont trait aux efflorescences algales potentiellement dangereuses
(dont la ciguatéra) et à leurs conséquences sur la chaîne alimentaire. En 2007, les activités du laboratoire
se sont articulées autour de 2 principaux axes :
la surveillance épidémiologique des cas de ciguatéra en Polynésie française, en collaboration avec les
structures médicales de la Direction de la Santé,
l'évaluation du risque ciguatérique dans différentes îles et atolls de Polynésie, en particulier Raivavae
(Australes) et Moruroa (Tuamotu-Gambier).
Surveillance épidémiologique des cas de ciguatéra et autres intoxications par
biotoxines marines
La fiche épidémiologique de surveillance des cas de ciguatéra, instaurée depuis la fin des années 60 par
l'ILM reste un outil indispensable pour connaître et suivre l'évolution de ce phénomène dans les 5 archipels
de Polynésie. Or, depuis quelques années, on note une désaffection progressive des structures de santé
vis-à-vis de ce suivi, qui se traduit par une sous-estimation significative du nombre de cas.
Par ailleurs, la ciguatéra n'étant pas l'unique cause d'intoxication par biotoxines marines (cf les
intoxications par consommation de bénitiers, crabes, tortues marines, requins,…), il convenait d'étendre
également cette surveillance aux autres formes d'intoxications susceptibles d'être rencontrées en
Polynésie.
Ainsi, par une circulaire émanant de la Direction de la Santé en juin 2007, il a été décidé de réactiver ce
suivi au moyen d'une nouvelle fiche épidémiologique réactualisée et complétée (http://www.ilm.pf).
Rapport annuel 2007 46

En 2007, 380 cas d'intoxication ont été officiellement déclarés sur l'ensemble de la Polynésie française,
répartis comme suit : Société: 37; Marquises: 57; Australes: 29, Tuamotu: 185; Gambier: 72
(http://www.ilm.pf).
Un point positif est à souligner : à la date du 31 décembre 2007, l'ensemble des structures adhérant à ce
suivi épidémiologique avaient adopté le nouveau formulaire.
Toutefois, le taux de sous-déclaration en 2007 reste élevé, si l'on se base i) sur le nombre d'îles pour
lesquelles nous n'avons recueilli aucune donnée pour 2007, soit 24 îles sur les 52 où la Direction de la Santé
est représentée, et ii) le nombre de personnes intoxiquées lors d'un même repas mais n'ayant pas rempli
de fiche de déclaration. Pour ces dernières, le pourcentage de sous-déclaration par archipel avoisinerait
les 38% au Gambier, 35% aux Tuamotu, 28% Marquises, 26% pour la Société et 17% aux Australes
(http://www.ilm.pf).
Parmi les familles de poissons les plus souvent incriminées dans les cas d'intoxication, citons notamment
les perroquets, les loches, les carangues, les perches et lutjans, ainsi que les becs de cane et les nasons.
Enfin, l'analyse des données 2007 souligne une situation particulièrement préoccupante en matière de
ciguatéra à Mangareva (Gambier) et à Fakarava (Tuamotu), avec respectivement 71 et 55 déclarations de
cas (soit respectivement 43/1.000 hab. et 64/1.000 hab.). Une étude sur le niveau de risque par zone de
pêche au niveau des lagons de ces 2 îles nous paraît donc être une priorité pour 2008.
Evaluation du risque ciguatérique en Polynésie française
Initiées dès 2004, les campagnes de collecte de l'ILM menées dans différents sites-pilotes de Polynésie
(Tubuai, Nuku Hiva,…) visent à valider, à grande échelle et sur le terrain, les tests de détection des
toxines ciguatériques mis au point au laboratoire, ainsi qu'à évaluer le niveau de risque associé aux zones
de pêche préférentielles des populations des îles concernées au moyen de ces outils de détection.
Parmi les tests disponibles à l'ILM (toxicité aiguë sur souris, cytotoxicité, radio-ligand,…) c'est le test de
radio-ligand qui apparaît comme le plus prometteur car alliant sensibilité et grande capacité de traitement
des échantillons grâce à une automatisation du test. Il est, en outre, bien adapté à l'analyse des diverses
matrices biologiques susceptibles de renfermer des ciguatoxines, i.e. les efflorescences de la micro-algue
Gambierdiscus ainsi que les chairs de poissons rencontrés aux différents étages trophiques de la chaîne
alimentaire.
Le cas de Raivavae
L'île de Raivavae a été retenue comme site-pilote sur la base d'informations selon lesquelles la population
locale ne consommait plus de poissons lagonaires depuis 2002, en raison du fort risque de ciguatéra qui
affecte l'ensemble de son lagon, et se limitait ainsi à la consommation de poissons du large (bonite, thon,
thazard,…). Toutefois, l’île ne recensant qu’un seul pêcheur professionnel licencié, qui rencontre parfois
des difficultés à approvisionner la population en poissons du large selon l’époque de l’année considérée,
cette situation a entraîné une modification du mode alimentaire de la population – qui est progressivement
passée d'une alimentation traditionnelle à un mode d'alimentation plus occidental – et son inévitable
cortège de maladies dites « de civilisation ».
Les informations recueillies faisaient par ailleurs état de la survenue d'intoxications par bénitiers qui font
actuellement l'objet d'une mini-filière économique dans l'île (env. 30 tonnes exportées/an, vers Tubuai et
Tahiti).
Du 18 au 25 avril 2007, une 1 ère mission scientifique a donc été organisée à Raivavae, avec 3 objectifs :
réactiver le programme de suivi épidémiologique des cas de ciguatéra dans l'île ;
vérifier l'existence de cas d'intoxications par bénitiers dans l'île et tenter d'en déterminer l'origine ;
évaluer le risque ciguatérique en divers points du lagon de Raivavae : à cette fin, 53 échantillons de
macro-algues, 8 de cyanobactéries, 103 spécimens de poissons et 123 bénitiers, répartis en 29 sites
distincts, ont été collectés et testés au laboratoire pour leur toxicité.
A cette occasion, nous avons rencontré une population véritablement désemparée par les conséquences
sanitaires et économiques des intoxications liées à la consommation des produits de son lagon, désireuse
d'en savoir plus sur l'origine de ces intoxications ainsi que sur les moyens pratiques de s'en prévenir.
Du 10 au 12 septembre 2007, une 2 nde mission de restitution des résultats a été menée à Raivavae, afin de
présenter à la population les principales conclusions et recommandations à l'issue de la campagne d'avril.
Rapport annuel 2007 47

Principales conclusions et recommandations
Fig. 1 : Niveau du risque ciguatérique dans le lagon de Raivavae,
tel que déterminé par le test de radio-ligand
1/La population de
Raivavae a en général
une bonne
connaissance des zones
du lagon à éviter et,
inversement des zones
où la pêche lagonaire
peut être pratiquée à
moindre risque.
La Figure 1 résume
l'état des lieux actuel
du lagon de Raivavae
en matière de risque
ciguatérique.
Les résultats de notre
étude confirment par
ailleurs l'excellente
performance sur le
terrain du test de
détection dit de "radioligand"
développé
depuis plusieurs
années à l'ILM ;
2/ Les zones à fort risque de ciguatéra du lagon de Raivavae correspondent aux zones où le corail
apparaît fortement dégradé à la suite d'agressions répétées, de diverses origines (naturelle et/ou
anthropique). Ainsi, toute opération future visant au développement de l'île mais impliquant un
impact certain sur l'écosystème corallien devra donc être mûrement soupesée ou, à tout le moins,
s'accompagner d'une étude d'impact.
3/ Grâce aux indications fournies par la population, nous avons pu vérifier l'existence de cas
d'intoxication liés à la consommation de bénitiers, en particulier ceux pêchés au niveau du dispensaire
de Rairua. In situ, nos observations sous-marines ont permis de confirmer l'association entre la
toxicité de ces bénitiers et la présence de larges tapis de cyanobactéries de couleur brune, sur le
même schéma que celui décrit à Lifou (Iles Loyauté, Nouvelle-Calédonie) (cf Fig.2). En revanche, les
bénitiers actuellement exploités au niveau du Motu Mano se sont avérés exempts de tout risque.
Les analyses morphologiques réalisées ultérieurement ont permis d'identifier ces cyanobactéries
benthiques comme appartenant au genre Hydrocoleum (groupe des Oscillatoriales) (cf Figs. 3-4). Ces
mêmes Hydrocoleum ont par ailleurs été repérés dans un autre site de l'île (dit "Motu de la Femme")
où les bénitiers se sont également avérés toxiques.
Des analyses chimiques poussées sont en cours pour tenter d'identifier le panel des composés toxiques
synthétisés par ces cyanobactéries et susceptibles de se concentrer au niveau des mollusques bivalves
filtreurs tels que les bénitiers.
Fig.2 : Prolifération de
tapis cyanobactériens in
situ
Fig.3 : Tapis cyanobactérien
d’Hydrocoleum après filtratio
Fig.4 : Filaments d’Hydrocoleum
au microscope optique
4/ En guise de prévention, il a été recommandé à la population :
d'éviter de pêcher dans la passe Nord de l'île et d'éviter de consommer 3 espèces spécifiques de
poissons herbivores (ume, roro et haumeretue) quelle que soit leur zone de pêche;
Rapport annuel 2007 48

Ume Roro Rairua
d'éviter de récolter et/ou de consommer les bénitiers inféodés aux zones infestées par des tapis
cyanobactériens, qui présentent l'avantage d'être facilement repérables à l'œil nu.
5/ Toute la zone sud-est du lagon (notamment celle autour du "Motu piscine"), qui est actuellement
exploitée par les pensions de famille de l'île pour leurs activités « pique-nique à la journée », reste à
être screenée. Cela correspond d'ailleurs à une demande forte de la population, dans la mesure où
toutes données sur le niveau de risque des poissons et bénitiers pêchés dans cette zone permettraient
de prévenir d'éventuelles intoxications de la clientèle touristique.
6/ Enfin, des indicateurs biologiques préoccupants ont été relevés au niveau de la zone située autour de
la piste de l'aéroport, tels que :
des signes évidents de souffrance madréporaire en plusieurs points du lagon, conséquence d'un
envasement progressif du haut des pinacles coralliens ;
la présence de cellules du dinoflagellé ciguatérigène Gambierdiscus à des niveaux de densités qui
demeurent toutefois faibles,
et surtout, des poissons présentant déjà, pour certains spécimens, un niveau de toxicité non
négligeable. En conséquence, un suivi à plus long terme de l'impact de l’installation de l’aéroport
en termes de risque ciguatérique, s'impose.
Le cas de Moruroa
Depuis 2003, une convention lie l'ILM au Ministère de la Défense, qui permet un suivi annuel du niveau de
toxicité de certaines espèces pisciaires (herbivores et carnivores) de l'atoll de Moruroa. Les collectes
d'échantillons biologiques (poissons et macro-algues) sont réalisées chaque année dans le cadre de la
mission Turbo, sous les supervisions scientifiques de Mrs C. MUSA et L. VILLIERS de la Direction du Suivi des
Centres d'Essais Nucléaires (DSCEN).
Le Tableau I résume les niveaux de toxicité - tels que déterminés par le test de radio-ligand - observés
pendant 5 années consécutives chez 8 des principales espèces de poissons représentées dans la base de
données du LMT, à savoir nasons, perroquets, mulets et saupes pour les poissons herbivores, et carangues,
becs de cane, lutjans et loches pour les poissons carnivores.
(*) < 0,31 ng éq. CTX-3C/g chair
Toxicité (exprimée en ng équivalent CTX-3C/ g de chair)
Nom commun Nom local (n) 2003 [Min-Max] 2004 [Min-Max] 2005 [Min-Max] 2006 [Min-Max] 2007 [Min-Max] Moy. + IC
nason ume 13 - - - 6 7 5,38 + 1,68
perroquet
uhu -raepuu, -
homohomo, - 21 - - 9 3 9 1,26 + 0,45
mamaria
mulet tehu 14 - - 4 3 7 1,98 + 0,70
saupe nanue 15 - - 4 atox 5 6 0,54 + 0,18
carangue
pa'aihere,
uruati, ruhi
13 - - - 7 6 1,87 + 0,64
bec de cane oeo 19 4 4 - 5 6 15,25 + 0,20
lutjan haamea 28 5 6 3 5 9 1,83 + 0,71
loche tonu 24 6 5 1 0,51 5 7 1,32 + 0,44
par année
n 147 15 15 21 39 57
Tableau I: Niveaux de toxicité minimum et maximum de 8 espèces de poissons du lagon de Moruroa (Tuamotu-
Gambier)
L'analyse préliminaire de ces données (comparaison des toxicités moyennes + intervalle de confiance, α =
0,05) par année et/ou par espèce souligne des résultats intéressants en ce qui concerne l'étage trophique
des herbivores, à savoir que :
la toxicité des perroquets de Moruroa a augmenté de manière significative entre 2005 et 2007 ;
Rapport annuel 2007 49

parmi les 4 espèces herbivores suivies annuellement à Moruroa de 2006 à 2007, ce sont les saupes qui
affichent les niveaux de toxicité les plus bas, avec un risque pour le consommateur globalement faible
à nul. A l'inverse, ce sont les nasons qui s'avèrent les plus toxiques, avec un risque d'intoxication pour
le consommateur très élevé (toxicité très largement supérieure à 1 ng équiv. CTX-3C /g de chair) (cf
Tableau I) ;
sur la base des données recueillies en 2007, les nasons et les carangues de Moruroa se sont avérés
significativement plus toxiques que ceux prélevés dans le lagon de Raivavae.
Les activités annexes et prestations de service
La souchothèque de l'ILM
Les missions de collecte réalisées à Moruroa et à Raivavae en 2007 ont permis d'enrichir l'algothèque de
l'ILM en respectivement 35 et 10 nouvelles lignées cellulaires de la micro-algue Gambierdiscus. La
caractérisation de leur position taxonomique (sur la base de critères morphologiques et moléculaires) et
celle de leur potentiel toxinique actuellement en cours, seront poursuivies en 2008.
La banque de standards (CTXs pures) de l'ILM
La purification par technique HPLC des CTXs algales produites in vitro par les lignées fortement
toxinogènes de Gambierdiscus fait partie des activités de routine du LMT. En 2007, elle a permis d'enrichir
la banque de toxines de l'ILM avec env. 5 mg de CTX-3C et proches analogues.
Le laboratoire de recherche sur les substances naturelles
L’équipe
Isabelle LECHAT, chef de service
Fanny ADAM, ingénieur de recherche (jusqu’au 31 août 2007) et doctorante (depuis le 1 er octobre
2007)
Yves MITERMITE, technicien supérieur de laboratoire
L’activité du service
L’année 2007 a été marquée par la mise en oeuvre du programme « Recherche, dans la biodiversité de la
Polynésie fançaise, de substances naturelles possédant une activité répulsive/attractive vis-à-vis de
moustiques vecteurs de maladies tropicales » dont l’objectif était d’identifier dans la chimiothèque du
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles (LSN) des substances naturelles insecticides,
répulsives et attractives des moustiques Aedes aegypti et Ae. polynesiensis. Le recrutement d’un ingénieur
financé par l’Etablissement public administratif pour la prévention (EPAP) a permis d’élargir ce programme
par l’adjonction de nouveaux échantillons à préparer et tester.
Le programme a consisté pour l’année 2007 à collecter 45 échantillons de plantes de Polynésie française
afin d’en extraire les huiles essentielles (9) et d’en obtenir des extraits bruts (21) puis d’en tester les
propriétés insecticides, répulsives et attractives sur le moustique Aedes aegypti, vecteur de la dengue à
l’aide de différents test : « test tunnel » réalisé au Laboratoire de recherche en entomologie médicale
(LEM) de l’ILM, « test en patch » et test « olfactomètre » réalisés au laboratoire du Dr Ulrich BERNIER, de
l’Unité de recherche sur les mouches et moustiques du Département de l’Agriculture des Etats-Unis ARS-
CMAVE, situé à Gainesville (Floride).
Ces différents tests ont permis de mettre en évidence l’activité répulsive de 13 échantillons sur les 45
testés. Aucune activité attractive n’a par contre été révélée. Des analyses de composition chimique fine
par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (CPG-SM) ont été entreprises
sur les huiles essentielles ayant montré une activité répulsive afin d’en déterminer les principes actifs. Des
réplications des tests sont engagées afin de confirmer les résultats préliminaires. Le programme se
poursuit donc dans le cadre d’un travail de thèse de doctorat ès sciences qui devrait être terminé fin 2008.
Un second programme concerne le criblage de molécules bioactives d’intérêt pharmacologique extraites
d’organismes de Polynésie française. Présentée en Conseil scientifique puis validé par le Conseil
d’administration de l’ILM en sa séance du 9 mai 2007, la convention générale de recherche signée début
2007 entre l’ILM et l’Université de Bretagne Occidentale (UBO) fixe les termes de la collaboration entre le
LSN et le Laboratoire d’Ecophysiologie et de Biotechnologie des Halophytes et des Algues marines
(LEBHAM) de l’UBO.
Cette collaboration prévue pour quatre années vise à identifier de nouveaux médicaments à fort potentiel
thérapeutique dans le domaine de la cancérologie et de l’immunologie par une approche innovante de
criblage de molécules polynésiennes d’origine terrestre et marine. Le LSN fournira au LEBHAM les
substances naturelles à tester, qu’il s’agisse d’extraits bruts, de fractions ou de molécules purifiées isolées
à ILM.
Rapport annuel 2007 50

Recherche, dans la biodiversité de la Polynésie Française, de substances naturelles
possédant une activité répulsive/attractive vis-à-vis de moustiques vecteurs de
maladies tropicales
Ce projet a associé 2 compétences de l’Institut
Louis Malardé : le LSN et le LEM.
Deux Instituts métropolitains ont contribué au
projet : par le financement partiel du
programme : LEBHAM de l’Université de Bretagne
occidentale (UBO) et par l’identification par
chromatographie en phase gazeuse couplée à la
spectrométrie de masse (CPG-SM) des huiles
essentielles actives : Institut Biomoléculaire Max
Mousseron IBMM de l’Université de Montpellier II,
équipe glycochimie.
Un laboratoire américain a été intégré au projet
pour la réalisation des tests de mise en évidence
de l’activité attractive des échantillons : le
laboratoire du Dr. Ulrich BERNIER, chercheur
chimiste de l’Unité de recherche sur les Mouches
et Moustiques du Département de l’Agriculture
des Etats Unis ARS-CMAVE, Gainesville (Floride).
Figure 2: Hydrodistillation menée au LSN
Le programme a consisté dans un premier temps à collecter 25 espèces végétales différentes (plantes
aromatiques ou littorales) issues et sélectionnées de la biodiversité de la Polynésie française afin d’en
extraire 9 huiles essentielles (mélange de substances volatiles odorantes) et les extraits bruts. A cet effet
de nombreux déplacements ont été effectués sur les îles de Tahiti, Moorea et des Tuamotu (Rangiroa,
Fakarava). L’utilisation d’un dispositif distillateur pilote de capacité 200 litres disponible au GEPSUN situé
à Arue dans le laboratoire dirigé par le Dr Taivini TEAI et gracieusement mis à notre disposition a permis
d’obtenir en une journée environ 37 ml d’huile essentielle.
21 extraits bruts ont été préparés selon la méthode au Soxhlet.
Figure 3 : Dispositif d’extraction Soxhlet
Dans un second temps les propriétés insecticides, répulsives et attractives des huiles essentielles et
extraits on été testées vis-à-vis de Aedes aegypti, vecteur de dengue, à l’aide du « test tunnel », du test
« patch » et de « l’olfactomètre ».
Les trois opérations suivantes se sont ensuite succédées :
les effets insecticides ou répulsifs des différents extraits de plantes ont été évalués et comparés au
LEM qui dispose des compétences et des équipements adéquats.
Les tests de mesure de répulsivité, « test tunnel » (voir photo) ont été mis en œuvre par le
laboratoire de Lutte contre les Insectes Nuisibles (LIN) de l’Institut de Recherche pour le
Développement (IRD) situé à Montpellier
le test en « patch » réalisé à l’Unité de recherche sur les mouches et moustiques du Département de
l’Agriculture des Etats Unis ARS-CMAVE situé à Gainesville en Floride.
Rapport annuel 2007 51

Les tests d'activité attractive de 24 huiles essentielles et 21 extraits au solvant ont été réalisés du 20 au
27 octobre 2007 par l’équipe du Dr BERNIER de l’Unité de recherche ARS-CMAV, Gainesville, Floride, USA,
selon la méthode de l’olfactomètre.
Analyses fines de composition des huiles essentielles de feuilles d’Ocimum
basilicum (L.) ou Miri Tahiti par chromatographie en phase gazeuse couplée à la
spectrométrie de masse (CPG-SM)
Le genre Ocimum (famille Lamiaceae) comprend des herbes annuelles ou pérennes et des arbustes
originaires des régions tropicales et subtropicales d’Asie, d’Afrique et d’Amérique centrale du Sud.
Ocimum basilicum ou basilic commun est l’espèce la plus connue notamment pour ses qualités
aromatiques. Cette plante médicinale et culinaire est largement cultivée pour la production d’huile
essentielle mais également pour sa commercialisation sous forme d’herbe fraîche, séchée ou lyophylisée.
L’espèce O. basilicum a donc été très étudiée, notamment la composition chimique de ses huiles
essentielles. Les travaux scientifiques mentionnent la présence de trois composants majeurs dans les
basilics : le linalol, le méthyl-chavicol
L’agence française de normalisation des huiles essentielles (AFNOR 2000) mentionne deux chémotypes
d’huiles essentielles d’Ocimum basilicum actuellement commercialisées :
1/ le type linalol (NF T 75-244) caractérisé par une grande teneur en linalol variant de 48 à 62%
accompagné de méthyl-chavivol (pourcentage pouvant atteindre 30%)
2/ le type méthyl-chavicol (NF ISO 11043) représentant jusqu’à 87% de l’huile essentielle.
Le chémotype linalol (généralement classifié comme basilic Type européen ou basilic doux) est rencontré
en France, Italie, Bulgarie mais a été récemment décrit en Afrique, Côte d’Ivoire, Cameroun ou au Brésil.
Le second chémotype constitué de façon prédominante de méthyl-chavicol (constituant résultant de la
voie biosynthétique de l’acide shikimique) est classifié « Type Réunion » et est fréquent à Madagascar, les
Iles Comores, mais également en Afrique (Togo, Bénin, Côte d’Ivoire, Congo), Egypte, Allemagne,
Autriche, Mongolie, Brésil et Thaïlande.
Le basilic tropical, riche en cinnamates, est beaucoup moins cité et n’est point mentionné par l’AFNOR. Ce
chémotype à cinnamate a été décrit pour les basilics collectés à Fiji et aux Phillipines. A coté de ces
chémotypes particuliers, on peut aussi trouver des chémotypes dérivant de croisements entre différents
chémotypes avec des composition mixtes non admises par l’agence AFNOR : type linalol/methyl-chavicol ;
linalol/méthyl cinnamate ; linalol/eugénol.
A Tahiti, Forest B. H. BROWN a décrit l’espèce O. basilicum comme indigène aux îles Marquises en 1930
tandis que SETCHEL mentionne sa présence à Tahiti en 1968. Les feuilles de Miri Tahiti sont utilisées
traditionnellement aux îles Tuamotu pour leurs propriétés répulsives vis-à-vis des insectes et des mouches
en particulier. Contrairement à une autre espèce Ocimum gratissimum ou Miri Taratoni, mauvaise herbe
très répandue dans les cocoteraies mal entretenues, l’espèce O. basilicum n’est pas aussi commune et doit
être propagée par l’homme près des habitations.
C’est la première fois qu’une analyse est réalisée sur la plante Ocimum basilicum indigène en Polynésie.
Trois échantillons de feuilles de Miri tahiti ont été collectés dans trois sites distincts : Papara, Punaauia et
Mahina. Les huiles essentielles ont été obtenues avec des rendements intéressants de 0,2 à 0.6% (ml/100g
de plante fraîche). Les huiles sont limpides, jaune pâle à vert-clair et fortement odorantes. L’ester E-
cinnamate de méthyle est le composant majoritaire (43.4 à 62.3%) suivi de son isomère le Z-cinnamate de
méthyle (8,1-8,6%). Ces deux esters constituent plus de 70% de l’huile issue de plants collectés à Papara,
66,7% des collectes de Punaauia et 51,6% de celles de Mahina. Deux monoterpènes oxygénés sont présents
en quantité appréciables : 1-8 cinéole (2,8-10,3%) et linalol (4,6-21,9%). Les plants analysés appartiennent
donc au rare chémotype cinnamate rencontré dans le Pacifique Sud (Fiji) et aux Phillipines. L’espèce
indigène étudiée a probablement été introduite durant les migrations anciennes des Polynésiens à partir
Rapport annuel 2007 52

de Fiji. Ces résultats démentent la théorie actuelle suggérant l’introduction récente de l’espèce par les
européens.
Une publication des résultats acquis sur Ocimum basilicum ou Miri Tahiti est acceptée depuis septembre
2007 à paraître dans Journal of Essential Oil Research (JEOR) tandis que deux (2) posters ont été affichés
au 9 ème Symposium International Aromathérapie et Plantes médicinales, 16-18 mars 2007, Grasse, France
(Etude chimique de l’huile essentielle d’Ocimum basilicum L. de l’île de Tahiti (Polynésie française) et au
4 ème Colloque International COSM’ING 2007 (Ingrédients cosmétiques et biotechnologies), 27-29 juin 2007,
Saint-Malo, France (Chemical composition of essential oils of Ocimum basilicum from Tahiti Island (French
Polynesia).
D’autres résultats préliminaires d’analyses par chromatographie en phase gazeuse des huiles essentielles
de Psidium cattleyanum, Psidium guajava et Eucalyptus citriodora ont été obtenus et affichés sous forme
de deux (2) posters à l’occasion du 38 th International Symposium on Essential Oils qui s’est tenu du 9 au
12 septembre 2007 à Graz en Autriche.
Des confirmations de ces identifications ont été réalisées par chromatographie couplée à la spectrométrie
de masse en collaboration avec l’équipe du Pr Chantal Menut de Montpellier.
Quant aux résultats obtenus de l’analyse des huiles essentielles d’eucalyptus, nous avons prévu de réaliser
en collaboration avec le Dr Taivini Teai de l’Université de Polynésie française une étude comparative des
compositions des huiles essentielles obtenues selon deux méthodes d’extraction : l’hydrodistillation
effectuée au LSN et la vapo-distillation à effectuer par le Dr Taivini début 2008.
SUNABIO-PF : Substances Naturelles Bio-actives de Polynésie française
Ce nouveau projet de criblage de molécules bioactives d’intérêt pharmacologique extraites d’organismes
de Polynésie française a été présenté en Conseil scientifique puis validé par le Conseil d’Administration.
Une convention générale de recherche signée début 2007 entre l’ILM et l’Université de Bretagne
Occidentale (UBO) fixe les termes de la collaboration entre le LSN et le LEBHAM de l’UBO.
Cette collaboration prévue pour quatre années vise à identifier de nouveaux médicaments à fort potentiel
thérapeutique dans le domaine de la cancérologie et de l’immunologie par une approche innovante de
criblage de molécules polynésiennes d’origine terrestre et marine. Le LSN fournira au LEBHAM les
substances naturelles à tester, qu’il s’agisse d’extraits bruts, de fractions ou de molécules purifiées isolées
à ILM.
Le LEBHAM qui dispose d’un équipement de pointe dans le cadre de sa plateforme technologique
BIODIMAR, notamment d’un robot de criblage à haut débit, procèdera aux tests d’activités biologiques
dans les domaines ciblés par le programme.
Cette collaboration scientifique s’inscrit dans la double mission de l’ILM en matière de recherche : le
domaine biomédical et la valorisation du patrimoine naturel de la Polynésie française.
La méthode de préparation des extraits a été fournie par le LEBHAM afin de permettre une
homogénéisation des extraits à tester. 37 échantillons d’extraits et fractions ont déjà été expédiés pour
les premiers tests. Ces extraits ont été préparés à partir de 16 espèces végétales terrestres collectées sur
les îles de Tahiti et Moorea. Les premiers tests sont en cours de réalisation tandis que d’autres extractions
sont prévues à partir des missions de collectes dans les archipels à réaliser au cours de l’année 2008.
Un premier résultat concernant l’analyse phytochimique, les activités anti-oxydantes, cytotoxiques et proapoptose
de l’algue Chnoospora minima a été affiché sous forme de poster à l’occasion du V e European
Congress on Marine Natural Produtcs qui s’est déroulé du 16 au 21 septembre 2007 à Ischia en Italie.
Visites scientifiques
Fabienne JOANNY MENVIELLE-BOURG, Fabienne Joanny Consulting & Licensing,
Patrick GARNON, adjoint au directeur de l’Office national interprofessionnel des plantes à parfum,
aromatiques et médicinales,
Paul LUU, directeur de l'Office de développement de l´économie agricole des départements d'Outre-
Mer.
Rapport annuel 2007 53

Les activités de santé publique
Le laboratoire d’analyses de biologie médicale
L’équipe
Cyril COUDERT, directeur
(disponibilité à compter du 1 er décembre 2007)
Frédéric BEAU, directeur adjoint
Stéphane LASTERE, directeur adjoint
Cédric SCHWEITZER, directeur adjoint
José RUIZ SUQUILBIDE, médecin anapath
Marie-Lise LIAO, surveillante
Alain ANDREU, technicien supérieur
Ahutea BERNARDINO
(du 23 juillet au 15 septembre 2007)
Christian CHAU, technicien supérieur
Valérie DUGAY, technicien supérieur
Kathia ESTALL, technicien
Vanessa GERON, technicien supérieur
Nathalie GUITARD, technicien supérieur
(jusqu’au 31 août 2007)
Christine LIVINE, technicien supérieur
Patrick LUQUIAUD, technicien supérieur
Véronique MARIA, technicien supérieur
Patricia MAUCOTEL, technicien supérieur
Floriane ORTOLA, technicien supérieur
(du 1 er août au 31 décembre 2007)
Tokahi ROTILLON, technicien supérieur
Aurore SHAN YAN, technicien supérieur
Anita TEISSIER, technicien supérieur
Karen ZISOU, technicien supérieur
Moea LIAO-TOIRORO, infirmière
(jusqu’au 31 octobre 2007)
Marie-CHANTAL BERGUIO, infirmière
(du 22 octobre au 13 décembre 2007)
Sylviane TEURURAI, infirmière
(à compter du 13 décembre 2007)
Tehea GOBRAIT, secrétaire
Elmire GILLOT, secrétaire
Yvonne MAOPI, agent d’accueil
Baildir GENTOU, agent de saisie
Hervé HASCOET, agent de saisie
Benjamin TAUPUA, agent de saisie
(jusqu’au 3 décembre 2007)
Karl WALKER, agent de saisie
Danièle KELLY, agent préparatoire
Marguerite TEMUTU, agent d’entretien
Marina BOUGUES, coursier
Charles NATUA, coursier
Terai SHAN, coursier
Poata TUHITI, coursier
Le développement du laboratoire
Au cours de l’année 2007, le LABM a fait l’acquisition d’un appareil de PCR en temps réel Lightcycler 2.0
(Roche). Cet appareil est venu renforcer le COBAS Taqman 48 (Roche) et permet notamment la mise en
place de techniques de biologie moléculaire essentielles à la veille microbiologique (PCR Dengue, PCR
Chikungunya, PCR influenza A/H5,…).
Un utilitaire Peugeot Partner pour les coursiers a par ailleurs été acquis en remplacement d’un ancien
véhicule.
La rénovation et la mise aux normes des installations
Le laboratoire de bactériologie a bénéficié d’une rénovation complète (sol, murs, plafond, nouvelles
paillasses) tandis que les pièces réservées à la laverie et à la préparation des milieux étaient remises à
niveau grâce à l’intervention de l’équipe du service technique.
En parallèle, le futur laboratoire de virologie du LABM était aménagé (peinture, installation de nouvelles
paillasses et mise en place d’un accès sécurisé).
La recherche clinique
Deux études ont été débutées au cours de l’année :
Evaluation des kits commerciaux Biorad et Panbio de détection de l’antigène NS1 dans le diagnostic
de l’infection aiguë à virus dengue ;
Etude de la prévalence et de la distribution des papillomavirus humains dans une population de
femmes polynésiennes.
Rapport annuel 2007 54

L’activité d’analyses
Courbe mensuelle comparative d’activité (2005-2007)
Evolution mensuelle du nombre de dossier 2005-2007
6000
5000
4000
3000
2000
2005
2006
2007
1000
0
Janvier
Février
Mars
Avril
Mai
Juin
Juillet
Août
Septembre
Octobre
Novembre
Décembre
mois
Evolution saisonnière habituelle (fléchissement au mois de juillet et de décembre).
Au total 55.366 dossiers ont été traités en 2007 contre 52.693 en 2006.
Evolution de l’activité en B (2005-2007)
Evolution mensuelle de l'activité du laboratoire (en B) 2005-2007
900000
800000
B
700000
600000
500000
400000
300000
B 2005
BP 2005
B 2006
BP 2006
B 2007
BP 2007
200000
100000
0
janvier
février
mars
avril
mai
juin
juillet
aout
septembre
octobre
novembre
décembre
mois
En 2007, on note une stagnation de l’activité en B ; l’activité du LABM est de 8,37 M de B pour 8,57 M en
2006. Cette stagnation de l’activité en B, malgré un nombre de dossiers traités en augmentation par
rapport à l’année dernière, pourrait s’expliquer par le contexte d’épidémie de dengue. En effet, les
examens nécessaires au diagnostic biologique de la dengue sont réalisés dans le cadre de la convention de
veille sanitaire conclue avec la Direction de la santé et ne sont pas facturés. De ce fait, ils n’apparaissent
pas dans la facturation en B de l’activité du laboratoire, tout comme les analyses de confirmation de la
leptospirose et de la grippe.
Le laboratoire d’anatomo-cyto-pathologie affiche une légère augmentation de son activité avec 434.970 BP
en 2007 contre 424.360 en 2006.
Rapport annuel 2007 55

Origine géographique des examens prescrits
Répartition par Archipel de l'activité (en B)
Autrales
Tahiti - Moorea
Iles sous le vent
Marquises
Tuamotu - Gambier
Ile Archipel B nombre actes %
Tahiti IDV 3 269 439 108 890 53,70
Moorea IDV 346 067 10 414 5,14
Bora Bora ISLV 827 878 27 530 13,58
Huahine ISLV 407 191 13 737 6,77
Maupiti ISLV 2 895 98 0,05
Raiatea ISLV 737 639 16 521 8,15
Tahaa ISLV 36 756 1 008 0,50
Marquise Nord MARQ_NORD 307 590 6 601 3,26
Marquise Sud MARQ_SUD 138 939 4 388 2,16
Raivavae AUSTRALES 53 691 1 959 0,97
Rapa AUSTRALES 397 15 0,01
Rimatara AUSTRALES 25 111 989 0,49
Rurutu AUSTRALES 49 380 1 765 0,87
Tubuai AUSTRALES 132 281 4 335 2,14
Tuamotu Gambier TUAM_GAMB 119 539 4 516 2,23
Tahiti et Moorea représentent plus de 58% de l’activité.
Origine des prescripteurs par secteur
Prescripteurs Total 2005 Total 2006 Total 2007
Santé publique 64% 68 % 65%
Privés 36% 32% 35%
La répartition reste identique : un tiers de prescripteurs privés et deux tiers provenant des établissements
relevant de la santé publique.
Rapport annuel 2007 56

Résultats par laboratoire
Laboratoires Actes % B %
Bactériologie/BK 15817 7.6 796775 10.4
Hématologie 39234 18.9 1216565 15.8
Biochimie 113689 54.7 3037843 39.6
Séro-immunologie 17599 8.5 1178925 15.4
Parasitologie/Mycologie 853 0.4 71560 0.9
Transmis 6266 3.0 524117 6.8
VIH (Diagnostic/Suivi) 5833 2.8 416000 5.4
Veille sanitaire
(Dengue/Leptospirose/Grippe)
7908 3.8
137060
+ 18 MXPF
La biochimie et l’hématologie représentent environ 75% de l’activité du laboratoire, et 55% de son chiffre
d’affaires.
5.7
Les données analytiques
Bactériologie
ECBU (Examen cyto-bactériologique des urines)
4004 examens réalisés. Répartition classique des bactéries isolées des urines.
ECBU 2007: répartition des différents germes isolés
1% Escherichia coli
1%
1%
4% 3% 3% 3% 2% 1%
5%
Staphylococcus saprophyticus
Klebsiella spp
Enterococcus spp
Streptococcus du groupe B
Proteus spp
Staphylococcus aureus
6%
7%
63%
Enterobacter spp
Staphylococcus coag neg (autres)
Citrobacter spp
Pseudomonas spp
Autres germes
Acinetobacter spp
Prélèvements vaginaux (PCV)
2027 réalisés.
Nombre %
Vaginose à Gardnerella vaginalis 259 12,8
Vaginite à Candida spp 230 11,4
Vaginite à Trichomonas vaginalis 18 0,9
Gonococci 1 0,05
Portage de streptocoque du groupe B 352 17,4
Portage de Staphylococcus aureus 303 14,9
Commentaires
A noter 17% de portage de Streptococcus agalactiae.
Rapport annuel 2007 57

Prélèvements urétraux
32 réalisés dont 6 cultures positives à Neisseria gonorrhoeae.
En 2007, le LABM a mis en place une PCR Gonocoque à la demande du Secrétariat de la Communauté
du Pacifique Sud. Celle-ci devrait être utilisée dans le cadre d’une étude sur les infections
sexuellement transmissibles.
L’utilisation de cette PCR sur des prélèvements pour lesquels l’examens direct était en faveur d’une
gonococcie mais qui se révélaient négatifs en culture a permis d’identifier 4 urétrites à Neisseria
gonorrhoeae.
Coprocultures
236 réalisées.
Coproculture
Espèces isolées
2007
Escherichia coli toxinogènes 6
Shigella dysenteriae 0
Salmonella spp 8
Campylobacter spp 11
Les principales espèces de salmonelles circulantes sont Salmonella typhimurium et weltevreden.
Prélèvements de pus de plaies
149 ont été réalisés en 2007.
20 (soit 14%) infections à Streptococcus pyogenes (groupe A) et 60 (43%) infections (ou portage) de
Staphylococcus aureus.
Pus 2007: répartition des différents germes isolés
7%
5%
5% 4%
43%
Staphylococcus aureus
Streptococcus du groupe A
Pseudomonas aeruginosa
Proteus spp
9%
Streptococcus (autres)
13%
14%
Escherichia coli
Enterobactéries (autres)
Autres germes
Recherche de mycobactéries
n =
Positif
Mycobacterium tuberculosis 693 37
37 positives pour Mycobacterium tuberculosis dont 5 nouveaux patients dépistés.
Pas de multi-résistance détectée (résistance à au moins 2 antibiotiques utilisés en thérapie).
Aux 693 prélèvements testés par le LABM, s’ajoutent 155 autres prélèvements transférés au
laboratoire de biologie du CHPf durant les travaux de réfection du laboratoire de bactériologie de
l’ILM.
215 hémocultures réalisées en 2007.
83 expectorations et 79 prélèvements ORL.
Rapport annuel 2007 58

Chlamydia trachomatis (recherche directe)
n =
Positif
PCR (Roche Diag.) 223 41
18 % des cas sont positifs.
Parasitologie
Sang
n =
Positifs
Filaires * 100 5
Plasmodium 7 1
* par hémofiltration et examen du frottis sanguin.
Selles
Nombre d'analyses 199
Parasitées 7
Giardia instestinalis est le seul parasite isolé de selles cette année.
Sensibilité aux antibiotiques des bactéries isolées au LABM
Staphylococcus aureus
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 110 souches
Pénicilline G
Oxacilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Tobramycine
Pénicilline G
Oxacilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Tobramycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Acide fusidique
Fosfomycine
Rifampicine
Vancomycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Acide fusidique
Fosfomycine
Rifampicine
Vancomycine
R 82,8 18,2 11 2,8 0 13,7 12,7 1,0 2,7 3,6 0 1,0 0
I 0 0 0 4,5 0 0 1,0 0 0 12,0 0 2,7 0
S 17,2 81,8 89 92,7 100 86,3 86,3 99 97,3 84,4 100 96,3 100
Rapport annuel 2007 59

La résistance à la pénicilline G concerne plus de 82% des souches et la résistance à l’oxacilline, principale
β-actamine anti-staphylocoque, est d’environ 18%. Ces souches résistantes à l’oxacilline sont résistantes à
l’ensemble des β-lactamines.
Bon niveau de sensibilité aux macrolides et aux antibiotiques apparentés : respectivement 89% et 93% des
souches restent sensibles aux macrolides et aux lincosamides. Pas de résistance à la pristinamycine.
Environ 86% les souches sont sensibles aux aminosides. La résistance à la gentamicine reste exceptionnelle.
Avec respectivement 100% et 96% de sensibilité, la fosfomycine et la rifampicine restent des antibiotiques
anti-staphylocoques majeurs.
En 2007, pour les souches provenant des hôpitaux (Taravao, Uturoa, Moorea, Taiohae), la proportion de
souches résistantes à l’oxacilline est de 21% et celle de souches de phénotype Kana. Tobra. R est 18%.
Escherichia coli
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 642 souches
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Amoxicilline
Amoxicilline + acide
clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
R 49,8 4,6 48 5,5 2,2 0,9 0 1,5 2,5 0,2 7,3 6 6,5 0,5 11,8
I 1,7 17,7 0,6 12,5 1,3 1,2 0 0,6 1,4 1,7 0 0 0 0 1,5
S 48,5 77,7 51,4 82 96,5 97,9 100 97,9 96,1 98,1 92,7 94 93,5 99,5 86,7
L’élément le plus important à souligner est la forte présence de souches productrices de β-lactamases.
Plus de 50% des souches sont résistantes (catégories R et I) à l’amoxicilline et 22% restent résistantes à son
association avec l’acide clavulanique.
13 souches isolées cette année étaient de sensibilité diminuée aux céphalosporines de troisième
génération (R ou I) par production d’une BLSE ou hyperproduction de céphalosporinase.
Par contre, pour les autres classes d’antibiotiques (aminosides, quinolones, furanes) on note un bon niveau
de sensibilité à peu près supérieur ou égal à 90%. Ces résultats sont d’autant plus intéressants que les
Rapport annuel 2007 60

quinolones et les furanes (pratiquement 100% de sensibilité) sont des antibiotiques de première ligne pour
le traitement des infections urinaires dont E. coli reste la principale étiologie.
Klebsiella pneumoniae
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 62 souches
Amoxicilline
Amoxicilline + acide
clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
R 100 8 100 5 0 0 0 3,3 1,6 0 11 5,4 6,5 5,5 9,6
I 0 8 0 5 0 0 0 0 1,6 0 0 1,8 1,6 7,2 1,6
S 0 84 0 90 100 100 100 96,7 96,8 100 89 92,8 91,9 87,2 88,8
La résistance à l’amoxicilline et à la ticarcilline correspond à une résistance naturelle de cette espèce par
sécrétion d’une pénicillinase naturelle.
On peut remarquer que contrairement à E. coli, il persiste une bonne activité de l’association amoxicilline
-acide clavulanique avec environ 84% des souches sensibles à cette association.
Bonne activité des autres familles d’antibiotiques :
Plus de 95% des souches sont sensibles aux aminosides ;
Environ 90% des souches sont sensibles aux quinolones ;
87% des souches restent sensibles aux furanes ;
89% de souches sont sensibles Cotrimoxazole (Bactrim).
Rapport annuel 2007 61

Proteus mirabilis
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Amoxicilline
Amoxicilline + acide
clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 36 souches
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
R 8,4 0 2,7 2,7 0 0 0 0 0 0 7,6 0 2,7 73 5,5
I 11,1 2,7 13,8 0 0 0 0 0 0 0 0 3,8 0 27 0
S 80,5 97,3 83,5 97,3 100 100 100 100 100 100 92,4 96,2 97,3 0 94,5
Persistance d’une bonne activité de l’ensemble des β-Lactamines et des autres classes d’antibiotiques
(aminosides, quinolones, cotrimoxazole) avec 80 à 100% de souches sensibles.
La résistance aux furanes (100% des souches R ou I) correspond à une résistance naturelle de cette espèce.
Rapport annuel 2007 62

Pseudomonas aeruginosa
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Ticarcilline
Ticarcilline + acide
clavulanique
Pipéracilline
Pipéracilline + tazobactam
Ceftazidime
Cefsulodine
Aztréonam
Imipénème
Tobramycine
Gentamicine
Amikacine
Ciprofloxacine
Fosfomycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 55 souches
Ticarcilline
Ticarcilline +
acide clavulanique
Pipéracilline
Pipéracilline +
tazobactam
Ceftazidime
Cefsulodine
Aztréonam
Imipénème
Tobramycine
Gentamicine
Amikacine
Ciprofloxacine
Fosfomycine
R 16,4 21,8 2,0 3,6 3,6 7,4 3,6 7,3 5,3 3,7 7,4 5,5 26,7
I 3,6 36,4 5,5 3,6 0 11,2 5,5 0 5,3 1,8 3,6 0 0
S 80 41,8 92,5 92,8 96,4 81,4 90,9 92,7 89,4 94,5 89 94,5 73,3
La proportion de souches présentant une résistance par pénicillinase acquise ou efflux est de 20% pour les
carboxypénicillines ; en revanche seulement 7% des souches sont résistantes aux uréidopénicillines.
La proportion importante de souches I ou R (58%) à l’association ticarcilline + acide clavulanique s’explique
par l’effet inducteur de l’acide clavulanique sur la production de la céphalosporinase naturelle de cette
espèce.
Seulement 2 souches étaient de sensibilité diminuée à la céftazidime par une céphalosporinase
hyperproduite.
A noter que 7% des souches sont de sensibilité diminuée à l’imipénème. Cette résistance par modification
des porines est dissociée de la résistance aux autres β-lactamines, mais elle peut toutefois être associée à
un autre mécanisme de résistance (enzymatique ou efflux) à cette famille d’antibiotiques.
La sensibilité aux aminosides et à la ciprofloxacine reste bonne avec plus de 90% des souches sensibles.
Rapport annuel 2007 63

Entérocoques
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Streptomycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Lévofloxacine
Furanes
Vancomycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 44 souches
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Streptomycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Lévofloxacine
Furanes
Vancomycine
R 0 36,4 100 22,7 22,7 25,3 4,6 59 6,8 2,3 0
I 0 15,9 0 11,4 77,3 74,7 95,4 0 4,6 0 0
S 100 47,7 0 65,9 0 0 0 41 88,6 97,7 100
L’ampicilline reste l’antibiotique de choix avec 100% des souches sensibles.
Parmi les aminosides, la gentamicine avec 95% des souches catégorisées I (par résistance naturelle à bas
niveau aux aminosides de tous les Streptocoques) conserve une excellente synergie avec les β-lactamines.
Par contre, la résistance aux macrolides et apparentés est importante. La résistance à la lincomycine
(100% des souches R) correspond à une résistance naturelle d’ E. faecalis, espèce la plus souvent isolée.
A noter une excellente sensibilité aux furanes avec 98% de souches sensibles. Cette interprétation n’est
toutefois valable que pour les souches isolées des urines.
Rapport annuel 2007 64

Streptocoques béta hémolytiques
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Lévofloxacine
Vancomycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 93 souches
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Vancomycine
R 0 9,5 5,5 2,1 2,2 0 51,6 0
I 0 3,3 6,4 5,5 97,8 100 6,5 0
S 100 87,2 88,1 92,4 0 0 41,9 100
Il persiste toujours une remarquable sensibilité aux β-lactamines avec 100% des souches sensibles à
l’Ampicilline.
Pour les macrolides et les antibiotiques apparentés la sensibilité tourne autour de 90%.
Les autres molécules antibiotiques sont encore en majorité très actives à l’exception des tétracyclines
dont 58% des souches ont une sensibilité diminuée. Cette résistance concerne principalement les
Streptocoques du groupe B.
Neisseria gonorrhoeae
6 souches isolées au cours de l’année 2007.
1 souche présentait une résistance à l’amoxicilline par sécrétion d’une β-lactamase et 3 souches avaient
une sensibilité diminuée aux fluoroquinolones.
Rapport annuel 2007 65

Campylobacter jejunii
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Ampicilline Amoxicilline +
acide
clavulanique
Céfotaxime Kanamycine Gentamicine Ciprofloxacine Tétracycline Erythromycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 11 souches
Ampicilline
Amoxicilline +
acide
clavulanique
Céfotaxime
Kanamycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Tetracycline
Erythromycine
R 36,3 9 0 0 0 9 0 0
I 36,3 18,3 36,4 0 0 0 0 0
S 27,4 72,7 63,6 100 100 91 100 100
72% des souches sont productrices de β-lactamase. Cette β-lactamase confère une résistance aux
aminopénicillines dont l’activité n’est pas toujours restaurée par l’association avec l’acide clavulanique.
Les céphalosporines de troisième génération sont peu actives sur campylobacter.
Par contre pour les autres molécules actives sur Campylobacter : aminosides, cyclines, fluoroquinolones et
macrolides la sensibilité est comprise entre 90% et 100%.
Salmonella spp
8 souches de Salmonelle ont été isolées cette année.
Elles ne présentaient aucun mécanisme de résistance aux antibiotiques testés.
β-Lactamines (amoxicilline ou céphalosporines), aminosides, fluoroquinolones, cotrimoxazole restent donc
parfaitement efficaces sur ces bactéries entéropathogènes.
Entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération isolées en
2007
Espèc es isolées
15
10
5
0
Escherichia coli
Proteus vulgaris
Rapport annuel 2007 66

Origine des prélèvements
Origine des prélèvements
2
3
urines
Autres
prélèvements
Hôpitaux
Dispensaires et
médecins privés
9
8
Mécanismes de résistance impliqués et résistances associées en fonction des espèces
Espèces isolées Nombre Mécanismes de résistance
Résistances associées
R Aminosides R Fluoroquinolones
Escherichia coli 7 BLSE 4 souches (Tobra.) 4 souches
Escherichia coli 2 Case hyperproduite Oui (T + Genta.) 1 souche
Proteus vulgaris 1 BLSE Oui (T + G +Amika.) non
Total 10
Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline isolés en 2007
Origine des prélèvements
Origine des prélèvements
4
Suppurations
Urines
7
Hôpitaux
3
13
Autres
prélèvements
13
Dispensaires et
médecins privés
Sensibilité aux autres familles d’antibiotiques
Rapport annuel 2007 67

100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Tobramycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Acide fusidique
Fosfomycine
Rifampicine
Vancomycine
Avec 18% des souches résistantes à l’oxacilline, le niveau de résistance à cet antibiotique est plutôt élevé.
Rappelons que ces souches sont résistantes à l’ensemble des β-lactamines.
La résistance aux aminosides montre une nette différence entre les souches OxaS et les souches OxaR avec
75% des souches résistantes à la kanamycine et à la tobramycine contre 14% pour les souches OxaS. Par
contre le phénotype résistant kana-tobra-Gentamycine (KTG) classiquement associé aux souches OxaR est
rare (5% des souches). A noter que ce phénotype à tendance à diminuer en métropole.
Ces souches méthicillino-résistantes se caractérisent aussi par un niveau plus élevé de résistance aux
fluoroquinolones (15% contre 3%).
Avec 80% et plus des souches sensibles, il persiste un bon niveau de sensibilité aux macrolides et aux
antibiotiques apparentés.
La veille microbiologique
Le LABM contribue à la surveillance microbiologique et épidémiologique d’un certain nombre de maladies
transmissibles, au premier rang desquelles la dengue et la leptospirose.
Le diagnostic et la surveillance de ces deux maladies infectieuses, ainsi que la grippe, font l’objet d’une
convention avec la Direction de la santé. Cette convention a pour but de stimuler les demandes de
confirmations biologiques en prenant en charge les analyses suivantes : diagnostic précoce de l’infection à
virus dengue, typage des virus dengue, diagnostic de la leptospirose, diagnostic et typage des virus de la
grippe.
Cette mesure concerne l’ensemble des prescripteurs de Polynésie française.
Le LABM est le seul laboratoire polynésien à pratiquer le diagnostic précoce de la dengue, de la
leptospirose et de la grippe. Il est également le laboratoire référent OMS pour le diagnostic sérologique de
la rougeole.
Les biologistes du LABM participent à divers comités et groupes de travail, tant au niveau local, que
national et international.
Diagnostic et surveillance de la dengue
Après l’épidémie massive de 2001 et 4 années d’activité de faible intensité relative, une augmentation
progressive et constante de l’activité de diagnostic et de surveillance de la dengue a été observée au cours
des années 2006 et 2007.
Sans pour autant être classée en épidémie, entre août 2006 et décembre 2007, la Polynésie française a dû
faire face à une très forte recrudescence du nombre de cas de dengue. Cette recrudescence d’activité a
été très certainement favorisée par la pullulation des moustiques vecteurs et l’augmentation régulière de
la population susceptible.
Pour rappel, depuis septembre 2006, les isolements viraux ont été abandonnés et remplacés dans un
premier temps par une technique d’amplification génique (RT-PCR). En effet, le délai de rendu de résultat
d’un isolement viral (7-10 jours) ne peut plus être considéré comme compatible avec une prise en charge
efficace des patients. Surtout, il ne permet pas de réaction rapide face à l’implantation éventuelle d’un
nouveau sérotype.
Rapport annuel 2007 68

En novembre 2006, l’antigénémie NS1 Dengue (Biorad) a, à son tour, remplacé la RT-PCR et constitue
désormais le test de première ligne utilisé pour les prélèvements précoces (6 e jour de
maladie), sachant que des faux positifs ne sont pas rares avec le kit utilisé (Panbio). Ces réactivités
correspondent, soit à des persistances longues d’IgM spécifiques, soit à des réactivations polyclonales à
l’origine de réactions croisées.
En 2007, une technique de RT-PCR en temps réel a été mise en place sur le LightCycler (Kong et al, 2006).
Cette technique, après avoir été adaptée au virus circulant, permet un rendu de résultat en un peu moins
de 2 heures.
Activité et nombre de cas pour 2007
Année 2005 2006 2007
Nb échantillons testés 413 2153 4221
Nb analyses
réalisées
Isolement viral
RT-PCR
92 901 1529
Antigène NS1 0 470 3123
IgM 349 1192 1958
Total 441 2854 6610
Nb échantillons positifs 39 686 1838
En 2007, 4221 prélèvements pour suspicion de dengue ont été pris en charge par le LABM.
1838 (43,5%) se sont révélés sérologiquement et/ou virologiquement positifs.
Activité mensuelle (période 2005-2007)
600
500
400
Nb de cas
300
200
100
0
05
05
05
05
janv.-
fev.-
mars-
avr.- mai-05 juin-05 juil.-05 aout- sept.- oct.-05 nov.-
05
05 05
05
dec.-
janv.- févr.- mars-
06 06 06
avr.- mai-06 juin-06 juil.-06 août- sept.- oct.-06 nov.-
06
06 06
06
déc.-
06
janv.- févr.- mars- avr-07 mai-07 juin-07 juil-07 aou-07 sept- oct-07 nov-07 dec-07
07 07 07
07
Figure : Activité mensuelle - période 2005-2007. En bleu : cas suspects. En rouge : échantillons positifs
L’activité Dengue a été particulièrement soutenue en début d’année pour diminuer au fil des mois.
Au total, 1796 patients se sont révélés positifs. Ce chiffre correspond à 1349 infections confirmées
(RT-PCR et/ou antigène NS1) et 447 infections probables (IgM positives isolées).
La moyenne d’âge était de 24 ans et la médiane de 17 ans (bornes : 0-87 ans). Le sexe ratio H/F était
de 1.31.
A l’exception d’un cas à virus DEN-2 détecté en janvier 2007 (importé des Philippines), l’ensemble des
1329 virus typés appartenait au sérotype 1.
Devant l’absence quasi systématique de fiche de renseignement, une étude épidémiologique fine est
impossible. De même, le jour de maladie manque très souvent, rendant délicat le choix de la
meilleure technique à utiliser.
Diagnostic de l’infection à virus Chikungunya
Un autre arbovirus est également sous haute surveillance : le virus Chikungunya dont le territoire ne cesse
de s’étendre. Bien que le flux de voyageurs entre les zones infestées et la Polynésie française soit limité,
le risque d’importation n’est pas négligeable et les conditions nécessaires à l’implantation de ce virus sont
pleinement réunies en PF (population totalement susceptible, vecteurs compétents).
L’ILM s’est donc équipé en 2007 d’une technique de détection précoce de ce virus par RT-PCR (Pastorino
et al, 2005). Cette mise en place a été validée par la participation à un contrôle de qualité externe
Rapport annuel 2007 69

international organisé par l’European Network for Diagnosis of Imported Diseases (ENIVD). Aucun kit
commercial n’étant actuellement disponible pour la détection des IgM, les éventuelles demandes seront
adressées au laboratoire Pasteur-Cerba.
Une seule PCR a été effectuée dans un contexte de retour de zone d’épidémie (Indonésie). Le résultat
était négatif.
Diagnostic et surveillance de la leptospirose
La leptospirose est connue comme l’une des pathologies infectieuses majeures de la Polynésie française.
Sur fond d’endémie tout au long de l’année, une recrudescence peut être observée pendant les mois
chauds et pluvieux. Les contaminations humaines ont une origine qui reste à préciser mais la baignade et
les travaux agricoles semblent être les modes de contamination privilégiés.
Le LABM de l’ILM traite la totalité des examens nécessaires au diagnostic biologique précoce (J1 à J6) de la
leptospirose. Le laboratoire réalise pour cela la mise en évidence de l’ADN bactérien par une technique de
biologie moléculaire. Cette analyse donne un résultat rapide et peut remplacer la culture bactériologique
plus longue à donner des résultats. Depuis 2006, le LABM met en œuvre une technique développée par
l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie utilisant la technologie SYBR-Green sur LighCycler (Roche
Diagnostics).
Le LABM réalise, en outre, la sérologie IgM à l’aide d’un kit commercial développé par Panbio.
Les demandes de sérotypage (par réaction de micro-agglutination, MAT) sont expédiées au Centre National
de Référence des Leptospires à l’Institut Pasteur de Paris.
Année 2005 2006 2007
Nb échantillons testés 286 695 1158
Nb analyses
réalisées
PCR 100 252 614
IgM 243 491 649
Total 343 743 1263
Nb échantillons positifs 60 53 60
Nb cas confirmés 18 33 40
Activité et nombre de cas pour 2007
L’activité leptospirose durant l’année 2007 s’est donc une nouvelle fois amplifiée. On peut noter que
l’activité double quasiment chaque année depuis 2005.
60 cas se sont révélés positifs (36 PCR positives et 24 sérologies IgM). La moyenne d’âge est de 35 ans, tout
comme la médiane (bornes : 5-71 ans). Le sexe ratio H/F est de 5.7.
L’essentiel des prélèvements provenaient de l’île de Raiatea et du Centre Hospitalier de la Polynésie
française (pour plus d’information voir bilan annuel établi par le Bureau des pathologies infectieuses de la
Direction de la santé).
47 cas peuvent être considérés comme des cas confirmés car trouvés positifs soit en PCR, soit en IgM puis
confirmés par MAT.
Les sérogroupes identifiables parmi les cas positifs testés (MAT, CNR Leptospirose) sont :
L. icterohaemorrhagiae (5),
L. australis (4),
L. canicola (1).
Le faible nombre d’identification du sérogroupe vient du fait que la plupart des diagnostics sont désormais
posés par une PCR. De plus, peu de médecins prennent le temps de réaliser un second prélèvement afin de
réaliser une réaction de micro-agglutination (MAT).
Enfin, on peut déplorer la trop fréquente absence de fiche de renseignements épidémiologiques ne
permettant pas une description précise de la leptospirose en Polynésie française.
Diagnostic et surveillance de la grippe saisonnière et préparation à une éventuelle pandémie à virus
influenza A/H5N1
En 2007, le LABM a traité 35 échantillons naso-pharyngés. En décembre, 6 de ces échantillons se sont
révélés positifs pour un virus grippe A. Ces échantillons ont été adressés au Centre collaborateur OMS de
Melbourne pour typage/sous-typage.
Il est important de noter qu’un tel niveau d’activité ne permet pas une surveillance efficace de la
circulation des virus grippaux en Polynésie française.
Rapport annuel 2007 70

Enfin, à la demande du Ministère de la Santé et de la Direction de la santé, le LABM a mis en place la
détection du virus A/H5N1. Pour le moment, le protocole utilisé est basé sur un kit commercial
Artus/Qiagen permettant de détecter le gène de l’hémagglutinine H5.
Aucune demande n’a été effectuée à ce jour.
Le laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments
L’équipe
Philippe BRANAA, directeur (à compter du 3 septembre 2007), chef de l’unité de microbiologie
Teva SUCHARD, directeur adjoint (à compter du 3 septembre 2007), chef de l’unité de chimie
analytique
Maud DURDAN, technicien supérieur de laboratoire (disponibilité à compter du 1 er juin 2007)
Marie-Paule FLEGEO, supérieur de laboratoire
Stéphanie REVERS, supérieur de laboratoire
Naea TAIORE, supérieur de laboratoire
Alice TANDIA, supérieur de laboratoire
Rommel WALKER, supérieur de laboratoire
Eliane CHANG, agent administratif et technique
Emiliane ARAKINO, adjoint administratif (du 15 octobre au 31 décembre 2007)
L’organisation du laboratoire
Au cours de l’année 2007, une réorganisation du laboratoire a été décidée pour pallier les départs de
l’agent administratif et d’un technicien de laboratoire bénéficiant d’une suspension de contrat d’un an.
Par ailleurs, d’autres agents impliqués de manière plus indirecte dans l’organisation du LASEA ont
démissionné de leurs postes respectifs. Il s’agit du Directeur général de l’Institut, également directeur du
LASEA, de la responsable qualité et de l’attaché de direction, qui était notamment en charge de
l’organisation commerciale du LASEA.
La charge de travail de ces différents personnels a été répartie au sein du laboratoire parallèlement à la
nomination de Philippe BRANAA en qualité de directeur du LASEA.
L’ensemble de l’équipe s’étant engagée, devant le Conseil d’administration de l’institut, à suivre un plan
de rigueur destiné à réduire le déficit du laboratoire à un niveau acceptable, le remplacement du
technicien de laboratoire a été différé à une date ultérieure afin de minimiser la charge salariale. Seul le
poste de l’agent administratif devait être pourvu. Devant les difficultés rencontrées par l’agent en
fonction à assurer les nombreuses tâches inhérentes à ce poste, il a été décidé de procéder au
recrutement d’une personne plus qualifiée et aux compétences élargies. Ce recrutement est intervenu
début 2008 avec l’intégration dans l’équipe d’une assistante de direction.
Sur le plan plus technique, deux acquisitions majeures ont été réalisées :
Une chromatographie ionique destinée au dosage simultané des anions dans les eaux propres et les
eaux résiduaires. Ce système de dosage performant automatisé et piloté par un système informatique
permettra de dégager du temps pour les opérateurs, en assurant un rendu de résultats en des temps
relativement courts avec une fiabilité accrue.
Une électrophorèse à champ pulsé destiné au typage moléculaire. Cet appareil va permettre de
donner le sérotype d’un germe et sera utilisé dans l’étude menée en partenariat avec l’Etablissement
public pour la prévention (EPAP) sur les Salmonelles (Cf. § « Les activités associées »).
Rapport annuel 2007 71

Le chiffre d’affaires
Prélèvements et études
4 100 000 CFP (6%)
Chimie
14 700 000 CFP (22%)
Sous traitance
10 800 000 CFP (16%)
Microbiologie
alimentaire
8 400 000 CFP (13%)
Microbiologie des eaux
28 300 000 CFP (43%)
Le Laboratoire d'analyses de la salubrité des eaux et des aliments (LASEA) a réalisé un chiffre d’affaires de
66,3 millions Fcfp, soit une progression de près de 47%, puisque ce chiffre était de 45,1 millions Fcfp en
2006. Cette augmentation importante s’explique principalement par la conclusion de nouveaux marchés
dans le secteur de la surveillance de l’environnement, avec notamment un volume d’analyses réalisées en
sous-traitance multiplié par cinq (2,28 millions Fcfp en 2006 pour 10,8 millions Fcfp en 2007).
Ces analyses sont sous-traitées auprès du laboratoire Hill, situé à Hamilton en Nouvelle-Zélande, le plus
important laboratoire privé du pays. Elles concerne uniquement les analyses physico-chimiques non
réalisables au LASEA telles que la recherche de pesticides, d’hydrocarbures et autres substances
dangereuses pour l’environnement.
L’imputation de ces prestations en sous-traitance à l’unité de chimie du LASEA donne un chiffre d’affaires
pour ce secteur de 25,5 millions Fcfp, un résultat comparable à celui de la section de microbiologie des
eaux (28,3 millions Fcfp). On constate donc que l’activité d’analyse de l’eau (chimie et microbiologie)
représente près de 80% du chiffre d’affaires du LASEA. Il existe en effet un dispositif réglementaire qui
prévoit un contrôle analytique régulier. Ce qui n’est pas le cas des analyses relevant du domaine de la
microbiologie alimentaire pour lequel certains secteurs d’activité ne disposent pas de réglementation à
l’heure actuelle.
Les marchés
La répartition des différents marchés en fonction du chiffre d’affaires est donnée dans le tableau suivant :
Différents marchés
Chiffre d’affaires
en Fcfp
% du chiffre
d’affaires
Services publics (CHSP, SDR, DIREN, IC) 20 000 000 30,1%
Bureaux d’études techniques 17 520 000 26,4%
Secteur de l’hôtellerie 8 060 000 12,1%
Secteur hospitalier (clinique, CHPf, APURAD…) 7 200 000 10,9%
Communes 4 900 000 7,4%
Collectivités (Lycées, collèges, entreprises…) 4 120 000 6,2%
Industries agroalimentaires 2 400 000 3,6%
Industries de la cosmétologie 1 300 000 2,0%
Particuliers 500 000 0,8%
Navires 300 000 0,5%
On constate que les commandes des bureaux d’études représentent un chiffre d’affaires comparable à
celui des services publics. Il s’agit principalement des analyses liées à l’impact de l’activité humaine sur
l’environnement (suivi des centres d’enfouissement techniques, des systèmes de traitement des eaux
résiduaires…). Si cette augmentation a pu être notée en 2006, elle s’est nettement confirmée en 2007
avec la mise en place de plusieurs programmes de surveillance annuels.
Rapport annuel 2007 72

A noter qu’au niveau des services publics de nouveaux programmes d’études ont été réalisés, tels que la
recherche de résidus de pesticides dans les fruits et légumes commercialisés localement. Cette étude
pilotée par l’Institut de la Consommation en partenariat avec le Service du Développement Rural devrait
se poursuivre en 2008.
S’agissant du contrôle analytique des denrées alimentaires, la situation est quasi identique à celle de l’an
passé. Le manque de réglementation dans ce secteur ne permet pas d’établir en partenariat avec les
industriels des plans de surveillance réguliers. On peut toutefois noter quelques programmes de contrôle
résultant le plus souvent de démarches volontaires de la part des professionnels. Certains d’entre eux ont
pris conscience de l’intérêt de réaliser des contrôles analytiques sur leurs produits dans le but d’améliorer
leur processus de fabrication.
Le milieu de l’hôtellerie se distingue car les professionnels possèdent d’ores et déjà une culture de qualité
inhérente à leur métier, notamment dans les hôtels de luxe souvent rattachés à une filiale internationale.
Ce marché devrait donc se maintenir à l’avenir.
On observe que les marchés du secteur public se stabilisent. Ils relèvent principalement le Centre
d’hygiène et de Salubrité Publique, le Service du Développement Rural et la Direction de l’Environnement.
Enfin s’agissant du secteur hospitalier, la progression par rapport à 2006 concerne surtout les centres
d’hémodialyse délocalisés (APURAD) qui se créent dans les différentes communes de Tahiti avec également
une ouverture prévue à Moorea en 2008.
L’activité
Au cours de l’année 2007, avec quelque 130 paramètres susceptibles d’être réalisés par le laboratoire, un
volume global d’environ 26.000 a été analysé. Ces analyses ont concerné les catégories suivantes :
Eaux destinées à la consommation humaine
Eaux de mer
Eaux résiduaires
Produits industriels (produits ménagers, flaconnage, huile végétale…)
Denrées alimentaires.
Les analyses chimiques concernent principalement les eaux. Les volumes traités se répartissent comme
suit :
Analyses physico-chimiques réduites : 1517
Analyses physico-chimiques complètes : 100
Analyses physico-chimiques sur eaux résiduaires : 173
Analyses physico-chimiques sur produits alimentaires : 13
Analyses physico-chimiques sur produits industriels : 56.
Les analyses physico-chimiques sur produits alimentaires concernent la recherche de mercure et
d’histamine dans le poisson destiné à l’exportation.
Les analyses réalisées en sous-traitance concernent principalement la recherche de substances organiques
(résidus de pesticides, hydrocarbures polycycliques aromatiques, PCB…).
En microbiologie des eaux, l’activité se traduit ainsi :
Analyses microbiologiques réduites : 215
Analyses microbiologiques sommaires : 270
Analyses microbiologiques complètes : 1300
Analyses eaux de piscine : 71
Analyses eaux de baignade : 920
Analyses d’eau microbiologiquement maîtrisée : 438
Recherche de légionnelles : 58.
Les analyses en hygiène alimentaire ont concerné principalement :
Les analyses microbiologiques sur denrées : 1060
Les recherches de salmonelles : 1058
L’hygiène des mains et surfaces : 184.
Il convient d’ajouter 305 analyses microbiologiques réalisées sur les produits industriels (produits à usage
ménager, produits cosmétiques…).
L’augmentation du nombre d’analyses est de l’ordre de 30% par rapport à l’année 2006. De nombreux
efforts, notamment sur la tarification et l’établissement de contrats commerciaux portant sur des périodes
à plus ou moins long terme, ont permis de fidéliser les clients.
Rapport annuel 2007 73

Les analyses effectuées en sous-traitance ont représenté 27 dossiers sur l’année, soit une expédition sur la
Nouvelle-Zélande tous les quinze jours et ce, pour un nombre de paramètres d’environ 250.
A l’instar des années précédentes, on constate qu’une vingtaine de paramètres, ceux des analyses physicochimiques
et microbiologiques réduites, permettent de réaliser environ 70% du chiffre d’affaires. En effet,
les groupements d’analyses imposés réglementairement obligent le laboratoire à maintenir ses
compétences sur un très grand nombre de paramètres pour répondre efficacement à la demande des
clients.
Les activités associées
Le programme initié en 2006 en collaboration avec l’Université de Laval au Canada sur « l’évaluation des
teneurs en métaux lourds dans les poissons lagunaires » s’est achevé en 2007, avec la détermination de la
teneur en mercure totale dans près de 80 échantillons. L’ensemble des résultats a été traité par le
Dr Edouard SUHAS, responsable des recherches « Santé et environnement » de l’Institut.
Le programme contractualisé 2006 avec l’EPAP intitulé « Salmonelle et alimentation : évaluation de la
situation épidémiologique en Polynésie française » s’est poursuivi. Le rapport devrait être édité fin 2008,
avec un peu de retard en raison notamment de difficultés rencontrées dans la collecte des échantillons.
Pour rappel, ce programme a pour objectif d’évaluer, sur le plan de la biorésistance, du sérotypage des
souches et du profil génétique des souches, les cinq filières agroalimentaires suivantes :
Les eaux destinées à la consommation humaine
Les denrées alimentaires fabriquées localement
La filière avicole locale
Les denrées importées
Les denrées issues de l’abattoir de Papara
L’accréditation du COFRAC
Accrédité depuis fin 2004, le LASEA est audité par des évaluateurs du Comité français d’accréditation
(COFRAC) tous les quatorze mois environ. L’audit de mars 2007 était le troisième audit de surveillance
avec la venue d’un expert technique dans le domaine de la chimie des eaux. A cette occasion, l’unité de
chimie analytique a étendu la portée d’accréditation sur les méthodes suivantes :
Mesure du pH dans les eaux résiduaires
Dosage des nitrites dans les eaux propres
Dosage des ammoniums dans les eaux propres
Dosage du calcium et magnésium dans les eaux propres
Dosage du sodium et du potassium dans les eaux propres
Dosage des ions silicates dans les eaux propres
Détermination de l’indice permanganate dans les eaux propres
Dosage du phosphore dans les eaux propres
Mesure de l’alcalinité totale et composite dans les eaux propres
Mesure du titre hydrotimétrique dans les eaux propres
Par ailleurs, l’auditeur technique a également vérifié les actions correctives mises en place par l’ensemble
du personnel du laboratoire. L’audit s’est conclu par le renouvellement de la confiance accordée au LASEA
et quatre fiches d’écarts, toutes non critiques, qui ont été soldées au cours de l’année sans difficulté.
Le prochain audit du COFRAC est prévu en juin 2008 avec la venue de deux experts dans les domaines de la
chimie alimentaire et dans celui de la microbiologie alimentaire.
Les perspectives
La diversification des demandes d’analyses, notamment celles réalisées en sous-traitance (pesticides,
hydrocarbures…), pose le problème de leur faisabilité au LASEA. Les méthodes à mettre en place
nécessitent un investissement humain et matériel important et coûteux. A l’heure actuelle, compte tenu
des restrictions budgétaires, il ne paraît pas envisageable de faire supporter cet investissement sur le seul
budget de l’Institut. Les décisions relevant de ce dossier devraient être prises à un niveau hiérarchique
supérieur (Ministère de tutelle, Gouvernement).
Il est cependant clair que ces demandes vont augmenter dans les années à venir, du fait notamment d’une
prise de conscience collective de la fragilité de l’environnement et de la nécessité de le préserver et donc
de réaliser des plans de surveillance. Et il est justifié que les organismes en charge de réaliser ces plans de
surveillance exigent un niveau de fiabilité analytique très élevé.
Les demandes réalisables au LASEA et relevant de la surveillance de l’environnement devraient se
maintenir pour l’année 2008. Les contrats de prestations de service signés avec les services publics,
notamment le Centre d’Hygiène et de Salubrité Publique et le Service du Développement Rural, devraient
être également confortés pour l’année prochaine.
Rapport annuel 2007 74

Enfin en ce qui concerne l’accréditation du laboratoire, la « politique qualité » de la Direction générale est
bien sûr de maintenir cette accréditation avec une démarche d’extension de la portée par l’accréditation
de nouvelles méthodes d’analyses innovantes telles que la détection de germes par technique PCR.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
L’équipe
Ngoc Lam NGUYEN, médecin
Anne BELLEOUD (jusqu’au 3 avril 2007)
Isabelle CAZALENS (jusqu’au 31 mars 2007)
Sylviane TEURURAI (disponibilité jusqu’au 31 mars 2007, changement d’affectation le 13 décembre
2007)
Véronique MOU, adjointe de soins
A cette équipe s’ajoute en prestation de service un médecin vacataire pneumologue (4 matinées de 4h /
semaine).
Les activités de recherche
En 2007, le CIE terminait la dernière phase de l’évaluation des sites sentinelles du programme PacELF en
Polynésie française. Ces études transversales à passages répétés étaient destinées à mesurer l’impact de la
stratégie régionale de l’élimination de la filariose lymphatique. Ces résultats montrent que la stratégie
actuelle ne permet pas d’atteindre l’objectif d’élimination de filariose lymphatique fixé par l’OMS, soit
une prévalence filarienne de moins de 1% (évaluée par le test ICT). (Cf : Rapport final d’évaluation des
sites sentinelles en Polynésie française).
De plus, le CIE était en charge de l’organisation pratique et de la conduite de l’enquête de terrain menée
en octobre 2007. Il s’agissait de l’étude multicentrique internationale pour la validation d’outils de
surveillance dans le cadre du programme mondial d’élimination de la filariose lymphatique, coordonnée
par le LPM au niveau de la Polynésie. Cette collaboration étroite entre le LPM, le LEM et le CIE a permis de
mener à bien la récolte d’informations médicales et entomologiques.
Les activités cliniques et de surveillance épidémiologique
Activités globales
L’activité clinique concerne les pathologies assez spécifiques telles que la tuberculose, la lèpre, la
filariose lymphatique, les infections sexuellement transmises, ou IST (y compris le VIH/SIDA), la ciguatéra,
les conseils aux voyageurs et le vaccin antiamarile, etc.
Deux particularités de cette activité clinique sont à souligner :
D’une part une activité de médecine générale est maintenue intentionnellement pour protéger les
patients, atteints de pathologies discriminantes, du stigmate psychologique et social en les
«banalisant» dans le flot de consultants tout venant.
D’autre part, la prise en charge est nécessairement globale, sur le plan médical mais aussi
psychologique et social notamment. Car à l’exception des nécessités d’hospitalisation, les patients qui
sont adressés au CIE pour ces pathologies spécifiques peuvent difficilement être redirigés ailleurs, le
CIE servant de structure de référence. Le temps de consultation s’en trouve ainsi allongé en fonction
de la complexité de la prise en charge.
Le CIE est un des centres de dépistage anonyme et gratuit (CDAG) pour le VIH. Il demeure toujours le plus
actif des 8 CDAG en Polynésie française.
Au cours de l'année 2007, 2.472 consultations ont été enregistrées (sexe ratio = 1,3). Ce chiffre est
globalement stable depuis 1997. (Fig. 1)
Les pathologies sont, par ordre d'importance :
IST : 45,3% (dont 21,7% de CDAG, 19,8% de patients HIV et 4,6% d’IST)
Mycobactérioses : 41,8% (tuberculose : 12% et lèpre 4,7%)
Divers : 25,7% (pneumopathies autres que tuberculose, affections dermatologiques autres que lèpre,
médecine générale, soins du personnel)
Vaccin contre la fièvre jaune : 8%
Ciguatera : 2,7%
Filariose : 1,4%
Rapport annuel 2007 75

Le nombre de consultants anonymes dans le cadre de dépistage VIH (CDAG) est de 536 personnes en 2007,
ce qui est assez similaire au chiffre de 2006 (516 consultants). Aucun nouveau cas d’infection HIV n’a été
détecté dans ce cadre.
Evolution des activités cliniques du CIE
(1997-2007)
3000
2808
60%
Nb de consultation (Nb Cs)
2500
2000
1500
1000
500
2434
2429
2249
2346 2338
1866
2216
2326
2413 2472
40%
20%
0
0%
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007
Année
Nb cs %TB %Lep %IST %Fil %Autres %FJ
Fig. 1 : Evolution des activités de consultation de 1997 à 2007 en nombre de consultations
et en pourcentage selon les pathologies
Surveillance de l’infection VIH/Sida
En collaboration avec le bureau DPP de la Direction de la Santé et le service de médecine interne du CHPf,
le CIE participe activement à l’activité de surveillance de l’infection VIH qui est publiée chaque année au
bulletin BISES édité par la Direction de la Santé.
Sur le plan du suivi, le nombre de patients HIV pris en charge par le CIE, quel que soit le stade de
l’infection, était de 91 personnes (soit près de 80% des patients activement suivis en 2007 en Polynésie
française). De ces patients 89% sont sous antirétroviraux. L’accessibilité aux nouvelles techniques de
biologie médicale, devenues routines, (dosages plasmatiques des antirétroviraux et antivirogrammes
génotypiques, typage HLA B5701, fibrotest, etc.) ont permis d’améliorer significativement la prise en
charge de ces patients.
Surveillance de la tuberculose
En collaboration avec le DPP, via le groupe d’intervention de terrain et d’épidémiologie (GITE), et le
service de pneumologie du CHPf, le CIE participe activement à la surveillance de la tuberculose dont la
situation épidémiologique annuelle est publiée au bulletin BISES par la Direction de la Santé.
Grâce à l’expertise technique du LABM de l’ILM, toutes les souches isolées de Mycobacterium tuberculosis
sont systématiquement testées pour les résistances aux anti-tuberculeux de première ligne. Aucune souche
isolée en 2007 n’a montré de multirésistance. Jusqu’à présent la résistance aux antituberculeux des M
tuberculosis isolés en Polynésie française reste limitée. L’application systématique du protocole de
supervision directe du traitement aux patients tuberculeux (DOTS) a sans doute joué un rôle important en
empêchant l’apparition des souches multirésistantes en Polynésie française.
Surveillance de la lèpre
La lèpre est une maladie à déclaration obligatoire en Polynésie française (Arrêté ministériel du 7 février
1911). Tous les nouveaux cas de lèpre sont déclarés au CIE. Le programme de contrôle de la lèpre est basé
sur le traitement des nouveaux cas par la polychimiothérapie. Le schéma thérapeutique standard appliqué
en Polynésie reste inchangé depuis plus de 20 ans, avec 2 ans de polychimiothérapie pour les formes
multibacillaires et 6 mois pour les formes pauci bacillaires. Et parfois, en traitement minute en cas de
lésion unique.
Rapport annuel 2007 76

La lutte repose également sur le dépistage actif dans l'entourage des patients pour détecter d'éventuels
cas méconnus. Mais l’affaiblissement progressif de l’effectif du CIE ne permet plus de mener
systématiquement et de façon adéquate cette activité de dépistage. La prise en charge de la lèpre
(médicaments, suivi clinique et paraclinique, traitement des complications, dépistage des sujets contacts)
est assurée à 100% par l’Institut Louis Malardé surtout pour les patients de l’archipel de la Société. Pour
les patients des îles plus éloignées, la collaboration avec les structures sanitaires périphériques reste
nécessaire.
Le nombre de nouveaux cas détectés en Polynésie française à la fin de décembre 2007 est de 3 adultes,
aucun enfant de moins de 15 ans n’a été détecté. L'incidence annuelle de la lèpre est de 1,15/100.000
habitants et la prévalence est de 0,5/10.000 habitants pour l’année 2007, toujours au-dessous du seuil
d'élimination fixé par l'OMS (1/10.000). Ces indicateurs sont stables depuis plus de 15 ans. Deux rechutes
ont été constatées. Compte tenu de la physiopathogénie particulière de la lèpre, il est nécessaire de
maintenir la compétence du personnel et sa vigilance afin que les nouveaux cas ne soient pas méconnus
(avec risque de diagnostic retardé et de séquelle importante).
Année
Population
X 1 000
Cas en
traitement
Prévalence
p. 10 000
Nouveaux
cas
Détection
p. 100 000
MB 1
%
Infirmités 2
%
Enfants 3
%
2001 235 6 0,25 4 1,70 75% 100% 0%
2002 240 17 0,71 11 4,58 91% 0% 0%
2003 246 14 0,57 3 1,20 33% 0% 33%
2004 249 11 0,44 7 2,80 71% 14,30% 0%
2005 251 16 0,63 10 3,95 50% 0,00 0%
2006 260 15 0,58 8 3,08 37,50% 12,50% 0%
2007 260 13 0,50 3 1,15 33,30% 33,30% 0%
(1) Proportion de malades multibacillaires
(2) Proportion de malades porteurs d'infirmités de grade 2
(3) Proportion de malades âgés de moins de 15 ans
Surveillance de la ciguatéra
Tableau 1 : Différents indicateurs de l'endémie lépreuse de 2001 à 2007
Arrêté d’être exploité par le CIE depuis un certain temps faute de moyens humains et pour son intérêt
assez limité, le recueil des fiches concernant la ciguatéra a été remis à jour et régulièrement exploitées
par le LMT.
Problèmes et perspectives
Depuis 2002, le CIE reste sans chef de service, ce qui n’a pas permis de développer ou de gérer
correctement ce service. Les questions récurrentes concernant le maintien du CIE au sein de l’ILM restent
sans réponse car elles n’ont pas été abordées ni discutées par les directions successives depuis 1999.
L’abandon moral de ce service est d’autant plus incompréhensible au regard des services rendus à la
population et à la Santé publique. Le départ du médecin vacataire prévu fin novembre 2008 aggravera le
déséquilibre entre l’effectif rachitique du CIE et ses nombreuses missions statutaires.
La remise à niveau du CIE, inhérente à la démarche de qualité mise en place partout ailleurs à l’ILM, est
plus que jamais nécessaire, à la fois sur le plan du personnel que sur le plan matériel (locaux adaptés et
sécurisés). Le rôle du CIE dans d’autres missions de surveillance et/ou de veille sanitaire devrait être
discuté avec les partenaires habituels et/ou nouveaux. La mutualisation des moyens, tant à l’ILM qu’à
l’extérieur (dans un cadre de partenariats conventionnels), méritent réflexion et pourrait permettre de
remplir au mieux les missions de l’ILM. Plus que tout autre service de l’ILM le CIE est la porte qui s’ouvre
sur la réalité sanitaire de la population polynésienne, il est l’interface privilégiée entre la recherche,
l’activité de laboratoire et de Santé publique. Négliger cet aspect serait priver l’ILM d’un atout important.
Le centre de distribution biomédicale
L’équipe
Agnès BESSOU, chef de service
Willy DECIAN, gestionnaire de stocks (disponibilité à compter du 25 juillet 2007)
Rémy TANGUY, gestionnaire de stocks et agent d’approvisionnement (depuis le 10 septembre 2007)
Rapport annuel 2007 77

Sylvia BENNETT, agent commissionnaire
Le bilan
La mission du DBM est double, elle se partage entre l’activité commerciale (vente de vaccins, réactifs de
laboratoire, préparations de désensibilisation allergique et produits vétérinaires) et la gestion interne des
stocks de l’ILM (réactifs de laboratoire, consommables, solvants à usage des laboratoires d’analyses et de
recherche).
La gestion interne du stock de l’ILM
Le recrutement d’un gestionnaire de stocks expérimenté en septembre 2007 a contribué à une meilleure
gestion des commandes et une optimisation du stock (gestion à flux tendu).
La mise en concurrence systématique entre les différents fournisseurs, locaux et internationaux, permet
d’obtenir le meilleur rapport qualité/prix.
Les consommables
Sur la base des besoins exprimés par les différentes entités de l’Institut, le gestionnaire de stocks
procède à des consultations auprès de différents fournisseurs et négocie le meilleur rapport
« qualité/prix ». Une commande annuelle est effectuée, puis complétée par une commande de
réajustement en cours d’année selon des besoins.
Les consommables sont stockés sur le site de Paea. Une fois par semaine, le gestionnaire de stocks
approvisionne les laboratoires.
L’aménagement de nouveaux locaux de stockage à Paea a largement contribué à un meilleur suivi de
stocks ainsi qu’à des conditions de conservation bien améliorées.
Les réactifs de laboratoire
Le gestionnaire de stocks est en charge des commandes de réactifs destinés au LABM. Les commandes
sont validées par le surveillant et par un biologiste. Le gestionnaire fait le suivi de ces commandes
auprès des fournisseurs et du transitaire.
S’agissant du LASEA et de la Recherche, les responsables de laboratoire effectuent eux-mêmes leurs
commandes et le gestionnaire se charge du suivi de l’acheminement auprès du transitaire.
L’activité commerciale
L’analyse du chiffre d’affaires
250 000 000
200 000 000
FCFP
150 000 000
100 000 000
50 000 000
-
1997
1998 1999
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006
2007
Figure 1 : Evolution du chiffre d’affaires de 1997 à 2007
Rapport annuel 2007 78

Le chiffre d’affaires a augmenté de 1% en 2007. Les différents domaines d’activité montrent une
progression stable. Seule la vente de préparation de désensibilisation allergique est en nette
progression, comme les années précédentes (+27%).
A l’heure actuelle, en raison de la situation géographique de la Polynésie, il est difficile de trouver de
nouveaux clients, sachant que la quasi-totalité des clients potentiels sont déjà partenaires du DBM.
De plus, étendre son domaine d’activité risque de mettre le DBM dans une situation de concurrence
directe avec ses clients actuels (ex : grossistes et pharmacies), ce qui pourrait avoir des conséquences
sur la pérennité de l’activité. La position du DBM repose en effet sur des relations commerciales
équilibrées entre les différents partenaires de santé polynésiens (pharmacies et grossistes
répartiteurs, laboratoires d’analyses).
La répartition du chiffre d’affaires par activité
Vaccins veterinaires
9%
Allergène
9%
Réactifs de laboratoire
27%
Vaccins humains
55%
Figure 2 : Répartition des ventes 2007 par secteur d’activité
140 000 000
120 000 000
100 000 000
80 000 000
FCFP
60 000 000
40 000 000
20 000 000
-
Vaccins humains Réactifs de laboratoire Vaccins vétérinaires Allergènes
Figure 3 : Répartition des ventes en 2007
Rapport annuel 2007 79

120 000 000
100 000 000
80 000 000
Chiffre d'affaires
HT en FCFP
60 000 000
40 000 000
20 000 000
-
Sanofi Pasteur Biorad Virbac Stallergènes CSP Véto Santé Biomérieux
Figure 4 : Répartition du chiffre d’affaires par fournisseur
140 000 000
120 000 000
100 000 000
en
FCFP
80 000 000
60 000 000
40 000 000
Vaccins humains
Réactifs de laboratoire
Vaccins vétérinaires
Allergènes
20 000 000
-
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007
Figure 5: Evolution du chiffre d'affaires par secteurs d’activité
La vente des vaccins humains Sanofi Pasteur et du Spirolept® (vaccin contre la leptospirose)
représente 55% du chiffre d’affaires (122 millions), identique à l’année dernière. Il est important de
souligner que 95% de la vaccination en Polynésie se fait avec les vaccins Sanofi Pasteur, distribués par
le DBM.
La vente de réactifs de laboratoire Bio-Rad (27%) représente 60 millions, en baisse de 4% par rapport à
2006. La raison principale est que le Centre de Transfusion Sanguine a fait l’acquisition d’un nouvel
automate qui ne fonctionne pas avec les réactifs Biorad. L’activité réalisée avec le CHPF a donc baissé
de 17% en 2007.
La vente des vaccins vétérinaires Virbac et Véto Santé est stable par rapport à 2006 (20 millions). Elle
représente 9% du chiffre d’affaires.
La vente des produits de désensibilisation allergique Stallergènes (immunothérapie spécifique et
housses anti-acariens) représente 9% du chiffre d’affaires, en hausse de 27% par rapport à 2006.
Rapport annuel 2007 80

L’analyse de la clientèle
100 000 000
90 000 000
80 000 000
Chiffre d'affaires
2007
70 000 000
60 000 000
50 000 000
40 000 000
30 000 000
20 000 000
10 000 000
0
Pharmappro Grossistes répartiteurs CHPF Laboratoires d'analyses privés Vétérinaires
La pharmacie d’approvisionnement de la Direction de la Santé
Le chiffre d’affaires réalisé avec la Santé Publique est de 88 millions FCFP. Le DBM a signé un marché
pour 3 ans renouvelable chaque année, ce marché incluant la totalité des vaccins nécessaires à la
campagne de vaccination de la Santé publique, y compris la campagne contre la grippe. Seul le vaccin
Prevenar®, vaccin contre le pneumocoque chez le nourrisson, est fourni par un autre fabricant (GSK).
Le Centre hospitalier de Polynésie française (Service de Biologie, Service de Biochimie, Pharmacie,
Centre de Transfusion Sanguine)
Le chiffre d’affaires réalisé avec le CHPf est en baisse (-17%) bien que, pour la première fois, le DBM a
été retenu pour le marché des réactifs Bio-Rad avec le service de Biochimie (chiffre d’affaires en
2007 : 5,7 millions).
La baisse d’activité (8 millions) est imputable au changement d’automate d’immuno hématologie au
CTS. Le fonctionnement s’effectue avec les réactifs du fabricant de cet automate fermé.
Les grossistes répartiteurs
Leurs achats de vaccins et leurs commandes d’allergènes sont en hausse par rapport à 2006 (+11%). La
progression est très nette, notamment pour les allergènes (+41%). L’augmentation de commandes de
vaccins (+2%) est essentiellement due à l’arrivée sur le marché du vaccin contre le rotavirus,
Rotateq®, qui représente pour le DBM plus de 3 millions de chiffre d’affaires en 2007.
Les laboratoires d’analyses médicales
Leur consommation en réactifs de laboratoire Bio-Rad est légèrement en baisse par rapport à 2006 (-
5%), malgré l’augmentation des ventes de réactifs à l’un des deux laboratoires privés. Cette baisse est
due au fait qu’un laboratoire a abandonné ses analyses faites sur un automate d’immuno-hématologie
Bio-Rad au profit d’une autre technique.
Les vétérinaires
Le chiffre d’affaires réalisé avec les vétérinaires augmente de 1% en 2007. Le DBM constate une
hausse continue de l’activité vétérinaire chaque année, ce qui encourage le développement d’une
gamme de produits plus étendue pour répondre à la demande de ces professionnels de santé, satisfaits
du service du DBM, de ses compétences en matière d’acheminement de produits réfrigérés et de la
sécurité garantie du stockage et de la livraison.
Rapport annuel 2007 81

La répartition de la vaccination public/privé
100000
90000
80000
Nombre
de doses
70000
60000
50000
40000
privé
public
30000
20000
10000
0
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007
Figure 7 : Répartition de la vaccination Privé / Public
En 2007, la vaccination a été réalisée à 84% au sein des structures de santé publique. Les vaccins
prescrits par le secteur privé n’étant pas remboursés par la Caisse de Prévoyance Sociale (CPS), une
forte proportion de la population se tourne vers les structures de santé publique, gratuites
(consultation + fourniture de vaccins).
Le DBM au sein de l’ILM
300 000 000
250 000 000
Chiffre d'affaires
200 000 000
150 000 000
Approvisionnement ILM
Ventes externe
100 000 000
50 000 000
0 -
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007
Figure 8 : Répartition de l’activité du DBM
Le DBM compte 7 fournisseurs pour son activité commerciale. S’agissant des réactifs de laboratoire, le DBM
commande auprès de Bio-Rad et Biomérieux des réactifs destinés à la fois à la vente et aux laboratoires de
l’ILM (LABM, LASEA, recherche). En 2007, 21% de ces commandes étaient destinées aux laboratoires en
interne.
Rapport annuel 2007 82

Les équipements
Le DBM possède un véhicule réfrigéré qui assure les livraisons quotidiennes, ainsi qu’un camion « Transit »
réservé aux livraisons de vaccins plus volumineuses.
Il est équipé de 3 chambres réfrigérées, dont les températures sont surveillées au moyen d’une centrale de
mesure informatisée. La mise en place, début 2007, d’un système d’alarme sur ces 3 chambres froides
(activation en cas de rupture de chaîne du froid), permet une surveillance optimale de la chaîne du froid
sur les produits stockés.
L’équipement est dorénavant entièrement sécurisé, performant et complet.
Les perspectives
Le DBM a été retenu pour le marché en 2006 des vaccins de la Santé publique grâce à des prix très
compétitifs et un service unique en Polynésie, performant sur le plan technique et entièrement sécurisé en
matière de transport, de stockage et de surveillance de température. Ce marché, valable 3 ans, est
prolongé chaque année par tacite reconduction. Il est impératif pour le DBM de pérenniser l’obtention du
marché global des vaccins 2009-2011, et du marché du vaccin grippe pour assurer le maintien de son
niveau d’activité.
Bien que d’une année à l’autre, quelques variations affectent le chiffre d’affaires global, on constate que
le service fourni correspond aux besoins du marché local. Toutefois, le potentiel de développement des
différents secteurs d’activité reste relativement limité.
La stabilisation de l’activité à son niveau actuel avec une qualité de prestation équivalente, notamment en
ce qui concerne le maintien de la chaîne du froid de l’expédition du produit à sa livraison au client,
exigera des efforts continus que le DBM saura mettre en œuvre pour assurer la pérennité de son activité.
S’agissant de la gestion de stocks, l’ILM devrait faire l’acquisition en 2008 d’un nouveau logiciel. La gestion
de stock sera centralisée et permettra une utilisation plus fluide et une analyse de l’activité beaucoup plus
approfondie et précise, en fonction des secteurs.
Rapport annuel 2007 83

Les collaborations
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
Dr V. CORBEL
J. BONNET
A-B. FAILLOUX
C. BERNEDE-BAUDUIN
Dr L. GUILLOMAUT
Dr S. DOBSON
Institut de recherche pour le Développement, Laboratoire de lutte contre
les insectes nuisibles, Montpellier
Institut Pasteur, Paris
Institut Pasteur de Nouméa, Nouvelle-Calédonie
Université du Kentucky, Etats-Unis
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
Dr S. DOBSON
Direction de la Santé, Tahiti
Université du Kentucky, Etats-Unis
Laboratoire de recherche en virologie médicale
I. SCHUFFENECKER
H. ZELLER
CNR, Lyon, France
X. DE LAMBALLERIE Unité des virus émergents, UMR 190 IRD-Université Aix-Marseille II
D. CHAMPAGNE University of Georgia, Etats-Unis
M. GRANDADAM
Institut de Médecine Tropicale, Service de santé des Armées,
Marseille, France
A. IMRIE University of Hawaii at Manoa, Etats-Unis
F. DEVAUD LABM, Hôpital d’Uturoa, Raiatea
S. LONCKE Centre d’hygiène et de salubrité publique, Tahiti
J. LEININGER Cellule prévention santé, Raiatea
Transition alimentaire et sanitaire en Polynésie française
Pr E. DEWAILLY
Unité de recherche en santé publique, Université de Laval, Québec,
Canada
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
Pr E. DEWAILLY
L. CHATEAU-DEGAT
D. LAURENT
S. PAUILLAC
Dr N. CERF
MY. BOTTEIN-DECHRAOUI
W. LITAKER
P. TESTER
Unité de recherche en santé publique, Université de Laval, Québec,
Canada
Institut de recherche pour le développement de Nouvelle-Calédonie -
Laboratoire de pharmacochimie des substances naturelles et
pharmacophores Redox UMR152 IRD/Université Paul Sabatier
Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie - Laboratoire des biotoxines,
Nouméa
Direction de la santé, Bureau des maladies infectieuses, Département des
programmes de prévention, Tahiti
National oceanic and atmospheric agency (NOAA) - Center for coastal
environmental health & biomolecular research
National oceanic and atmospheric agency (NOAA) - Center for coastal
fisheries & habitat research
M. FAUST Smithonian Institution - Département de botanique
L. VILLIERS
C. MUSA
Commandement supérieur des forces armées en Polynésie française
(COMSUP), Papeete
Direction pour le suivi des centres d'expérimentations nucléaires (DSCEN) -
F. BOISSON Agence internationale de l'énergie atomique (IAEA) - Radioecology section
Rapport annuel 2007 84

Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
Pr C. MENUT
Pr E. DESLANDES
Dr U. BERNIER
Laboratoire de glycochimie de l’Institut biomoléculaire Max Mousseron
IBMM de l’Université de Montpellier II, France
Laboratoire d’Ecophysiologie et de Biotechnologie des Halophytes et des
Algues Marines (LEBHAM) de l’Université de Bretagne occidentale (UBO),
directeur de la plateforme BIODIMAR (Brest-UBO), France.
Unité de recherche sur les mouches et moustiques du Département de
l’Agriculture des Etats-Unis ARS-CMAVE, Gainesville, Floride, Etats-Unis
Rapport annuel 2007 85

La formation professionnelle
Service financier
F. HERMIER : Les statistiques : un outil de gestion et d’aide à la décision, Demos (Paris, France). 17 au
19 octobre 2007.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
J. RUIZ SUQUILBIDE : Formation dans le Service d’anatomie pathologique de l’hôpital Louis Mourier.
(Colombes, France). 30 avril au 5 mai et 1 er juin 2007.
F. BEAU : méthodologies d’investigations des maladies transmissibles. Université Claude Bernard (Lyon,
France). 11 au 15 juin 2007.
V. MARIA : Bioformation Mycobactéries et actinomycètes aérobies, Faculté de médecine et de pharmacie
(Lyon, France). 16 au 19 octobre 2007.
S. LASTERE : Formation au Centre national de référence Grippe Sud. (Lyon, France). 15 au 17 octobre
2007.
C. COUDERT : Prélèvements génitaux et infections materno-fœtales, Biomérieux (Lyon, France). 24 au
26 octobre 2007.
F. BEAU : Formation MLVA (biologie moléculaire), Val de Grâce (Paris, France). 3 au 5 décembre 2007.
Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments
P. BRANAA : Evaluation de la mise en place du contrôle microbiologique des DASRI, aspects techniques,
Laboratoire des Pyrénées (Lagor, France). 4 au 6 juin 2007.
T. SUCHARD : Validation des méthodes de laboratoire : répondre aux besoins du client. Cap Afnor (Saint-
Denis, France). 5 au 7 décembre 2007.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
M. CHEONG SANG : Formation accélérée en entomologie médicale dans le cadre du programme NIH
(Raiatea). 4 au 16 juin 2007.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
T. DARIUS : Formation Personne compétente en radioprotection, CEA (Gif-sur-Yvette, France). 24 au
27 avril 2007.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
I. LECHAT : Chromatographie en phase gazeuse, problèmes et anomalies, Varian (Les Ulis, France). 24 au
27 avril 2007.
Rapport annuel 2007 86

Les congrès et séminaires
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
S. LASTERE : 20èmes Rencontres européennes sur la grippe et sa prévention organisées par le GEIC
(Groupe d’étude et d’information sur la grippe) (Paris, France). 25 et 26 septembre 2007.
S. LASTERE : Congrès PROGIN2007 : Infections à Papillomavirus – Nouvelles stratégies de prévention du
cancer du col utérin (Monaco). 5 et 6 octobre 2007.
C. COUDERT : Journées internationales de biologie. (Paris, France). 6 au 9 novembre 2007.
Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments
P. BRANAA : Congrès de la Société française de microbiologie (SFM) (Nantes, France). 30 mai au 1 er juin
2007.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
N.L. NGUYEN : Atelier de travail sur le maintien des services de lutte contre la lèpre dans les pays
insulaires du Pacifique, organisé par l’OMS. (Nandi, Fidji). 23 au 28 avril 2007.
Direction de la recherche
R. TEYSSOU : Second Denframe General Meeting – Consortium pour l’étude de la dengue, Institut
Pasteur. (Paris, France). 8 au 10 mars 2007. Participation aux présentations de rendu de résultats des
projets initiés dans le cadre du Consortium.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
A-M. LEGRAND, C. PLICHART : IInd Séminaire en Entomologie médicale de Polynésie, ILM-Université du
Kentucky. (ILM, Tahiti). 19 au 23 février 2007.
A-M. LEGRAND, C. PLICHART: Meeting to finalise the « LF diagnostics multi-center trial protocol », LF
Support Center (Atlanta, USA). 24 au 26 avril 2007.
C. GATTI : 15 èmes Rencontres en Toxinologie de la Société française d’étude des toxins : Toxines
émergentes – Nouveaux risques. (Paris, France). 13 et 14 décembre 2007.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
H. BOSSIN, J. MARIE : IInd Séminaire en Entomologie médicale de Polynésie, ILM-Université du Kentucky.
(ILM, Tahiti). 19 au 23 février 2007.
H. BOSSIN : Congrès annuel de l’Association américaine de lutte antivectorielle (AMCA) (Orlando,
Floride, Etats-Unis). 1 er 5avril 2007.
H. BOSSIN : Conférence annuelle de l’Association européenne de lutte antivectorielle (EMCA) (Prague,
République tchèque). 11-14 septembre 2007.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
M. LORMEAU : Second Denframe General Meeting – Consortium pour l’étude de la dengue, Institut
Pasteur. (Paris, France). 8 au 10 mars 2007. Participation aux présentations de rendu de résultats des
projets initiés dans le cadre du Consortium.
M. LORMEAU, C. ROCHE : 56th Annual meeting of American society of tropical medicine and hygiene
(Philadelphie, USA). 4 au 8 novembre 2007.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
I. LECHAT : XII ManaPro. (Queenstown, Nouvelle-Zélande). 4 au 9 février 2007.
Rapport annuel 2007 87

Communications orales ou posters
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
H. BOSSIN : Conférence annuelle de l’Association américaine de lutte anti-vectorielle (AMCA), (Orlando,
USA). Présentation du projet NIH, en partenariat avec le Pr Dobson (Université du Kentucky). 1 er au
5 avril 2007.
H. BOSSIN : 4 ème Conférence de l’Association européenne de lutte anti-vectorielle (EMCA). Présentation
du projet NIH. 11 au 14 septembre 2007.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
C. PLICHART : « Laboratory tools available to survey lymphatic filariasis prevalence in French
Polynesia ». IInd séminaire en Entomologie médicale de Polynésie (ILM, Tahiti). 19 février 2007.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
VM CAO-LORMEAU, C. ROCHE, E. DESCLOUX, J. VIALLON, S. LASTÈRE, A. WIEGANDT, R. TEYSSOU :
LOST in French Polynesia : Which strategies for a dengue virus to spread ? Communication affichée au
56 th Annual Meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene (Philadelphie, Etats-Unis).
4-8 novembre 2007.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
HT DARIUS : Application of the receptor-binding assay to ciguatera risk assessment: monitoring of
toxigenic phytoplankton, fish and marine invertebrates in various toxic localities in French Polynesia.
Communication présentée par F. BOISSON, 1 st Research Coordination Meeting of the CRP : Applications
of Radiotracer and Radioassay Technologies to Seafood Safety Assessment, IAEA Marine Environment
Laboratories (Monaco). 20-23 November 2007
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
F. ADAM, I. VAHIRUA-LECHAT, Y. MITERMITE, E. DESLANDES, JM. BESSIERE, C. MENUT : Etude chimique
de l’huile essentielle d’Ocimum basilicum L. de l’île de Tahiti (Polynésie française). Communication
affichée au 9 ème Symposium International Aromathérapie et Plantes Médicinales (Grasse, France). 16-
18 mars 2007.
F. ADAM, I. VAHIRUA-LECHAT, Y. MITERMITE, E. DESLANDES, JM. BESSIERE, C. MENUT : Chemical
composition of essential oils of Ocimum basilicum from Tahiti Island (French Polynesia). Communication
affichée au 4 ème Colloque International COSM’ING 2007 (Ingrédients cosmétiques et biotechnologies)
(Saint-Malo, France). 27-29 juin 2007.
E. SNOGAN, I. VAHIRUA-LECHAT, R. HO, G. BERTHO, JP. GIRAULT, S. ORTIGA, A. MARIA and R. LAFONT :
Ecdysteroids from the medicinal fern Microsorum scolopendria (Burm. f.). Communication affichée au
12 th ACC (Asian Chemical Congress) et NPMC 2007 (International Symposium on Natural Products and
Medicinal Chemistry) (Kuala Lumpur, Malaisie ). 23-35 août 2007.
I. VAHIRUA-LECHAT, Y. MITERMITE, C. MENUT : Chemical composition of essential oil of leaves of
Eucalyptus citriodora L. from Tahiti Island (French Polynesia). Communication affichée au 38 th
International Symposium on Essential Oils (Graz, Autriche). 9-12 septembre 2007.
F. ADAM, I. VAHIRUA-LECHAT, Y. MITERMITE, E. DESLANDES, C. MENUT : Chemical composition of
essential oils of leaves of Psidium cattleyanum Sabine and Psidium guajava L. from Tahiti Island (French
Polynesia). Communication affichée au 38 th International Symposium on Essential Oils (Graz, Autriche).
9-12 septembre 2007.
E. DESLANDES, F. ADAM, M. LEMOINE, MS. FABRE, Z. MAYALEN, E. PLOUGERNE, I. VAHIRUA-LECHAT,
C. BERTHOU, C. PAYRI : Phytochemical analysis and potent antioxydant, cytotoxic and pro-apoptotic
activities from the tropical marine brown alga Chnoospora minima (Hering) papenfuss from the French
Polynesia islands, South Pacific. Communication affichée au V e European Congress on Marine Natural
Produtcs (Ischia Island, Italie). 16-21 septembre 2007.
Rapport annuel 2007 88

Les publications
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
COUDERT C., BEAU F., BERLIOZ-ARTHAUD, A., MELIX G., DEVAUD F., BOYEAU E., JAOMEAU C.,
LABLEE P., JARNO P. (2007) La leptospirose humaine en Polynésie française : aspects épidémiologiques,
cliniques et bactériologiques. Med Trop : 67 pp.137-144.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
NGUYEN NL., PLICHART C., MARIE J., LEGRAND AM. (2007) La filariose lymphatique en Polynésie
française, situation actuelle vue au travers de trois sites sentinelles. Bulletin d’Informations Sanitaires
et Epidémiologiques : pp.4-5.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
ROCHE C., CASSAR O., LAILLE M., MURGUE B. (2007) Dengue-3 virus genomic differences that correlate
with in vitro phenotype on a human cell line but not with disease severity. Microbes and infection : 9
pp.63-69.
ROCHE C., CHARREL RN., MURGUE B., de LAMBALLERIE X., CAO-LORMEAU VM. Sustained transmission of
dengue virus type 3 (genotype I) in South Pacific islands led to the emergence of a specific topotype.
(soumis Emerging Infectious Diseases).
CAO-LORMEAU VM., ROCHE C., TEYSSOU R. (2007) Standardisation d’outils moléculaires pour la
surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en Polynésie française.
Bulletin d’Informations Sanitaires et Epidémiologiques : 6 pp.5-6.
WIEGANDT A., TEYSSOU R. (2007) Les maladies liées aux insectes : la dengue. In : La santé et
l’environnement, Direction de la santé, pp.5-6.
WIEGANT A., RENOU L., LOUETTE R., MELIX G., HIRSHAUER C., LASTERE S., ROCHE C. (2007) Dengue
fever epidemiology and related control strategies in French Polynesia 2006-2007. Inform’Action : Sept,
27 pp.7-15 – http://www.spc.int/phs/ENGLISH/Publications/InformACTION/IA27/Denguefever-
FrenchPolynesia-2006-2007.pdf
Laboratoire de recherche en entomologie
LONCKE S., MARIE J. (2007) Les maladies liées aux insectes : les programmes de prévention et de lutte
antivectorielle In : La santé et l’environnement, Direction de la santé, pp.7-9.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
WIEGANDT A., LEGRAND A.M., NGUYEN N.L. (2007) Les maladies liées aux insectes : la filariose. In : La
santé et l’environnement, Direction de la santé, pp.6-7.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
DARIUS T., PONTON D., REVEL T., CRUCHET P., UNG A., TCHOU FOUC M., CHINAIN M. (2007)
Ciguatera risk assessment in two toxic sites of French Polynesia using the receptor-binding assay.
Toxicon : 50 (5) pp.612-26.
CHATEAU-DEGAT M-L., DEWAILLY E., CERF N., NGUYEN NL., HUIN-BLONDEY M-O., HUBERT B.,
LAUDON F., CHANSIN R. (2007) Temporal trends and epidemiological aspects of ciguatera in French
Polynesia : a 10-year analysis. Trop Med Int Health : 12 (4) pp.485-92.
CHATEAU-DEGAT M-L., HUIN-BLONDEY M-O., CHINAIN M., DARIUS T., LEGRAND A-M., NGUYEN NL.,
LAUDON F., CHANSIN R., DEWAILLY E. (2007) Prevalence of chronic symptoms of ciguatera disease in
French Polynesian adults. Amer J Trop Med Hyg. In Press.
CHATEAU-DEGAT M-L., BEUTER A., VAUTERIN G., NGUYEN NL., CHINAIN M., DARIUS T., LEGRAND A-M.,
CHANSIN R., DEWAILLY E.( 2007) Neurologic signs of ciguatera disease : evidence of their persistence.
Amer J Trop Med Hyg. Soumis.
CHINAIN M. (2007) Les maladies liées aux toxines marines. In : La santé et l’environnement, Direction de
la santé, pp.9-10.
Rapport annuel 2007 89

Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
SNOGAN E., LECHAT-VAHIRUA I., HO R., BERTHO G., GIRAULT J-P., ORTIGA S., MARIA A., LAFONT R.
(2007) Ecdysteroids from the medicinal fern Microsorum scolopendria (Burm.f.). Phytochem Analysis : 18
pp.441-50.
F. ADAM, I. VAHIRUA-LECHAT, E. DESLANDES, J.M. BESSIERE, C. MENUT. Aromatic plants of French
Polynesia. III. Constituents of the essential oil of leaves of Ocimum basilicum L. Accepté en septembre
2007 pour publication dans Journal of Essential Oil Research.
Rapport annuel 2007 90

Les missions
Direction générale
R. TAPUTUARAI : Mission à Nuku Hiva dans le cadre du Programme de lutte biologique contre le Miconia.
13 au 15 mars 2007.
R. TAPUTUARAI : Mission à Nuku Hiva dans le cadre du Programme de lutte biologique contre le Miconia.
27 au 29 juin 2007.
R. TAPUTUARAI : Mission à Nuku Hiva dans le cadre du Programme de lutte biologique contre le Miconia.
10 au 13 juillet 2007.
R. TAPUTUARAI : Evaluation de l’invasion du Miconia à Fatu Hiva. 13 au 24 août 2007.
R. TAPUTUARAI : Suivi de l’impact de la dissémination du champignon pathogène dans le cadre du
Programme de lutte biologique contre le Miconia à Nuku Hiva. 26 au 28 septembre 2007.
Service informatique/Service financier
F. LEMASSON, M. LAUSAN, G. VIDAL : Visite auprès d’éditeurs informatiques pour le remplacement du
logiciel Galaxie : AGFA (Lyon et Paris), WESTCOM (Larmor Plage), BIOSYSTEM (Massy), INLOG (Lyon),
MIPS (Paris et Lyon) et visite à JVS-ADIX (Metz) pour le logiciel ADIX. 3 au 7 et 10 au 12 décembre 2007.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale/Service financier
S. LASTERE, N. GUITARD, M-F. BOURGEOIS : Diffusion du Guide des analyses de biologie médicale 2007 à
Maupiti, Bora Bora, Huahine, Tahaa, Raiatea. 30 janvier au 03 février 2007.
C. COUDERT, G. TERIA, K. ZISOU : Diffusion du Guide des analyses de biologie médicale 2007 à Nuku
Hiva. 22 au 23 février 2007.
C. COUDERT, P. MAUCOTEL, F. HERMIER : Diffusion du Guide des analyses de biologie médicale 2007 à
Rikitea. 6 au 9 mars 2007.
M-L. LIAO, V. MARIA, M. LAUSAN : Diffusion du Guide des analyses de biologie médicale 2007 à Hiva Oa
et Ua Pou. 27 février au 1 er mars 2007.
M-F. BOURGEOIS, S. LASTERE, T. ROTILLON : Diffusion du Guide des analyses de biologie médicale 2007 à
Rangiroa. 1 er au 05 mars 2007.
S. LASTERE, G. TERIA : Diffusion du Guide des analyses de biologie médicale 2007 à Rurutu et Tubuai. 19
au 21 mars 2007.
S. LASTERE : Rendez-vous avec le Dr LE GOFF du laboratoire de virologie de l’Hôpital Saint-Louis sur les
viroses respiratoires. (Paris, France). 6 septembre 2007.
S. LASTERE : Rendez-vous avec le Dr GORDIEN du laboratoire de bactériologie et virologie de l’Hôpital
Avicenne sur l’hépatite B (Bobigny, France). 6 septembre 2007.
C. COUDERT : Rencontre avec le Dr Ph. THULLIEZ, Institut de puériculture et de périnatalogie (Paris,
France). 23 novembre 2007.
F. BEAU : Visite auprès d’éditeurs informatiques pour le remplacement du logiciel Galaxie : MIPS et
AGFA (Paris). 6 et 7 décembre 2007.
Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments
P. BRANAA : Mission d’évaluation des laboratoires des services vétérinaires, agroalimentaires et
phytosanitaires de Nouvelle-Calédonie. Port Daguerre (Nouvelle-Calédonie). 12 au 19 mai 2007.
P. BRANAA : Audit Hygiène. Bora Bora. 8 au 9 novembre 2007.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
N.L. NGUYEN : Préparation du projet d’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea.
16 août 2007.
N.L. NGUYEN : Préparation du projet d’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea.
5 septembre 2007.
N.L. NGUYEN : Réunion d’information sur l’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea.
2 au 3 octobre 2007.
Rapport annuel 2007 91

N.L. NGUYEN : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 7 octobre 2007.
N.L. NGUYEN : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 14 au 17 octobre 2007.
N.L. NGUYEN : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 23 au 24 octobre 2007.
N.L. NGUYEN : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 29 au 31 octobre 2007.
N.L. NGUYEN : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 5 au 7 novembre 2007.
N.L. NGUYEN : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 12 au 14 novembre 2007.
S. TEURURAI : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 14 au 16 novembre 2007.
Centre de distribution biomédicale
A. BESSOU : Visite des fournisseurs (Biorad, Stallergènes, Sanofi Pasteur à Paris et Lyon, France).
Rencontre avec les nouveaux responsables de zone et les interlocuteurs des services de commande et de
facturation, règlement des litiges, négociation des tarifs et remises consenties à l’ILM, information sur
les nouveaux produits. 3, 4, 5 et 12 décembre 2007.
Direction de la Recherche
E. SUHAS : Mission de prospection à Tubuai et Raivavae dans le cadre du Programme de transition
alimentaire en Polynésie française. 15 au 18 avril 2007.
R. TEYSSOU : Evaluation du risque ciguatérique dans le lagon de Raivavae. 23 au 25 avril 2007.
R. TEYSSOU : Information, communication et mise en route du Programme Wolbachia à Raiatea. 2 mai
2007.
R. TEYSSOU : Mission à Raiatea dans le cadre du Programme Wolbachia. 26 au 27 juillet 2007.
R. TEYSSOU : Préparation du projet d’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 16
août 2007.
E. SUHAS, M. PIEHI, B. TAUPUA : Mission à Tubuai dans le cadre du Programme de transition alimentaire
en Polynésie française. 7 au 23 septembre 2007.
B. TAUPUA : Mission à Tubuai dans le cadre du Programme de transition alimentaire en Polynésie
française. 26 septembre au 3 octobre 2007.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
H. BOSSIN, J. MARIE, M. FAARUIA : Evaluation de la faune culicidienne sur trois motu de Raiatea. 19 au
24 mars 2007.
H. BOSSIN : Visite scientifique et technique au laboratoire du Pr DOBSON, Université du Kentucky
(Lexington, USA), dans le cadre du projet NIH. 16 au 20 avril 2007.
H. BOSSIN, M. MARIE, M. FAARUIA, A. TETUANUI : Information, communication et mise en route du
Programme NIH à Raiatea. 2 au 10 mai 2007.
J. MARIE, M. FAARUIA, H. BOSSIN, M. GERMAIN : Cartographie des gîtes et évaluation des moustiques
vecteurs (Culicidae) et des insectes nuisibles pour le tourisme (Ceratopogonidae) sur les motu de
Tetiaroa. 13 au 18 mai 2007.
J. MARIE, H. BOSSIN : Poursuite de la surveillance culicidienne dans le cadre du programme NIH, à
Raiatea. Communication avec le propriétaire du motu Tiano. Installation de la station météorologique.
23 au 27 juillet 2007.
H. BOSSIN, A. TETUANUI : Préparation du projet d’étude multicentrique de surveillance de la filariose à
Moorea. 16 août 2007.
H. BOSSIN : Visite scientifique auprès du Pr B. DICKSON, Institut de pathologie moléculaire (Vienne,
Autriche). Génétique et mécanismes neuronaux impliqués dans le comportement sexuel des insectes ;
Faisabilité d’un test sur le terrain d’une stratégie simple, spécifique et efficace de stérilisation des
moustiques femelles à l’aide d’un inhibiteur du sex peptide. 17 septembre 2007.
H. BOSSIN : Visite scientifique de l’Agence internationale de l’énergie atomique (AIEA), Unité
d’entomologie. Evaluation de cages AIEA d’élevage de masse semi-automatisées sur Tahiti ; Coordination
avec l’étude de faisabilité visant à l’élimination d’une population d’Anopheles arabiensis ; Discussion au
sujet de la participation du LEM au prochain projet AIEA de recherche en coordination sur la bio-écologie
des moustiques vecteurs de maladies (2007-2011). (Vienne, Autriche). 18 septembre 2007.
H. BOSSIN : Visite de la mission permanente française auprès de l’AIEA. Entretien des relations
diplomatiques ; Identification des opportunités de soutien par le Ministère des Affaires étrangères
d’activités futures de formation en entomologie médicale dispensées par l’ILM auprès des pays du
Pacifique Sud. (Vienne, Autriche). 19 septembre 2007.
Rapport annuel 2007 92

H. BOSSIN : Visite scientifique et technique sur invitation du Pr BELLINI, Department Entomologia Medica
Veterinaria, Centro Agricultura Ambiente (Bologne, Italie). Participation à un mini workshop sur les
techniques durables de lutte anti-vectorielle ; Visite de l’infrastructure d’élevage de masse de
moustiques Aedes albopictus ; Soutien pour le transfert de la technologie d’élevage de masse à Tahiti ;
Comparaison de la méthodologie et des protocoles d’élevage de moustiques de type Aedes ;
Méthodologie pour le suivi et le maintien de la qualité des moustiques produits ; Méthodologie pour
l’évaluation de la compétitivité des mâles en conditions semi naturelles ; Modalités d’étude de la
capacité de dispersion et de la longévité de mâles stérilisés par rapport aux mâles sauvages. 24 au
28 septembre 2007.
A. TETUANUI : Réunion d’information sur l’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea.
20 au 21 septembre 2007.
A. TETUANUI : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 29 au 31 octobre 2007.
A. TETUANUI, J. MARIE : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 5 au 9 novembre
2007.
H. BOSSIN, A. TETUANUI : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 12 au
16 novembre 2007.
H. BOSSIN, M. FAARUIA : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 14 au 20 octobre
2007.
M. FAARUIA, J. MARIE : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea. 22 au 26 octobre
2007.
J. MARIE : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea 29 au 31 octobre 2007.
J. MARIE, M. FAARUIA, H. BOSSIN, A. TETUANUI : Etude multicentrique de surveillance de la filariose à
Moorea. 2 au 7 décembre 2007.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
A-M. LEGRAND : Préparation du projet d’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea.
16 août 2007.
C. PLICHART, C. GATTI : Préparation du projet d’étude multicentrique de surveillance de la filariose à
Moorea. 5 septembre 2007.
C. PLICHART : Réunion d’information sur l’étude multicentrique de surveillance de la filariose à Moorea.
20 septembre 2007.
C. PLICHART : Evaluation des outils de surveillance de la filariose (étude multicentrique Tasl Force) à
Moorea. 14 octobre au 16 novembre 2007.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
J. VIALLON : Mission à Tubuai dans le cadre du Programme de transition alimentaire en Polynésie
française. 7 au 23 septembre 2007.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
M. CHINAIN, A. UNG, M. TCHOU FOUC : Evaluation du risque ciguatérique dans le lagon de Raivavae. 18
au 25 avril 2007.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
I. LECHAT : Collectes de plantes sur l’île de Tahiti. Mars à juillet 2007.
I. LECHAT : Visite du Pr PARIS et du Dr JOANNY MENVIELLE-BOURG (Paris, France). 30 avril 2007.
I. LECHAT : Visite du LEBHAM de l’Université de Bretagne occidentale (France). 2 mai 2007.
I. LECHAT : Collecte de plantes à Moorea. 25, 27 juillet 2007.
I. LECHAT : Collecte de plantes à Moorea. 1 er , 6, 8, 10, 16 août 2007.
I. LECHAT : Mission à Moorea dans le cadre du Programme de recherche dans la biodiversité de la
Polynésie française de nouvelles substances naturelles insecticides. 16 août 2007.
I. LECHAT, Y. MITERMITE : Collecte de plantes. Octobre à décembre 2007.
Rapport annuel 2007 93

Les activités d’enseignement/Stage/CVD
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
H. BOSSIN : Formation à la génomique fonctionnelle et à la protéomique des insectes vecteurs de
maladies, organisée par l’OMS, Université de Antoquia (Medellin, Colombie). 18 au 30 juin 2007.
J. MARIE : Intervention sur le thème des insectes nuisibles en zone tropicale (entomologie générale et
médicale), dans le cadre de la licence professionnelle « Conseiller agricole en milieu insulaire »,
Université de Polynésie française.
J. MARIE : Intervention lors du stage de formation à l’entomologie médicale des agents du service
d’hygiène organisé aux îles Cook du 15 au 22 septembre 2007. Cette formation a été réalisée sous
l’égide du Secrétariat général de la communauté du Pacifique Sud (CPS), en partenariat avec l’Institut
Pasteur de Nouvelle-Calédonie et l’Institut Louis Malardé.
Accueil en stage de Limb HAPAIRAI, étudiant polynésien en Master II de l’Université de l’Utah (Etats-
Unis), du 31 mai au 22 août 2007. Ce stage s’est inscrit dans le cadre du programme NIH de recherche
mené en partenariat avec le laboratoire du Pr Stephen DOBSON de l’Université du Kentucky. Limb
HAPAIRAI a contribué :
- A la mise au point d'une procédure de séparation pratique et efficace d'un grand nombre de
nymphes mâles des nymphes femelles,
- Au développement de procédures de conditionnement pour le futur transport de moustiques mâles
adultes entre Tahiti et d'autres îles de l'archipel (ex. Raiatea).
Accueil en stage de Tuterarii PAOAAFAITE, étudiant tahitien de l’Université de Polynésie française,
major de la promotion de licence, du 29 mai au 24 août 2007. Ce stage s’est également inscrit dans le
cadre du programme NIH. Tuterarii PAOAAFAITE a contribué :
- à la validation des protocoles de capture de moustiques vecteurs (Aedes polynesiensis) et non
vecteurs (Culex) de la filariose, destinés à être utilisés dans la prochaine campagne d’évaluation de
tests diagnostiques (novembre 2007)
- à la comparaison des paramètres du cycle de vie des spécimens Aedes polynesiensis en laboratoire
et en conditions semi-naturelles (serres expérimentales).
Accueil en stage de Vaitea ATUAHIVA, étudiante tahitienne de l’Université de Montpellier, du 19 mars au
22 juin 2007. Au cours de son stage, Vaitea ATUHIVA a contribué à la réalisation de tests d'activité
insecticide de substances extraites de plantes de Polynésie française, dans le programme de recherche
mené en partenariat avec le LSN, visant à l'identification dans la biodiversité de Polynésie française de
nouvelles substances naturelles insecticides, répulsives ou attractives vis-à-vis des moustiques.
Accueil en stage de Sarina NORRIS, étudiante anglaise de la London School of Hygiene and Tropical
Medicine (LSHTM), du 21 juin au 21 août 2007. Au cours de son stage, Sarina NORRIS a contribué à la
réalisation de tests de compétence vectorielle et à l’amélioration d’une technique de repas sanguin sur
membrane artificielle.
Accueil en stage de Dania PAOFAI et Andrea BLELLY, étudiantes tahitiennes de la licence CAMI
promotion 2007, en décembre 2007. Toutes deux ont reçu une initiation à l’entomologie médicale. Leurs
activités se sont portées sur la familiarisation aux pratiques en entomologie médicale, la recherche
bibliographique, la présentation d’articles scientifiques et le développement d’un projet scientifique
dont la réalisation s’effectuera dans le cadre d’un stage qualifiant de 3 mois, prévu dans le courant de
l’année 2008. Au cours de leur stage, Mlles PAOFAI et BLELLY ont travaillé à l’élaboration d’un projet
d’évaluation d’une nouvelle technique d’élevage de moustiques en masse.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
Accueil en stage de Maite AUBRY, stagiaire en Contrat Volontaire au Développement jusqu’en septembre
2007 et Master 2 Recherche en Pathologie humaine, spécialité Maladies transmissibles et pathologies
tropicales, Faculté de médecine de Marseille, du 17 décembre 2007 au 30 juin 2008. Thème : Dynamique
des quasi-espèces de dengue : (i) in vivo dans le sang capillaire ; (2) in vitro sur lignées cellulaires de
mammifères et de moustique.
Accueil en stage de Elodie DESCLOUX, stagiaire Master 2 Recherche en Pathologie humaine, spécialité
Maladies transmissibles et pathologies tropicales, Faculté de médecine de Marseille, de janvier à juillet
2007. Thème : Etude de la variabilité génomique des virus de dengue 1 en PF de 2001 à 2006.
Accueil en stage d’observation de Lindsay CHU, stagiaire Licence 3, en juillet 2007.
Accueil de Vaea RICHARD, Docteur en Sciences biologiques et médicales, Université Bordeaux II,
stagiaire en Contrat Volontaire au Développement (3 décembre 2007 au 2 décembre 2008).
Rapport annuel 2007 94

Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
Accueil de Ralph PAWLOWIEZ, Etudiant titulaire d’un Master M2 en Sciences de la Vie et de la Santé,
mention Biochimie et Biotechnologie, spécialité Bio-ingénierie à finalité professionnelle, Université Paul
Sabatier de Toulouse, stagiaire en Contrat Volontaire au Développement pour un an à partir du 14 mai
2007.
Thèse de pharmacie : « Lutte anti-vectorielle contre la filariose de Bancroft en Polynésie française.
Données et expérimentations sur Wolbachia, bactérie endosymbiote ». Clément FROISSART, Université
Bordeaux 2 – Victor Ségalen, soutenue le 23 mars 2007.
Thèse de médecine : « La ciguatéra en Polynésie française, étude de 126 cas hospitalisés au centre
hospitalier de Papeete sur la période 1999–2005 », Erwan OEHLER, Université de Rennes 1, Faculté de
Médecine, soutenue le 30 mars 2007.
Thèse en sciences de la vie, option physiologie (2006-2008) : « Les neuropathies d’origine toxique en
Polynésie française. Caractérisation physiopathologique des principales intoxications par biotoxines
marines (ciguatéra et autres) », Clémence GATTI, Université de Polynésie française, Ecole Doctorale
Pluridisciplinaire Numérique « Milieux Insulaires Ultramarins » (EDPn MIUM), en cours.
Volet 1
Publication : « Severe seafood poisoning in French Polynesia : A retrospective analysis of 129 medical
files », Clémence GATTI, Erwan OEHLER, Anne-Marie LEGRAND, Toxicon 2008.
Volet 2
Mise en évidence de l’apparition d’une neuropathie périphérique dys-immune pouvant être à l’origine de
la chronicité ou de la résurgence ponctuelle de symptômes associés à un épisode d’intoxication par
biotoxines marines. Evaluation de l’implication du système immunitaire par dosages d’auto-anticorps
anti-gangliosides.
Présentation par affiche à l’occasion des Journées de Rencontre de la Société Française pour l’Etude des
Toxines, Paris, décembre 2007.
Publication « Intérêt de l’exploration des séquelles chroniques associées aux intoxications de type
ciguatéra » In : Toxines émergentes, nouveaux risques, Lavoisier pp 1-2.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
Accueil en stage Olivier LAURET, Etudiant en 4 ème année de Pharmacie, Faculté de pharmacie de Lyon,
18 juin au 14 août 2007. Thème : Etude du rôle des cyanobactéries marines dans les intoxications par
consommation de produits de la mer.
Accueil en stage de Eva AUFRAY, Etudiante en Master 1 de Biologie et Santé, Université de Montpellier 1,
du 4 juillet au 5 août. Thème : Initiation aux techniques de laboratoire.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
Accueil en stage de Pressilia LAROCHE, Master 1, Université de Perpignan, avril à juin 2007.
Fanny ADAM, doctorante de l’Université de Bretagne Occidentale, 2 ème année de doctorat.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
Participation à la surveillance des épreuves du baccalauréat (section Science et technique de
laboratoire) et fourniture de souches bactériologiques.
Fourniture de souches bactériologiques au lycée La Mennais.
Accueil et formation d’étudiants stagiaires aux techniques de laboratoire tout au long de l’année.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
Thèse de médecine : « Filariose lymphatique : évaluation de la stratégie par traitement de masse en
Polynésie française », Georges LE FAHLER. Université de Montpellier 1, UFR de Médecine, soutenue le
27 mars 2007.
Rapport annuel 2007 95

Manifestations
Fête de la science
Jérôme MARIE, chargé de recherche au LEM, membre du comité d’organisation de la Fête de la science, a
coordonné les activités sur l’île de Tahiti (Taravao et Papeete).
A cette occasion, l’Institut Louis Malardé a organisé une journée portes ouvertes le samedi 6 octobre 2007 et
participé au village de la science. Les thèmes proposés étaient les suivants :
LASEA : L’instrumentation au service du contrôle de la qualité de l’eau et des aliments ;
LABM : Les outils de diagnostic de la dengue ;
Anatomo-cyto-pathologie : La prise en charge du prélèvement en anatomie pathologique ;
LPM : De nouvelles techniques de détection de la filariose pour une lutte plus efficace ;
LVM : Virus investigation : du microscope optique aux outils moléculaires.
Rapport annuel 2007 96