Laboratoire de recherche en virologie médicale - Institut Louis ...
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Le diagnostic virologique<br />
1- D<strong>en</strong>gue<br />
Après l’épidémie massive <strong>de</strong> 2001 et 4 années d’activité <strong>de</strong> faible int<strong>en</strong>sité relative, une<br />
augm<strong>en</strong>tation progressive et constante <strong>de</strong> l’activité <strong>de</strong> diagnostic et <strong>de</strong> surveillance <strong>de</strong> la<br />
<strong>de</strong>ngue a été observée au long <strong>de</strong> l’année 2006.<br />
Sans pour autant être classée <strong>en</strong> épidémie, <strong>de</strong>puis août 2006 la Polynésie française doit faire<br />
face à une très forte recru<strong>de</strong>sc<strong>en</strong>ce <strong>de</strong> la <strong>de</strong>ngue, la circulation du virus étant très<br />
certainem<strong>en</strong>t favorisée par la pullulation <strong>de</strong>s moustiques vecteurs et l’apport régulier <strong>de</strong><br />
pati<strong>en</strong>ts naïfs (naissances, arrivée <strong>de</strong> métropolitains). Cette augm<strong>en</strong>tation régulière a d’ailleurs<br />
conduit le classem<strong>en</strong>t <strong>de</strong> la Polynésie <strong>en</strong> phase d’alerte pré-épidémique fin septembre. Il est<br />
important <strong>de</strong> noter qu’une augm<strong>en</strong>tation s<strong>en</strong>sible du nombre <strong>de</strong> cas avait d’ailleurs été notée<br />
dès le mois <strong>de</strong> février 2006.<br />
Depuis l’embauche d’un nouveau technici<strong>en</strong> <strong>de</strong> laboratoire <strong>en</strong> septembre 2005, l’<strong>en</strong>semble du<br />
diagnostic et <strong>de</strong> la surveillance passive <strong>de</strong> la <strong>de</strong>ngue est du ressort du LABM. Ce recrutem<strong>en</strong>t,<br />
suivi <strong>de</strong> celui du 3 ème biologiste, a permis <strong>de</strong> d’adapter les conditions <strong>de</strong> traitem<strong>en</strong>t <strong>de</strong>s<br />
échantillons pour faire face notamm<strong>en</strong>t aux contraintes à la fois internes et externes à l’ILM.<br />
Ainsi, à partir <strong>de</strong> septembre 2006, les isolem<strong>en</strong>ts viraux ont été abandonnés et remplacés par la<br />
RT-PCR. En effet, la durée <strong>de</strong> r<strong>en</strong>du <strong>de</strong> résultat d’un isolem<strong>en</strong>t viral (7-10 jours) ne peut plus<br />
être considéré comme compatible avec une prise <strong>en</strong> charge efficace <strong>de</strong>s pati<strong>en</strong>ts. Surtout elle<br />
ne permet pas la réaction rapi<strong>de</strong> face à l’implantation év<strong>en</strong>tuelle d’un nouveau virus.<br />
De plus, à partir d'octobre 2006, <strong>de</strong>vant l’afflux <strong>de</strong> <strong>de</strong>man<strong>de</strong>s <strong>de</strong> confirmation, l’antigénémie<br />
NS1 D<strong>en</strong>gue (Biorad) a été mise <strong>en</strong> place et est désormais utilisée <strong>en</strong> première int<strong>en</strong>tion pour les<br />
prélèvem<strong>en</strong>ts précoces. En effet, divers <strong>de</strong> ses avantages font qu’elle peut remplacer la RT-PCR<br />
<strong>en</strong> pério<strong>de</strong> <strong>de</strong> forte activité (augm<strong>en</strong>tation globale <strong>de</strong> la productivité, r<strong>en</strong>du rapi<strong>de</strong> <strong>de</strong><br />
résultat,…).<br />
En revanche, le kit sous sa forme actuelle ne permet pas le typage du virus. Tout prélèvem<strong>en</strong>t<br />
positif <strong>en</strong> NS1 doit donc faire l’objet d’un typage par RT-PCR. La sérologie IgM reste le moy<strong>en</strong><br />
<strong>de</strong> diagnostic tardif, sachant que <strong>de</strong>s faux positifs ne sont pas rares avec le kit utilisé (Panbio).<br />
Ces réactivités correspon<strong>de</strong>nt, soit à <strong>de</strong>s persistances longues d’IgM spécifiques, soit à <strong>de</strong>s<br />
réactivations polyclonales à l’origine <strong>de</strong> réactions croisées.<br />
Ainsi, l’algorithme <strong>de</strong> diagnostic/surveillance est désormais le suivant :<br />
Cas suspect<br />
Jour <strong>de</strong> maladie<br />
J5<br />
NS1 NS1 & RT-PCR Sérologie IgM<br />
ou RT-PCR<br />
+/- IgM<br />
Typage<br />
par RT-PCR<br />
DENV-1, 2, 3, 4<br />
Typage<br />
par RT-PCR<br />
DENV-1, 2, 3, 4<br />
<strong>Institut</strong> <strong>Louis</strong> Malardé – Rapport annuel 2006 64