Laboratoire de recherche en virologie médicale - Institut Louis ...

- Un changement de polarité dans la région du gène prM/M : la substitution
prM/M-I31T correspond à un acide aminé hydrophile (T) pour la souche PF64 et
à un acide aminé hydrophobe (I) sur les autres souches. Une substitution
semblable a été décrite par Leitmeyer et al (1999) entre les souches de
dengue 2 du génotype américain (faiblement virulent) et celles du génotype
asiatique (impliqué dans de nombreux cas de DH/DSC). Cette substitution révèle
un changement de polarité (plus hydrophile) ainsi qu’un changement dans la
prédiction antigénique pour le génotype américain. Cependant, la structure
antigénique de prM étant inconnue, le rôle de cette substitution reste
indéterminé.
- Un changement de charge sur le gène E : La substitution E-E62G (domaine II)
conduit à un gain de charge positive pour la souche PF64. Lee et al. (2004) ont
montré qu’un gain de charge positive au sein de la protéine E augmente
l’affinité des virus de l’Encéphalite Japonaise et West Nile pour les
glycosaminoglycanes (GAG) ce qui pourrait jouer un rôle dans l’atténuation de
la virulence de ces virus. De plus, Lee et al (2006), suggèrent une atténuation
de la virulence du virus de la dengue suite à une augmentation de l’affinité de
liaison pour les GAG, notamment dans le domaine II de l’enveloppe. La
substitution observée sur la souche PF64 pourrait avoir les mêmes
conséquences.
Des analyses phylogénétiques sur ces séquences de DEN-3 ont également montré que les
génotypes I, II et III à l’origine des cas de DH/DSC présentent plus d’homologies entre
eux (9% de divergence au maximum) qu’avec le génotype IV (plus de 11,4% de
divergence) qui n’a lui n’a jamais été impliqué dans des épidémies graves.
• Conclusions et perspectives
Cette étude préliminaire a permis d’identifier, parmi les 15 substitutions en acides
aminés observées, 2 substitutions potentiellement impliquées dans l’atténuation de la
virulence des souches de DEN-3. Cette analyse doit être poursuivie sur la totalité du
génome de la souche PF64 afin d’identifier la totalité des substitutions d’intérêt.
Par ailleurs, la détermination du rôle effectif des substitutions observées nécessiterait
des expériences de mutagenèse dirigée (suivies de tests in vitro et/ou de
neurovirulence sur souriceaux nouveaux-nés) et des tests de modélisation de la
structure des protéines virales.
L’étude des différences éventuelles dans les structures secondaires des extrémités 3’
non codantes doivent également être envisagées.
2- Axe 2 : Surveillance de la dengue et autres arboviroses
Surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en Polynésie française
(Programme en partie financé par le Ministère de l’Outre-Mer)
• Participants et collaborateurs
V.M. CAO-LORMEAU, C. ROCHE, M. AUBRY, J. VIALLON, R. TEYSSOU, J. MARIE (LEM),
S. LASTERE (LABM), S. LONCKE (CHSP), M. GRANDADAM (IMTSSA, Marseille)
• Objectif
Ce programme a pour objectif la standardisation d’outils de détection pour la
surveillance de la dengue et autres arboviroses en Polynésie française (PF) : RT-PCR en
temps réel (TR) pour la détection des quatre sérotypes de dengue sur sérum ou lot de
moustiques; RT-PCR universelles (Flavivirus, Alphavirus et Phlébovirus) et RT-PCR
spécifiques des virus présentant un risque pour la PF (ex. Chikungunya).
Parallèlement à la standardisation de ces outils, une étude de séroprévalence réalisée
sur des prélèvements venant de différents archipels de PF devrait contribuer à
l’identification d’arbovirus introduits de façon ponctuelle ou circulant à bas bruit,
susceptibles d’être à l’origine de l’émergence de nouvelles épidémies.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 35