étude ostéo-morphométrique des tortues marines de ... - Seaturtle.org

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Sommaire ................................................................................................................................... 1 Sommaire des tables................................................................................................................... 6 Sommaire des figures ................................................................................................................. 8 PARTIE I.................................................................................................................................. 12 Introduction .............................................................................................................................. 12 1-Problématique ................................................................................................................... 14 2-Présentation des animaux.................................................................................................. 16 2-1-Rapide historique de la taxonomie des tortues marines ............................................ 16 2-2-La taxonomie des tortues marines, 200 ans après sa première formulation (tableau 1) .......................................................................................................................................... 16 2-3-Sept ou huit espèces ?................................................................................................ 17 3-Bibliographie..................................................................................................................... 18 3-1-Mesure de la croissance et de l’âge des tortues marines ........................................... 19 3-1-1-Définition des termes.......................................................................................... 19 3-1-2- Les difficultés pour mesurer la croissance ........................................................ 20 3-1-3-Estimation de l’âge d’une tortue marine : méthodes, critiques et alternatives... 21 a-Méthodes indirectes............................................................................................... 21 b-Méthodes directes.................................................................................................. 23 3-1-4-La morphométrie géométrique pour l’estimation de l’âge ................................. 24 3-2-Le lien entre le génome et la morphométrie : comprendre les relations phylogénétiques chez les tortues marines ........................................................................ 25 3-2-1-Méthodes pour la construction d’arbres phylogénétiques .................................. 25 3-2-2-Notion de tribu chez les tortues marines (tableau 2) .......................................... 28 3-2-3-Populations ou sous-espèces ?............................................................................ 28 3-3-Le lien entre la croissance et la morphométrie : comprendre les processus de croissance et d’allométrie................................................................................................. 30 3-4-Le lien entre l’environnement et la morphométrie : comprendre le mode de vie des tortues marines ................................................................................................................. 31 3-4-1-Cycle de vie ........................................................................................................ 32 3-4-2-Notion de population chez les tortues marines................................................... 34 PARTIE II ................................................................................................................................ 35 Matériel et méthode.................................................................................................................. 35 2
1-Matériel : le choix des os ...................................................................................................... 36 1-1-Critères de sélection................................................................................................... 36 1-2-Quels os retenir ? ....................................................................................................... 36 1-3-Présentation des os retenus........................................................................................ 38 2-Méthode ............................................................................................................................ 42 2-1-Méthode de prise des points : .................................................................................... 42 2-2-Choix des points repères............................................................................................ 44 2-2-1-Nature des points envisagés................................................................................ 44 2-2-2-Détails des points repères retenus sur les os (figures 6 à 10, tableaux 3 à 12)... 46 2-3-Préparation des données avant les analyses statistiques............................................56 2-3-1-Pourquoi préparer les données ?......................................................................... 56 2-3-2-Cas des points repères : la superposition Procuste ............................................. 57 a-Superposition par translation à partir des centres de tous les objets à comparer (figure12) .................................................................................................................. 58 b-Mise à l’échelle (figure 13) ................................................................................... 59 c-Rotation (figure 14) ............................................................................................... 61 2-3-3-Cas des points contours : modélisation et superposition.................................... 63 a-Centrage réduction des contours discrets (figure 17) ............................................ 64 b-Superposition des contours (figure 18) ................................................................. 65 c-Ajustement d’une fonction continue à un contour discret..................................... 67 2-4-analyses statistiques................................................................................................... 72 2-4-1-Analyse en composantes principales sur les os superposés................................ 73 2-4-2-Analyse de la variance multivariée..................................................................... 74 2-4-3-Analyse factorielle discriminante ....................................................................... 75 2-4-4-Analyse des similitudes : arbres de classification .............................................. 75 a-Calcul des distances............................................................................................... 75 b-Arbres de classification ......................................................................................... 76 2-4-5-Etude comparative des formes aux extrémités des axes factoriels de l’AFD..... 77 2-4-6-Analyse des allométries...................................................................................... 78 PARTIE III............................................................................................................................... 79 Résultats ................................................................................................................................... 79 1-La base de données obtenue après CRI............................................................................. 80 1-1-Les données dans leur ensemble................................................................................ 81 3
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Dans le cas particulier des contour
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a h = 2 P 2 πth n 2 th n−1
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Duguy, R., Morinière, P. & Meunier
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Loy, A., Busilacchi, S., Costa, C.,
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Pritchard, P.C.H., 1997. Evolution,
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Wiens, J.J., 2001. Character analys
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