Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
Bilan de la comparaison aison Microarrays Séquençage Génome de référence OUI Pour dessiner les oligonucléotides NON OUI pour l’alignement Technique Hybridation avec les sondes Accès direct à la séquence Système de détection Lecture de la fluorescence par un scanner: problème de détection dans les faibles et les fortes intensités Précision de la lecture à une base donc étude de SNP possible Coût + +++ Reproductibilité +++ +++ Obtention des résultats Rapide environ 4 jours Assez long environ 3 semaines Quantité de données générées é é + +++ Outils d’analyses statistiques Bien définis Encore en développement Analyses Etude de gènes différentiellement exprimés Épissage alternatif, découverte de nouveaux exons, quantification de transcrits http://get.genotoul.fr
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