étude ostéo-morphométrique des tortues marines de ... - Seaturtle.org

La combinaison de paires retenue est celle pour laquelle la valeur de la longueur totale
L t de l’arbre est la plus petite. Le nœud de cette paire est alors considéré comme un nouvel
individu (regroupant deux individus) pour recalculer la matrice des longueurs totales des
différents arbres lors de l’itération suivante.
L’originalité de cette méthode repose sur le fait que l’arbre se construit itérativement à
partir d’un arbre initial (avant itération) en étoile qui représente la topologie où la longueur
totale est maximale. Les paires, puis les paires de paires sont ensuite déterminées à partir des
données de distances.
L’arbre final est obtenu après n-2 itérations et par nature n’est pas enraciné.
Il ne représente en aucun cas une phylogénie. Il s’agit pour nous uniquement d’une
représentation graphique des similitudes entre individus sur la base des informations globales
des formes des os, tenant compte des informations les plus significatives (premières
composantes de l’AFD) aux plus fines (dernières composantes de l’AFD retenues).
Elle présente donc l’avantage, par rapport à un graphique d’AFD ne figurant que deux
composantes, de tenir compte de la totalité des composantes retenues.
2-4-5-Etude comparative des formes aux extrémités des axes
factoriels de l’AFD
Dans la mesure où l’AFD optimise la séparation entre les groupes connus, l’analyse
des formes vraies des os pour les individus dont les projections sur les composantes
présentent des valeurs extrêmes (minimum et maximum) nous permet de repérer les structures
caractéristiques des groupes.
Pour chaque composante de l’AFD, on compare les formes centrées, réduites et
superposées des deux individus ayant respectivement la plus petite et la plus grande valeur de
projection.
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