étude ostéo-morphométrique des tortues marines de ... - Seaturtle.org

2-Méthode
2-1-Méthode de prise des points :
La géométrie d’un objet biologique peut être numérisée de différentes manières et à
différentes résolutions. Par définition elle consiste à relever un nombre p de points en deux
dimensions (2D) ou trois dimensions (3D) de manière à le décrire au niveau de précision
souhaité.
La méthode des points repères, qui consiste à relever les coordonnées des p points
homologues sur un objet statique, permet de synthétiser rapidement un ensemble d’objets
similaires (même type de structure pour différents individus par exemple). Elle garantit aussi
la possibilité de d’obtenir des statistiques robustes pour comparer ensuite les objets entres eux
(Adams et al., 2004).
Une autre technique consiste à relever le contour d’un objet sans se préoccuper de ne
numériser que des points homologues mais en considérant l’ensemble des structures entre
elles comme homologues. Cette méthodologie est plus complexe et moins utilisée pour des
raisons pratiques. Nous avons souhaité la mettre en place pour comparer entres eux les
contours des épiphyses et des facettes articulaires afin de multiplier les méthodes et répondre
le plus possible à notre problématique.
• 2D
La méthode la plus utilisée pour positionner des points repères en deux dimensions sur
un objet biologique est l’application des points choisis sur une photographie de l’objet avec
une échelle de mesure. Elle est à la fois rapide et précise.
On pose dans notre cas l’os voulu sur une surface plane noire afin d’augmenter les
contrastes des contours. Pour les objets épais, l’échelle doit être élevée au niveau du plan de
mise au point afin de minimiser les effets de parallaxe de l’objectif.
Plus la photo est prise de loin et moins les effets de parallaxe seront importants : il faut
donc trouver un compromis de distance lentille – objet pour convenir à toutes les tailles des os
et minimiser la parallaxe.
Les photos sont ensuite directement importées dans la suite de logiciels de Stony
Brook Morphometrics de James Rohlf : Tps (http://life.bio.sunysb.edu/morph/). Elle permet
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