Laboratoire de recherche en virologie médicale - Institut Louis ...

Le diagnostic virologique
1- Dengue
Après l’épidémie massive de 2001 et 4 années d’activité de faible intensité relative, une
augmentation progressive et constante de l’activité de diagnostic et de surveillance de la
dengue a été observée au long de l’année 2006.
Sans pour autant être classée en épidémie, depuis août 2006 la Polynésie française doit faire
face à une très forte recrudescence de la dengue, la circulation du virus étant très
certainement favorisée par la pullulation des moustiques vecteurs et l’apport régulier de
patients naïfs (naissances, arrivée de métropolitains). Cette augmentation régulière a d’ailleurs
conduit le classement de la Polynésie en phase d’alerte pré-épidémique fin septembre. Il est
important de noter qu’une augmentation sensible du nombre de cas avait d’ailleurs été notée
dès le mois de février 2006.
Depuis l’embauche d’un nouveau technicien de laboratoire en septembre 2005, l’ensemble du
diagnostic et de la surveillance passive de la dengue est du ressort du LABM. Ce recrutement,
suivi de celui du 3 ème biologiste, a permis de d’adapter les conditions de traitement des
échantillons pour faire face notamment aux contraintes à la fois internes et externes à l’ILM.
Ainsi, à partir de septembre 2006, les isolements viraux ont été abandonnés et remplacés par la
RT-PCR. En effet, la durée de rendu de résultat d’un isolement viral (7-10 jours) ne peut plus
être considéré comme compatible avec une prise en charge efficace des patients. Surtout elle
ne permet pas la réaction rapide face à l’implantation éventuelle d’un nouveau virus.
De plus, à partir d'octobre 2006, devant l’afflux de demandes de confirmation, l’antigénémie
NS1 Dengue (Biorad) a été mise en place et est désormais utilisée en première intention pour les
prélèvements précoces. En effet, divers de ses avantages font qu’elle peut remplacer la RT-PCR
en période de forte activité (augmentation globale de la productivité, rendu rapide de
résultat,…).
En revanche, le kit sous sa forme actuelle ne permet pas le typage du virus. Tout prélèvement
positif en NS1 doit donc faire l’objet d’un typage par RT-PCR. La sérologie IgM reste le moyen
de diagnostic tardif, sachant que des faux positifs ne sont pas rares avec le kit utilisé (Panbio).
Ces réactivités correspondent, soit à des persistances longues d’IgM spécifiques, soit à des
réactivations polyclonales à l’origine de réactions croisées.
Ainsi, l’algorithme de diagnostic/surveillance est désormais le suivant :
Cas suspect
Jour de maladie
J5
NS1 NS1 & RT-PCR Sérologie IgM
ou RT-PCR
+/- IgM
Typage
par RT-PCR
DENV-1, 2, 3, 4
Typage
par RT-PCR
DENV-1, 2, 3, 4
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 64