2011-2012 - IRCM

Tambutet, étudiants au doctorat • Chantal Lefebvre,
technicienne • Gabrielle St-Pierre, Ali Kassim-Ahmed
stagiaires • Lucile Lafleur, secrétaire
Activités de recherche L’unité de recherche en chimie
bioorganique s’intéresse à la découverture de nouvelles
molécules à visées anti-tumorales et antivirales. Elle
s’intéresse particulièrement à la découverte de nouveaux
analogues de nucléosides et à la synthèse de produits
naturels bioactifs. Yvan Guindon et son équipe travaillent
également à l'élaboration de nouvelles méthodologies de
synthèse impliquant des substrats acycliques lors de
réactions radicalaires. Ces méthodologies sont ensuite
utilisées pour la préparation de molécules complexes
d'intérêt biologique. Enfin, une nouvelle voie de synthèse
d’analogues de nucléosides, à la fois versatile et
convergente, est également à l’étude. Les subventions de
recherche dont bénéficie cette équipe proviennent du
Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie
du Canada et du Terry Fox Research Institute.
Chromatine et expression du génome
sous la direction de François Robert, Ph. D., chercheurboursier
Senior « volet recherche fondamentale », Fonds
de recherche du Québec - Santé.
Membres de l’équipe 2011-2012 Celia Jeronimo,
Émelyne Dejeux, Anton Lebedev, stagiaires postdoctoraux
• Alain Bataille, Simon Drouin, étudiants au doctorat •
Loreleï Durand, étudiante à la maîtrise • Catherine Strifas,
Vijaya Madhoo, adjointes administratives
Activités de recherche Cette unité s’intéresse au rôle
que joue la chromatine dans la régulation de processus
nucléaires telle la transcription. La chromatine est le
substrat physiologique des protéines liant l’ADN. Elle joue
ainsi un rôle central dans la régulation d’activités
nucléaires comme la transcription, la réplication et la
réparation de l’ADN; des activités qui sont au cœur de
processus cellulaires importants telles la croissance et la
différenciation cellulaires. Par l’utilisation d’une technologie
développée par François Robert, cette équipe étudie les
interactions protéine-ADN in vivo à l’échelle génomique
chez la levure et chez les mammifères. Cette technologie
implique entre autres une utilisation non conventionnelle
des puces à ADN. Ces études permettent de mieux
comprendre par quels mécanismes la chromatine est
régulée et comment elle influence les fonctions cellulaires.
Les subventions de recherche dont bénéficie cette équipe
proviennent des Instituts de recherche en santé du
Canada et de l’Institut national du cancer du Canada.
Transcription génique et protéomique
sous la direction de Benoit Coulombe, Ph. D.
Membres de l’équipe 2011-2012 Christian Poitras,
analyste programmeur • Diane Forget, assistante de
recherche chevronnée • Annie Bouchard, Philippe Cloutier,
Céline Domecq, assistants de recherche • Joëlle Pérusse,
Justine Rousseau, stagiaires postdoctorales • Andrée-
Anne Lacombe, Mathieu Lavallée-Adam, étudiants au
doctorat • Dorothée Bégin, adjointe administrative
Activités de recherche Cette unité de recherche
s’intéresse au mécanisme et à la régulation de l’ARN
polymérase II (ARNPII), l’enzyme à sous-unités multiples
qui synthétise tous les ARN messagers et plusieurs petits
ARN nucléaires chez les eucaryotes. Son activité de
recherche actuelle vise deux points principaux.
Premièrement, les chercheurs utilisent la chromatographie
d’affinité couplée à la spectrométrie de masse pour
cartographier le réseau d’interactions protéine-protéine
pour l’ARNPII humaine. Cette approche les a menés à
découvrir de nouveaux facteurs qui régulent cette enzyme
à douze sous-unités. Plus particulièrement, certains de ces
facteurs, incluant un groupe de protéines n’ayant pas été
caractérisées auparavant et qu’ils ont appelées « RNA
Polymerase II-Associated Proteins (RPAPs) », se sont
avérés être des facteurs de régulation de la biogenèse de
l’ARN polymérase II (repliement, import nucléaire et
assemblage des sous-unités en enzyme active). De plus,
leurs résultats récents montrent que des défauts dans ce
réseau régulateur de la biogenèse de l’ARNPII sont
impliqués dans la pathophysiologie de certaines maladies
neuromusculaires et possiblement de maladies
métaboliques et de cancers. Deuxièmement, ils utilisent la
simulation moléculaire dynamique avec des structures
cristallographiques existantes de l’ARNPII pour construire
des modèles détaillés de l’élongation transcriptionnelle.
Ces modèles sont ensuite testés à la fois in vitro et in vivo
via la génération d’ARNPII mutantes et par l’utilisation de
celles-ci dans des essais permettant de monitorer
différents aspects de la réaction transcriptionnelle. Leurs
études permettent de décrire, avec une résolution
atomique, l’élongation transcriptionnelle par l’ARNPII et de
définir comment ce « moteur pas à pas moléculaire », qui
est aussi l’une des enzymes les plus volumineuses et
dynamiques qui soient, est régulé. Les subventions de
recherche dont bénéficie cette équipe proviennent du
Fonds de recherche du Québec - Santé, des Instituts de
recherche en santé du Canada, du Conseil de recherches
en sciences naturelles et en génie du Canada et de la
Fondation canadienne pour l’innovation.
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