Etude biochimique et nutritionnelle de l'effet immunomodulateur des ...

Intermédiaire PLD-PA
Hydrolyse ou
transphosphatidylation
Libération
du produit
Histidines
catalytiques
Liaison au substrat
Domaine
HKD
Figure 9: Modèle théorique de catalyse par les PLD
Le mécanisme est divisé en quatre étapes successives. Ce modèle a pu être élaboré grâce aux
observations de Sung et al. (1997) et Stuckey et Dixon (1999). Au début de la réaction, seul un des
deux résidus histidyl- du site catalytique est protoné. La première demi-réaction (étapes 1 et 2)
conduit à la formation d’un intermédiaire phosphatidyl-PLD covalent « PLD-PA intermediaire ». La
formation de cet intermédiaire se traduit par la libération de la choline grâce à l’intervention de
l’histidine protonée, l’autre histidine du site catalytique étant liée de manière covalente au
groupement phosphatidyl-. Dans la deuxième demi-réaction (étapes 3 et 4), il se produit une
substitution nucléophile grâce à une molécule d’eau ou d’alcool qui va ainsi libérer l’histidine de la
liaison covalente. Cette substitution nucléophile est réalisée grâce à l’histidine libre qui affaiblit une
liaison H - O de l’eau et se retrouve ainsi à nouveau protonée. Entre les étapes 3 et 4, l’acide
phosphatique ou le phosphatidylalcool selon la nature de l’accepteur nucléophile (H2O ou alcool
primaire) est libéré du site actif. La PLD est alors de nouveau capable de réaliser le même cycle
d’hydrolyse de la PC (étape 1) (MC Dermott et al., 2004).
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