swissherdbook bulletin 7-2011-1-f

ulletin swissherdbook I numéro 7/2011
Réunion d’Interbull 2011 en Norvège
Sélection génomique et critères de
fitness au centre d’intérêt
Madeleine Berweger, Qualitas SA
A la réunion d’Interbull 2011 à Stavanger
(27 et 28 août), la sélection
génomique était le thème dominant,
comme les deux années précédentes.
Ce « mot d’ordre » comporte
plusieurs questions méthodiques et
techniques ainsi que des discussions
politiques. Un autre accent fort a
été mis sur les critères de fitness.
Le grand intérêt pour ces présentations
souligne l’importance de la
recherche solide dans ce domaine –
et cela aussi, ou peut-être surtout, à
l’époque de la sélection génomique.
Dans de nombreux pays, comme en
Suisse, des valeurs d’élevage génomiques
sont estimées et publiées de
routine. Les premiers défauts de jeunesse
ont pu être éliminés – mais de
nombreuses questions sont toujours
ouvertes. Les divers types de puces
et leurs applications sont toujours
discutés. Dans ce contexte, l’imputing
(voir encadré) est une méthode
beaucoup discutée et analysée. Les
divers pays membres ainsi qu’Interbull
s’occupent avec intensité des
divers aspects de la sélection géno-
mique. L’accent y est mis sur les
contrôles de qualité des estimations
des valeurs d’élevage génomiques
(validation), le relevé de valeurs
d’élevage génomiques comparables
sur le plan international ainsi que
le rôle d’Interbull dans l’utilisation
internationale et l’échange des données
génomiques.
Robust milk
Le deuxième jour de la réunion d’Interbull
a été consacré à la santé et à
la fécondité des vaches laitières. Le
grand nombre et le large éventail
des présentations ainsi que le grand
intérêt de la part des auditeurs ont
souligné l’importance de ces caractères
dans le travail zootechnique de
nos jours. Et c’est particulièrement
en vue de l’application de la sélection
génomique qu’il faut accorder encore
plus d’importance aux critères de
fitness. Nombreux sont les caractères
(entre autres la fécondité) qui ont
une corrélation négative avec les critères
de performances. L’accélération
du progrès zootechnique au niveau
des critères de performances sans
la pondération correspondante peut
en revanche amener la détérioration
des critères de fitness. D’autre part,
la sélection génomique représente
aussi une chance. Cette méthode
peut notamment ouvrir de nouvelles
possibilités concernant les caractères
avec des héritabilités basses et des
relevés laborieux des données. n
Imputing
Cette notion résume des méthodes pour compléter des données manquantes.
En rapport avec la sélection génomique, on utilise ces méthodes
pour « extrapoler » les génotypes de typages 3k (3’000 SNP) à 50-k (~50’000
SNP) resp. de 50-k à « high density » (800’000 SNP). Cela veut dire que
l’on essaie, moyennant l’imputing, de déterminer l’état des SNP non typés.
Cette méthode ne donne pourtant satisfaction que si certains ancêtres ont
été typés moyennant la puce plus importante.
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