Laboratoire de recherche en virologie mÃ©dicale - Institut Louis ...

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La plupart des cas provenant des ISLV ont été prélevés à l’hôpital de Raiatea. Les professionnels de santé se montrent sensibles au problème de la leptospirose particulièrement depuis l’étude 2004/2005 menée pour le ROSSP. Ceux des IDV proviennent en grande partie, pour les cas confirmés, du CHPf et pour les autres de Tahiti (Taravao, Côte Est) et de Moorea. Aucun cas n’est constaté aux Australe et Tuamotu Gambier. Evolution saisonnière des cas 2006 12 10 Nombre 8 6 4 cas confirmés cas probables Cas cumulés 2 0 janvier février mars avril mai juin juillet Mois aout septembre octobre novembre décembre La leptospirose se manifeste toute l’année avec une nette diminution de juin à octobre (saison sèche). Cas biologiques de leptospirose Evolution annuelle 60 50 Nombres de cas 40 30 20 10 0 2004 2005 2006 Années cas confirmés cas probables Cas cumulés • 33 cas confirmés (PCR positives et/ou séronversion IgM /ELISA Panbio). • 20 cas probables (Sérologie IgM isolée > 20 ua.) • 3 sérovars Leptospira icterohaemorrhagiae et 1 Leptospira canicola ont pu être identifiés (Microagglunitation de Martin et Pettit – Intsitut Pasteur de Paris). Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 63
Le diagnostic virologique 1- Dengue Après l’épidémie massive de 2001 et 4 années d’activité de faible intensité relative, une augmentation progressive et constante de l’activité de diagnostic et de surveillance de la dengue a été observée au long de l’année 2006. Sans pour autant être classée en épidémie, depuis août 2006 la Polynésie française doit faire face à une très forte recrudescence de la dengue, la circulation du virus étant très certainement favorisée par la pullulation des moustiques vecteurs et l’apport régulier de patients naïfs (naissances, arrivée de métropolitains). Cette augmentation régulière a d’ailleurs conduit le classement de la Polynésie en phase d’alerte pré-épidémique fin septembre. Il est important de noter qu’une augmentation sensible du nombre de cas avait d’ailleurs été notée dès le mois de février 2006. Depuis l’embauche d’un nouveau technicien de laboratoire en septembre 2005, l’ensemble du diagnostic et de la surveillance passive de la dengue est du ressort du LABM. Ce recrutement, suivi de celui du 3 ème biologiste, a permis de d’adapter les conditions de traitement des échantillons pour faire face notamment aux contraintes à la fois internes et externes à l’ILM. Ainsi, à partir de septembre 2006, les isolements viraux ont été abandonnés et remplacés par la RT-PCR. En effet, la durée de rendu de résultat d’un isolement viral (7-10 jours) ne peut plus être considéré comme compatible avec une prise en charge efficace des patients. Surtout elle ne permet pas la réaction rapide face à l’implantation éventuelle d’un nouveau virus. De plus, à partir d'octobre 2006, devant l’afflux de demandes de confirmation, l’antigénémie NS1 Dengue (Biorad) a été mise en place et est désormais utilisée en première intention pour les prélèvements précoces. En effet, divers de ses avantages font qu’elle peut remplacer la RT-PCR en période de forte activité (augmentation globale de la productivité, rendu rapide de résultat,…). En revanche, le kit sous sa forme actuelle ne permet pas le typage du virus. Tout prélèvement positif en NS1 doit donc faire l’objet d’un typage par RT-PCR. La sérologie IgM reste le moyen de diagnostic tardif, sachant que des faux positifs ne sont pas rares avec le kit utilisé (Panbio). Ces réactivités correspondent, soit à des persistances longues d’IgM spécifiques, soit à des réactivations polyclonales à l’origine de réactions croisées. Ainsi, l’algorithme de diagnostic/surveillance est désormais le suivant : Cas suspect Jour de maladie J5 NS1 NS1 & RT-PCR Sérologie IgM ou RT-PCR +/- IgM Typage par RT-PCR DENV-1, 2, 3, 4 Typage par RT-PCR DENV-1, 2, 3, 4 Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 64
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