Innovations agricoles au service du dÃ©veloppement durable

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Les deux amorces cpSSR ont relevé un polymorphisme intra-spécifique à l’analyse phylo-géographique. La diversité génétique moyenne de Nei pour toutes les populations, si on utilise le cpSSR, était de 0,212 (Tableau 1). La plus forte diversité génétique a été mise au jour chez les populations de Magadi et de Kajido, représentant respectivement les variétés de leiorhachis et de senegal. Ces deux populations sont généralement proches l’une de l’autre. Les populations de Daaba et de Kulamawe sont géographiquement proches l’une de l’autre et n’ont toutes deux montré aucune diversité identifiable. L’AMOVA a mis au jour d’importantes variations génétiques au sein et entre les populations pour les deux types de marqueurs (Tableau 2). Le marqueur ISSR a révélé une plus forte diversité génétique, tant au sein qu’entre les populations, tandis que le marqueur cpSSR a révélé une plus forte diversité entre les populations qu’au sein de celles-ci. La distance génétique la plus courte a été observée entre les populations de Ngarendare et de Daaba, toutes deux représentant la variété kerensis, tandis que les populations les plus distantes étaient celles de Kajiado et de Kulamawe, représentant respectivement les variétés senegal et leiorhachis (Tableau 3). L’analyse typologique basée sur l’UPGMA a regroupé les populations en deux régions : le Nord et le Sud (Fig. 2). Les populations de Ngarendare et de Daaba ont été regroupées selon une analyse en composante principale (ACP), confirmant les résultats obtenus par l’analyse par paires (Fig. 3). Tableau 1. Valeur génétique des sept populations de variété de A. senegal au regard des marqueurs d’ISSR et de cpSSR ISSR* cpSSR Population Variété N P % N A H Haplotype (énumération) H P Kibwezi kerensis 173 85,22 1,852 0,250 8 (6), 11 (1), 12 (1) 0,203 Ngarendare kerensis 172 84,73 1,847 0,255 4 (6), 5 (1), 7 (1) 0,219 Daaba kerensis 160 78,82 1,788 0,238 4 (8) 0,000 Magadi leiorhachis 149 73,40 1,734 0,218 6 (3), 7 (2), 9 (2), 0,469 10 (1) Kulamawe leiorhachis 133 65,52 1,655 0,218 3 (8) 0,000 Kajiado senegal 107 52,72 1,527 0,155 10 (4), 9 (3), 7 (1) 0,344 Ntumburi senegal 112 55,17 1,552 0,146 4 (4), 4 (4) 0,250 Mean 144 70,80 1,708 0,211 0,212 *N = Nombre de loci polymorphes ; % N = Pourcentage de loci polymorphes ; A = Nombre moyenne d’allèles ; H = Diversité génétique de Nei. P P Tableau 2 : AMOVA des sept populations de A. senegal au regard des marqueurs d’ISSR et de cpSSR Innovations agricoles au service du développement ISSR* cpSSR* Source de variation dl MS %V P dl MS %V P Entre régions 1 1162,033 16
Tableau 3. Matrice de population par paires de la distance génétique (D) non biaisée de Nei des sept populations de A. senegal au Kenya établie à l’aide des marqueurs d’ISSR Kulamawe Ngarendare Daaba Ntumburi Kibwezi Magadi Kajiado Kulamawe 0,000 Ngarendare 0,286 0,000 Daaba 0,261 0,030 0,000 Ntumburi 0,321 0,261 0,242 0,000 Kibwezi 0,357 0,204 0,181 0,319 0,000 Magadi 0,245 0,355 0,333 0,425 0,139 0,000 Kajiado 0,464 0,345 0,343 0,249 0,143 0,237 0,000 Figure 2. Dendrogramme UPGMA des populations de A. senegal Principales coordonnées Kulamawe Ngarendare Daaba Coord. 2 Ntumburi Kibwezi Magadi Kajiado Coord. 1 Figure 3. Analyse typologique des sept populations de A. senegal établie à l’aide de l’Analyse en composante principale Ngarendare Daaba Ntumburi Nord Kulamawe Magadi 0,15 0,10 0,05 0,00 Kibwezi Kajiado Sud Les femmes dans les concours scientifiques 35
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