Laboratoire de recherche en virologie médicale - Institut Louis ...

Sommaire
Introduction ………………………………………………………………………………………………………………
Conseil d’administration………………………………………………………………………………………….
2
3
S o m m a i r e
Ressources de l’Institut……………………………………………………………………………………………
Direction générale…………………………………………………………………………………………………………
Ressources humaines…………………………………………………………………………………………………….
Service financier…………………………………………………………………………………………………………….
Bilan financier……………………………………………………………………………………………………………….
Service informatique………………………………………………………………………………………………………
Management de la qualité………………………………………………………………………………………………
Centre de documentation………………………………………………………………………………………………
Service technique………………………………………………………………………………………………………….
Activités de recherche…………………………………………………………………………………………….
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale……………………………………………………….
Laboratoire de recherche en virologie médicale………………………………………………………………
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques……………………………………………………
Laboratoire de recherche en entomologie médicale………………………………………………………..
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles…………………………………………………….
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique………………………………..
Activités de santé publique…………………………………………………………………………………….
Laboratoire d’analyses de biologie médicale……………………………………………………………………
Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments………………………………………..
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique………………………………..
Centre de distribution biomédicale…………………………………………………………………………………
Distinctions, prix……………………………………………………………………………………………………….
Formation professionnelle………………………………………………………………………………………
Missions………………………………………………………………………………………………………………………..
Congrès et séminaires……………………………………………………………………………………………….
Publications scientifiques………………………………………………………………………………………….
Communications orales ou posters………………………………………………………………………….
Stagiaires/Doctorants…………………………………………………………………………………………………
Activités d’enseignement – Conférences……………………………………………………………….
Collaborations…………………………………………………………………………………………………………….. 104
Autres (rapports techniques…)………………………………………………………………………………… 106
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Introduction
L’année 2006 a permis de consolider les axes prioritaires de développement de l’Institut Louis
Malardé, en exécution des décisions et délibérations de son Conseil d’Administration.
Le Département de la Recherche a été renforcé par de nouveaux cadres scientifiques (virologie,
entomologie) ainsi que des stagiaires. Il a bénéficié notamment du recrutement du Pr Rémy
TEYSSOU en qualité de Directeur de la Recherche dans un contexte de collaborations nationales,
régionales et internationales prometteuses. Aux thématiques traditionnelles de l’ILM, s’ajoute
désormais celle des maladies liées au mode de vie et à la transition alimentaire rapide.
La venue d’un troisième biologiste au LABM, dont l’activité continue de croître, a permis le
développement de la virologie médicale, domaine essentiel aux besoins du Pays en matière de veille
sanitaire (grippe, dengue…) et de plan pandémie (grippe avaire).
Le LASEA a fait l’objet d’une analyse financière et de propositions d’action visant à diminuer ses
coûts et augmenter sa compétitivité tout en préservant l’accréditation COFRAC pour laquelle des
extensions ont été demandées.
Les autres entités de l’établissement (DBM, CIE, département administratif) ont fonctionné sans
difficultés excessives.
La démarche qualité progresse malgré les obstacles inhérents à ce processus qui bouscule des
habitudes ou des routines ancrées. Après le LASEA, c’est le LABM qui s’inscrit dans la procédure
spécifique du GBEA.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 2

Le Conseil d’administration
Les administrateurs
• Mme Pia HIRO, Ministre de la santé, chargé de la prévention, de la sécurité alimentaire et de
la médecine traditionnelle, Présidente
• M. Jean-Marius RAAPOTO, Ministre de l’éducation, de l’enseignement supérieur, chargé du
plurilinguisme et de la promotion des langues polynésiennes
• M. Keitapu MAAMAATUAIAHUTAPU, Ministre de la mer, de la pêche, de l’aquaculture et de la
recherche, chargé des relations avec l’Assemblée de la Polynésie française et le Conseil
économique, social et culturel
• Mlle Priscille FROGIER, Déléguée à la recherche ou son représentant
• Dr Mareva TOURNEUX, Directrice de la santé ou son représentant
• Mme Maryse OLLIVIER, Représentant à l’Assemblée de la Polynésie française ou sa suppléante
(Mme Sabrina BIRK)
• Mme Louise PELTZER, Présidente de l’Université de la Polynésie française ou son représentant
• Mme Kathia ESTALL, Représentant du personnel au Conseil d’administration ou sa suppléante
(Mlle Patricia MAUCOTEL)
• Dr Ngoc Lam NGUYEN, Représentant du personnel au Conseil d’administration ou son
représentant (Dr Cyril COUDERT)
Les participants de droit
• M. Jacques ILTIS, Représentant de l’Institut de recherche pour le développement (IRD) en
Polynésie française ou son représentant
• Mme Yolande VERNAUDON, Chef du service de l’Inspection générale de l’administration ou son
représentant
• Mme Nancy MAO CHE, Commissaire de Gouvernement
• M. André BRUSON, Trésorier des établissements publics
• Dr René CHANSIN, Directeur général de l’Institut Louis Malardé
Sur invitation
• M. François HERMIER, Chef du service financier
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 3

Les ressources de l’Institut
La Direction générale
L’équipe
• Dr René CHANSIN
• Aurélie SUNARA
• Francis DENGREMONT
• Michèle MOURLON
• Marie-Claude RENARD
• Dorothéa PONS
• Débora TUTAIRI
La Direction générale assure la gestion quotidienne de l’établissement. A cet égard, l’absence
prolongée de la Directrice générale adjointe a augmenté de façon significative la charge de travail
dévolue au Directeur général qui a simultanément assumé la chefferie du CIE et, en fin d’année, du
LASEA.
Cinq réunions du Conseil d’Administration se sont tenues aux dates suivantes : 10 janvier, 18 avril,
20 juin, 21 août, 7 novembre, mobilisant le secrétariat de direction mais également la chargée des
Ressources humaines et le chef du service financier.
Le Directeur général préside les réunions mensuelles du Comité d’entreprise et du CHSCT ; il reçoit
collectivement les délégués du personnel tous les mois ou à leur demande.
Le Directeur général a participé à de nombreuses réunions de nature administrative ou technique au
niveau ministériel (Santé, Recherche) et dans le cadre de comités techniques ou de pilotage animés
par la Direction de la santé publique (tuberculose, VIH, comité dengue, plan pandémie, dossier
DASRI, etc.).
Il fait partie du Conseil scientifique de l’Université de la Polynésie française au titre de
représentant d’un organisme de recherche, nommé par le Gouvernement.
Il a effectué une mission en France du 23 novembre au 2 décembre 2006 : contact avec les
dirigeants de l’ISPED de l’Université de Bordeaux 2, participation aux Journées de veille sanitaire,
rencontre avec la Direction de l’Institut de recherche pour le développement (IRD) et le président
du Conseil d’Administration de l’Agence nationale de la recherche (ANR) à Paris.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 4

Les ressources humaines
L’organigramme
La structure du personnel
La structure du personnel de l’ILM a peu évolué entre 2005 et 2006. L’effectif global est passé de
103 à 107 personnes. Il est composé de 14 fonctionnaires détachés de la Fonction publique et de
93 salariés (ANFA et assimilés) relevant du droit privé.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 5

ILM Salariés relevant du droit privé FPT Divers
Au
31.12.05
Au
31.12.06
CC1 CC2 CC3 CC4 CC5 Total A B C D Total Total
Effectif
total
18 36 15 11 7 87 6 8 14 2 2 103
21 37 16 13 5 92 6 8 14 1 1 107
Les reclassements
Un agent ANFA de deuxième catégorie titulaire d’un Master de recherche au terme d’une procédure
de valorisation des acquis de l’expérience (VAE) et justifiant d’une évolution de ses fonctions a
bénéficié d’un reclassement en 1 ère catégorie. Deux agents de 5 ème catégorie possédant le Certificat
d’études primaires ont été reclassés en 4 ème catégorie.
Par ailleurs, deux agents de 5 ème catégorie ont changé de groupe en récompense du sérieux de leur
travail.
Les mouvements de personnel
La volonté de la Direction générale de dynamiser le secteur de la recherche a conduit au
recrutement d’un Directeur de la recherche.
Un jeune docteur ès sciences a également été embauché au LVM en qualité de chargé de recherche.
Grâce à un financement de l’Etablissement pour la prévention (EPAP), un ingénieur de recherche a
pu être recruté pour une durée de 11 mois dans le cadre d’un programme du LSN et le contrat à
durée déterminée d’un chargé de mission sur la prévention de la maladie d’Alport a été prolongé
d’une année.
Deux conventions d’engagement de volontaires au développement ont été signées ; les deux
volontaires sont supervisés par la responsable du LPM.
S’agissant du secteur des analyses, l’organigramme et l’organisation du travail du LASEA ont été
modifiés après la démission du directeur du laboratoire. Celui-ci a réintégré le département de la
recherche dont il était issu en qualité de chargé de recherche. Le directeur général assure la
direction du LASEA.
Au LABM, l’augmentation du nombre de dossiers traités a nécessité le recrutement d’un troisième
biologiste.
Le départ à la retraite fin 2005 d’un agent du service financier a été l’occasion d’une réorganisation
du service de la Recette et du recrutement d’un régisseur.
Enfin, un attaché de direction a été recruté en fin d’année afin, notamment, d’assister le directeur
général dans les missions de développement de la politique commerciale de l’Institut (préparation
et suivi des contrats, fidélisation de la clientèle). Il est par ailleurs chargé de la mise en place d’une
logistique d’achat et de gestion des stocks.
L’équipe du service des ressources humaines
• Emmanuelle BOUSQUIE, chargée des Ressources humaines
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 6

L’activité du service
Le service, composé d’une unique personne, recrutée en novembre 2005, s’est fixé pour objectif,
en 2006, de poser les bases d’une gestion des ressources humaines conformes aux exigences
réglementaires et conventionnelles. Les actions menées ont été les suivantes :
la rédaction du règlement intérieur dès janvier 2006. La procédure de consultation des
représentants du personnel s’est achevée le 20 janvier 2006. Au 31 décembre 2006, le
règlement intérieur n’était toujours pas adopté par le Conseil d’administration ;
la mise en œuvre de l’article 14 de la convention collective des ANFA et la tenue des
commissions paritaires consultatives (CPC) lors des recrutements en contrat de travail à
durée déterminée ou indéterminée ; le respect des règles de recrutement édictées par la
convention collective des ANFA (modalités de reprise de l’expérience professionnelle et de
la grille de salaires annexée) ;
la politique maîtrisée des recrutements en contrat de travail à durée déterminée.
Toutefois, le strict respect des exigences réglementaires, bien que incontournables, s’est
heurté à l’incompréhension du personnel et des représentants du personnel ;
la suppression des procès-verbaux des réunions mensuelles des délégués du personnel au
profit de réponses écrites de la Direction générale formulées dans les délais impartis par la
réglementation ;
la réflexion sur la cohabitation des trois statuts du personnel et sur les modalités
d’application de la convention collective des ANFA au sein de l’Institut.
Ces actions ont été menées en étroite collaboration avec les services référents : Inspection du
Travail, Caisse de Prévoyance Sociale, Service des Contributions, Service de l’Emploi, de la
Formation et de l’Insertion Professionnelle…
Il convient cependant de noter que la réalisation de la paye (de la saisie des informations jusqu’à la
mise sous enveloppe des bulletins de salaire), les procédures de recrutement, le suivi des dossiers
avec la CPS, les tâches purement administratives de gestion du personnel (congés, maladies,
absences…) laissent très peu de disponibilité pour l’élaboration d’une véritable politique de gestion
des ressources humaines.
Le service financier
L’équipe
• François HERMIER, chef de service
• Moeata LAUSAN, chargée de la Recette
• Marie-France BOURGEOIS, adjoint de la chargée de la Recette
• Rodrigue AH MIN, adjoint administratif
• Marcelle ESTALL, adjoint administratif
• Ghislaine LICHENG, adjoint administratif
• Guy TERIA, adjoint administratif
• Vaea RICHMOND, régisseur
• Pascale TIMIONA, régisseur
• Walter TIMIONA, adjoint administratif
• Guy JACQUET, adjoint administratif
• Brigitte CHANE, chargée de la Dépense
• Geoffrey VIDAL, adjoint de la chargée de la Dépense
• Nicole BENNETT, adjoint administratif
• Wilfrid GUILLOUX, adjoint administratif
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 7

L’activité du service
L’année a été marquée par l’embauche d’un régisseur après le départ anticipé à la retraite d’un
agent. Cet événement a été l’occasion de réorganiser le service de la Recette. S’agissant des
dépenses de fonctionnement et afin de rationaliser la gestion des commandes, chaque secteur
d’activité est suivi par un agent. La section en capital, les investissements et les immobilisations
ont également été dédiés à un agent.
Dans la poursuite de la politique de mise en place de procédures, l’exercice 2007 devra être
l’occasion de redéfinir les attributions des services et de leurs tâches. Le service a également
participé à la rédaction de la procédure des approvisionnements de l’ILM.
Le bilan financier
Les moyens financiers
Les moyens financiers mis à la disposition de l’établissement au cours des trois derniers exercices
ont évolué comme suit :
D ESIGNATION
Subvention
du Pays
Subvention
de l’Etat
Ressources
propres
Autres
ressources
2004 2005 2006
Valeur % Valeur % Valeur %
368 169 083 24,76% 441 108 917 35,50% 354 700 000 30,26%
7 140 990 0,48% 60 103 966 4,84% 0 0,00%
1 097 268 526 73,81% 718 188 385 57,79% 773 685 434 66,01%
14 076 521 0,95% 23 266 231 1,87% 43 621 754 3,73%
TOTAL 1 486 655 120 1 242 667 499 1 172 007 188
Les ressources propres proviennent des activités de laboratoire et des produits de la vente des
sérums et vaccins.
1 600
1 400
1 200
1 000
800
600
400
Autres ressources
Ressources propres
Subvention de l’Etat
Subvention du Pays
200
0
2004 2005 2006
Les moyens financiers
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 8

Les faits marquants de l’exercice
1- La section fonctionnement
Le budget exécuté en 2006 constate des recettes à hauteur de 1 172 007 188 Fcfp et des
dépenses nettes de 1 251 323 389 Fcfp. Au terme de l’exercice, le résultat comptable est
déficitaire à hauteur de 79 316 201 Fcfp sur un déficit prévu de 74 089 000 Fcfp.
Charges financières,
exceptionnelles, impot
et taxe (63, 66, 67)
Dotation aux
amortissements (68)
Charges de
personnels (64)
Produits financiers &
exceptionnels (76,77)
Subvention
d'exploitation (74)
Services extérieurs
(61, 62)
Achats (60)
Produits - Ventes
(70
)
CHARGES
PRODUITS
1 251,3 Millions FCFP 1 172 Millions FCFP
Les produits
Les recettes de l’exercice 2006 s’élèvent à 1 172 007 188 Fcfp, soit une baisse de
70 660 311 Fcfp (-6%) par rapport à celles de 2005.
Nature des produits 2004 2005 2006 Variat°2006 / 2005
Valeurs des prestations de
service, des ventes de
marchandises
1 097 268 526 718 188 385 773 685 434 55 497 049 8%
Subventions d'exploitation 1 375 310 073 501 212 883 354 700 000 -146 512 883 -29%
Produits financiers 235 259 88 138 376 763 288 625 327%
Produits exceptionnels 13 841 262 23 178 093 43 244 991 20 066 898 87%
Reprises sur
amortissements et
provisions
0 0 0 0
Total 1 486 655 120 1 242 667 499 1 172 007 188 -70 660 311 -6%
Cette baisse des recettes s’explique par :
• une subvention du Pays ramenée de 407 639 000 Fcfp à 354 000 000 Fcfp soit une
perte de 53 639 000 Fcfp ;
• des subventions d’exploitation moins nombreuses qu’en 2005 ;
• des subventions d’Etat inexistantes par rapport à 2005 ;
1
Les subventions intègrent la subvention d’exploitation versée par le Pays, les financements sur le Contrat de
Développement, les financements EPAP et sur les Contrats d’Objectifs Santé Etat-Territoire.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 9

Mais on peut observer :
une forte hausse des produits d’exploitations de près de 56 millions Fcfp ;
une hausse des produits exceptionnels de 20 066 898 Fcfp par rapport à 2005 qui
provient de remboursements (CPS, clients, entreprises) et par l’amortissement des
matériels achetés sur subventions d’investissement les années précédentes.
Les dépenses de fonctionnement
L’écart avec l’autorisation budgétaire
En section de fonctionnement, le montant total des charges est de 1 251 323 389 Fcfp
pour une autorisation budgétaire de dépenses votée à hauteur de 1 269 900 000 Fcfp, soit
une exécution du budget à hauteur de 98,5 %.
L’écart entre les prévisions et les réalisations s’élève à 18 576 611 FCFP. Les volumes
budgétaires non exécutés se concentrent principalement sur les points suivants :
• Chapitre 60 – Achats : 9 040 534 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, le faible volume budgétaire non exécuté touche
principalement les achats de fournitures de laboratoire. Une meilleure gestion des
commandes nous permet d’optimiser et rationaliser nos besoins et donc mieux les
prévoir ;
• Chapitre 61 – Services extérieurs : 2 197 927 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, le volume budgétaire non exécuté touche plus précisément les
frais d’entretien et réparation sur matériels de transport et informatique ;
• Chapitre 62 – Autres services extérieurs : 4 502 494 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, le volume budgétaire non exécuté touche plus précisément les
frais poste/communication (626), les frais divers (628) ;
• Chapitre 64 – Charges de personnel : 2 510 786 Fcfp de crédits disponibles.
Au sein de ce chapitre, le très faible volume budgétaire non exécuté tient au fait qu’il
y a eu certains recrutements non prévus ;
• Chapitre 67 – Charges exceptionnelles : 100 869 Fcfp de crédits disponibles.
L’évolution par rapport à l’exercice précédent
Les évolutions des dépenses par rapport à l'exercice 2005 sont données ci-après :
Nature des dépenses Compte 2005 2006 Variat°2006 / 2005
Achats et variation de stocks 60 306 741 850 338 057 974 27% 31 316 124 10%
Achats de sous-traitance et
services extérieurs
Autres services extérieurs
(en relation avec l'activité)
Autres impôts, taxes et
versements assimilés
61 21 326 556 24 566 565 2% 3 240 009 15%
62 79 231 868 77 264 506 6% -1 967 362 -2%
63 143 119 148 560 0% 5 441 4%
Charges de personnels 64 588 837 872 635 749 214 51% 46 911 342 8%
Charges financières 66 2 438 594 1 175 309 0% -1 263 285 -52%
Charges exceptionnelles 67 1 545 008 38 439 131 3% 36 894 123 2388%
Dotations aux amortissements
et aux provisions
68 71 597 502 74 222 117 6% 2 624 615 4%
Impôt sur les bénéfices 69 12 679 300 61 700 013 5% 49 020 713 387%
Total 1 084 541 669 1 251 323 389 100% 166 781 720 15%
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 10

Les principaux postes de dépenses sont :
• les charges de personnel - chapitre 64 - (soit 635 749 214 Fcfp) : 51% du total des
charges en 2006 ;
La masse salariale connaît une croissance de l’ordre de 8% liée à de nombreux
recrutements (attaché de Direction, Directeur de la Recherche, remplacements non
prévus) ;
• les achats - chapitre 60 - (soit 338 057 974 Fcfp) : 27% du total des charges ;
La hausse de ce chapitre s’élève à 31 316 124 Fcfp. Elle est due :
- à la hausse de l’activité du LABM, du DBM et à moindre échelle du LASEA,
- à la hausse de l’activité et à la fin de réalisation des différents projets de
recherche dans le cadre du Contrat de développement ou des Contrats
d’Objectifs Santé Etat-Territoire.
• les autres charges externes - chapitres 61 et 62 - (soit 101 831 071 Fcfp) : 8% des
dépenses de fonctionnement ;
La hausse des dépenses sur le chapitre 61 (3 240 009 Fcfp) est liée à une
augmentation des frais de maintenance des matériels de laboratoire et informatique.
• les charges exceptionnelles – chapitre 67 – (soit 38 439 131 Fcfp) : 3% du total ;
La hausse s’explique par un rappel de la TVA de 2003 sur subvention pour
28 482 974 Fcfp, et majoration pour dépôt tardif de l’IS, CSIS et la TVA.
• les dotations aux amortissements et provisions - chapitre 68 - (soit 74 222 117
Fcfp) : 6% du total.
• les impôts sur les bénéfices - chapitre 69 - (soit 61 700 013 Fcfp) : 5% du total.
2- Les opérations en capital
Les recettes de la section II
Au titre des opérations en capital, 74 222 117 Fcfp ont été réalisés sur une prévision
budgétaire de 115 000 000 Fcfp, soit un montant non réalisé de 40 777 883 Fcfp.
Les dépenses de la section II
Au titre des opérations en capital, 90 191 851 Fcfp ont été consommés sur l’autorisation
budgétaire de 177 759 680 Fcfp soit un taux de réalisation de 50,7%.
Les immobilisations incorporelles
Concernant les immobilisations incorporelles (chapitre 20), les crédits non utilisés
(7 850 997 Fcfp ) concernent en grande partie le report sur 2006 d’acquisitions de logiciels
informatiques et des licences d’exploitation. Seulement 803 456 Fcfp ont été consommés
sur l’exercice 2006.
Répartition des dépenses du compte 205 par service
CCO
LMT
DOC
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 11

Les principales opérations sont les suivantes :
• Photo illustrator et licence AdoP7 (DOC) : 306 229 Fcfp
• Logiciel Beacon Designer pour sondes (LMT) :
292 363 Fcfp
• Photoshop CS2 V9 (LMT) :
102 432 Fcfp
• AdobePro7 et Norton (CCO) :
102 432 Fcfp
Les immobilisations corporelles
S’agissant des constructions (compte 213), 11 875 114 Fcfp ont été réalisés sur une
autorisation budgétaire de 59 244 098 FCFP, soit un taux de réalisation de 20,4%.
Répartition des dépenses du compte 213 par service
LASEA
LEM
LMT
LVM
LSM
CCO
LABM
TEC
INF
FI
DOC
Les principales opérations sont les suivantes :
• Réalisation escalier béton (CCO): 2 424 238 Fcfp
• Contrôle d’accès (LABM) : 1 897 659 Fcfp
• Remise aux normes électricité LAC (CCO) : 1 710 646 Fcfp
• Travaux rénovation de la Bibliothèque (DOC): 1 399 894 Fcfp
• Rénovation climatisation (LABM) :
635 301 Fcfp
• Travaux Hotte Sorbonne laboratoire (LMT) : 576 180 Fcfp
Les sommes non réalisées correspondent aux opérations ci-après :
• Construction de l’animalerie évaluée à 30 millions de Fcfp,
• Construction d’un local d’archives évalué à 10 millions de Fcfp,
• Aménagement du laboratoire de bactériologie évalué à 8 millions de Fcfp.
S’agissant des installations et des matériels techniques (compte 215), 43 277 887 Fcfp
ont été réalisés sur une autorisation budgétaire de 54 727 277 Fcfp, soit un taux de
réalisation de 79,1%.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 12

Répartition des dépenses du compte 215 par service
LVM
LPM
REC
LMT
CCO
INF
TEC
LASEA
LABM
Les principales acquisitions sont :
Pour le LABM
• Un ACCESS Beckman Coulter : 7 196 800 Fcfp
• Chambres négatives pour réactifs :
3 948 825 Fcfp
• Un Hydrasys (électrophorèse) :
2 183 656 Fcfp
• Une centrifugeuse Thermo JUAN: 1 104 021 Fcfp
• Un lecteur Multiscan EX : 747 360 Fcfp
• Une centrifugeuse Biofuge : 271 721 Fcfp
• Bac évier + mélangeur : 219 512 Fcfp
Total de 15 671 895 Fcfp soit 36,2%
P our
le LASEA
• Appareil GENEPATH : 4 415 275 Fcfp
• Appareil iQ Cycler :
3 503 318 Fcfp
• Analyseur carbone organique :
2 937 767 Fcfp
• Matériels pour préparation échantillons :
1 707 752 Fcfp
• Autres acquisitions : 4 062 043 Fcfp
Total de 16 626 155 Fcfp soit 38,4%
P our le Service informatique
• Système d’alarme salle des serveurs :
534 412 Fcfp
Total de 534 412 Fcfp soit 1,3%
Pour le Service technique
• Matériels entretien terrain Paea : 644 851 Fcfp
Total de 644 851 Fcfp soit 1,6%
Pour le CCO
• Acquisition autoclave : 5 693 040 Fcfp
• Rénovation alarme incendie :
267 078 Fcfp
Total de 5 960 118 Fcfp soit 13,7%
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 13

Pour le secteur de la recherche
Laboratoire de Microalgues toxiques
•
•
•
Microscope DMIL (LMT) :
Matériels de laboratoire :
Centrifugeuse :
919 299 Fcfp
597 917 Fcfp
181 091 Fcfp
Total de 1 698 307 Fcfp soit 3,9%
Commun à plusieurs laboratoires (LMT, LPM, LVM)
• Congélateur -80° (LPM) :
• Laveur de plaques (LPM) :
• Congélateur Liebherr :
Total de 2 142 149 Fcfp soit 4,9%
1 669 623 Fcfp
321 718 Fcfp
150 808 Fcfp
Le volume non réalisé porte sur principalement sur les éléments ci-après :
• un appareil PCR détection pathogène,
• u n lecteur UV microplaque des eaux de baignades,
• une armoire de stockage et d’élevage des animaux inoculés.
S’ agissant des autres immobilisations corpo relles (compte 218), 20 701 809 Fcfp ont été
réalisés sur une autorisation budgétaire de 26 133 852 Fcfp, soit un taux de réalisation de
79,2 %.
Répartition des dépenses du compte 218 par service
LMT
LEM
REC
CIE
LASEA
LSN
LABM
CCO
TEC
RH
FI
DG
INF
Les principales acquisitions sont :
• l’autocom MD évolution (CCO) : 6 384 979 Fcfp
• du matériel informatique
(deux onduleurs, 28 unités centrales, de la mémoire, serveurs, …) : 5 728 199 Fcfp
• l’achat d’un véhicule transport marchandises (TEC):
3 157 722 Fcfp
• l’achat d’un véhicule type 107 (L ABM) :
1 744 917 Fcfp
• l’achat d’un véhicule type 107 (FI) : 1 616 526 Fcfp
• Mobiliers de rangement (FI et LABM) :
1 484 031 Fcfp
Le volume non réalisé porte essentiellement sur l’acquisition
coursiers et de mobilier des agents devant être embauchés.
d’un véhicule pour les
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 14

L’examen du compte financier
1- Exécution du budget de l’exercice
Les éléments déterminants du résultat
Le tableau simplifié des soldes intermédiaires de gestion
Produits Charges Soldes intermédiaires
Ventes et
Production
Achats & Serv.
773 685 434
439 889 045 Valeur Ajoutée 333 796 389
Ext.
+ Subvention 354 700 000
d'exploitation
+ Impôt et
Taxes
+ Charges de
pers.
148 560
635 749 214
Total 1 128 385 434 Total 1 075 786 819
Excéd. brut
d' exploit.
52 598
615
+ Autres produits
d'exploit
0
+ Dot. amort
et autres
charges
74 222 117 -74 222 117
Produits
d'Exploit.
1 128 3 34 C harges
85 4
d'Exploit.
ésultat
1 150 008 936 R -21 623 502
d'Exploit.
Produits
Financiers
376 763
Charges
Financ.
1 175 309
Résultat
Financier
-798 546
Charges
Produits Except. 43 244 991
38 439 131 Résultat Except.
4 805 860
Except.
Impôts 61 700 013 Impôts -61 700 013
Solde débiteur Solde créditeur -79 316 201 Résultat -79 316 201
L’évoluti on par rapport aux exercices précédents
Désignation 2004 2005 2006
Résultats d’exploitation 423 552 763 151 522 501 -21 623 502
Résultat financier -2 858 854 -2 350 456 -798 546
Résultat exceptionnel 6 471 032 21 633 085 4 805 860
Impôt / Sociétés -5 865 316 -12 679 300 -61 700 013
Total 423 552 763 151 522 501 -79 316 201
en Fcfp
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 15

Impôt / Sociétés
500 Résultat exceptionnel
400
300
Résultat financier
Résultats
d’exploitation
200
100
0
-100
2004 2005 2006
Tel qu’il apparaît au compte de résultat simplifié ci-dessus, le déficit est surtout composé
du résultat d’exploitation et de l’impôt.
La baisse du résultat d’exploitation repose sur :
• la baisse de la subvention d’exploitation suite à la réduction de la subvention versée
par le Pays, et par des financements moindres de la part d’organismes extérieurs
(EPAP, Contrats de Développement, etc.),
• la hausse des charges de personnels due à des recrutements et remplacements non
prévus.
L’Impôts/Sociétés est de 61 700 013 Fcfp puisque l’exercice 2005 avait un résultat
bénéficiaire.
Il est à noter que notre impôt sur les sociétés ne fait qu’augmenter depuis que
l’Etablissement fait des bénéfices. Il s’élevait en 2005 à 12 679 300 Fcfp.
Le retraitement du résultat et analyse complémentaire
Le résultat de l’exercice peut être retraité en retirant les éléments exceptionnels ou
ponctuels de l’exercice 2006.
Il se présente comme suit :
• Le versement des subventions liées au Contrat de Développement, - 49 897 971
EPAP et autres
• Le paiement de la TVA sur subvention versée par le Pays en 2003, +28 482 474
• Les pénalités de retard de paiement de la TVA sur subvention
versée par le Pays en 2003 et de l’IS,
+ 9 097 254
• Les charges exceptionnelles sur opérations de gestion, +858 903
-11 459 340
+ Résultat de l’exercice - 79 316 201
+ Résultat retraité - 90 775 541
Le résultat retraité est déficitaire de 90 775 541 Fcfp.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 16

2- L’évolution de la structure financière de l’établissement
La situation patrimoniale
Actif 2004 2005 2006
Actif Immobilisé 508 980 823 495 212 423 498 553 686
• Brut 1 434 639 462 1 492 468 564 1 569 126 830
• Amortissements 929 658 639 997 256 141 1 070 573 144
Actif circulant 572 596 341 746 604 718 655 718 088
• Brut 593 805 374 767 813 751 676 927 121
• Provisions 21 209 033 21 209 033 21 209 033
Total 1 081 577 164 1 241 817 141 1 154 271 774
Passif 2004 2005 2006
Capitaux propres 953 040 521 1 115 442 771 1 027 997 965
Provisions
Dettes 128 536 643 126 374 370 126 270 725
• Dont DMLT
37 717 433 29 107 066 24 607 200
(emprunt)
• Dettes
d’exploitation
90 819 210 97 267 304 101 666 609
Régularisation 0 0 0
Total 1 081 577 164 1 241 817 141 1 154 271 774
La valeur patrimoniale est en baisse de 87 545 367 Fcfp (- 7 %).
A l’actif, cette baisse notable s’explique par une diminution des stocks de l’ILM, de la
réduction de nos créances mais aussi de notre trésorerie.
Au passif, ce sont les capitaux propres qui baissent de 87 444 806 Fcfp (car résultat
déficitaire).
Le fonds de roulement
Le fonds de roulement s’établit à 575 263 596 Fcfp. Son évolution sur les derniers
exercices est donnée ci-après :
• 2004 : 502 986 164 Fcfp
• 2005 : 670 546 447 Fcfp
• 2006 : 575 263 596 Fcfp
Par rapport à l’exercice précédent, le fonds de roulement est en baisse de 95 285 935 Fcfp
sur une diminution prévue de 105 239 744 Fcfp. La décomposition de son calcul est donnée
ci-après :
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 17

2004 2005 2006 Variations 2006/ 2005
+ Capitaux propres 953 040 521 1 115 442 771 1 027 997 965 -87 444 806 -8%
+ Emprunts 37 717 433 29 107 066 24 607 200 -4 499 866 -15%
+ Provisions pour
dépréciations des créances
21 209 033 21 209 033 21 209 033 0 0%
Ressources stables 1 011 966 987 1 165 758 870 1 073 814 198 -91 944 672 -8%
Emplois durables : Actif
immobilisé
508 980 823 495 212 423 498 553 686 3 341 263 1%
Fonds de roulement 502 986 164 670 546 447 575 260 512 -95 285 935 -14%
Fonds de roulement net 481 777 131 649 337 414 554 051 479 -95 285 935 -15%
Trésorerie 153 835 216 282 305 707 214 442 719 -67 862 988 -24%
Le diagramme ci-dessous met en évidence :
• les évolutions du fonds de roulement (FR) et de la trésorerie,
• la part des provisions pour dépréciation des créances dans le fonds de roulement.
700
600
500
400
300
200
100
-
Trésorerie 2004
Nb de jour FdR 2003
Trésorerie 2005
FR 2004
Nb de jour FdR 2004
Trésorerie 2006
FR 2005
Nb de jour FdR 2005
FR 2006
Nb de jour FdR
Trésorerie
Provisions pour
dépréciations
des créances
Fonds de
Roulement Net
La trésorerie de l’établissement en fin d’exercice s’élève à 214 442 719 Fcfp. Cette
somme représente un peu plus de deux mois et demi des besoins de trésorerie de l’Institut.
Ce montant est un plancher en dessous duquel il conviendra de ne pas descendre à moins
d’exposer l’établissement à de sérieux problèmes de gestion du quotidien.
EL’endettement
Le taux d’endettement et le ratio d'indépendance financière sont donnés dans le tableau cidessous
:
2004 2005 2006
Taux d'endettement
(Somme des dettes/Capitaux propres)
Ratio d'indépendance financière
(Capitaux propres / Emprunt)
13,5% 11,3% 12,3%
25,27 38,32 41,78
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 18

Taux d'endettement
Ratio d'indépendance
financière
14%
13%
12%
11%
10%
50
40
30
20
10
-
2 004 2 005 2 006 2 004 2 005 2 006
L’affectation des résultats
Le compte financier de l’Institut Louis Malardé est arrêté pour l’exercice 2006 :
• pour les produits, à la somme de : 1 172 007 188 Fcfp
• pour les charges, à la somme de : 1 251 323 389 Fcfp
• pour les recettes en capital, à la somme de : 74 222 117 Fcfp
• pour les dépenses en capital, à la somme de : 90 191 851 Fcfp
Le résultat est déficitaire et ainsi arrêté à la
somme de 79 316 201 Fcfp et la perte des
recettes sur les dépenses, en capital, à la somme
de 15 969 734 Fcfp.
Le résultat budgétaire de la section de
fonctionnement et de la section d’investissement
consolidé de 2006 est arrêté :
• en dépenses à 1 341 515 240 Fcfp,
• en recettes à 1 246 229 305 Fcfp.
L’ensemble des activités de l’Institut Louis Malardé
menées en 2006 a dégagé un résultat budgétaire
consolidé déficitaire de 95 285 935 Fcfp.
Résultat budgétaire
2004 2005 2006
470 566 649 167 560 283 - 95 285 935
500
400
300
200
100
0
en Fcfp
-100
2004 2005 2006
en millions Fcfp
Il convient d’affecter la somme de 79 316 201 Fcfp au compte 110 (report à nouveau débiteur).
Le service informatique
L’équipe
• Denis MARIN, chef de service
• Joël MOUX, technicien en informatique
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 19

• Christian HUGUES, technicien en informatique
L’activité en 2006
Le service informatique a pour principales missions :
• la maintenance et l’exploitation du système d’information et du réseau téléphonique,
• la fourniture d’un service de « hot-line » auprès des utilisateurs,
• la mise en place et l’exploitation de nouveaux logiciels ou progiciels,
• le suivi et la gestion du parc informatique (matériels et logiciels),
• le développement de nouveaux applicatifs clients à la demande des différents services de
l’ILM.
1 - Optimisation et disponibilités du système d’information
Clusters : deux nouveaux serveurs ont été configurés en contrôleurs de domaine sur la base
de logiciels libres (Open Source). Les fonctionnalités principales déployées sur ces serveurs
concernent la gestion du réseau (serveur DHCP et DNS) et la gestion des fichiers partagés
avec les contrôles d’accès associés. Ces serveurs fonctionnent sur le principe de clustering,
afin de garantir la continuité de service en cas de défaillance matérielle et/ou logicielle de
l’un des deux serveurs.
Architecture réseau : les principaux éléments actifs ont été remplacés par de nouveaux
switchs totalement administrables et permettant un meilleur suivi du trafic réseau.
Parallèlement, tout l’adressage du réseau a été modifié pour optimiser son administration
et sa supervision. L’ensemble des postes a été reconfiguré au moment de la bascule.
Sécurité physique : un système de contrôle d’accès à la salle des serveurs a été mis en place,
verrouillant automatiquement la porte. Ce dispositif est complété par un système d’alarme
pour la détection d’intrusions, pannes électriques, fumées et défaillances des climatiseurs
(un nouveau climatiseur ayant également été installé).
Réseau ondulé : le réseau ondulé de la salle informatique a été remis aux normes. Deux
onduleurs ont été installés et fonctionnement en parallèle, assurant ainsi la continuité en
cas de défaillance matérielle et permettant d’effectuer la maintenance sans interruption de
service. Parallèlement, un système de remontées d’alarme a été mis en place afin de
prévenir le Service informatique immédiatement en cas de défaillance secteur.
Service de courrier sécurisé : le service informatique fait appel à un prestataire qui assure
chaque jour la récupération à l’ILM et l’entreposage dans des locaux sécurisés des
sauvegardes des données de l’Institut. Ce système permet de garantir la disponibilité des
données en cas d’incendie par exemple.
2 - La gestion du parc informatique et téléphonique
Micro-informatique : le service a procédé au renouvellement de quinze micro-ordinateurs au
cours de l’année 2006, effectuant parallèlement la mise à jour des versions logicielles.
Téléphonie : le service informatique a effectué le changement du central téléphonique
devenu obsolète et saturé. Le nouveau central basé sur les technologies radio (DECT) offre
notamment à chaque agent la possibilité d’appeler ou recevoir des appels depuis n’importe
quel point de l’ILM ainsi qu’un système de messagerie vocale.
Dans le même temps, ce système a permis de s’affranchir d’un câblage téléphonique
anarchique offrant plus de souplesse et une meilleure réactivité pour sa gestion au
quotidien (ajout de postes, changement de numéro,…).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 20

Les objectifs 2007
L’objectif du service informatique pour 2007, outre ses missions d’exploitation et de maintenance,
est de poursuivre sa démarche de sécurisation du système d’information, en se basant notamment
sur les recommandations des normes ISO 27001 et ISO 27002 (anciennement BC-1799).
Une refonte des services de messagerie et d’accès à Internet, avec la mise en place de quotas est
également planifiée pour le 1 er semestre.
Le site Internet de l’ILM sera également revisité pour accueillir de nouveaux services et offrir une
vision plus dynamique de l’Institut.
Le management de la qualité
L’équipe
• Michèle MOURLON, responsable qualité
Le bilan 2006 apparaît satisfaisant sur certaines actions engagées, notamment l’hygiène et la
sécurité et les actions de formation interne et externe.
Néanmoins des difficultés demeurent, souvent liées à la réticence, voire au blocage, de personnels
face aux changements qu’exige la culture qualité. Le manque de communication interne constitue
également un obstacle à l’avancement du projet qualité. La fonction de responsable qualité, au
service des unités, est souvent mal perçue car elle remet en question certaines pratiques
anciennes. Le rôle des personnels d’encadrement sera déterminant dans la poursuite du
management de la qualité à l’ILM.
L’hygiène et la sécurité
1 - L’nimation des réunions mensuelles du CHSCT
La responsable qualité a maintenu son assistance auprès du comité d’hygiène, de sécurité et des
conditions de travail (CHSCT) jusqu’au mois d’octobre 2006. L’objectif était de pérenniser le
fonctionnement du comité par l’apport d’une expérience dans le domaine. Aujourd’hui, le
comité travaille de façon autonome, la responsable qualité n’intervenant que sur sa demande.
2 - Les actions réalisées
Plusieurs actions d’amélioration en matière de sécurité et conditions de travail ont été réalisées
en 2006 :
Sécurité Incendie
Formation du personnel
Une première formation a été dispensée par la société ARGOS au mois de juin au profit de
17 personnes. Cette formation associe une partie théorique (triangle du feu, notions de
combustion, caractères des différentes combustions, causes d’éclosion d’incendie, classes
de feu, agents extincteurs, extincteurs) et une partie pratique (extinction réelle sur
différents foyers : classes A, B, C).
Mise en conformité des installations d’éclairage de sécurité
Les travaux ont été réalisés par la société ARGOS. Tous les blocs d’éclairage de secours ont
été remis en état ou remplacés. La signalétique d’évacuation a fait elle aussi l’objet d’une
mise en conformité.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 21

Procédure d’évacuation
Une procédure d’évacuation a été rédigée par la responsable qualité et doit être validée
par le CHSCT et la Direction avant sa mise en application. Cette procédure intègre les
modifications apportées aux infrastructures ; une formation sur le processus d’évacuation
sera dispensée au personnel pour une meilleure maîtrise et efficacité.
Conditions de travail
Un chariot de transport pour les cartons de déchets a été acheté et les plans inclinés ont
été réalisés pour faciliter le travail des personnels.
Prévention des risques chimiques
Equipement des laboratoires
L’ensemble des laboratoires a été équipé d’armoires et coffres sécurisés destinés au
stockage des produits chimiques dans des conditions maîtrisées.
Formation des membres du CHSCT
Les formations dispensées aux membres du CHSCT ont été axées sur la méthodologie
d’analyses des risques :
• audit interne : évaluation et analyse en situation de travail (norme ISO 19011)
• méthode des « cinq » : analyse des risques par poste de travail
• document unique : recensement exhaustif des risques en entreprise
• méthode des cinq M : exploitée dans l’analyse des accidents du travail.
Suivi de l’accréditation ISO 17025 du LASEA
Pour assurer le maintien du niveau de qualité des prestations du laboratoire, un suivi
régulier est essentiel. L’animation du système de management par les réunions, les audits
et le traitement des non-conformités a été assurée par la responsable qualité.
Modification organisationnelle
La démission du directeur du laboratoire a impacté fortement sur l’organisation du LASEA.
Le redéploiement des taches et la modification de l’organigramme ont fait l’objet d’une
revue effectuée par la responsable qualité pour s’assurer du maintien de la conformité avec
les exigences de la norme ISO 17025 ;
L’attaché de direction, chargé des processus commerciaux et de la revue d’offre a bénéficié
d’une formation sur les principes de management de la norme ISO 17025 et sur les
procédures dispensée par la responsable qualité.
Gestion documentaire
Toutes les procédures du système de management ont été revues et modifiées pour prendre
en compte la nouvelle organisation. Les fiches fonction ont fait l’objet des modifications
nécessaires à la mise en adéquation des documents avec la nouvelle répartition des taches
et responsabilités
Audits internes
Le plan d’audits internes a été modifié en raison du changement d’organisation. Malgré
tout, le bilan de ces audits montre une excellente maîtrise des processus techniques. Les
efforts d’amélioration doivent porter sur la planification, la revue d’offre et sur
l’application des procédures liées à la gestion documentaire.
Revue de Direction
Conformément aux exigences de la norme ISO 17025, la revue de Direction générale,
réalisée en août, a permis de dresser un bilan à partir des éléments fournis par les chefs
d’unité du LASEA et la responsable qualité. De nouveaux objectifs associés à des indicateurs
ont été définis par le Directeur général :
• Objectifs économiques : recherche de l’équilibre financier et meilleur contrôle des
dépenses (indicateur associé : tableau de bord mensuel, justificatifs donnés pour les
dépenses en matériel et formation) ;
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 22

• Objectif organisationnel : polyvalence des personnels, planification optimisée,
gestion des congés maîtrisée (indicateur associé : délais de rendu des résultats
conformes aux exigences contractuelles, diminution des heures supplémentaires) ;
• Objectif de développement : développement des activités existantes (marchés
similaires) permettant d’exploiter les moyens et compétences existants,
développement du secteur des prestations associées (indicateur associé : tableau de
bord mensuel) ;
• Objectifs « qualité » : maintien et extension de l’accréditation 17025, application
des procédures qualité (indicateur associé : levée des écarts de l’audit de décembre
2005, diminution de 70% des non-conformités liées à la non application des
procédures).
Le suivi de l’audit d’accréditation
Les fiches d’écarts émises par le COFRAC ont fait l’objet d’un suivi régulier pour s’assurer
que les actions correctives planifiées étaient mises en œuvre et se révélaient efficaces.
Comité de pilotage du GBEA
L’animation des comités de pilotage
La responsable qualité a animé tout au long de l’année les comités de pilotage et rédigé les
comptes-rendus. Des actions ont été définies et réalisées : élaboration de procédures,
formation des personnels, mise en place de la signalétique pour les patients…
L’élaboration des procédures et formation
• Procédure de saisie des échantillons : elle a été revue et modifiée par les membres du
comité en y associant le personnel d’exécution. La procédure a été présentée lors
d’une séance de formation à tous les acteurs du processus ;
• Procédure d’hygiène au laboratoire : la mise en place de cette procédure a fait
l’objet d’une formation (rappel) aux règles élémentaires d’hygiène pour l’ensemble
des personnels du LABM ;
• Procédure de nettoyage et désinfection des infrastructures et du matériel de
laboratoire : la formation pour la mise en place de cette procédure a été dispensée
en deux temps : un premier cycle pour les personnels de la laverie sur les produits et
les techniques d’entretien de locaux, une présentation à tout le personnel du LABM de
la procédure ;
• Procédure de transport des échantillons : avant la rédaction de la procédure, une
formation sur les exigences réglementaires et normatives a été dispensée aux
coursiers par la responsable qualité. Cette procédure n’est pas encore validée (achat
de matériel en cours) ;
• Procédure de gestion documentaire : la simplification du système documentaire
apparaît nécessaire. La réflexion engagée devrait aboutir en 2007 à un mode de
gestion simplifié en cohérence avec la politique de l’établissement sur la gestion
électronique des documents.
Les audits
Des audits ont été menés (préparation des milieux, hygiène) et ont permis d’identifier des
axes d’améliorations. Certaines actions ont été mises en œuvre : tests de stérilité,
meilleure traçabilité…
Bioqualité
La direction du laboratoire a pris la décision d’adhérer à Bioqualité, association chargée de
promouvoir et évaluer la démarche qualité en conformité avec le GBEA (guide de bonne
exécution des analyses). Le rôle et les responsabilités de la responsable qualité devront être
redéfinis avec le directeur du laboratoire pour une collaboration efficace entre tous les
acteurs.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 23

La démarche qualité sur l’ensemble des activités de l’ILM
La formation interne
Deux cycles de formation à l’audit interne ont été organisés et réalisés par la responsable
qualité les 23 et 24 février et 20 et 21 avril 2006. Tous les chefs de service ont été sollicités
pour faire participer leur personnel à ces sessions. Le nombre de participants étant limité,
d’autres sessions seront organisées en 2007 pour les personnes intéressées ; 21 participants
ont suivi la formation et 18 ont obtenu leur certificat d’auditeur.
Les objectifs de l'audit qualité sont de veiller à ce que l'entité auditée respecte les points
suivants :
• la conformité aux exigences légales et réglementaires : exemple la sécurité ;
• l'efficacité : un système qualité est efficace lorsqu'il permet de réaliser des produits
ou services conformes d'une manière régulière et d'accroître la satisfaction des clients
externes et internes ;
• l'aptitude à atteindre les objectifs.
Le programme de formation est conforme à la norme NF EN ISO 19011 : lignes directrices
pour l’audit des systèmes de management de la qualité et/ou de management
environnemental. Contenu pédagogique :
• Termes et définitions,
• Compétences et qualités des auditeurs,
• Principes de l’audit,
• Activités d’audit.
Une évaluation est réalisée à l’issue de la formation pour délivrer un certificat d’auditeur
interne :
• Evaluation écrite : préparation d’un audit (plan et questionnaire) à l’issue de la
formation théorique ;
• Evaluation en situation : préparation et réalisation d’un quick audit sur un processus
ou une procédure.
Les audits
Le programme d’audit a pu être enrichi grâce au nombre d’auditeurs. Les audits réalisés ont
permis de définir les axes d’amélioration pour les secteurs audités :
• Centre de documentation,
• Service technique,
• Circuit des documents externes….
Les actions correctives sont ou vont être engagées permettant ainsi de progresser et
d’optimiser l’organisation.
Le comité de pilotage GED
Des difficultés dans la gestion documentaire (interne et externe) ont été identifiés au cours
des différents audits effectués sur ce thème. La Direction générale a décidé d’initier une
réflexion pour la mise en place d’un système de gestion électronique des documents (GED).
Un comité de pilotage, représentatif de l’ensemble des activités de l’Institut, a été créé. La
gestion du projet a été confiée au chef du Service informatique, l’animation et la
coordination à la responsable qualité. Le recensement de tous les documents reçus,
produits et consultés a été effectué pour permettre au responsable informatique de définir
les besoins en matériel et logiciel. Un cahier des charges est en cours d’élaboration et le
projet doit se poursuivre en 2007.
Les procédures
L’élaboration des procédures générales initiées en 2005 s’est poursuivie :
• Mise en place d’une procédure de transport et d’élimination des déchets
potentiellement contaminés. La mise en application permet de répondre aux
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 24

exigences de sécurité (définies par la réglementation) et aux exigences de traçabilité
(définies par la norme ISO 17025 et le GBEA). Cette procédure suivie et appliquée
permet d’optimiser le fonctionnement de l’incinérateur.
• Rédaction de la procédure de transport des produits chimiques : aujourd’hui cette
procédure est validée mais sa mise en application reste difficile.
Le DUOG
Le document unique d’organisation et de gestion
La mise à jour du document est confiée à la responsable qualité en collaboration étroite
avec la chargée des ressources humaines. Les évolutions ont régulièrement été présentées
en Conseil d’administration.
Ce document reste méconnu de l’ensemble du personnel et son exploitation par les chefs de
service n’est pas encore effective notamment dans la politique de recrutement qui devrait
être en lien constant avec la maquette future du DUOG.
Les fiches de poste
La planification initiale prévoyait la rédaction des fiches de poste pour tous les personnels
fin 2006. En réalité, leur élaboration a été ralentie par d’incessantes remises en question
pour des raisons diverses : format inadapté pour certains (prévu pour des fonctionnaires
territoriaux), refus d’un chef de service de collaborer avec la responsable qualité pour la
rédaction, reports successifs de réunions de travail… Le travail a malgré tout progressé
grâce à l’implication de certains cadres.
La participation à la commission des déchets
Le Pays s’est doté d’un incinérateur dédié à l’élimination des déchets d’activités de soins.
L’organisation de la collecte et du transport doit faire l’objet d’un appel d’offre. Le
Ministère de la santé a constitué une commission pour la définition et l’élaboration du
cahier des charges.
La Direction générale de l’Institut Louis Malardé, sollicitée pour participer à cette
commission, a délégué à la responsable qualité la mission de collaborer à cette réflexion.
La politique de l’Institut a été de défendre le niveau de qualité et de traçabilité appliqué
en interne dans le cadre de ses exigences réglementaires et normatives.
Les actions de formation externe
Deux actions de formation externe ont été réalisées par la responsable qualité auprès d’une
association du secteur médical :
• une formation d’auditeurs internes (huit auditeurs formés),
• une assistance à la rédaction du projet d’établissement par la formation de la
responsable du projet aux exigences qualité du référentiel d’accréditation ANAES.
Ces prestations facturées par l’ILM dans le cadre de conventions, contribuent à véhiculer la
dynamique de l’établissement à promouvoir la qualité des prestations et à répondre aux
besoins de formation qualité de ses clients actuels ou potentiels.
Le centre de documentation
L’équipe
• Marie SOLIGNAC, chef de service
Après l’absence de la documentaliste pendant près de cinq mois en début d’année, l’activité du
service a repris en juin 2006, se partageant entre la documentation et les actions de
communication.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 25

La documentation
1 - Les abonnements
En 2006, l’ILM a souscrit un abonnement à 35 revues scientifiques, informatiques et juridiques, pour
un montant de 1,6 million Fcfp. Pour 2007, une réflexion menée en concertation avec les cadres de
l’Institut a conduit à réajuster la liste des abonnements afin de cibler plus précisément les besoins.
Par ailleurs, les abonnements online ont été privilégiés. L’accès aux sites internet des éditeurs offre
en effet un double avantage aux utilisateurs :
une consultation rapide, dès la parution du périodique : soit un gain de temps appréciable si
l’on considère les délais d’acheminement, parfois très longs, des revues en format papier ;
une consultation facilitée car possible depuis le poste de travail des utilisateurs et non plus
exclusivement au Centre de documentation.
En raison de son coût élevé ce mode d’abonnement n’a cependant pu être généralisé. Pour l’année
2007, sur un total de 29 abonnements, on compte 7 abonnements online. D’autres titres pourront y
être ajoutés dans l’avenir.
2 – Les acquisitions de documents
En complément des abonnements, les personnels de l’ILM ont à leur disposition un service d’achat
d’articles. Le Centre de documentation est en relation de longue date avec l’Institut de
l’information scientifique et technique (INIST), dépendant du Centre national de la recherche
scientifique (CNRS), lequel possède un large fonds documentaire scientifique et est en relation avec
un important réseau de bibliothèques à travers le monde.
Les commandes transmises par internet sont renvoyées au Centre de documentation via le logiciel
Ariel de livraison électronique de documents. Ce mode de fonctionnement a permis de réduire les
délais de réception jusqu’à 24 heures dans le cas où les documents sont disponibles dans le fonds de
l’INIST (archives numérisées depuis l’année 1990). Dans le cas contraire, les copies d’articles sont
expédiées par voie postale.
Parallèlement, en 2006, l’ILM a signé un contrat avec les Editions Elsevier afin d’obtenir un accès au
site ScienceDirect permettant de consulter, imprimer, télécharger les articles des revues éditées
par Elsevier, de créer une alerte personnalisée sur les nouvelles publications, de sauvegarder les
recherches bibliographiques… Ce service proposé récemment par les Editions Elsevier semble
apprécié des scientifiques de l’Institut.
S’agissant des ouvrages, une quarantaine d’acquisitions seulement ont été recensées en 2006. Le
vieillissement du fonds bibliographique nécessitera dans l’avenir une réflexion sur une véritable
politique d’achat.
3 - La gestion électronique des documents
Au mois de juillet, un comité de pilotage du projet de gestion électronique de documents s’est
constitué, réunissant cinq membres représentant l’ensemble des entités de l’ILM, parmi lesquels le
chef du Centre de documentation.
Le projet de GED a pour objectif de rationaliser l’enregistrement, l’indexation, l’archivage des
documents et de permettre une recherche et une diffusion efficaces de l’information.
La priorité a été donnée aux documents entrant à l’ILM. Les circuits de circulation de l’information
ont été identifiés. Un cahier des charges sera rédigé par le responsable qualité et le responsable
informatique.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 26

La communication
1 - Site internet
Le Centre de documentation participe aux côtés du directeur de la Recherche, du chef du Service
informatique et d’un biologiste du LABM, au comité de pilotage constitué dans la perspective de la
restructuration du site internet.
La réalisation technique du site a été confiée au Service informatique, la création graphique au
Centre de documentation et les propositions suivantes formulées :
• structure du site autour des grandes thématiques scientifiques de l’ILM ;
• liens vers les responsables de projet, les laboratoires et leurs équipes ;
• présentation des collaborations ;
• accès au Guide des analyses de biologie médicale et aux formulaires du LABM à
télécharger ;
• accès à l’espace sécurisé réservé aux prescripteurs du LABM ;
• étude de faisabilité d’un service identique pour le Laboratoire d’anatomo-cyto-pathologie
et pour le LASEA.
• zone « actualité » sur la page d’accueil, avec une périodicité mensuelle ;
• mise en place d’un moteur de recherche pour une recherche rapide et simplifiée ;
• espace dédié aux questions des internautes et éventualité d’un forum de discussions.
La réalisation du site devrait intervenir au cours de l’année 2007.
2 - Posters
Dans le cadre de la XII è Conférence sur les algues toxiques qui s’est tenue à Copenhague (Danemark)
au mois de septembre, le Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques a présenté deux
posters. Puis, en fin d’année, l’ILM a exposé, à l’occasion de la Fête de la science, treize
kakemonos. La conception graphique en a été confiée au Centre de documentation.
Ces travaux ont été réalisés en étroite collaboration avec les scientifiques, concepteurs des posters.
Les maquettes, le choix des illustrations, des couleurs… ont été adaptés au public ciblé.
Cette nouvelle mission dédiée au Centre de documentation marque la volonté de la Direction
générale de maîtriser la politique de communication et de créer une nouvelle image de l’ILM.
3 - BISE
Sur proposition de la Direction de la Santé, les activités de recherche scientifique et de veille
sanitaire de l’ILM font l’objet d’un numéro spécial du Bulletin d’information sanitaire et
épidémiologique (BISE) au mois de janvier 2007.
Le Centre de documentation s’est chargé de la coordination de ce projet et des relations avec le
Service de veille sanitaire de la Direction de la Santé.
4 - Guide LABM
Le Centre de documentation a collaboré au projet de réédition du Guide des analyses de biologie
médicale. Cette participation a consisté à faire le lien entre le LABM et l’agence de création
graphique Wake Up ! pour la gestion de la commande, la transmission des informations, la sélection
de l’iconographie, le choix du format, la validation des maquettes et l’impression finale.
Cette nouvelle édition s’accompagne d’une affichette d’information sur les prélèvements pour les
analyses les plus courantes.
La diffusion du Guide et de l’affichette auprès des prescripteurs est programmée pour le début
2007. La version actualisée du Guide a été intégrée au site internet de l’ILM fin décembre 2006.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 27

5 - Manuel qualité du LASEA
Dans la perspective de l’audit de suivi du Comité français d’accréditation (COFRAC) au LASEA, prévu
en mars 2007, le responsable qualité a sollicité le Centre de documentation afin de réaliser la
maquette du Manuel qualité. Ce document a été finalisé début 2007.
6 - CHSCT
En association avec le Comité d’hygiène, de sécurité et des conditions de travail (CHSCT), le Centre
de documentation a réalisé des documents d’information destinés à sensibiliser le personnel de
l’ILM sur la prévention des risques.
La première campagne a pour thème « Le port des gants de protection ». Une affichette, diffusée
dans les laboratoires, explique pourquoi et quand porter des gants, comment les choisir et les
utiliser.
Deux fiches d’information spécifiques sur les gants de protection contre le risque chimique et
contre le risque biologique ont également été élaborées et mises à disposition des personnels
techniques.
D’autres thèmes devraient être abordés au cours de l’année 2007.
Par ailleurs, dans le cadre de la mise en place des prescriptions du Guide de bonne exécution des
analyses (GBEA) au LABM, le Centre de documentation a réalisé la signalétique du laboratoire,
permettant une meilleure orientation des visiteurs au sein de l’ILM.
7 - Rapports
Le Centre de documentation a enfin réalisé le Rapport annuel et le Rapport annuel d’activité de
santé publique 2005 de l’ILM, en collaboration avec les chefs de service, ainsi que les documents de
présentation des activités scientifiques de l’Institut dans le cadre de la visite du Ministre de la
recherche, en juin, et de M. Gagnepain, conseiller pour la politique internationale auprès du
Directeur du CNRS, en octobre 2006.
Les activités annexes
En raison de ses fonctions antérieures au sein du Service des ressources humaines, le chef du Centre
de documentation effectue le contrôle mensuel de la paie en collaboration avec la chargée des
ressources humaines, et assure une suppléance partielle de celle-ci en cas d’absence.
Le service technique
L’équipe
• Alexandre KECK, chef de service
• Léon COLOMBANI, aide-technicien
• Laurent MOILON, animalier
• Karl PUTOA, aide-technicien
• Fleury TAVAE, manœuvre
• Pomateao TEARIKI, lingère
• Tu TETAURU, manœuvre
L’activité du service
La mission du Service technique consiste à fournir un support logistique aux services et laboratoires
de l’ILM. Son effectif est resté constant.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 28

Le Service technique a ainsi supervisé divers travaux d’investissements réalisés par les entreprises
extérieures :
mise en place de nouveaux climatiseurs ou remplacement équipements défectueux,
rénovation du circuit frigorifique de chambres négatives,
mise en conformité des installations électriques de l’ancien LAC,
rénovation de la bibliothèque,
mise en place de panneaux de séparation au service de la Recette.
Divers travaux ont par ailleurs été effectués en régie par les agents du Service technique :
aménagement de 2 bureaux pour les biologistes,
sécurisation à l’aide de grilles de protection des fenêtres des laboratoires donnant sur le
jardin du Ministère de la Santé,
aménagement d’un local de stockage pour le matériel technique,
aménagement d’un local pour élevage de champignons dans le cadre d’un programme de
lutte contre le miconia, avec mise en place d’un nouveau plafond, pose de revêtement
thermoplastique et peinture,
réalisation d’un plan incliné pour les chariots au rez-de-chaussée et d’un plan incliné avec
main courante pour les personnes à mobilité réduite,
peinture du bureau du directeur LABM,
rénovation de la laverie,
réparation de fuites dans la toiture.
Les travaux programmés pour 2007 sont multiples :
remise à niveau de la cour intérieure de l’ILM, inondée en cas de pluie,
élagage de l’arbre situé dans la cour de l’ex-LAC,
destruction des édifices bâtis par les squatters du terrain de Paea après leur expulsion par
la force publique et implantation de clôtures de protection de la propriété,
construction d’un hangar de stockage de produits de laboratoire et création d’une zone
d’archivage,
construction de la nouvelle animalerie,
élagage des arbres devenus dangereux par leur taille et abattage de vieux cocotiers pour
garantir la sécurité des personnes sur le terrain de Paea,
rénovation du laboratoire de bactériologie, du laboratoire de virologie, de la laverie et de la
salle de préparation des milieux,
réfection de plafonds dans les laboratoires d’immunologie et de virologie,
Enfin, le Service technique a pour objectif commun avec le Service qualité la mise en place des
procédures de transfert des déchets de laboratoire vers le site de Nive’e, conformément à la
nouvelle réglementation.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 29

Les activités de recherche
Le laboratoire de recherche en parasitologie médicale
L’équipe
• Anne-Marie LEGRAND, chef de service
• Catherine PLICHART, ingénieur de recherche
Les activités de recherche
1- Evaluation 2005-2006 de la situation de l’endémie filarienne après six années de
bithérapie communautaire notézine-albendazole
La filariose lymphatique de Bancroft, variété pacifica, demeure un problème de santé publique
principalement dans les archipels de la Société et des Marquises. Si les formes extrêmement
invalidantes comme l'éléphantiasis ou l'hydrocèle ont pratiquement disparu grâce à divers essais
de chimioprotection de masse (actuellement il s’agit d’une bithérapie communautaire notézinealbendazole
une fois par an), la prévalence des formes courantes de l’infection est mal estimée
car celles-ci passent souvent inaperçues.
Dans le cadre du Programme pour l’Elimination de la Filariose Lymphatique dans le Pacifique
(PacELF) mis en œuvre en Polynésie française début 2000, réalisé en collaboration avec le
Laboratoire de recherche en entomologie médicale (LEM) et le Centre de consultation médicale
et d’investigation épidémiologique (CIE), le LPM effectue les analyses biologiques qui
permettent d’évaluer la prévalence du parasitisme et l’efficacité de l’actuelle stratégie
médicamenteuse.
La recherche d’antigènes du ver adulte dans le sang (par un test ELISA de laboratoire quantitatif
et un test de terrain qualitatif) permet d’évaluer le niveau d’infestation de la population, la
mesure des taux d’IgG anti-parasitaire (par un test ELISA mis au point, validé et automatisé par
l’équipe du laboratoire) permet d’estimer son niveau d’exposition.
Trois populations sentinelles, soit près de 3000 personnes habitant les îles de Maupiti, Raiatea
(archipel de la Société) et Tahuata (archipel des Marquises) font l’objet du suivi.
L’évaluation initiale (réalisée en 2000) et l’évaluation intermédiaire (réalisée en 2003) avaient
montré qu’après 3 campagnes de traitement et pour une couverture médicamenteuse moyenne
de 79% la tendance était à la stagnation. Suite à cela, des mesures incitatives ont été prises par
la Direction de la Santé en 2004 et 2005 pour tenter de faire progresser la couverture
médicamenteuse au-dessus de 85%.
L’évaluation finale réalisée en novembre 2005 pour le site sentinelle de Maupiti et en février –
mars 2006 pour les deux autres sites a permis de faire le point sur la situation actuelle de
l’endémie filarienne.
Les deux principaux objectifs de cette évaluation étaient :
mesurer l’impact de cette stratégie dans les sites de forte endémie en utilisant une
combinaison d’outils de surveillance du parasitisme chez l’homme et chez le moustique
Aedes polynesiensis ;
tester l’hypothèse de l’élimination possible de la filariose lymphatique dans un site de
faible endémie par le traitement communautaire pendant 5 années consécutives (c’est-àdire,
selon l’objectif de l’OMS, diminuer la prévalence de l’antigénémie, antigènes
circulants du ver adulte, à un niveau inférieur à 1%).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 30

En outre, afin d’évaluer l’efficacité intrinsèque du traitement DEC – ALB, les données portant
sur les personnes parasitées qui se sont réellement traitées annuellement pendant la durée de
l’étude ont été évaluées.
Les conclusions retenues par le chef de projet (Dr Lam NGUYEN) sont les suivantes :
La stratégie proposée a été mise en œuvre correctement avec une couverture globale de
75% au moins ;
Après l’évaluation intermédiaire de 2003 et l’observation de l’impact très limité du
traitement communautaire dans les sites sentinelles, la couverture médicamenteuse a pu
être améliorée ;
La combinaison DEC – ALB est efficace pour un contrôle de l’endémie ;
Cependant on est loin d’atteindre l’objectif évoqué : éliminer la filariose par rupture de la
transmission, rupture supposée atteinte dès lors qu’une prévalence du parasitisme chez
l’Homme descend en dessous de 1% ;
L’efficacité intrinsèque du traitement (basée sur les analyses de cohortes) est, réelle,
cependant le taux de négativation en microfilaires circulantes est seulement de l’ordre de
40%.
La moyenne géométrique de la microfilarémie des personnes positives qui se sont traitées et
qui sont toujours positives est de l’ordre de 5 Mf/mL, niveau suffisant pour maintenir la
transmission par les moustiques-vecteurs
Dans le site sentinelle de Tevaitoa à Raiatea, une analyse en 4 zones et une illustration par
Système d’Information Géographique (SIG) démontrent un bon échantillonage des
prélèvements, une répartition diffuse des filariens (aucune zone n’est indemne), mais aussi
des différences dans les niveaux d’infection d’une zone à l’autre.
2- Surveillance biologique et entomologique de la filariose - Mise au point et validation de
la détection de larves de Wuchereria bancrofti dans les moustiques (Aedes
polynesiensis, Culex quinquefasciatus) et dans le sang des patients par PCR en temps
réel
En 1993, une technique permettant la détection du parasite W.b dans le moustique Aedes
polynesiensis par amplification spécifique de son l’ADN (PCR) a été développée au laboratoire.
Les amplicons étaient détectés par électrophorèse sur gel d’agarose. Nous avons adaptée cette
technique sur un appareil (icycler iQ, Biorad) qui permet de réaliser une PCR en temps réel,
grâce à une détection des amplicons par fluorescence. Tout d’abord, nous avons utilisé les
mêmes amorces (NV1-NV2) que pour la PCR conventionnelle et le SYBR green comme marqueur
fluorescent. L’observation des courbes de fusions pour chaque échantillons analysés nous
permet d’éliminer d’éventuels faux positifs ce qui augmente la spécificité de cette nouvelle
PCR, la sensibilité restant équivalente. De plus, puisque l’analyse des amplicons se fait
directement sur la machine, il n’est plus nécessaire d’ouvrir les tubes après la réaction ce qui
diminue beaucoup les risques de contamination.
Nous avons testé un autre couple d’amorces (LDR1- LDR2) avec une sonde TaqMan (Fam/Tamra)
comme marqueur fluorescent. La cible de ces amorces est également une séquence d’ADN
génomique répété située à plusieurs centaines de bases du fragment Ssp1 amplifié par NV1-
NV2. Les résultats obtenus sur nos extraits d’ADN d’Aedes polynesiensis, montrent une moins
bonne sensibilité qu’avec le système NV1-NV2-SYBR green, contrairement aux résultats publiés
par une équipe américaine.
A ce jour, la microfilarémie, concentration des microfilaires dans le sang, est déterminée par
comptage direct des microfilaires, après coloration d’un filtre sur lequel 1 ml de sang a été
filtré. Cette technique, nécessite beaucoup de petit matériel et de manipulations.
La mise au point d’une PCR quantitative pour permettre d’obtenir la microfilarémie à partir du
dosage de l’ADN spécifique de W. bancrofti dans le sang est en cours. Plusieurs formes
d’échantillons sanguins (sang frais, sang congelé, buvards imprégnés de sang) et plusieurs kits
d’extraction sont actuellement testés
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 31

3- La doxycycline dans la chimiothérapie individuelle contre la filariose lymphatique de
Bancroft ; essai thérapeutique ciblant la bactérie Wolbachia (Rickettsiae),
endosymbiote de la filaire Wuchereria bancrofti var. pacifica
Depuis quelques années, de nouvelles voies de recherche se sont ouvertes dans la communauté
scientifique filarienne grâce à la re-découverte des bactéries Wolbachia, bactéries
endocellulaires présentes dans un certain nombre de parasites nématodes. Ces bactéries
semblent jouer un rôle important dans la biologie du parasite et contribuer à la pathogenèse.
Chez plusieurs espèces de filaires disposant d'un modèle animal, il a été montré qu’un
traitement antibiotique adapté entraîne des modifications de l'embryogenèse, de la fertilité et
du développement du parasite. Concernant Wuchereria bancrofti, deux essais thérapeutiques
menés chez l’homme en 2001 et 2003 ont montré que la chimiothérapie des filarioses par la
doxycycline induit une stérilité durable du parasite. En ce qui concerne la pathogenèse,
caractérisée par des réponses inflammatoires aiguës ou chroniques générées soit par le parasite
soit par le système immunitaire du patient, de nombreuses interrogations demeurent mais
plusieurs équipes s’intéressant particulièrement aux mécanismes immuno-pathologiques ont
cherché à étudier le rôle des bactéries Wolbachia.
Dans un précédent programme de recherche mené au cours de la période 2002-2004 (et valorisé
en 2005 ; Cf publication), nous avons démontré la présence d’une lignée de ces bactéries dans
la filaire responsable de la filariose lymphatique en Polynésie, Wuchereria bancrofti
var. pacifica.
En 2005, un essai thérapeutique comprenant un traitement antibiotique à la doxycycline associé
au classique traitement anti-filarien à la notézine a été préparé. Un protocole détaillé a été
arrêté en collaboration avec le CIE. Le projet a été soumis à l’avis du Comité d’Ethique de
Polynésie française (avis favorable n°22 du 8 août 2005).
L’objectif de cette étude est d’évaluer l’apport d’un traitement antibiotique pour une
meilleure prise en charge du patient filarien. Nous espérons être ensuite à même de proposer à
la communauté médicale un schéma thérapeutique à visée individuelle conduisant à une
clairance durable de la microfilarémie et à une action notable sur les vers adultes.
Le pré-recrutement des patients pour un suivi de leur situation parasitaire avant traitement et
le lancement de l’essai proprement dit n’ont pas pu être réalisés en 2006, l’équipe médicale
ayant été très occupée par le programme PacELF. Le recrutement d’un attaché de recherche
clinique devrait permettre d’étoffer l’équipe médicale actuelle.
Le laboratoire de recherche en virologie médicale
L’équipe
• Anne-Marie LEGRAND, chef de service jusqu’au 9 septembre 2006
• Rémy TEYSSOU, chef de service à compter du 13 novembre 2006
• Van-Mai LAO-LORMEAU, Doctorante, soutenance de thèse en mars 2006. Chargée de recherche
depuis en CDD (avril à septembre 2006), en CDI depuis fin octobre.
• Claudine ROCHE, ingénieur de recherche
• Jérôme VIALLON, technicien de recherche
• Maite AUBRY, stagiaire (janvier à juillet 2006), CVD (novembre 2006 à novembre 2007)
• Manuarii MANUEL, CVD (juin à août 2006)
Au début de l’année 2006, le rapprochement du Laboratoire de recherche en virologie médicale
(LVM) avec le Laboratoire de recherche en parasitologie médicale, placés sous l’autorité du
Dr Anne-Marie LEGRAND, responsable du laboratoire par intérim depuis le deuxième semestre 2005,
a été effectif. En l’attente de la fin de la disponibilité du précédent responsable du laboratoire, le
Dr Manola LAILLE, prévue le 10 septembre 2006, ce rapprochement n’a pas été officialisé et s’est
déroulé de façon expérimentale.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 32

Le Dr Manola LAILLE ayant fait connaître sa décision de démissionner à l’issue de sa disponibilité, le
Pr Rémy TEYSSOU, Directeur de la Recherche depuis le 16 octobre 2006, a été nommé responsable
du LVM le 13 novembre 2006.
L’année 2006 a donc été une année de transition, avec une incertitude sur l’organisation du
laboratoire. Une restructuration s’en est suivie après la nomination du Pr Rémy TEYSSOU, le
recrutement du Dr Van-Mai CAO LORMEAU à l’issue de sa thèse, d’abord en CDD (3 mois) puis en CDI
à compter du 23 octobre 2006, et le recrutement de Maite AUBRY en CVD d’un an, en fin d’année,
après 6 mois de stage dans le cadre d’un Master 1 de Recherche.
Les programmes du LVM se sont articulés autour de 4 axes :
• Etudes génétiques du virus de la dengue,
• Surveillance de la dengue et autres arboviroses,
• Relations Virus de la dengue/Hôte humain,
• Relations Virus de la dengue/Moustique vecteur.
Les activités de recherche
1- Axe 1 : Etude génétique du virus de la dengue
Mise en évidence d’un topotype de dengue 3 spécifique du Pacifique Sud
• Participants et collaborateurs
C. ROCHE, B. MURGUE (IRD Paris), R. CHARREL et X. de LAMBALLERIE (Faculté
de Médecine de Marseille)
• Objectif
Ce programme a pour objectif la caractérisation de l’évolution génétique de souches
virales de DEN-3 ayant circulé dans la zone Pacifique de 1989 à 1996.
• Etude
Lors d’un programme précédent portant sur la caractérisation de marqueurs génétiques
de la dengue associés à la sévérité de la maladie, nous avons mis en évidence un groupe
de souches de DEN-3 génétiquement proches laissant supposer l’existence d’un topotype
spécifiquement polynésien.
Cette étude d’épidémiologie moléculaire basée sur l’analyse phylogénétique du gène E
des virus de DEN-3 a pour objectif de confirmer cette hypothèse.
Seize souches isolées dans les différents archipels de la Polynésie française de 1989 à
1996 ont été sélectionnées de façon à étudier la variabilité génétique du virus de la
dengue à la fois dans l’espace et au cours du temps. Le séquençage du gène
d’enveloppe (1485 bp) de ces souches a été réalisé. De façon à élargir notre étude, nous
avons également séquencé l’enveloppe entière d’une souche isolée en Nouvelle-
Calédonie en 1989 (NC89).
• Etat d’avancement des travaux/Résultats
Le séquençage a été réalisé et les séquences ont été alignées avec 74 souches de DEN-3
dont les séquences complètes du gène E sont disponibles sur GenBank.
L’analyse phylogénétique a été réalisée grâce au logiciel MEGA3 utilisant l’algorithme
Jukes-Cantor pour la détermination des distances et la méthode du Neighbor-Joining
pour la construction de l’arbre. La solidité de l’arbre a été testée par 500 bootstraps.
L’analyse phylogénétique du gène E de DEN-3 confirme l’existence de 4 génotypes déjà
décrits par d’autres auteurs. Les souches de Polynésie française de notre étude
appartiennent toutes au génotype I et forment un topotype particulier au sein de ce
génotype. Une souche Fiji92 ainsi que la souche NC89 font également partie de ce
topotype, spécifique du « Pacifique Sud ». Au sein de ce topotype, on note une
microévolution temporelle à partir de 1994.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 33

On notera accessoirement la présence d’une souche isolée à Tahiti en 1965 (Tahiti65) au
sein du génotype IV qui semble ne plus circuler dans le monde depuis la fin des
années 70.
Plus de la moitié des souches (9/17) ont une séquence en acide aminés rigoureusement
identiques sur le gène de l’enveloppe. La souche la plus divergente a seulement
2 substitutions en aa sur les 493 que comporte l’enveloppe.
• Conclusions et perspectives
Cette étude phylogénétique montre l’existence d’un topotype spécifique du Pacifiquesud
au sein du génotype I de DEN-3 et une évolution génétique des souches au sein de
ce génotype qui s’effectue dans le temps.
Ces études phylogénétiques sont essentielles pour suivre l’évolution virale, et guider
l’introduction de futurs vaccins.
Identification de marqueurs moléculaires corrélés à la virulence et à l’atténuation de souches
virales de dengue 3 isolées en Polynésie française
• Participants et collaborateurs
C. ROCHE, M. AUBRY, B. MURGUE (IRD Paris)
• Objectif
Ce programme a pour objectif l’évaluation de l’implication éventuelle des modifications
génétiques dans les variations de virulence des souches de DEN-3.
• Etude
Trois épidémies de DEN-3 ont touché la Polynésie française en 1964, 1969 et 1989. Les
deux premières épidémies, au cours desquelles des souches de DEN-3 du génotype IV ont
été isolées, n’ont pas été impliquées dans l’apparition de formes sévères de la maladie
(DH/DSC). Par contre, l’épidémie de 1989 qui a pour origine des souches de DEN-3 du
génotype I, a été qualifiée de sévère en raison des nombreux cas de DH/DSC (72 DSS et
11 décès recensés parmi 263 cas confirmés et hospitalisés dans le service de pédiatrie
du Centre hospitalier territorial). D’après ces observations, les souches de DEN-3 du
génotype I auraient un potentiel de virulence plus élevé que celles du génotype IV.
Afin d’étayer cette hypothèse, nous nous proposons d’étudier les différences
génétiques de souches de DEN-3 de génotypes différents, ayant circulé en Polynésie
française avec un impact épidémiologique différent, en comparant leurs séquences
complètes en nucléotides et/ou en acides aminés.
Les souches du génotype I ont été séquencées lors d’une précédente étude portant sur
la caractérisation de marqueurs génétiques de la dengue associés à la sévérité de la
maladie.
Concernant le génotype IV, 3 souches lyophilisées de DEN-3 des années 60
(Tahiti64/228771, Tahiti69/22770 et Tahiti69/29770) ont été testées.
• Etat d’avancement des travaux/Résultats
Seule la souche Tahiti64/228771 (PF64) a pu être amplifiée sans pouvoir être réactivée
sur culture cellulaire. Malgré cette difficulté, 70% du génome ont pu être séquencés en
2006.
Une partie du génome (21,17%, correspondant à la séquence complète du gène prM/M
et des séquences partielles des gènes C, E, NS1 et NS2a), a pu être comparée aux
séquences correspondantes de 17 autres souches de DEN-3. Le tableau ci-dessous
résume les différences en acides aminés observées entre la souche PF64 et les souches
des génotypes I, II et III.
Les premières analyses ont mis en évidence 2 modifications d’intérêt au sein des
protéines de structure :
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 34

- Un changement de polarité dans la région du gène prM/M : la substitution
prM/M-I31T correspond à un acide aminé hydrophile (T) pour la souche PF64 et
à un acide aminé hydrophobe (I) sur les autres souches. Une substitution
semblable a été décrite par Leitmeyer et al (1999) entre les souches de
dengue 2 du génotype américain (faiblement virulent) et celles du génotype
asiatique (impliqué dans de nombreux cas de DH/DSC). Cette substitution révèle
un changement de polarité (plus hydrophile) ainsi qu’un changement dans la
prédiction antigénique pour le génotype américain. Cependant, la structure
antigénique de prM étant inconnue, le rôle de cette substitution reste
indéterminé.
- Un changement de charge sur le gène E : La substitution E-E62G (domaine II)
conduit à un gain de charge positive pour la souche PF64. Lee et al. (2004) ont
montré qu’un gain de charge positive au sein de la protéine E augmente
l’affinité des virus de l’Encéphalite Japonaise et West Nile pour les
glycosaminoglycanes (GAG) ce qui pourrait jouer un rôle dans l’atténuation de
la virulence de ces virus. De plus, Lee et al (2006), suggèrent une atténuation
de la virulence du virus de la dengue suite à une augmentation de l’affinité de
liaison pour les GAG, notamment dans le domaine II de l’enveloppe. La
substitution observée sur la souche PF64 pourrait avoir les mêmes
conséquences.
Des analyses phylogénétiques sur ces séquences de DEN-3 ont également montré que les
génotypes I, II et III à l’origine des cas de DH/DSC présentent plus d’homologies entre
eux (9% de divergence au maximum) qu’avec le génotype IV (plus de 11,4% de
divergence) qui n’a lui n’a jamais été impliqué dans des épidémies graves.
• Conclusions et perspectives
Cette étude préliminaire a permis d’identifier, parmi les 15 substitutions en acides
aminés observées, 2 substitutions potentiellement impliquées dans l’atténuation de la
virulence des souches de DEN-3. Cette analyse doit être poursuivie sur la totalité du
génome de la souche PF64 afin d’identifier la totalité des substitutions d’intérêt.
Par ailleurs, la détermination du rôle effectif des substitutions observées nécessiterait
des expériences de mutagenèse dirigée (suivies de tests in vitro et/ou de
neurovirulence sur souriceaux nouveaux-nés) et des tests de modélisation de la
structure des protéines virales.
L’étude des différences éventuelles dans les structures secondaires des extrémités 3’
non codantes doivent également être envisagées.
2- Axe 2 : Surveillance de la dengue et autres arboviroses
Surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en Polynésie française
(Programme en partie financé par le Ministère de l’Outre-Mer)
• Participants et collaborateurs
V.M. CAO-LORMEAU, C. ROCHE, M. AUBRY, J. VIALLON, R. TEYSSOU, J. MARIE (LEM),
S. LASTERE (LABM), S. LONCKE (CHSP), M. GRANDADAM (IMTSSA, Marseille)
• Objectif
Ce programme a pour objectif la standardisation d’outils de détection pour la
surveillance de la dengue et autres arboviroses en Polynésie française (PF) : RT-PCR en
temps réel (TR) pour la détection des quatre sérotypes de dengue sur sérum ou lot de
moustiques; RT-PCR universelles (Flavivirus, Alphavirus et Phlébovirus) et RT-PCR
spécifiques des virus présentant un risque pour la PF (ex. Chikungunya).
Parallèlement à la standardisation de ces outils, une étude de séroprévalence réalisée
sur des prélèvements venant de différents archipels de PF devrait contribuer à
l’identification d’arbovirus introduits de façon ponctuelle ou circulant à bas bruit,
susceptibles d’être à l’origine de l’émergence de nouvelles épidémies.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 35

• Etude
Comme dans plus d’une centaine de pays des régions tropicales et intertropicales du
globe, la dengue constitue un problème de santé publique majeur en PF. Plusieurs
facteurs, propres à la situation géographique particulière de la PF, contribuent à
l’émergence régulière d’épidémies de dengue: (i) l’augmentation du pool d’individus
réceptifs, par les naissances et les mouvements de population ; (ii) les échanges
internationaux entre le Pays et des régions où ces virus circulent ou co-circulent,
contribuant à l’introduction d’un sérotype contre lequel une grande partie de la
population n’est pas immunisée.
Ces échanges internationaux constituent également un facteur de risque pour
l’introduction d’arbovirus, pour lesquels les espèces de moustiques (ou autres insectes)
établies en PF sont des vecteurs potentiels, et vis-à-vis desquels la population ne
possède aucune immunité protectrice. La récente épidémie de Chikungunya sur l’île de
la Réunion, due à des cas importés des Comores, illustre la menace que constituent les
arbovirus circulant dans des régions du monde avec lesquels un pays auparavant
indemne multiplie ses échanges.
Le présent programme de recherche, prévu sur une période de deux ans (2007/2008) et
qui a récemment reçu un accord d’aide de financement par le Ministère de l’Outre-Mer,
se décline en trois volets:
1. Elaboration d’un protocole pour la détection du virus de la dengue par RT-PCR
TR à la fois dans le sérum de patients et dans des lots de moustiques capturés.
2. Elaboration d’un protocole de RT-PCR universelles « Flavivirus, Alphavirus,
Phlébovirus » et de RT-PCR spécifiques.
3. Etude de séroprévalence d’arboviroses autres que la dengue dans la
population humaine de PF.
• Etat d’avancement des travaux/Résultats
1. Elaboration d’un protocole pour la détection du virus de la dengue par RT-PCR
TR à la fois dans le sérum de patients et dans des lots de moustiques capturés
Le programme a débuté par des essais destinés à l’élaboration d’un protocole de
RT-PCR TR (SybrGreen) pour la détection du DENV dans le sérum de patients.
Différents couples d’amorces et différents paramètres (ex. température
d’hybridation, hybridation/élongation en une seule étape, durée de chaque
étape, etc) ont été testés sur l’ iCycler iQ (Biorad).
Pour chaque couple d’amorces, la sensibilité de la RT-PCR TR a été comparée à
celle de la RT-PCR nichée actuellement utilisée pour le diagnostic (1 er tour d1/d2
= RT-PCR conventionnelle, 2 ème tour d1/TS1-4= PCR nichée).
a. Couple d1/d2: sur une gamme de dilution d’ARN extrait d’un sérum (++++ au
1 er tour de la RT-PCR nichée soit >10 6 eq DICT 50 *), la limite de détection en
RT-PCR TR est de 2,5.10 -1 (≥2,5.10 5 eq DICT 50 ); cette faible sensibilité,
comparée à celle de la RT-PCR nichée (10 2 eq DICT 50 ), pourrait s’expliquer par
la taille du fragment amplifié (511pb), supérieure à celle préconisée pour le
TR (10 2 eq DICT 50 ), soit en dessous de la sensibilité du 1 er tour
de la RT-PCR nichée.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 36

c. Couple DN-F / DN-R: la limite de détection obtenue sur une gamme de
dilutions réalisée à partir d’un pool d’ARN extraits de sérums DEN1 (04.12.06)
(++++) est de 10 -4 (>10 2 eq DICT 50 ), soit en dessous de la sensibilité du 1 er tour
de la RT-PCR nichée.
d. Couple d1/TS1 et d1/D1-R: les meilleurs résultats, en terme de sensibilité,
ont été obtenus avec ces couples d’amorces. Néanmoins, lors de la même
expérience et sur les mêmes échantillons, les courbes de fusion étaient de
plus grande amplitude avec le couple d1/TS1. La limite de détection obtenue
avec d1/TS1, sur une gamme de dilutions réalisée à partir du pool d’ARN
utilisé pour les amorces précédentes, est de 5.10 -5 (>5.10 1 eq DICT 50 ), soit une
sensibilité qui pourrait s’approcher de celle du 1 er tour de la RT-PCR nichée.
2. Elaboration d’un protocole de RT-PCR universelles « Flavivirus, Alphavirus,
Phlébovirus » et de TR-PCR spécifiques
En raison du risque potentiel non négligeable de l’introduction du virus
Chikungunya (CHIKV) en Polynésie française via La Réunion, il a été choisi de
mettre au point la détection de ce virus par RT-PCR RT prioritairement à la mise
au point des RT-PCR universelles.
Le protocole de détection du CHIKV (RT-PCR Taqman sur 3400 DNA synthesizer
d’Applied Biosystems) mis au point et transmis par l’IMTSSA, a servi de base pour
la mise au point des RT-PCR TR (Sybrgreen et Taqman) à l’ILM sur l’iCycler iQ
(Biorad). En l’absence de sérums positifs, un plasmide contenant la région du
CHIKV à amplifier nous a été fourni par l’IMTSSA. Nous avons procédé suivant
différentes étapes :
a- Vérification de la présence dans le plasmide de la séquence à amplifier
b- Transcription de la PCR M13-rM13 en ARN
Utilisation du kit Riboprobe-Combination System-T3/T7 (Promega)
c- RT-PCR CHIK SybrGreen.
• Conclusions et perspectives
Les premiers essais de RT-PCR TR DENV dans le sérum de patients ont permis l’obtention
d’une sensibilité équivalente à celle du 1 er tour de RT-PCR nichée (amorces d1/TS1).
Afin d’augmenter la sensibilité de la technique (suffisamment pour envisager son
utilisation pour le diagnostic), d’autres couples d’amorces vont être testés (Johnson et
al., 2005) en Sybrgreen et Taqman. Les essais de détection du DENV sur lots de
moustiques débuteront une fois que le protocole aura été défini sur sérum.
Les premiers essais de PCR TR Chikungunya, SybrGreen et Taqman, montrent une bonne
qualité du plasmide et un bon fonctionnement des amorces et de la sonde. La RT-PCR
SybrGreen donne une sensibilité limite comprise entre une dilution 10 -7 et 10 -8 de l’ARN
transcrit. Cet ARN pur est en quantité insuffisante pour pouvoir être titré en
spectrophotométrie UV et nous ne connaissons donc pas la sensibilité effective de la
technique. La courbe standard montre un coefficient de corrélation excellent (R 2 >
0.985) mais une efficacité de réaction trop faible (devrait être de 100% + 15%).
Nous devons poursuivre la mise au point de cette technique en :
1. titrant l’ARN transcrit par une technique fluorescente (Quant-iT RiboGreen RNA
Assay)
2. améliorant l’efficacité de la RT-PCR SybrGreen par le test de températures
d’hybridation inférieures à 60°C
3. en testant la RT-PCR Taqman.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 37

3- Axe 3 : Relations Virus de la dengue/Hôte humain
Ligands peptidiques altérés et immuno-pathogenèse de la dengue
• Participants et collaborateurs
C. ROCHE, R. TEYSSOU, I. CAZALENS (CIE), A. BELLEOUD (CIE), V. MOU (CIE),
J. LEININGER (Cellule prévention santé – Raiatea), A. IMRIE (Université d’Hawaii)
• Objectif
Ce programme a pour objectif la caractérisation de la réponse cellulaire T mémoire
anti-dengue vis-à-vis de sérotypes hétérologues, par l’étude in vitro des réponses
cellulaires T (cytolyse et profil cytokinique) de patients dont l’historique de dengue est
connu, en présence de peptides NS5 de sérotype homo- ou hétérologues.
• Etude
L’intérêt de développer cette étude en Polynésie française réside en l’absence connue
de co-circulation des différents sérotypes de dengue permettant l’étude des réponses
immunitaires consécutives à une infection d’un seul sérotype de virus de dengue, sans
que cet effet soit masqué par une infection endémique par les 4 sérotypes.
Dans ce contexte, chez des personnes dont la chronologie des infections par la dengue
en Polynésie française est connue, l’objectif de l’étude est de mesurer la réactivité des
lymphocytes T après stimulation avec des antigènes de virus de dengue hétérologues et
déterminer le profil de cytokines produites par les lymphocytes T spécifiques des virus
de dengue par des méthodes incluant ELISpot, relargage de 51 Cr, et marquage
intracellulaire de cytokines.
La sélection des personnes à inclure, les prélèvements (100 ml de sang hépariné),
l’isolement et la congélation des PBMC seront réalisés à l’ILM. Les cellules seront
ensuite expédiées en bonbonne d’azote liquide à l’Université de Hawaii où seront
réalisés l’ELISPOT pour mesurer la réponse IFNγ à une stimulation par des peptides
viraux, l’établissement de lignées et de clones T, l’immortalisation de lymphocytes B
(étude de cytolyse et typage des molécules CMH présentant les peptides donnant la
meilleure réponse).
• Etat d’avancement des travaux/Résultats
Une sélection d’une vingtaine de personnes ayant eu au moins 2 épisodes de dengue
confirmés par le laboratoire de l’ILM a été effectuée. La plupart de ces personnes ont
pu être contactées soit par le Centre de consultation médicale et d’investigation
épidémiologique (CIE) de l’ILM pour les personnes résidant aux Iles-du-Vent, soit par la
Cellule prévention santé des Iles-sous-le-Vent pour ceux résidant aux Iles-sous-le-Vent.
Les personnes ayant accepté de participer à cette étude feront un don de sang (100 ml
sur tube hépariné) en janvier 2007. Une feuille de consentement rédigée en français et
en tahitien leur sera soumise avant le prélèvement.
Par ailleurs, le séquençage des gènes E et NS5 de 4 souches de DEN2 (1996/1997) a été
réalisé de façon à identifier les peptides spécifiques des souches de dengue 2 ayant
circulé en Polynésie française.
• Conclusions et perspectives
Ce programme se poursuivra dès le début de l’année 2007 avec le recueil et le
traitement des prélèvements.
4- Axe 4 : Relations Virus de la dengue/Moustique vecteur
Protéines se liant au virus de la dengue dans les extraits de cellules cibles et de glandes salivaires de
moustiques vecteurs
• Participants et collaborateurs
V.M. CAO-LORMEAU, C. HERBAUT (Université de Polynésie française)
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 38

• Objectif
L’objectif de ce programme était d’identifier, chez le moustique vecteur, des protéines
capables de se lier au virus de la dengue et, par cette propriété, susceptibles de jouer
un rôle dans la dissémination virale chez le vecteur et/ou sa transmission à l’hôte
humain.
• Etude
La dissémination du virus de la dengue (DENV) dans les tissus du moustique et sa
transmission à l’homme via la salive infectante sont deux événements clés du cycle de
transmission. Afin d’identifier les protéines susceptibles d’être impliquées dans la
dissémination virale chez le vecteur, nous avons recherché celles capables de se lier au
DENV, dans des extraits de cellules C6/36 d’Aedes albopictus et de glandes salivaires
(EGS) d’Ae. aegypti et d’Ae. polynesiensis. Ces protéines sont des « candidats » au rôle
de récepteur au DENV; une cible de choix dans le cadre de stratégies de blocage de la
transmission virale. De plus, les EGS contenant à la fois des protéines du tissu de la
glande et des protéines salivaires, notre étude propose de premières pistes pour
l’identification de complexes « DENV/protéine salivaire », susceptibles d’interagir avec
la réponse immunitaire de l’hôte.
• Etat d’avancement des travaux/Résultats
En utilisant la technique du Virus Overlay Binding Assay (VOPBA), nous avons recherché,
dans les trois types d’extraits, la présence de protéines capables de se lier aux souches
de référence des quatre sérotypes de dengue ainsi qu’à un isolat clinique de DEN4
(provenant d’un patient ayant été infecté au cours de l’épidémie de DEN4 de 1979 en
PF). Plusieurs protéines ont ainsi été détectées dans les extraits de cellules C6/36 (82,
70, 48, 46, 27 kDa) et les EGS d’Ae. aegypti (77, 67, 58, 54, 37 kDa). Dans les EGS
d’Ae. polynesiensis (67, 56, 54, 50, 48 kDa) les expériences de VOPBA ont montré la
présence de protéines capables de se lier aux souches de référence des virus DEN1 et
DEN4 (pour des raisons de quantité de matériel biologique, seuls ces sérotypes ont pu
être testés).
Les résultats de ce travail ont fait l’objet d’une soutenance de thèse de Doctorat de
l’Université de la Polynésie française, présentée par V.M. Cao-Lormeau, le 30 mars
2006: Virus de la Dengue et Moustiques vecteurs – Protéines se liant au virus de la
Dengue dans les extraits de cellules cibles et de glandes salivaires de moustiques
vecteurs.
• Conclusions et perspectives
Les résultats obtenus sur les extraits de cellules C6/36 complètent ceux précédemment
publiés par d’autres équipes, dont certains récemment (Mercado-Curiel et al., 2006). Ils
devraient contribuer à la caractérisation d’un récepteur aux quatre sérotypes de dengue
sur le modèle cellulaire C6/36, puis l’extension de l’étude à des tissus du vecteur Ae.
albopictus (estomac, glandes salivaires).
Concernant la détection de protéines capables de se lier au DENV dans les extraits de
glandes salivaires d’Ae. aegypti et Ae. polynesiensis, la perspective immédiate
engendrée par ce travail est la caractérisation biochimique et fonctionnelle de ces
protéines.
- D’une part, l’identification de protéines issues du tissu de la glande salivaires
(membrane basale ou cellules épithéliales) et capable de se lier au DENV est une
première étape dans l’identification d’un récepteur au DENV, soit un élément clé
dans le cadre de nouvelles approches anti-dengue (réduction de la compétence
vectorielle, nouvelles stratégies vaccinales,…).
- D’autre part, l’identification de protéines salivaires complexées au DENV et
l’existence de tels complexes à la première étape de l’infection humaine
contribuerait à la proposition de nouvelles hypothèses sur le jeu des interactions
« virus/salive du vecteur/système immunitaire de l’hôte » et son impact sur
l’infection.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 39

Les activités de santé publique
1- Comité dengue
• Participants
R. TEYSSOU, C. ROCHE, V.M. CAO-LORMEAU
Participation aux réunions du Comité dengue (ILM, DS, CHSP) : réflexion sur les améliorations à
apporter au système de réseau sentinelle pour la dengue (fiches de renseignements patients
pour le diagnostic; coordination entre l’ILM et les autres laboratoires d’analyses pour la
surveillance).
2- Surveillance de la dengue
• Participants
C. ROCHE, J. VIALLON, M. AUBRY, N. GUITARD (LABM), S. LASTERE (LABM)
• Etude
La surveillance de la dengue s’est poursuivie au LVM jusqu’à la prise de fonction au LABM du
Dr Stéphane LASTERE. Le LVM a conservé la réalisation de l’épidémiologie moléculaire.
Suite à la recrudescence des cas de dengue en fin d’année, le séquençage de 3 souches de
D1 isolées en 2006 a été réalisé pour vérification du génotype en cause, 5 ans après
l’épidémie.
• Résultats
Un arbre phylogénétique sur le gène E de la DEN-1 a été construit selon les modalités
habituelles. Cet arbre montre que les 3 souches isolées en Polynésie française en 2006
(PF311006-242, PF201106-32, PF141006-206) appartiennent au génotype IV, tout comme la
souche isolée en Polynésie française en 2001 (PF01). Elles ont cependant légèrement évolué
par rapport à cette dernière.
• Conclusions
Ce résultat laisse supposer qu’il n’y a pas eu d’introduction d’un nouveau génotype durant
les 5 dernières années. Cependant, il est nécessaire de faire cette étude sur de plus
nombreuses souches, isolées de 2001 à 2006, pour pouvoir l’affirmer.
Le laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
L’équipe
• Mireille CHINAIN, chef de service
• Taiana DARIUS, chargée de recherche
• Philippe CRUCHET, technicien de recherche
• Taina REVEL, technicien de recherche
• André UNG, technicien de recherche
• Mote TCHOU FOUC, plongeur, aide-technicien
Les activités de recherche
Les programmes de recherche du Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques (LMT) ont
trait aux efflorescences algales potentiellement dangereuses (ciguatéra) et à leurs conséquences sur
la chaîne alimentaire. Ils se déclinent selon 2 principaux axes :
l'étude de la micro-algue à l'origine de l'intoxication ciguatérique, le dinoflagellé
Gambierdiscus,
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 40

le développement et la validation de différentes méthodes de détection des toxines
ciguatériques (CTXs), pour une meilleure gestion du risque ciguatérique in situ.
1- Etude du dinoflagellé Gambierdiscus
Elle a pour but de mettre au point des sondes moléculaires permettant la détection des
différentes espèces de Gambierdiscus, et plus particulièrement des lignées dangereuses
(toxiques) de cette micro-algue dans le milieu naturel. La caractérisation de sondes nucléiques
et le recours à des anticorps ou des marqueurs fluorescents sont quelques-unes des voies qui ont
été explorées.
Détection des différentes espèces de Gambierdiscus
• par sondes nucléiques : cette méthode consiste à élaborer des amorces ciblant l'opéron
ribosomal de Gambierdiscus - plus particulièrement les domaines hypervariables D1-D3
et D8-D10 de la sous-unité 24S rDNA -, et utilisables en PCR classique ou en temps réel.
Trois couples d'amorces, spécifiques des espèces G. polynesiensis, G. toxicus et
G. yasumotoi, sont d'ores et déjà disponibles, en revanche, la spécificité des amorces
ciblant les espèces G. pacificus et G. australes nécessite encore d'être améliorée.
En 2007, notre priorité sera de mettre au point et d'optimiser la technique de PCR
quantitative en temps réel sur ces sondes, afin de l'appliquer à la quantification des
différentes lignées de Gambierdiscus directement au sein des efflorescences naturelles
de cette micro-algue.
• criblage par des FITC-lectines : les lectines sont des molécules capables de se lier aux
glycoprotéines et glycolipides de surface de bon nombre de cellules. Couplées à la
fluorescéine isothiocyanate (FITC), elles constituent d'excellents marqueurs cellulaires.
L'affinité de 11 FITC-lectines commerciales pour 12 souches de Gambierdiscus,
appartenant aux espèces G. toxicus, G. polynesiensis, G. pacificus et G. australes, a été
comparée par microscopie en fluorescence. Les lectines FITC-HPA (issu de Helix
pomatia); FITC-WGA (Triticum vulgaris); FITC-PEA (Pisum sativum); et FITC-UEA (Ulex
europaeus) ont montré une excellente affinité pour les souches de G. australes et G.
polynesiensis. Un marquage ultérieur avec FITC-LcH (Lens culinaris) ou FITC-BS1
(Bandeiraea simplicifolia) permet ensuite de différencier ces 2 espèces entre elles. A
l'inverse, les espèces G. pacificus et G. toxicus n'ont montré que peu ou pas d'affinité
pour les lectines testées, à l'exception de FITC-DBA (Dolichus biflorus) et FITC-ConA
(Canavalia ensiformis). Toutefois, ces 2 lectines n'ont pas permis de différencier ces 2
espèces entre elles qui apparaissent très proches génétiquement, comme le confirment
nos données de séquences. Leur criblage au moyen de nouvelles lectines sera donc
poursuivi en 2007. De par sa mise en œuvre plus aisée que la PCR, cette méthode de
détection nous paraît la mieux adaptée à une utilisation en routine dans les îles
éloignées de Polynésie désireuses de surveiller le risque ciguatérique dans leur lagon.
Détection des lignées cellulaires toxiques de Gambierdiscus
• par sondes nucléiques : cette méthode consiste à élaborer des amorces ciblant les
gènes codant pour le complexe enzymatique Polykétide Synthase (PKS) impliqué dans la
voie de biosynthèse des CTXs. Déjà bien décrit chez les bactéries Actinomycètes et les
champignons, ce complexe reste toutefois mal connu chez les dinoflagellés. Une
consultation préalable des banques de données relatives aux gènes PKS déjà séquencés
sera initiée en 2007, afin de nous éclairer sur le degré de conservation de ces séquences
d'une espèce à l'autre. Des amorces "dégénérées" adaptées aux dinoflagellés seront
ensuite élaborées, en vue d'un criblage par PCR des lignées cellulaires toxiques et
atoxiques disponibles dans la souchothèque de l'ILM.
• au moyen d'anticorps anti-CTXs : cette méthode consiste à cribler les homogénats
cellulaires de Gambierdiscus (lysats totaux ou fractions subcellulaires) au moyen
d'anticorps anti-CTXs. Ce volet fait partie intégrante d'un contrat de recherche signé le
1 er mars 2006 entre l'ILM et l'Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie (IPNC) (cf
1 er Rapport d'étape portant sur la "Recherche et mise au point de tests de détection
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 41

permettant la prévention de la ciguatéra; tests pouvant être utilisés au niveau des
algues, des poissons ou chez l'homme", mars 2007)
2- Développement et validation des méthodes de détection des CTXs
Trois méthodes de détection in vitro pouvant, chacune, déboucher sur un test de très haute
sensibilité et facilement automatisable, ont été explorées :
Test "interaction ligand-récepteur (ILR)"
Il permet de doser les CTXs présentes dans les cellules de Gambierdiscus ou la chair des
poissons, par mesure de leur affinité vis-à-vis de récepteurs membranaires (Canal-Na + )
isolés de cerveaux de rats. Utilisé en routine au laboratoire, sa validation à grande échelle a
débuté dès 2004 dans le cadre des 2 essais-pilotes d'évaluation du risque ciguatérique à
Tubuai et Nuku Hiva.
En 2006, il a essentiellement servi à réaliser le criblage toxinique d'une trentaine de
nouvelles souches de Gambierdiscus et de 61 échantillons pisciaires (45% carnivores vs. 55%
d'herbivores) originaires de Moruroa. Nos résultats indiquent qu'entre mars 2005 et mars
2006, un fort pourcentage des poissons du lagon de Moruroa présentait encore une toxicité
résiduelle (21% seulement de poissons testés atoxiques) alors même que la totalité des
souches de la micro-algue s'est avérée atoxique.
En revanche, nous n'avons que peu progressé dans nos tentatives de déterminer le seuil des
valeurs ILR à partir desquelles le poisson testé va effectivement provoquer des symptômes
d'intoxication chez l'homme. Une des difficultés majeures rencontrées dans ce type d'étude
est l'impossibilité, souvent, de récupérer les restes des poissons à l'origine d'intoxications
chez les patients, en vue d'analyses ultérieures. Un appel à patients intoxiqués + relief des
repas par la voie des médias, en collaboration avec la Direction de la Santé, est prévu en
2007.
Le potentiel du test ILR pour la recherche de substances actives dans le traitement de la
ciguatéra a également été abordé en 2006, en collaboration avec l'Institut pour la
Recherche et le Développement (IRD) de Nouvelle-Calédonie. Des essais préliminaires
réalisés sur les extraits d'une quinzaine de plantes issues de la pharmacopée traditionnelle
calédonienne (dont Argusia argentea ou faux tabac) ont donné des résultats encourageants
pour au moins cinq d'entre elles. Il convient maintenant de les confirmer après
fractionnement bioguidé des extraits bruts d'intérêt.
Test de cytotoxicité
Il permet de doser les CTXs algales ou pisciaires, par mesure de leurs effets sur la viabilité
de lignées cellulaires en culture : les Neuro-2A sur laquelle le test a été mis au point au
laboratoire, et plus récemment les HEK-µ1, génétiquement modifiée pour exprimer
préférentiellement un nombre élevé de canaux Na + . Ce volet n'a que peu avancé en 2006 en
raison notamment :
• de difficultés croissantes à s'approvisionner en certains réactifs (e.g. vératridine et
ouabaïne),
• d'un vieillissement de la lignée Neuro-2A entretenue depuis plusieurs années à L’ILM et
qui nécessite d'être renouvelée,
• d'un rendement insuffisant des cultures de la lignée HEK-µ1, qu'il est toutefois possible
d'améliorer grâce à l'utilisation de fioles de cultures présentant une meilleure qualité
d'adhésion.
Immuno-détection des CTXs
Contrairement aux 2 tests précédents qui permettent de distinguer les différentes CTXs en
fonction de leur toxicité, ce type de détection est basée sur une reconnaissance structurale
des CTXs, au moyen d'outils produits par immunochimie classique i.e. anticorps polyclonaux
(Ac) ou monoclonaux (Acm), ou issus du génie génétique i.e. anticorps recombinants (AcR).
L'état d'avancement de ces travaux est détaillé dans le 1 er rapport d'étape du contrat de
recherche ILM-IPNC portant sur la "Recherche et mise au point de tests de détection
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 42

permettant la prévention de la ciguatéra; tests pouvant être utilisés au niveau des algues,
des poissons ou chez l'homme", mars 2007.
Les activités annexes et prestations de service
Un certain nombre d'activités ont été poursuivies en routine, en 2006, parmi lesquelles la
production in vitro de CTXs algales (notamment CTX-3C et proches analogues) et leur purification
par technique HPLC, afin de continuer à étoffer la banque de standards de l'ILM.
Par ailleurs, le LMT continue d'assurer pour le compte de particuliers la recherche de toxicité dans
divers échantillons pisciaires.
Enfin, le laboratoire effectue des analyses d'échantillons d'eau ainsi que des analyses toxicologiques
pour le compte du Dr C. GASPAR, mandatée par le Ministère du Développement durable pour des
suivis vétérinaires sur des tortues marines souffrant d'une pathologie dont la cause reste encore
indéterminée.
L’état d’avancement des collaborations et/ou projets de collaboration
1- Avec l'IPNC (Laboratoire des Biotoxines, Dr S. Pauillac)
Se référer au 1 er rapport d'étape du contrat de recherche ILM-IPNC portant sur la "Recherche et
mise au point de tests de détection permettant la prévention de la ciguatéra; tests pouvant
être utilisés au niveau des algues, des poissons ou chez l'homme", mars 2007.
2- Avec l'IRD (Laboratoire de Pharmacochimie des Substances Naturelles et
Pharmacophores Redox, Dr D. Laurent)
Un projet de collaboration avec l'UMR 152 IRD-Université Paul Sabatier Toulouse III est
actuellement à l'étude. Il a pour objet de clore le triangle conventionnel ILM-INPC-IRD,
contribuant ainsi à fédérer l'ensemble des équipes de recherche françaises travaillant sur la
ciguatéra dans la zone Pacifique. Les thèmes de recherche qui seront privilégiés dans le cadre
de cette collaboration sont : i) l'implication des cyanobactéries et des invertébrés dans le
phénomène ciguatéra, ii) la gestion du risque ciguatérique et l'aide à la filière-pêche et iii) la
recherche de substances actives dans la pharmacopée traditionnelle pour le traitement de la
ciguatéra.
Le laboratoire de recherche en entomologie médicale
L’équipe
• J. MARIE, chef de service
• Marc FAARUIA, technicien entomologiste
• Michel GERMAIN, aide-technicien
• Albert TETUANUI, aide-technicien
• Henri FROGIER, manœuvre captureur
En raison d’une passation de consignes brève après le départ à la retraite du Dr Yves SECHAN
responsable du Laboratoire de recherche en entomologie médicale (LEM) et de l’incertitude de son
remplacement, un seul nouveau programme de recherche a été entrepris en 2006.
L’année écoulée a essentiellement été consacrée :
• à la poursuite du recueil des données entomologiques du programme PacElf sur l’île de
Tahuata,
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 43

• à l’évaluation des propriétés chimiques des extraits naturels sur les moustiques vecteurs,
dans le cadre d’un programme de recherche en collaboration avec le LSN,
• à l’élaboration de 3 projets de recherche pour l’année 2007.
Les activités de recherche
1- Recherche, dans la biodiversité de la Polynésie française, de substances naturelles
possédant une activité répulsive/attractive vis-à-vis de moustiques vecteurs de maladies
tropicales
Les tests d’activité attractive/répulsive et insecticides : ces effets des différents extraits de
plantes ont été et seront évalués et comparés sur deux espèces de moustiques. L’année 2006 a
permis de calibrer et mettre au point la technique du test en tunnel sur Aedes aegypti. Les
résultats, actuellement en cours de rédaction, seront ajoutés aux autres données positives en
répulsion de vecteurs. Les essais sur Aedes polynesiensis ont montré une plus grande fragilité de
cette espèce comparée à sa voisine.
Le dispositif fonctionne de la manière suivante :
- 100 moustiques femelles du genre Aedes sont déposés à jeun dans une cage dite de départ.
- Les effectifs sont comptabilisés de part et d’autre d’une moustiquaire imprégnée qui sépare
2 compartiments, après 2 heures d’expérimentation : le compartiment C1 correspondant au
lâcher initial et le compartiment C2 abritant un rat qui sert d’appât.
- Une observation à T = 1H00 informe du caractère répulsif ou non et de la volatilité de
l’huile après une heure d’exposition.
On comptabilise ensuite les moustiques :
- gorgés ou non gorgés
- vivants ou morts
- d’un côté ou de l’autre de la moustiquaire imprégnée.
A titre d’exemple, une fraction de miri, basilic, codée sous la dénomination X4 et X1 montre
dans la figure 1 ci-dessous un fort pouvoir répulsif sur Aedes aegypti comparé à la population
témoin testée. On observe un passage de 88% chez le témoin au cours de la première heure
contre 1% chez X1 et X4. La deuxième heure, la substance demeure encore active puisqu’elle ne
laisse passer que 10% de femelles tandis que le passage témoin montre une diminution en C2
due au retour de quelques individus en C1.
% de passage des moustiques femelles
en compartiment C2
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
0H 1H 2H 3H 4H
Témoin
X1
X4
Figure 1 : Pouvoir répulsif du miri tahiti(X1 et X4)
en fonction du temps d’exposition du tulle imprégné
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 44

Pour échantillonner les populations adultes des moustiques vecteurs, les collectes sur appât
humain constituent encore ce jour la seule technique fiable (standard OMS et seule méthode
actuelle disponible). Pour des raisons d’efficacité et surtout d’éthique, il est indispensable et
urgent de remplacer l’homme en tant qu’appât. Cette étude doit se poursuivre en 2007 et 2008,
en collaboration avec le LSN. Elle consiste à valider le concept de collecte par des moyens
mécaniques afin d’évaluer les densités de moustiques vecteurs et éventuellement lutter contre
ceux-ci. A cette fin, l’efficacité de plusieurs types de pièges et de plusieurs substances
olfactives attractives est testée. (Voir aussi LSN)
2- Elimination d’une population d’Aedes polynesiensis, vecteur principal de la filariose
lymphatique, dans un site endémique
Au mois de novembre a débuté ce programme en collaboration avec le LPM, le National Institute
of Health (USA) et l’Université du Kentucky (USA).
Ce projet financé par le National Institute of Health et l’Université du Kentucky a pour but de
tester sur le terrain (3 motu de l’île de Raiatea) une stratégie d’éradication du moustique Aedes
polynesiensis, vecteur principal de la filariose lymphatique.
L’hypothèse à tester, préalablement élaborée et modélisée en laboratoire est la suivante : des
lâchers de moustiques mâles présentant une incompatibilité cytoplasmique peuvent d’abord
réduire puis éliminer les populations naturelles d’Ae. polynesiensis.
Les travaux sont planifiés sur 5 ans (2007-2012) :
Objectif 1 : Elevage en cages au laboratoire (année 1)
Test initial de stratégie de contrôle dans de petites cages au LEM : tester les taux de lâchers
nécessaires pour viser l’éradication. Etude comparée des compétences vectorielles de la
souche « modifiée en Wolbachia » et de la souche sauvage.
Objectif 2 : Caractérisation du site d’étude (année 1)
Evaluation des densités des populations de vecteurs sur les motu, prévalence de l’infection
filarienne.
Objectif 3 : Tests en cages sur le terrain (année 2)
Répétition des tests de stratégie de contrôle mais dans de grandes cages sur site en utilisant
des moustiques collectés sur place.
Objectif 4 : Développement d’autres souches de moustiques « modifiées en Wolbachia »
(année 2)
Souche « back up ».
Objectif 5 : Tests de terrain (années 3 à 5)
Lâchers sur le motu ; suivi des populations de vecteurs (densités) ; comparaison aux données
de l’objectif 2 (réduction de population ?) ; comparaison motu (site expérimental) et île
haute (site contrôle) ; détecter s’il y a des migrations du motu vers l’île haute.
Objectif 6 : Evaluation après essai (années 4 et 5)
Suivi des densités de populations après la fin des lâchers ; si réapparition de la population
d’Ae. polynesiensis, recherche de la cause : immigration, persistance d’œufs dormants ?
Nouvelle évaluation de la prévalence de l’infection filarienne, comparaison aux données de
l’objectif 2.
3- Programmes en projet
L’année a également été consacrée à l’élaboration de deux nouveaux projets de recherche :
• un programme de « surveillance des arboviroses », en partenariat avec le LVM,
• un projet international de « lutte anti-vectorielle intégrée », en collaboration avec
l’Université d’Oxford (RU), l’Université du Kentucky (USA), les Universités de Cairns et
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 45

Sydney (Australie), l’Organisation mondiale de la santé et la Fondation Bill et Melinda
Gates.
Les activités annexes
L’accueil en stage d’un étudiant polynésien de l’Université de l’Utah (USA) a été l’occasion d’une
mise à jour de la collection de référence entomologique de la Polynésie française.
Ce stage a visé :
• la remise à niveau des connaissances,
• l’identification des spécimens inconnus et leur classement par provenance,
• la conception d’une base de données à partir des échantillons de la collection.
La durée de ce stage (11 semaines) et les difficultés rencontrées sur le plan météorologique n’ont
autorisé qu’un nombre limité de collectes. Cette période a été judicieusement mise à profit par
l’étudiant pour réaliser l’étude bibliographique, l’examen et le classement de la collection
existante.
Le travail de terrain a permis de collecter des espèces vraisemblablement non encore décrites.
Le laboratoire de recherche sur les substances naturelles
L’équipe
• Isabelle VAHIRUA-LECHAT, chef de service
• Fanny ADAM, chargé de recherche
• Yves MITERMITE, technicien de recherche
L’année 2006 a été très productive pour le Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
(LSN) qui a présenté les résultats finaux du programme de recherche « Valorisation de la pêche
thonière en Polynésie française : teneur en oméga-3 de la graisse orbitale », financé par le
Ministère de l’Outre-Mer et le Service de la Pêche.
Les premiers résultats du programme « Recherche, dans la biodiversité de la Polynésie française, de
substances naturelles possédant une activité répulsive/attractive vis-à-vis de moustiques vecteurs
de maladies tropicales » ont été obtenus et affichés à l’occasion du Colloque International Plantes
Aromatiques et Médicinales qui s’est déroulé à Papeete du 11 au 13 juillet 2006, avec une
communication orale présentée par la responsable du LSN et quatre posters. Le financement partiel
de ce programme par l’EPAP a permis de recruter pour une période de 11 mois un ingénieur
chimiste. Cet apport en personnel supplémentaire permet d’élargir les actions de recherche de
l’équipe du LSN.
Il faut également souligner pour cette année 2006 l’importante action de formation du LSN qui a
accueilli et formé à la chromatographie en phase gazeuse cinq étudiantes : 2 ingénieurs stagiaires
du GEPSUN, une étudiante en licence de biologie de l’Université de Pau, une étudiante en Master 1
de chimie de l’Université Claude Bernard de Lyon et une doctorante en chimie de l’Université de
Bretagne occidentale.
Le LSN s’est vu proposer en fin d’année une très intéressante collaboration scientifique avec le
Laboratoire d’écophysiologie et de biotechnologie des halophytes et des algues marines (LEBHAM)
de l’Institut universitaire européen de la mer (IUEM) de l’Université de Bretagne occidentale (UBO).
Un programme de coopération, élaboré par les responsables des deux laboratoires, a été retenu par
le Conseil Scientifique de l’UBO puis validé par son Conseil d’administration. Cette collaboration
prévue pour 4 années vise à identifier de nouveaux médicaments à fort potentiel thérapeutique
dans le domaine de la cancérologie et de l’immunologie par une approche innovante de criblage de
molécules polynésiennes d’origines terrestre et marine. Cette collaboration s’inscrit dans la double
mission de l’ILM en matière de recherche : le domaine biomédical et la valorisation du patrimoine
naturel de la Polynésie française.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 46

Les activités de recherche
1- Valorisation de la pêche thonière en Polynésie française : teneur en oméga-3 de la
graisse orbitale
La pêche thonière, quatrième secteur économique en Polynésie française, représente
5.000 tonnes de poisson débarquées en 2005, année creuse en raison de conditions
environnementales défavorables. Les productions ont cependant atteint, en 2001, plus de
10.000 tonnes de poisson débarqué congelé (poisson entier destiné aux conserveries, longes de
thon congelées à bord et steaks pour les marchés américain et européen) ou frais (poisson
entier vidé).
Les 3 espèces ciblées par cette pêche sont le germon (Thunnus alalunga) avec 60% des captures,
le thon à nageoires jaunes (Thunnus albacares) avec 10% des captures et le thon obèse (Thunnus
obesus) avec 7% des captures.
Le poisson, lorsqu'il est détaillé en filet, génère 45% de déchets, ce qui représente
annuellement environ 800 tonnes à terre (regroupées au Port de pêche de Papeete) et
1.500 tonnes en mer (avec un potentiel de 1.500 tonnes à terre et 3.000 tonnes en mer).
Aujourd’hui, ces déchets sont évacués en mer, à un coût de 8,5 Fcfp/kg pour les mareyeurs
(soit 0,07 €/kg).
Ils sont constitués de la tête, de l’arête centrale, de la peau et des nageoires. Certains
éléments de ces déchets peuvent être valorisés. Le Service de la Pêche a passé une convention
avec l'IFREMER afin de tirer un bilan de la deuxième conférence sur la valorisation des sousproduits
de la pêche (Anchorage - Alaska du 9 au 15 novembre 2002) puis a lancé, auprès de la
société IDMER, une étude sur les possibilités de traiter et valoriser ces déchets (IDMER, 2003)
L’objectif recherché était un coût nul pour les mareyeurs.
Plusieurs solutions se sont dégagées de ces études dont celle à plus forte valeur ajoutée portait
sur la valorisation de la graisse des yeux de thon, riches en acides gras oméga 3. Comme
l’écrivent Panggat et Rives (1997) les acides gras n-3 sont principalement l’EPA et le DHA qui
sont synthétisés par les algues unicellulaires marines (phytoplancton). Ces acides gras se
transmettent dans la chaîne alimentaire. Ils ne sont pas synthétisés par les animaux terrestres
et l’homme et sont donc apportés par le régime alimentaire.
Il y a plus de vingt ans, Dyerberg et Bang (1978) avaient montré qu’une consommation très
élevée d’acides gras oméga 3 chez les Inuits du Groenland était sans doute à l’origine d’une
absence de mortalité par coronaropathie.
Les fonctions et mécanismes par lesquels les oméga 3 (acides gras polyinsaturés ou AGPIs)
exercent leurs effets physiologiques ont, depuis, été très étudiés dans les domaines de la
nutrition, de la prévention des maladies et de la thérapeutique.
La consommation de poisson, et plus particulièrement des oméga 3 qu’il contient, est
actuellement reconnue comme d’un intérêt majeur en ce qui concerne la prévention des
maladies cardiovasculaires. Elle est associée à une diminution des concentrations en
triglycérides (TG) du plasma, lesquels favorisent le développement de l’athérosclérose et des
infarctus du myocarde. Plusieurs études indiquent qu’une alimentation riche en oméga 3 réduit
la réponse postprandiale aux aliments riches en graisses saturées, d’où un effet positif sur le
métabolisme des TG.
On reconnaît aussi à ces oméga 3 des propriétés relatives à un fonctionnement optimal du
cerveau, à l’amélioration de la santé de l’œil et de la peau, au développement du tissu cognitif
des enfants, à la protection contre certains cancers. Enfin, des effets thérapeutiques sont
associés à la consommation d’oméga 3 dans les cas de dépressions et de maladies auto-immunes
(lupus, psoriasis, arthrite).
De nombreux séminaires sur les quantités journalières recommandées en acides gras n-3 et n-6
ont été tenus de par le monde par des médecins, nutritionnistes, enseignants tels que : « Fats
and lipids : How to balance fat intake wisely ? », « What available foods contain omega 3 and
omega 6 fats ? » organisés par l’Institut des omega-3 à Bethesda. L’American Heart Association
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 47

(AHA) recommande aujourd’hui aux patients atteints de maladies des coronaires de consommer
1g d’EPA+DHA par jour, préférentiellement issu de poissons gras. Le NIH International Workshop
propose également des recommandations pour les adultes (Tableau 1). Ces recommandations
prennent en compte les ratios oméga 6 et oméga 3, le risque lié aux acides gras trans ainsi
qu’une limite supérieure pour les doses quotidiennes d’acides gras saturés pour les adultes.
Plus encore que d’autres produits alimentaires, c’est donc de manière tout à fait légitime qu’ils
peuvent bénéficier d’une prise en compte de leurs caractéristiques nutritionnelles.
Au niveau du public, il existe actuellement une réelle prise de conscience des effets bénéfiques
des oméga 3 et un engouement s’est manifesté vis-à-vis des huiles marines (Suzuki, 1993). Sont
apparues sur le marché des formes encapsulées d’oméga 3 d’un coût parfois prohibitif. Aussi,
toutes les sources de ces acides gras sont recherchées (Arteburn et al., 2006 ; Green et al.,
2006).
La fabrication industrielle d’oméga 3 à partir d’œil de thon, en Polynésie française, par
l’utilisation de technologies « propres » d’extraction de ces acides gras d’intérêt biologique,
permettrait donc, tout en valorisant un produit aujourd’hui gaspillé, de participer au traitement
des déchets de la pêche, d’abaisser cette charge pour les mareyeurs et de créer une activité
génératrice d’emploi.
Rappelons également que l'activité économique de la Polynésie française présente de
nombreuses caractéristiques des économies insulaires des DOM-TOM : le commerce extérieur
tient une place prépondérante dans un ensemble économique qui importe beaucoup et exporte
peu. La balance commerciale polynésienne est fortement déficitaire et rend plus nécessaire que
jamais la recherche de débouchés maîtrisés et à haute valeur ajoutée sur les marchés
internationaux.
L’objectif de ce projet de recherche était de qualifier et quantifier les oméga 3 de la graisse
orbitale de thons pêchés par la flotille polynésienne. Les résultats obtenus sont en résumé les
suivants :
Les profils de composition en acides gras des graisses orbitales des différentes espèces de
thons traités demeurent constants avec une teneur en acide docosahéxaènoïque (DHA) très
élevée pour toutes les espèces traitées. Par ordre décroissant, le thon germon en contient
le plus avec 275,56 mg/g de lipides en moyenne, puis le thon à nageoires jaunes avec
258,07 mg/g de lipides et enfin le thon obèse avec 254,15 mg/g de lipides (moyenne pour
l’ensemble des thons 262,60 mg/g de lipides).
Les acides gras saturés représentent en moyenne 263,86 mg/g de lipides tandis que les
acides gras monoinsaturés représentent en moyenne 60,55 mg/g de lipides.
Les acides gras polyinsaturés représentent en moyenne 360,09 mg/g de lipides.
Les acides gras n-6 insaturés sont présents en faible quantité (en moyenne 33,96 mg/g de
lipides) tandis que les acides oméga 3 y sont présents en quantité environ dix fois
supérieure (moyenne de 330,60 mg/g de lipides).
Le tableau 1 récapitule les teneurs en acides gras en mg par gramme de lipide de graisse
orbitale.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 48

Tableau 1 : Teneur en acides gras des lipides des graisses orbitales de thons
AG mg/g lipides gr. orb. de thon Obèse Germon
A nageoire
jaune
Moyenne
acides gras mg mg mg
C14:0 acide myristique 23,97 23,19 26,64 24,60
C15:0 acide pentadécanoique 7,39 7,14 7,97 7,50
C16:0 acide palmitique 176,33 170,00 193,76 180,03
C18:0 acide stéarique 44,75 43,65 66,79 51,73
C16:1 acide palmitoleique 54,57 48,75 44,58 49,30
C18:1n9 acide cis-oléique 199,68 158,95 139,80 166,14
C20:1n9 11,85 13,43 8,47 11,25
C18:2n6 acide linoléique 6,84 12,10 10,23 9,72
C18:3n6 acide g-linolénique 1,63 3,65 1,83 2,37
C18:3n3 acide a-linolénique 3,60 2,18 3,09 2,95
C20:4n6 arachidonic 26,68 18,88 27,14 24,24
C20:5n3 EPA 60,81 72,78 61,55 65,05
C22:6n3 DHA 254,15 275,56 258,07 262,60
Somme n-6 polyinsaturés 33,52 30,98 37,37 33,96
18:2n6 6,84 12,10 10,23 9,72
20:4n6 26,68 18,88 27,14 24,24
Somme n-3 polyinsaturés 318,56 350,52 322,72 330,60
C18:3n3 acide a-linolénique 3,60 2,18 3,09 2,95
C20:5n3 EPA 60,81 72,78 61,55 65,05
C22:6n3 DHA 254,15 275,56 258,07 262,60
Rapport Sn-6/Sn-3 0,10 0,09 0,12 0,10
Somme saturés 252,44 243,98 295,16 263,86
Somme monoinsaturés 66,42 62,18 53,05 60,55
Somme polyinsaturés 352,08 381,50 360,09 364,56
En conclusion, notre étude a abouti à la quantification systématique des 13 acides gras majeurs
présents dans les lipides étudiés, ces acides gras représentant plus de 80% des acides gras
totaux. Un certain nombre d’acides gras demeurent non identifiés dans nos échantillons. Il
serait intéressant de lever cette inconnue par des analyses fines d’identification par
spectrométrie de masse pour notamment vérifier l’absence de contamination bactérienne.
Le tableau 1 de synthèse regroupant les valeurs d´acides gras polyinsaturés à longue chaîne en
fonction des espèces étudiées montre en première approche une bonne valeur de ces n-3 chez
le thon obèse tout particulièrement ainsi qu’une possibilité d´utilisation de cette graisse
orbitale presque telle quelle (sans concentration des acides gras) vu les concentrations
observées. Cela faciliterait grandement l’extraction mais il faut toutefois remarquer que le thon
obèse n’est pas l´espèce majoritaire dans les captures.
Nos analyses ont montré que plus la quantité de lipides était élevée, plus faible était la
quantité d’acides gras oméga 3 comme le signale l’étude de Katvi. Les différences observées du
point de vue qualitatif demeurent cependant faibles et l’on peut considérer comme constant le
profil en acides oméga 3 des lipides des graisses orbitales avec un pourcentage de 6,5% d’EPA
pour 26,6% de DHA soit un total de 33,1% d’EPA + DHA.
S’il s’avérait par des analyses ultérieures à engager que le profil d’acides gras provient
essentiellement de triglycérides, il serait possible d´envisager une utilisation directe de l’huile
extraite. Ceci présenterait l’énorme avantage de ne pas avoir à faire une concentration des
oméga 3 en évitant donc ces méthodes de concentration à l’urée qui sont contraignantes et peu
adaptées à un produit destiné à l´utilisation en supplément alimentaire (nutraceutique).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 49

Le taux de DHA est élevé dans toutes les graisses orbitales analysées et demeure constant
quelle que soit l’espèce de thon considérée. Ce taux de DHA est très élevé par rapport à
d’autres poissons et nous pouvons estimer que l’utilisation du thon entier et non seulement la
graisse orbitale comme une source fiable de DHA.
2- Recherche, dans la biodiversité de la Polynésie française, de substances naturelles
possédant une activité répulsive/attractive vis-à-vis de moustiques vecteurs de maladies
tropicales
Afin de remplacer les captures sur appâts humains qui demeurent à ce jour le seul moyen pour
échantillonner les populations de moustiques vecteurs, il est impératif de trouver des produits
beaucoup plus attractifs que ceux qui sont actuellement commercialisés et qui ont été évalués
par le Laboratoire de recherche en entomologie médicale (LEM) de l’ILM. Par ailleurs, la
recherche dans la biodiversité de la flore locale de substances naturelles répulsives de ces
moustiques vecteurs apparaît nécessaire dans le développement de produits biologiques locaux
et efficaces.
Pour ce faire, le présent programme de recherche financé en partie par l’Etablissement pour la
Prévention (EPAP) se propose de rechercher les éventuelles matières olfactives de diverses
plantes locales. Ce programme a débuté en juillet 2005 et implique la participation de deux
compétences au sein de l’ILM : les compétences du LSN en matière de connaissance des plantes
aromatiques et des techniques de chimie extractive et celles du LEM en matière d’entomologie
et de test d’activité attractive/répulsive vis-à-vis des moustiques.
Le « test en tunnel » utilisé par l’équipe du LEM a pour but d’évaluer l’impact des moustiquaires
imprégnées de répulsifs sur des moustiques adultes dans des conditions de laboratoire simulant
les conditions du terrain. Les moustiques sont regroupés en huit catégories :
1. gorgés-vivants-petit compartiment
2. gorgés-vivants-grand compartiment
3. gorgés-morts-petit compartiment
4. gorgés-morts-grand compartiment
5. non gorgés-vivants-petit compartiment
6. non gorgés-vivants-grand compartiment
7. non gorgés-morts-petit compartiment
8. non gorgés-morts-grand compartiment
Selon qu’ils sont :
1. gorgés ou non gorgés
2. vivants ou morts
3. d’un côté ou de l’autre de la moustiquaire imprégnée
L’analyse détaillée de ces données permet de noter : 1/ le degré de protection individuelle (PI)
par détermination du nombre de moustiques gorgés (gorgés ou morts) d’un côté ou de l’autre de
la paroi moustiquaire, 2/le degré de protection collective (PC) par détermination du nombre de
moustiques gorgés vivants d’un côté ou de l’autre de la paroi moustiquaire.
Dans une moindre mesure, ces huit catégories de moustiques peuvent donner une indication sur
le degré minimum de répulsivité de l’HE par détermination du nombre de moustiques récoltés à
l’extérieur de la paroi moustiquaire. Le test en tunnel utilisé par le LIN est inspiré du modèle
mis au point par Elissa et Curtis. Il a été ensuite adapté par le LIN pour reproduire un peu plus
les conditions naturelles puis validé en Côte d’Ivoire en comparant les résultats obtenus en
parallèle dans le dispositif en tunnel et les case expérimentales.
Les huiles essentielles à étudier devant être diluées avant utilisation, les premières
expérimentations engagées ont consisté à tester l’activité de divers solvants vis-à-vis des
moustiques afin de choisir le solvant adéquat pour entreprendre les tests. Les expérimentations
ont défini le méthanol comme meilleur solvant de dilution pour réaliser les tests car il ne
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 50

possède aucune activité vis-à-vis des moustiques contrairement à
(expérimentalement) ou l’acétone attractif (selon la littérature).
l’hexane répulsif
Les expérimentations suivantes ont consisté à éprouver le test par l’étude de l’activité répulsive
d’échantillons de préparations anti-moustiques répulsives commercialisées. Des essais multiples
opérées par le LEM ont conduit à mettre au point les conditions optimales d’utilisation du test
tunnel.
Parmi la vingtaine d’espèces végétales aromatiques de Polynésie française dont les huiles
essentielles ont été totalement caractérisées par le LSN au cours des dix dernières années,
7 premières espèces ont fourni des huiles essentielles qui ont fait l’objet de tests d’activité
répulsive vis-à-vis du moustique Aedes aegyti. Parmi ces 7 échantillons certains, ont révélé une
forte activité répulsive vis-à-vis du moustique. Voici présenté ci-dessous deux graphiques
élaborés à partir d’un test sur une huile essentielle, que nous appelons E1 (les substances qui
font l’objet de test sont en effet codées avant d’être transmises au LEM).
%
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
0
0H 1H 2H 3H 4H 5H
durée
Témoin /E1
E1
% repas après 2 heures.
100
80
60
40
20
0
Témoin E1
E1 présente un passage de 3% au bout de 2 heures, tandis que le témoin présente 84% de passage de
l’autre côté de la moustiquaire. Par ailleurs, on remarque bien que le nombre de moustiques gorgés
de sang (c'est-à-dire qui ont fait un repas sanguin sur le rat) est très faible au bout de deux heures.
Le produit E1 est ainsi très significativement répulsif vis-à-vis d’Aedes aegypti.
Grâce à ces résultats, nous pouvons entrevoir une capacité certaine de développer des produits
répulsifs naturels au sein même de la biodiversité originale de la flore polynésienne.
Afin de compléter l’étude de la substance active, des analyses fines d’identification des composants
volatils ont été menées par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de
masse, en collaboration avec l’équipe Glycochimie, IBMM (UMR 5247) de l’Ecole nationale
supérieure de chimie (ENSCM) de Montpellier, en vue de rechercher puis isoler la molécule
responsable de l’activité observée. Les résultats préliminaires de ces travaux ont été affichés sous
forme de posters au Colloque international plantes aromatiques et médicinales qui s’est déroulé du
13 au 15 juillet 2006 à l’Université de Polynésie française.
L’arrivée en janvier 2006 au LSN de Fanny ADAM, étudiante en thèse de chimie organique inscrite à
l’Université de Bretagne occidentale (UBO), a permis d’élargir le programme à l’étude d’extraits
exotiques nouveaux notamment à partir de fleurs et racines de certaines espèces végétales. Parmi
les 11 espèces végétales traitées, 5 espèces ont fourni une huile essentielle : 2 huiles essentielles
de fleurs, 2 huiles essentielles de feuilles, 1 huile essentielle du fruit.
En conclusion les résultats sont très encourageants et devront être soumis à publication très
prochainement.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 51

Il restera à tester ces mêmes huiles essentielles sur les autres espèces de moustiques. Il faudra
également préparer à partir de ces végétaux des extraits autres que les huiles essentielles à tester
comme insecticides.
En perspective enfin, il est prévu d’intégrer au programme l’étude des algues marines dont la
composition en substances halogénées devrait pouvoir conférer aux extraits des propriétés actives
vis-à-vis des moustiques. (Voir aussi LEM)
Le centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
L’équipe
• René CHANSIN, chef de service
• Ngoc Lam NGUYEN, médecin
• Sylviane TEURURAI, infirmière
• Véronique MOU, adjointe de soins
• Anne BELLEOUD, médecin (du 6 décembre 2006 au 03 avril 2007)
• Isabelle CAZALENS, infirmière (du 1 er septembre 2006 au 31 mars 2007)
L’activité du service
Le programme PacElf qui a connu le report de deux missions en 2005 s’est poursuivi en 2006.
L’équipe de l’ILM s’est successivement déplacée à Tevaitoa (Raiatea) du 13 février au 4 mars et à
Tahuata (Marquises) du 13 au 23 mars 2006.
Les résultats préliminaires ont été compilés dans un rapport et présentés aux responsables de la
Direction de la santé.
La rétro-information des résultats vers les populations des trois sites sentinelles a été faite en
novembre et décembre 2006.
Par ailleurs, les résultats préliminaires du programme « Evaluation de l’exposition prénatale aux
métaux lourds chez les nouveaux-nés de Polynésie française », mené en collaboration avec le CHPf,
la Direction de la santé, les médecins libéraux et l’Université Laval à Québec (Canada) grâce à un
financement de l’Etablissement pour la Prévention (EPAP), ont fait l’objet de communications
orales du Pr Eric DEWAILLY, à l’ILM, en août 2006.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 52

Activités de santé publique
Le laboratoire d’analyses de biologie médicale
L’équipe
• Cyril COUDERT, directeur du laboratoire
• Frédéric BEAU, directeur adjoint
• Stéphane LASTERE, directeur adjoint
• José RUIZ SUQUILBIDE, médecin anapath
• Ronald GIAU, chargé de mission
• Marie-Lise LIAO, surveillante
• Alain ANDREU, technicien de laboratoire
• Christian CHAU, technicien de laboratoire
• Valérie DUGAY, technicien de laboratoire
• Kathia ESTALL, technicien de laboratoire
• Vanessa GERON, technicien de laboratoire
• Nathalie GUITARD, technicien de laboratoire
• Christine LIVINE, technicien de laboratoire
• Patrick LUQUIAUD, technicien de laboratoire
• Véronique MARIA, technicien de laboratoire
• Patricia MAUCOTEL, technicien de laboratoire
• Tokahi ROTILLON, technicien de laboratoire
• Aurore SHAN YAN, technicien de laboratoire
• Anita TEISSIER, technicien de laboratoire
• Karen ZISOU, technicien de laboratoire
• Moea LIAO-TOIRORO, infirmière
• Tehea GOBRAIT, secrétaire médicale
• Elmire GILLOT, secrétaire médicale
• Yvonne MAOPI, agent d’accueil
• Baildir GENTOU, agent de saisie
• Hervé HASCOET, agent de saisie
• Benjamin TAUPUA, agent de saisie
• Karl WALKER, agent de saisie
• Danièle KELLY, agent préparatoire
• Marguerite TEMUTU, agent d’entretien
• Marina BOUGUES, coursier
• Charles NATUA, coursier
• Terai SHAN, coursier
• Poata TUHITI, coursier
Les événements marquants
Au mois d’avril, le LABM a accueilli un troisième biologiste dont le recrutement avait été rendu
nécessaire par la hausse constante de l’activité.
S’agissant des équipements, le laboratoire a été doté de deux nouveaux automates : Access II pour
l’immunosérologie et Hyri pour la biochimie (lecteur des électrophorèses sériques et
immunofixations).
L’autoclave Varioklav TYPE 135s, aux normes CE et certifié par le bureau Veritas, a été installé à la
laverie. Cette acquisition a permis de sécuriser la stérilisation humide et sous pression des milieux
et matériels répondant ainsi aux normes d’assurance qualité du GBEA. Elle a également été
l’occasion de travaux de rénovation de la salle dédiée à la laverie et à la préparation des milieux.
L’agencement du secrétariat a été modifié afin d’offrir au personnel un cadre de travail plus
ergonomique et de disposer d’un meuble pour le classement des comptes-rendus d’analyses.
La sécurisation des accès aux laboratoires s’est poursuivie.
Par ailleurs, un véhicule a été remplacé ainsi que 10 glacières médicalisées de transport des
échantillons.
Enfin, le Guide des analyses du LABM a fait l’objet d’une réédition. Cette parution a été précédée
d’une enquête de satisfaction auprès des prescripteurs et précisément adaptée aux besoins
exprimés. Elle se double d’une affichette d’information sur les prélèvements. Ces réalisations
participent à l’amélioration de la phase pré-analytique dans le cadre du GBEA.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 53

L’activité d’analyses
1- Données générales
Courbe mensuelle comparative d’activité en B (2005 - 2006)
Evolution saisonnière habituelle (fléchissement saisonnier au mois d’août).
Evolution mensuelle du nombre de dossiers LABM
Nombre de dossiers
5000
4500
4000
3500
3000
2500
2000
1500
1000
500
0
2005
2006
mois
Janvier
Février
Mars
Avril
Mai
Juin
Juillet
Août
Septembre
Octobre
Novembre
Décembre
Mois
Evolution de l’activité en B (2005-2006)
En 2006 l’activité du LABM est de 8.57 M de B pour 7.93 M de B en 2005, soit une
augmentation de 7%. L’activité du laboratoire d’anatomo-cyto-pathologie reste
relativement stable avec 424 360 BP en 2006 contre 439 850 BP en 2005.
Origine géographique des examens prescrits
Evolution de l'Activité
800000
700000
B/B.DS/BP
600000
500000
400000
300000
200000
B LABM 2005
B hospit 2005
BP 2005
B LABM 2006
B hospit 2006
BP 2006
100000
0
janvier
février
mars
avril
mai
juin
juillet
aout
septembre
octobre
novembre
décembre
mois
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 54

Ile Archipel B nombre acte %
Raivavae Australes 52 141 1 841 0,8
Rapa Australes 4 054 113 0,06
Rimatara Australes 9 682 349 0,15
Rurutu Australes 141 763 5 206 2,3
Tubuai Australes 85 071 2 844 1,36
Moorea IDV 433 860 14 387 7
Tahiti IDV 3 187 803 104 077 51
Bora Bora ISLV 715 351 24 551 11,43
Huahine ISLV 487 205 15 494 7,8
Maupiti ISLV 3 851 146 0,05
Raiatea ISLV 658 011 15 416 10,52
Tahaa ISLV 28 291 857 0,45
Marquises nord Marquises nord 290 924 7 600 4,6
Marquises sud Marquises sud 76 920 2 602 1,22
Tuamotu/Gambier 79 005 2 757 1,26
Répartition par archipel de l'activité en B
AUSTRALES
TAHITI et MOOREA
Iles sous le vent
MARQUISES
Tuamotou Gambiers
Tahiti et Moorea représentent plus de 58% de l’activité.
Origine des prescripteurs par secteur
Prescripteurs Total 2003 Total 2004 Total 2005 Total 2006
Santé publique 69% 62,2% 64% 68 %
Secteur privé 31% 37,8% 36% 32%
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 55

Résultats par laboratoire (LABM)
Laboratoires Actes % B %
Bactériologie/BK/Mycologie 18801 7.77 834060 11.24
Hématologie 37806 15.62 1258885 17
Biochimie 141098 58.3 3025300 40.7
Séro-immunologie 33601 13.88 1483565 15
Virologie 2671 1.1 113770 1.53
Parasitologie 1623 0.7 97690 1.32
Transmis 5973 2.5 484250 6.5
2- Données analytiques
Bactériologie
E.C.B.U. (Examen cyto-bactériologique des urines) : 4395 examens réalisés.
Prélèvements vaginaux (PCV) : 2085 réalisés.
Nombre %
Vaginose à Gardnerella vaginalis 241 11.6
Vaginite à Candida spp 244 11.7
Portage de Candida spp 563 27
Vaginite bactérienne 18 0.9
Vaginite à Trichomonas 20 1
Gonococci 0 0
Portage de streptocoque du groupe B 353 17
Portage de Staphylococcus aureus 327 15.7
Absence de signe biologique d’infection génitale 935 45
Commentaires : Plus d’une patiente sur 2 présente un signe d’infection génitale (55%). Plus
de 38% des prélèvements présentent une vaginite à Candida albicans ou un portage. A
noter 17% de portage de Streptococcus agalactiae.
Prélèvements urétraux : 19 réalisés dont 3 cultures positives à Neisseria gonorrhoeae.
Coprocultures : 264 réalisés.
Coproculture
Espèces isolées
2006
Escherichia coli toxinogènes 14
Shigella dysenteriae 0
Shigella flexneri 0
Shigella sonnei 1
Salmonella spp 9
Campylobacter spp 2
Commentaires : Les principales espèces de salmonelles circulantes sont Salmonella
weltevreden et Salmonella typhimurium.
Recherche de virus dans les selles
8 selles (enfants de moins de 2 ans) testées : positives à 4 à Rotavirus, à 4 Adenovirus.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 56

Prélèvement de pus de plaies
119 ont été réalisés en 2006. 11 (soit 10%) infections à Streptococcus pyogenes (groupe
A) et 59 (50%) d’infections ou de portage de Staphylococcus aureus.
Mycobactéries
n =
M. tuberculosis 973
M. leprae 37
Pour Mycobacterium tuberculosis, 4 nouveaux patients dépistés.
Pas de poly-résistance détectée (résistance à au moins 2 antibiotiques utilisés en
thérapie).
224 hémocultures réalisées en 2006.
62 expectorations et 84 prélèvements ORL.
Chlamydia trachomatis (recherche directe)
n =
Positifs
PCR (Roche Diag.) 212 25
12% des cas sont positifs.
Spermocytogramme
6 spermogrammes ont été réalisés en 2006.
Parasitologie
Sang
n =
Positifs
Filaires* 144 17
Plasmodium 5 0
• par Hémofiltrationet examne du frottis sanguin.
Commentaires : Au total 39 patients dépistés positifs si l’on prend en compte la
détection de l’antigène filarien.
Selles
Nombre d'analyses 336
Parasitées 23
Commentaires : Principalement des Giardiases (15) et amibiases (3 à Entomoeba
hystolytica).
Séro-Immunologie
Parasitaire
Paludisme : 58 sérologies palustres en 2006.
Toxoplasmose
Au cours de l’année 2006, 5593 sérologies toxoplasmose ont été réalisées. 50 études de
l’avidité des IgG réalisées au LABM pour la datation de l’infection dans le cadre des
suspicions de primo-infection en début de grossesse.
Filariose
Antigènes filariens 453 22 positfs
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 57

Bactériennes
Treponema pallidum, Chlamydia trachomatis, salmonella
Demandes
T. pallidum (syphilis) 2871 et 7 FTA
C. trachomatis 307
Salmonelle (Widal Felix) 30
Streptococcies "A"
ASLO 861
ASDOR 819
Leptospirose
n = +
Leptospirose IgM / Elisa 491 45
PCR* 252 21
Commentaires : Sérologies leptospirose considérées comme positives pour des valeurs
>20 (technique Panbio Elisa). Soit un total de 53 cas biologiques de leptospirose dont 33
« cas confirmés » (21 PCR et 11 séroconversions) et 20 « cas probables ».
Virales
Rubéole
n =
Rubéole IgG 3652
Rubéole IgM 28
Commentaires : Environ 80% des femmes présentent une immunité protectrice.
Hépatites virales
Hépatite A n =
IgG 197
IgM 145
Hépatite B n =
Ag HBs 3504
Ag HBe 229
AC anti HBs 1490
AC anti HBe 178
AC anti HBc 562
Ac anti Hépatite E 1
AC anti HBc IgM 83
ADN viral (transmis) 158
Hépatite C n =
IgG 850
ARN Quantification (transmis) 27
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 58

VIH
n = +
Tests de dépistage 4638 5
Confirmation (WB) 33 6
Charges Virales 267
Typages Lymphocytaires CD4 - CD8 321
Commentaires : 6 Western Blot de confirmation sont positifs, en réalité 5 nouveaux cas
de VIH I sont confirmés à l’ILM en 2006.
Dengue
n =
Recherche IgM 1192
PCR 761
Isolements viraux 162
Antigénémie NS1 470
Commentaires : 686 prélèvements se sont révélés positifs (32%) sur les 2153 demandes
d’examens; parmi ceux-ci, 482 ont permis le typage du virus. Tous les virus typés se
sont révélés être des virus DENV-1, soit de même sérotype qu’en 2001. Aucun autre
sérotype n’a été mis en évidence.
Hématologie
Cytologie hématologique
Hémogrammes 20164
Réticulocytes 115
V.S. 5961
Hémostase
Taux de prothrombine (TQ) 3655
T.C.A. 707
Fibrinogène 426
T.S. 5
Immuno-hématologie
Groupage sanguin
Groupage sanguin + phénotype 2807
R.A.I. 2463
CD4 - CD8
S/pop. Lymphocytaire CD4-CD8 321
Examens réalisés par cytométrie en flux.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 59

Biochimie (nombre d'examens effectués)
Métabolisme glucidique
Glycémies 11714
H.G.P.O. & O’Sullivan 2372
Hémoglobines glycosylées 5700
Métabolisme lipidique
Cholestérol total 37515
Triglycérides 3657
Exploration d’une anomalie lipidique 7745
Métabolisme thyroïdien
FT3 1139
FT4 3720
TSH 5252
Marqueurs tumoraux
PSA totale
PSA libre
2175
304
AFP 226
ACE 209
CA153 247
CA125 139
CA199 86
Enzymologie
Amylase 621
Lipase 212
Phosphatases alcalines 2531
Transaminases 7215
C.P.K. 756
C.P.K. MB 157
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 60

Autres (échantillons sanguins)
Electrophorèse des protéines 610
Protéines totales 1258
Ferritine 1582
Fer sérique 2085
IgG 35
IgA 39
IgM 34
Clairance de créatinine
232
192 (calcul)
Acide urique 8843
Urée 8491
Créatinine 13426
Bilirubine 1620
Ionogramme 7598
CRP 6616
Troponine 28
Procalcitonine 44
Anatomo-cytopathologie
Cytologies cervico-vaginales 6027
Histologie 319
Examens transmis 961
Allergologie
Stallertest (Phadiatop)
70
Trophatop 84
RAST 79
IgE totale 222
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 61

La surveillance de la leptospirose
Examens biologiques de la leptospirose à ILM en 2006
600
500
400
Positifs
Demandes
Nombre
300
200
100
0
PCR
Type d'analyses
IgM Elisa
Origine des échantillons
Dispensaires, hôpitaux périphériques, médecins privés (30%) de l’ensemble des archipels de
Polynésie française ainsi que les prélèvements provenant des cliniques privées (Paofai et
Cardella. Le LABM réalise également les PCR pour le CHPf.
Résultats
• 21 PCR, soit environ 8% des demandes, sont positives (cas confirmés).
• 32 sérologies positives de nouveaux cas. En réalité, 45 sérologies découvertes > 20 ua/ml
(c’est-à-dire un titre d’emblée élevé/Elisa Panbio, seuil de détection à 9) auxquelles ont
été soustraites les doublons (10) et 3 PCR positives sur un premier sérum.
Soit un total de 53 cas biologiques de leptospirose dont 33 « cas confirmés » (21 PCR et
11 séroconversions) et 20 « cas probables ».
Définition des cas
Les patients présentant une PCR positive ou une séroconversion au test ELISA sont considérés
comme des « cas confirmés ». Certains profils que l’on pourrait intituler « cas probables » se
caractérisaient par une sérologie IgM positive (taux supérieur à 20 unités arbitraires/ml (ua/ml)
en ELISA IgM).
Répartition géographique
Iles du Vent
Iles sous le Vent
Marquises
Australes
Tuamotu-Gambier
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 62

La plupart des cas provenant des ISLV ont été prélevés à l’hôpital de Raiatea. Les professionnels
de santé se montrent sensibles au problème de la leptospirose particulièrement depuis l’étude
2004/2005 menée pour le ROSSP.
Ceux des IDV proviennent en grande partie, pour les cas confirmés, du CHPf et pour les autres
de Tahiti (Taravao, Côte Est) et de Moorea.
Aucun cas n’est constaté aux Australe et Tuamotu Gambier.
Evolution saisonnière des cas 2006
12
10
Nombre
8
6
4
cas confirmés
cas probables
Cas cumulés
2
0
janvier
février
mars
avril
mai
juin
juillet
Mois
aout
septembre
octobre
novembre
décembre
La leptospirose se manifeste toute l’année avec une nette diminution de juin à octobre (saison
sèche).
Cas biologiques de leptospirose
Evolution annuelle
60
50
Nombres de cas
40
30
20
10
0
2004 2005 2006
Années
cas confirmés cas probables Cas cumulés
• 33 cas confirmés (PCR positives et/ou séronversion IgM /ELISA Panbio).
• 20 cas probables (Sérologie IgM isolée > 20 ua.)
• 3 sérovars Leptospira icterohaemorrhagiae et 1 Leptospira canicola ont pu être identifiés
(Microagglunitation de Martin et Pettit – Intsitut Pasteur de Paris).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 63

Le diagnostic virologique
1- Dengue
Après l’épidémie massive de 2001 et 4 années d’activité de faible intensité relative, une
augmentation progressive et constante de l’activité de diagnostic et de surveillance de la
dengue a été observée au long de l’année 2006.
Sans pour autant être classée en épidémie, depuis août 2006 la Polynésie française doit faire
face à une très forte recrudescence de la dengue, la circulation du virus étant très
certainement favorisée par la pullulation des moustiques vecteurs et l’apport régulier de
patients naïfs (naissances, arrivée de métropolitains). Cette augmentation régulière a d’ailleurs
conduit le classement de la Polynésie en phase d’alerte pré-épidémique fin septembre. Il est
important de noter qu’une augmentation sensible du nombre de cas avait d’ailleurs été notée
dès le mois de février 2006.
Depuis l’embauche d’un nouveau technicien de laboratoire en septembre 2005, l’ensemble du
diagnostic et de la surveillance passive de la dengue est du ressort du LABM. Ce recrutement,
suivi de celui du 3 ème biologiste, a permis de d’adapter les conditions de traitement des
échantillons pour faire face notamment aux contraintes à la fois internes et externes à l’ILM.
Ainsi, à partir de septembre 2006, les isolements viraux ont été abandonnés et remplacés par la
RT-PCR. En effet, la durée de rendu de résultat d’un isolement viral (7-10 jours) ne peut plus
être considéré comme compatible avec une prise en charge efficace des patients. Surtout elle
ne permet pas la réaction rapide face à l’implantation éventuelle d’un nouveau virus.
De plus, à partir d'octobre 2006, devant l’afflux de demandes de confirmation, l’antigénémie
NS1 Dengue (Biorad) a été mise en place et est désormais utilisée en première intention pour les
prélèvements précoces. En effet, divers de ses avantages font qu’elle peut remplacer la RT-PCR
en période de forte activité (augmentation globale de la productivité, rendu rapide de
résultat,…).
En revanche, le kit sous sa forme actuelle ne permet pas le typage du virus. Tout prélèvement
positif en NS1 doit donc faire l’objet d’un typage par RT-PCR. La sérologie IgM reste le moyen
de diagnostic tardif, sachant que des faux positifs ne sont pas rares avec le kit utilisé (Panbio).
Ces réactivités correspondent, soit à des persistances longues d’IgM spécifiques, soit à des
réactivations polyclonales à l’origine de réactions croisées.
Ainsi, l’algorithme de diagnostic/surveillance est désormais le suivant :
Cas suspect
Jour de maladie
J5
NS1 NS1 & RT-PCR Sérologie IgM
ou RT-PCR
+/- IgM
Typage
par RT-PCR
DENV-1, 2, 3, 4
Typage
par RT-PCR
DENV-1, 2, 3, 4
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 64

Les données produites par le LABM sont mise en forme et transmisses régulièrement au Bureau
des pathologies infectieuses de la Direction de la Santé (si nécessaire, des rapports quotidiens,
hebdomadaires et mensuels sont envoyés).
Au total, pour l’année 2006, le LABM a traité 2153 demandes de confirmation, soit 761 RT-PCR
(Lanciotti, 1992), 162 isolements viraux, 470 antigénémies NS1 (Biorad) et 1192 sérologies IgM
(Panbio).
686 prélèvements se sont révélés positifs (32%) ; parmi ceux-ci 482 ont permis le typage du
virus. Tous les virus typés en 2006 se sont révélés être des virus DENV-1, soit de même sérotype
qu’en 2001. Aucun autre sérotype n’a été mis en évidence.
Au total, ces données montrent l’endémisation du virus DEN-1 et sa résurgence à la faveur de
changements démographiques et climatiques.
Projets 2007
• Mise en place d’une technique de RT-PCR en temps réel pour la détection et le typage
des DENV (suite à l’acquisition d’un analyser LightCycler Roche) ;
• Mise en place du diagnostic sur buvard (sang capillaire) afin de faciliter la surveillance
de la maladie et le prélèvement des enfants ;
• Mise en place d’une technique de diagnostic de l’infection à virus Chikungunya (tests et
validation par le laboratoire de recherche en virologie).
2- Grippe
Le LABM est le seul laboratoire polynésien à avoir mis en place les outils de base permettant le
diagnostic et la surveillance de la grippe.
Néanmoins, la demande est encore extrêmement faible et une réflexion est actuellement
menée afin de mettre en place, en collaboration avec la Direction de la Santé, les moyens
suffisants pour surveiller la grippe commune et détecter les éventuels cas de grippe aviaire
(H5N1 ou autre).
Au total, 86 prélèvements ont été traités en 2006. Parmi ceux-ci, 20 se sont révélés positifs en
test rapide Quickview et confirmés par RT-PCR. 3 de ces virus étaient des virus influenza de
type A et 17 de type B.
Un seul de ces virus a pu être typé par le Centre OMS de Référence et de Recherche sur la
Grippe de Melbourne (Dr I. Barr. Australie). Il s’agissait d’un virus A/H3N2 (A/TAHITI/3/2006),
proche de la souche A/Wisconsin/67/2005 incluse dans la préparation vaccinale 2006.
Projets 2007
• Création d’un GROG polynésien ;
• Mise en place des outils moléculaires permettant la détection, le typage et le soustypage
des virus grippaux (renforcement des capacités existantes) ;
• Renforcement des interactions avec les réseaux RESPARI/GROG/ROSSP et OMS.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 65

L’état de la sensibilité aux antibiotiques des bactéries isolées au LABM
1- Staphylococcus aureus
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Pénicilline G
Oxacilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Tobramycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Acide
fusidique
Fosfomycine
Rifampicine
Vancomycine
Sensibilité aux antibiotiques 2006
Conclusion RIS (%) Antibiotiques
Pour 132 souches
Pénicilline G
Oxacilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Tobramycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Acide fusidique
Fosfomycine
Rifampicine
Vancomycine
R 91,6 19,6 11,0 3,0 1,0 16,0 15,0 1 4,5 7,5 1,0 1,0 0
I 0 0 1,0 1,0 0 0 0 0 0 6,0 0 0 0
S 8,4 80,4 88.0 97,0 99,0 84,0 85,0 99 95,5 86,5 99,0 99,0 100
La résistance à la pénicilline G concerne plus de 90% des souches et la résistance à l’oxacilline
principale β-lactamine anti-staphylocoque, est d’environ 20%. Ces souches résistantes à
l’oxacilline sont résistantes à l’ensemble des β-lactamines.
Bon niveau de sensibilité aux macrolides et aux antibiotiques apparentés : respectivement 88%
et 97% des souches restent sensibles aux macrolides et aux lincosamides. La résistance à la
pristinamycine reste anecdotique.
Environ 85% les souches sont sensibles aux aminosides. La résistance à la gentamicine reste
exceptionnelle.
Avec 99% de sensibilité la fosfomycine et la rifampicine restent des antibiotiques antistaphylocoques
majeurs.
En 2006, pour les souches provenant des hôpitaux (Taravao, Uturoa, Moorea, Taiohae) la
proportion de souches résistantes à l’oxacilline est de 33% et celle de souches de phénotype
Kana. Tobra. R est 24%.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 66

2- Escherichia coli
100%
80%
60%
40%
20%
S
I
R
0%
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide
nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
Conclusion RIS (%) Antibiotiques
Pour 651 souches
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide
clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
R 52,0 6,0 51,0 8.4 4,0 1,0 0 2,0 2,0 0 5,5 4,0 4,0 0,5 13,0
I 2,0 26,0 0 25,4 2,5 1,0 0 0 1,0 2,0 0 0 0 0 1,0
S 46,0 68,0 49,0 66,2 93,5 98,0 100 98,0 97,0 98,0 94,5 96,0 96,0 99,5 86,0
L’élément le plus important à souligner est la forte présence de souches productrices de β-
lactamases. Plus de 50% des souches sont résistantes (catégories R et I) à l’amoxicilline et 32%
restent résistantes à son association avec l’acide clavulanique.
13 souches isolées cette année étaient de sensibilité diminuée aux céphalosporines de troisième
génération (R ou I) par production d’une BLSE (9) ou hyperproduction de céphalosporinase (4).
Par contre, pour les autres classes d’antibiotiques (aminosides, quinolones, furanes), on note un
bon niveau de sensibilité, à peu près supérieur ou égal à 95%. Ces résultats sont d’autant plus
intéressants que les quinolones et les furanes sont des antibiotiques de première ligne pour le
traitement des infections urinaires dont E. coli reste la principale étiologie.
A noter qu’il n’y a pas de différence significative de sensibilité entre les souches provenant des
hôpitaux (Taravao, Uturoa, Moorea, Taiohae) et les souches communautaires (dispensaires et
prescripteurs du secteur libéral).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 67

3- Klebsiella pneumoniae
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide
nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 72 souches
Ampicilline
Amoxicilline +
acide clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
R 100 7,0 100 2,0 2,0 0 0 4,0 5,5 1,5 5,0 5,0 5,0 7,0 7,0
I 0 8.3 0 5,0 0 1,0 0 0 0 0 0 0 0 15,5 1,0
S 0 84,7 0 93,0 98,0 99,0 100 96,0 94,5 98,5 95,0 95,0 95,0 77,5 92,0
La résistance à l’amoxicilline et à la ticarcilline correspond à une résistance naturelle de cette
espèce par sécrétion d’une pénicillinase naturelle.
On peut remarquer que contrairement à E. coli, il persiste une bonne activité de l’association
amoxicilline-acide clavulanique avec environ 85% des souches sensibles à cette association.
Toutefois le nombre de souches résistantes ou intermédiaires est en augmentation 15% contre
5% en 2005.
Bonne activité des autres familles d’antibiotiques :
• 95% des souches sont sensibles aux aminosides et aux quinolones ;
• 77% des souches restent sensibles aux furanes ;
• 92% de souches sont sensibles Cotrimoxazole (Bactrim).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 68

4- Proteus mirabilis
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Amoxicilline
Amoxicilline +
acide
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide
nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 52 souches
Ampicilline
Amoxicilline +
acide clavulanique
Ticarcilline
Céfalotine
Céfixime
Céfotaxime
Imipénème
Gentamicine
Tobramycine
Amikacine
Acide nalidixique
Norfloxacine
Ciprofloxacine
Furanes
Cotrimoxazole
R 11,5 4,0 11.5 6,0 2,0 2,0 0 6,0 4,0 0 13,5 3,0 2,0 81,0 2,0
I 0 2,0 0 0 1,0 0 0 0 0 0 0 0 0 19,0 2,0
S 88,5 94,0 88,5 94,0 97,0 98,0 100 94,0 96,0 100 86,5 97,0 98,0 0 96,0
Persistance d’une bonne activité de l’ensemble des β-Lactamines et des autres classes
d’antibiotiques (aminosides, quinolones, cotrimoxazole) avec 86 à 100% de souches sensibles.
La résistance aux furanes (100% des souches R ou I) correspond à une résistance naturelle de
cette espèce.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 69

5- Pseudomonas aeruginosa
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Ticarcilline
Ticarcilline +
acide
clavulanique
Pipéracilline
Pipéracilline +
tazobactam
Ceftazidime
Cefsulodine
Aztréonam
Imipénème
Tobramycine
Gentamicine
Amikacine
Ciprofloxacine
Fosfomycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 37 souches
Ticarcilline
Ticarcilline +
acide
clavulanique
Pipéracilline
Pipéracilline +
tazobactam
Ceftazidime
Cefsulodine
Aztréonam
Imipénème
Tobramycine
Gentamicine
Amikacine
Ciprofloxacine
Fosfomycine
R 27,0 32,5 5,5 3,0 0 3,0 0 3,0 13,5 13,5 8,0 21,5 13,5
I 11,0 40,5 8,5 8,0 3,0 16,0 8,0 8,0 3,0 3,0 5,5 0 0
S 63,0 27,0 86,0 89,0 97,0 81,0 92,0 89,0 83,5 83,5 86,5 78,5 86,5
La proportion de souches présentant une résistance acquise aux carboxypénicilline et/ou aux
uréidopénicillines par pénicillinase acquise ou efflux est en augmentation par rapport à 2005.
Cette augmentation concerne surtout la ticarcilline car 86% des souches restent sensibles à la
pipéracilline.
La proportion importante de souches I ou R (73%) à l’association ticarcilline + acide clavulanique
s’explique par l’effet inducteur de l’acide clavulanique sur la production de la céphalosporinase
naturelle de cette espèce.
Une seule souche était de sensibilité diminuée à la céftazidime par une céphalosporinase
hyperproduite.
A noter que 11% des souches sont de sensibilité diminuée à l’imipénème. Cette résistance par
modification des porines est dissociée de la résistance aux autres β-lactamines, mais elle peut
toutefois être associée à un autre mécanisme de résistance (enzymatique ou efflux) à cette
famille d’antibiotique.
La sensibilité aux aminosides reste bonne, par contre la proportion de souches sensibles à la
ciprofloxacine passe de 88% en 2005 à 78%.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 70

6- Entérocoques
100%
80%
60%
40%
20%
S
I
R
0%
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Streptomycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Lévofloxacine
Furanes
Vancomycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 40 souches
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Streptomycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Lévofloxacine
Furanes
Vancomycine
R 0 47,5 100 17,5 22,5 37,5 10,0 70,0 5,0 0 0
I 0 7,5 0 10,0 77,5 62,5 90,0 0 0 0 0
S 100 45,0 0 72,5 0 0 0 30,0 95,0 100 100
L’ampicilline reste l’antibiotique de choix avec 100% des souches sensibles.
Parmi les aminosides, la gentamicine avec 90% des souches catégorisées I (par résistance
naturelle à bas niveau aux aminosides de tous les Streptocoques) conserve une excellente
synergie avec les β-lactamines.
Par contre, la résistance aux macrolides et apparentés est importante. La résistance à la
lincomycine (100% des souches R) correspond à une résistance naturelle d’ E. faecalis espèce la
plus souvent isolée.
A noter une excellente sensibilité aux furanes avec 100% de souches sensibles. Cette
interprétation n’est toutefois valable que pour les souches isolées des urines.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 71

7- Streptocoques Beta Hémolytiques
100%
80%
60%
40%
20%
S
I
R
0%
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Vancomycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 92 souches
Ampicilline
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Gentamicine
Tétracycline
Vancomycine
R 0 8,5 4,5 1,0 4,5 0 66,0 0
I 0 3,5 2,0 2,0 95,5 100 2,0 0
S 100 88,0 93,5 97,0 0 0 32,0 100
Il persiste toujours une remarquable sensibilité aux β-lactamines avec 100% des souches
sensibles à l’Ampicilline.
Pour les macrolides et les antibiotiques apparentés la sensibilité tourne autour de 90%.
Les autres molécules antibiotiques sont encore en majorité très actives à l’exception des
tétracyclines dont 68% des souches ont une sensibilité diminuée. Cette résistance concerne
principalement les Streptocoques du groupe B.
8- Neisseria gonorrhoeae
4 souches isolées au cours de l’année 2006.
Aucune ne présentait de mécanisme de résistance aux β-lactamines ni aux fluoroquinolones.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 72

9- Campylobacter jejunii
100%
80%
60%
40%
20%
S
I
R
0%
Ampicilline
Amoxicilline +
acide
clavulanique
Céfotaxime
Kanamycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Tétracycline
Erythromycine
Conclusion RIS (%)
Antibiotiques
Pour 10 souches
Ampicilline
Amoxicilline +
acide
clavulanique
Céfotaxime
Imipénème
Kanamycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Tetracycline
Erythromycine
R 80,0 30,0 30,0 0 0 0 0 0 0
I 0 0 10,0 0 0 0 10,0 0 0
S 20,0 70,0 60,0 100 100 100 90,0 100 100
80% des souches sont productrices de β-lactamase. Cette β-lactamase confère une résistance
aux aminopénicillines dont l’activité n’est pas toujours restaurée par l’association avec l’acide
clavulanique. Les céphalosporines de troisième génération sont peu actives sur campylobacter.
Par contre, pour les autres molécules actives sur Campylobacter : aminosides, cyclines,
fluoroquinolones et macrolides la sensibilité est comprise entre 90% et 100%.
10- Salmonella spp. et Shigella spp.
8 souches de Salmonelle et 1 souche de Shigella sonnei ont été isolées cette année. Elles ne
présentaient aucun mécanisme de résistance aux antibiotiques testés.
β-Lactamines (amoxicilline ou céphalosporines), aminosides, fluoroquinolones, cotrimoxazole
restent donc parfaitement efficaces sur ces bactéries entéropathogènes.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 73

11- Entérobactéries résistantes aux céphalosporines de 3 ème génération isolées
Espèces isolées
14
12
10
8
6
4
2
0
Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Enterobacter cloacae Citrobacter freundii
Origines des prélèvements
3
Hopitaux
Autres
Urines
9
8
Dispensaires
et médecins
privés
14
Mécanismes de résistance impliqués et résistances associées en fonction des espèces
Espèces isolées Nombre Mécanismes de résistance Résistances associées
R Aminosides R Fluoroquinolones
Escherichia coli 13 BLSE (9) Case hyperproduite (4) 15% souches 50% souches
Klebsiella pneumoniae 1 BLSE oui oui
Enterobacter cloacae 1 Cephalosporinase hyperproduite oui oui
Citrobacter freundii 1 Cephalosporinase hyperproduite non oui
Total 16
A noter l’association très fréquente d’une résistance aux fluoroquinolones chez ces souches
d’entérobactéries (9 souches sur 16), plus fréquente que la résistance aux aminosides (4
souches sur 16).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 74

12- Staphylococcus aureus resistants à la méthicilline isolées
Origines des prélèvements
4
1
3
15
Suppuration
Urines
Hemoculture
Autres
9 Hôpitaux
14
Dispensaires et
médecins privés
Sensibilité aux autres familles d’antibiotiques
100%
80%
60%
40%
S
I
R
20%
0%
Erythromycine
Lincomycine
Pristinamycine
Kanamycine
Tobramycine
Gentamicine
Ciprofloxacine
Acide
fusidique
Fosfomycine
Rifampicine
Vancomycine
Avec 20% des souches résistantes à l’oxacilline, le niveau de résistance à cet antibiotique
est plutôt élevé. Rappelons que ces souches sont résistantes à l’ensemble des β-lactamines.
La résistance aux aminosides montre une nette différence entre les souches OxaS et les
souches OxaR avec 80% des souches résistantes à la kanamycine et à la tobramycine contre
15% pour les souches OxaS. Par contre le phénotype résistant kana-tobra-Gentamycine
(KTG) classiquement associé aux souches OxaR est rare (3,8% des souches). A noter que ce
phénotype à tendance à diminuer en métropole mais concerne toujours 15 à 20% des
souches OxaR.
Ces souches méthicillino-résistantes se caractérisent aussi par un niveau plus élevé de
résistance aux fluoroquinolones (23% contre 5%) et à l’acide fusidique (40% contre 14%).
Avec 80% et plus des souches sensibles, il persiste un bon niveau de sensibilité aux
macrolides et aux antibiotiques apparentés.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 75

L’étude génétique du syndrome d’Alport
Le syndrome d’Alport (SA) est une pathologie héréditaire qui affecte les reins. L’évolution
progressive de cette maladie vers l’insuffisance rénale terminale s’accompagne de surdité de
perception et d’anomalies oculaires. Une mutation responsable d’une forme de SA en PF a été
identifiée. Une étude préliminaire, réalisée en 2005-2006, a démontré la fréquence élevée de cette
mutation parmi les patients présentant un SA.
De même, les résultats obtenus révèlent la présence d’autres mutations également à l’origine de
cette maladie. Un programme de recherche visant à caractériser ces polymorphismes est en cours
d’élaboration.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 76

Le laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments
L’équipe
• Edouard SUHAS, directeur du laboratoire jusqu’au 18 octobre 2006
• René CHANSIN, directeur du laboratoire à compter du 19 octobre 2006
• Philippe BRANAA, chef de l’unité de microbiologie
• Teva SUCHARD, chef de l’unité de chimie analytique
• Maud DURDAN, technicien de laboratoire
• Marie-Paule FLEGEO, technicien de laboratoire
• Stéphanie REVERS, technicien de laboratoire
• Naea TAIORE, technicien de laboratoire
• Alice TANDIA, technicien de laboratoire
• Rommel WALKER, technicien de laboratoire
• Eliane CHANG, agent administratif et technique
Le chiffre d’affaires
Revenus par activité
7 800 000
288 000
2 289 189
8 894 571
13 076 052
20 383 126
Prélèvements
Sous traitanc e
Chimie
Microbiologie des eaux
Mic robiologie des aliments
Programmes d'études
Au cours de l’année 2006, le Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments (LASEA)
a réalisé un chiffre d’affaires de 45,1 millions contre 35,1 en 2005 et 38,7 en 2004. Cette évolution
traduit un effort important dans le développement de contrats avec le secteur privé tout en
maintenant une contribution active auprès des services publics (Centre d’hygiène et de salubrité
publique, Service du développement rural). A ce chiffre s’ajoutent 7,8 millions de revenus liés à la
participation à des programmes financés par l’Etablissement pour la prévention (EPAP).
Cela représente une croissance des ventes de 28,5% et une croissance des revenus totaux de 50,4%.
Cette évolution résulte de la diversification du portefeuille de clients. En effet, le CHSP qui est à
l’origine de la création du LASEA représentait 65% du chiffre d’affaires en 2004 et ne correspond
plus qu’à 28,5% du chiffre de 2006. Cette diminution de la part relative du CHSP dans le chiffre
d’affaires global a été largement compensée par la prise de nouveaux marchés.
Les marchés
La répartition du chiffre d’affaires suivant les différents secteurs de marché peut se traduire de la
façon suivante :
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 77

Services publics de contrôle (CHSP, SDR) 34.4%
Autocontrôles sur l’environnement 16.8%
Agro-alimentaire (Commerces, industries) 16%
Hôtellerie 13.4%
Milieu hospitalier (Hôpitaux, cliniques) 11.5%
Collectivités (Lycées, collèges, entreprises) 3.4%
Industries de la cosmétologie 2%
Particuliers 1.5%
Navires 1%
Les secteurs des autocontrôles sur l’environnement, l’agro-alimentaire et l’hôtellerie représentent
désormais presque la moitié du chiffre d’affaires.
Le secteur des autocontrôles sur l’environnement doit voir sa progression se poursuivre avec la mise
en place progressive des mesures liées aux contrôles sur la distribution des eaux destinées à la
consommation humaine dans les communes. Par ailleurs, les centres d’enfouissement techniques
génèrent une demande croissante en analyses pour maîtriser leur impact sur l’environnement. Ce
secteur porteur fera donc l’objet d’une grande attention dans l’avenir.
Le secteur agro-alimentaire reste peu soumis à l’obligation d’autocontrôles. Cependant, de plus en
plus d’entreprises préfèrent prévenir qu’attendre un contrôle inopiné des services publics. La
fréquence et la nature des analyses dans ce secteur pourraient évoluer de manière significative
avec une réglementation plus stricte sur les autocontrôles.
Enfin, dans le secteur de l’hôtellerie, seuls les grands hôtels mettent en place des mesures de
surveillance en matière d’hygiène alimentaire. Les plans d’autocontrôle recommandés par des
cabinets d’études varient d’un établissement à l’autre dans la mesure où la réglementation n’est
pas précise dans ce domaine. La petite hôtellerie choisit de faire l’économie des analyses liées à un
programme de surveillance dans la mesure où rien ne l’y oblige.
L’activité 2006
Le LASEA a procédé à environ 20.000 analyses en 2006. Celles-ci portaient sur 120 paramètres
différents et concernaient principalement cinq catégories d’échantillons :
les eaux destinées à la consommation humaine,
les eaux de mer,
les eaux résiduaires,
les produits industriels (bouchons, monoi,…),
les aliments.
En chimie, les analyses les plus courantes concernent la potabilité de l’eau. Environ 90% des
paramètres réglementaires sont analysés par le LASEA, le reste est sous-traité en Nouvelle-Zélande.
Les volumes traités représentent :
Analyses physico-chimiques réduites : 1160
Analyses physico-chimiques complètes : 40
Analyses physico-chimiques particulières : 150
En outre 42 dosages d’histamine dans le poisson et 36 analyses de monoi ont été réalisées dans le
cadre des contrôles avant exportation.
En microbiologie des eaux, l’activité s’est traduite par :
Analyses bactériologique réduites : 200
Analyses bactériologiques sommaires : 540
Analyses bactériologiques complètes : 860
Analyses d’eau de piscine : 90
Analyses d’eau de baignade : 310
Analyse d’eau microbiologiquement maîtrisée : 410
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 78

Recherches de légionnelles : 140
En hygiène alimentaire, les analyses ont concerné principalement :
Aliments : 1500
Recherches de salmonelles : 360
Recherches de listeria : 16
Levures et moisissures : 300
Hygiène des mains ou surfaces : 200
Dans son ensemble, l’activité du LASEA a augmenté de 35% par rapport à 2005. Les tarifs très
compétitifs supportés par de nombreux paramètres liés aux analyses des eaux n’ont pas permis
d’augmenter le chiffre d’affaires dans les mêmes proportions.
Une vingtaine de paramètres seulement permet de réaliser 80% du chiffre d’affaires. Cependant les
groupes d’analyses imposés par les réglementations obligent le laboratoire à maintenir ses
compétences sur un très grand nombre de paramètres pour répondre efficacement à la demande
des clients. Compte tenu de l’étroitesse du marché en Polynésie française, cela impose de
concentrer une large expertise sur un nombre limité de techniciens.
L’organisation
Fin 2006, le LASEA a fait l’objet d’une réorganisation ayant pour conséquence d’alléger sa
structure. La direction du laboratoire est désormais assurée par la Direction générale de l’institut.
Les deux chefs d’unité, les six techniciens et l’agent technique et administratif affectés au
fonctionnement du LASEA bénéficient du soutien appuyé du responsable qualité de l’ILM dans le
cadre de l’accréditation COFRAC et de l’attaché de direction pour le suivi de la rentabilité et les
relations clients.
Cette nouvelle structure doit permettre au LASEA d’augmenter sa compétitivité dans un domaine
devenu très concurrentiel.
Les activités associées
En chimie, le LASEA a poursuivi sa collaboration au programme de recherche sur l’ « Evaluation des
teneurs en métaux lourds et valeurs nutritionnelles des poissons lagonaires ». Ce programme est
dirigé par le professeur DEWAILLY de l’université de Laval au Canada. Il doit se terminer courant
2007.
En bactériologie, une convention a été signée avec l’EPAP pour un programme intitulé « Salmonelle
et alimentation : évaluation de la situation épidémiologique en Polynésie française ». Il s’agit
d’évaluer (étude antibiorésistance, sérotypage souches et profil génétique des souches) cinq filières
agro-alimentaires :
les eaux destinées à la consommation humaine,
les denrées alimentaires fabriquées localement,
la filière avicole locale,
les denrées importées,
les denrées de l’abattoir.
Les perspectives
L’évolution des règlementations en 2006 n’a pas permis d’étendre le champ d’action du laboratoire.
Cependant, certaines mesures liées, en particulier, à la potabilité des eaux destinées à la
consommation humaine conduisent de nombreuses communes à mettre en place une surveillance de
leurs réseaux de distribution d’eau. L’ensemble des communes de Polynésie française devant à
terme satisfaire à l’obligation de la mise en place de programmes d’autocontrôles. Certains
paramètres comme la recherche de pesticides ou d’hydrocarbures dans les eaux ne peuvent être
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 79

analysés sur le territoire à ce jour. Une étude sera réalisée en 2007 pour envisager leur traitement
au sein du laboratoire.
Par ailleurs, le secteur du traitement des déchets porte une plus grande attention à son impact sur
l’environnement. Ainsi, les centres d’enfouissement techniques exigent davantage d’analyses sur
des paramètres particuliers. Outre les analyses sur les eaux d’infiltration ou résiduaires, l’analyse
des boues fait son apparition. Le travail sur de nouvelles matrices demande un élargissement des
compétences et une extension du parc matériel. Une étude d’opportunité déterminera s’il convient
d’investir dans ce domaine ou d’avoir recours à une sous-traitance systématique.
Enfin, les secteurs d’activité traditionnels bénéficieront d’une attention soutenue et l’accréditation
COFRAC fera l’objet de demandes d’extension à des paramètres devenus fréquents à analyser. Ces
extensions seront examinées début 2007 lors d’un audit diligenté par le COFRAC.
L’ensemble de ces facteurs permet d’anticiper une croissance significative du chiffre d’affaires en
2007 qui doit, compte tenu des mesures de maîtrise des dépenses, conduire à une rentabilité
acceptable de l’activité du laboratoire.
Le centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
L’équipe
• René CHANSIN, chef de service
• Ngoc Lam NGUYEN, médecin
• Sylviane TEURURAI, infirmière
• Véronique MOU, adjointe de soins
• Anne BELLEOUD, médecin (du 6 décembre 2006 au 03 avril 2007)
• Isabelle CAZALENS, infirmière (du 1 er septembre 2006 au 31 mars 2007)
Le personnel médical comprend un médecin à temps plein, salarié de l’ILM, et un médecin
pneumologue, prestataire de service, qui a assuré 4 demi-journées de consultation par semaine.
Une infirmière et d’une adjointe de soins complètent l’équipe du Centre de consultation médicale
et d’investigation épidémiologique.
L’absence simultanée de l’infirmière, en disponibilité pour un an à compter du 1 er avril 2006 et du
médecin, en congé administratif pour une durée de quatre mois à dater du 08 décembre 2006, a
rendu nécessaire le recrutement de deux agents en contrat à durée déterminée. Un médecin,
toutes les compétences requises en matière de VIH/sida, lèpre, maladies infectieuses et
parasitaires, a ainsi pris le relais des consultations dans les meilleures conditions.
Le remplacement de l’infirmière s’est révélé plus problématique faute de candidats remplissant les
conditions de l’appel à candidatures publié dans la presse locale. Ce n’est que 5 mois plus tard que
le poste a pu être pourvu.
Le bilan de l’activité médicale en 2006
De façon globale, l’activité du CIE est restée stable. En 2006, ont été enregistrées
2413 consultations contre 2326 en 2005, soit une augmentation de 3,7%, les patients de sexe
masculin représentant 55% du total.
Les motifs de consultation concernent :
la tuberculose : 347 (14,4%)
le dépistage anonyme et gratuit du sida : 516 (2,4%)
la ciguatéra : 59 (2,4%)
la lèpre : 134 (5,6%)
le VIH/sida : 414 (17,2%)
les MST : 68 (2,8%)
les conseils aux voyageurs et vaccinations : 182 (7,5%)
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 80

la filariose : 25 (1%)
divers : 668 (27,7%)
Total
M
Sexe
F
Filariose
Tuberculose
Lèpre
Ciguatéra
Divers
Dépistage
anonyme
du sida
MST
LAV
Fièvre jaune
Conseils
aux voyageurs
2005 2326 1252 1074 44 375 144 80 603 452 161 318 117 32
2006 2413 1335 1078 25 347 134 59 668 516 68 414 182 2
La comparaison avec l’année précédente fait apparaître une diminution des consultations pour les
pathologies traditionnellement dévolues à l’ILM : lèpre, filariose, tuberculose, MST. A contrario, les
consultations sont plus nombreuses pour le VIH/sida, le dépistage anonyme et gratuit du sida et les
« divers ».
Par ailleurs, le CIE a continué de participer aux campagnes de consultation anti-tabagique mises en
place par la Direction de la Santé.
Le centre de distribution biomédicale
L’équipe
• Agnès BESSOU, chef de service
• Willy DECIAN, gestionnaire de stock
• Sylvia BENNETT, agent commissionnaire
La mission du DBM est double, elle se partage entre l’activité commerciale (vente de vaccins,
réactifs de laboratoire, préparations de désensibilisation allergique et produits vétérinaires) et la
gestion interne des stocks (réactifs de laboratoire, consommables, solvants à usage des laboratoires
d’analyses et de recherche de l’ILM).
Le bilan
1- La gestion interne du stock de l’ILM
La nomination en janvier 2006 d’un surveillant de laboratoire au LABM a permis de mettre en
place un partenariat efficace avec le gestionnaire de stocks et améliorer ainsi le
fonctionnement en interne.
Consommables
Sur la base des besoins exprimés par les différentes entités de l’Institut, le gestionnaire de
stocks procède à des consultations auprès de différents fournisseurs et négocie le meilleur
rapport « qualité/prix ». Une commande annuelle est effectuée, puis complétée par une
commande de réajustement en cours d’année au gré des besoins.
Les consommables sont stockés sur le site de Paea. Une fois par semaine, le gestionnaire de
stocks approvisionne les laboratoires.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 81

Réactifs de laboratoire
Le gestionnaire de stocks est en charge des commandes de réactifs destinés au LABM. Il
passe ces commandes, établies par les responsables des paillasses et validées par le
surveillant, et suit leur acheminement en relation avec les transitaires.
S’agissant de la Recherche, les responsables de laboratoire effectuent eux-mêmes leurs
commandes dont ils transmettent une copie au gestionnaire qui supervise, dans ce cas
exclusivement, le suivi de l’acheminement.
Information sur le suivi des commandes
Le gestionnaire tient à disposition des unités concernées un tableau, consultable sur le
réseau Intranet et mis à jour régulièrement, regroupant l’ensemble des commandes de
consommables et réactifs. Dans le souci de communiquer une information claire et
exhaustive, les données telles que les délais prévisionnels d’arrivée, la date réelle
d’arrivée, la conformité des commandes, etc. y sont précisées.
2- L’activité commerciale
Analyse du chiffre d’affaires
250 000 000
200 000 000
150 000 000
FCP
100 000 000
50 000 000
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2 004 2 005 2 006
Figure 1 : Evolution du chiffre d’affaires de 1997 à 2006
Le chiffre d’affaires du DBM atteint 221.675.552 Fcfp et augmente ainsi de + 26%.
La commande de vaccins par la Pharmacie d’approvisionnement de la Direction de la Santé
a retrouvé le niveau des années précédentes après une baisse en 2006 due à un problème
budgétaire. Dans le même temps, l’ILM a remporté le marché du vaccin contre la grippe,
d’où une majoration de plus de 9 millions du chiffre d’affaires.
Les ventes de réactifs de laboratoire sont restées stables par rapport à 2005.
Par ailleurs, certains secteurs (vaccins vétérinaires et allergènes) affichent une hausse
significative. Afin de répondre aux besoins exprimés par les professionnels, le DBM a en
effet élargi sa gamme de produits vétérinaires. Par ailleurs, la désensibilisation allergique
se développe de plus en plus en Polynésie, notamment grâce à la simplification du protocole
à suivre, aux délais d’obtention des préparations raccourcis et à la présence d’un stock au
sein du DBM pour les compositions les plus courantes.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 82

Répartition du chiffre d’affaires par activité
Allergènes
Vaccins vétérinaires 7%
10%
Vaccins humains
55%
Réactifs de laboratoire
28%
Figure 2 : Répartition des ventes 2006 par secteur d’activité
140 000 000
120 000 000
100 000 000
80 000 000
FCP
60 000 000
40 000 000
20 000 000
-
Vaccins humains Réactifs de laboratoire Vaccins vétérinaires Allergènes
Figure 3 : Répartition des ventes en 2006
120 000 000
100 000 000
80 000 000
chiffre
d'affaires 60 000 000
HT en FCP
40 000 000
20 000 000
-
Sanofi Pasteur Biorad Virbac Stallergènes CSP Véto Santé
Figure 4 : Répartition du chiffre d’affaires par fournisseurs
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 83

140 000 000
120 000 000
100 000 000
en CFP
80 000 000
Vaccins humains
Réactifs de laboratoire
60 000 000 Vaccins vétérinaires
40 000 000
Allergènes
20 000 000
-
1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2 004 2 005 2 006
Figure 5: Evolution du chiffre d'affaires par secteurs d’activité
La vente des vaccins humains Sanofi Pasteur et du Spirolept® (vaccin contre la leptospirose)
représente 55% du chiffre d’affaires du DBM, soit une augmentation de 53% par rapport à
2005.
Les réactifs de laboratoire Bio-Rad (28% des ventes) accusent une baisse de 5% par rapport à
2005.
La vente des vaccins vétérinaires Virbac et Véto Santé est en hausse de 25%, grâce à
l’extension de la gamme proposée aux vétérinaires. Elle représente 10% du chiffre
d’affaires.
La vente des produits de désensibilisation allergique Stallergènes (immunothérapie
spécifique et housses anti-acariens) représente 7% du chiffre d’affaires, en hausse de 13%
par rapport à 2005.
Analyse de la clientèle
100 000 000
90 000 000
80 000 000
70 000 000
Chiffre 60 000 000
d'affaires
2006 50 000 000
40 000 000
30 000 000
20 000 000
10 000 000
0
Pharmappro Grossistes répartiteurs CHpf+CTS Laboratoires d'analyses privés Vétérinaires
Figure 6: Analyse de la clientèle du DBM en 2006
La pharmacie d’approvisionnement de la Direction de la Santé
L’activité réalisée avec la Santé publique est en nette progression (+ 44%) par rapport à
2005, malgré la diminution des commandes de réactifs de laboratoire consécutive à
l’intégration du Centre de Transfusion Sanguine (CTS) au CHPf en 2006.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 84

Cette hausse s’explique par l’obtention du marché de la vaccination grippe (21 000 doses)
pour la campagne de vaccination publique (personnes à risque, personnel de santé).
De plus, les recommandations relatives à la vaccination ROR (rubéole/oreillons/rougeole)
ont changé en 2006 : la 2 ème dose de vaccin qui était auparavant administrée à l’âge de
8 ans l’est à présent au cours de la 2 ème année. Cela a engendré de nombreux rattrapages.
Le Centre hospitalier de Polynésie française (Service de Biologie, Pharmacie, CTS)
Le chiffre d’affaires réalisé avec le CHPf est également en augmentation (+ 104%) du fait de
l’intégration du CTS.
Les grossistes répartiteurs
Leurs achats de vaccins et leurs commandes d’allergènes sont en hausse par rapport à 2005.
Les laboratoires d’analyses médicales
Leur consommation en réactifs de laboratoire Bio-Rad est stable par rapport à 2005.
Les vétérinaires
Le chiffre d’affaires réalisé avec les vétérinaires augmente de 23% en 2006.
Le DBM constate une hausse continue de l’activité vétérinaire chaque année, ce qui
encourage le développement d’une gamme de produits plus étendue pour répondre à la
demande de ces professionnels de santé, satisfaits du service du DBM, de ses compétences
en matière d’acheminement de produits réfrigérés et de la sécurité garantie du stockage et
de la livraison.
Répartition de la vaccination public/privé
100000
90000
80000
Nombre
de doses
70000
60000
50000
privé
public
40000
30000
20000
10000
0
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006
Figure 7 : Répartition de la vaccination Privé/Public
En 2006, la vaccination a été réalisée à 84% au sein des structures de santé publique. La
hausse observée est due principalement à la campagne de vaccination anti-grippe lancée
par le Ministère de la Santé. En effet, les vaccins prescrits par le secteur privé n’étant pas
remboursés par la Caisse de Prévoyance Sociale (CPS), une forte proportion de la population
s’est tournée vers les structures de santé publique, gratuites (consultation + fourniture de
vaccins).
Il est à noter que plus de 90% de la vaccination en Polynésie française est réalisée au moyen
des vaccins Sanofi Pasteur.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 85

Le DBM au sein de l’ILM
300 000 000
250 000 000
Chiffre
d'affaires
200 000 000
150 000 000
Approvisionnement ILM
Ventes externes
100 000 000
50 000 000
-
2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006
Figure 8 : Répartition de l’activité du DBM
Le DBM compte 7 fournisseurs pour son activité commerciale.
S’agissant des réactifs de laboratoire, le DBM commande auprès de Bio-Rad et Biomérieux
des réactifs destinés à la fois à la vente et aux laboratoires de l’ILM (LABM, LASEA). En
2006, 20% de ces commandes étaient destinées aux laboratoires en interne.
Les équipements
Le DBM a fait l’acquisition en juillet 2005 d’un véhicule réfrigéré permettant d’assurer le transport
des vaccins et réactifs dans des conditions optimales.
En parallèle, une nouvelle chambre froide de grande capacité (13 m 3 ) a été installée en décembre
2005, afin de stocker la totalité des produits. Le DBM est dorénavant équipé de 3 chambres
réfrigérées, dont les températures sont surveillées au moyen d’une centrale de mesure
informatisée.
La mise en place, début 2007, d’un système d’alarme sur ces 3 chambres froides (activation en cas
de rupture de chaîne du froid), ainsi que d’un groupe électrogène adapté, viendra compléter le
système.
L’équipement sera alors entièrement sécurisé, performant et complet.
Les perspectives
Le DBM a remporté le marché 2006 des vaccins de la Santé Publique grâce à des prix très
compétitifs et un service unique en Polynésie, performant sur le plan technique et entièrement
sécurisé en matière de transport et de surveillance de température.
Il reste cependant impératif pour le DBM de pérenniser l’obtention du marché global des vaccins et
du marché du vaccin grippe pour assurer le maintien de son niveau d’activité.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 86

Bien que d’une année à l’autre, quelques variations affectent le chiffre d’affaires global, on
constate que le service fourni correspond aux besoins du marché local. Toutefois, le potentiel de
développement des différents secteurs d’activité reste relativement limité.
La stabilisation de l’activité du service à son niveau actuel avec une qualité de prestation
équivalente, notamment en ce qui concerne le maintien de la chaîne du froid de l’expédition du
produit à sa livraison au client, exigera des efforts continus que le DBM saura mettre en œuvre pour
assurer la pérennité de son activité.
S’agissant de la gestion de stocks en interne, il est indispensable de continuer les actions menées.
Les procédures d’évaluation des différents fournisseurs devront être améliorées afin de garantir à
l’établissement des prestations conformes aux exigences de chaque service tout en maintenant une
dépense de fonctionnement maîtrisée.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 87

Distinctions, prix
Après le Prix Trégouboff de Biologie Marine décerné en 2005 par l'Académie des Sciences de Paris,
le Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques a une nouvelle fois été distingué en 2006
pour ses travaux sur la ciguatéra, avec l'attribution du Prix Albert Sézary par l'Académie Nationale
de Médecine à Mme Mireille Chinain (co-lauréate avec Raymond Bagnis et Anne-Marie Legrand).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 88

Formation professionnelle
Service financier
E. BOUSQUIE : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006.
Service informatique
D. MARIN : ISO 27001 Lead Auditor – HSC Hervé Shauer Consultants, Levallois Perret, 4 au 8
décembre 2006.
C. HUGUES : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 29 mai 2006
C. HUGUES : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Service financier
G. TERIA : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006
M-F. BOURGEOIS, M. LAUSAN : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 29 mai 2006.
G. VIDAL : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Service technique
K. PUTOA, F. TAVAE : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
A-M. LEGRAND : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006.
C. PLICHART : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 29 mai 2006
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
M. CHINAIN : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006.
T. DARIUS, A. UNG : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité, 29 mai 2006.
T. DARIUS, T. REVEL : Maintenance et diagnostic de pannes sur le compteur à scintillation
liquide Trilux 1450-021 – 11 et 12 décembre 2006, (Papeete-ILM. C. Sanchez, PerlinElmer
France).
M. TCHOU FOUC, A. UNG : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
M. LORMEAU, J. VIALLON : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 89

M. FAARUIA : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
LECHAT : Spectrométrie de Masse – perfectionnement – Interprétation de spectres de masse -
Société VARIAN, Les Ulis, France, 25 au 27 avril 2006.
Y. MITERMITE : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
NL. NGUYEN : Formation en biostatistiques – John Hopkins University, Baltimore, USA, 22 juin au
2 juillet 2006.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
K. ESTALL, M. BOUGUES, E. GILLOT, D. KELLY, C. NATUA, T. SHAN, M. TEMUTU, P. TUHITI, K.
WALKER : Hygiène en laboratoire, Papeete, Responsable Qualité ILM, 27 février 2006.
C. COUDERT, M-L. LIAO : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006.
C. COUDERT : Leptospirose et leptospires – Institut Pasteur de Nouméa, avril 2006.
J. RUIZ SUQUILBIDE : Immunofluorescence directe – Hôpital Louis Moirier (Colombes) et Hôpital
Bichat (Paris), 17 au 28 avril 2006.
T. ROTILLON : Mycobactéries et actinomycètes aérobies – Bioformation, Lyon, 5 au 7 avril 2006.
R. GIAU, P. LUQUIAUD, A. TEISSIER, K. ZISOU : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité
ILM, 29 mai 2006.
V. DUGAY : Perfectionnement en cytométrie de flux – Laboratoire central d’immunologie
cellulaire, HP-AP Pitié-Salpêtrière, Paris, 17 au 24 mai 2006.
C. COUDERT : Techniques de laboratoire – Bioformation, juin 2006.
D. KELLY, M. LIAO, M. TEMUTU : Nettoyage et désinfection – Papeete, Responsable qualité ILM,
7 juin 2006.
H. HASCOET, D. KELLY, Y. MAOPI, T. SHAN, M. TEMUTU : Initiation à la lutte contre l’incendie –
Argos Polynésie, 6 juin 2006.
M. BOUGUES, C. NATUA, T. SHAN, P. TUHITI : Transport des échantillons - Papeete, Responsable
qualité ILM, 21 juin 2006.
F. BEAU : Medullogramme : notions de pathologie hématologique – Laboratoire d’Hémétologie
du CHU Purpan, Toulouse, 13 au 18 mai 2006.
K. ESTALL : Interprétation de l’hémogramme – Bioformation, Charenton-Le-Pont, 4 au 7 juillet
2006.
K. ESTALL, B. GENTOU, D. KELLY, T. GOBRAIT, C. LIVINE, V. MARIA, P. MAUCOTEL, M. TEMUTU,
K. WALKER : Nettoyage et désinfection des matériels et infrastructures, Papeete, Responsable
qualité ILM, 24 août 2006.
A. ANDREU, K. ESTALL, V. GERON, C. LIVINE, P. MAUCOTEL, A. SHAN YAN : Utilisation de
l’Hydrasys – Sebia/ILM, 15, 18 et 21 décembre 2006.
K. ZISOU : Secrétaire du CHSCT – CPS, Papeete, 4 au 6 décembre 2006.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 90

Laboratoire d’analyses de la salubrité des eaux et des aliments
M. DURDAN : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006
M. DURDAN : Spectroscopie d’absorption atomique – Varian, Paris, 19 au 21 avril 2006.
M. DURDAN : Contrôle de la charge organique et minérale dans les eaux de rejet – CPE, Lyon, 9
au 11 octobre 2006.
P. BRANAA : Sécurité sanitaire des aliments et analyse de risque – Institut Pasteur, Paris, 27
mars au 10 avril, 24 et 25 avril 2006.
M-P. FLEGEO : Recherche des légionelles par PCR en temps réel - Biorad, septembre 2006.
A. TANDIA : Le point sur les méthodes normalisées et validées en microbiologie des aliments –
Institut Pasteur de Lille, novembre 2006.
Centre de distribution biomédicale
A. BESSOU : Audit interne – Papeete, Responsable Qualité ILM, 10 avril 2006.
S. BENNETT : Initiation à la lutte contre l’incendie – Argos Polynésie, 6 juin 2006.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 91

Missions
Direction générale
R. TAPUTUARAI : Suivi de la lutte biologique contre le miconia, Raiatea et Tahaa, 28 au
30 novembre 2006.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
M. CHINAIN : Mission en Nouméa du 25 février au 3 mars 2006, à l'Institut Pasteur de Nouvelle-
Calédonie (IPNC) et l'Institut pour la Recherche et le Développement (IRD), à l'occasion de la
signature de la convention de recherche ILM-IPNC en présence de Mme Pia HIRO, Ministre de la
Santé, chargée de la Prévention, de la Sécurité alimentaire et de la Médecine traditionnelle
(cf : Rapport de mission du 10 mars 2006, 6 pp).
M. TCHOU FOUC : Prélèvements de microalgues ciguatérigènes, Mururoa, 12-13 avril 2006.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
R. TEYSSOU : Visite à l’Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie, Nouméa, 6 au 12 décembre 2006.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
A-M. LEGRAND : Réunion du comité locale d’IFRECOR, Teavaro, 22 août 2006.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
J. MARIE, A. TETUANUI : Pose de pièges, Moorea, 2 et 3 mars 2006.
J. MARIE, L. HAPAIRAI : Collecte d’insectes dans la vallée de la Punaruu, 20 juillet 2006.
J. MARIE, L. HAPAIRAI : Collecte entomologique à Moorea, 28 et 31 juillet 2006.
M. FAARUIA, A. TETUANUI : Dernier volet de l’évaluation PacElf à Tevaitoa (Raiatea), 12 février
au 24 février 2006.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
F. ADAM : Collecte de plantes dans le cadre du programme « Recherche, dans la biodiversité de la
Polynésie française, de substances naturelles possédant une activité répulsive/attractive vis-à-vis
de moustiques vecteurs de maladies tropicales », Taravao et Tiarei, 13, 15, 22 et 29 novembre
2006.
CIE/LEM
M. PIEHI : Programme d’évaluation de l’exposition prénatale aux métaux lourds chez les
nouveaux-nés de Polynésie française, Raiatea, 17-18 janvier, 3- 5 et 19-20 février 2006.
NL. NGUYEN, S. TEURURAI, H. HASCOET, J. VIALLON : Evaluation du programme PacElf à
Tevaitoa (Raiatea), 12 février au 4 mars 2006.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 92

NL. NGUYEN, J. MARIE, A. TETUANUI, M. FAARUIA, V. MOU, J. VIALLON, H. HASCOET :
Evaluation du programme PacElf à Tahuata (Marquises), 13 au 23 mars 2006.
NL. NGUYEN : Dépistage de la lèpre à l’hôpital de Moorea, 16 juin 2006.
NL. NGUYEN : Evaluation du programme PacElf à Maupiti, 24 au 27 octobre 2006.
NL. NGUYEN : Evaluation du programme PacElf à Tahuata (Marquises), 4 au 8 novembre 2006.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
S. LASTERE : Participation au Comité de lutte contre la dengue.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 93

Congrès et séminaires
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
C. PLICHART : 55 th Annual meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene,
11-15 novembre 2006, Atlanta, USA ; chairman de la session scientifique 44 “Filariasis I –
Clinical/Epidemiology du 14 novembre 2006, 8:00 - 9:45.
A-M. LEGRAND : 15 th World Congress on Animal, Plant and Microbial Toxins, 24-28 juillet 2006,
Glasgow (Grande-Bretagne), organisé par l’International Society of Toxinology et au 12 th
International Conference on Harmful Algae, 4-8 septembre 2006, Copenhague (Danemark),
organisé par l’International Society for the Study of Harmful Algae.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
M. CAO-LORMEAU : 55 th Annual meeting of the American Society of Tropical Medicine and
Hygiene, 11-15 novembre 2006, Atlanta, USA.
La participation à ce congrès a été l’occasion de faire le point sur les dernières recherches en
cours sur la dengue et autres arboviroses. Au cours des présentations orales (symposiums et
sessions scientifiques) et des sessions de présentations de posters, différentes thématiques de
recherche liées aux arboviroses ont été développées : des études cliniques et biologiques
(cohortes) aux derniers outils à envisager pour la transformation génétique de moustiques
vecteurs, en passant par l’étude des dynamiques d’évolution génétique du virus de la dengue à
différentes échelles (modèles de laboratoire : cultures cellulaires, passage sur modèles
animaux ; population naturelle : diversité intra-hôte, étude de clusters de population humaine
et vectorielle) et selon différents paramètres (taux de transmission, saisons). La participation et
la présentation des travaux du LVM (poster) au cours de ce congrès a également été l’occasion
d’échanges avec d’autres scientifiques, parmi lesquels de futurs collaborateurs.
R. TEYSSOU : Réunion du Groupe d’étude et d’information sur la grippe, 4 au 9 décembre 2006.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
M. CHINAIN, T. DARIUS : XII th International conference on harmful algal blooms, Copenhague,
Danemark, 4-8 septembre 2006.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
LECHAT : CIPAM (Colloque international plantes aromatiques et médicinales), 11-13 juillet 2006,
Papeete, Tahiti.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
J. MARIE : CIPAM (Colloque international plantes aromatiques et médicinales), 11-13 juillet 2006,
Papeete, Tahiti.
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
NL. NGUYEN : Conférence on retroviruses and opportunistic infections (CROI), 5-8 février 2006,
Denver, USA.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 94

NL. NGUYEN : 10 èmes Avancées VIH, 17-18 mai 2006, Paris.
NL. NGUYEN : 3 ème Réunion « Halte à la tuberculose dans les îles du Pacifique » - WHO/SPC Joint
Meeting, 31 juillet-3 août 2006, Nouméa, Nouvelle-Calédonie.
NL. NGUYEN : Régional TB/HIV meeting – SPC, 3 au 5 août 2006, Nouméa, Nouvelle-Calédonie.
NL. NGUYEN : 46 th ICAAC (Interscience conference on antimiocrobial agents and chemotherapy),
27 septembre-30 octobre 2006, San Francisco, USA.
NL. NGUYEN : 55 th Annual meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene,
11-15 novembre 2006, Atlanta, USA.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
S. LASTERE : 19 èmes Rencontres européennes sur la grippe et sa prévention – Groupe d’étude et
d’information sur la grippe, 5-6 octobre 2006, Paris.
C. COUDERT : 3 ème Réunion du ROSSP, 31 juillet au 4 août 2006, Nouméa, Nouvelle-Calédonie.
S. LASTERE : 3 ème Réunion « Halte à la tuberculose », 31 juillet au 5 août 2006, Nouméa,
Nouvelle-Calédonie.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 95

Publications scientifiques
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
ESTERRE P, PLICHART C, HUIN-BLONDEY MO, NGUYEN NL, HARTMANN D, GUERRET S, REIMERT
CM, RICARD-BLUM S. (2006) Circulating fibrosis markers, eosinophil cationic protein and
eosinophil protein X in patients with Wuchereria bancrofti infection: association with clinical
status. Parasite. Jun;13(2):165-70.
PLICHART C, LANEY S, SECHAN Y, DAVIES N, LEGRAND AM. (2006) PCR and dissection as tools
to monitor filarial infection of Aedes polynesiensis mosquitoes in French Polynesia. Filaria J.
Feb 24;5:2.
PLICHART C, LEGRAND AM, NGUYEN NL. Les bactéries Wolbachia endosymbiotes des
nématodes et des arthropodes, outils de recherche dans la lutte contre la filariose lymphatique
de Bancroft et autres arboviroses. 1 – Les recherches prenant en compte la présence de
bactéries endosymbiotes dans la filaire Wuchereria bancrofti, var. pacifica. (Soumis à Bulletin
d’informations sanitaires et épidémiologiques).
PLICHART C, MARIE J, LEGRAND AM. Les bactéries Wolbachia endosymbiotes des nématodes et
des arthropodes, outils de recherche dans la lutte contre la filariose lymphatique de Bancroft et
autres arboviroses. 2 – Les recherches prenant en compte la présence de bactéries
endosymbiotes dans certains moustiques-vecteurs. (Soumis à Bulletin d’informations sanitaires
et épidémiologiques).
LEGRAND AM. Les bactéries Wolbachia endosymbiotes des nématodes et des arthropodes, outils
de recherche dans la lutte contre la filariose lymphatique de Bancroft et autres arboviroses. 3 –
Les bactéries endosymbiotes (Wolbachia et autres) présentes chez de nombreux arthropodes :
quels risques pour la santé humaine en Polynésie française. (Soumis à Bulletin d’informations
sanitaires et épidémiologiques). (Soumis à Bulletin d’informations sanitaires et
épidémiologiques).
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
LITAKER RW, VANDERSEA MW, KIBLER SR, FAUST MA, CHINAIN M, HOLMES MJ, HOLLAND C &
TESTER PA (2006). Taxonomy of Gambierdiscus including four new species, Gambierdiscus
caribbeanensis sp. nov., Gambierdiscus caroliniana sp. nov., Gambierdiscus carpenteri sp. nov.
and Gambierdiscus ruetzleri sp. nov. (Gonyaulacales, Dinophyceae). Phycologia (soumis).
DARIUS HT, PONTON D, REVEL T, CRUCHET P, UNG A, TCHOU FOUC M & CHINAIN M (2006).
Ciguatera risk assessment in two toxic sites of French Polynesia using the Receptor Binding
Assay. Toxicon (en révision)
LAURENT D, KERBRAT AS, DARIUS HT, GIRARD E, GOLUBIC S, BENOIT E, SAUVIAT MP,
CHINAIN M, MOLGO J & PAUILLAC S (2006). Are cyanobacteria involved in Ciguatera Fish
Poisoning outbreaks in New-Caledonia ? Toxicologic Pathology (soumis).
CHINAIN M, DARIUS T, YEN KAI SUN L. Essais-pilotes d’évaluation du risque ciguatérique à
Tubuai (Australes) et Nuku Hiva (Marquises). (Soumis à Bulletin d’informations sanitaires et
épidémiologiques).
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
FERQUEL E, GARNIER M, MARIE J, BERNEDE-BAUDUIN C, BARANTON G, PEREZ-EID C, POSTIC D.
Prevalence of Borrelia burgdorferi Sensu Lato and Anaplasmataceae. Members in Ixodes ricinus
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 96

ticks in Alsace, a focus of Lyme borreliosis endemicity in France. Appl Environ Microbiol
(soumis).
Laboratoire de recherche en virologie médicale
IMRIE A, ZHAO Z, BENNETT SN, KITSUTANI P, LAILLE M, EFFLER P (2006). Molecular
epidemiology of dengue in the Pacific : introduction of two distinct strains of dengue virus type-
1. Ann Trop Med Parasitol. Jun, 100(4):327-336.
ROCHE C, CASSAR O, LAILLE M, MURGUE B. Dengue-3 virus genomic differences that correlate
with in vitro phenotype on a human cell line but not with disease severity. Microbes &
Infections. Sous-presse
CAO-LORMEAU M, ROCHE C, TEYSSOU R. Standardisation d’outils moléculaires pour la
surveillance entomologique et biologique de la dengue et autres arboviroses en Polynésie
française. (Soumis à Bulletin d’informations sanitaires et épidémiologiques).
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
SNOGAN E, VAHIRUA-LECHAT I, HO R, BERTHO G, GIRAULT J-P, ORTIGA S, MARIA A, LAFONT R.
Ecdysteroids from the medicinal fern Microsorum scolopendria (Burm. f.), soumis à
Phytochemical analysis.
VAHIRUA-LECHAT I, MARIE J, ADAM F, GERMAIN M, MENUT C. Contribution à la lutte
antivectorielle et à la prévention des maladies transmissibles : recherche dans la biodiversité de
Polynésie française de nouvelles substances naturelles insecticides vis-à-vis des moustiques.
(Soumis à Bulletin d’informations sanitaires et épidémiologiques).
VAHIRUA-LECHAT I, BOVY E, CUZON G, MITERMITE Y. Valorisation de la pêche thonière en
Polynésie française : teneur en oméga-3 de la graisse orbitale. (Soumis à Bulletin d’informations
sanitaires et épidémiologiques).
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
NGUYEN NL, PLICHART C, MARIE J, LEGRAND AM. La filariose lymphatique en Polynésie
française, situation actuelle vue au travers de trois sites sentinelles. (Soumis à Bulletin
d’informations sanitaires et épidémiologiques).
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
GIAU R, CHUNE P, TETARIA C, ANTIGNAC C, HEIDET L, FOURNIER A, CORDONNIER C,
CHANSIN R. Etude génétique de la néphropathie d’Alport en Polynésie française. (Soumis à
Bulletin d’informations sanitaires et épidémiologiques).
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 97

Communications orales, posters
LPM/CIE/LEM
NGUYEN NL, SECHAN Y, PLICHART C, TEURURAI S, HASCOET H, VIALLON J, MANUEL M,
MARIE J, MOU V, LEGRAND A-M (2006). “Intrinsic efficacy and real impact of the mass drug
administration with diethylcarbamazine and albendazole for the elimination of lymphatic
filariasis in French Polynesia”. 55 th Annual meeting of the American Society of Tropical Medicine
and Hygiene”, 11-15 novembre 2006, Atlanta, USA.
NGUYEN NL, SECHAN Y, PLICHART C, TEURURAI S, HASCOET H, VIALLON J, MANUEL M,
MARIE J, MOU V, LEGRAND A-M (2006). “Efficacy and limitations of the pacific programme to
eliminate Lymphatic filariasis (PacElf) in the French Polynesia sentinel sites : a dream beyond
our grasp ?” 55 th Annual meeting of the American Society of Tropical Medicine and Hygiene”, 11-
15 novembre 2006, Atlanta, USA.
PLICHART C, NGUYEN NL, SECHAN Y, MARIE J, VIALLON J, MANUEL M, LEGRAND A-M (2006).
“Monitoring of Wuchereria bancrofti parasitism in an endemic sentinel site : a three time survey
of adult worm infection level in human population and larvae circulation through Aedes
polynesiensis mosquito-vector”. 55 th Annual meeting of the American Society of Tropical
Medicine and Hygiene”, 11-15 novembre 2006, Atlanta, USA.
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
• PAUILLAC S, VERNEL-PAUILLAC F, KUMAR-ROINE S, SAUVIAT MP, BENOÎT E, CHINAIN M &
LAURENT D (2006). First evidence for the implication of Nitric Oxide in Ciguatera Fish
Poisoning. XII th International Conference on Harmful Algae, Copenhague, Danemark, 4-
8 septembre 2006
• TESTER PA, FAUST MA, VANDERSEA MW, KIBLER SR, CHINAIN M, HOLMES MJ, HOLLAND C &
LITAKER RW (2006). Does Gambierdiscus toxicus exist ? XII th International Conference on
Harmful Algae, Copenhague, Danemark, 4-8 septembre 2006.
• LAURENT D, KERBRAT AS, DE FREMICOURT I, DARIUS HT, CHINAIN M & PAUILLAC S (2006).
Involvement of cyanobacteria in the tropical ecotoxicological phenomenon of ciguatera fish
poisoning. XII th International Conference on Harmful Algae, Copenhague, Danemark, 4-
8 septembre 2006.
• DARIUS HT, REVEL T, UNG A, CRUCHET P, TCHOU FOUC M & CHINAIN M (2006). The
situation of ciguatera fish poisoning in French Polynesia from 2000 to 2004. XII th
International Conference on Harmful Algae, Copenhague, Danemark, 4-8 septembre 2006.
• CHINAIN M, WONG O, UNG A, DARIUS HT, REVEL T & CRUCHET P (2006). FITC-conjugated
lectins as a tool for differentiating between various Polynesian strains of the ciguateracausing
dinoflagellate, Gambierdiscus spp. XII th International Conference on Harmful Algae,
Copenhague, Danemark, 4-8 septembre 2006.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
• VAHIRUA-LECHAT I. Huiles essentielles de plantes aromatiques médicinales polynésiennes.
Colloque international plantes aromatiques et médicinales. 11-13 juillet 2006, Papeete,
Tahiti. Communication orale
• ADAM F, VAHIRUA-LECHAT I, MARIE J, MITERMITE Y, GERMAIN M, RAHARIVELOMANANA
PH. Composition chimique d’une huile essentielle de « Miri tahiti » ou basilic tahitien
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 98

possédant une activité répulsive vis-à-vis de Aedes aegypti. Colloque international plantes
aromatiques et médicinales, 11-13 juillet 2006, Papeete, Tahiti. Poster
• VAHIRUA-LECHAT I , MARIE J, MITERMITE Y, CAVE D, VOGNIN F, GERMAIN M. Composition
chimique d’une huile essentielle de « Ti » possédant une activité répulsive vis-à-vis de
Aedes aegypti. Colloque international plantes aromatiques et médicinales, 11-13 juillet
2006, Papeete, Tahiti. Poster
• VAHIRUA-LECHAT I, MARIE J, MITERMITE Y, GERMAIN M. Composition chimique d’une
huile essentielle d’Eucalyptus possédant une activité répulsive vis-à-vis de Aedes aegypti.
Colloque international plantes aromatiques et médicinales, 11-13 juillet 2006, Papeete,
Tahiti. Poster
• VAHIRUA-LECHAT I, MITERMITE Y, MENUT C, BESSIERE J-M. La vanille tahitienne :
analyses fines du profil aromatique par chromatographie en phase gazeuse. Colloque
international plantes aromatiques et médicinales, 11-13 juillet 2006, Papeete, Tahiti.
Poster
• BOVY E, CUZON G, VAHIRUA-LECHAT I. Tuna waste in Papeete : How to process, What to
do with the product ? 7 ème Congrès ISSFAL, 23-28 juillet 2006, Cairns, Australie. Poster
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 99

Stagiaires, doctorants
Service financier
Y. TIN HIN, élève du Lycée Victor Louis de Talence, 06 au 17 novembre 2006.
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
1- Stagiaires
Manuarii MANUEL, étudiant titulaire d’une licence de Biologie cellulaire et Physiologie de
l’Université, stagiaire en Contrat Volontaire au Développement (CVD) pour un an à partir du
21 octobre 2005.
Caroline ROTH, 8 au 25 août 2006.
2- Doctorants
Thèses de pharmacie
• « Wolbachia, bactéries endosymbiotes de Wuchereria bancrofti. Dernières
connaissances sur la pathogénie des filarioses lymphatiques et nouvelles perspectives
thérapeutiques », Tiphaine MALAVAL, Université Bordeaux 2 – Victor Ségalen, soutenue
le 7 décembre 2006.
• « Wolbachia, bactéries parasites endocellulaires des arthropodes. Implication possible
dans la transmission de la filariose lymphatique de Bancroft en Polynésie française.
Clément FROISSART, Université Bordeaux 2 – Victor Ségalen, en préparation.
Thèses de médecine
« La ciguatéra en Polynésie française, étude de 126 cas hospitalisés au Centre Hospitalier de
Papeete sur la période 1999 – 2005 », Erwan OEHLER, Université de Rennes 1, en
préparation.
Thèses en sciences de la vie, option physiologie (2006-2008)
« Les neuropathies d’origine toxique en Polynésie française. Caractérisation
physiopathologique des principales intoxications par biotoxines marines (ciguatéra et
autres) », Clémence GATTI, Université de Polynésie française, Ecole Doctorale
Pluridisciplinaire Numérique « Milieux Insulaires Ultramarins » (EDPn MIUM), en cours.
• Volet 1 : Bilan des cas d’intoxications par biotoxines marines traités au CHPf pour la
période 1999-2005 ; réflexions et discussions pour un meilleur suivi. Une présentation
par affiche a eu lieu à l’occasion du congrès mondial de l’International Society of
Toxinology, 24-28 juillet 2006, Glasgow (Grande-Bretagne) et une publication
scientifique : Severe seafood poisoning in French Polynesia : A retrospective analysis of
129 medical files, Clémence GATTI, Erwan Oehler, OEHLER, Anne-Marie LEGRAND a été
soumise à Toxicon.
• Volet 2 : Mise en évidence de l’apparition d’une neuropathie périphérique dysimmune
pouvant être à l’origine de la chronicité ou de la résurgence ponctuelle de symptômes
associés à un épisode d’intoxication par biotoxines marines. Evaluation de l’implication
du système immunitaire par dosages d’auto-anticorps dirigés contre le système nerveux
de patients. Un dosage d’auto-anticorps anti-myéline et anti glycoprotéines associées à
la myéline (anti-MAG) a déjà été effectué sur des sérums de patients modérément
intoxiqués et de témoins. Une recherche bibliographique approfondie et la mise au
point d’un protocole de recherche sont en cours.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 100

Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
Orama WONG, Master 1 ère année Université de Perpignan Via Domitia (France), 2 février-2
juin 2006. Titre du mémoire de stage : « Caractérisations toxicologique, morphologique et
moléculaire de souches polynésiennes du dinoflagellé ciguatérigène Gambierdiscus. Intérêt
des FITC-lectines et des sondes nucléiques pour leur identification taxonomique », 15 pp.
Lee Yen TEFAN, Licence de Biologie, Brigham Young University (Hawaii-USA), 1 er juillet-25
août 2006. Titre du mémoire de stage : « Gambierdiscus, dinoflagellate responsible for
Ciguatera Fish Poisoning : morphological and molecular characterizations of Polynesian
strains ».
S. KUMAR-ROINE, Laboratoire de pharmacochimie des substances naturelles et
pharmacophores Redox du centre IRD de Nouméa, 17 au 21 juillet.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
M. AUBRY, Master 1, Université Nice Sophia-Antipolis, janvier à juillet 2006 : Sujet de
stage : « Caractérisation de marqueurs génétiques corrélés à la virulence des souches de
dengue 3 isolées en PF : comparaison des séquences complètes de dengue 3 de génotypes
différents ».
M. CAO-LORMEAU, Thèse soutenue en mars 2006 : « Virus de la dengue et moustiques
vecteurs. Protéines se liant au virus de la dengue dans les extraits de cellule cibles et de
glandes salivaires de moustiques vecteurs ».
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
Elodie HOANG, 13 au 19 mai 2006, licence de biologie, Université de Pau.
Evelyne PARKER, Master 1 de chimie, 2 mois, Université Claude Bernard, Lyon.
Lisa SAINTAGNE, ingénieur GEPSUN, 6 mois
Anne-Sophie MAQUINHEM, ingénieur GEPSUN, 2 mois
Fanny ADAM, thèse de chimie organique, Université de Bretagne Occidentale.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
Limb HAPAIRAI, étudiant de l’Université de l’Utah (USA) - thème du stage : Valorisation et mise à
jour de la collection de référence entomologique de Polynésie française, 12 juin au 25 août 2006.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
Accueil d’étudiants stagiaires aux techniques de laboratoire tout au long de l’année.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 101

Activités d’enseignement, conférences
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
Fête de la Science, Te Fare Tauhiti Nui – La Maison de la Culture, 23-28 octobre 2006, Papeete,
Tahiti.
Présentation de deux posters :
• PLICHART C : La filariose, ce n’est pas fini.
• LEGRAND A-M : Parasites et insectes-vecteur : quels risques pour la santé humaine.
Laboratoire de recherche en virologie médicale
Fête de la Science, Te Fare Tauhiti Nui – La Maison de la Culture, 23-28 octobre 2006, Papeete,
Tahiti.
Présentation de trois posters : 1,2, 3 Dengue
• Qu’est-ce que la dengue ?
• Comment savoir si tu as la dengue ?
• QCM
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
"Les Mardis de la Découverte", IRD, 27 février 2006, Nouméa, Nouvelle-Calédonie.
Fête de la Science, Te Fare Tauhiti Nui – La Maison de la Culture, 23-28 octobre 2006, Papeete,
Tahiti.
Présentation de deux posters :
• DARIUS T : Comment détecter les ciguatoxines dans le poisson ?
• CHINAIN M : A la recherche de la petite algue qui gratte.
Demandes de documentation assurées via l'internet.
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
Fête de la Science, Te Fare Tauhiti Nui – La Maison de la Culture, 23-28 octobre 2006, Papeete,
Tahiti.
Présentation de deux posters :
• LECHAT I : Et si les plantes nous aidaient à combattre les moustiques ?
• ADAM F : Tout sur les huiles essentielles.
Laboratoire de recherche en entomologie médicale
Fête de la Science, Te Fare Tauhiti Nui – La Maison de la Culture, 23-28 octobre 2006, Papeete,
Tahiti. J. MARIE, membre du Comité d’organisation et coordinateur pour l’ILM.
Présentation de deux posters :
• MARIE J : Le moustique, l’homme et les maladies… Un trio sans faille ?
• HAPAIRAI L : Pourquoi collectionner les petites bêtes ?
Cours sur les « Insectes nuisibles en zone tropicale » dans le cadre de la Licence professionnelle,
CAMI.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 102

Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
10 heures de cours sur le VIH/sida et les MST à l’Institut de soins infirmiers Mathilde Frébault.
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
Participation du LABM à la surveillance des épreuves du baccalauréat (section sciences et
techniques de laboratoire) et fourniture de souches bactériologiques.
Fourniture de souches bactériologiques au Lycée La Mennais.
Fête de la Science, Te Fare Tauhiti Nui – La Maison de la Culture, 23-28 octobre 2006, Papeete,
Tahiti.
Présentation d’un poster :
COUDERT C : La leptospirose, une menace pour tous. Le diagnostic biologique s’impose.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 103

Collaborations
Laboratoire de recherche en parasitologie médicale
Dr A. WIEGANDT
Dr J.-C. ROULLET
Dr S. DOBSON
Direction de la santé
Centre hospitalier de Polynésie française
Université du Kentucky, USA
Laboratoire de recherche en virologie médicale
B. MURGUE Institut de recherche pour le développement, Paris
R. CHARREL
X. de LAMBALLERIE
Faculté de Médecine, Marseille
S. LONCKE Centre d’hygiène et de salubrité publique
M. GRANDADAM IMTSSA, Marseille
A. IMRIE Université d’Hawaii, USA
J. LEININGER Cellule prévention santé, Raiatea
C. HERBAUT Université de Polynésie française
Laboratoire de recherche sur les micro-algues toxiques
Dr E. DEWAILLY
Dr M.-L. CHATEAU-DEGAT
Dr J. RAMSDELL
Dr M.-Y. DECHRAOUI-BOTTEIN
Dr Z. WHANG
COMSUP, Division Opérations
Dr C. MUSA
Dr L. VILLIERS
Dr S. PAUILLAC
Unité de Recherche en Santé Publique, Centre Hospitalier de
l’Université de Laval, Québec, Canada
Center for Coastal Environmental Health and Biomolecular
Research (CCEHBR), NOAA, Charleston, Caroline du Sud, USA
Ministère de la Défense
Département de Suivi des Centres d’Essais Nucléaires (DSCEN),
Service des Programmes Nucléaires et de Missiles, Arcueil, France
Laboratoire des Biotoxines, Institut Pasteur, Nouvelle-Calédonie
H. GORAGUER Laboratoire de Production Algale, Ifremer, Tahiti
Dr D. LAURENT
Dr W. LITAKER
Dr P. TESTER
Dr M. FAUST
UMR 152 Pharmacochimie des Substances Naturelles et
Pharmacophores Redox, IRD, Nouvelle-Calédonie
Center for Coastal Fisheries and Habitat Research, NOS/NOAA,
Beaufort, Caroline du Nord, USA
United States National Herbarium, Smithsonian Institution,
Suitland, Maryland, USA
Laboratoire de recherche sur les substances naturelles
G. CUZON IFREMER, Vairao, Tahiti
E. BOVY Service de la pêche, Tahiti
P. RAHARIVELOMANANA Université de la Polynésie française
T. TEAI GEPSUN
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 104

Laboratoire de recherche en entomologie médicale
Dr V. CORBEL
J. BONNET
A-B. FAILLOUX
C. BERNEDE-BAUDUIN
Dr L. GUILLOMAUT
Dr S. DOBSON
Institut de recherche pour le Développement, Laboratoire de lutte
contre les insectes nuisibles, Montpellier
Institut Pasteur, Paris
Institut Pasteur de Nouméa, Nouvelle-Calédonie
Université du Kentucky
Centre de consultation médicale et d’investigation épidémiologique
Dr E. DEWAILLY
Direction de la santé
Unité de Recherche en Santé Publique, Centre Hospitalier de
l'Université de Laval, Québec, Canada
Laboratoire d’analyses de biologie médicale
Dr A. WIEGANDT, Dr S. YNESTA Direction de la santé
Dr M. LEVI
Dr T. KIEDRZYNSKI
Dr A. BERLIOZ
Dr J-D. POVEDA
Dr M. CORNET
Dr I. BARR
Dr P. THULLIEZ
Centre hospitalier de Polynésie française (Biologie)
Commission du Pacifique Sud
Institut Pasteur de Nouméa, Nouvelle-Calédonie
Laboratoire de biologie moléculaire – Pasteur Cerba
CNR Leptospirose – Institut Pasteur de Paris
Centre mondial OMS de référence et de recherche sur la grippe
Melbourne, Australie
Institut de puériculture et de périnatalogie, Paris
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 105

Autres
Visites scientifiques
M. GAGNEPAIN, Conseiller pour la politique internationale auprès du Directeur de CNRS,
11 octobre 2006.
Pr Eric DESLANDES, Directeur du Laboratoire d’écophysiologie et de biotechnologie des
halophytes et des algues marines de l’Université de Bretagne occidentale (UBO).
Rapports techniques
VAHIRUA-LECHAT I : Rapport de mission sur la participation au Congrès PACIFICHEM, Honolulu, 15
au 20 décembre 2005, 80 p.
VAHIRUA-LECHAT I : Rapport d’activité 2005, 29 p.
HOANG E : Rapport de stage de licence de biologie, 39 p, annexe 12 p.
PARKER E : Rapport de stage de Master 1 de chimie, Université Claude Bernard de Lyon, 65 p.
VAHIRUA-LECHAT I : Rapport intermédiaire THON.
VAHIRUA-LECHAT I : Rapport d'exécution du programme « Valorisation des déchets de la pêche
thonière en Polynésie française. Etude de la teneur en oméga-3 de la graisse orbitale », 79 p.
ADAM F : Rapport d’activité de thèse, 89 p.
Institut Louis Malardé – Rapport annuel 2006 106