Introduction au RNA-seq - Institut de Mathématiques de Toulouse
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Contrôles qualité des ARN ‣ Dosage au Nanodrop Concentration de l’ARN en ng/µL (au moins 100 ng/µL) Ratio 260/280: contamination par les protéines; doit être > 1.8 Ratio 260/230: contamination par les sels (résidus de l’extraction); doit être > 1.8 Peut engendrer une diminution du rendement de la Rétrotanscription ‣ Evaluation de l’état de dégradation de l’ARN par un dosage au Bioanalyser (Agilent) RIN (RNA Integrity Number) : compris entre 0 et 10 ; doit être > 8.5 28S/18S : doit être > 1.8 15 http://get.genotoul.fr
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Contrôles qualité <strong>de</strong>s ARN<br />
‣ Dosage <strong>au</strong> Nanodrop<br />
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Concentration <strong>de</strong> l’ARN en ng/µL (<strong>au</strong> moins 100 ng/µL)<br />
Ratio 260/280: contamination par les protéines; doit être > 1.8<br />
Ratio 260/230: contamination par les sels (résidus <strong>de</strong> l’extraction); doit être > 1.8<br />
Peut engendrer une diminution du ren<strong>de</strong>ment <strong>de</strong> la Rétrotanscription<br />
‣ Evaluation <strong>de</strong> l’état <strong>de</strong> dégradation <strong>de</strong> l’ARN par un dosage <strong>au</strong> Bioanalyser (Agilent)<br />
RIN (<strong>RNA</strong> Integrity Number) : compris entre 0 et 10 ; doit être > 8.5<br />
28S/18S : doit être > 1.8<br />
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