Laboratoire de recherche en virologie médicale - Institut Louis ...
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- Un changem<strong>en</strong>t <strong>de</strong> polarité dans la région du gène prM/M : la substitution<br />
prM/M-I31T correspond à un aci<strong>de</strong> aminé hydrophile (T) pour la souche PF64 et<br />
à un aci<strong>de</strong> aminé hydrophobe (I) sur les autres souches. Une substitution<br />
semblable a été décrite par Leitmeyer et al (1999) <strong>en</strong>tre les souches <strong>de</strong><br />
<strong>de</strong>ngue 2 du génotype américain (faiblem<strong>en</strong>t virul<strong>en</strong>t) et celles du génotype<br />
asiatique (impliqué dans <strong>de</strong> nombreux cas <strong>de</strong> DH/DSC). Cette substitution révèle<br />
un changem<strong>en</strong>t <strong>de</strong> polarité (plus hydrophile) ainsi qu’un changem<strong>en</strong>t dans la<br />
prédiction antigénique pour le génotype américain. Cep<strong>en</strong>dant, la structure<br />
antigénique <strong>de</strong> prM étant inconnue, le rôle <strong>de</strong> cette substitution reste<br />
indéterminé.<br />
- Un changem<strong>en</strong>t <strong>de</strong> charge sur le gène E : La substitution E-E62G (domaine II)<br />
conduit à un gain <strong>de</strong> charge positive pour la souche PF64. Lee et al. (2004) ont<br />
montré qu’un gain <strong>de</strong> charge positive au sein <strong>de</strong> la protéine E augm<strong>en</strong>te<br />
l’affinité <strong>de</strong>s virus <strong>de</strong> l’Encéphalite Japonaise et West Nile pour les<br />
glycosaminoglycanes (GAG) ce qui pourrait jouer un rôle dans l’atténuation <strong>de</strong><br />
la virul<strong>en</strong>ce <strong>de</strong> ces virus. De plus, Lee et al (2006), suggèr<strong>en</strong>t une atténuation<br />
<strong>de</strong> la virul<strong>en</strong>ce du virus <strong>de</strong> la <strong>de</strong>ngue suite à une augm<strong>en</strong>tation <strong>de</strong> l’affinité <strong>de</strong><br />
liaison pour les GAG, notamm<strong>en</strong>t dans le domaine II <strong>de</strong> l’<strong>en</strong>veloppe. La<br />
substitution observée sur la souche PF64 pourrait avoir les mêmes<br />
conséqu<strong>en</strong>ces.<br />
Des analyses phylogénétiques sur ces séqu<strong>en</strong>ces <strong>de</strong> DEN-3 ont égalem<strong>en</strong>t montré que les<br />
génotypes I, II et III à l’origine <strong>de</strong>s cas <strong>de</strong> DH/DSC prés<strong>en</strong>t<strong>en</strong>t plus d’homologies <strong>en</strong>tre<br />
eux (9% <strong>de</strong> diverg<strong>en</strong>ce au maximum) qu’avec le génotype IV (plus <strong>de</strong> 11,4% <strong>de</strong><br />
diverg<strong>en</strong>ce) qui n’a lui n’a jamais été impliqué dans <strong>de</strong>s épidémies graves.<br />
• Conclusions et perspectives<br />
Cette étu<strong>de</strong> préliminaire a permis d’i<strong>de</strong>ntifier, parmi les 15 substitutions <strong>en</strong> aci<strong>de</strong>s<br />
aminés observées, 2 substitutions pot<strong>en</strong>tiellem<strong>en</strong>t impliquées dans l’atténuation <strong>de</strong> la<br />
virul<strong>en</strong>ce <strong>de</strong>s souches <strong>de</strong> DEN-3. Cette analyse doit être poursuivie sur la totalité du<br />
génome <strong>de</strong> la souche PF64 afin d’i<strong>de</strong>ntifier la totalité <strong>de</strong>s substitutions d’intérêt.<br />
Par ailleurs, la détermination du rôle effectif <strong>de</strong>s substitutions observées nécessiterait<br />
<strong>de</strong>s expéri<strong>en</strong>ces <strong>de</strong> mutag<strong>en</strong>èse dirigée (suivies <strong>de</strong> tests in vitro et/ou <strong>de</strong><br />
neurovirul<strong>en</strong>ce sur souriceaux nouveaux-nés) et <strong>de</strong>s tests <strong>de</strong> modélisation <strong>de</strong> la<br />
structure <strong>de</strong>s protéines virales.<br />
L’étu<strong>de</strong> <strong>de</strong>s différ<strong>en</strong>ces év<strong>en</strong>tuelles dans les structures secondaires <strong>de</strong>s extrémités 3’<br />
non codantes doiv<strong>en</strong>t égalem<strong>en</strong>t être <strong>en</strong>visagées.<br />
2- Axe 2 : Surveillance <strong>de</strong> la <strong>de</strong>ngue et autres arboviroses<br />
Surveillance <strong>en</strong>tomologique et biologique <strong>de</strong> la <strong>de</strong>ngue et autres arboviroses <strong>en</strong> Polynésie française<br />
(Programme <strong>en</strong> partie financé par le Ministère <strong>de</strong> l’Outre-Mer)<br />
• Participants et collaborateurs<br />
V.M. CAO-LORMEAU, C. ROCHE, M. AUBRY, J. VIALLON, R. TEYSSOU, J. MARIE (LEM),<br />
S. LASTERE (LABM), S. LONCKE (CHSP), M. GRANDADAM (IMTSSA, Marseille)<br />
• Objectif<br />
Ce programme a pour objectif la standardisation d’outils <strong>de</strong> détection pour la<br />
surveillance <strong>de</strong> la <strong>de</strong>ngue et autres arboviroses <strong>en</strong> Polynésie française (PF) : RT-PCR <strong>en</strong><br />
temps réel (TR) pour la détection <strong>de</strong>s quatre sérotypes <strong>de</strong> <strong>de</strong>ngue sur sérum ou lot <strong>de</strong><br />
moustiques; RT-PCR universelles (Flavivirus, Alphavirus et Phlébovirus) et RT-PCR<br />
spécifiques <strong>de</strong>s virus prés<strong>en</strong>tant un risque pour la PF (ex. Chikungunya).<br />
Parallèlem<strong>en</strong>t à la standardisation <strong>de</strong> ces outils, une étu<strong>de</strong> <strong>de</strong> séropréval<strong>en</strong>ce réalisée<br />
sur <strong>de</strong>s prélèvem<strong>en</strong>ts v<strong>en</strong>ant <strong>de</strong> différ<strong>en</strong>ts archipels <strong>de</strong> PF <strong>de</strong>vrait contribuer à<br />
l’i<strong>de</strong>ntification d’arbovirus introduits <strong>de</strong> façon ponctuelle ou circulant à bas bruit,<br />
susceptibles d’être à l’origine <strong>de</strong> l’émerg<strong>en</strong>ce <strong>de</strong> nouvelles épidémies.<br />
<strong>Institut</strong> <strong>Louis</strong> Malardé – Rapport annuel 2006 35