étude ostéo-morphométrique des tortues marines de ... - Seaturtle.org
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La combinaison <strong>de</strong> paires retenue est celle pour laquelle la valeur <strong>de</strong> la longueur totale<br />
L t <strong>de</strong> l’arbre est la plus petite. Le nœud <strong>de</strong> cette paire est alors considéré comme un nouvel<br />
individu (regroupant <strong>de</strong>ux individus) pour recalculer la matrice <strong><strong>de</strong>s</strong> longueurs totales <strong><strong>de</strong>s</strong><br />
différents arbres lors <strong>de</strong> l’itération suivante.<br />
L’originalité <strong>de</strong> cette métho<strong>de</strong> repose sur le fait que l’arbre se construit itérativement à<br />
partir d’un arbre initial (avant itération) en étoile qui représente la topologie où la longueur<br />
totale est maximale. Les paires, puis les paires <strong>de</strong> paires sont ensuite déterminées à partir <strong><strong>de</strong>s</strong><br />
données <strong>de</strong> distances.<br />
L’arbre final est obtenu après n-2 itérations et par nature n’est pas enraciné.<br />
Il ne représente en aucun cas une phylogénie. Il s’agit pour nous uniquement d’une<br />
représentation graphique <strong><strong>de</strong>s</strong> similitu<strong><strong>de</strong>s</strong> entre individus sur la base <strong><strong>de</strong>s</strong> informations globales<br />
<strong><strong>de</strong>s</strong> formes <strong><strong>de</strong>s</strong> os, tenant compte <strong><strong>de</strong>s</strong> informations les plus significatives (premières<br />
composantes <strong>de</strong> l’AFD) aux plus fines (<strong>de</strong>rnières composantes <strong>de</strong> l’AFD retenues).<br />
Elle présente donc l’avantage, par rapport à un graphique d’AFD ne figurant que <strong>de</strong>ux<br />
composantes, <strong>de</strong> tenir compte <strong>de</strong> la totalité <strong><strong>de</strong>s</strong> composantes retenues.<br />
2-4-5-Etu<strong>de</strong> comparative <strong><strong>de</strong>s</strong> formes aux extrémités <strong><strong>de</strong>s</strong> axes<br />
factoriels <strong>de</strong> l’AFD<br />
Dans la mesure où l’AFD optimise la séparation entre les groupes connus, l’analyse<br />
<strong><strong>de</strong>s</strong> formes vraies <strong><strong>de</strong>s</strong> os pour les individus dont les projections sur les composantes<br />
présentent <strong><strong>de</strong>s</strong> valeurs extrêmes (minimum et maximum) nous permet <strong>de</strong> repérer les structures<br />
caractéristiques <strong><strong>de</strong>s</strong> groupes.<br />
Pour chaque composante <strong>de</strong> l’AFD, on compare les formes centrées, réduites et<br />
superposées <strong><strong>de</strong>s</strong> <strong>de</strong>ux individus ayant respectivement la plus petite et la plus gran<strong>de</strong> valeur <strong>de</strong><br />
projection.<br />
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