Innovations agricoles au service du développement durable

Les deux amorces cpSSR ont relevé un polymorphisme intra-spécifique à l’analyse phylo-géographique. La diversité génétique
moyenne de Nei pour toutes les populations, si on utilise le cpSSR, était de 0,212 (Tableau 1). La plus forte diversité génétique a été
mise au jour chez les populations de Magadi et de Kajido, représentant respectivement les variétés de leiorhachis et de senegal.
Ces deux populations sont généralement proches l’une de l’autre. Les populations de Daaba et de Kulamawe sont
géographiquement proches l’une de l’autre et n’ont toutes deux montré aucune diversité identifiable.
L’AMOVA a mis au jour d’importantes variations génétiques au sein et entre les populations pour les deux types de marqueurs
(Tableau 2). Le marqueur ISSR a révélé une plus forte diversité génétique, tant au sein qu’entre les populations, tandis que le
marqueur cpSSR a révélé une plus forte diversité entre les populations qu’au sein de celles-ci. La distance génétique la plus courte
a été observée entre les populations de Ngarendare et de Daaba, toutes deux représentant la variété kerensis, tandis que les
populations les plus distantes étaient celles de Kajiado et de Kulamawe, représentant respectivement les variétés senegal et
leiorhachis (Tableau 3). L’analyse typologique basée sur l’UPGMA a regroupé les populations en deux régions : le Nord et le Sud
(Fig. 2). Les populations de Ngarendare et de Daaba ont été regroupées selon une analyse en composante principale (ACP),
confirmant les résultats obtenus par l’analyse par paires (Fig. 3).
Tableau 1. Valeur génétique des sept populations de variété de A. senegal au regard des marqueurs d’ISSR et de cpSSR
ISSR*
cpSSR
Population Variété N P
% N A H Haplotype (énumération) H
P
Kibwezi kerensis 173 85,22 1,852 0,250 8 (6), 11 (1), 12 (1) 0,203
Ngarendare kerensis 172 84,73 1,847 0,255 4 (6), 5 (1), 7 (1) 0,219
Daaba kerensis 160 78,82 1,788 0,238 4 (8) 0,000
Magadi leiorhachis 149 73,40 1,734 0,218 6 (3), 7 (2), 9 (2), 0,469
10 (1)
Kulamawe leiorhachis 133 65,52 1,655 0,218 3 (8) 0,000
Kajiado senegal 107 52,72 1,527 0,155 10 (4), 9 (3), 7 (1) 0,344
Ntumburi senegal 112 55,17 1,552 0,146 4 (4), 4 (4) 0,250
Mean 144 70,80 1,708 0,211 0,212
*N = Nombre de loci polymorphes ; % N = Pourcentage de loci polymorphes ; A = Nombre moyenne d’allèles ; H = Diversité génétique de Nei.
P
P
Tableau 2 : AMOVA des sept populations de A. senegal au regard des marqueurs d’ISSR et de cpSSR
Innovations agricoles au service du développement
ISSR*
cpSSR*
Source de variation dl MS %V P dl MS %V P
Entre régions 1 1162,033 16