BioBaz Campagnes Couv - Station Biologique de Roscoff

Demande de Campagne 2010 – 2011 

Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus 

BioBaz Initiale – 2010 

& 

BioBaz Centrale – 2011 

Pourquoi pas ? – Victor 

GDR 2907 Ecchis 

15 Janvier 2009 

Contact : François Lallier

PROPOSITION DE CAMPAGNE A LA MER 

IFREMER - IPEV – IRD 

FLOTTE OCEANOGRAPHIQUE 

APPEL D’OFFRES 2010 et 2011 

Nom de la campagne : 

Nom du chef de mission principal : 

BIOBAZ INITIALE 

François LALLIER 

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FICHE SYNTHETIQUE N°1 

NOM DE LA CAMPAGNE : 


Date de rédaction du dossier : JANVIER 2009 

Année demandée : 2010 Chef de mission principal Autre(s) chef(s) de 

mission 

Durée totale souhaitée ( de l’embarquement au 

débarquement : 

1 j sur site 

Période (si impératif) : 

LALLIER François 

Eté 2010 Nom Prénom : 

Zone : 

UPMC 

Dorsale Medio Atlantique Açores 

Organisme : 

(Menez Gwen) 

Pays dont les eaux territoriales sont concernées 

: Laboratoire : 

UMR 7144 

CNRS / UPMC 

Pays dont la zone économique est concernée : 

Portugal 

Station Biologique 

Adresse : 

29680 Roscoff 

Tél.: 02 9829 2311 

Fax : 02 9829 2324 

E-mail : lallier@sb-roscoff.fr 

Travaux : 

Récolte de moules sur le site Menez Gwen 

Equipes scientifiques et techniques embarquées 

1 personne – UMR 7144 ou Ifremer DEEP/LEP 

Navire(s) souhaité(s) par ordre de préférence : 

Pourquoi pas ? ou L'Atalante 

Engin(s) sous-marin(s) : 

ROV Victor ou Nautile 

Gros équipements : 

Ascenceur 

Nécessité d’une campagne pour récupération d’engins ? 

Non 

Equipes scientifiques et techniques à terre 

Participants de l'ANR BioBaz 

UMR 7144 AD2M UPMC-CNRS Roscoff 

UMR 7138 SAE UPMC-CNRS Paris 

DEEP/LEP Ifremer Brest 

EA 2160 Isomer Univ. Nantes 

IRSN-LERCM La Seyne 

DOP UAC Horta (Portugal) 

Type de campagne : Recherche scientifique 

Recherche Scientifique – "Transit valorisé" 

Thème de la campagne : 200 signes maxi 

BioBaz – Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus. Campagne initiale: récolte de moules pour travail expérimental à terre 

Cette proposition s’inscrit dans une série de campagnes : 

OUI - Voir campagne BioBaz Centrale 

Si oui nom du programme ou du chantier : 

Bio Baz – Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus - Projet ANR Non thématique 

Année de démarrage : 2009 Année prévue de fin : 2012 

Cette proposition est rattachée à des programmes nationaux ou internationaux avec comité scientifique : OUI - 

Si oui lesquels : GDR ECCHIS – GIS EUROPOLE MER 

Envoyer une copie de ce dossier de proposition de campagne aux responsables des programmes concernés 

S’agit-il d’une première demande ? : OUI - 

Si il y a eu une précédente demande fournir une copie du rapport de la commission l’ayant évaluée 

2






Estimation du coût du navire et des engins et de leur financement 

Types de coûts Coûts en Euros Sources et niveaux des 

financements assurés sur 

projet (ANR, EU …) 

Coût de fonctionnement du 

temps navire 

30000 

Coût de la mise en œuvre 

des engins sous-marins 

16000 

Coût de la mise en oeuvre 

des autres engins lourds 

Coût total 46000 

Sources et niveaux des 

financements envisagés 

sur projet (ANR, EU …) 

Pour compléter ce tableau contacter selon le navire demandé : flotte-ird@ird.fr ou Helene.Leau@ipev.fr ou 

dmon.prog@ifremer.fr 

Evaluation des frais directement à la charge de l’équipe demandeuse et de 

leur financement 


financements assurés 



Frais de préparation de la 

campagne (missions 

2000 ANR BioBaz 

préparatoires, équipement à 

acquérir, consommables, ….) 

Frais de missions (voyages + 

séjour) des membres de 

1500 GDR Ecchis ANR BioBaz 

l’équipe embarquant 

Frais d’acquisition de 

nouveaux matériels, contrat, 

sous-traitance 

Frais de transport du matériel 

propre à la campagne 

2000 GDR Ecchis ANR BioBaz 

Frais d’analyse et de 

dépouillement à terre 

12000 ANR BioBaz 

Autres frais (ex : chien de 

garde pour sismique) 

Coût total 17500 

Vous pouvez éventuellement rajouter, en annexe, une fiche détaillant les montants et les sources de financements que vous avez indiqués 

dans le tableau ci-dessus 

3



Avis et signatures des responsables 

Responsable 

hiérarchique du chef de 

mission principal* 

Responsable 

du programme 

(uniquement pour 

l’Ifremer) 

Autre responsable 

concerné 

Nom et Prénom LALLIER François LALLIER François 

Titre Directeur Directeur 

Unité UMR 7144 AD2M GDR 2907 ECCHIS 

Organisme UPMC - CNRS Ifremer - CNRS 

Adresse 





Tel 02 9829 2311 02 9829 2311 

Fax 02 9829 2324 02 9829 2324 

E-mail lallier@sb-roscoff.fr lallier@sb-roscoff.fr 

Nombre de dossiers 

présentés par l’unité 

Avis - Priorité 

(Obligatoire) 

Série de 2 campagnes 

2 

liées au projet BioBaz 

Priorité 1 Priorité 2 / 2 

Date et signature des 

responsables 

15/1/2009 15/1/2009 

* Suivant l’organisme dont dépend le chef de mission principal le responsable hiérarchique qui doit signer le 

dossier est : 

• pour l’Ifremer le directeur de département 

• pour les laboratoires universitaires et/ou CNRS le directeur du laboratoire (UMR …) 

• pour l’IRD le directeur du département de recherche 

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RESUME - ABSTRACT 



RESUME 

• Texte synthétique résumant l'ensemble des documents 1 à 6, lisible par un non spécialiste 

(ne pas dépasser 15 lignes) 

BioBaz Initiale (BBI) est une demande atypique: 1 plongée sur le site Menez Gwen de la dorsale Medio- 

Atlantique afin d'y effectuer une récolte de moules. L'espèce Bathymodiolus azoricus est en effet au cœur d'un 

projet de recherche, BioBaz : Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus, organisme modèle pour la symbiose 

chimiotrophe en environnement extrême. BBI constitue en fait la première campagne d'une série de 3 et son 

objectif est de pourvoir en matériel biologique la première session expérimentale intensive qui doit se dérouler à 

terre, à Horta (Faïal, Açores), immédiatement après la récolte. BBI est accompagnée d'une autre demande, 

BioBaz Centrale (BBC), prévue l'année suivante avec un véritable programme de travail in situ et à bord. La 

journée de campagne BBI peut être considérée comme un "transit valorisé" et peut (doit) se greffer à toute autre 

campagne avec submersible programmée sur la zone Açores, comme par exemple le projet de campagne 

MOMARSAT. 

ABSTRACT 

Traduction en Anglais du résumé 

BioBaz Initial (BBI) is an unusual proposal for 1 dive at the Menez Gwen site on the Mid-Atlantic Ridge to perform 

mussel sampling. The mussel species Bathymodiolus azoricus is the focus of a research project, BioBaz: Biology 

of Bathymodiolus azoricus, a model organism for chemotrophic symbiosis in an extreme environment. BBI is 

actually the first cruise of a set of 3 and it comprises a unique task: to provide biological material for the first 

intensive experimental session scheduled on land at Horta (Faïal, Azores) immediately after the cruise. BBI is 

linked to another proposal, BioBaz Central (BBC), scheduled one year after with a complete work program in situ 

and on board. The one-day cruise BBI can be viewed as a piggyback project to be linked to any other cruise 

scheduled in the Azores area with a submersible, the MOMARSAT proposal being particularly well suited for this 

purpose. 

5



DOCUMENT N° 1 



PROJET SCIENTIFIQUE,TECHNOLOGIQUE OU TECHNIQUE 

• Objectifs scientifiques, originalité de la demande et références bibliographiques (si projet pluridisciplinaire ou 

interdisciplinaire mettre en évidence le degré d’intégration des différentes composantes). 

• Si la campagne est incluse dans un projet comportant plusieurs campagnes mettre obligatoirement un diagramme avec 

toutes les campagnes concernées et leur chronologie - Préciser les obligations de retour sur zone, pour des relevages de 

mouillages par exemple. 

• Ce programme comporte t-il une partie terrestre ? si oui la décrire succinctement 

• Avancement du projet. Pour les campagnes antérieures préciser brièvement pour chacune d’elles les résultats majeurs 

obtenus et répondez à l’annexe sur la valorisation des campagnes réalisées 

• Collaborations et programmes de rattachement (nationaux et internationaux) 

• Résultats escomptés 

Le document 1 ne doit pas dépasser 12 pages maximum 

avec les illustrations et la bibliographie (15 pages pour les campagnes pluridisciplinaires) 

La campagne BioBaz Initiale (BBI) est une demande atypique pour une seule plongée sur le site Menez Gwen de 

la dorsale Medio-Atlantique afin d'y effectuer une récolte de moules. L'espèce Bathymodiolus azoricus ,abondante 

sur ce site, est en effet au cœur d'un projet de recherche, BioBaz : Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus, 

organisme modèle pour la symbiose chimiotrophe en environnement extrême. BBI constitue en fait la première 

campagne d'une série de 3 et son objectif est de pourvoir en matériel biologique la première session expérimentale 

intensive qui doit se dérouler à terre, à Horta (Faïal, Açores), immédiatement après la récolte. 

La demande BBI est accompagnée d'une autre demande, BioBaz Centrale (BBC), prévue l'année suivante (2011) 

avec un véritable programme de travail in situ et à bord. On trouvera ci-dessous un résumé succinct du projet 

BioBaz dont une version plus complète se trouve dans la demande BBC. Il est en effet évident que la présente 

demande ne peut-être jugée indépendamment de la demande BBC. 

Le projet BioBaz 

Ce projet de recherche a pour objectif d'étudier la biologie intégrée d'une symbiose entre un animal, la moule 

hydrothermale Bathymodiolus azoricus, et deux types de bactéries chimioautotrophes, l'une utilisant les sulfures et 

l'autre le méthane. Plusieurs raisons font de cette espèce un modèle intéressant. 

Tout d'abord, il y a relativement peu de modèles de symbioses eucaryote/procaryote qui soient étudiés jusque 

dans le détail des mécanismes moléculaires qui régissent l'équilibre délicat entre deux organismes distincts. En 

dehors du modèle plante/rhizobium (fixation d'azote dans les nodules racinaires) et de quelques modèles 

insectes/bactéries (complémentation alimentaire), on connaît peu d'endosymbioses bactériennes qui jouent un 

aussi grand rôle trophique que celles qui prévalent dans les écosystèmes chimiosynthétiques profonds. 

Par ailleurs, du fait de leur abondance, les modioles jouent un rôle écologique de premier ordre dans ces 

écosystèmes en structurant l'habitat pour le rendre disponible pour d'autres espèces (espèce "ingénieur"). Enfin, 

dans le cas de Bathymodiolus azoricus, la présence de deux types bactériens et l'apparente plasticité avec laquelle 

la proportion de ces deux types peut varier en fonction des caractéristiques de l'environnement (ration 

sulfure/méthane) en font un modèle expérimental particulièrement adapté à nos objectifs. 

Enfin, depuis une dizaine d'années, nous avons largement développé à la fois les outils qui nous permettent 

d'analyser l'environnement de ces espèces (analyseurs in situ) et de travailler de façon correcte sur ces animaux 

(enceintes hyperbares), et parallèlement, les outils moléculaires ("génomiques" au sens large) qui permettent 

aujourd'hui d'analyser la réponse de ces organismes de façon plus globale et plus détaillée. Le projet BioBaz a 

justement pour ambition de mettre en œuvre l'ensemble de ces outils en se focalisant sur une espèce modèle, 

Bathymodiolus azoricus. 

Les questions que nous nous posons sont les suivantes: 

- Quelle est l'équilibre entre sources photosynthétiques et chimiosynthétiques de la nutrition de B. azoricus à 

divers stades de son cycle de vie ? 

- Comment le type et l'abondance des symbiotes sont précisément liés aux conditions environnementales 

ou expérimentales de leur hôte ? 

- Comment les éléments traces mértalliques et radioactifs, abondants dans cet écosystème, influent-ils sur 

la réponse des organismes ? 

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- Est-ce que le génotype des hôtes influe sur l'efficacité de la chimiosynthèse, via la quantité et la spécificité 

(thiotrophe/méthanotrophe) des symbiotes ? 

Pour y répondre, nous proposons de réaliser un ensemble d'analyses (T3-T9 ci-dessous) de différents aspects de 

la biologie de B. azoricus, analyses toutes réalisées sur des lots d'individus soumis à des conditions 

expérimentales identiques. 

Le cœur du projet c'est donc un ensemble de 3 sessions de travail expérimental intensif (T2), réalisées à terre, à 

Horta (Faïal, Açores) en nous fondant sur l'expérience acquise depuis le programme européen Ventox (1999-2002) 

à l'origine de la mise en place de LabHorta. Un grand nombre d'expériences est prévu, à la fois sous pression 

atmosphérique et en enceintes hyperbares. Ces expériences sont réparties dans le temps en 3 sessions sur 18 

mois pour pouvoir affiner nos protocoles en fonction des premiers résultats. C'est précisément ce qui ne peut être 

réalisé, faute de temps, au cours d'une seule campagne océanographique. 

Naturellement, pour alimenter ces sessions expérimentales en matériel biologique, il nous faut bien sûr prélever 

des moules sur les sites où l'on sait les trouver, le site le plus favorable étant Menez Gwen où, 

1/ du fait de la profondeur modérée (-850m), la survie des moules récoltées par submersibles est la plus élevée, et 

2/ le fluide hydrothermal contient à la fois sulfure et méthane 

Mais ces expériences devront aussi être confrontées aux effets des variations naturelles de l'environnement. Elles 

doivent donc être complétées par un travail d'analyse similaire réalisé sur des individus provenant de sites 

contrastés: Lucky Strike et Rainbow. 

Nous envisageons donc un ensemble de 3 campagnes d'échantillonnage: 

- une première campagne d'1 jour, objet de la présente demande (BBI), pour fournir les échantillons 

nécessaires à la première session de travail 

- une seconde campagne (BBC BioBaz Centrale), plus ambitieuse, de 12 jours sur les 3 sites d'intérêt, pour 

réaliser tous les aspects environnementaux (analyses in situ et in vivo), récolter des moules pour la 

seconde session expérimentale à LabHorta, et déployer des cages à moules… 

- … qui seront récupérées au cours d'une troisième campagne, sans submersible, pour fournir les 

échantillons nécessaires à la dernière session de travail 

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DESCRIPTIF DE LA CAMPAGNE 

• Méthodologie détaillée et liste précise des travaux et de leur niveau d’intégration pour atteindre les résultats escomptés - 

stratégie, 

• Déroulement général de la mission, durée totale (incluant durée mobilisation/démobilisation), transits, temps sur zone, 

période souhaitée, escale éventuelle et motif de ce souhait, 

• Calendrier journalier prévisionnel des travaux présenté sous forme d’un tableau (J1 à Jx) précisant : travaux, stations, 

profils, zones d'études, transits inter-stations ou inter-zones (obligatoire). Pour les études de sismique et les levés sonar il 

est indispensable d'indiquer le nombre de milles nautiques des profils et les vitesses de déplacement du navire. 

Coordonnées du site 

Temps de transit 

Carte issue de http://www.ipgp.jussieu.fr/rech/lgm/MOMARNET/ 

Menez Gwen 37°51,60' N 31°31,30' W 850 m 

Menez Gwen – Horta : 13 h à 11 nœuds 

La campagne BBI peut être considérée comme un "transit valorisé" (piggyback en anglais) d'un genre particulier. 

Elle nécessite une seule plongée sur le site Menez Gwen à l'aide d'un submersible, Victor ou Nautile, chargé de la 

récolte de moules (environ 500 individus viables) dans le panier de récolte et dans des boîtes de prélèvement. La 

remontée des boîtes peut nécessiter un ascenseur. La durée de la plongée ne devrait pas excéder 6 heures sur le 

fond. 

Il est clair que BBI ne peut être réalisée de façon indépendante et dépend de la programmation dans la zone 

Açores d'une autre campagne avec submersible, BBI constituant alors une journée supplémentaire de travail sur le 

site Menez Gwen avec débarquement des échantillons récoltés à Horta immédiatement après récolte. Ce dernier 

impératif peut nécessiter un toucher à Horta si le port de débarquement de la campagne porteuse est différent. 

Cela correspondrait par exemple au projet de campagne MOMARSAT 1, campagne géologie-biologie demandée 

sur le site Lucky Strike. Dans l'éventualité de la programmation de MOMARSAT 1 en 2010, les embarquants 

chimistes ou biologistes de cette campagne pourraient gérer la journée de plongée supplémentaire sans problème. 

Dans l'éventualité du rattachement de BBI à une autre campagne, il serait éventuellement nécessaire d'embarquer 

un biologiste compétent pour assurer la supervision scientifique de la plongée (choix du site et des échantillons à 

prélever) et le conditionnement des moules. 

Calendrier journalier 

Jour Site Travaux 

J1 Menez Gwen BioBaz Sélection sites – Prélèvement moules 

J2* Horta Toucher pour Débarquement des échantillons 

* optionnel 

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MOYENS A METTRE EN OEUVRE 

• Navire support, submersible et positionnement (justifier le choix du navire et du submersible) 

• Équipements fixes mis en œuvre par GENAVIR, par l'IPEV ou par l’IRD (Tableau précisant pour chaque équipement : le 

type, le nombre, la fréquence et la durée d’utilisation envisagés) 

• Équipements mobiles mis en œuvre par GENAVIR, par l'IPEV, par l’IRD ou les parcs nationaux (INSU) (Tableau précisant 

pour chaque équipement : le type, le nombre, la fréquence et la durée d’utilisation envisagés) 

• Laboratoires et outils de dépouillement informatique nécessaires à bord 

• Est-il prévu d’embarquer des produits chimiques ou radioactifs ? pour les éléments radioactifs précisez lesquels 

• Matériel propre de l'équipe demandeuse (préciser existant ou à acquérir) 

• Personnel spécialisé si nécessaire 

• Besoins en équipements ou matériels complémentaires (préciser quels types ou spécifications) 

• Matériels fournis par des organismes extérieurs (préciser quels organismes ou laboratoires) 

• Moyens terrestres à mettre en œuvre 

Le seul impératif de BBI est de pouvoir disposer d'un submersible, Nautile ou Victor, et donc de son navire support, 

Pourquoi Pas ou L'Atalante, pour effectuer une plongée de récolte de moules. 

Des boites de prélèvement adaptées au submersible seront mises à disposition 

Nous devons pouvoir disposer d'un laboratoire thermostaté (4°-10°C max) avec alimentation en eau de mer pour 

stabuler les moules jusqu'au retour à terre à Horta (13 heures de transit depuis le site). Le matériel nécessaire, 

bacs plastiques de 50 litres environ, sera fourni. 

Pas de produits chimiques. 

Un biologiste compétent pour assurer la supervision scientifique de la plongée (choix du site et des échantillons à 

prélever) et le conditionnement des moules. 

9






ANALYSE ET TRAITEMENT DES ECHANTILLONS ET DES DONNEES 

• Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à bord (liste exhaustive, référence des méthodes de 

traitement) 

• Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à terre (liste exhaustive, référence des méthodes de 

traitement) - calendrier 

• Archivage des données (lieux, supports, mise à disposition des utilisateurs) 

• Stockage des échantillons (lieux et dispositifs pris pour leur conservation, leur maintenance et leur mise à disposition des 

utilisateurs) 

• Prévision et calendrier de publication des résultats (distinguer rapports de données, articles scientifiques, thèses …) 

Les modioles prélevés au fond seront transférées dans des bacs de stabulation themostatés pour leur transfert 

vers Horta. 

Le détail des expériences et analyses prévues à terre se trouve dans la demande BBC. 

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EQUIPE SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE 

• Equipe demandeuse : chef de projet - chefs de missions - équipe embarquée – équipe à terre (Laboratoire, spécialité, 

responsabilité et rôle à bord et à terre, participation à de précédentes campagnes) 

• Présentation des références scientifiques récentes de l'équipe demandeuse et, en particulier, état du traitement des données 

des dernières campagnes menées par les équipes participantes 

• Collaborations prévues (ne mentionner que si l'accord est acquis) - parts respectives des participations nationales ou 

internationales à terre et en mer. Y a-t-il un protocole ? 

1 - Equipe demandeuse 

Chef de projet : François Lallier 

Chef(s) de mission : François Lallier 

Dans l'éventualité où BBI serait greffée à MOMARSAT 1, aucun personnel supplémentaire ne serait nécessaire. Il 

y aurait à bord les compétences nécessaires pour assurer le suivi de la plongée et le conditionnement des moules 

prélevées. Par exemple, Jozée Sarrazin, Pierre-Marie Sarradin ou Ana Colaço. 

Dans l'éventualité où BBI serait greffée à une autre campagne sans aucun biologiste à bord, il pourrait être 

nécessaire d'embarquer une personne responsable de la supervision de la plongée et du conditionnement des 

moules prélevées. 

Equipe embarquée 

X 

Nom Prénom 

Institut 

Laboratoire 

Ifremer DEEP/LEP 

ou UMR 7144 

Spécialité 

Biologiste 

Responsabilité 

et rôle à bord 

(données, analyses …) 

Récolte et conditionnement des 

moules 


et rôle à terre 


Equipe à terre 

Voir la demande BBC pour une liste complète. 

Campagnes auxquelles les membres de l’équipe demandeuse ont participé au cours des 10 dernières 

années 

Voir la demande BBC 

2 - Références scientifiques de l’équipe demandeuse 

(Pour les campagnes réalisées au maximum dans les 10 dernières années par des participants ayant été chef de projet ou chef de mission 

joindre en annexe une fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques antérieures” pour chacune des campagnes 

concernées) 


3 - Collaborations prévues 

(Précisez l’appartenance à un programme national, international REX, PI européens) par exemple 


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ASPECTS INTERNATIONAUX ET ENGAGEMENTS CONTRACTUELS 

• Distinction entre travaux Eaux internationales - ZEE - Eaux territoriales 

• Contacts préliminaires éventuellement pris et interlocuteurs privilégiés des pays riverains 

• Personnel étranger invité 

• Manifestations éventuelles post-campagnes (colloques, conférences, échanges de personnel) 

• Engagements contractuels dans le cadre de programmes européens, financements européens 

• Autres engagements contractuels 

La zone de travail (site Menez Gwen), est située dans la ZEE portugaise. Une équipe portugaise fait partie 

intégrante du projet BioBaz ce qui devrait nous autoriser à travailler sur cette zone : 

Universidade do Azores (IMAR/DOP), à Horta. PI: Ana Colaço (acolaco@uac.pt ) 

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CURRICULUM VITAE DES CHEFS DE MISSION 

(1 page au maximum par personne) 

François H. LALLIER 

Né le 17 Novembre 1959 à Paris 14ème 

Professeur à l’Université Pierre-et-Marie-Curie (Paris 6) depuis 2003 

Directeur de l’UMR 7144 CNRS/UPMC Adaptation et Diversité en Milieu Marin depuis 2001 (90 personnes) 

Directeur du GDR 2907 Ifremer/CNRS Biologie des Ecosystèmes Chimiosynthétiques Profonds depuis 2009. 

Responsable de l’équipe Ecophysiologie de 1994 à 2003, et depuis 2009 (6-10 personnes) 

Habilitation à Diriger des Recherches. Université Pierre et Marie Curie. Octobre 2001. 

Doctorat de l'Université de Bordeaux I en Physiologie Animale. Novembre 1988 

Enseignant en 2 nd et 3 ème cycle, en zoologie et écologie marine, océanologie biologique, biodiversité, 

écophysiologie des organismes. 

Membre du Comité de Sécurité des Engins Habités (Ifremer-Genavir) depuis 2000 

Membre de la Commission Nationale d 

Programmes de recherche (extrait) 

•GDR Ecchis (Ifremer/CNRS) "Biologie des Ecosystèmes Chimiosynthétiques Profonds" 2005- 

•Unité de Recherches Marines N°7 (IFREMER/UPMC/CNRS), “Ecologie et Ecophysiologie des Organismes 

Hydrothermaux Thermophiles” 1993-2001. Membre contractant. 

•Programme national DORSALES 1994-2001. Plusieurs projets financés, responsable du groupe de projets 

Symbioses, organisation de colloques. 

•Programme MAST 3 (CEE). Partenaire contractant dans le projet AMORES (resp. D. Desbruyères), Azores Mid- 

Oceanic Ridge Ecosystem Studies: an integrated research program on deep-sea hydrothermal transfers and 

fluxes.1996-98. 

•Programme CEE-5°PCRD. Partenaire contractant dans le projet VENTOX (resp. D. Dixon, SOC, UK). 

"Hydrothermal vents as a natural pollution laboratory". 2000-02. 1200 kF 

Campagnes océanographiques 

•2010 MESCAL (CdM N. Le Bris & F. Lallier) EPR NO/L'Atalante - Nautile 

•2004 BIOSPEEDO (CdP F. Lallier ; CdM. D. Jollivet) SEPR. NO/L'Atalante - Nautile 

•2002 PHARE (CdM. N. Le bris) EPR. NO/L'Atalante - Victor 

•2001 ATOS (CdM. P.M. Sarradin) MAR. NO/L'Atalante - Victor 

•1999 HOPE 99 (CdM. F. Lallier pour l'URM 7) EPR. NO/L'Atalante - Nautile. 

•1997 MARVEL (CdM. Desbruyères/Alayse) MAR. NO/L'Atalante - Nautile. 

•1996 HOT 96 (CdM. F. Gaill pour l’URM 7) EPR. NO/Nadir - Nautile et RV/Wecoma. 

•1994 EPR9-13 (CdM. Mullineaux/Childress/Felbeck) EPR. RV/NewHorizon & RV/Atlantis2 - Alvin. 

•1994 DIVA2 (CdM. Desbruyères/Alayse) MAR. NO/Nadir - Nautile. 

Encadrement de thèses : Franck Zal (1996), Stéphane Hourdez (2000), Fabienne Chausson (2001) Marie- 

Cécile De Cian (2002), Sophie Sanchez (2007), Matthieu Bruneaux (2008), Joana Garcia (en cours), Sophie 

Plouviez (en cours). 

Publications : 5 récentes sélectionnées sur environ 60 

Bruneaux M., Rousselot M., Leize E., Lallier F.H. & Zal F. 2008. The Structural Analysis of Large Noncovalent 

Oxygen Binding Proteins by MALLS and ESI-MS: A Review on Annelid Hexagonal Bilayer Hemoglobin and 

Crustacean Hemocyanin. Current Protein and Peptide Science, 9: 150-180. 

Sanchez S., Hourdez S. & Lallier F.H. 2007. Identification of proteins involved in the functioning of Riftia 

pachyptila symbiosis by Subtractive Suppression Hybridization. BMC Genomics, 8: 337. 

Lallier, F. H. (2006). Thioautotrophic symbiosis: towards a new step in eukaryote evolution? Cahiers de Biologie 

Marine 47, 391-396. 

Chausson, F., Sanglier, S., Leize, E., Hagège, A., Bridges, C. R., Sarradin, P.-M., Shillito, B., Lallier, F. H. and 

Zal, F. (2004). Respiratory adaptations to the deep-sea hydrothermal vent environment: the case of Segonzacia 

mesatlantica, a crab from the Mid-Atlantic ridge. Micron 35, 31-41. 

De Cian, M.-C., Andersen, A. C., Bailly, X. and Lallier, F. H. (2003). Expression and localization of carbonic 

anhydrase and ATPases in the symbiotic tubeworm Riftia pachyptila. J. of Exp. Biology 206, 399-409. 

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ACCORD DES PERSONNELS EMBARQUANT 

(Chaque embarquant devra indiquer les autres propositions de campagnes pour lesquelles il a donné son accord) 

Sans objet. 

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Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques ” 

(à envoyer par courriel à Com-Flotte@ifremer.fr ) 

Les Fiches de valorisation des campagnes suivantes se trouvent dans la demande BBC: 

1999 HOPE – Chef de mission F. Lallier 

2001 ATOS – Chef de mission P.M. Sarradin 

2004 BIOSPEEDO – Chef de projet F. Lallier – Chef de mission: D. Jollivet 

2006 MOMARETO – Chef de mission J. Sarrazin et P.M. Sarradin 

15



FLOTTE OCEANOGRAPHIQUE 

APPEL D’OFFRES 2010 et 2011 

Nom de la campagne : 

Nom du chef de mission principal : 

BIOBAZ CENTRALE 

François LALLIER 

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Date de rédaction du dossier : JANVIER 2009 

Année demandée : 2011 Chef de mission principal Autre(s) chef(s) de 

mission 

Durée totale souhaitée ( de l’embarquement au 

débarquement : 16 j 

Période (si impératif) : Eté 2011 

Nom Prénom : 

Zone : Dorsale Medio Atlantique Açores 

(Rainbow-Lucky Strike-Menez Gwen) Organisme : 

Pays dont les eaux territoriales sont concernées 

: Laboratoire : 


UPMC 

UMR 7144 

CNRS / UPMC 

Pays dont la zone économique est concernée : 

Portugal 


Adresse : 


Tél.: 02 9829 2311 

Fax : 02 9829 2324 

E-mail : lallier@sb-roscoff.fr 

Travaux : 

Mesures in situ 

Échantillonnage fluide et faune 

Navire(s) souhaité(s) par ordre de préférence : 

Pourquoi Pas ? 

Engin(s) sous-marin(s) : 

ROV Victor 

Gros équipements : 

Equipes scientifiques et techniques embarquées 

Participants de l'ANR BioBaz 

UMR 7144 AD2M UPMC-CNRS Roscoff 

UMR 7138 SAE UPMC-CNRS Paris 

DEEP/LEP Ifremer Brest 

EA 2160 Isomer Univ. Nantes 

IRSN-LERCM La Seyne 

DOP UAC Horta (Portugal) 

Nécessité d’une campagne pour récupération d’engins ? 

Oui, avec navire portugais 

Equipes scientifiques et techniques à terre 

Idem 

Type de campagne : Recherche scientifique 

Thème de la campagne : 200 signes maxi 

BioBaz – Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus. Campagne centrale: mesures in situ, récolte de moules pour travail 

expérimental à bord et à terre, déploiement de cages instrumentées télélargables. 

Cette proposition s’inscrit dans une série de campagnes : OUI - 

Si oui nom du programme ou du chantier : 

Bio Baz – Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus - Projet ANR Non thématique 

Année de démarrage : 2009 Année prévue de fin : 2012 

Cette proposition est rattachée à des programmes nationaux ou internationaux avec comité scientifique : OUI - 

Si oui lesquels : GDR Ecchis 

Envoyer une copie de ce dossier de proposition de campagne aux responsables des programmes concernés 

S’agit-il d’une première demande ? : OUI - 

Si il y a eu une précédente demande fournir une copie du rapport de la commission l’ayant évaluée 

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Estimation du coût du navire et des engins et de leur financement 


financements assurés sur 

projet (ANR, EU …) 

Coût de fonctionnement du 12 j sur site 

temps navire 

360 000 € 

Coût de la mise en œuvre 12 j sur site 

des engins sous-marins 

192 000 € 



sur projet (ANR, EU …) 

6 jours ANR BioBaz 

180 000 € 

6 jours ANR BioBaz 

96 000 € 

Coût de la mise en oeuvre 

des autres engins lourds 

Coût total 552 000 € 276 000 € 

Pour compléter ce tableau contacter selon le navire demandé : flotte-ird@ird.fr ou Helene.Leau@ipev.fr ou 

dmon.prog@ifremer.fr 

Evaluation des frais directement à la charge de l’équipe demandeuse et de 

leur financement 


financements assurés 



Frais de préparation de la 

campagne (missions 

20 000 ANR BioBaz 

préparatoires, équipement à 

acquérir, consommables, ….) 

Frais de missions (voyages + 40 000 CNRS INEE (40%) 

ANR BioBaz (50%) 

séjour) des membres de 

Ifremer (10%) 

l’équipe embarquant 

Frais d’acquisition de 

nouveaux matériels, contrat, 

ANR BioBaz 

sous-traitance 

Frais de transport du matériel 

propre à la campagne 

40 000 CNRS INEE (40%) 


Frais d’analyse et de 

dépouillement à terre 

Autres frais (ex : chien de 

garde pour sismique) 

Coût total 220 000 

Ifremer (10%) 

180 000 Budgets propres aux équipe 

participantes (20%) 


Vous pouvez éventuellement rajouter, en annexe, une fiche détaillant les montants et les sources de financements que vous avez indiqués 

dans le tableau ci-dessus 

3



Avis et signatures des responsables 

Responsable 

hiérarchique du chef de 

mission principal* 

Responsable 

du programme 

(uniquement pour 

l’Ifremer) 

Autre responsable 

concerné 

Nom et Prénom LALLIER François LALLIER François 

Titre Directeur Directeur 

Unité UMR 7144 GDR 2907 

Organisme UPMC - CNRS Ifremer - CNRS 

Adresse 

Station Biologique de 

Roscoff 

Station Biologique de 

Roscoff 

Tel 02 9829 2311 02 9829 2311 

Fax 02 9829 2324 02 9829 2324 

E-mail lallier@sb-roscoff.fr lallier@sb-roscoff.fr 

Nombre de dossiers 

présentés par l’unité 

Avis - Priorité 

(Obligatoire) 

2 (liées au même projet) 3 (dt 2 liées au même 

projet) 

Priorité 1 Priorité 2/2 

Date et signature des 

responsables 

15/1/2009 15/1/2009 

* Suivant l’organisme dont dépend le chef de mission principal le responsable hiérarchique qui doit signer le 

dossier est : 

• pour l’Ifremer le directeur de département 

• pour les laboratoires universitaires et/ou CNRS le directeur du laboratoire (UMR …) 

• pour l’IRD le directeur du département de recherche 

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RESUME - ABSTRACT 



RESUME 

• Texte synthétique résumant l'ensemble des documents 1 à 6, lisible par un non spécialiste 

(ne pas dépasser 15 lignes) 

BioBazCentrale (BBC) est la principale campagne d'échantillonnage et d'expérimentation associée au projet 

BioBaz : Biologie intégrée de Bathymodiolus azoricus, organisme modèle pour la symbiose chimiotrophe en 

environnement extrême. Cette espèce abrite à la fois des symbiotes sulfo-oxydants et méthanotrophes en 

proportions variables selon les conditions environnementales des sites d'origine. BBC explorera donc les moulières 

des sites Menez Gwen (-850m), Lucky Strike (-1700m) et Rainbow (-2400m) de la dorsale medio-Atlantique au 

sud des Açores pour y réaliser parallèlement la caractérisation physico-chimique du micro-environnement et 

l'analyse de paramètres biologiques des moules et de leurs bactéries symbiotiques. L'originalité de BBC réside 

principalement dans la mise en œuvre conjointe d'outils d'expérimentation (enceintes hyperbares) et d'outils 

moléculaires (puces ADN, protéomique) permettant des approches expérimentales et des analyses globales. Ces 

analyses doivent aboutir à une meilleure compréhension de la relation symbiotique entre moules et bactéries, 

relation qui affecte aussi bien la nutrition, l'immunité, ou l'écotoxicologie de cette espèce. Deux objectifs 

supplémentaires, concernant les symbioses de crustacés et l'écologie des communautés, complètent le 

programme de BBC. Enfin, un échantillonnage spécifique à Menez Gwen et le déploiement de cages télélargables 

serviront à alimenter en modioles deux sessions expérimentales intensives à terre (LabHorta), l'une 

immédiatement après la campagne et l'autre dans un délai de 6 à 10 mois après la campagne. 

ABSTRACT 

Traduction en Anglais du résumé 

BioBaz Central (BBC) is the main sampling and experimental cruise associated with the BioBaz proposal: The 

integrative Biology of Bathymodiolus azoricus, a model organism for chemotrophic symbiosis in an extreme 

environment. This species harbors both sulfide-oxidizing and methanotrophic bacteria whose proportion is related 

to the physico-chemical characteristics of their habitat. BBC will thus explore mussel beds at the Menez Gwen (- 

850m), Lucky Strike (-1700m) et Rainbow (-2400m) hydrothermal vent fields of the Mid-Atlantic Ridge south of the 

Azores to perform a small-scale physico-chemical survey together with biological analysis of mussels and bacteria. 

The originality of BBC is mainly the effective and concomitant use of experimental devices (hyperbaric 

experimental containers) together with large-scale molecular tools (DNA chips, proteomics). These innovative 

approaches should bring a better understanding of the symbiotic relation between the host mussel and its bacteria, 

which affect such biological functions as nutrition, immunity or ecotoxicology. Two complementary objectives for 

the BBC cruise will address crustacean symbioses and community ecology. And finally, a specific mussel sampling 

at Menez Gwen and the mooring of remotely recoverable cages will provide biological material for two intensive 

experimental sessions on land (LabHorta), one immediately following the BBC cruise and the other scheduled 6 to 

10 months after. 

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PROJET SCIENTIFIQUE,TECHNOLOGIQUE OU TECHNIQUE 

• Objectifs scientifiques, originalité de la demande et références bibliographiques (si projet pluridisciplinaire ou 

interdisciplinaire mettre en évidence le degré d’intégration des différentes composantes). 

• Si la campagne est incluse dans un projet comportant plusieurs campagnes mettre obligatoirement un diagramme avec 

toutes les campagnes concernées et leur chronologie - Préciser les obligations de retour sur zone, pour des relevages de 

mouillages par exemple. 

• Ce programme comporte t-il une partie terrestre ? si oui la décrire succinctement 

• Avancement du projet. Pour les campagnes antérieures préciser brièvement pour chacune d’elles les résultats majeurs 

obtenus et répondez à l’annexe sur la valorisation des campagnes réalisées 

• Collaborations et programmes de rattachement (nationaux et internationaux) 

• Résultats escomptés 

Le document 1 ne doit pas dépasser 12 pages maximum 

avec les illustrations et la bibliographie (15 pages pour les campagnes pluridisciplinaires) 

La campagne BIOBAZCENTRALE (BBC) est au cœur du projet BioBaz (Biologie intégrée de Bathymodiolus 

azoricus, organisme modèle pour la symbiose chimiotrophe en environnement extrême), projet déposé en réponse 

à l'appel d'offre ANR non thématique en novembre 2008. Les objectifs du projet, y compris l'intégration de la 

campagne dans le déroulement du projet et ses liens avec les sessions de travail expérimental à terre sont 

précisés ci-dessous. Pour les besoins stricts du projet BioBaz, six journées de plongée ROV sont un impératif 

minimal et indispensable. La présente demande est liée à celle d'une campagne préparatoire, BIOBAZINITIALE 

(BBI), l'année précédente (2010), dont le seul objectif est d'échantillonner les moules nécessaires à la première 

session de travail à terre. 

Mais il nous a semblé opportun de proposer dans le cadre de cette campagne BBC quelques objectifs 

supplémentaires qui constituent des prolongements ou des compléments des objectifs réalisés (ou prévus mais 

non réalisés) durant les campagnes précédentes ou à venir sur cette zone: EXOMAR (2005), MOMARETO (2006) 

et MOMARDREAM (2007-08), et MOMARSAT (2010 & 2011). 

I - Le projet BioBaz 

The BioBaz project proposes to study the integrative biology of a mutualistic symbiosis system involving a 

metazoan, the deep-sea, hydrothermal vent mussel Bathymodiolus azoricus, with two chemotrophic endosymbiotic 

prokaryotes, a sulfide-oxidizing (SOX) and a methanotrophic (MOX) γ-proteobacteria. 

Why symbiosis ? 

The importance of mutualistic symbiosis in past and present evolution of Eukaryotes is now widely recognized and 

the increasing use of genomic tools has made possible the biological study of uncultivable endosymbionts (Moya et 

al. 2008). Symbiotic events have been key to major breakthroughs in the successful radiation of eukaryotic 

organisms. They are involved at the origin of Eukaryota with the evolution of mitochondria from α-proteobacterial 

symbionts, and in the origin of phototrophic Eukaryota with the evolution of chloroplasts from cyanobacterial 

symbionts. But these events are so ancient (over 1 billion years) and the traces they left in contemporary 

organisms are so derived that it is difficult to interpret them unambiguously and explain the evolutionary steps of 

the now intimate relationships linking eukaryotic cells and their organelles. More recently, the Rhizobium symbiosis 

with some plant root nodules have allowed them to derive their nitrogenous requirements from gaseous nitrogen 

and thus conquer nitrate-poor environments (Jones et al. 2007), and many insects have successfully colonized 

new ecological niches by developing symbiosis with various bacteria to complement their limited diet (Dale and 

Moran 2006). A vast number of other occurrences must exist, especially between unicellular eukaryotes and 

bacteria (e.g. the recently discovered Endobacteria within Flagellates inside termite guts). However, our current 

knowledge of the precise mechanisms for the establishment and functioning of endosymbiotic associations is 

restricted to a very limited number of model species (Walker and Crossman 2007). 

From these models, it appears that the establishment of a mutualistic endosymbiosis implies delicately balanced 

relationships between eukaryotic cells and bacteria, at the boundary between the "simple" phagotrophic 

predation/digestion of bacteria by eukaryotes and the cell disease/disruption provoked by pathogenic bacteria. 

Understanding the pathways enabling these balanced interactions is therefore of foremost importance for 

fundamental research in eukaryote/prokaryote interaction within both a functionally and evolutionary framework. 

6



Why Bathymodiolus ? 

The discovery of chemosynthetic ecosystems in the deep-sea in the late 1970's have unexpectedly demonstrated 

the ability of some metazoans to develop mutualistic symbioses with chemoautotrophic bacteria, allowing them to 

grow and to dominate these ecosystems. Images of tubeworms fields and mussel beds found around deep-sea hot 

vents and cold seeps are now familiar and the ecological basis of these ecosystems well understood (Desbruyeres 

et al. 2001b). 

Among these symbioses, mussels of the family Bathymodiolinae are special in that they have spread over all 

oceans at both hot vents and cold seeps. Their radiation is fairly recent (ca. 60 million years) and they are able to 

establish endosymbiotic relationships with either sulfide-oxidizing or methanotrophic bacteria, or both (Duperron et 

al. 2008). Multiple symbioses and associated plasticity evidenced in B. azoricus is convincing evidence that the 

capacity to establish symbiotic relationships with the appropriate bacterial strains remains during the adult life of 

the mussel. In addition B. azoricus constitute an "engineer species" in the hydrothermal vent ecosystem, by 

influencing the direction of fluid flows and by building large aggregates suitable for colonization by other species, 

and as such, improved knowledge on its biology is necessary for the global understanding of the functioning of this 

ecosystem. 

We therefore propose to establish Bathymodiolus azoricus as a model system for chemotrophic 

endosymbiosis, because this species is and will remain accessible and because we now possess 

experimental and molecular tools to perform a feasible integrated study. 

- the Azores Triple Junction / Mid Atlantic Ridge (ATJ/MAR) hydrothermal vent sites are well characterized: 

they have been the target of a number of European programs (e.g. EU-FP4 AMORES, EU-FP5 VENTOX, 

EU-FP6 EXOCET) and continue to be an integrated study site for national (e.g. ANR DEEP OASES) and 

European (e.g. ESONET-MOMAR/D & Momarsat cruise proposals) initiatives. The latter on-going project 

aims at deploying a long-term deep-sea floor observatory at the Lucky Strike vent site 1 . This will guarantee 

repeated opportunities for sampling and experimenting on this particular species, during and after the 

duration of this project. The interest of this particular ecosystem is further demonstrated by the American 

Ridge 2000 program, which is presently implementing an integrated study site in this area 2 . 

- our collective expertise for experimenting with deep-sea animals has dramatically increased during the past 

ten years beginning with the IPOCAMP system (Shillito et al. 2001), followed by variously adapted 

pressurized vessels (PICCEL, DESEARES, …), an effort presently continuing within a national program 

(ANR BALIST). In parallel, analytical tools for in situ analysis have considerably improved (e.g. (Vuillemin 

et al. 2008) and allow for an extended number of relevant parameters to be monitored. 

- during the last four years (and in the coming years), we have developed (and will continue to develop) a 

number of molecular tools directed towards both the host and symbionts genomes and transcriptomes, 

from individual functional genes to ESTs and microarrays, mostly within the NoE Marine Genomics Europe 

and the national ANR Deep Oases program, with on going or pending projects on symbionts metagenome 

(MetaMuM, Genoscope) and host transcriptome / genome (JST/CNRS proposal pending) sequencing and 

annotation. 

We thus feel that the time is ripe to initiate a major program to put our tools and knowledge at work into an in 

depth integrative biology project. The following proposal is built around a core of experimentations testing the 

plasticity and functional properties of the symbiosis between Bathymodiolus azoricus and its symbionts within 

environmentally relevant controlled conditions. We have assembled a consortium capable of conducting a large 

array of analyses on the biochemistry, physiology, and "genomics" of host and symbionts submitted to the 

same environmental or experimental constraints. 

State of the art 

Over the last thirty years our vision of deep-sea biodiversity has dramatically changed: instead of a high 

diversity / low density kind of desert (Menzies 1965) we now recognize an increasing number of low diversity / high 

density assemblages corresponding to various biogeochemical settings (Tyler 1995), namely hydrothermal vents, 

cold seeps and massive organic deposits. Most of these spots rely on chemosynthetic archea and bacteria at the 

base of the foodweb and the bulk of the animal biomass is generally composed of invertebrates that directly harbor 

chemosynthetic bacterial endosymbionts (Van Dover et al. 2002). Images from the deep ocean showing large 

tubeworm fields or mussel beds are now familiar even to the general public. However, we still have little 

understanding of the onset, evolution, life history and general biology of these symbioses although an in-depth 

knowledge of these main components of the deep-sea fauna is needed if we are to understand and model deepsea 

ecosystem functioning. 

1 http://www.ifremer.fr/esonet/esonet-noe/observatory-network/momar/momar-observatory.pdf 

2 http://www.ridge2000.org/science/iss/other_projects.php 

7



The BioBaz project aims at bringing together an interdisciplinary task force focusing on a single dominant species 

to gain access to reliable biological data gathered in situ and, more importantly, in vivo. This corpus of biological 

data will improve our understanding of eukaryote/prokaryote relationships. Our biological model is Bathymodiolus 

azoricus (von Cosel et al. 1999), which occurs at three contrasted hydrothermal vent sites of the Mid Atlantic Ridge 

near the Azores. Mussels of the subfamily Bathymodiolinae (family Mytilidae) inhabit almost all hydrothermal vents 

and cold seeps around the world (von Cosel 2002). Their adaptive success in such challenging environments that 

are largely devoid of photosynthetic primary production and subject to rapid changes in geochemical regimes is 

due to their symbiotic association with chemosynthetic bacteria within their gills (Fisher 1990; Cavanaugh et al. 

2005). Two phylogenetically and physiologically distinct types of g-proteobacteria occur as symbionts in 

bathymodioline mussels 3 : small chemoautotrophic bacteria shown to oxidize sulfide, and type I methanotrophic 

bacteria with typical stacked internal membranes that use methane both as an electron and a carbon source 

(Cavanaugh et al. 1987; Fisher et al. 1993; Nelson et al. 1995). Symbionts are phylogenetically conserved among 

the subfamily (Won et al. 2003b; Duperron et al. 2006a). Some bathymodioline mussels harbor only a thiotrophic or 

a methanotrophic symbiont, while others, including Bathymodiolus azoricus, live in a dual symbiosis, with both 

types of bacteria co-occurring in the gill bacteriocytes, making them appropriate models for studies of symbiose 

involving metabolically diverse bacteria (Fiala-Medioni et al. 2002). These symbioses enable their hosts to colonize 

sulfide and/or methane rich environments, in which the primary production of the symbionts ensures the nutrition of 

the host. 

Our project builds on the results issued from previous european projects in the 3rd, 4th, and 5th RTD: 

FARA (1993-1995), AMORES (1996-1998) and VENTOX (1999-2002). It is also relevant to the recent MOMAR 

actions, including the STREP EXOCET/D (6th RTD) and two related oceanographic cruises, MOMARETO (2006) 

and MOMARDREAM (2007). Through previous and on-going research, 

we have gained some insights into the chemical environment and 

community structure at the three sites where B. azoricus occurs (Sarradin 

et al. 1999; Desbruyeres et al. 2000; Desbruyeres et al. 2001a; Sarradin 

et al. 2008) and into the population structure and genetics of this species 

(Comtet and Desbruyeres 1998; Comtet et al. 2000) and its food web 

(Colaço et al. 2002a; Colaço et al. 2007). The dual symbiosis was shown 

to respond flexibly to differences in vent chemistry, most notably in 

differences in availabilities of electron donors of the respective symbionts 

(Colaco et al. 2002; Duperron et al. 2006a) and experimental loss and reacquisition 

of symbionts has been achieved (Kadar et al. 2005). Additional 

results concern nutrition biology (Riou et al. 2008; Colaço et al. 

submitted), immune responses (Bettencourt et al. 2007), and responses to 

metal exposure and oxidative stress (Company et al. 2004; Bebianno et 

al. 2005; Colaço et al. 2006; Company et al. 2006; Company et al. 2008; 

Cosson et al. 2008b). The latest results obtained during the MoMARETO 

cruise (Sarrazin et al. 2006) showed that the structure of the mussel 

assemblages is strongly variable along the chemical gradients 

encountered. 

Investigating the dynamic interplay between metazoan hosts, bacterial 

symbionts and the environment has become a central question in the 

study of multiple symbioses involving metabolically diverse bacteria. Living 

in several chemically distinct vent sites and harbouring sulphur- and 

methane-oxidizing symbionts distinguishable based on existing 

fluorescence in situ probes (FISH), B. azoricus is a relevant model 

organism for such studies (Fiala-Médioni et al. 2002). Besides these two 

symbionts, nuclei of gill epithelial cells of B. azoricus were also recently 

shown to be infected by a Gammaproteobacterium, named 

Endonucleobacter, most closely related to an intranuclear parasite of a 

shallow water razor clam that causes mass mortalities (Zielinski et al. 

submitted). 

Because sulphur- and methane-oxidizing symbionts have distinct 

requirements with regards to electron donors and carbon sources, their 

co-occurrence is thought to increase the flexibility of the association, 

which could improve the fitness of their host in varying environments such 

as hydrothermal vents with variable fluid regimes (Distel et al. 1995). Both sulphur- and methane-oxidizers 

contribute significantly to the carbon nutrition of their host, as shown in a study where respective contributions of 

3 Figure from Dubilier N., Bergin C. & Lott C. 2008. Symbiotic diversity in marine animals: the art of harnessing 

chemosynthesis. Nat Rev Micro, 6: 725-740. 

8



20% and 15-25%, respectively, were estimated based 

on the analysis of lipid d 13 C signatures in B. azoricus 

(Pond et al. 1998). 

It is established that within B. azoricus, symbiont 

densities as well as whole tissue stable isotope 

composition (C and N) are variable among sites 

(Trask and Van Dover, 1999; Colaco et al., 2002; 

Fiala-Médioni et al., 2002; Duperron et al., 2006). C 

and N isotope composition can also be variable in a 

single site along the environmental gradient (De 

Busseroles et al. accepted). Recently, a method 

based on 3D FISH allowed to estimate bacterial 

densities within B. azoricus bacteriocytes and was 

employed to confirm that variations were statistically 

significant, and that a short term sulphur pulse 

influenced symbiont densities (Halary et al. 2008). 

Attempts to compare results with qPCR have been undertaken (Boutet, unpublished). However, quantitative 

comparison with appropriate in situ chemical data acquisition in an integrative approach has not yet been 

performed. 

The interest of MAR vent mussels as model organisms of chemosynthetic symbioses has also motivated the start 

of a Genoscope sequencing project : MetaMuM involving Dr. N. Dubilier (Max Planck Institute for Marine 

Microbiology, Bremen), Françoise Gaill (CNRS) and Sébastien Duperron (UMR 7138). The project is about B. 

puteoserpentis from MAR more southern sites (Broken Spur, Snake Pit, Logatchev), which harbours the exact 

same two 16S rRNA symbiont phylotypes as B. azoricus (Duperron et al. 2006b). 

The interest in bathymodiolin mussels also encompasses comparative and evolutionary aspects. In the phylogeny 

of bathymodiolin mussels three main clades of mussels are recognized 4 , but the relationships between these 

clades are poorly resolved. Recently, a few studies dealing with the evolutionary history of the vent mussels along 

the mid-Atlantic Ridge demonstrated that B. azoricus and B. puteoserpentis are able to hybridize at the vent field 

Broken Spur 29°N (O'Mullan et al. 2001; Won et al. 2003a). Hybridization between these two taxa is not recent and 

lead to a large gene introgression at the genome scale between B. azoricus and B. puteoserpentis that extend over 

the whole geographic range of both species (Faure et al. submitted). In most genes, a nearly complete admixture 

of alleles from the two “species” is found in B. azoricus individuals collected from the sites Rainbow (2500 m) to 

Menez Gwen (800 m). 

Generally speaking, gene introgression is likely to be driven by selective processes associated with contrasted 

environmental constraints (Bierne et al. 2002). Transfer of advantageous alleles of one species to the other has 

been shown to be one of the most efficient adaptive mechanism by which species may colonize new habitats. 

These transfers seem to be frequent occurrences in coastal mytilids (Faure et al. 2008). Additional work based on 

nucleotidic divergence/polymorphism analyses also indicated that several genes (mostly involved in stress 

response: Hsp70, ferritin Gf1, sulphotransferase) were subjected to recent duplication events, at least within the 

genus Bathymodiolus (Faure 2008). In our case, varying environmental conditions over the range of vent species 

(depth, temperature, fluid enrichments in methane, iron concentration etc…) may have been crucial in maintaining 

specific allelic pools in both species, each species keeping the most favorable alleles in their own environmental 

specificities. This might have had a pronounced impact on the evolution of the dual symbiosis in both species and 

the evolution of specific gene networks associated with detoxifying processes, respiration or heat tolerance. In the 

course of evolution, one might even argue that dual symbiosis may have been the direct consequence of 

hybridization if ancestors were monospecific in their endosymbiosis (such as the Pacific species B. thermophilus 

which will be included in this project for comparative purposes). 

Originality and novelty of the proposal 

Chemoautotrophic endosymbioses are very complex and diverse systems, and their integration level is not always 

identical among deep-see animal species. For example, in the tubeworm Riftia, the digestive tract is completely 

absent and thus the symbiosis is obligatory although symbiont transmission remains horizontal. In the clam 

Calyptogena, the digestive tract is not functional and thus the symbiosis is also obligatory with a vertical symbiont 

transmission. In contrast, the symbiosis of the mussel B. azoricus seems facultative, or at least flexible, because 

they retain a functional digestive tract and are capable of filter feeding. While the symbiont genomes of Riftia 

(Robidart, Env Microbiol, 10:727, 2008) and Calyptogena (Newton, Science, 315:998, 2007) have been 

sequenced, and the metagenome of B. azoricus symbionts is being sequenced at present (MetaMuM, Genoscope), 

the metazoan hosts have only been the subject of targeted genes or small-scale EST sequencing. We now have 

an operational 3500-gene microarray and a prospective full transcriptome for B. azoricus allowing for the first time 

4 Figure on Bathymodiolinae phylogeny taken from Duperron S., Lorion J., Samadi S., Gros O. & Gaill F. 2008. 

Symbioses between deep-sea mussels (Mytilidae: Bathymodiolinae) and chemosynthetic bacteria: diversity, 

function and evolution. C. R. Biol., in press 

9



to study gene expression in this symbiotic model organism under a variety of experimental conditions, testing 

for the functionality and plasticity of the symbiosis. 

Precisely, the major keyword of the BioBaz project is experimentation. The choice of B. azoricus found at the 

moderate-depth Menez Gwen site has been critical during the preparation of this project since it is close to the 

Horta marine laboratory – LabHorta (Colaço et al. 2002b) – thus allowing fast recovery of living individuals and 

extended periods for experimentation. During regular oceanographic cruises, experimentations are heavily limited 

by the duration of the cruise itself, i.e. 2-3 weeks, time being shared with sampling and other cruise-related duties. 

And the next opportunity lies at least three or four years ahead. For this project we have scheduled three intensive 

"Experimental Work Sessions" (EWS) in Horta for a total duration of at least 10 weeks. The interval between 

EWS is intentional: it will allow a feedback from the preliminary results of analysis and improvement of the 

experimental protocols for the next EWS. 

In addition, we have gathered a consortium capable of analyzing chemical, biochemical and molecular aspects on 

the same individuals subjected to these experimentations. This collaborative effort, even when originally planned in 

cruise proposals, is rarely practically feasible mostly due to time or sampling constraints. Putting people at work 

altogether at a single place will warrant the integrative approach we intend to carry out. We thus propose to deploy 

at once the effort required to build a self-consistent data set and to obtain a body of knowledge sufficiently large 

(beyond a critical size) to significantly improve our present understanding of the biology of a chemotrophic 

symbiosis. 

The biological questions we will address within the framework of the BioBaz project can be summarized as 

follows: 

• What is the balance between photosynthetic and chemosynthetic sources in B. azoricus nutrition, 

at different developmental stages ? 

• Precisely how symbiont type and abundance is related to environmental or experimental conditions 

? 

• What are the genes (and proteins) which are over-expressed or depressed in relation with abiotic 

conditions and/or symbiont profile ? 

• How does trace metal and radionuclides bioaccumulation affect these expression profiles ? 

• How host genotypes may affect the endosymbiont carrying-capacity or the nature of the symbiosis 

(thioautrophy vs methanotrophy) ? 

Scientific programme and specific aims of the proposal 

10



Task 1 – Sampling and in situ analysis (Sarradin) 

The first step is obviously to sample the habitat of Bathymodiolus azoricus, using an oceanographic vessel with 

deep-sea diving capabilities. The mussel assemblages are found at three well known locations south of the Azores 

(see map below). The vent fields differ by their depths (850 m, 1700 m and 2350 m for Menez Gwen, MG, Lucky 

Strike, LS, and Rainbow, RB, respectively), their tectonic settings, the composition of the underlying rocks (mantlederived 

serpentinized peridotite vs. basalt), the nature of associated volcanism, their fluid composition (see below) 

and the dominance of different key faunal assemblages. LS has been chosen as the main site for the deployment 

of a deep sea floor observatory with MoMARSAT cruises proposed for 2010 and 2011 within the NoE ESONET. 

The BioBaz short sampling cruises could be planned before or after the MoMARSAT cruises, taking benefit of the 

presence of a vessel and submersible in the area and of the close proximity of the Azores islands. 

We are planning 3 cruises during the project . 

#1- One short 1 day for initial sampling at MG to start the first series of EWS (2010): BioBaz Initial 

#2- One main, central 12-day cruise, (BBC, present proposal) including 6 dives devoted to the BioBaz project for 

sampling at the 3 sites RB, LS, MG and for deploying 3-4 cages at MG (2011). 

#3- One short 2 days retrieval cruise to collect the cages (2012) using the Portuguese research vessel Archipelago. 

Additional sampling of other Bathymodiolus species will be possible during opportunity cruises: B. puteoserpentis 

from the Logatchev site during a German cruise in 2009 (S. Hourdez invited) and B. thermophilus from 9°50N EPR 

during the MESCAL cruise (pre-scheduled Jan 2010). 

Task 2 – Experimental Work Sessions (Lallier) 

The second step, central to the BioBaz project, is to study the in vivo biology of B. azoricus through their 

acclimatization to various environmental conditions. This experimental approach is absolutely necessary but 

oceanographic cruises are usually too short to implement extensive experimental work. However, a combination of 

factors makes it feasible with B. azoricus. First Menez Gwen is not too deep (850 m) so that mussels sampled from 

this site survive well at atmospheric pressure. Second, Horta is close enough to recover remotely retrievable cages 

with mussels during an extended period of time (i.e. without submersible, using the local ship RV Archipelago). And 

third, LabHorta and its facilities are well equipped to implement these experimental approaches. This has been fully 

demonstrated during the VENTOX program (EU 5 th PCRD http://www.soc.ac.uk/ventox/) and subsequent continued 

collaborations (e.g. see (Bettencourt et al. 2008)). 

We will have two major sets of experiments, focussing on: 

- energy and carbon requirement, manipulating O 2 , CO 2 , H 2 S and CH 4 

- trace element toxicity and uptake pathways (water vs food), storage and excretion using stable and 

radioactive elements (heavy metals and radionuclides). 

Trophic biology, symbiosis, immunological and physiological responses to these conditions will be investigated at 

an organismic, cellular and, mostly, molecular level. (See 3.3 for details). 

Task 3 – Global Expression Profiles (Tanguy) 

This key task gathers the most innovative approaches developed within BioBaz, making use of recently developed 

tools on this model (3D-Fish, micro-arrays,…) to analyze both environmental (3 sites) and experimental samples. 

The global, transcriptomic and proteomic approaches will be performed on gills ( i.e. including symbionts and host 

= holobiont) and at least some other host tissues devoid of symbionts (mantle, muscle, digestive gland, 

hemocytes,…), and their results will be related to symbiont type and relative abundance. 

3.1 Symbionts quantification and localization (Duperron) 

We will perform symbiont quantification approaches using 3D FISH and qPCR on environmental and experimental 

samples. This task will address how chemical parameters correlate with symbiont abundances, and how 

experimental treatments affect them. Quantifications will be performed on the same specimens used for 

transciptomic analyses and isotope-based investigation of diet to get an integrated and dynamic overview of the 

functioning of the symbiotic system. 

3.2 Holobiont gene expression (Tanguy) 

In order to study the adaptive processes developed by B. azoricus, we propose to study the regulation of the 

transcriptome at a large scale and to characterize common and/or specific gene networks (gene co-regulation) in 

response to experimental parameters studied in this proposal (O 2 , CO 2 , H 2 S, CH 4 , metals and trace elements, 

nutrition). This task will combine both DNA microarrays and quantitative PCR (Q-PCR). Microarrays do not yield 

fully quantitative results but allow us to scan a wide range of genes and to detect patterns of regulation, whereas 

Q-PCR will provide precise quantitative levels of the expression for single genes. A first generation of cDNA 

microarrays containing 2500 genes previously sequenced from a full-length cDNA library (Tanguy et al. 2008) and 

1300 new genes sequenced from subtractive libraries related to symbiosis studies in B. azoricus (Boutet et al., in 

prep) has already been constructed. These microarrays will be used to follow the global differential expression of 

genes in individuals collected in the different environments (T1) and experiments (T2). 

In addition, a second generation of high-density oligoarrays covering almost the whole transcriptome of B. azoricus 

will be developed for the second year of the program. This oligo-array will be constructed using the sequences 

obtained from the pyrosequencing (Roche 454 sequencer) of whole tissue normalized cDNA libraries in 

11



collaboration with the Max Planck Institute (Marine Genomic Europe Network: 200 000 sequences done in 

December 2008) and with the Okinawa Institute of Science and Technology (JST/CNRS proposal submitted with N. 

Satoh). See Task 6 for the annotation of these sequences (not funded through this project). 

3.3 Holobiont protein expression (Cosson et al.) 

In parallel to gene expression profiles, we plan to develop a differential proteomic approach either by 2D 

electrophoresis and mass spectrometry (MS) or by gel-free techniques based on multidimensional liquid 

chromatography separation of complex peptide mixtures coupled to MS (shotgun proteomics) to identify specific 

proteins on samples issued from environmental or experimental mussel tissues. The availability of annotated ESTs 

databases for host and symbionts is absolutely needed for protein identification. 

As stated above, the two following tasks, although disconnected from the experimental work, are absolutely 

needed to interpret the previous results. They are already started, but not completed, and will be only partly 

financially covered through the BioBaz project. 

Task 4 – Symbionts genome annotation (Duperron, in collaboration with Dubilier and Bapteste) 

We will contribute the collaborative project of symbiont genomes annotation and analysis in order to get insights 

into the genetic potential of symbionts, and to compare these genomes with those of related free-living (such as 

Thiomicrospira or Methylococcus species) as well as symbiotic bacteria (Ruthia magnifica, Endoriftia persephone) 

to investigate potential gene losses, genome reduction and evolution. These data will help understanding the 

metabolic pathways available to the symbionts and therefore the metabolites available to hosts, which genes are 

involved in the establishment and functioning of the association, and whether symbionts have the potential to occur 

as free-living microbes. It will also provide target bacterial genes for further functional studies of symbiotic 

interactions. But, within BioBaz, symbiont genome annotation is crucial for the correct characterization of genes 

and proteins identified in transcriptomic (T3.2) and proteomic (T3.3) approaches. 

Task 5 – Host transcriptome annotation (Tanguy) 

This task is already underway, through a MGE and DEEP-OASES related project in collaboration with the MPI 

Bremen sequencing facility (1 run of 454) and with O. Lecompte (IGBMC Strasbourg) for annotation. and should be 

completed during the first 18 months of BioBaz. It may even get faster if the collaborative project proposed through 

a JST/CNRS call with Nori Satoh (Okinawa Scientific Institute) is granted (pending until Dec 2008): the full cDNA 

transcriptome of several tissues should then be available. Therefore, no financial support is needed from BioBaz 

for this task but the task is included because the results are absolutely necessary to analyze transcriptomic (T3.2) 

and proteomic (T3.3) profiles. 

Annotation of B. azoricus sequences issued from MPI will be annotated by IGBMC (O. Lecompte). 

The four following tasks, exploring diverse aspects of B. azoricus biology, will make use of the same environmental 

(T1) and experimental (T2) samples as those used for T3. Comparing independently acquired results from 

individuals with identical history will benefit both approaches and strengthen the biological interpretation of the 

observed variations. 

Task 6 – Host genotype studies (Jollivet) 

A fine-scale analysis of synonymous/non-synonymous substitutions (dN/dS) across paralogue genes suggested 

that gene evolution after duplication was not neutral and that some amino-acid replacements could be adaptive 

(Positive Darwinian selection). Since these genes are well-known to be involved both in metallic and hydrocarbon 

stresses, additional experimental works are now needed to test whether individuals carrying different sets of alleles 

on paralogues could be better adapted to specific environmental conditions of temperature, sulphur/methane, iron 

and manganese and, how genotypes may affect the endosymbiont carrying-capacity or the nature of the symbiosis 

(thioautrophy vs methanotrophy). To test this hypothesis, we propose to perform a specific acclimatization 

experiment on MG mussels at atmospheric pressure to follow condition indices, dual symbiosis and mortality over a 

two-week period and then to check surviving individuals both in terms of genotype and levels of expression for 

each paralogous gene. Moreover, a recent heat shock study of B. azoricus already demonstrated that this bivalve 

is more likely a cold stenoece species in which the heat response may be genetically-driven (Boutet et al. 

submitted). Moderate heat shocks indeed induced a global metabolic depression that could be dampered 

depending on genotype. We therefore also propose to genotype experimental individuals (T2 and specific) at the 

Pgm-1 and Mdh-2 loci in order to test whether these loci could be also involved in the tolerance of both metallic and 

sulphide/methane stresses. 

Task 7 – Host immunity studies (Bettencourt) 

Even in the absence of the characteristic high hydrostatic pressure found at deep sea vent sites and without 

methane and/or sulfide supplementation, vent mussels seem to endure well aquarium conditions. Thus, the 

maintenance of live vent mussels in our laboratory is a key factor in gaining insights into the physiology of vent 

12



mussels including the study of evolutionary conserved immune factors commonly found in other marine bivalves. 

The present task is, therefore, centered on cellular and humoral defense mechanisms in animals which have 

acclimatized to “sea level” conditions. Preliminary data obtained in our lab do support the premise that vent 

mussels are equipped with an innate immune system and are capable to respond to immune stimulants. We now 

extend our investigations to primary immune constituents and defense reactions not only to validate the aquarium 

settings to which to which B. azoricus has acclimatized but also to establish an in vitro experimental system to 

study immune gene expression. 

Task 8 – Nutrition studies (Sarrazin-Colaço) 

We will study the food web structure of both environmental or experimental mussel tissues using stable isotopes 

(C, N, S), lipid analysis, biochemical and pigment analysis. These results will be compared with analysis performed 

on sources: fluids (including sulfide and methane content), microorganisms, mucus, dissolved and particulate 

organic matter, for which isotopic data are often missing. 

We propose to refine the characterization of the thermal and chemical gradients occurring within the hydrothermal 

fluid–seawater mixing zone on the habitat colonized by B. azoricus (Sarradin et al. 2009). The small-scale studies 

initiated during the EXOMAR, MoMARETO and MoMARSAT cruises on habitat characterization of B. azoricus 

mussels will be extended to the two other vent fields (MG and Rb). This will allow regional comparison of vent 

mussel habitats. The environmental factors to be studied will be temperature (also used as semi conservative 

tracer of fluid dilution), O 2 , energy sources (CH 4 and total dissolved H 2 S compounds), pH, fluid flow rate (Sarrazin 

et al. submitted), organic matter, trace elements and natural radionuclides. 

Characterization of food sources (free-living microbes, suspended and particulate organic matter), using both 

stable isotopic analyses and biological markers (collaboration Y. Gelinas, Univ. Concordia, Canada), will be done 

at small spatial scales. Results obtained on the functional role of the microorganisms associated with microbial 

mats found within the mussel beds (Thesis V. Crépeau, ANR-DEEP-OASES) will also be used as they could 

represent potential organic matter sources for B. azoricus and associated species. The importance of the different 

nutritional modes (filtration, methanotrophy, thiotrophy) in the mussels at different developmental stages and along 

the environmental gradient, will be evaluated by the same analytical approach. Preliminary δ 34 S analyses support a 

diet based on thiotrophy but the presence of carbon isotopic ratios of -20‰ within some of the mussels is intriguing 

(De Busserolles et al. accepted). In addition, recent results show that δ 13 C and δ 15 N isotopic ratios are strongly 

influenced by environmental factors, particularly within B. azoricus mussels, suggesting a strong influence of fluid 

characteristics on the mussel’s diet (De Busserolles et al. accepted). The potential link of environmental factors on 

the expression of the different symbionts within the mussel will be evaluated (collaboration S. Duperron). 

The environmental and biological database obtained will be used to define and validate the experimental conditions 

used during the EWS and to validate the results obtained on freshly sampled mussels. 

Experimental evidence indicates that B. azoricus is a mixotrophic organism, which obtains energy from its dual 

endosymbiosis and filter feeding. But the relative contribution of endosymbiosis and filter feeding to B. azoricus 

nutrition is still unclear. To address this question, models were developed where the relative contribution of filter 

feeding was extrapolated from Mytilus edulis data (Martins et al 2008). But preliminary experiments showed that B. 

azoricus filtration rate was 10 fold lower than that of M. edulis (Cognie, unpublished). However owing to nonoptimal 

exprimentation conditions we failled in establishing acurate data for the retention rates. Consequently we 

need to perform new experimentations using freshly recovered B. azoricus and better-suited experimental 

conditions than used formerly. Not only the expected results will bring informations regarding B. azoricus nutritional 

pathway but will be used to study trace element uptake via food or directly from surrounding water (Task 9). 

One of the major innovations in our objectives is to include a substantial focus on the N acquisition and 

translocations in this symbiotic relationship – an important aspect given the potential role of amino acids in the 

physiology and transfer of energy between symbionts and hosts. Very little work has been done on these aspects 

in the past, but analytical advances now enable us to develop the necessary tools to investigate this further. 

The research objectives will be reached trough stable isotope enrichment experiments under controlled laboratory 

conditions using a number of specific labelled substrates. The latter will serve to confirm the biomarker specificity 

for the chemo-autotrophs, and to enable specific tracing of C and N uptake or exchange through the symbiont-host. 

Mussels which host a dual symbiosis, will be maintained with different energy food sources in artificial seawater. 

Some of these animals will thrive in artificial sea water with different nitrogen sources enriched isotopically. Tissues 

will be analysed by IRMS. Tissues of the animals will be analysed on an elemental analyser to determine the 

element C, N, S ratios. Calorimetric bomb will be used to determine the caloric content of the animals kept in the 

different feeding regime. 

Task 9 – Trace elements bioaccumulation (Cosson) 

Metal bioavailability and speciation in the environment. P.M. Sarradin, R. Riso, M. Waeles 

The behaviour of trace metals (Cu and Cd) and natural radionuclides will be studied along the mixing zone in the 

particulate, colloidal and dissolved fractions (Sarradin 2009, Waeles in press). The organically complexed fractions 

13



of Cu and Cd will be evaluated in order to assess their bioavailability for the mussels (SCP, Waeles 2004). In 

parallel, the organic matter with a high complexing capacity will be measured using a polarographic method (XXX) 

in the chemical gradient. Water samples will be obtained using the PEPITO water sampler, which now permits in 

situ filtration on 0.45 µm filters. 

Radionuclides characterization in the environment. S. Charmasson, A. Le Faouder 

Hydrothermal vent ecosystems are associated with areas of tectonic activities throughout the deep sea and are 

thus enriched in natural primitive radionuclides characterizing the magma source i.e. uranium-thorium series. Some 

papers reported high levels in 210Po and 210Pb in polychaetes from the East Pacific Rise and in bivalves from 

shallow vent areas in the Aegean basin in the Mediterranean Sea (Cherry et al. 1992). Preliminary analyses on B. 

azoricus recovered from Menez Gwen in May 2008 confirm the occurrence of high levels of various natural 

radionuclides (Charmasson et al., submitted). 

We propose to determine radionuclides concentration accumulated in biota especially B. azoricus and to study their 

tissue distribution. Detoxification processes by excretion or accumulation under non-toxic forms will also be 

evaluated. U-Th analyses will be carried out through ICP-MS while 210Po will be studied via classical method of 

electro-deposition on disks and alpha counting. 

Bioaccumulation, transformation and excretion of trace elements in B. azoricus. R.P. Cosson (in coll. with 

P. Bustamante, P. Rosa, M. Warnau). 

It is well known that B. azoricus accumulates metal occuring in its environment as soluble forms or bound to 

particles. The variation of stable metallic element levels in mussels at the scale of the ATJ fields has been 

described (Cosson et al. 2008) but natural radionuclides levels are still to be assessed. At a smaller scale, and 

taking into account the fluctuation of environmental parameters, the relationship between the bioaccumulated trace 

elements and their occurence in the surrounding environment is still unclear. To tackle this question, we need to 

perform experimentations under controlled conditions. We will determine the bioaccumulation kinetics, tissue 

distribution and detoxification processes of metals using radiotracers ( 110m Ag, 241 Am, 109 Cd, 57 Co, 134 Cs, 203 Hg, 54 Mn 

et 65 Zn) added to seawater and particles (organic : microalgae or inorganic : kaolinite). The aim of such 

experimentations is to determine the relative contributions of seawater and food pathways in different conditions 

(mussels harbouring or deprived of symbionts, different food items). The different parameters obtained (uptake and 

elimination rates, assimilation efficiencies, ingestion rate) will allow us to get an insight into the effects of both food 

quality and environmental factors on the main pathways of exposure and on the degrees of the bioaccumulation. 

II – Objectifs supplémentaires 

1. Interactions between crustacean and microbial communities: symbioses establishment 

M.A. Cambon-Bonavita (UMR 6197 LM2E) and M. Zbinden (UMR 7138 SAE) 

To characterise the microbial diversity associated with deep-sea hydrothermal crustaceans, mainly Rimicaris 

exoculata on Rainbow site and other shrimp species (Mirocaris fortunata and Chorocaris chacei) on Lucky Strike 

and Menez Gwen as well as tegastid copepods on the 3 sites. If the study concerning Rimicaris exoculata 

symbioses is now in progress in our group, very few is known about other shrimps possible symbioses, if any, and 

even less about copepods. 

Rimicaris exoculata: our main goal is to collect fresh specimen in order to complete our collection of time series, 

from 2001 ATOS cruise, 2005 EXOMAR cruise, 2007 MoMARDREAM-Naut cruise and 2008 MoMAR cruise. We 

intend to condition samples for FISH and microscopy observations and to compare the results with previous ones. 

The muscles will be conditioned for molecular analyses for time series observations of genetic fluxes on the 

Rainbow site (S. Arnaud). Usually Rimicaris exoculata is only found at Rainbow, we intend to look for it on the other 

sites and if not found, to find clues explaining its absence. 

Other shrimps: We intend to condition samples of gill chamber and digestive tract for molecular analyses and 

microscopic observations. 

Copepods: in collaboration with J. Sarrazin (DEEP-LEP) and S. Ivanenko (Univ. Moscow), we have observed the 

possible presence of microorganisms in the digestive tracts of some copepods of the family Tegastidae. In addition, 

isotopic analyses on copepod species have shown that they were extremely depleted in δ 13 C, leading us to suspect 

a trophic link with the microbial compartment (De Busserolles et al. in revision, DSR). We now need fresh samples 

for DNA and RNA extraction and analyses, and microscopic observation. 

Microbial diversity: culturing attempts will be done on all samples if possible. 

14



2. Community ecology at Menez Gwen and Rainbow vent sites 

Project leaders: J. Sarrazin and P.M. Sarradin (Ifremer DEEP/LEP) 

Deep-sea hydrothermal ecosystems are extreme habitats, driven by microbial chemosynthesis and characterized 

by strong endemism. They harbour faunal assemblages dominated by complex animal communities associating 

microbial producers and secondary consumers that have co-evolved in a constraining environment. Several studies 

have shown that hydrothermal communities are shaped by dynamic, small- and large-scale geological processes 

which vary substantially in time and space. The spatial distribution of the fauna can be linked to fluid characteristics 

including concentrations of chemicals (methane, sulphide, metals) and fluid flow, to the type of substratum and 

also, to water depth (Sarradin et al. 1999; Sarrazin et al. 1999, 2002, Desbruyères et al. 2000, Le Bris et al. 2003, 

Sarradin et al. 2007, Cuvelier et al. submitted). Hydrothermal faunal communities also exhibit significant temporal 

changes that are linked to the temporal variability of their habitats and the ephemeral nature of energy sources 

(Sarrazin et al. 1997, Shank 1998). 

To complement the extensive spatial and temporal studies developed at the Lucky Strike vent site (see 

Thematic package 4 in the MoMARSAT cruise proposal), we would like to take the opportunity of the 

BioBazCentral cruise to implement comparable (although more limited) in situ ecological analysis at the 

Menez Gwen and Rainbow vent sites. 

We propose to continue exploring the different sources of environmental variability and their consequences on 

relying faunal communities by promoting a comparative approach. We will examine the small-scale spatial and 

temporal dynamics of faunal assemblages on selcted Menez Gwen and Rainbow sites in relation to the variability 

of environmental factors at these sites and compared to Lucky Strike (depth, temperature, sulfide, methane, metals 

contents,…). 

More specifically, we plan to address the following objectives: 

1. To assess the variations of faunal assemblages in terms of composition, diversity and density at a local 

spatial scale; 

2. To identify the variations of environmental factors at the same study sites; 

3. To identify the factors that significantly affects the structure of faunal assemblages at vents through 

multivariate statistics; 

The experimental design will rely on the acquisition of time series temperature data by a network of autonomous 

temperature probes deployed on selected mussel assemblages (at least 2 at Menez Gwen and 1 at Rainbow). 

In situ analysis using Chemini will be complemented by discrete sampling that will allow the acquisition of other 

important factors (dissolved and particulate metal concentrations, methane, organic matter…) to understand the 

processes controlling the fluid/seawater mixing zone and more specifically metal speciation (and hence 

bioavailability). Fluid flow measurements will be also performed (Sarrazin et al. submitted). Small–scale 

characterization of the different assemblages colonizing the studied sites will be done by a combination of imagery 

- using IRIS video camera system (Brandou et al. 2007) – and quantitative sampling of selected faunal patches. 

These samples will also be used to understand the variation of biochemical composition (condition/productivity 

index) of the animal patches in relation to the environmental factors. 

The characterization, distribution and evolution of the microfauna are also important aims of deep sea hydrothermal 

ecosystem studies. Depending on dive-time availability, we may deploy a set of microbial colonization devices in 

the immediate vicinity of the studied sites. 

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18






DESCRIPTIF DE LA CAMPAGNE 

• Méthodologie détaillée et liste précise des travaux et de leur niveau d’intégration pour atteindre les résultats escomptés - 

stratégie, 

• Déroulement général de la mission, durée totale (incluant durée mobilisation/démobilisation), transits, temps sur zone, 

période souhaitée, escale éventuelle et motif de ce souhait, 

• Calendrier journalier prévisionnel des travaux présenté sous forme d’un tableau (J1 à Jx) précisant : travaux, stations, 

profils, zones d'études, transits inter-stations ou inter-zones (obligatoire). Pour les études de sismique et les levés sonar il 

est indispensable d'indiquer le nombre de milles nautiques des profils et les vitesses de déplacement du navire. 

Méthodologie détaillée, stratégie 

Le documents 2 ne doit pas dépasser 6 pages maximum 

avec les illustrations, la bibliographie et une carte de localisation 

En ce qui concerne l'espèce Bathymodiolus azoricus, cible principale, les objectifs de la campagne BioBazCentrale 

peuvent être résumés ainsi : 

- prélèvement et études d'individus des populations naturelles colonisant des sites contrastés 

- prélèvement d'individus à Menez Gwen pour acclimatation et expérimentation à terre (LabHorta) 

- prélèvements et analyse in situ de fluides pour la caractérisation des conditions environnementales 

1. Sélection des sites 

from http://www.ipgp.jussieu.fr/rech/lgm/MOMARNET/ 

Le choix des sites sera essentiellement fondé sur les connaissances acquises ces dernières années sur les 

caractéristiques physico-chimiques qui règnent au niveau des moulières (campagnes ATOS, MOMARETO, 

MOMARDREAM). 

Table 1 : Concentrations dans le fluide hydrothermal sur les sites Menez Gwen, Lucky Strike and 

Rainbow, tire de Douville et al. 2002, Charlou et al. 2000 et Charlou et al. 2002. 

Site Menez Gwen Lucky Strike RainBow 

Depth (m) 840 1700 2280 

T (°C) 265 - 284 152 - 333 360 - 365 

pH 4.2 - 4.8 3.5 - 4.9 2.8 - 3.1 

CO 2 (mM) 20.1 – 22.6 8.9 – 39.9 16 

Cl - (mM) 360 - 400 410 - 540 750 

H 2 S(mM) 1.3 – 1.82 0.6 - 3.3 1 - 2.5 

CH 4 (mM) 1.35 – 2.15 0.30 - 0.89 2.2 - 2.5 

Fe (mM) 0.024 – 0.028 0.03 - 0.86 24 

19



Ba (µM) 20 - 43 6 - 80 67 

Mn (µM) 59 - 68 77 - 450 2250 

Co(µM)

Déroulement général de la mission 



Durée totale 16 jours 

- Nombre de jours effectifs de plongées 12 jours 

- Transits 2 jours (+ 2 nuits) 

- Mise à disposition 2 jours 

Positions géographiques des zones et des stations de travail 

- Rainbow 36°13,44' N 33°54,10' W 2300 m 

- Lucky Strike 37°17,29' N 32°16,45' W 1700 m 

- Menez Gwen 37°51,60' N 31°31,30' W 850 m 

Estimation des temps de transit (11 Nds) 

- Punta Delgada - Menez Gwen 20 h 

- Menez Gwen - Lucky Strike 7 h 

- Lucky Strike - Rainbow 11 h 

- Rainbow – Menez Gwen 18 h 

- Menez Gwen – Horta 13 h 

Période souhaitée : La zone de travail est soumise à des conditions de mer parfois difficiles pour la mise en oeuvre du 

submersible, mais la période la plus favorable est de mi-mai à mi-août. Cette période nous a été recommandée par les 

participants portugais et doit être considérée comme la plus favorable à la suite des différentes missions effectuées sur cette 

zone depuis 1993. 

Calendrier journalier 

Jour Site Travaux 

J1 Punta Delgada Mise à disposition - Embarquement 

J2 Transit Transit de Punta Delgada vers Menez Gwen 

J3 Menez Gwen BioBaz Sélection sites – Monitoring In situ – Prélèvement moules 

J4 Menez Gwen Autres objectifs 

J5 Menez Gwen Autres objectifs – Transit de nuit vers Lucky Strike 

J6 Lucky Strike BioBaz Sélection sites – Monitoring In situ – Prélèvement moules 

J7 Lucky Strike BioBaz Monitoring In situ – Prélèvement moules 

J8 Lucky Strike Autres objectifs – Transit de nuit vers Rainbow 

J9 Rainbow BioBaz Sélection sites – Monitoring In situ – Prélèvement moules 

J10 Rainbow BioBaz Monitoring In situ – Prélèvement moules 

J11 Rainbow Autres objectifs 

J12 Rainbow Autres objectifs 

J13 Transit Transit de Rainbow vers Menez Gwenn 

J14 Menez Gwen BioBaz – Déploiement cages – Relèvement expérimentation in situ 

J15 Menez Gwen BioBaz – Déploiement cages - Prélèvement moules – Transit de nuit 

J16 Horta Fin de mise à disposition - Débarquement 

Coordination 

Cette demande de campagne pourra être coordonnée avec la demande MoMARSAT 2 (Cannat et al. sur le champ 

Lucky Strike). Quelques participants (Ifremer, IUEM) sont d'ailleurs impliqués dans ces 2 projets, complémentaires 

pour la biologie. Alors que MoMARSAT s'occupe de l'aspect temporel et de la dynamique de l'écosystème, BioBaz 

Central a pour objectif la compréhension des relations de Bathymodiolus avec ses symbiontes et son 

environnement. 

21






MOYENS A METTRE EN OEUVRE 

• Navire support, submersible et positionnement (justifier le choix du navire et du submersible) 

• Équipements fixes mis en œuvre par GENAVIR, par l'IPEV ou par l’IRD (Tableau précisant pour chaque équipement : le 

type, le nombre, la fréquence et la durée d’utilisation envisagés) 

• Équipements mobiles mis en œuvre par GENAVIR, par l'IPEV, par l’IRD ou les parcs nationaux (INSU) (Tableau précisant 

pour chaque équipement : le type, le nombre, la fréquence et la durée d’utilisation envisagés) 

• Laboratoires et outils de dépouillement informatique nécessaires à bord 

• Est-il prévu d’embarquer des produits chimiques ou radioactifs ? pour les éléments radioactifs précisez lesquels 

• Matériel propre de l'équipe demandeuse (préciser existant ou à acquérir) 

• Personnel spécialisé si nécessaire 

• Besoins en équipements ou matériels complémentaires (préciser quels types ou spécifications) 

• Matériels fournis par des organismes extérieurs (préciser quels organismes ou laboratoires) 

• Moyens terrestres à mettre en œuvre 

1- Navire support, submersible et positionnement 

Navire support : N.O. Pourquoi Pas ? 

La campagne BBC repose sur de l’expérimentation (à bord et in situ) et sur l’acquisition d’un volume de données et 

d’échantillons important. Le Pourquoi pas ? répond à ce besoin en offrant 29 places pour les scientifiques et une 

importante surface de laboratoire. Ces deux critères sont décisifs pour mener à bien les objectifs des plongées 

avec la plus grande efficacité possible tout en menant en parallèle des expérimentation biologiques à bord. Il offre 

également des emplacements pour des containers laboratoires spécialisés (enceintes sous pression notamment) 

qui seront débarqués à Horta pour la poursuite des travaux à terre. 

Submersible : VICTOR 6000 

Le scénario proposé repose sur les capacités de Victor à travailler en mode chantier avec le module de 

prélèvement de base pour des plongées quotidiennes de 12 à 16 heures. Victor permet d'envisager les stations 

longues nécessaires pour réaliser les analyses in situ et, en conjonction avec l'utilisation de l'ascenseur-navette, 

permet de mener parallèlement l'échantillonnage de faune nécessaire aux expérimentations à bord. En particulier, 

l'expérience (ATOS, MOMARETO) a montré que l'opération de déploiement des cages à moules réclame 2 à 3 h 

par cage. 

L'utilisation du submersible Nautile est néanmoins possible mais pour tenir compte des limitations de temps utile 

sur le fond, nécessiterait au moins 3 jours supplémentaires de campagne (1j par site) pour réaliser l'ensemble des 

objectifs. Elle nécessiterait également l'adaptation de l'instrumentation développée spécifiquement pour le ROV 

Victor. 

Positionnement : GPS différentiel et base ultra courte POSIDONIA du submersible 

2- Equipements de base 

Matériel géré par GENAVIR 

- Victor 6000 et son matériel de mise en oeuvre 

- Module de prélèvements de base 

- Navettes et ascenseurs 

- Chaîne du froid (-20 et –80°C) 

Matériel propre de l'équipe demanderesse 

Outillage à intégrer sur Victor 

- Analyseur chimique in situ (CHEMINI équipé de sondes Unisense (pH, oxygène dissous, H2S) 

(Vuillemin et al. 2009). 

- Préleveur d'eau PEPITO équipé de filtres 0.45µM (Sarradin et al. 2009). 

- Débitmètre FLO (Sarrazin et al. soumis) 

- Préleveur quantitatif de faune sur substrat dur (en développement à Ifremer, TSI/LEP, ANR BioBaz). 

Instrumentation autonome 

- Préleveur sous pression PERISCOP 

Matériel « de laboratoire » 

22



- Enceintes pressurisées (BALIST, IPOCAMP, DESEARES) 

- Matériel de laboratoire 

3- Installations du navire qui doivent être utilisées 

Equipements scientifiques : 

PC scientifiques 

Tous les laboratoires scientifiques, y compris laboratoire thermostaté 

4- Personnel spécialisé 

Equipe VICTOR :10 personnes 

5- Besoins en équipements ou matériels complémentaires 

Néant à ce jour 

6- Produits chimiques ou radioactifs 

Une liste indicative des principaux produits chimiques est présentée ci-dessous: 

Nom Code UN Formule 

GAZ COMPRIMES 

Air synthétique 1002 N2 + O2 

Azote 1066 N2 

Dioxyde de carbone 1013 CO2 

Hélium 1046 He 

Hydrogène 1049 H2 

Oxygène 1072 O2 

Azote liquide 1066 N2 

LIQUIDES 

Acide chlorhydrique 1789 HCl 

Acide sulfurique 1830 H2SO4 

Chloroforme 1888 CHCl3 

Ethanol absolu 

C2H5OH 

Formol 2209 CH2O 

7- Matériel fourni par des équipes extérieures 

Néant à ce jour hormis celui apporté par les équipes participantes 

23







• Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à bord (liste exhaustive, référence des méthodes de 

traitement) 

• Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à terre (liste exhaustive, référence des méthodes de 

traitement) - calendrier 

• Archivage des données (lieux, supports, mise à disposition des utilisateurs) 

• Stockage des échantillons (lieux et dispositifs pris pour leur conservation, leur maintenance et leur mise à disposition des 

utilisateurs) 

• Prévision et calendrier de publication des résultats (distinguer rapports de données, articles scientifiques, thèses …) 


Les méthodes d’analyse et de traitement, trop nombreuses, sont détaillées dans les références bibliographiques. 

Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à bord 

Echantillons/ données Traitement Analyse 

Imagerie optique 

Logiciel Adélie 

Données in situ 

CHEMINI 

Débitmètre FLO 

Température 

Prélèvements discrets Acidification, congélation Mesures pH, filtrations, 

passage sur colonne 

Echantillons biologiques Tri Anatomie 

Dissection 

Histologie 

Fixation (alcool, formol, azote liquide) 

Biochimie 

Expérimentation in vivo 

Biologie moléculaire 

Transfert vers LabHorta 

Echantillons microbiologiques Fixation (alcool, formol, azote liquide, …) 

Incubation 

Analyses et traitements des échantillons et des données effectués à terre 

L'essentiel de l'exploitation des résultats devrait être réalisé dans un délai de 12 à 18 mois. L'expérimentation 

biologique in vivo se poursuivra dans le laboratoire basé à Horta, immédiatement suite à la mission et 6-12 mois 

après la mission, lors de la récupération des cages à faune (campagne portugaise dédiée Archipelago). 

Les analyses envisagées dépendent de la nature des échantillons et des objectifs de chaque tâche. 

Les crevettes et copépodes feront l'objet d'une caractérisation de la diversité microbienne associée par analyses 

moléculaires, FISH et observations microscopiques (DEEP-LMEE et UMR 7138). Des analyses génétiques sur les 

crevettes et les copépodes seront réalisées (DEEP-LEP). 

Archivage 

Les opérations effectuées pendant la campagne seront archivées via le logiciel embarqué Alamer. Les échantillons 

et données seront ensuite référencés dans la base de données BIOCEAN et associés à leur détenteur. Cette base 

sera consultable par les participants à la campagne. Les rapports de plongées et les données acquises par le 

submersible seront accessibles après la mission sous forme de CD-ROM. Les données vidéoscopiques brutes 

seront à la disposition des participants de la campagne après engagement de confidentialité vis-à-vis des médias. 

Prévision et calendrier de publication des résultats 

Les résultats obtenus dans le cadre du projet BioBaz seront de fait intégrés à celui-ci. Ces résultats seront 

notamment partie intégrante des rapports d'étape réclamés par l'ANR et des publications qui en découleront. Un 

site web initialement réservé aux membres du projet BioBaz rassemblera les résultats au fur et à mesure de leur 

disponibilité. Un site web grand public sera également élaboré dans le cadre de BioBaz et un carnet de bord 

permettra de suivre le déroulement de la campagne en temps réel. 

A la suite de la campagne, des rapports scientifiques préliminaires relatant les faits marquants seront soumis pour 

publication dans des revues sans comité de lecture (InterRidge News, ...). La publication et la communication des 

résultats s'échelonneront entre 6 mois et 5 ans après la fin de la campagne, en fonction de l'avancement des 

travaux de chaque laboratoire impliqué. 

24



A titre indicatif, la stratégie de valorisation des résultats et le mode de protection et d’exploitation des résultats tels 

qu'indiqués dans le projet BioBaz est reproduit ci-desous. 

- All gene or protein sequences obtained throughout this project will be deposited in appropiate molecular 

data libraries (GenBank, Swiss Prot, etc…). 

- The results of the various analysis performed will be posted as quickly as possible on the dedicated BioBaz 

website in a section with limited access for the BioBaz consortium to ensure information spreading within 

the partners. A consortium agreement regarding confidentiality will be prepared and submitted to the 

partners before the start of the project. Rules for Intellectual properties (in particular for patent deposition 

opportunities) will follow those of the participating institutions. 

- All publishable results will be presented at international conferences and submitted to international journals 

as appropriate. Our collective publication record is a guarantee that communication and publication will 

indeed start within the duration of the project and shortly (1-2 years) after its completion. The expected 

outcome of the BioBaz project should be a minimum of 24 articles (about 2-3 papers per task for T3 to T9) 

published in high rank journal for the disciplines (i.e. IF>2). We will try to publish a comprehensive series of 

papers issued from BioBaz in a special issue of an appropriate journal (e.g. Deep-Sea Research) after the 

final meeting. 

- The BioBaz project will be posted at various institutional and network websites: all partners institutions, and 

GDR Ecchis, InterRidge, MoMAR/ESONET, CAREX, …. This will ensure awareness of the scientific 

community at large. 

- The BioBaz web site will have a special section for general public outreach 

- The coordinator will encourage media coverage while supervizing information being released to confirm 

partners agreement. 

25






EQUIPE SCIENTIFIQUE ET TECHNIQUE 

• Equipe demandeuse : chef de projet - chefs de missions - équipe embarquée – équipe à terre (Laboratoire, spécialité, 

responsabilité et rôle à bord et à terre, participation à de précédentes campagnes) 

• Présentation des références scientifiques récentes de l'équipe demandeuse et, en particulier, état du traitement des données 

des dernières campagnes menées par les équipes participantes 

• Collaborations prévues (ne mentionner que si l'accord est acquis) - parts respectives des participations nationales ou 

internationales à terre et en mer. Y a-t-il un protocole ? 

1 - Equipe demandeuse 

Chef de projet et chef de mission : François Lallier 

Equipe embarquée 

Il est prévu d'embarquer 30 scientifiques. 

Pour le rôle à bord, la mention ROV signifie "Chef de quart", ce qui n'empêchera pas la participation régulière ou 

ponctuelle des autres embarquants dans la supervision scientifique des opérations de plongées. 

Pour le rôle à terre, se référer à la liste des taches (T0-T9) du document 1 

Nom Prénom 

Institut 

Laboratoire 

Spécialité 


et rôle à bord 



et rôle à terre 


LALLIER François UMR 7144 SBR Physiologie Chef mission, suivi plongées T0, T2 

X Ingénieur UMR 7144 SBR Chimie Acclimatation animaux, ROV T0, T2 

TANGUY Arnaud UMR 7144 SBR Génétique Exp. Sous pression, transcripto T2, T3 

BOUTET Isabelle UMR 7144 SBR Génétique Exp. Sous pression, transcripto T2, T3 

ANDERSEN Ann UMR 7144 SBR Histologie Dissection, fixation T2, T3 

MARY Jean UMR 7144 SBR Biochimie Dissection, fixation T2, T3 

JOLLIVET Didier UMR 7144 SBR Génétique Dissection, fixation, ROV T2, T6 

TOULLEC Jean-Yves UMR 7144 SBR Physiologie Exp. Sous pression, biochimie T2, T3, T6 

LE GUEN Dominique UMR 7144 SBR Tech. Biologie Exp. Sous pression, biochimie T3, T6 

DUPERRON Sébastien UMR 7138 SAE Microbiologie Fixation analyse symbiotes T2, T3, T4 

SHILLITO Bruce UMR 7138 SAE Physiologie Exp. sous pression T2 

X Etudiant UMR 7138 SAE Biochimie Dissection, fixation T3, T4 

SARRADIN Pierre-Marie Ifremer DEEP/LEP Chimie Analyses eau T8, T9 

SARRAZIN Jozée Ifremer DEEP/LEP Ecologie Manip écologie in situ, ROV T8 

Ingénieur Ifremer DEEP/LEP Chimie, écologie Analyses eau T8, T9 

COSSON Richard Isomer Nantes Physiologie Exp. Sous pression, biochimie T2, T3, T9 

COGNIE Bruno Isomer Nantes Physiologie Analyses nutrition T8 

RISO Ricardo UMR 6539 IUEM Chimie Analyse métaux T2, T9 

WAELES Mathieu UMR 6539 IUEM Chimie Analyse métaux T2, T9 

CHARMASSON Sabine IRSN La Seyne Biologie Radioéléments naturels T2, T8, T9 

COLACO Ana DOP UAC Horta Ecologie Analyses trophiques, ROV T2, T8 

BETTENCOURT Raul DOP UAC Horta Biologie Biochimie, immunologie T2, T3, T7 

X PhD DOP UAC Horta Biologie Analyses trophiques, biochimie T2, T7, T8 

CAMBON-BONAVITA M-Anne UMR 6197 LM2E Microbiologie Symbioses crustacés Symbioses crustacés 

ZBINDEN Magali UMR 7138 SAE Microbiologie Symbioses crustacés Symbioses crustacés 

X PhD Ifremer DEEP/LEP Chimie Chimie des fluides Chimie des fluides 

X PhD Ifremer DEEP/LEP Ecologie Dynamique peuplements Dynamique peuplements 

X Patrick BRIAND Ifremer DEEP/LEP Sytématique Tri faune et Biocean Tri faune et Biocean 

Nicole DUBILIER MPI Bremen Microbiologie Analyses symbioses Analyses symbioses 

X Student MPI Bremen Microbiologie Analyses symbioses Analyses symbioses 

A cette liste il faut ajouter l'équipe GENAVIR dédiée à la mise en œuvre du ROV Victor (10 personnes) 

Equipe à terre 

Pour le projet BioBaz 

Partenaire 1 

UMR 7144 Roscoff 

Nom Prénom Emploi actuel Personne.m 

ois 

Rôle/Responsabilité dans le projet 

4 lignes max 

Coordinateur/responsable LALLIER François PR1 16 T0 Coordination, T1, T2 

Autres membres X IE2-CDD 48 T0, T1 Logistics and web, T2 monitoring 

TANGUY Arnaud MCU 16 T1, T2, T3 Host gene expression studies 

26



X Post-doc 1 24 T2, T3 Holobiont gene expression 

MARY Jean MCU 16 T2, T3 Holobiont protein expression 

TOULLEC Jean-Yves MCU 10 T2, T3 Experimentation & Gene expression 

JOLLIVET Didier CR1 6 T2, T6 Genotype analysis 

RISO Ricardo PR2 12 T1, T2, T9 Metal bioavailability in water 

and tissues 

WAELES Mathieu MCU 6 T9 Metal bioavailability in water and 

tissues 

X PhD 1 50% 18 T1, T2, T9 Metal bioavailability in water 

and tissues 

Total P1 172 

Partenaire 2 

UMR 7138 Paris 


ois 


4 lignes max 

Coordinateur/responsable DUPERRON Sébastien MCU 20 T1, T2, T3, T4 Symbionts quantification 

and genome annotation 

Autres membres SHILLITO Bruce MCU 3 T2 Experimentation equipment 

X Post-doc 2 18 T3, T4 Symbionts quantification and 

genome annotation 

Total P2 41 

Partenaire 3 

DEEP-LEP Ifremer Brest 


ois 


4 lignes max 

Coordinateur/responsable SARRADIN Pierre- 

Marie 

CR2 7 T1, T8, T9 Characterization of the 

environmental gradient, experimentation 

monitoring 

Autres membres SARRAZIN Jozée 10 T1, T8 Nutrition analysis in situ and 

experiments 

X PhD 18 T1, T2, T9 Metal bioavailability in water 

and tissues 

Ingénieur 3 T1, T8, T9 

Total P3 38 

Partenaire 4 

EA 2160 Nantes 


ois 


4 lignes max 

Coordinateur/responsable COSSON Richard CR1 14 T1, T2, T3, T9 Trace element metabolism 

and gene expression 

Autres membres BARILLE Laurent MCU 6 T8, Nutrition processes 

COGNIE Bruno MCU 6 T8, Nutrition processes 

Total P4 26 

Partenaire 5 

LERCM IRSN Toulon 

Nom Prénom Emploi 

actuel 

Personne. 

mois 


4 lignes max 

Coordinateur/responsable CHARMASSON Sabine 12 T1, T2, T9 Radionuclide accumulation 

Autres membres X Post doc 6 T1, T8, T9 Radionuclide accumulation 

Total P5 18 

Partenaire 6 

IMAR / DOP UAç 

Nom Prénom Emploi 

actuel 

Personne. 

mois 


4 lignes max 

Coordinateur/responsable COLACO Ana Chercheur 12 T1,T2; T8 Nutrition experiments 

Autres membres BETTENCOURT Raul Chercheur 12 T1 ; T2 : T3 ; T7 Immunology 

PhD 18 T1,T2; T8 Nutrition experiments 

MSc 4 T1 ; T2 : T3 ; T7 Immunology 

MSc 4 T1 ; T2 : T3 ; T7 Immunology 

Total P6 50 

Pour le projet "Symbioses Crustacés" 

UMR6197 LMEE 

M.A. Cambon Bonavita 

V. Cueff-Gauchard 

M.Guri 

UMR 7138 SAE 

M. Zbinden 

DEEP/LEP Ifremer 

S. Arnaud 

J. Sarrazin 

27



Pour le projet Ecologie des peuplements 

DEEP/LEP Ifremer 

J. Sarrazin 

PhD écologie 

Université de Concordia 

Y. Gélinas 

Campagnes auxquelles les membres de l’équipe demandeuse ont participé au cours des 10 dernières 

années 

Nom des campagnes Année Noms des membres de l’équipe demandeuse 

ayant participé 

MOMARDREAM PPas/Nautile 2007 B. Shillito, M.A. Cambon-Bonavita 

MOMARETO PPas/Victor 2006 P.M. Sarradin, J. Sarrazin, D. Jollivet, B. Shillito, A. 

Tanguy, 

VIKING PPas/Victor 2006 A. Andersen 

EXOMAR Atalante/Victor 2005 B. Shillito, M.A. Cambon-Bonavita 

BIOSPEEDO 

Atalante/Nautile 

2004 P.M. Sarradin, F. Lallier, D. Jollivet ; B. Shillito, , 

M.A. Cambon-Bonavita 

NAUTINIL 2003 S. Duperron 

PHARE Atalante/Victor 2002 B. Shillito, F. Lallier ; D. Jollivet 

ATOS Atalante/Victor 2001 P.M. Sarradin, B. Shillito, F. Lallier ; D. Jollivet 

BIOZAIRE 2001 P.M. Sarradin, A. Andersen 

HOPE 

Atalante/Nautile 

1999 P.M. Sarradin, B. Shillito, F. Lallier ; D. Jollivet ; A. 

Andersen 

2 - Références scientifiques de l’équipe demandeuse 

(Pour les campagnes réalisées au maximum dans les 10 dernières années par des participants ayant été chef de projet ou chef de mission 

joindre en annexe une fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques antérieures” pour chacune des campagnes 

concernées) 

Pour les projets BioBaz et Ecologie des peuplements: 

Voir Fiches de Valorisation des campagnes suivantes en annexe: 

HOPE 1999 – Chef de mission François Lallier 

ATOS 2001 – Chef de mission Pierre-Marie Sarradin 

BIOSPEEDO 2004 – Chef de projet : François Lallier; Chef de mission: Didier Jollivet 

MOMARETO 2006 – Chef de projet : Jozée Sarrazin; Chef de mission : Pierre-Marie Sarradin 

Pour le projet Biologie des crustacés 

Liste des publications sur 10 années 

1 – Barbier G., Godfroy A., Meunier J.R., Quérellou J., Cambon M.A., Lesongeur F., Grimont P.A.D. ans Raguénès G. (1999). 

Pyrococcus glycovorans sp. nov., a hyperthermophilic Archaeon isolated from the East Pacific Rise. International Journal of 

Systematic Bacteriology 49, 1829-1837. 

2 - Cambon-Bonavita, M.A., Schmitt, P., Zieger, M., Flaman, J. M., Lesongeur, F., Raguénès, G., Bindel, D., Frisch, N., Lakkis, 

Z., Dupret, D., Barbier, G., and Quérellou, J. (2000). Cloning, expression, and characterization of DNA polymerase I from the 

hyperthermophilic archaea Thermococcus fumicolans. Extremophiles 4, 215-225. 

3 - Juniper, S. K., Cambon, M.A., Lesongeur, F., and Barbier, G. (2001). Extraction and purification of DNA from organic rich 

subsurface sediments (ODP Leg 169S). Marine Geology 174 : 241-247. 

4 - Wery, N., Lesongeur, F., Pignet, P., Derennes, V., Cambon-Bonavita, M.A., Godfroy, A., and Barbier, G. (2001). Marinitoga 

camini gen. nov., sp. nov., a rod-shaped bacterium belonging to the order Thermotogales, isolated from a deep-sea 

hydrothermal vent. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51, 2 pp 495-504. 

5 - Zbinden, M., Martinez, I., Guyot, F., Cambon-Bonavita, M.A., and Gaill, F. (2001). Zinc-iron sulphide mineralization in tubes of 

hydrothermal vent worms. European journal of mineralogy 13 :653-658. 

6 - Cambon-Bonavita M.A., Lesongeur F., Menoux S., Lebourg A. and Barbier G. (2001) Molecular study of microbial diversity in 

smoked salmon. International Journal of Food Microbiology 70 : 179-187. 

7 - Wery, N., Moricet, J.-M., Pignet, P., Lesongeur, F., Cambon-Bonavita, M.A., and Barbier, G. (2001). Caloranaerobacter 

azorensis, gen. nov., sp. nov., an anaerobic thermophilic bacterium, isolated from a deep-sea hydrothermal vent. 

International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 : 1789-1796. 

8 - Quérellou J, Alain K, Cambon-Bonavita M.A., (2001). Thermophiles from deep-sea hydrothermal vents. Vie Milieu, 51 (4): 

161-172. 

28



9 - Cambon-Bonavita M.A., Raguénès G, Jean J., Vincent P. and Guezennec J. (2002). Alteromonas macleodii subsp. Fijienseis 

biovar deepsane a new polymer producing bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete annelid. 

Journal of applied microbiology 93, 310-315. 

10 - Alain K., Pignet P., Zbinden M., Quillevere M., Duchiron F., DonvalL J.P., Donval A., Lesongeur F., Raguénès G., Crassous 

P., Quérellou J., and Cambon Bonavita M.A., (2002). Caminicella sporogenes gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic sporeforming 

bacterium isolated from an East-Pacific Rise hydrothermal vent. International Journal of Systematic and Evolutionary 

Microbiology. 52, 1621-1628. 

11 - Alain K., Quérellou J. , Lesongeur F., Pignet P., Crassous P., Raguénès G., Cueff V., and Cambon Bonavita. M.A., (2002). 

Caminibacter hydrogenophilus gen. nov., sp. nov., a novel thermophilic hydrogen-oxidising bacterium isolated from an East- 

Pacific Rise hydrothermal vent. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52, 1317-1323. 

12 - Alain K., Olagnon, M., Desbruyères, D., Page, A., Barbier, G. , Juniper, K. , Quérellou J. and Cambon Bonavita. M.A., 

(2002). Phylogenetic characterization of the bacterial assemblage associated with the hydrothermal vent polychaete 

Paralvinella palmiformis. FEMS microbiol Ecol,42 463-476 . 

13 - Wery N., Cambon-Bonavita M.A., Lesongeur F., Barbier G. (2002) Diversity of anaerobic heterotrophic thermophiles 

isolated from deep-sea hydrothermal vents of the Mid-Atlantic Ridge. FEMS microbiol Ecol, 41, 105-114. 

14 - Guillou, L., Nezan, E., Cueff, V., Erard-Le-Dern, E., Cambon-Bonavita, M.A., Gentien, P., and Barbier, G. (2002). Seminested 

PCR detection of three toxic dinoflagellate genera (Alexandrium, Dinophysis, and Gymnodinium) in sea water and 

sediments from French coasts. Protist 153, 223-238. 

15 - Cambon-Bonavita M.A., Lesongeur F., Pignet P., Wery N., Lambert, C. R. R, Godfroy A., and Barbier G. (2003) 

Thermococcus atlanticus, sp. nov. a new hyperthermophilic Archaeum isolated from deep-sea hydrothermal vent on Mid 

Atlantic Ridge. Extremophiles 7/2 101-109. 

16 - Raguénès G., Cambon-Bonavita M.A., Lohier, J.F., Boisset C. and Guezennec J. (2003) A novel high viscous 

polysaccharide excreted by an Alteromonas isolated from a deep-sea hydrothermal vent shrimp. Current Microbiology . 

46:448-52. 

17 - Zbinden M. and Cambon-Bonavita M.A.,(2003) Occurence of Deferribacterales and Entomoplasmatales in the deep-sea 

shrimp Rimicaris exoculata gut. FEMS Microbial Ecol.; 46, pp.23-30 

18 - Le Bris N, Gaill F, Alain K, Cambon M.A., Desbruyères D, Fabri M-C, Jeanthon C, Jollivet D, Lallier F, Lopez-Garcia P, 

Mevel C, Phillipot P, Piccino P, Pradillon F, Prieur D, Ravaux J, Rees J-F, Sarradin P-M, Shillito B, Thiebault E, Zal F, 

Zbinden M. (2002) Biogeochemical interactions in extreme environment conditions: an integrated study (PHARE 2002/ EPR 

13°N ). InterRidge news 11:20-3. 

19 - Alain K., Rolland S, Crassous P, Lesongeur F, Zbinden M, Le Gall C, Godfroy A, Pagé A, Juniper SK, Cambon-Bonavita 

M.A., Duchiron F, Querellou J. (2003) Desulfurobacterium crinifex sp. nov., a novel thermophilic, pinkish-streamer forming, 

chemolithoautotrophic bacterium isolated from a Juan de Fuca Ridge hydrothermal vent and amendment of the genus 

Desulfurobacterium. Extremophiles 7 (5):361-70. 

20 - Alain K., Zbinden M., Le Bris N., Lesongeur F., Quérellou J., Gaill F. and Cambon-Bonavita M.A., (2004) Early steps in 

microbial colonization processes at deep-sea hydrothermal vents. Environmental Microbiol., pp 227-241 

21 - Pagé A., Juniper S. K., Olagnon M., Alain K., Desrosiers G., Quérellou J. and Cambon-Bonavita M.A., (2004). Influence of 

Paralvinella sulfincola on the Microbial Diversity Associated with a Deep-Sea Hydrothermal Vent Sulfide Chimney . 

Geobiology 2: 225-238 

22 - Jollivet, D., F. H. Lallier, A. S. Barnay, N. Bienvenu, E. Bonnivard, P. Briand, M. A. Cambon Bonavita, T. Comtet, C. Daguin, 

J. P. Donval, B. Faure, M. Gaillard, V. Glippa, L. Guillou, S. Hourdez, N. Le Bris, S. Morand, F. Pradillon, J. F. Rees, M. 

Segonzag, B. Shillito, E. Thiebaut, and F. Viard. (2004). The BIOSPEEDO cruise : a new survey of hydrothremal vents along 

the South East Pacific Rise from 7°24'S to 21°33'S. InterRidge News 13:20-26. 

23 - H. Moussard, D. Moreira, M.A. Cambon-Bonavita, P.López-García, C. Jeanthon (2006) Uncultured Archaea in a 

hydrothermal microbial assemblage: phylogenetic diversity and characterization of a genome fragment from a euryarchaeote 

FEMS Microbiol Ecol,57(3)452-469. 

24 - Moussard H, Corre E., Cambon-Bonavita M.A., Fouquet Y, Jeanthon C. (2006) Novel uncultured Epsilonproteobacteria 

dominate a filamentous sulphur mat from the 13°N hydrothermal vent field, East Pacifique Rise. FEMS Microbiol Ecol. 58 (3) 

pp 449-463. 

25 – Zbinden M., Shillito B., Le Bris N., De Villardi de Montlaur C., Roussel E., Guyot F., Gaill F., Cambon-Bonavita M.A. (2008) 

New insights in metabolic diversity among the epibiotic microbial communities of the hydrothermal shrimp Rimicaris 

exoculata. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 359/2 pp131-140. 

26 – Corbari L., Zbinden M., Cambon-Bonavita M.A., Gaill F., Compère P. (2008) Moult-related settlement and mineral deposits 

in the branchial chamber of the MAR hydrothermal shrimp Rimicaris exoculata. Aquatic Biology, vol1 225-238. 

27 - Corbari L., Garry L., Grandjean F., Zbinden M., Cambon-Bonavita M.A., Gaill F., Compère P. (2008) Iron oxide deposits 

associated to the ectosymbiotic bacteria in the MAR hydrothermal vent shrimp Rimicaris exoculata. Biogeoscience. 

28 - Roussel E., Cambon Bonavita M.A., , Joël Querellou, Barry A. Cragg, Gordon Webster, Daniel Prieur & R. John Parkes. 

(2008). Extending the depth, age and temperature range of the sub-seafloor biosphere Science, 320, 1046. 

29 - Cambon-Bonavita M.A, Nadalig T., Roussel E., Delage E., Olu K., Duperron S., Caprais J.C., Boetius A., and Sibuet M. 

(2009) Distribution of AOM aggregates and microbial diversity associated to different faunal assemblages in a giant 

pockmark of Gabon continental margin. Deep Sea research, accepté. 

30 - E.G. Roussel, A.L. Sauvadet, J. Allard, C. Chaduteau, P. Richard, M.A. Cambon Bonavita, E. Chaumillon. (2009) .Active 

Archaeal Methane Cycling Communities Associated with Gassy Subsurface Sediments of Marennes-Oléron Bay (France) 

Geomicrobiology. In press. 

29



3 - Collaborations prévues 

(Précisez l’appartenance à un programme national, international REX, PI européens) par exemple 

Programmes nationaux: ANR DEEP OASES, ANR BALIST, ANR BioBaz (demande) 

Programmes européens: 

- SCA CAREX (Life in Extreme Environments) 

- ESONET/MoMAR/D 

- HERMIONE 

Programme international: InterRidge 

30






ASPECTS INTERNATIONAUX ET ENGAGEMENTS CONTRACTUELS 

• Distinction entre travaux Eaux internationales - ZEE - Eaux territoriales 

• Contacts préliminaires éventuellement pris et interlocuteurs privilégiés des pays riverains 

• Personnel étranger invité 

• Manifestations éventuelles post-campagnes (colloques, conférences, échanges de personnel) 

• Engagements contractuels dans le cadre de programmes européens, financements européens 

• Autres engagements contractuels 

Contacts préliminaires éventuellement pris et interlocuteurs privilégiés des pays riverains 

Une partie de la zone de travail (sites Lucky Strike et Menez Gwen), est située dans la ZEE portugaise. Une 

équipe portugaise fait partie intégrante du projet BioBaz et embarque 3 scientifiques : 

Universidade do Azores (IMAR/DOP), à Horta. PI: Ana Colaço (acolaco@uac.pt ) 

Personnel étranger invité 

• Ana Colaço 

• Raul Bettencourt 

• 1 étudiant portugais 

• Nicole Dubilier 

• 1 étudiant allemand 

31






CURRICULUM VITAE DES CHEFS DE MISSION 

(1 page au maximum par personne) 

François H. LALLIER 

Né le 17 Novembre 1959 à Paris 14ème 

Professeur à l’Université Pierre-et-Marie-Curie (Paris 6) depuis 2003 

Directeur de l’UMR 7144 CNRS/UPMC Adaptation et Diversité en Milieu Marin depuis 2001 (90 personnes) 

Directeur du GDR 2907 Ifremer/CNRS Biologie des Ecosystèmes Chimiosynthétiques Profonds depuis 2009. 

Responsable de l’équipe Ecophysiologie de 1994 à 2003, et depuis 2009 (6-10 personnes) 

Habilitation à Diriger des Recherches. Université Pierre et Marie Curie. Octobre 2001. 

Doctorat de l'Université de Bordeaux I en Physiologie Animale. Novembre 1988 

Enseignant en 2 nd et 3 ème cycle, en zoologie et écologie marine, océanologie biologique, biodiversité, 

écophysiologie des organismes. 

Membre du Comité de Sécurité des Engins Habités (Ifremer-Genavir) depuis 2000 

Membre de la Commission Nationale d 

Programmes de recherche (extrait) 

•GDR Ecchis (Ifremer/CNRS) "Biologie des Ecosystèmes Chimiosynthétiques Profonds" 2005- 

•Unité de Recherches Marines N°7 (IFREMER/UPMC/CNRS), “Ecologie et Ecophysiologie des Organismes 

Hydrothermaux Thermophiles” 1993-2001. Membre contractant. 

•Programme national DORSALES 1994-2001. Plusieurs projets financés, responsable du groupe de projets 

Symbioses, organisation de colloques. 

•Programme MAST 3 (CEE). Partenaire contractant dans le projet AMORES (resp. D. Desbruyères), Azores Mid- 

Oceanic Ridge Ecosystem Studies: an integrated research program on deep-sea hydrothermal transfers and 

fluxes.1996-98. 

•Programme CEE-5°PCRD. Partenaire contractant dans le projet VENTOX (resp. D. Dixon, SOC, UK). 

"Hydrothermal vents as a natural pollution laboratory". 2000-02. 1200 kF 

Campagnes océanographiques 

•2010 MESCAL (CdM N. Le Bris & F. Lallier) EPR NO/L'Atalante - Nautile 

•2004 BIOSPEEDO (CdP F. Lallier ; CdM. D. Jollivet) SEPR. NO/L'Atalante - Nautile 

•2002 PHARE (CdM. N. Le bris) EPR. NO/L'Atalante - Victor 

•2001 ATOS (CdM. P.M. Sarradin) MAR. NO/L'Atalante - Victor 

•1999 HOPE 99 (CdM. F. Lallier pour l'URM 7) EPR. NO/L'Atalante - Nautile. 

•1997 MARVEL (CdM. Desbruyères/Alayse) MAR. NO/L'Atalante - Nautile. 

•1996 HOT 96 (CdM. F. Gaill pour l’URM 7) EPR. NO/Nadir - Nautile et RV/Wecoma. 

•1994 EPR9-13 (CdM. Mullineaux/Childress/Felbeck) EPR. RV/NewHorizon & RV/Atlantis2 - Alvin. 

•1994 DIVA2 (CdM. Desbruyères/Alayse) MAR. NO/Nadir - Nautile. 

Encadrement de thèses : Franck Zal (1996), Stéphane Hourdez (2000), Fabienne Chausson (2001) Marie- 

Cécile De Cian (2002), Sophie Sanchez (2007), Matthieu Bruneaux (2008), Joana Garcia (en cours), Sophie 

Plouviez (en cours). 

Publications : 5 récentes sélectionnées sur environ 60 

Bruneaux M., Rousselot M., Leize E., Lallier F.H. & Zal F. 2008. The Structural Analysis of Large Noncovalent 

Oxygen Binding Proteins by MALLS and ESI-MS: A Review on Annelid Hexagonal Bilayer Hemoglobin and 

Crustacean Hemocyanin. Current Protein and Peptide Science, 9: 150-180. 

Sanchez S., Hourdez S. & Lallier F.H. 2007. Identification of proteins involved in the functioning of Riftia 

pachyptila symbiosis by Subtractive Suppression Hybridization. BMC Genomics, 8: 337. 

Lallier, F. H. (2006). Thioautotrophic symbiosis: towards a new step in eukaryote evolution? Cahiers de Biologie 

Marine 47, 391-396. 

Chausson, F., Sanglier, S., Leize, E., Hagège, A., Bridges, C. R., Sarradin, P.-M., Shillito, B., Lallier, F. H. and 

Zal, F. (2004). Respiratory adaptations to the deep-sea hydrothermal vent environment: the case of Segonzacia 

mesatlantica, a crab from the Mid-Atlantic ridge. Micron 35, 31-41. 

De Cian, M.-C., Andersen, A. C., Bailly, X. and Lallier, F. H. (2003). Expression and localization of carbonic 

anhydrase and ATPases in the symbiotic tubeworm Riftia pachyptila. J. of Exp. Biology 206, 399-409. 

32






ACCORD DES PERSONNELS EMBARQUANT 

(Chaque embarquant devra indiquer les autres propositions de campagnes pour lesquelles il a donné son accord) 

UMR 7144 Adaptation et Diversité en Milieu Marin 

UPMC – CNRS – Station Biologique de Roscoff 

ANDERSEN Ann 

BOUTET Isabelle 

JOLLIVET Didier 


LE GUEN Dominique 

MARY Jean 

TANGUY Arnaud 

TOULLEC Jean-Yves 

Nous donnons notre accord pour participer à la campagne BioBaz Centrale en 2011. 

Engagement sur d'autres projets de campagne 2010/11: 

WACS (Andersen, Jollivet) 

Fait à Roscoff, le 12 janvier 2009 

UMR 7138 – Systématique, Adaptation et Evolution – Equipe AMEX 

UPMC CNRS Paris 

DUPERRON Sébastien 

SHILLITO Bruce 

ZBINDEN Magali 


Engagement sur d'autres projets de campagne 2010/11: AUCUN 

Fait à Paris le 9 janvier 2009 

UMR 6539 – LEMAR 

CNRS – UBO Brest 

RISO Ricardo 

WAELES Mathieu 


Engagement sur d'autres projets de campagne 2010/11: AUCUN 


DEEP Laboratoire Environnement Profond 

Ifremer Brest 

SARRADIN Pierre-Marie 

SARRAZIN Jozée 


Engagement sur d'autres projets de campagne 2010/11: 

33

MOMARSAT (Sarradin, Sarrazin) 




Equipe Associée 2160 - Mer, Molécules, Santé (EA 2160 - MMS) 

Université de Nantes 

COGNIE Bruno 

COSSON Richard P. 


Engagement sur d'autres projets de campagne 2011: AUCUN 

Fait à Nantes le 12 Janvier 2009 

IRSN / LERCN 

CHARMASSON Sabine 

Je donne mon accord pour participer à la campagne BioBaz Centrale en 2011. 

Engagement sur d'autres projets de campagne 2011: AUCUN 

Fait à La Seyne/Mer le 12 Janvier 2009 

Je, soussigné Marie Anne Cambon Bonavita, chercheur en microbiologie et biologie moléculaire, accepte 

d'embarquer sur la campagne BioBazCentral pour l'étude des communautés microbiennes symbiontes de 

crustacés associées aux systèmes hydrothermaux des Azores. 

Fait à Plouzané, le 12 janvier 2009 

Dr CAMBON-BONAVITA Marie-Anne 

Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes DEEP/ML2E 

Ifremer centre de Brest BP 70 29280 Plouzané France 

Tel : 33(0)2-98-22-47-56 Fax : 33(0)2-98-22-47-57 

IMAR DOP 

U. Açores, Horta, Faial, Portugal 

COLACO Ana 

BETTENCOURT Raul 


Engagement sur d'autres projets de campagne 2011: 

MOMARSAT (Colaço) 

Fait à Horta le 14 Janvier 2009 

Dear Francois, 

Stephane told me about your proposal for a research cruise - BioBaz Central - to the hydrothermal vent sites on 

the Azores Triple Junction in 2011 and your kind invitation for me to join this cruise if it is funded. It is with great 

pleasure that I accept this invitation and I am very much looking forward to our collaboration within the BioBaz 

34



project. Please let me know if there is anyway in which I can support you in your efforts to receive funding for this 

cruise. 

I wish you good luck with the proposal! 

Best wishes, 

Nicole Dubilier 

Dr. Nicole Dubilier 

Head of the Symbiosis Group 

Max Planck Institute of Marine Microbiology 

Celsiusstr. 1, D-28359 Bremen, Germany 

Jan. 7th - Feb. 13th: chiefscientist@merian.io-warnemuende.de 

Afterwards : ndubilie@mpi-bremen.de 

35



ANNEXES 

Fiches “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques ” 

Campagnes 

1999 HOPE – Chef de mission F. Lallier 

2001 ATOS – Chef de mission P.M. Sarradin 

2004 BIOSPEEDO – Chef de projet F. Lallier – Chef de mission: D. Jollivet 

2006 MOMARETO – Chef de mission J. Sarrazin et P.M. Sarradin 

36



Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques ” 

(à transmettre par courrier électronique à lallier@sb-roscoff.fr) 

Nom de la campagne : HOPE Programme : 

Navire : L’ATALANTE 

Engins lourds :NAUTILE 

Dates de la campagne : 9/04-22/05/1999 

Zone : EPR 9-13°N 

Chef de projet : F. Lallier 

Organisme : UPMC / CNRS 

Chef de mission 1 : F. Lallier 


Chef de mission 2 : F. Lallier 


Fiche remplie par : F. Lallier Date de rédaction de la fiche : 30/11/2005 

Adresse :Ecophysiologie - UMR7127 CNRS/UPMC Station Biologique, Roscoff 

Email : lallier@sb-roscoff.fr Tel : 02 9829 2311 Fax : 02 9829 2324 

Résultats majeurs obtenus : 

Récapitulatif 1999-2005 - Final 

La campagne HOPE a marqué un tournant dans les capacités d'interventions analytiques et expérimentales de la 

communauté nationale travaillant sur la biologie des sources hydrothermales profondes: 

• Première utilisation d'ALCHIMIST pour l'analyse chimique in situ (Sarradin, Le Bris) 

• Première utilisation d'IPOCAMP, enceinte pressurisée pour l'expérimentation in vivo (Shillito) 

• Première utilisation d'ADELIE en liaison avec BIOCEAN pour le traitement immédiat et ultérieur des 

données de plongées (LeCornu, Fabri) 

Très brièvement, les résultats majeurs obtenus concernent: 

• Obtention des premiers stades de développement d'Alvinella pompejana (Pradillon) 

• Premières analyses des interactions biologie/géochimie sur le pôle chaud (Zbinden, Le Bris) 

• Avancées importantes sur la thermotolérance des Annélides du pôle chaud (Shillito, Jollivet) 

• Premières expériences sur des bactériocytes isolés de Riftia pachyptila (De Cian) 

• Contributions importantes dans l'étude du métabolisme de Riftia (Minic, Arndt) 

• Avancées sur l'évolution et les fonctions des hémoglobines (Bailly, Hourdez) 

• Première mise en évidence d’éléments mobiles de la famille mariner chez les organismes hydrothermaux 

(Hardivillier) 

• Avancées majeures sur l'osmorégulation et la respiration des Crustacés Décapodes (Chausson, Martinez) 

1 Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées SCI 51 

2 Publications dans d’autres revues scientifiques 6 

3 Publications sous forme de rapports techniques 6 

4 Articles dans des revues / journaux grand public 4 

5 Publications de résumés de colloques 

6 Communications dans des colloques internationaux 

dont communications orales 

dont posters 

7 Communications dans des colloques nationaux 


dont posters 

37 

67 

32 

35 

31 

11 

20 

Nombre 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 

9 Applications (essais thérapeutiques ou cliniques, AMM …) 

10 Brevets 1 

11 Publications d’atlas (cartes, photos) 

12 Documents vidéo-films 

13 Publications électroniques sur le réseau Internet 

14 DEA ayant utilisé les données de la campagne 8 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne 10 

16 Validation des données en cours : .... terminée : ....X



17 Transmission au SISMER Non : .... Oui : ....X 

18 Transmission à d’autres banques de données Non : .... Oui : ....X 

19 Transmission à d’autres équipes Non : .... Oui : .... 

20 Considérez-vous l’exploitation en cours : .... terminée : ....X 

Fournir pour chacune des rubriques du tableau : 

Rubriques 1 à 7 incluses : 

Une liste des publications et colloques avec les noms d’auteurs suivant la présentation en vigueur pour les revues 

scientifiques. A présenter selon la classification du tableau ci-dessus. 

Rubriques 8 à 13 : 

Liste des références des rapports, des applications, des brevets, atlas ou documents vidéo 

Rubriques 14 et 15 : (Pour chaque étudiant) 

Nom et Prénom, Laboratoire d’accueil 

Sujet du DEA ou de la thèse, Date de soutenance 


Le type des données validées et/ou transmises, 

Les banques de données (SISMER, JGOFS, CDIAC …) les équipes auxquelles elles ont été transmises. 

Rubrique 20 : 

Si l’exploitation est toujours en cours, pouvez-vous donner un échéancier ? 

1. PUBLICATIONS 

1999 Sarradin P.M., Le Bris N., Birot D., Caprais J.C. Laboratory adaptation of the methylene blue methode to flow 

injection analysis: towards in situ sulfide analysis in hydrothermal seawater. Analytical Communication: 36, 157-160. 

2000 Chevaldonné P., Fisher C.R., Childress J.J., Desbruyères D., Jollivet D., Zal F., Toulmond A. Thermotolerance and 

the "Pompeii worms". Marine Ecology Progress Series: 208, 293-295. 

2000 De Cian M.-C., Regnault M., Lallier F.H. Nitrogen metabolites and related enzymatic activities in the body fluids and 

tissues of the hydrothermal vent tubeworm Riftia pachyptila. J. Exp. Biol.: 203, 2907-2920. 

2000 Desbruyères D., Hourdez S. A new species of scale-worm (Polychaeta: Polynoidae), Lepidonotopodium atalantae sp. 

nov., from the East Pacific Rise at 13°N and 9°50'N. Cah. Biol. Mar.: 41, 47-54. 

2000 Hourdez S., Debruyères D. A new species of scale-worm (Polychaeta: Polynoidae), Levensteiniella plicata sp. nov., 

from the East Pacific Rise. Cah. Biol. Mar.: 41, 97-102. 

2000 Hourdez S., Lallier F.H., De Cian M.-C., Green B.N., Weber R.E. The gas transfer system in Alvinella pompejana 

(Annelida Polychaeta, Terebellida). Functional properties of intracellular and extracellular hemoglobins. Physiol. Bioch. 

Zool.: 73, 365-373. 

2000 Le Bris N., Sarradin P.M., Birot D., Alayse-Danet A.M. A new chemical analyzer for in situ measurement of nitrate 

and total sulfide over hydrothermal vent biological communities,. Marine Chemistry: 72, 1-15. 

2001 Andersen A.C., Hamraoui L., Zaoui D. The obturaculum of Riftia pachyptila (Annelida, Vestimentifera): 

ultrastructure and function of the obturacular muscles and extracellular matrix. Cahiers de Biologie Marine: 42, 219-237. 

2001 Arndt C., Gaill F., Felbeck H. Anaerobic sulfur metabolism in thiotrophic symbioses. Journal of Experimental 

Biology: 204, 741-750. 

2001 Chamoy L., Nicolai M., Ravaux J., Quennedey B., Gaill F., Delachambre J. A novel chitin-binding protein from the 

vestimentiferan Riftia pachyptila interacts specifically with beta-chitin. Cloning, expression, and characterization. J Biol 

Chem: 276, 8051-8. 

2001 Chausson F., Bridges C.R., Sarradin P.M., Green B.N., Riso R., Caprais J.C., Lallier F.H. Structural and functional 

properties of hemocyanin from Cyanagraea praedator, a deep-sea hydrothermal vent crab. Proteins: 45, 351-359. 

2001 Green B.N., Gotoh T., Suzuki T., Zal F., Lallier F.H., Toulmond A., Vinogradov S.N. Observation of Large, Noncovalent 

Globin Subassemblies in the ~3600 kDa Hexagonal Bilayer Hemoglobins by Electrospray Ionization Time-of- 

Flight Mass Spectrometry. Journal of Molecular Biology: 309, 553-560. 

2001 Le Bris N., Sarradin P.M., Pennec S. A new deep-sea probe for in situ pH measurement in the environment of 

hydrothermal vent biological communities. Deep Sea Research I: 48, 1941-1951. 

2001 Martinez A.-S., Toullec J.Y., Shillito B., Charmantier-Daures M., Charmantier G. Hydromineral regulation in the 

hydrothermal vent crab Bythograea thermydron. Biological Bulletin: 201, 167-174. 

2001 Minic Z., Simon V., Penverne B., Gaill F., Herve G. Contribution of the bacterial endosymbiont to the biosynthesis 

of pyrimidine nucleotides in the deep-sea tube worm Riftia pachyptila. J Biol Chem: 276, 23777-23784. 

2001 Pradillon F., Shillito B., Young C.M., Gail F. Development arrest in vent worm embryos. Nature: 413, 698-699. 

2001 Ravaux J., Hassanin A., Deutsch J., Gaill F., Markmann-Mulisch U. Sequence analysis of the myosin regulatory light 

chain gene of the vestimentiferan Riftia pachyptila. Gene: 263, 141-9. 

2001 Segonzac M., Young R.E., Guerra A., Lindsay D.J., Clague D.A., Bernhard J.M., Sager W.W., Gonzalez A.F., Rocha 

F.J. Worldwide observations of remarkable deep-sea squids. Science: 294, 2005-2006. 

2001 Shillito B., Jollivet D., Sarradin P.M., Rodier P., Lallier F.H., Desbruyères D., Gaill F. Thermotolerance of annelids 

living on deep-sea vents smoker walls. Marine Ecology Progress Series: 216, 141-149. 

2001 Zbinden M., Martinez I., Guyot F., Cambon-Bonavita M.A., Gaill F. Zinc-iron sulphide mineralization in tubes of 

38



hydrothermal vent worms. Eur. J. Mineral.: 

2002 Andersen A.C., Jolivet S., Claudinot S., Lallier F.H. Biometry of the branchial plume in the hydrothermal vent 

tubeworm Riftia pachyptila (Vestimentifera; Annelida). Canadian Journal of Zoology: 80, 320-332. 

2002 Bailly X., Jollivet D., Vanin S., Deutsch J., Zal F., Lallier F.H., Toulmond A. Evolution of the sulfide-binding 

function within the globin multigenic family of the deep-sea hydrothermal vent tubeworm Riftia pachyptila. Molecular 

Biology and Evolution: 19, 1421-1433. 

2002 Biscoito M., Segonzac M., Almeida A., Desbruyères D., Geistdoerfer P., Turnipseed M., Van Dover C.L. Fishes from 

the Hydrothermal Vents and Cold Seeps – An Update. Cahiers de Biologie Marine: 43, 359-362. 

2002 Casse N., Pradier E., Demattei M.-V., Bigot Y., Laulier M. Mariner transposons are widespread genetic parasites in 

the genome of hydrothermal invertebrates. Cahiers de Biologie Marine: 43, 325-328. 

2002 Chevaldonné P., Jollivet D., Desbruyères D., Lutz R.A., Vrijenhoek R.C. Sister-species of eastern Pacific 

hydrothermal vent worms (Ampharetidae, Alvinellidae, Vestimentifera) provide new mitochondrial COI clock calibration. 

Cahiers de Biologie Marine: 43, 367-370. 

2002 Denis F., Vachoux C., Gauvry L., Leignel V., Salin C., Hardivillier Y., Cosson R., Laulier M. Characterization and 

expression of a Bathymodiolus sp. metallothionein gene. Cahiers de Biologie Marine: 43, 329-332. 

2002 Dixon D.R., Dixon L.R.J., Shillito B., Gwynn J.P. Background and induced levels of DNA damage in Pacific deepsea 

vent polychaetes: the case for avoidance. Cahiers De Biologie Marine: 43, 333-336. 

2002 Gonzalez A., Guerra A., Rocha F., Briand P. Morphological variation in males of Vulcanoctopus hydrothermalis. 

Bulletin of Marine Science: 71, 289-298. 

2002 Jouin-Toulmond C., Mozzo M., Hourdez S. Ultrastructure of spermatozoa in four species of Alvinellidae (Annelida: 

Polychaeta). Cahiers de Biologie Marine: 43, 391-394. 

2002 Lechaire J.P., Shillito B., Frebourg G., Gaill F. Elemental characterization of microorganism granules by EFTEM in 

the tube wall of a deep-sea vent invertebrate. Biology of the Cell: 94, 243-249. 

2002 Lopez Garcia P., Gaill F., Moreira D. Wide bacterial diversity associated with tubes of the vent worm Riftia 

pachyptila. Environmental Microbiology: 4, 204-215. 

2002 Minic Z., Pastra-Landis S., Gaill F., Herve G. Catabolism of pyrimidine nucleotides in the deep-sea tube worm Riftia 

pachyptila. J Biol Chem: 277, 127-34. 

2002 Sadosky F., Thiébaut E., Jollivet D., Shillito B. Recruitment and population structure of the Vetigastropod 

Lepetodrilus elevatus at 13°N hydrothermal vent sites on East Pacific Rise. Cahiers de Biologie Marine: 43, 399-402. 

2002 Sorgo A., Gaill F., Lechaire J.P., Arndt C., Bright M. Glycogen storage in the Riftia pachyptila trophosome: 

contribution of host and symbionts. Marine Ecology Progress Series: 231, 115-120. 

2002 Toullec J.Y., Vinh J., Le Caer J.-P., Shillito B., Soyez D. Structure and phylogeny of the crustacean hyperglycemic 

hormone and its precursor from a hydrothermal vent crustacean : the crab Bythograea thermydron. Peptides: 23, 31-42. 

2002 Zal F., Chausson F., Leize E., Van Dorsselaer A., Lallier F.H., Green B.N. Quadrupole time-of-flight mass 

spectrometry of the native hemocyanin of the deep-sea crab Bythograea thermydron. Biomacromolecules: 3, 229 -231. 

2003 Bailly X., Leroy R., Carney S., Collin O., Zal F., Toulmond A., Jollivet D. The loss of the hemoglobin H2S-binding 

function in annelids from sulfide-free habitats reveals molecular adaptation driven by Darwinian positive selection. 

Proceedings of the National Academy of Sciences: 100, 5885-5890. 

2003 De Cian M.-C., Andersen A.C., Bailly X., Lallier F.H. Expression and localization of carbonic anhydrase and 

ATPases in the symbiotic tubeworm Riftia pachyptila. Journal of Experimental Biology: 206, 399-409. 

2003 De Cian M.-C., Andersen A.C., Toullec J.-Y., Biegala I., Caprais J.-C., Shillito B., Lallier F.H. Isolated bacteriocyte 

cell suspensions from the hydrothermal vent tubeworm Riftia pachyptila, a potent tool for cellular physiology in a 

chemoautotrophic symbiosis. Marine Biology: 142, 141-151. 

2003 De Cian M.C., Bailly X., Morales J., Strub J.M., Van Dorsselaer A., Lallier F.H. Characterization of carbonic 

anhydrases from Riftia pachyptila, a symbiotic invertebrate from deep-sea hydrothermal vents. Proteins: 51, 327-339. 

2003 Le Bris N., Sarradin P.-M., Caprais J.C. Contrasted sulphide chemistries in the environment of 13°N EPR vent fauna. 

Deep Sea Research I: 50, 737-747. 

2003 Sanglier S., Leize E., Van Dorsselaer A., Zal F. Comparative ESI-MS Study of ≈2.2 MDa Native Hemocyanins from 

Deep-Sea and Shore Crabs: From Protein Oligomeric State to Biotope. Journal of the American Society of Mass 

Spectrometry: 14, 419-429. 

2003 Sarradin P.M., Le Bris N. Fe analysis by the the ferrozine method: Adaptation to FIA towards laboratory and in situ 

analysis in hydrothermal environment. Analytica Chimica Acta: 

2003 Zbinden M., Le Bris N., Compère P., Martinez I., Guyot F., Gaill F. Mineralogical gradients associated with 

Alvinellids at deep-sea hydrothermal vents. Deep Sea Research I: 50, 269-280. 

2004 Company R., Serafim A., Bebianno M.J., Cosson R.P., Fiala-Médioni A., Shillito B. Effect of cadmium, copper and 

mercury on antioxidant enzyme activities and lipid peroxidation in the gills of the hydrothermal vent mussel Bathymodiolus 

azoricus. Marine Environmental Research: 58, 377-381. 

2004 Halaimia-Toumi N., Casse N., Demattei M.-V., Renault S., Pradier E., Bigot Y., Laulier M. GC-rich transposon 

Bytmar1 from the deep-sea hydrothermal crab, Bythograea thermydron, may encode three transposase isoforms from a 

single ORF. Journal of Molecular Evolution: 59, 747-760 

2004 Hardivillier Y., Leignel V., Denis F., Ugen G., Cosson R., Laulier M. Do organismes living around hydrothermal 

vent sites contain specific metallothioneins ? The case of the genus Bathymodiolus (Bivalvia, Mytilidae). Comparative 

Biochemistry and Physiology Part C: 139, 111-118. 

2004 Piccino P., Viard F., Sarradin P.M., Le Bris N., Le Guen D., Jollivet D. Thermal selection of PGM allozymes in 

39



newly founded populations of the thermotolerant vent polychaete Alvinella pompejana. Proceedings of the Royal Society of 

London, serie B: 271, 2351-2359. 

2005 Bailly X., Vinogradov S. The sulfide binding function of annelid hemoglobins: relic of an old biosystem? Journal of 

Inorganic Biochemistry: 99, 142-150. 

2005 Hourdez S., Weber R.E. Molecular and functional adaptations in deep-sea hemoglobins. Journal of Inorganic 

Biochemistry: 99, 130-141. 

2. AUTRES PUBLICATIONS 

1999 Lallier F.H., Gaill F., Desbruyères D., campagne l.e.d.p.à.l. Campagne HOPE 99 (N.O. L'Atalante et Nautile; avrilmai 

99): retour sur la zone atelier 13°N EPR. La Lettre Dorsales, Sep 1999: 6, 16-20. 

1999 Lallier F.H., Gaill F., Desbruyères D., Andersen A.C., Birrien J.-L., Biscoito M., Bonhomme F., Boorman B., Briand 

P., Caprais J.C., Chausson F., Chevaldonné P., Cheynel D., Cosson R., De Cian M.-C., Dixon D.R., Edge D., Fabri M.-C., 

Fiala-Medioni A., Herring P.J., Hervé G., Hourdez S., Jollivet D., Khripounoff A., Laulier M., Le Bris N., Lecornu F., 

Ondréas H., Pradillon F., Pond D., Rodier P., Sarradin P.-M., Ségonzac M., Shillito B., Thiébaut E., Toullec J.Y. The 

HOPE 99 cruise: back to 13°N EPR. InterRidge News, Fall 1999: 8, 19-22. 

1999 Shillito B. Instrumentation sous pression : Mise en oeuvre de l'aquarium pressurisé IPOCAMP lors de la mission 

HOPE 99. La lettre Dorsales, 6, 8-9. 

2000 Le Bris N., Sarradin P.M., Rodier P., Birot D. L'ALCHIMIST : un nouvel outil pour caractériser l'environnement 

chimique des organismes hydrothermaux. La Lettre Dorsales, 7, 7-9. 

2002 Pavillon J.-F., Douez C., Menasria R., Forget J., Amiard J.-C., Cosson R.P. Impact of dissolved and particulate 

organic carbon on the bioavailability of the trace metals silver and mercury for the harpacticoid copepod Tigriopus 

brevicornis. J. Rech. Océanographique, 27, 43-52. 

2003 Le Bris N. Insights from modeling of physico-chemical conditions in vent habitats. InterRidge News, 12, 17-18. 

3/ RAPPORTS 

1999 Jolivet S. Estimation de la surface branchiale de Riftia pachyptila; évolution au cours de la croissance. Maitrise de 

Biologie et Physiologie Cellulaire. Université de Bretagne Occidentale. 18 p. 

1999 Sarradin P.M., Le Bris N., Rodier P. ALCHIMIST : AnaLyseur CHIMique In SiTu : Bilan de la première mission 

scientifique HOPE 99, évolutions et perspectives. 

2000 Durand S. Ultrastructure des soies sur le vaisseau éfferent branchial du crabe hydrothermal: Bythograea thermydron. 

Maîtrise Biologie des Populations et des Ecosystèmes. Maîtrise, Univ. de Bretagne Occidentale. 20 p. (Supervisé par A. 

C. Andersen and F. Chausson) 

2000 Gestin N. Apprentissage de techniques de biologie moléculaire appliquées aux globines de Riftia pachyptila. IUP 

Biologie et Informatique. DEUST, Univ. Evry Val d'Essonne. 18 p. (Supervisé par X. Bailly) 

2001 Le Roy R. Mise au point d’une technique permettant de déterminer les concentrations de sulfure d’hydrogène liées à 

des hémoglobines extracellulaires. Biologie des populations et écosystèmes. Maîtrise, Univ. Bretagne Occidentale. p. 

(Supervisé par F. Zal and X. Bailly) 

2003 Ritter A. Hypercapnie et équilibre acide-base chez le crabe hydrothermal Bythograea thermydron et la crevette 

Palaemon elegans. Biologie des Populations et Ecosystèmes. Maitrise, Univ. de Bretagne Occidentale. p. (Supervisé par 

F. H. Lallier) 

4. GRAND PUBLIC 

1999 Andersen A.C., Lallier F.H. En plongée sur les sources hydrothermales. Revue du Palais de la Découverte, 27, 17-26. 

2001 Zal F. 2 000 mètres sous les mers, à la recherche de l'origine de la vie. Science Infuse, Juin: 

2002 Zal F. Les sources abyssales, berceau de la vie? La Recherche, Juillet-Aout: 355, 22-25. 

2003 Zal F., Jollivet D. Les colons des vallées sous-marines. La Recherche, Avril: HS n°11, 42-45. 

6.COMMUNICATIONS INTERNATIONALES 

1999 Chausson F., Sarradin P.-M., Green B.N., Truchot J.-P., Lallier F.H. 20th European Society for Comparative 

Biochemistry and Physiology Conference, Aahrus (DK), 27-30 Jun. Respiratory adaptations to the hydrothermal vent 

environment: structure and functional properties of Cyanagraea praedator (Crustacea: Decapoda) haemocyanin 

1999 Le Bris N., Sarradin P.-M., Colaço A. 34th European Marine Biology Symposium, Punta Delgada, Açores, Portugal, 

1999. Oral. In situ chemical analysis to characterize the environment of hydrothermal vent fauna at the microhabitat scale 

1999 Sarradin P.M., Le Bris N., Birot D., Caprais J.C., Briand D. 4ème Congrès International Limnologie-Océanographie 

: Variabilités temporelles au sein des hydrosystèmes, Bordeaux, France, Sep 7-10. Poster. Caractérisation chimique de 

l'écosystème hydrothermal et analyse in situ 

2000 Bailly X., Jollivet D., Zal F. XIIth International Conference on Invertebrate Dioxygen Binding Proteins, Roscoff, 

France, Jul 23-28. Oral. Did duplication events generate a new function of H2S binding in the multigenic globin family of 

Riftia pachyptila ? 

2000 Chausson F., Bridges C.R., Sarradin P.-M., Lallier F.H. XIIth International Conference on Invertebrate Dioxygen 

Binding Proteins, Roscoff, France, Jul 23-28. Oral. Micro-environments and functional properties of haemocyanin: 

correlation or divergence? The case of two hydrothermal vent crabs 

2000 Chausson F., Camus L., Lallier F.H., Sarradin P.M., Truchot J.P., Bridges C.R. Society for Experimental Biology, 

Exeter, UK, Mar 27-31. Poster. Haemocyanin function in deep-sea hydrothermal decapod crustaceans 

40



2000 Chausson F., Lallier F.H., Sarradin P.-M., Green B.N., Boisset N., Van Dorsselaer A. XIIth International Conference 

on Invertebrate Dioxygen Binding Proteins, Roscoff, France, Jul 23-28. Poster. Quaternary structure of the hydrothermal 

vent crab, Cyanagraea praedator, haemocyanin 

2000 de Buron I., Morand S., Segonzac M. RIDGE 2000 Exploratory Studies Planning Workshop, Nashville, USA, 5-7 

October 2000. Poster. Acanthocephalans parasites of hydrothermal fish: a model for exploratory collaborations amongst 

biologists and chemists? 

2000 De Cian M.C., Bailly X., Andersen A.C., Shillito B., Lallier F.H. Experimental Biology 2000, Cambridge UK, Jul 30 

- Aug 3. Poster. Carbon dioxide cellular transport in a symbiotic invertebrate, the hydrothermal vent tubeworm Riftia 

pachyptila 

2000 Desbruyères D., Le Bris N., Sarradin P.-M., Caprais J.-C., Gaill F., Chevaldonné P. 18th International Congress of 

Zoology, Athenes, Greece, 28 Aug - 02 Sep. Oral. Is the "Pompei worm" a true extremophile? 

2000 Gonzalez A., Guerra A., Rocha F., Briand P. Cephalopod International Advisory Council, Aberdeen, UK, Jul. Poster. 

Variabilité biométrique des mâles de Vulcanoctopus hydrothermalis 

2000 Hourdez S., Jollivet D. XIIth International Conference on Invertebrate Dioxygen Binding Proteins, Roscoff, France, 

Jul 23-28. Poster. Structure of Branchipolynoe symmytilida (Polychaeta; Polynoidae) hemoglobin 

2000 Hourdez S., Weber R.E., Lallier F.H., Toulmond A. XIIth International Conference on Invertebrate Dioxygen 

Binding Proteins, Roscoff, France, Jul 23-28. Oral. Gas transfer system in the hydrothermal vent polychaete Alvinella 

pompejana 

2000 Jollivet D., Comtet T., Hourdez S., Chevaldonné P. Aquatic Habitats as Ecologicval Islands, Plymouth, United 

Kingdom, Sep 5-7. Poster. Phylogeography of the hydrothermal vent association Bathymodiolus-Branchipolynoe using 

ITS2 sequences: occurence of an ancient pathway via the Panama seaway. 

2000 Lallier F.H. Invited Seminar, University of Miami, Feb 28. Oral. How to be the perfect host ? Sulfide and carbon 

dioxide transport in the hydrothermal vent tubeworm Riftia pachyptila. 

2000 Lallier F.H., Zal F. XIIth International Conference on Invertebrate Dioxygen Binding Proteins, Roscoff, France, Jul 

23-28. Poster. Multi-angular laser light scattering : an alternative to measure the mass of giant O2 binding proteins 

2000 Le Bris N., Sarradin P.M. RIDGE In situ sensors workshop, Aptos, USA, Poster. In situ analysis to characterize the 

chemical environment of hydrothermal vent fauna 

2000 Sarradin P.M., Riso R., Le Bris N., Caprais J.C., Fouquet Y., Radford-Knoery J., Zuddas P., Crassous P. 7th FECS 

Conference on Chemistry and the Environment, Metal Speciation in the Aquatic Environment, Oporto (Portugal), 27/08 au 

30/08/2000. Oral. Metal content in the environment surrounding hydrothermal vent comunities: preliminary approach and 

outlook 

2000 Shillito B., Sarradin P.-M., Zal F., Jollivet D., Lallier F., Desbruyères D., Gaill F. 9th Deep-Sea Biology Symposium, 

Galway Ireland, 26-30th June 2000. Oral. Investigations on temperature tolerance of hydrothermal vent organisms, using a 

video-equipped pressurizes incubator 

2000 Zal F. Séminaire invité, Université de Louvain-La-Neuve, Belgique, Mar 1. Oral. La vie en présence d'hydrogène 

sulfuré: l'exemple du ver géant des abysses Riftia pachyptila 

2000 Zal F., Bailly X., Gotoh T., Lallier F.H., Toulmond A., Childress J.J. XIIth International Conference on Invertebrate 

Dioxygen Binding Proteins, Roscoff, France, Jul 23-28. Oral. Free Cystein residues: active sites for “new” functions in 

worm hemoglobins, sulfide carrying and/or trapping 

2001 Andersen A.C., De Cian M.C., Bailly X., Lallier F.H. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent Biology, 

Brest, France, Oct 8-12. Oral. Hemoglobin synthesis in the symbiotic vestimentiferan tubeworm Riftia pachyptila 

2001 Andersen A.C., Jolivet S., Claudinot S., Lallier F.H. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent Biology, 

Brest, France, Oct 8-12. Poster. Biometry of the branchial plume of Riftia pachyptila 

2001 Bailly X., Jollivet D., Zal F. Society for Experimental Biology, Canterbury, UK, Oral, invited. Molecular evolution 

of the sulphide binding mechanisms in the multigenic hemoglobin of the tube-worm Riftia pachyptila. 

2001 Biscoito M., Segonzac M., Almeida A., Desbruyères D., Geistdoerfer P., Turnipseed M., Van Dover C.L. Second 

International Symposium on Deep-sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Fishes from the 

Hydrothermal Vents and Cold Seeps – An Update 

2001 Casse N., Pradier E., Demattei M.-V., Bigot Y., Laulier M. Second international symposium on deep sea 

hydrothermal vent biology, Brest, France, Oct 8-12. Oral. Mariner transposons are a genetic parasites occuring in the 

genome of hydrothermal invertebrates 

2001 Chausson F., Bridges C.R., Sarradin P.M., Lallier F.H. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent Biology, 

Brest, France, Oct 8-12. Oral. Ecophysiological approach of the respiratory adaptation of two hydrothermal vent crabs, 

Bythograea thermydron and Cyanagraea praedator 

2001 Chausson F., Lallier F.H., Sarradin P.M. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vents Biology, 

Brest, France, Oct 8-12. Poster. Adaptation to hypercapnia in hydrothermal vent crustaceans 

2001 Chevaldonné P., Jollivet D., Desbruyères D., Lutz R.A., Vrijenhoek R.C. Second International Symposium on Deep- 

Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Oral. Sibling species of eastern Pacific hydrothermal-vent worms 

(Ampharetidae, Alvinellidae, Vestimentifera) provide new mitochondrial COI clock calibration 

2001 Cossa D., Caprais J.C., Sarradin P.M., Briand P. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vents 

Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Concentrations in mercury in the hydrothermal fluids of East Pacific rise (13°N): 

First results 

2001 Cosson R.P., Bustamante P. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, 

France, Oct 8-12. Poster. Fluctuations of metals and metallothioneins with time (Nov97 – May99 – Dec99) in 

41



Bathymodiolus thermophilus at the same spot on the EPR (9°50'N) 

2001 Cosson R.P., Bustamante P., Sarradin P.M., Le Bris N., Fiala-Médioni A. Second International Symposium on Deep- 

Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Metals and metallothioneins in Bathymodiolus 

thermophilus from 9°50'N sites (BioVent – Mussel Bed – East Wall) 

2001 Cosson R.P., Chausson F., Bustamante P., Laulier M., Fiala-Médioni A. 2nd International Symposium on Deep-Sea 

Hydrothermal Vent Biology, Brest, Oct 8-12. Oral. First experimental induction of metallothioneins in Bathymodiolus 

azoricus and B. thermophilus at the atmospheric pressure 

2001 Cosson R.P., Shillito B., Laulier M., Bustamante P., Boulègue J. Second International Symposium on Deep-Sea 

Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. First experimental induction of metallothioneins by cadmium 

in Bathymodiolus thermophilus under controlled pressure using the IPOCAMP vessel 

2001 De Cian M.C., Andersen A.C., Lallier F.H. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent Biology, Brest, 

France, Oct 8-12. Oral. Carbonic anhydrase localization and expression in Riftia pachyptila 

2001 De Cian M.C., Andersen A.C., Toullec J.Y., Lallier F.H. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent 

Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. CO2 transport and intracellular pH in Riftia pachyptila isolated bacteriocytes 

2001 De Cian M.C., Andersen A.C., Toullec J.Y., Lallier F.H. Second International Conference of Comparative 

Physiology & Biochemistry in Africa : How Animals Work, Chobe National Park, Botswana, Aug 18-24. Poster. Carbonic 

anhydrase and carbon dioxide cellular transport in a symbiotic invertebrate, the hydrothermal vent tubeworm Riftia 

pachyptila 

2001 Denis F., Vachoux C., Gauvry L., Leignel V., Salin C., Hardivillier Y., Cosson R., Laulier M. Second international 

symposium on deep sea hydrothermal vent biology, Brest, France, Oct 8-12. Oral. Metallothionein in Bathymodiolus sp. : 

Complementary DNA characterization and quantification of expression 

2001 Hourdez S., Jollivet D., Lallier F.H. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 

8-12. Poster. A new morphotype of Riftia pachyptila at 13°N EPR 

2001 Jouin-Toulmond C. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. 

Anatomy of spermatozoids in the family Alvinellidae (Polychaeta) 

2001 Khripounoff A., Vangriesheim A., Crassous P., Segonzac M. Second international symposium on deep-sea 

hydrothermal vent biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Particulate material production from Atlantic and Pacific 

hydrothermal vents 

2001 Lallier F.H. Second International Conference of Comparative Physiology & Biochemistry in Africa : How Animals 

Work, Chobe National Park, Botswana, Aug 18-24. Oral, Invited. Oxygen, carbon dioxide and sulfide transport in the 

symbiotic tubeworm Riftia pachyptila 

2001 Le Bris N., Sarradin P.M., Caprais J.C. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vents Biology, 

Brest, France, Oct 8-12. Oral. Characteristic features of the chemical environment of Alvinella pompejana at Genesis/EPR 

13°N 

2001 Martinez A.-S., Toullec J.Y., Shillito B., Charmantier-Daures M., Charmantier G. Annual main meeting of the Society 

for Experimental Biology (SEB), Canterbury (UK), Apr. Poster. Morpho-functional adaptations of the crab Bythograea 

thermydron to the salinity of the hydrothermal environment 

2001 Martinez A.-S., Toullec J.Y., Shillito B., Charmantier-Daures M., Charmantier G. Annual main meeting of the Society 

for Integrative and Comparative Biology (SICB), Chicago (USA). Jan. Poster. Osmotic and ionic regulations in the 

hydrothermal vent crab Bythograea thermydron 

2001 Piccino P., Jollivet D., Viard F. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, 

France, Oct 8-12. Thermal adaptation of Alvinella pompejana (Polychaeta: Alvinellidae) in a highly fluctuating 

environment: a case study of phosphoglucomutase PGM-1 

2001 Rocha F., Gonzalez A., Segonzac M., Guerra A. Second international symposium on deep-sea hydrothermal vent 

biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Observations about behaviours of Vulcanctopus hydrothermalis 

2001 Sadosky F., Thiébaut E., Jollivet D., Shillito B., Bonhomme F., Labbe P. Second International Symposium on Deep- 

Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Population structure and recruitment of the hydrothermal 

vent limpet Lepetodrilus elevatus from the East Pacific Rise (13°N and 9°50N) 

2001 Sarradin P.M. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vents Biology, Brest, France, Oct 8-12. 

Oral. New approach to the study of biogeochemical interactions in hydrothermal vents 

2001 Shillito B. Second international symposium on deep-sea hydrothermal vent biology, Brest, France, Oct 8-12. Oral. 

Use of a video-equipped pressurized incubator for the study of hydrothermal vent organisms 

2001 Vagne A., Desbruyères D., Sarradin P.M., Bris N.L., Lecornu F. Second international symposium on deep-sea 

hydrothermal vent biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Mosaicking tool for hydrothermal vent community study 

2001 Zal F., Bailly X., Lallier F.H., Toulmond A., Childress J.J. 2nd International Symposium on Hydrothermal Vent 

Biology, Brest, France, Oct 8-12. Oral. Hemoglobin and sulfide : how does it work ? 

2001 Zal F., Bailly X., Lallier F.H., Toulmond A., Childress J.J. SEB Annual meeting, University of Kent, Canterbury, UK, 

2-6 Avril. Oral, Invité. The life in sulfidic environment 

2001 Zal F., Chausson F., Leize E., Van Dorsselaer A., Lallier F.H., Green B.N. American Society of Mass Spectrometry 

Symposium, Chicago, IL, USA, 27-31 Mai. Poster. Quadrupole time of flight mass spectrometry of the native hemocyanin 

of the deep-sea crab Bythograea thermydron 

2001 Zal F., Leize E., Chausson F., Van Dorsselaer A., Lallier F.H., Green B.N. 2nd International Symposium on 

Hydrothermal Vent Biology, Brest, France, Oct 8-12. Poster. Quaternary structure of hemocyanin from the crab 

Bythograea thermydron refined by mass spectrometry 

42



2002 Bailly X., Jollivet D., Toulmond A. Molecular Evolution: Evolution, Genomics, Bioinformatics, Sorrento, IT, Jun 13- 

16. Poster. Molecular evolution of the sulphide-binding function in the multigenic haemoglobin family of the tube-worm 

Riftia pachyptila: implications for annelid haemoglobin evolution 

2002 De Cian M.C., Bailly X., Morales J., Van Dorsselaer A., Lallier F.H. The power of comparative physiology: 

evolution, integration and application, San Diego, USA, Aug 24-28. Oral. Carbonic anhydrase in an autotrophic animal, the 

symbiotic tubeworm Riftia pachyptila 

2002 Sanglier S., Van Dorsselaer A., Zal F., Leize E. 50th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, 

Orlando, USA, 2-6 Juin. Poster. Comparative ESMS study of native hemocyanins from deep-sea and shore crabs with 

molecular weights up to 2 341 kDa 

2002 Sanglier S., Van Dorsselaer A., Zal F., Leize E. EuroConference on Fundamental Studies and Applications, Wilbad 

Kreuth, Allemagne, 21-26 Juillet. Poster. Comparative ESMS study of native hemocyanins from deep-sea and shore crabs 

with molecular weights up to 2 341 kDa 

2003 Bailly X., Zal F., Toulmond A., Jollivet D. 13th International Conference on Invertebrate Dioxygen Binding 

Proteins, Mainz, DE, Sep 7-12. Oral. Detection of positive Darwinian selection events from globin molecular evolution 

suggests the loss of hemoglobin sulfide binding function in annelids from sulfide-free environments 

2003 Cosson R.P., Bustamante P. IIIème Congrés International des Sociétés Européennes de Malacologie, La Rochelle, 

France, Jun. Poster. The bioaccumulation of trace metals in the hydrothermal vent clam Calyptogena magnifica from the 

East Pacific Rise (9°N). 

2003 De Cian M.C., Andersen A.C., Lallier F.H. 10th Deep-Sea Biology Symposium, Coos Bay, Oregon, USA, Aug 25-29. 

Poster. Carbonic anhydrase localization in the gills of two hydrothermal vents crustaceans, Bythograea thermydron and 

Rimicaris exoculata 

2003 Hourdez S., Jollivet D., Lallier F.H., Schaeffer S.W., Toulmond A., Fisher C.R. 13th International Conference on 

Invertebrate Dioxygen Binding Proteins, Mainz, DE, Sep 7-12. Oral. Evolution of hemoglobins in deep-sea hydrothermal 

vent polynoids 

2003 Lallier F.H., De Cian M.C., Andersen A.C. 4th International Symbiosis Symposium, Halifax, Nova Scotia, Canada, 

Aug 17-22. Oral, Invited. Specific adaptations of the hydrothermal vent tubeworm, Riftia pachyptila, to fuel its symbionts 

with inorganic carbon 

2004 Le Bris N., Thouron D., Pennec S., Comtat M., Garçon V. Xth transfrontier conference on Sensor and Biosensor, 

Tarragona. Spain, Sep 15-17. Oral. Sensors for in situ monitoring of bioactive compounds in oceanic environments 

7. COMMUNICATIONS NATIONALES 

1999 Birot D., Woerther P., Lanteri N., Leilde B., Menut E., Merceur R., Le Bris N., Sarradin P.M., Blain S. 4ème Congrès 

International Limnologie-Océanographie. Variabilités temporelles au sein des hydrosystèmes, Bordeaux, France, Poster. 

Un analyseur en flux pour des mesures chimiques in situ et à haute fréquence 

1999 Shillito B., Zal F., Sarradin P.-M., Mesnage M., Rugala J.P., Gail F. Journees des Sciences de le Vie, UPMC, Paris, 

France, Oral. I.P.O.C.A.M.P. : un aquarium pressurisé pour l'étude de la macrofaune hydrothermale profonde 

2000 Andersen A.C., Jolivet S., Claudinot S., Bailly X. Journées Dorsales 2000, Roscoff, FR, Sep 20-22. Poster. 

L'approvisionnement des symbiontes de Riftia: rôle de l'organe branchial 

2000 Bailly X., Jollivet D., Zal F. Journées DORSALES 2000, Roscoff, France, Sep 20-22. Poster. Evolution moléculaire 

de la famille multigénique des hémoglobines de Riftia pachyptila 

2000 Cossa D., Caprais J.C., Sarradin P.M., Briand P. Journées DORSALES 2000, Roscoff, Concentrations en mercure 

dans les fluides hydrothermaux de la Ride Est Pacifique (13°N) : Premiers résultats 

2000 de Buron I., Morand S., Segonzac M. Journées DORSALES 2000, Roscoff, 20-22 septembre 2000. Les 

acanthocéphales, vers parasites de poissons Zoarcidae : des modèles d'étude de la biologie des communautés 

hydrothermales ? 

2000 De Cian M.C., Bailly X., Andersen A.C., Shillito B., Lallier F.H. Journées Dorsales 2000, Roscoff F, Sep 20-22. 

Oral. Transport et conversion du dioxyde de carbone chez un invertébré symbiotique autotrophe, le vestimentifère Riftia 

pachyptila 

2000 Gonzalez A., Guerra A., Rocha F., Briand P. Journées Dorsales 2000, Roscoff, France, Sep 20-22. Poster. 

Variabilité biométrique des mâles de Vulcanoctopus hydrothermalis 

2000 Hourdez S., Jollivet D. Journées DORSALES 2000, Roscoff, France, Sep 20-22. Poster. Structure des hémoglobines 

de Branchipolynoe symmytilida (Polychète; Polynoidé) 

2000 Hourdez S., Weber R.E., Lallier F.H., Toulmond A. Journées DORSALES 2000, Roscoff, France, Sep 20-22. Poster. 

Système de transfert gazeux chez le Polychète des sources hydrothermales Alvinella pompejana 

2000 Khripounoff A., Crassous P., Vangriesheim A., Segonzac M. Journées DORSALES 2000, Roscoff, 20-22 septembre 

2000. Flux particulaire hydrothermal sur les rides océaniques de l'Atlantique et du Pacifique 

2000 Le Bris N., Sarradin P.M., Caprais J.C. Journées DORSALES 2000, Roscoff, France, Oral. Teneurs et disponibilité 

des sulfures, de l'oxygène et du carbone inorganique dans les habitats des organismes hydrothermaux (HOPE99, 

Genesis/13°N/EPR) 

2000 Martinez A.-S., Toullec J.Y., Shillito B., Charmantier-Daures M., Charmantier G. Journées Dorsales, Roscoff, 

France, Sep. Oral. Osmotic and ionic regulations in the hydrothermal vent crab Bythograea thermydron 

2000 Ondréas H., Fouquet Y., Lallier F., Andersen A.C., HOPE E. Rassemblement des Sciences de la Terre, Paris (FR), 

Apr. Poster. Hydrothermalisme hors-axe: cadre géologique et métallogénie des sites de l'EPR à 13°N 

2000 Sarradin P.M., Riso R., Le Bris N., Caprais J.C., Fouquet Y., Radford Knoery J., Zuddas P. Journées DORSALES 

43



2000, Roscoff, Environnement métallique des communautés hydrothermales : approche préliminaire et perspectives 

2000 Shillito B., Jollivet D., Sarradin P.-M., Rodier P., Desbruyères D., Lallier F.H., Gaill F. Journees des Sciences de le 

Vie, UPMC, Paris, France, Poster. Etude de la thermotolérance d'Hesiolyra bergi, un organisme vivant sur les parois des 

cheminées hydrothermales 

2000 Thiébaut E., Shillito B., Ravaux J., Zbinden M., Durif C., Huther X., Laurent C., Francoual M., Sarradin P.M., 

Caprais J.C., Gaill F. Journées DORSALES 2000, Roscoff, Dynamique de populations de Vestimentifères hydrothermaux 

des sites 9 et 13°N : utilisation des tubes comme marqueur de taille, de croissance et d'environnement 

2000 Toullec J.Y., Soyez D., Vinh J., Le Caer J.-P., Shillito B. Journées Dorsales, Roscoff, France, Sep. Poster. 

Caractérisation du complexe neuroendocrine du crabe Bythograea thermydron 

2000 Zal F., Bouchereau A., Galichet F., Shillito B., Sarradin P.-M., Bris N.L., Caprais J.-C., Lallier F.H. Journées 

DORSALES 2000, Roscoff, France, Sep 20-22. Poster. Évolution du système IPOCAMP : Contrôle des paramètres 

chimiques de l'enceinte (O 2 , CO 2 , CH 4 , H 2 S, NO 2 et NO 3 ) pour une expérimentation in situ simulée 

2001 Casse N., Pradier E., Demattei M.-V., Bigot Y., Laulier M. 10ème colloque “ éléments transposables ”. Lyon, Jul 4- 

6. Poster. Mise en évidence et caractérisation d’un transposon de la famille Mariner chez les invertébrés marins des 

dorsales océaniques 

2001 Le Bris N., Sarradin P.M., Vuillemin R. Vème Rencontre transfrontalière capteurs/biocapteurs, Toulouse, France, 

Sep 20-21. Oral. In situ chemical analysis to characterise the environment of deep-sea hydrothermal vent fauna 

2001 Zal F., Chausson F., Leize E., Van Dorsselaer A., Lallier F.H., Green B.N. Société Française de Spectrométrie de 

Masse, La Rochelle, 11-31 Septembre. Oral, Invité. Electrospray Quadropule Time of Flight mass spectrometry of a native 

hemocyanin from the deep-sea crab Bythograea thermydron with a molecular weight of 1.3 MDa 

2002 Bailly X., Jollivet D. Petit Pois Déridé, XXIVème réunion annuelle du Groupe de Génétique et Biologie des 

Populations, Aug 27-30. Oral. Evolution moléculaire de la fonction de fixation de l'hydrogène sulfuré au sein de la famille 

multigénique des hémoglobines de Riftia pachyptila, ver des sources hydrothermales profondes: implications sur l'origine 

des annélides 

2002 Piccino P., Jollivet D., Viard F. XXIV Petit Pois Déridé, Montpellier, France, Aug 27-30. Poster. Adaptation 

moléculaire du polychète Alvinella pompejana aux importantes fluctuations thermiques de l'environnement hydrothermal 

profond: étude des variants alléliques de la phosphoglucomutase PGM-1 

2002 Zal F. Rencontres Biologie-Physique du Grand Ouest, Rennes, France, 4-5 Juillet. Analyse de l'hémocyanine du 

crabe hydrothermal Bythograea thermydron par electrospray de type Q-Tof 

2003 Casse N., Demattei M.-V., Pradier E., Leignel V., Bigot Y., Laulier M. 11ème colloque “ Éléments Transposables ”, 

Montpellier, Jul 7-9. Poster. Étude phylogénétique des éléments Mariner : cas du milieu marin 

2003 Toumi N., Casse N., Renault S. 11ème colloque “ Éléments Transposables ”, Montpellier, France, Caractérisation de 

l’élément Mariner chez les organismes des sources hydrothermales océaniques 

2004 Casse N., Bui Q.T., Uguen G., Demattei M.-V., Pradier E., Leignel V., Bigot Y., Laulier M. 12ème colloque “ 

Éléments Transposables ”, Tours, France, Jul 5-7. Oral. Occurrence of Mariner transposons in invertebrates living in deepsea 

hydrothermal and coastal environments 

2004 Faure B., Piccino P., Jollivet D. XXVI Petit Pois Déridé, Paris, France, Aug 25-28. Poster. Etude de l'efficacité 

reproductrice du polychète hydrothermal Alvinella pompejana en fonction du génotype 

2004 Lallier F.H. Récents progrès en écophysiologie: respiration et osmorégulation, Institut Océanographique, Paris, Dec 

7. Oral, Invited. Oxygène et sulfure d'hydrogène: deux frères ennemis ? 

2004 Uguen G., Hardivillier Y., Casse N., Leignel V., Laulier M. 12ème colloque “ Éléments Transposables ”, Tours, Jul 

5-7. Oral. Conception d’une base de données sur les éléments transposables de type Mariner-like elements (MLEs 

database) et réalisation d’analyses bioinformatiques 

10. BREVETS 

2003 Laulier M., Bigot Y., Casse N. Utilisation de transposons et éléments dérivés d’eucaryotes hydrothermaux. 

14. DEA 

2001 Lannuzel D. Etude de la distribution dissous/particulaire des métaux dans la zone de mélange fluide hydrothermal/eau 

de mer. DEA Chimie Marine. Ifremer DRO EP, Univ. Bretagne Occidentale. p. 

2001 Sadosky F. Structure de populations et recrutement de l’archéogastéropode Lepetodrilus elevatus des sites 

hydrothermaux de la dorsale Est-Pacifique (13°N et 9°50’ N). Océanologie Biologique et Environnement Marin. DEA, 

Univ. Pierre et Marie Curie. p. 

2001 Vagne A. Etude des interactions entre organismes et environnement chimique en milieu hydrothermal profond : 

application au site GENESIS (EPR 13°N). DEA Chimie Marine. Ifremer DRO EP, Univ. Bretagne Occidentale. p. 

2002 Ménard L. Les crustacés hydrothermaux: des adaptations originales à l'hypercapnie ? Biologie Intégrée des 

Invertébrés. DEA, Univ. Pierre et Marie Curie. 20 p. (Supervisé par F. H. Lallier) 

2002 Sadosky F. Variabilité morphotypique et recrutement de Lepetodrilus elevatus (Vétigastéropode) sur les sites 

hydrothermaux de la Dorsale Est-Pacifique (13°N et 9°50’N). DES. Sciences Naturelles, Univ. Pierre et Marie Curie. p. 

2003 Barrau A. Caractérisation et purification des anhydrases carboniques de crustacés. Biotechnologies. DESS, Université 

de Limoges. p. (Supervisé par A. C. Andersen and F. H. Lallier) 

Toumi, N. DEA Univ Tours c/o Laulier (Le Mans) 

Uguen, G. DEA Univ Rennes c/o Laulier (Le Mans) 

44



15. THESES 

2000 Hourdez S. Adaptations respiratoires des Annélides Polychètes de milieux abyssaux hypoxiques. Doctorat, 

Océanologie Biologique. Thèse, Univ. Pierre et Marie Curie (Paris 6). 197 p. (Supervisé par A. Toulmond and F. H. 

Lallier) 

2001 C. Arndt. Metabolic reactions and interactions in hydrothermal vent animals. Doctorat, Marine Biology and Biochemistry. 

University of Dantzig, Dantzig (Allemagne). p. (Supervisé par H. Felbeck and F. Gaill) 

2001 Chausson F. Adaptation au milieu hydrothermal profond: étude comparative de l'écophysiologie respiratoire des 

Crustacés Décapodes des Dorsales Pacifique et Atlantique. Doctorat, Biologie Intégrée des Invertébrés. Thèse, Univ. 

Pierre et Marie Curie (Paris 6). 184 p. (Supervisé par F. H. Lallier and F. Zal) 

2001 L. Chamoy. Caractérisation de protéines du tube d'un vestimentifère des sources hydrothermales profondes: Riftia pachyptila. 

Doctorat, Biochimie, Biologie Cellulaire et Moléculaire. Université de Bourgogne, Dijon. 143 p. (Supervisé par J. Delachambre 

and F. Gail) 

2001 M. Zbinden. Données sur les interactions biogéochimiques en milieu hydrothermal : l'exemple d'Alvinella pompejana. 

Doctorat, Adaptations et survie en environnements extrêmes. Université Aix-Marseille II,, Aix-Marseille. 130 p. (Supervisé par 

F. Gail) 

2001 Martinez A.-S. Adaptations morpho-fonctionnelles des crustacés caridés et brachyoures à la salinité du milieu 

hydrothermal profond. Doctorat. Thèse, Université Montpellier II. p. 

2002 De Cian M.-C. Transport du CO2 et échanges ioniques chez un animal autotrophe, le vestimentifère Riftia pachyptila. 

Etude de l'anhydrase carbonique et des transporteurs impliqués. Doctorat, Biologie Intégrée des Invertébrés. Thèse, Univ. 

Pierre et Marie Curie. 239 p. (Supervisé par F. H. Lallier and A. C. Andersen) 

2002 F. Pradillon. Données sur les processus de reproduction et de développement précoce d'un eucaryote thermophile, Alvinella 

pompejana. Doctorat, Physiologie des Invertébrés. Université Pierre et Marie Curie, Paris. 163 p. (Supervisé par F. Gail) 

2003 Bailly X. Evolution moléculaire de la fonction de liaison du sulfure d'hydrogène par les hémoglobines de Riftia 

pachyptila. Doctorat, Diversité du Vivant. Thèse, EPHE et Univ. Pierre et Marie Curie. p. (Supervisé par A. Toulmond, 

D. Jollivet and F. Zal) 

2005 Hardivillier, Y. Caractérisation et expression des gènes de métallothionéines chez deux modioles hydrothermales : 

Bathymodiolus thermophilus et Bathymodiolus azoricus. Doctorat Biophysiologie des Organismes et des Populations. 

Thèse, Université du Maine, Le Mans (Supervisé par M. Laulier) 

17. DONNEES SISMER 

Données bathymétriques 

http://www.ifremer.fr/sismer/ 

18. AUTRES BANQUES DE DONNEES 

Données taxinomiques biogeographiques 

BIOCEAN : http://www.ifremer.fr/isi/biocean/ 

Ocean Biogeographic Information System :(OBIS) : http://www.iobis.org/ 

20. EXPLOITATION 

TERMINEE 

45



DEEP-SEA HYDROTHERMAL VENTS:A NATURAL POLLUTION LABORATORY, (EVK3 CT1999-00003) 

ATOS cruise 

Nom de la campagne : ATOS 

Programme : VENTOX (EVK3-CT1999-00003) 

Navire : NO Atalante 

Engins lourds : Victor 

Dates de la campagne : Juin, juillet 2001 

Zone : Atlantique , Açores 

Chef de projet : D. Desbruyères 

Organisme : Ifremer 

Chef de mission 1 : P.M. Sarradin 

Organisme : Ifremer 

Chef de mission 2 : Organisme : 

Fiche remplie par : P.M. Sarradin Date de rédaction de la fiche : janvier 2004, révision 01/09 

Adresse : Ifremer DRO EP, BP 70 F-29280 PLOUZANE 

Email : Pierre.Marie.Sarradin@ifremer.fr Tel : 02 98 22 46 72 Fax : 


Etude des adaptations et processus spécialisés développés par les organismes hydrothermaux et leurs communautés 

microbiennes associées en réponse à un environnement « toxique ». 

Nombre 

1 Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées SCI 53 




5 Publications de résumés de colloques 2 


41 


dont posters 


12 


dont posters 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 


10 Brevets 


12 Documents vidéo-films 1 

13 Publications électroniques sur le réseau Internet 

14 DEA ayant utilisé les données de la campagne 2 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne 

16 Validation des données terminée : .... 

17 Transmission au SISMER Oui : .... 

18 Transmission à d’autres banques de données Biocean Oui : .... 

19 Transmission à d’autres équipes Oui : .... 

20 Considérez-vous l’exploitation en cours : .... X 

Rubrique 1: Refereed papers published 

Anderson, L., Lechaire, J.P., Boudier, T., Halary, S., Frébourg, G., Zbinden, M., Marco, S., Gaill, F., 2008. 

Tomography of bacteria-mineral associations within the deep sea hydrothermal vent shrimp Rimicaris 

exoculata. C.R. Chimie 11 (3), 268-280. 

Bebianno, M.J., Company, R., Serafim, A., Camus, L., Cosson, R.P., Fiala-Medoni, A., 2005. Antioxidant 

systems and lipid peroxidation in Bathymodiolus azoricus from Mid-Atlantic Ridge hydrothermal vent fields. 

Aquatic Toxicology 75 (4), 354-373. 

Biscoito, Manuel, Michel Segonzac, Armando J. Almeida, Daniel Desbruyères, Patrick Geistdoerfer, Mary 

Turnipseed & Cindy Van Dover. 2002. Fishes from the hydrothermal vents and cold seeps – An update. 

Cahiers de Biologie Marine (2002) 43: 359-362. 

Casse, N., E. Pradier, M.-V. Demattei, Y. Bigot, and M. Laulier, 2002. Mariner transposons are widespread 

genetic parasites in the genome of hydrothermal invertebrates. Cahiers de Biologie Marine 43: 325-328. 

Chausson, F., Sanglier, S., Leize, E., Hagege, A., Bridges, C.R., Sarradin, P.M., Shillito, B., Lallier, F.H., Zal, F., 

2004a. Respiratory adaptations to the deep-sea hydrothermal vent environment: the case of Segonzacia 

mesatlantica, a crab from the Mid-Atlantic Ridge. Micron 35 (1-2), 31-41. 

Chausson, F., Sanglier, S., Leize, E., Hagège, A., Bridges, C.R., Sarradin, P.M., shillito, B., Lallier, F.H., Zal, F., 

2004b. Respiratory adaptations of a deep-sea hydrothermal vent crab. Micron 35, 27-29. 

Colaço, A., F. Dehairs and D. Desbruyères. (2002). Nutritional relations of deep-sea hydrothermal fields at the 

Mid-Atlantic Ridge: a stable isotope approach. Deep-Sea Research I, 49, 395-412. 

46



Colaço, A., F. Dehairs, D. Desbruyères, N. Le Bris and P.M. Sarradin. (2002). d13C signature of hydrothermal 

mussels is related with the end-member fluid concentrations of H2S and CH4 at the Mid-Atlantic Ridge 

hydrothermal vent fields. Cahiers de Biologie Marine, 43(3-4), 259-262. 

Colaço, A., Bustamante, P., Fouquet, Y., Sarradin, P.M., Serrao-Santos, R., 2006. Bioaccumulation of Hg, Cu, 

and Zn in the Azores triple junction hydrothermal vent fields food web. Chemosphere 65 (11), 2260-2267. 

Company, R., Serafim, A., Bebianno, M.J., Cosson, R., Shillito, B., Fiala-Medioni, A., 2004. Effect of cadmium, 

copper and mercury on antioxidant enzyme activities and lipid peroxidation in the gills of the hydrothermal 

vent mussel Bathymodiolus azoricus. Marine Environmental Research 58 (2-5), 377-381. 

Company, R., Serafim, A., Cosson, R., Fiala-Medioni, A., Dixon, D., Joao Bebianno, M., 2006a. Temporal 

variation in the antioxidant defence system and lipid peroxidation in the gills and mantle of hydrothermal vent 

mussel Bathymodiolus azoricus. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers 53 (7), 1101- 

1116. 

Company, R., Serafim, A., Cosson, R.P., Camus, L., Shillito, B., Fiala-Medioni, A., Bebianno, M.J., 2006b. The 

effect of cadmium on antioxidant responses and the susceptibility to oxidative stress in the hydrothermal vent 

mussel Bathymodiolus azoricus. Marine Biology 148 (4), 817-825. 

Company, R., Serafim, A., Cosson, R., Fiala-Medioni, A., Dixon, D.R., Bebianno, M.J., 2007. Adaptation of the 

antioxidant defence system in hydrothermal-vent mussels (Bathymodiolus azoricus) transplanted between 

two Mid-Atlantic Ridge sites. Marine Ecology 28 (1), 93-99. 

Company, R., Serafim, A., Cosson, R.P., Fiala-Médioni, A., Camus, L., Colaço, A., Serrão-Santos, R., Bebianno, 

M.J., 2008. Antioxidant biochemical responses to long-term copper exposure in Bathymodiolus azoricus from 

Menez-Gwen hydrothermal vent. Science of the Total Environment 389 (2-3), 407-417. 

Compère P., Martinez A.S., Charmentier-Daures M., Toullec J.-Y., Goffinet G. et Gaill F. 2002 Does sulfide 

detoxication occur in the gills of the hydrothermal vent shrimp, Rimicaris exoculata? C. R. Biologies, 325, 

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Cosson, R.P., Thiebaut, E., Company, R., Castrec-Rouelle, M., o, A.C., Martins, I., Sarradin, P.-M., Bebianno, 

M.J., 2008. Spatial variation of metal bioaccumulation in the hydrothermal vent mussel Bathymodiolus 

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Dixon, D.R., Dixon, L.R.J., Pascoe, P.L. & Wilson, J.T. (2001). Chromosomal and nuclear characteristics of 

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Dixon, D.R., Dixon, L.R.J., Shillito, B. and Gwynn, J.P. 2002. Background and induced levels of DNA damage in 

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Dixon, D.R., Pruski, A.M., Dixon, L.R.J. ad Jha, A.N. 2002. Marine invertebrate eco-genotoxicology: a 

methodological overview. Mutagenesis, 17, 495-507. 

Duperron, S., Bergin, C., Zielinski, F., Blazejak, A., Pernthaler, A., McKiness, Z.P., DeChaine, E., Cavanaugh, 

C.M., Dubilier, N., 2006. A dual symbiosis shared by two mussel species, Bathymodiolus azoricus and 

Bathymodiolus puteoserpentis (Bivalvia: Mytilidae), from hydrothermal vents along the northern Mid-Atlantic 

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Faure, B., Bierne, N., Tanguy, A., Bonhomme, F., Jollivet, D., 2007. Evidence for a slightly deleterious effect of 

intron polymorphisms at the EF1[alpha] gene in the deep-sea hydrothermal vent bivalve Bathymodiolus. 

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Geret F., Riso R., Sarradin P.M., Caprais J.C. and Cosson R.P., 2002. Metal bioaccumulation and storage forms 

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approach to the fluid-organism relationship. Cahiers de Biologie Marine. 43, pp 43-52. 

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947-957. 

Hardivillier, Y., Denis, F., Demattei, M.-V., Bustamante, P., Laulier, M., Cosson, R., 2006. Metal influence on 

metallothionein synthesis in the hydrothermal vent mussel Bathymodiolus thermophilus. Comparative 

Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology 143 (3), 321-332. 

Hardivillier, Y., Leignel, V., Denis, F., Uguen, G., Cosson, R., Laulier, M., 2004. Do organisms living around 

hydrothermal vent sites contain specific metallothioneins? The case of the genus Bathymodiolus (Bivalvia, 

Mytilidae). Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology 139 (1-3), 111- 

118. 

47



Hourdez, S. and Desbruyères, D. (2003). A new species of scale-worm (Polychaeta: Polynoidae), 

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Biologie Marine 44, 13-21. 

Komai, T., Segonzac, M., 2005. A revision of the genus Alvinocaris Williams and Chace Crustacea: Decapoda: 

Caridea: Alvinocarididae, with descriptions of a new genus and a new species of Alvinocaris. Journal of 

Natural History 39, 1111-1175. 

Le Bris N., P. M. Sarradin, D. Birot and A. M. Alayse-Danet (2000) A new chemical analyzer for in situ 

measurement of nitrate and total sulfide over hydrothermal vent biological communities. Marine Chemistry, 

72, 1-15. 

Le Bris N., P. M. Sarradin and S. Pennec (2001) A new deep-sea probe for in situ pH measurement in the 

environment of hydrothermal vent biological communities. Deep-Sea Research I, 48, 1941-1951 

Lopez-Garcia, Phillipe H., Gaill F., Moreira D., 2003, Autochtonous eukayotic diversity in hydrothermal sediment 

and experimental microcolonizers at the Mid Atlantic Ridge, Proceedings of National Academy of Sciences, 

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Plouviez, S., Daguin-Thiebaut, C., Hourdez, S., Jollivet, D., 2008. Juvenile and adult scale worms 

Barnchipolynoe seepensis in Lucky Strike hydrothermal vent mussels are genetically unrelated. Aquatic 

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Postec A, Breton CL, Fardeau ML, Lesongeur F, Pignet P, Querellou J, Ollivier B, Godfroy A (2005) Marinitoga 

hydrogenitolerans sp. nov., a novel member of the order Thermotogales isolated from a black smoker 

chimney on the Mid-Atlantic Ridge. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 

55:1217-1221 

Postec A, Urios L, Lesongeur F, Ollivier B, Querellou J, Godfroy A (2005) Continuous Enrichment Culture and 

Molecular Monitoring to Investigate the Microbial Diversity of Thermophiles Inhabiting Deep-Sea 

Hydrothermal Ecosystems. Current Microbiology 50:138-144 

Postec, A., Lesongeur, F., Pignet, P., Ollivier, B., Querellou, J., Godfroy, A., 2007. Continuous enrichment 

cultures: insights into prokaryotic diversity and metabolic interactions in deep-sea vent chimneys. 

Extremophiles 11 (6), 747-757. 

Pruski, A.M. and D.R. Dixon (2002). Effects of cadmium on nuclear integrity and DNA repair efficiency in the gill 

cells of Mytilus edulis L. Aquatic Toxicology, 52, 127-137. 

Ravaux, J., Toullec, J.-Y., Leger, N., Lopez, P., Gaill, F., Shillito, B. (2007) "First hsp70 from two hydrothermal 

vent shrimps, Mirocaris fortunata and Rimicaris exoculata : characterization and sequence analysis" Gene, 

386, 162-172. 

Ravaux, J., Toullec, J.Y., Leger, N., Lopez, P., Gaill, F., Shillito, B., 2007. First hsp70 from two hydrothermal 

vent shrimps, Mirocaris fortunata and Rimicaris exoculata: characterization and sequence analysis. Gene 

386 (1-2), 162-172. 

Sanglier, S., Leize, E. Van Dorsselaer, A. and Zal, F. 2003. Comparative ESI-MS study of ~2.2MDa native 

hemocyanins from deep-sea and shore crabs: from protein oligomeric state to biotope. Journal of the 

American Society of Mass Spectrometry, 14: 419-429. 

Sarradin, P.-M., Le Bris, N., Le Gall, C., Rodier, P., 2005. Fe analysis by the ferrozine method: Adaptation to FIA 

towards in situ analysis in hydrothermal environment. Talanta 66, 1131-1138. 

Schmidt, C., Vuillemin, R., Le Gall, C., Gaill, F., Le Bris, N., 2008. Geochemical energy sources for microbial 

primary production in the environment of hydrothermal vent shrimps. Marine Chemistry 108 (1-2), 18-31. 

Shillito, B., Jollivet, D., Sarradin, P.-M., Rodier, P., Lallier F.H., Desbruyères, D. & Gaill, F. 2001. Temperature 

Resistance of Hesiolyra bergi, A Polychaetous Annelid Living on Deep-Sea Vent Smoker Walls. Marine 

Ecology Progress Series, 216, 141-149. 

Shillito, B., Le Bris, N., Hourdez, S., Ravaux, J., Cottin, D., Caprais, J.-C., Jollivet, D., Gaill, F., 2006. 

Temperature resistance studies on the deep-sea vent shrimp Mirocaris fortunata. Journal of Experimental 

Biology 209 (5), 945-955. 

Shillito, B., Le Bris, N., Hourdez, S., Ravaux, J., Cottin, D., Caprais, J.-C., Jollivet, D., Gaill, F. (2006) 

"Temperature Resistance Studies on the Deep-Sea Vent Shrimp Mirocaris fortunata" Journal of 

Experimental Biology, 209, 945-955. 

Stöhr, S., Segonzac, M., 2005. Deep-sea ophiuroids (Echinodermata) from reducing and non-reducing 

environments in the North Atlantic Ocean. Journal of the Marine Biological Association of the United 

Kingdom 85, 383-402. 

Tanguy, A., Bierne, N., Saavedra, C., Pina, B., Bachere, E., Kube, M., Bazin, E., Bonhomme, F., Boudry, P., 

Boulo, V., Boutet, I., Cancela, L., Dossat, C., Favrel, P., Huvet, A., Jarque, S., Jollivet, D., Klages, S., 

Lapegue, S., Leite, R., Moal, J., Moraga, D., Reinhardt, R., Samain, J.F., Zouros, E., Canario, A., 2008. 

Increasing genomic information in bivalves through new EST collections in four species: Development of 

new genetic markers for environmental studies and genome evolution. Gene 408 (1-2), 27-36. 

Wilson, J.T., D.R. Dixon & L.R.J. Dixon (2002). Numerical chromosomal aberrations in the early life-history 

stages of the marine tubeworm, Pomatoceros lamarckii (Polychaeta: Serpulidae). Aquatic Toxicology, 59, 

163-175. 

48



Zbinden M., Martinez I., Guyot F., Cambon-Bonavita M.A. and Gaill F. (2001). Zinc-iron sulphide mineralization 

in tubes of hydrothermal vent worms. Eur. J. Mineral., 13 : 653-658. 

Zbinden, M., Le Bris, N., Gaill, F., Compère, P., 2004. Distribution of bacteria and associated minerals in the gill 

chamber of the vent shrimp Rimicaris exoculata and related biogeochemical processes. Marine Ecology - 

Progress Series 284, 237-251. 

Zbinden, M., Shillito, B., Le Bris, N., de Villardi de Montlaur, C., Roussel, E., Guyot, F., Gaill, F., Cambon- 

Bonavita, M.-A., 2008. New insigths on the metabolic diversity among the epibiotic microbial communitiy of 

the hydrothermal shrimp Rimicaris exoculata. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 359 (2), 

131-140. 

Rubrique 2 : Non- refereed papers 

Biscoito, M., Segonzac, M. & Almeida, A. J. . New zoarcid fish species from deep-sea hydrothermal vents of 

Atlantic and Pacific Oceans. InterRidge News, 10 (1): 2001, 15-17. 

Dixon, D.R., J.T. Wilson, L.R.J. Dixon. Toxic vents and DNA damage. InterRidge News Vol. 9(1), 2000, 13-14. 

Dixon, D.R., P.M. Sarrdin, L.R.J. Dixon, A. Khripounoff, A. Colaço and R. Serrao Santos (2002). Towards 

unravelling the enigma of vent mussel reproduction on the Mid-Atlantic Ridge, or when ATOS met Cages!. 

InterRidge News, 11, 14-17. 

Dixon, D.R., Dando, P.R., Santos, R.S. and Gwynn, J.P. (2001). Retrievable cages open up new era in deep-sea 

vent research. InterRidge News, 10, 21-23. 

Sarradin, P. M., Desbruyères, D., Dixon, D., Almeida, A. J., Briand, P., Caprais, J. C., Colaço, A., Company, R., 

Cosson, R., Cueff, V., Dando, P., Etoubleau, J., Fabri, M. C., Fiala Medioni, A., Gaill, F., Godfroy, A., Gwynn, J., 

Hourdez, S., Jollivet, D., Khripounoff, A., Lallier, F., Laulier, M., Le Bris, N., Martins, I., Mestre, N., Pruski, A., 

Rodier, P., Serrão Santos, R., Shillito, B., Zal, F., & Zbinden, M. - ATOS cruise, R/V L'Atalante, ROV Victor, 

June 22nd - July 21st 2001. InterRidge News, 10 (2): 2001, 18-20. 

Sarradin, P.M. (2001) Campagne ATOS. Lettre aux Médias, 65, 6. 

Sarradin, P.M. et les participants à la campagne (2001) Campagne ATOS (N.O. L'Atalante et Victor 6000, 22 juin- 

21 juillet). La lettre Dorsales, n°8/12, 14-16. 

RUBRIQUE 4 : Press and Media 

LabHorta : Diário de Notícias. Friday, 25 August 2000, p. 20 (report in a national newspaper) (Copy sent to Brussel 

August 2000). 

Açoriano Oriental. 13565, 25 August 2000, p. 3 (report in a regional newspaper) (Copy sent to Brussels August 

2000). 

Plymouth Evening Herald – June 20, 2001.Secrets of the deep explored. (Copy included with this report) 

BBC Radio 4 June 14 2001 – The Leading Edge. Interview with David Dixon on VENTOX. 

Saber Açores, No. 21, August 2001 p10-11. Oasis de vida no mar junto aos Açores. (Copy included with this 

report) 

Saber Açores, No. 21, August 2001 p12-15. Estranhas formas de vida. (Copy included with this report) 

Visao, No. 442, 30 Agosto a 5 Setembro 2001 p. 86-91. Estranhas formas de vida. (Copy included with this report) 

RTP Açores. Telejornal 22/7/2001 Entitled “Atalante na Horta” 

RTP-Açores Telejornal 27/6/2001 Entitled “Missão VENTOX” 

Açoriano Oriental, nº 13953 20 of June 2001. Universidade defende criação de um laboratório subaquático. page: 

1 (news on a regional newspaper) 

Açoriano Oriental, nº 13953 20 of June 2001. Projecto VENTOX cria bases para laboratório subaquático. Page 5 

(news on a regional newspaper) 

Infociências (Folha informativa da Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa), {Almeida, A} 96, pp.15-16 

(copy included with 2 nd Annual Report). 

National Geographic Portugal, February 2003. Campos Hidrotermain. Golpe de Sorte. (Text Gonçalo Pereira), 6 

pages (Report on VENTOX project) (copy included with Final Report). 

Sciences Ouest, 2001, n°181, 8.. Campagne Océanographique ATOS : les secrets de la vie à 2000m de 

profondeur. 

Le Télégramme, 15 juin 2001, n°17412. Milieux extrêmes : l'Ifremer en campagne.. 

Ouest France, 15 juin 2001. La vie dans les milieux extrêmes de l'Atlantique Nord : Ifremer cherche en eau 

profonde.. 

RUBRIQUE 5 : Conference proceedings 

Biscoito, M. J., Almeida, A. J. & Santos, R. S. 2002 – The Ichthyology of the MAR Hydrothermal vents and the 

MOMAR Initiative. P. 26 in R. S. Santos, J. Escartin, A. Colaço & A. Adamczewska (Eds). Towards planning of 

sea-floor observatory programs for the MAR region. (Proceedings of the II MOMAR Workshop). Arquipélago, 

Suplem. 3: XII+64pp. 

Sarradin, P.M., K. Olu-Le Roy, H. Ondréas, M. Sibuet, M. Klages, Y. Fouquet, B. Savoye, J.F. Drogou and J.L. 

Michel. (2002). Evaluation of the first year of scientific use of the french ROV Victor 6000. Underwater 

Technology 2002, Tokyo, Japan (extended abstract 

49



RUBRIQUE 6 : Conferences Internationales 

B-Deos meeting in Cardiff (25-27 July 2001) LABHORTA- a land base laboratory for vent studies Colaço, A.; 

Serrão Santos, R.; and the VENTOX partners – Poster. 

Biscoito, M., A. J. Almeida, D. Desbruyères & A. Colaço, 2002. Ambientes hidrotermais profundos. O caso do 

Ponto Triplo dos Açores. Plenary talk at the “7º Encontro Nacional de Ecologia”, Ponta Delgada, Açores, 14-16 

November, 2002. 

Biscoito, M., Segonzac, M., Almeida, A.J., Desbruyères, D., Geistdoerfer, P, Turnipseed, M. and Van Dover, C. 

Fishes from the hydrothermal vents and cold seeps – an update. 2 nd International Symposium on Deep sea 

Hydrothermal vent Biology (Brest, 8- 12/10/2001). 

Casse N., Pradier E., Demattéi M-V., Bigot Y. and M. Laulier. Mariner transposons are genetic parasite occuring in 

the genome of hydrotermal invertebrates. Second International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal vent 

biology, Brest 8-12 October 2001. 

Charmasson, S., M. Agarande, A. M. Neiva Marques, P. M. Sarradin and D. Desbruyères (2003). Natural 

radioactivity (U-Th) in biota from hydrothermal vents: first results. 5th Applied isotope Geochemistry conference, 

Heron Island, Australia. Poster. 

Chausson F., A. Colaço, F. Dehairs, D. Desbruyères, F. Lallier, P.M. Sarradin, (2000). Some biological aspects of 

Segonzacia mesatlantica, an hydrothermal vent crab from the Mid Atlantic Ridge. Colloque Galway & Journées 

Dorsales, Roscoff. 

Chausson F., Menard L., Lallier F.H. (2003) Acid-base responses to hypercapnia in hydrothermal vent 

crustaceans. 10th Deep-Sea biology symposium, Coos Bay, Oregon, Aug 25-30 2003. Poster. 

Colaço, A.; Santos, R.; VENTOX party. -LABHORTA- a land base laboratory for vent studies- II MOMAR workshop- 

Towards planning of seafloor observatory programs for the MAR region. Horta, 15 -17 June 2002 – Poster. 

Company, R., Serafim, A. & Bebianno, M.J., 2002. Antioxidant defence mechanisms in hydrothermal vent mussels 

Bathymodiolus azoricus from Mid-Atlantic Ridge. MOMAR Workshop. Azores. Portugal. 15-17 June 2002- 

Poster. 

Company, R., Serafim, A. & Bebianno, M.J., 2002. Antioxidant Defence Mechanisms in Mussels Bathymodiolus 

azoricus from Mid-Atlantic Ridge Hydrothermal Vent Sites. International Symposium on the Environment & 

Analytical Chemistry-ISEAC 32. 17-21 June 2002. Plymouth, UK-Poster. 

Company, R., Serafim, A. & Bebianno, M.J., 2002. Antioxidant enzymes in hydrothermal vent mussels 

Bathymodiolus azoricus from Menez-Gwen and Lucky Strike. XI Seminário Ibérico de Química Marinha. Faro. 

Portugal. 2-4 April 2002-Poster. 

Company, R., Serafim, A., Bebianno, M.J., Cosson, R. & A. Fiala-Médioni . Effect of cadmium, copper and 

mercury on antioxidant enzyme activities and lipid peroxidation in the gills of the hydrothermal vent mussel 

Bathymodiolus azoricus” Abstract accepted to PRIMO 12, Florida, June 2003 

Cosson R.P., Chausson F., Bustamante P., Laulier M. and Fiala-Médioni A., 2001. First experimental induction of 

metallothioneins in Bathymodiolus azoricus and B. thermophilus at the atmospheric pressure. Second 

International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 2001. 

Daguin, C., Plouviez, S., Hourdez, S., Jollivet, D., 2005. Who’s your mummy? A parentage analysis in the 

commensal hydrothermal vent polychaete Branchipolynoe seepensis within host mussels with microsatellite 

markers. 40th European Marine Biology Symposium, Vienna (AUT). 

Dando, P. R. Growth and maintenance of vent mussels, Bathymodiolus azoricus, in aquaria. 2 nd International 

Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vent Biology, Brest, October 2001. (oral presentation) 

De Cian, M.C., Andersen, A.C.& Lallier, F>H. Carbonic anydydrase loaclization in the gills of two hydrothermal vent 

crustaceans, Bythograea thermydron and Rimicaris exoculata. 10th Deep-Sea biology symposium, Coos Bay, 

Oregon, Aug 25-30 2003. Poster. 

Denis F., Vachoux C., Gauvry L., Leignel V., Salin C., Cosson R.P. and Laulier M., 2002. Metallothionein in 

Bathymodiolus sp.: complementary DNA characterization and quantification of expression. Second International 

Symposium on Deep-Sea Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 2001. 

Desbruyères, D. (2002). Biology and ecological zonation of Lucky Strike and Menez Gwen hydrothermal vent 

fields. Campos Hidrothermais dos Açores. Management Workshop, Horta Faial (Portugal), 18-19 juin 2002 

Desbruyères, D. (2002). Hydrothermal vents as functional parts of the deep-sea. Gift of the Earth Ceremony, Horta 

Faial (Portugal), 20 juin 2002. 

Desbruyères, D. (2002). MOMAR : The ecosystem dynamics and how to study it. Momar 2 workshop, Horta Faial 

(Portugal), 15-17 juin 2002. 

Dixon, D.R. 2001. In vitro Komet method using haemocytes. Industrial Genotoxicology Group Meeting at Institute 

of Medicine, London, 17 December 2001. 

Dixon, D.R. and L.R. Dixon. Summer spawning in the MAR vent shrimp Rimicaris exoculata: fact or fallacy? Island 

Ecosystems Symposium – A Conservation and Molecular Approach, Madeira, Portugal, 5-9 March 2001. 

Dixon, D.R., Dando, P.R., Santos, R.S, Gwynn, J.P. and the VENTOX Consortium. Retrievable cages open up a 

new era in deep-sea vent research. 2. Reproductive studies. MOMAR Workshop held in Horta, Açores, 

Portugal, 15-17 June 2002. 

Dixon, D.R., Dixon, L.R.J., Shillito, B. and Gwynn, J.P. Background and induced levels of DNA damage in Pacific 

deep-sea bent polychaetes: the case for avoidance. Second International Symposium on Deep-Sea 

Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 2001. 

50



Felícia, H., Serafim, A., Company, R. & Bebianno, M.J., 2002. Metallothionein levels in fishes from Lucky Strike 

hydrothermal vent site. MOMAR Workshop. Azores. Portugal. 15-17 June 2002-Poster. 

Godfroy A., Cambon-Bonavita M.A., Geslin C., Leromancer M.,Prieur D. and Quérellou J. Microbial diversity in 

marine extreme environements. ASLO 2005 Aquatic sciences Meeting Salt Lake City,Utah, USA 

Godfroy A., Postec A., Lesongeur F., Ollivier B. and Quérellou J.Use of continuous culture to access the cultivable 

thermophilic microbial diversity from deep-sea hydrothermal vent. Deep Sea Vent and Seep Biology Symposium 

2005 , La Jolla, Californie, USA 

Godfroy A., Postec A., Ollivier B., et Quérellou J. Etude de la biodiversité microbienne obtenue par enrichissement 

en fermenteur de micro-organismes thermophiles issus d'échantillons hydrothermaux de la Dorsale Médio- 

Atlantique. Premier Colloque d'Ecologie Microbienne Carry le Rouet, France. 2003 

Godfroy A., Postec, A., Lesongeur, F. Ollivier B. and Quérellou J. Use of continuous culture to access the cultivable 

thermophilic microbial diversity from deep-sea hydrothermal vent. Extremophile 2004, Cambridge Maryland 

USA 

Hourdez, S., Jollivet, D., Lallier, F. H., Schaeffer, S. W., Toulmond, A. and Fisher, C. R. (2003). Evolution of 

hemoglobins in deep-sea hydrothermal vent polynoids. In 13th International Conference on Invertebrate 

Dioxygen Binding Proteins. Mainz, DE. 

Jollivet, D., D., Le Guen, T., Comtet & F., Viard. (2001) Bathymetric cline of allozyme frequencies despite high 

levels of gene flow between azorean mytilid populations. poster, Second International Symposium on Deep-Sea 

Hydrothermal Vent Biology. 8-12 October, Brest 2001, France. 

Lallier F.H., Chausson F., Sarradin P.M. Adaptation to hypercapnia in hydrothermal vent crustaceans. Second 

International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal vent biology, Brest 8-12 October 2001 

Postec A., Urios L., Ollivier B., Quérellou J. and Godfroy A. Microbial diversity obtained by enrichment culture in 

bioreactor of thermophilic microorganisms from hydrothermal samples of the Medio?Atlantic Ridge. Symposium 

d'Ecologie Microbienne « ISME 2004 », Cancun, Mexique. 


bioreactor of thermophilic microorganisms from hydrothermal samples of the Medio?Atlantic Ridge. Colloque « 

Micro-organismes et environnement », Rennes, France. 2003 


bioreactor of thermophilic microorganisms from hydrothermal samples from the Mid-Atlantic Ridge 

Thermophiles 2003 Exeter, Grande Bretagne.2003 

Postec A.; Laurent Urios ; Bernard Ollivier ; Joël Querellou and Anne Godfroy .Microbial diversity obtained by 

enrichment culture in bioreactor of thermophilic microorganisms from hydrothermal samples of the Medio- 

Atlantic Ridge. Poster, Thermophiles 2003, Exeter , UK September 2003 

Sanglier S., Van Dorsselaer A., Zal F., Leize E. (2002) Poster. Comparative ESMS study of native hemocyanins 

from deep-sea and shore crabs with molecular weights up to 2 341 kDa. EuroConference on Fundamental 

Studies and Applications, Wilbad Kreuth, Allemagne, 21-26 Juillet. 

Sanglier S., Van Dorsselaer A., Zal F., Leize E. (2002Poster. Comparative ESMS study of native hemocyanins 

from deep-sea and shore crabs with molecular weights up to 2 341 kDa. ) 50th ASMS Conference on Mass 

Spectrometry and Allied Topics, Orlando, USA, 2-6 Juin. 

Sarradin P. M. (2001) New approach to the study of biogeochemical interactions in hydrothermal vents. Second 

International Symposium on Deep-Sea Hydrothermal Vents Biology, Quartz, Brest, 8-12 octobre, pp. 19. 

Sarradin, P.M., K. Olu-Le Roy, H. Ondréas, M. Sibuet, M. Klages, Y. Fouquet, B. Savoye, J.F. Drogou and J.L. 

Michel. (2002). Evaluation of the first year of scientific use of the french ROV Victor 6000. Underwater 

Technology 2002, Tokyo, Japan (extended abstract) 

Zal, F., Sanglier, S., Leize, E. and Van Dorsselaer, A. (2003). Comparative ESI-MS Study of ~2.2 MDa Native 

Haemocyanins from Deep-sea and Shore Crabs : from Oligomerization to the Biotope of the Crabs. In 13th 

International Conference on Invertebrate Dioxygen Binding Proteins. Mainz, DE. 

RUBRIQUE 7 : Conférences Nationales 

Almeida, A. J., M. Biscoito & P. Briand - First attempt to assess the distribution and abundance of fish at the hydrothermal 

vent fields and surrounding areas of the Azores Triple Junction (Mid-Atlantic Ridge, 36ºN-37ºN). Oral presentation to 

RIF2003 – “Deuxièmes rencontres de l’ichthyologie en France”, Paris 25-28 March 2003. 

Desbruyères, D. (2001) Dynamique des écosystèmes et observation à long terme. La vision d'un écologiste. Atelier 

"Observation à long terme sur les dorsales océaniques", Roscoff, 29-31 octobre. 

Desbruyères, D. (2002). Ecologie des milieux abyssaux extrêmes : l'indispensable approche non invasive. Journée Imagerie 

Optique Sous-Marine, POP, Maison des Technologies, Toulon, 28 novembre 2002. 

Godfroy A., Anne Postec, Bernard Ollivier et Joël Querellou. Etude de la diversité microbienne obtenue par enrichissement en 

fermenteur de micro-organismes thermophiles issus d’échantillons hydrothermaux de la Dorsale Médio-Atlantique. 

Communication orale Colloque d’Ecologie Microbienne , Carry le Rouet , France Avril 2003. 

Guerreiro, V., L. Narciso, A. J. Almeida & M. Biscoito – Lipid profile of deep-sea fishes from the Lucky Strike and Menez 

Gwen Hydrothermal vent sites (Mid-Atlantic Ridge). Poster presentation to RIF2003 – “Deuxièmes rencontres de 

l’ichthyologie en France”, Paris 25-28 March 2003. 

Hardivillier Y., Leignel V., Denis F. and Laulier M.. Cloning of metallothionein gene and characterization of cDNA sequence 

in hydrothermal mussel, Bathymodiolus sp. XIX ème forum des jeunes oceanographes. Nantes – 4/04/2002.Poster. 

51



Le Bris, N., P.-M. Sarradin and R. Vuillemin In situ chemical analysis to characterise the environment of deep-sea 

hydrothermal vent fauna.. Sensor and Biosensors, Toulouse, France 2001. 

Le Bris, N., P.M. Sarradin, R. Vuillemin, D. Birot, S. Pennec and B. Leilde. Analyseurs et capteurs pour l'étude des 

écosystèmes chimiosynthétiques profonds. Atelier Experimentation et Instrumentation, INSU-Ifremer-Meteo-France, 28-30 

janv. 2003, Brest, France. 

Sarradin, P.M. (2002). Observatoire fond de mer pour l'étude des interactions organismes - habitats : le chantier Açores. 

Séminaire DRO, Ifremer Centre de Brest, 30-31 octobre 2002. 

Sarradin, P.M. (2002). WP4 : ATOS Cruise. VENTOX Meeting, Ifremer Centre de Brest, 18-19 novembre 2002. 

Teixeira, S. C., F. Dehairs, A. J. Almeida & M. Biscoito – Evaluation of heavy metals spatio-temporal variations in otoliths 

and vertebrae of fishes from the Azorean hydrothermal vent areas: Lucky Strike and Menez Gwen (Mid-Atlantic Ridge). 

Oral presentation to RIF2003 – “Deuxièmes rencontres de l’ichthyologie en France”, Paris 25-28 March 2003. 

Zal, Franck, Bruce Shillito, Pierre-Marie Sarradin, Nadine Le Bris, Jean-Claude Caprais & François H. Lallier (2000) 

Évolution du système IPOCAMP : Contrôle des paramètres chimiques de l'enceinte (O2, CO2, CH4, H2S, NO2 et NO3) 

pour une expérimentation in situ simulée. Journées DORSALES 2000, 20-22 Sep, Roscoff (France) – Poster. 

RUBRIQUE 8 : reports 

Desbruyères, D., Khripounoff, A., Le Bris, N. , Sarradin P.M. (2002). Rapport annuel VENTOX. Plouzané, Ifremer. 

Sarradin P. M. (2000) Demande de campagne ATOS. (demande de campagne). 

Sarradin P. M. (2000) Demande d'autorisation de travaux de recherche scientifique dans la zone économique exclusive sous 

juridiction du Portugal (rapport). 

Sarradin P. M. (2001) Demande de soutien de campagne à la mer (soutien de campagne ATOS, VENTOX). 

Sarradin, P.M. et participants campagne ATOS (2001) Campagne ATOS (texte pour le Comité d'Administration). 

Sarradin, P. M. (2002). Rapport de campagne ATOS. Plouzané, Ifremer: 294 p. (rapport de campagne) 

Sarradin, P-M., Fabri, M-C. & Briand, P. 2002. Rapport de campagne ATOS. (N/O Atalante – Victor 6000, 22 juin – 21 

juillet, 2001 5°PCRD VENTOX (EVK3-CT1999-00003). Brest: IFREMER, DRO/EP Avril 2002 – DRO/EP-02/31, 

304pp. 

Rubrique 12 : documents vidéo, films 

Biscoito, M. & A. J. Almeida, 2003 - Fishes of the Hydrothermal Vents of the Azores Triple Junction (Mid-Atlantic 

Ridge). . 2 nd edition. CD-ROM. 

Rubrique 14 : DEA 

Duperron, S. Diversité des bactéries associéees à différentes substrats au niveau de sources hydrothermales sous 

marines. DEA Biodiversité, Université Pierre et Marie Curie 

Menard, L., 2002. Les crustacés hydrothermaux : des adaptations originales à l’hypercapnie ? DEA report, DEA 

Biologie Intégrée des Invertébrés, Université Pierre et Marie Curie, 20 pp. 

Plouviez, S., 2005. Etude de l'apparentement juvénile/femelle mature et de la dispersion chez le polychète 

hydrothermal Branchipolynoe seepensis du point triple des Azores à l'aide de marqueurs microsatellites. M1, 

Univ. Montpellier 2. 

Chapitre d'ouvrage 

Godfroy A, Postec A, Raven N (sous presse) Growth of hyperthermophilic microorganisms for physiological and 

nutritional studies. In: A. RF, A. O (eds) Methods in Microbiology, Extremophiles. Academic Press., Oxford, 

England 

52



Fiche “ Valorisation des résultats des campagnes océanographiques antérieures ” 

Nom de la campagne : BIOSPEEDO 

Navire : L’ATALANTE 

Dates de la campagne :30/04-13/06/04 

Chef de projet : F. Lallier 

Chef de mission : D. Jollivet 

Programme : GDR ‘Ecchis’ 

Engins lourds : Nautile 

Zone : SEPR (7°25N, 14S, 17°25S, 18°25S, 21°33S) 

Organisme : CNRS 

Organisme : CNRS 

Fiche remplie par : D. Jollivet et participants Date de rédaction de la fiche : 04/09/08 

Adresse : BP 70 29280 Plouzané 

Email : jollivet@sb-roscoff.fr Tel : 02 98 29 23 67 Fax : 02 98 29 23 24 

Résultats majeurs obtenus 

La campagne Biospeedo avait pour objectif d’étudier l’évolution de la diversité biologique et 

géochimique le long d’un cline latitudinal sur la dorsale SEPR (7°25S-21°33S), de mieux comprendre les 

processus biogéochimiques gouvernant la distribution des espèces à micro-échelle spatiale et, de poursuivre les 

études sur la réponse adaptative des espèces aux fluctuations thermochimiques du mélange hydrothermal. Le 

dépouillement de la campagne est en cours mais, notons que (1) un grand nombre d’espèces nouvelles ont été 

décrites ou sont en cours de description, (2) que le transcriptome d’Alvinella pompejana fait actuellement l’objet 

d’un séquençage complet et, (3) que de nombreuses études portant sur la phylogéographie et la diversité 

génétique des 3 grands compartiments de la faune hydrothermale (archaea, microeucaryotes et macrofaune) 

sont en cours d’analyse à travers plusieurs sujets de thèse de doctorat. 

Géodiversité des fluides chauds. Les échantillons de fluide chaud récoltés au niveau des conduites de 

cheminées de type ‘fumeur noir’ ont été analysés partiellement au niveau des éléments majeurs et mineurs par 

Chromatographie ionique et spectrométrie d'Absorption atomique à IFREMER DRO/GM (J.C. Charlou & J.P. 

Donval). Certains éléments-traces font l’objet d’une analyse par ICP/MS et l’analyse isotopique de plusieurs 

éléments est en cours au LSCE-CEA-Saclay. 

Biodiversité hydrothermale et structures des communautés. De nombreuses espèces nouvelles pour la 

science font actuellement l’objet d’une description taxinomique. C’est le cas de nombreuses espèces de polychètes 

(Hourdez & Desbruyères), des actinies (Lopez-Gonzalez; Université Séville), des némertes, (Rogers, Shields & 

Segonzac), des copépodes, (Ivanenko et al.), des amph ipodes (Jaume, Université des Baléares), des décapodes 

Munidopsis (Macpherson, Université de Barcelone) et des aplacophores, (Salvini-Palwen, Université de Vienne). 

Les échantillons correspondant aux espèces déjà décrites de mollusques bivalves et gastéropodes ont été envoyés à 

R. von Cosel et P. Bouchet pour confirmation de leur identification spécifique au niveau des zones explorées (7°S, 

13°58’S, 18°36’S, 21°S). L’ensemble des données a été compilé et analysé quantitativement par M. Matabos, E. 

Thiébaut et S. Hourdez pour retracer l’évolution spatiale des communautés hydrothermales à l’échelle de 2 

micro-habitats : les moulières et les colonies à Alvinella. La microflore virale, archéenne, bactérienne et 

microeucaryotique (ciliés) fait également l’objet d’une description à un niveau moléculaire (analyse des séquences 

16S obtenus dans les échantillons d’eau, de fluide et de roche. L’analyse de la biodiversité des microeucaryotes 

fait d’ores et déjà l’objet d’un contrat financé par le GIS Génomique Marine. Porteur du projet : L. Guillou. Titre: 

Etude du parasitisme chez une nouvelle lignée de protistes (les nouveaux alvéolés du Groupe II): spécificité et 

bases moléculaires des interactions hôte/parasite. Une étude comparative du régime alimentaire des principaux 

gastéropodes (Lepetodrilus elevatus, L. ovalis, L. pustulosus, Eulepetopsis vitrea) des peuplements hydrothermaux à 

Bathymodiolus à partir de l’analyse des isotopes stables du carbone et de l’azote est actuellement en cours. Enfin, 

une analyse fine de la microdistribution des peuplements des moulières (+ gazon à cirripèdes pédonculés) en 

relation avec les conditions physicochimiques du milieu a d’ores et déjà été faite au niveau du segment 17°25S (J. 

Sarrazin et coll., IFREMER). Une étude du statut troph ique de Bathymodiolus thermophilus est également en cours. 

Des analyses isotopiques (δ 13 C et δ 15 N) ont été effectuées sur près de 200 individus de tailles allant de quelques 

mm à 8 cm, ainsi que sur la matière organique particulaire de surface et du fond, afin de préciser les modifications 

éventuelles du régime alimentaire de Bathymodiolus au cours de sa croissance. L’interprétation de ces résultats est 

en cours. Cinq espèces nouvelles de trématodes digènes (réparties dans la famille des Opecoelidae Ozaki, et les 

sous-familles Plagioporinae Manter, 1947, Stenakrinae Yamaguti, 1970, Opecoelininae Gibson & Bray, 1984) ont 

été décrites à partir de leurs caractéristiques morphologiques et moléculaires par S. Morand (INRA Montpellier) 

en collaboration avec R. Bray et T.M Littlewood (NHM de Londres). Cette étude associe une analyse 

phylogénétique afin de retracer l’origine de ces parasites chez les poissons abyssaux. La diversité des virus 

53



associés à des Archaea hyperthermophiles issues de sources hydrothermales océaniques profondes a également 

été étudiée par C. Geslin et M. Gaillard (IUEM Brest) et un isolat "Biospeedo" contient un virus et un plasmide 

particulièrement intéressant en termes d’évolution et d’outil génétique. De la même façon, des parasites 

moléculaires nouveau de type « retrotransposon » ont pu être mis en évidence chez les crustacés décapodes, 

notamment chez les galathées (E. Bonnivard, UPMC) ainsi que chez les annélides hydrothermales. 

Génétique et dynamique des populations hydrothermales. L’analyse des structures génétiques de 4 espèces 

clefs de la macrofaune hydrothermale (A. pompejana, L. elevatus, B. thermophilus et B. symmytilida) est 

actuellement en cours sous la forme de 3 thèses de doctorat (M. Matabos, B. Faure & S. Plouviez). Une première 

analyse phylogéographique du vétigastéropode Lepetodrilus elevatus à l’échelle de la dorsale Est-Pacifique 

(i.e. 13°N, 9°50’N et 17°S) a déjà été réalisée au moyen de marqueurs allozymiques et nucléaires et de séquences 

d’ADN mitochondrial. Le criblage des populations à l’aide de marqueurs allozymiques est en cours chez les 

espèces A. pompejana et B. thermophilus. Chez ces trois dernières espèces, l’obtention de plusieurs milliers de 

séquences codantes pour chaque espèce (banques ADNc) nous permet d’ores et déjà de rechercher des marqueurs 

introniques hypervariables nous permettant de mieux quantifier les flux de gènes entre les différents champs 

hydrothermaux. Une analyse des polymorphismes nucléotidiques sur une vingtaine de gènes candidat est 

également en cours au niveau des espèces L. elevatus et B. thermophilus et montre la présence de zones 

d’hybridation entre plusieurs espèces cryptiques à l’extrémité sud de la dorsale. Chez Bathymodiolus, une étude 

polymorphisme/divergence a été réalisé sur 5 gènes nucléaires (exons-intron). Elle permet de fournir des 

informations précieuses sur la taille efficace des populations, les taux de mutation et recombinaison des gènes 

et l’histoire évolutive récente de cette espèce sur l’EPR (B. Faure, Roscoff). Chez Lepetodrilus, l’analyse de 3 

gènes nucléaires (exons-intron) fournit de nouvelles informations sur le niveau de structuration actuelle de ces 

gastéropodes le long de l’EPR sud et permet de quantifier le degré d’introgression de certains allèles entre les 2 

lignées cryptiques détectées par M. Matabos l’année précédente (S. Plouviez). Au niveau de la microflore 

hydrothermale, une étude phylogéographique de Methanocaldococcus jannaschii, une archaea méthanogène 

inféodée aux cheminées hydrothermales profondes entre Juan de Fuca et 21°33S à l’aide de 5 gènes (RPO, 

MCRA, ARGS, ARO et 16S : S. L’Haridon & C. Jeanthon) fait actuellement l’objet d’une rédaction d’article. 

La dynamique de la reproduction et du recrutement a également été étudiée chez les espèces A. pompejana 

(B. Faure), B. thermophilus (F. Viard & T. Comtet) et L. elevatus (E. Thiébaut). En ce qui concerne B. thermophilus, 

l’analyse de la distribution des sexes dans les différentes populations indique l’existence d’un hermaphrodisme 

protandrique qui devrait être confirmé par l’étude des échantillons de gonade en collaboration avec Paul Tyler 

(Southampton Oceanography Centre, Angleterre). La structure des populations de cirripèdes Neolepatidae a 

également été étudié sur le site Oasis à 17°24S par D. Desbruyères. 

 

Séquençage du transcriptome d’A. pompejana 

Les échantillons récoltés au cours de Biospeedo ont permis de réaliser le projet Genoscope de séquençage du transcriptome 

complet d’A. pompejana (10 000 cDNA complets : 250 000 séquences (resp. O. Poch, U. Strasbourg) & F. Zal, SBR). Un 

nombre d’environ 50 000 clones a déjà été séquencé sur 3 banques ADNc tissulaires (branchie, tégument ventral, 

pygidium) et une nouvelle banque normalisée est en cours de construction. Afin de préparer le séquençage du 

génome complet, les estimations de la taille du génome (S. Brown & E. Bonnivard) et du nombre de 

chromosomes (S. Hourdez & D.R. Dixon) ont été réalisé et feront l’objet d’articles. Une analyse 

phylogénétique portant sur la place des polychètes dans l’arbre du vivant à partir des données génomes est en 

cours, notamment par comparaison des séquences orthologues des protéines ribosomales (O. Lecompte & O. 

Poch) et une analyse portant sur la recherche des mutations favorisant la thermostabilité des protéines 

eucaryotes est actuellement en cours par comparaison des séquences orthologues d’A. pompejana et de Paralvinella 

grasslei sur une vingtaine de catégories de gènes transcrits (D. Jollivet & A. Tanguy). Ce type d’analyses a 

également été utilisé pour définir le biais d’usage du code, la recherche d’isochores et la fréquence des 

mutations avantageuses ou délétères chez les polychètes. Une recherche de retrotransposons a également été 

conduite dans les régions 3’UTR des gènes transcrits par D. Higuet & E. Bonnivard (UPMC). 

Panaches larvaires. La récolte de larves à partir de traits d’un filet à plancton au dessus des 

principales moulières des différentes zones actives à d’ores et déjà permis l’identification d’un specimen de 

chaetognathe du genre Sagitta, (site Oasis, 17°25’S), de nombreuses nauplii de cirripèdes (Neolepas spp.), de 

larves de polychètes, de véligères de gastéropodes hydrothermaux (Lepetodrilus spp) et d’un juvénile de 

crevette (T. Comtet). Il s’agit d’un juvénile appartenant à la famille des Alvinocarididae. Il pourrait s’agir 

d’un genre différent d'Alvinocaris, mais la description est délicate à partir d’un seul juvénile. De plus, des tissus 

et des ovocytes de différentes espèces de polychètes ont été récoltés pour le développement d’une méthode 

moléculaire d’identification des stades embryonnaires et larvaires par hybridation in situ dans le cadre du 

54



projet Marie Curie LIST (Larvae In Situ Tracking : detection and identification of early-life-stages of marine 

organisms using in situ hybridisation with oligonucleotide probes. MEIF-CT-2003-501323 : F. Pradillon). Les 

principaux résultats obtenus jusqu’à présent utilisant en partie du matériel récolté lors de la campagne 

concernent le développement de sondes oligonucléotidiques ciblant l’ARN ribosomique 18S permettant 

l’identifiation des stades de vie précoces (oeufs, embryons et larves) des polychètes hydrothermaux Alvinella 

pompejana, Alvinella caudata, Riftia pachyptila, et Tevnia jerichonana. 

Adaptations et physiologie du stress. Les expériences d'exposition à différents stress oxydatifs 

(oxygène, fer) sur le ver alvinellidé Alvinella caudata font l'objet de mesures d'activités enzymatiques et de gels 2D 

afin de rechercher les protéines différentes entre les animaux stressés et les animaux témoins. Une première étude 

des activités enzymatiques a été réalisée dans le laboratoire de J.-F. Rees et a donné lieu à deux mémoires 

d'étudiants où ces activités sont comparées à celles mesurées chez les alvinellidés A. pompejana et Paralvinella 

grasslei, ainsi que le ver littoral Arenicola marina. Les expériences de physiologie cellulaire sur les bactériocytes de 

Riftia pachyptila isolés au cours de la mission sont aussi en cours d'analyse. Le pH intracellulaire de ces cellules 

exposées à de fortes P CO 2 entre présence ou absence d'inhibiteurs pharmocologiques spécifiques d'échangeurs 

anioniques et pompes ioniques nous permettra de déterminer les mécanismes importants dans le fonctionnement de 

la symbiose chez Riftia. En plus de ces cibles spécifiques, une approche de transcriptomique est menée en ce moment 

afin d'identifier d'autres protéines impliquées dans le fonctionnement de la symbiose (thèse Sophie Sanchez). 

Cette approche consiste à faire une banque soustractive en prenant un organe de référence (la paroi du corps) et à y 

comparer le panache branchial (échanges de métabolites nécessaires à la symbiose) et le trophosome qui contient 

les symbiontes. De cette façon, nous avons déjà pu mettre en évidence plusieurs gènes intéressants. Le dosage des 

fractions métalliques solubles/insolubles et des protéines métallothionéines est également en cours chez les 

bivalves Calyptogena et Bathymodiolus provenant des mêmes sites (Oasis & Rehu marka, 17°25S : R. Cosson & P. 

Bustamante) à partir des techniques de spectrométrie de flamme et de polarographie à impulsions 

différentielles. Enfin, une analyse de la réponse au stress thermique est en cours chez le gastéropode Eosipho sp. 

par l’équipe de F. Gaill (B. Shillito). 

La campagne BIOSPEEDO a aussi permis de valider certaines innovations techniques et analytiques : 

- la capture de larves à l’aide d’un filet à plancton spécialement dédié au submersible ‘Nautile’ 

- l’étude in vivo d’espèces animales dans les respiromètres sous pression DESEARE, régulés en oxygène 

(SYRENE), 

- déploiement d’un système d’aspiration dédié à la récolte des Alvinellas (Alvinette) 

- la récolte d’eau de fond et de mélange par bouteille Niskin 12L 

Nombre 

1 Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées 

SCI 

25 publiés + 12 en 

préparation 


3 Publications sous forme de rapports techniques 13 dont 5 mémoires de 

Master1 

4 Articles dans des revues / journaux grand public + reportages TV et émissions radio 1 




dont posters 



dont posters 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 2 

9 Applications (essais thérapeutiques ou cliniques, AMM …) 1 (Génoscope) 

10 Brevets 0 

11 Publications d’atlas (cartes, photos) 0 


13 Publications électroniques sur le réseau Internet 0 

14 DEA/Master2 ayant utilisé les données de la campagne 10 

15 Thèse ayant utilisé les données de la campagne 11 dont 4 soutenues 

55 

23 

11 

12 

6 

4 

2



16 Validation des données terminée 

17 Transmission au SISMER Non : . Oui : X.. 

18 Transmission à d’autres banques de données Non : .... Oui : X. 

19 Transmission à d’autres équipes Non : .... Oui : .X 

20 Considérez-vous l’exploitation: X en cours 

Rubrique 1 (Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture référencées SCI) 

Soumis/en revision 

Charlou J. L., J. P. Donval, P. Jean-Baptiste, E. Fourré, P. Bienvenu, D. Jollivet, Variability of mineral and gas composition in hydrothermal 

fluids between 4°S and 19°S, East Pacific Rise. En préparation. 

Fourré E., P. Jean-Baptiste, J. L. Charlou, J. P. Donval, A. Dapoigny, Space and time variability of helium isotopes in hydrothermal fluids 

between 4°S and 19°S, East Pacific Rise. En préparation. 

Bray R., Littlewood T.M. & S. Morand New digeneans from hydrothermal vent fishes in the South East Pacific. En préparation. 

L'Haridon, S, D. Jollivet & C. Jeanthon Population structure of the hyperthermophilic methanogenic archaeon Methanocaldococcus 

jannaschii from hydrothermal vent sites of the Juan de Fuca ridge and the East Pacific Rise (en préparation). 

Matabos, M., Plouviez, S., Hourdez, S., Desbruyères, D., Legendre, P., Jollivet, D., & Thiébaut, E. Evidence for a biogeographic transition 

zone in vent gastropods along the South EPR (en préparation). 

Plouviez, S., Daguin-Thiébaut, C., Viard, F., Legendre, P., Shank, T., Lallier, F. & Jollivet D. Comparative phylogeography between vent 

species along the East Pacific Rise reveals vicariant processes and population expansion to the South. Mol. Ecol. (soumis). 

Sauvadet A.-L., Gobet A., Winkler J. & Guillou L. Protist living in association with deep hydrothermal vent and cold seep bivalves (en 

preparation). 

Viprey M., Not F., Massana R., Moon-van der Staay S. Y., Vaulot D. & Guillou L. Genetic diversity and distribution of Radiolarian assessed 

from picoplanktonic-size 18S rDNA clone libraries retrieved from diverse marine ecosystems (en preparation). 

Gagnière N., Jollivet D., Bigot Y., Boutet, I., Busso D., Chénais B., Gaill F., Higuet D., Hourdez S., Knoops B., Lallier F., Leize-Wagner E., 

Mary J., Moras D., Rees J.-F., Shillito B., Segurens B., Tanguy A., Thierry J.-C., Weissenbach J., Zal F., Poch O., Lecompte O. (2008) 

Insights into metazoan evolution from Alvinella pompejana cDNA libraries. Genome Res., En preparation. 

Geanard B., Marie B., Loumaye E., Knoops B., Zal F. & Rees JF (2008) Living in a hot redox soup : the antioxidant defense arsenal of the 

hydrothermal worm, Alvinella pompejana. Marine Biology, soumis. 

In revision 

Tanguy, A., Boutet, I., Shillito, B., Moraga, D. & Jollivet, D. Evidence for up- and down-regulated genes associated with a thermal stress in 

Bathymodiolus thermophilus and Paralvinella pandorae irlandei using substractive cDNA libraries. BMC Genomics. 

Faure, B., Jollivet, D., Tanguy, A., Bonhomme, F. & Bierne N. Secondary contact zone in the deep sea : a multi-locus analysis of divergence 

and gene flow between two closely-related species of Bathymodiolus. Genetics. 

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Synaphobranchidae) from the Pacific Ocean. Cybium, 29, (4): 413-416. 

Chabasse, C., Bailly, X., Sanchez, S., Rousselot, M. & Zal, F. (2006) Gene structure and molecular phylogeny of the linker chains from the 

giant annelid hexagonal bilayer hemoglobins. J. Mol. Biol. 63: 365-374. 

Daly, M. 2006. Boloceroides daphneae, a new species of giant sea anemone (Cnidaria: Actiniaria: Boloceroididae) from the deep Pacific. 

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Faure, B., Bierne, N., Tanguy, A., Bonhomme, F. & Jollivet, D. (2007) Evidence for a slightly deleterious effect of intron polymorphisms at 

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Nematocarcinidae) from hydrothermal vents on the North and South East Pacific Rise. Zoosystema, 27(2): 343-364. 

Le Bris, N., Anderson, L., Chevert, F. & Gaill, F. (2007) Sulfide diffusion and chemoautotrophy requirements in an extremophilic worm 

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Matabos M., Thiébaut E., Le Guen D., Sadosky F., Jollivet D., Bonhomme F. 2008. Geographic clines and isolation-by-distance patterns 

detected along the EPR in the vetigastropod Lepetodrilus elevatus reflects species crypticism. Marine Biology 153 : 545-563. 

Moller, P.R. & Jones, W. J. (2007) Eptatretus strickrotti n. sp. (Myxinidae) : first hagfish captured from a hydrothermal vent. Biol. Bull., 

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Nielsen, J.G. & Cohen, D.M. (2005) Thermichthys (Bythitidae), replacement name for preoccupied Gerhardia Nielsen & Cohen and a 

second specimen of Thermichthys hollisi from the Southeast Pacific. Cybium, 29, (4): 395-398. 

Nielsen, J.G., Moller, P.R. & Segonzac, M. (2006) Ventichthys biospeedoi n. gen. et sp. (Teleostei, Ophidiidae) from a hydrothermal vent in 

the South East Pacific. Zootaxa, 1247: 13-24. 

Pradillon, F., Schmidt, A., Peplies, J. & Dubilier, N. (2007) Species identification of marine invertebrate early stages by whole-larvae in situ 

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Sanchez S., Andersen A.C., Hourdez S. & Lallier F.H. (2007) Identification, sequencing, and localization of new carbonic anhydrase 

transcripts from the hydrothermal vent tubeworm Riftia pachyptila. FEBS J., 274: 5311-5324. 

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Sanchez S., Hourdez S. & Lallier F.H. (2007) Identification of proteins involved in the functioning of Riftia pachyptila symbiosis by 

Subtractive Suppression Hybridization. BMC Genomics, 8: 337. 

Sanchez S., Hourdez S. & Lallier F.H. (2007) Les endosymbioses chimioautotrophes : des modèles contemporains de la symbiogénèse ? J. 

Soc. Biol., 201: 247-257. 

Salini-Plawen, von, L. 2008. Three new species of Simrothiellidae (Solenogastres) associated with the hot-vent biotope. J. Moll. Stud. 74, 

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Sarrazin, J., Walter, C., P.M. Sarradin, Brind'Amour, A., Desbruyères, D. , Briand, P. , Fabri, M. C. , Van Gaever, S., Vanreusel, A., 

Bachraty, C. and Thiebaut, E. (2006) Community structure and temperature dynamics within a mussel assemblage on the Southern East 

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Stöhr, S. & Segonzac, M. (2006) Two New Genera and species of Ophiuroid (Echinodermata) from Hydrothermal Vents in the East Pacific. 

Species Diversity 11, (1): 7-32. 

Terrat, Y. Bonnivard, E., Higuet, D. 2008. GalEa retrotransposons from galatheid squat lobsters (decapoda, anomura) define a new clade of 

Ty1/copia-like elements restricted to aquatic species. Mol. Genet. Genomics, 279: 63-73. 

Vacelet, J. (2006) New carnivorous sponges (Porifera, Poecilosclerida) collected from manned submersibles in the deep Pacific. Zoological 

Journal of the Linnean Society. 148: 553-584. 

González A.F., Guerra A., Pascual S. and Segonzac M. (2008) Female description of the hydrothermal vent cephalopod Vulcanoctopus 

hydrothermalis. Journal of the Marine Biological Association of the UK, 88:375-379. 

Wiklund H., Nygren A., Pleijel F. and Sundberg P. (2008) The phylogenetic relationships between Amphinomidae, Archinomidae and 

Euphrosinidae (Amphinomida: Aciculata: Polychaeta), inferred from molecular data Journal of the Marine Biological Association of the 

UK, 88:509-513. 

Rubrique 2 (Publications dans d’autres revues scientifiques) : 

Jollivet, D. and the shipboard scientific party 2005. The BIOSPEEDO cruise : a new survey of hydrothermal vents along the South East 

Pacific Rise from 7°24S to 21°33S. InterRidge News, 13, 20-26. 

Lecompte, O., Poch, O., Bigot, Y., Cormier, P., Conti, E., Dietrich, J., Duchiron, F., Gaill, F., Higuet, D., Hourdez, S., Jollivet, D., Knoops, 

B., Lallier, F., Laullier, M., Leize-Wagner, E., Moras, D., Rees, J.-F., Vandorsselaer, A., Shillito, B., Thierry, J.-C. & Zal, F. 2005. 

Alvinella Consortium : a large scale sequencing project at the french Genoscope. InterRidge News, 14 : 27-28. 

Rubrique 3 (Publications sous forme de rapports techniques) : 

Aillerie L. 2005-2006. Comparaison des teneurs en métallothionéines chez Bathymodiolus thermophilus prélevés en différents sites de la 

Dorsale du Pacifique Sud-Est. 1 ère et 2 ème année BTS "Bio Analyse et Contrôle", Université de Nantes (dir. R. Cosson). 

Delhage A. 2005. Etude de l'impact d'un traitement au peroxyde d'hydrogène (H2O2) sur le métabolisme anti-oxydant d'Alvinella caudata 

(espèce hydrothermale) et d'Arenicola marina (espèce intertidale). 116 p. Mémoire de M1 de l'université Catholique de Louvain-La- 

Neuve. (dir. : J-F. Rees et F. Zal). 

Hermant P. 2005. Impact du Fer sur le métabolisme antioxydant d'annélides: Alvinella caudata (espèce hydrothermale) et Arenicola marina 

(espèce intertidale) . 104 p. Mémoire de M1 de l'université Catholique de Louvain-La-Neuve. (dir. :J.-F. Rees & F. Zal). 

Le Cunuder, E. 2005. Analyse par spectroscopie d'absorption atomique du strontium dans les fluides hydrothermaux des campagnes IRIS 

(2001) et BIOSPEEDO (2004). Rapport IFREMER. 

Walter, C. 2005. Etude à microéchelle d'une moulière hydrothermale située dans une zone d'émissions diffuses de la dorsale sud est 

Pacifique. Master 1 de l'Université La Rochelle, (dir. J. Sarrazin). 

Rubrique 4 : Articles et reportages presse et grand public 

Rees J-F., Zal, F. & Thome J.-P. Enfer et paradis : la toxicité de l’oxygène chez les organismes abyssaux. Océanis, 31, sous presse. 

Rubrique 6 (Communications dans des colloques internationaux) 

Bertrand, G., Marie, B., Zal, F. and Rees, J.-F. Enzymatic antioxidative defense mechanisms in the pompeii worm Alvinella pompejana 

collected in situ and acclimated in high-pressure vessels. Third International Symposium on Hydrothermal Vent and Seep Biology, San 

Diego, California, 12-16 septembre 2005. 

Hourdez S. and D. Desbruyeres. Polychaete assemblages on the South East Pacific Rise. Third International Symposium on Hydrothermal 

Vent and Seep Biology, San Diego, California, 12-16 septembre 2005. 

Faure, B., Tanguy, A. & Jollivet, D. Adaptive polymorphisms and gene coalescence in the deep-sea hydrothermal mussel Bathymodiolus 

spp. In: Developmental phylogeny, « Marine Genomics » NoE session, 45th annual meeting of the S. E. B., 10-15 Juillet 2005, 

Barcelona, Espagne. 

Faure, B., Shillito, B., Tanguy, A. & Jollivet, D. Adaptive polymorphisms and gene coalescence in the deep-sea hydrothermal mussel 

Bathymodiolus spp. Poster, Third International Symposium on Hydrothermal Vent and Seep Biology, 12-18 septembre 2005, La Jolla, 

California. 

Faure, B., Jollivet, D., Tanguy, A., Bierne, N. & Bonhomme, F. 2006. A deep-sea story: adaptive polymorphism and gene coalescence in the 

hydrothermal vent mussel Bathymodiolus spp. The first International Conference on Marine genomics, Poster, 28 October-3 November 

2006, Sorento, Italy. 

Faure, B., Bierne, N., Tanguy, A., Bonhomme, F. & Jollivet, D. (2007) Departure from neutrality at the second intron of the EF1 gene in 

the deep-sea hydrothermal vent bivalve Bathymodiolus. Conférence Jacques Monod “Génomique évolutive”, 2-6 mai 2007, Roscoff, 

France (Affiche). 

Gagnière N, Bigot Y, Gaill F, Higuet D, Jollivet D, Leize E, Rees JF, Weissenbach J, Zal F, Poch O & Lecompte O. 2007. From cDNA to 

integrative protein annotation and beyond: application to Alvinella pompejana cDNA collection. AFP 2007, Vienne (communication 

orale). 

57



Jollivet, D., Tanguy, A. & Piccino, P. Molecular adaptation of hydrothermal vent polychaetes to temperature. In: Developmental phylogeny, 

« Marine Genomics » NoE session, 45th annual meeting of the S. E. B., 10-15 Juillet 2005, Barcelona, Espagne. 

Lecompte, O., Poch, O., Bigot, Y., Conti, E., Cormier, P., Dietrich, J., Duchiron, F., Gagnière, N., Gaill, F., Higuet, D., Hourdez, S., Jollivet 

D., Knoops, B., Lallier, F., Laulier, M., Leize-Wagner, E., Moras, D., Pradillon, F., Rees, J-F., Vandorsselaer, A., Ravaux, J., Shillito, 

B., Thierry, J.-C. & Zal, F. Alvinella Consortium: a large scale sequencing project at the French Genoscope. Poster, Third International 

Symposium on Hydrothermal Vent and Seep Biology, 12-18 septembre 2005, La Jolla, California. 

Piccino, P., Faure, B., Pradillon, F. & Jollivet, D. Thermal adaptation of Alvinella pompejana (Polychaeta : Alvinellidae) in a highly 

fluctuating environment : a fitness cost to colonists that carry allele 90 at locus PGM-1. Poster, Third International Symposium on 

Hydrothermal Vent and Seep Biology, 12-18 septembre 2005, La Jolla, California. 

Pradillon, F. Gaill, F. Mullineaux, L. and Dubilier, N. Tracking vent larvae using in situ hybridization with oligonucleotidic probes. Third 

International Symposium on Hydrothermal Vent and Seep Biology, San Diego, California, 12-16 septembre 2005. 

Sanchez, S., Hourdez, S. and Lallier, F.H. Transcriptomics approach to determine the proteins involved in the functioning of Riftia 

pachyptila symbiosis. Third International Symposium on Hydrothermal Vent and Seep Biology, San Diego, California, 12-16 septembre 

2005. 

Sarrazin, J., Bachrati, C., Desbruyères, D., Walter, C., Sarradin, P.-M., Le Bris, N. and Thiébaut, E. Abiotic and biotic factors characterizing 

two faunal assemblages colonizing active diffuse flow areas on the southern east Pacific rise at 17°S. Third International Symposium on 

Hydrothermal Vent and Seep Biology, San Diego, California, 12-16 septembre 2005. 

Terrat, Y., Bonnivard, E., Higuet, D. An ubiquitous family of retrotransposons in Galathean species. 39th Populations Genetics Group 

Meeting, Edinburgh. 

Hourdez, S., D. Jollivet, S.W. Schaeffer, and C.R. Fisher. Evolutionary history of hydrothermal vent scaleworms. Ridge 2000 Theoretical 

Institute 2006. Modelling hydrothermal vent processes: from magma to microbes. Mammoth Lakes (CA), USA, June 25-30 2006. 

Poster. 

Sanchez S., Andersen A., Hourdez S., Lallier F. Gill-specific expressed sequences in the chemoautotrophic symbiosis Riftia pachyptila. 5th 

ISS (International Symbiosis Society) Congress, August 4-10, 2006, Vienna, Austria, communication orale. 

Sanchez S., Hourdez S., Lallier F. A transcriptomics approach to the Riftia pachyptila symbiosis: Outcome from gill- and trophosomespecific 

suppression subtractive hybridization libraries. 5th ISS (International Symbiosis Society) Congress, August 4-10 2006, Vienna, 

Austria, Poster. 

Matabos M., Barnay A.S., Jollivet D., Thiébaut E. Preliminary results on community structure of gastropods from mussel beds at deep-sea 

hydrothermal vents along the South East Pacific Rise (SEPR). Poster au /11th Deep Sea Biology Symposium: Southampton (England), 

9-14 juillet 2006. 

Gagnière N, Bigot Y, Gaill F , Higuet D , Jollivet D , Leize E, Rees JF, Weissenbach J, Zal F, Poch O, Lecompte O 2007. From cDNA to 

integrative protein annotation and beyond: application to Alvinella pompejana cDNA collection AFP2007, Juillet, Vienne. 

Poch O. 2007. Insights from cDNA analysis of the thermotolerant deep-sea worm, Alvinella pompejana. Conférence Jacques Monod, 9-13 

juin 2007, Roscoff. 

Plouviez, S., Daguin-Thiébaut, C., Viard, F., Lallier, F.H. & Jollivet, D. Comparative phylogeography of deep-sea hydrothermal vent species 

along the East Pacific Rise. Oral Communication, 52nd Ecological Genetics Group Meeting 1-3 avril 2008, University of Sheffield. UK. 

Plouviez, S., Daguin-Thiébaut, C., Viard, F., Lallier, F.H. & Jollivet, D. Comparative phylogeography of deep-sea hydrothermal vent species 

along the East Pacific Rise. Oral Communication, XX ICZ 2008 26-29 août 2008, Museum national d’Histoire Naturelle de Paris. 

France. 

Faure, B. & Jollivet D. Secondary contact zones in the deep sea: a multilocus analysis of divergence and gene flow between closely-related 

species of Bathymodiolus. Chess Workshop, Census of Marine Life, 4-8 septembre 2008, Roscoff. 

Rubrique 7 (Communications dans des colloques nationaux) : 

Faure, B., Piccino, P. & Jollivet, D. Etude de l'efficacité reproductrice du polychète hydrothermal Alvinella pompejana en fonction du 

génotype. Poster, XXVI Petit Pois Déridé, 25-28 Août, Paris 2004, France. 

Terrat, Y., Bonnivard, E., Jacques, M. & Higuet D. 2005. Plasticité des génomes et éléments transposables : cas des éspèces de la superfamille 

des Galathées. 13 eme Réunion ‘Eléments Transposables’, Grenoble. 

Sanchez S., Hourdez S., Lallier F. Approche transcriptomique pour identifier des proteins impliquées dans le fonctionnement de la symbiose 

Riftia pachyptila : résultats de banques soustractives tissu-spécifiques. 6ème Rencontre SifrARN Structure, Intégration, Fonction et 

Réactivité des ARN, sous l’égide de la SFBBM (Société Française de Biochimie et de Biologie Moléculaire), 3-6 juillet 2006, Rennes, 

France. 

Plouviez, S., Tanguy, A., Jollivet, D. & Bonhomme, F. Divergence et polymorphismes nucléotidiques chez les gastéropodes hydrothermaux 

Lepetodrilidae. Poster, 28 e edition Petit Pois Déridé, 28-31 Août 2006, Université de LilleI, France. 

Winkler J., Gobet A., Jollivet D., Hourdez S., Guillou L. Etude de la diversité génétique des microeucaryotes des sources hydrothermales 

profondes. 45 e Colloque du GPLF, Station Biologique, Roscoff, 28-31 Mai 2007 (communication orale). 

Jollivet, D., Boutet-Tanguy, I., Tanguy, A., Mary, J., Lecompte, O., Segurens, B., Weissenbach, J. & Poch O. 2007. Premières signatures 

moléculaires de l’adaptation thermique chez le polychète Alvinella pompejana par analyse du transcriptome. Axe « Génomique & 

Chimie bleue » Kick off Meeting GIS Europôle Mer, 5-6 juillet 2007, Roscoff. 

Rubriques 12 : 

Rubriques 13 : Pages Web sur sb-roscoff.fr/campagnes, CNRS.fr. 

Rubriques 14: DEA/Master ayant utilisé les données de la campagne. 

Bachraty, C. 2005. Etude d'une population de cirripèdes pédonculés (Neolepas n. sp.) associée à l'hydrothermalisme actif sur la dorsale du 

pacifique oriental par 17°S. Rapport Ifremer. Master 2 Sciences de la Mer et du Littoral, (dir. : D. Desbruyères). 

58



Chever, F. 2005. Diffusion des sulfures au travers du tube d’Alvinella pompejana et conséquences sur la chimie des micro-environnements 

interne et externe. Sciences Chimiques de l’Environnement Marin. UBO.. Master 2. (dir : N. Le Bris). 

Gorlas A. 2007. caractérisation d'un nouveau système hôte-virus associé aux sources hydrothermales océaniques profondes Master 2 : 

Microbiologie Fondamentale et Appliquée, Université de Bretagne Occidentale, (Dir. C. Geslin) 

de Busserolles, F. 2005. Reproduction of Bathymodiolus thermophilus over a large latitudinal scale (7°25S-21°33S). Southampton 

Oceanographic Centre, Master thesis (dir. : P.A. Tyler & T. Comtet). 

Faure, B. 2004. Dynamique de la reproduction chez le polychète hydrothermal Alvinella pompejana à l’échelle de la dorsale SEPR. D.E.A. 

Océanologie Biologique, Université Paris VI, (dir. D. Jollivet). 

Grayot, S. 2005. Mise au point d'un nouveau marqueur moléculaire pour l'étude de la biogéographie des Thermococcales, Master 2 de 

Université de Bretagne Occidentale (dir. : MA Cambon Bonavita). 

Gobet, A. 2006. Diversité génétique des microeucaryotes des sources hydrothermales profondes. Master 2, Université Pierre et Marie Curie 

(dir. L. Guillou). 

Morineaux, M. 2007. Taxinomie des annélides polychètes des milieux profonds fondés sur la chimiosynthèse bactérienne. CDD IFREMER 

18 mois (dir. D. Desbruyères). 

Plouviez, S. 2006. Recherche de variants adaptatifs impliqués dans la différenciation écologique chez des gastéropodes patelliformes 

Lepetodrilidae strictement inféodés aux sources hydrothermales profondes. Master 2, Université de MontpellierII (dir. D. Jollivet). 

Vannier, P. 2007. Diversité virale associée à des archaea hyperthermophiles issues de sources hydrothermales océaniques. Master 1. 

Université de Bretagne Occidentale (dir. C. Geslin). 

Winckler, J. 2007. Etude de la diversité des microeucaryotes inféodés aux bivalves hydrothermaux. Master 2, Université de Pierre et Marie 

Curie (dir. L. Guillou). 

Manrique Herrera, A. 2007. Adaptation à la température des annélides hydrothermaux du genre Paralvinella : étude transcriptomique. Master 

2, Université Pierre et Marie Curie (dir. A. Tanguy). 

Cormier-Caillault, C. 2007 Diversité génétique des microeucaryotes hydrothermaux. Stage IUT. 

Rubriques 15 –Thèse et HDR ayant utilisé les données de la campagne: 

Burgaud, G. (2006-2009) Etude de la biodiversité fongique marine dans les écosystèmes hydrothermaux. Doctorat de l’Université de 

Bretagne Occidentale (dir. G. Barbier). 

Chambouvet, A. (2005-2008) Le parasitisme au sein des nouvelles lignées d'alvéolés marins. Thèse de Doctorat de l’université Pierre et 

Marie Curie, Ecole doctorale ‘Diversité du vivant’, (codir. : D.Vaulot & L. Guillou). 

Faure, B. (2005-2008) Etude multi-locus des pressions évolutives s’exerçant sur les bivalves marins en situation d’hybridation : cas des 

moules hydrothermales du genre Bathymodiolus des dorsales médio-atlantique et est-pacifique. Thèse de Doctorat de l’Université de 

Montpellier II, (codir. F. Bonhomme & D. Jollivet). Thèse soutenue. 

Gaillard, M. (2006) Diversité virale chez les archaea hyper-thermophiles des sources hydrothermales profondes. Thèse de Doctorat de 

L’Université de Bretagne Occidentale (dir. D. Prieur). Thèse soutenue. 

Matabos M. (2007). Biodiversité des peuplements hydrothermaux de la dorsale Est-Pacifique : influence des traits d’histoire de vie des 

organismes et de l’environnement géophysique et physico-chimique. Thèse de doctorat de l’Université Paris VI. (codir.: G. Boucher & 

E. Thiébaut). Thèse soutenue 

Sanchez, S. (2007) Approche transcriptomique pour identifier des protéines impliquées dans le fonctionnement de la symbiose de Riftia 

pachyptila. Thèse de Doctorat de l’Université de Pierre et Marie Curie (dir. F. Lallier). Thèse soutenue. 

Plouviez, S. (2006-2009) Phylogéographie comparée des espèces hydrothermales de la dorsale Est Pacifique. Thèse de doctorat de 

l’Université Pierre et Marie Curie (co-dir. D. Jollivet, F. Lallier). 

Projecto Garcia, J. C. (2007-2009) Evolution of respiratory pigments in hydrothermal vent scale worms (Polynoidae). Doctorat européen 

Marie Curie, Esteam (dir. S. Hourdez). 

Sauvadet, A.L. (2008-2010) Diversité génétique des microeucaryotes des écosystèmes réduits profonds. Thèse de doctorat de l’Université 

Pierre et Marie Curie (co-dir. L. Guillou, D. Vaulot). 

Terrat, Y. (2007-2009) Etude des retrotransposons chez les crustacés décapodes hydrothermaux. Thèse de doctorat de l’Université Pierre et 

Marie Curie (co-dir. D. Higuet, E. Bonnivard). 

Gagnière, N. (2006-2008) Annotation du transcriptome d’Alvinella pompejana et meta-analyses des gènes en relation avec la thermophilie. 

Thèse de Doctorat de l’Université de Strasbourg (dir. O. Lecompte, IGBMC). 


(Données transmises -banques de données (SISMER, JGOFS, CDIAC …) 

• Séquences d’ARNr 16S, 18S, 28S, COI déposées dans banques EMBL et GenBank. 

• Echantillons biologiques transmis aux Museums pour description 

Rubrique 20 : Etat d’avancement des études, échéancier. 

Exploitation en cours. L’analyse des échantillons est dans sa première phase d’exploitation. Une petite partie des résultats fait déjà l’objet de 

publications soumises ou en cours de préparation faisant plus spécifiquement l’objet de descriptions d’espèces nouvelles. L’année 2007 

devrait permettre de valoriser de nombreuses études moléculaires (actuellement en phase d’analyses) sous la forme d’articles dans des 

journaux à haut facteur d’impact. A cela s’ajouteront plusieurs études écologiques associées au gradient latitudinal exploré. 

59



Monitoring the Mid Atlantic Ridge: Ecology, Technology Observation 

MoMARETO cruise 2006 

Fiche de valorisation 2008 

Nom de la campagne : MoMARETO 

Navire : NO Pourquoi pas? 

Dates de la campagne : Août – Septembre 2006 

Chef de projet : J. Sarrazin 

Chef de mission 1 : P.M. Sarradin 

Chef de mission 2 : J. Sarrazin 

Programme : EXOCET/D FP6-GOCE-CT-2003- 

505342 

Engins lourds : Victor 

Zone : Atlantique, Açores 

Organisme : Ifremer DEEP LEP 



Fiche remplie par : P.M. Sarradin et J. Sarrazin Date de rédaction de la fiche : Janvier 

Adresse : Ifremer DEEP LEP, BP 70 F-29280 PLOUZANE 

Email : Pierre.Marie.Sarradin@ifremer.fr 

Jozee.Sarrazin@ifremer.fr 

Tel : 02 98 22 46 72 

02 98 22 43 29 

Fax : 02 98 22 47 57 

La première partie du document et le tableau de synthèse rassemblent la valorisation « directe » de la 

campagne MoMARETO. 

La fiche de valorisation contractuelle du projet EXOCET/D (2004-2007) est en fin de document. 

Les références communes sont marquées par un *. 


La campagne Momareto s'est déroulée du 7 août au 6 septembre 2006 au large des Açores sur le navire 

océanographique Pourquoi Pas?. La campagne Momareto a permis l'embarquement de 55 scientifiques, ingénieurs 

et techniciens de plusieurs nationalités et de quatre journalistes. Deux plongées Victor ont été réalisées avec le 

nouveau module de mesures en route et 21 plongées ont été faites avec le module de prélèvement de base. Quatre 

plongées ont été effectuées sur le site Menez Gwen, 3 plongées sur le site Rainbow et 16 plongées sur le site Lucky 

Strike. Cette campagne, pilotée par l'Ifremer (chefs de mission : PM Sarradin et J Sarrazin, DEEP/LEP) était divisée 

en deux legs. 

Le premier leg (7-17 août), financé en partie par l'Europe (étape de démonstration du projet européen EXOCET/D), 

avait comme objectif principal de valider une quinzaine de prototypes dédiés à l'étude des écosystèmes marins 

profonds, développés dans du projet EXOCET/D. L'utilisation au cours des deux premières plongées du module de 

mesure en route de Victor, équipé du sondeur multifaisceaux et d'un sonar pêche a permis i) l'obtention d'une carte 

micro-bathymétrique de très haute résolution du site hydrothermal Lucky Strike avec un zoom sur l'édifice Tour 

Eiffel, ii) de valider l'utilité du sondeur pêche (collaboration C. Scalabrin) pour la cartographie à petite échelle des 

émissions hydrothermales et de iii) vérifier l'interférence soupçonnée entre le SMF et le sonar pêche. Deux caméras 

de stéréovision (IRIS -Ifremer/SM- et CAMEREO -AWI-), permettant la reconstruction 3D de petites structures, ont 

été testées. L'utilisation du sonar Tritech "Super seeking dual frequency profiler" pour cartographier la distribution 

de la faune et des substrats sur les édifices hydrothermaux a pu être validée techniquement au cours du premier 

leg. La partie "imagerie vidéo" (Ifremer/SM) du module d'observation biologique TEMPO a été testée avec succès 

lors d'un mouillage autonome. L'analyseur chimique miniaturisé CHEMINI (Fer et Sulfure -Ifremer/TSI), le préleveur 

d'eau PEPITO (Ifremer/TSI) ainsi qu'un capteur de méthane (AWI) et un débitmètre (Cardiff University) ont été 

testé à plusieurs reprises avec succès dans le milieu hydrothermal. Le déploiement sur plusieurs jours d'une CTD 

associée à un profileur de courants (Université de Brême) à proximité de l'édifice hydrothermal Tour Eiffel a permis 

l'acquisition de données de courant à petite échelle autour de la structure. Enfin, les trois outils dédiés au 

prélèvement et à l'échantillonnage de la faune (enceinte sous pression Periscop -UPMC-, respiromètres sous 

pression DESEARES -Station biologique de Roscoff- et colonisateur microbien AISICS -Ifremer/TSI) ont été testés 

avec succès. Mis à part la mise en évidence d’ajustements et d'améliorations possibles sur les instruments testés, ce 

premier leg a été un grand succès. Il a également montré l'importance de la phase de test/validation technologique, 

initiée à Toulon en avril 2006, avant le passage à l’utilisation scientifique. Le site web de la campagne Momareto a 

été lancé, avec l'aide d'un webmaster terrestre, au cours de ce premier leg. 

Le deuxième leg (18 août – 5 septembre) avait pour objectifs principaux de i) rechercher les liens entre la 

distribution spatio-temporelle des assemblages de moules et les facteurs environnementaux sur le champ 

hydrothermal Lucky Strike, ii) d'étudier la réponse et l’adaptation des organismes hydrothermaux aux 

caractéristiques et aux variations à court terme des facteurs du milieu et iii) de communiquer les avancées de cette 

60



campagne en temps réel avec le grand public. Une partie de l'instrumentation testée au 1er leg a été utilisée avec 

succès pour l'échantillonnage et l'étude de la faune ainsi que pour la caractérisation du milieu. Les différentes 

équipes scientifiques impliquées ont pu mener à bien leurs expériences et les objectifs globaux sont atteints. Le 

module d'observation biologique à long terme TEMPO a été déployé avec succès en fin de campagne sur un 

assemblage de moules. Il permettra le suivi de la dynamique de cette faune et de son habitat pendant un an. 

Tempo constitue la première phase dans l'établissement d'un observatoire sur le champ hydrothermal Lucky Strike 

dans le cadre du projet MoMAR. Des sondes de température et des modules de colonisation ont également été 

déployés pour compléter le suivi temporel. 

Au niveau communication, la campagne affiche un réel succès avec plus de 18 articles dans la presse, 6 émissions 

radio et au moins trois émissions TV. Le site web a connu la deuxième plus grande affluence des sites Ifremer avec 

10% du trafic. Il a attiré au moins 10 000 internautes distincts (hors Ifremer) et a permis une réelle synergie avec 

les gens du bord. Enfin, une grande première avec la "Nuit des abysses", une plongée en direct, rediffusée au 

centre Ifremer de Brest devant 250 personnes. 

Nombre 

1 Publications d’articles originaux dans des revues avec comité de lecture 

référencées SCI 

3 

4 soumises 





6 Communications dans des colloques internationaux 22 

7 Communications dans des colloques nationaux 16 

8 Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 4 


10 Brevets – enveloppes Soleau 2 



13 Publications électroniques sur le réseau Internet 2 

14 Etudiants ayant utilisés les données de la campagne 7 

15 Thèses et post doc ayant utilisés les données de la campagne 6 + 2 

16 Validation des données En cours 

17 Transmission au SISMER Oui : .... 

18 Transmission à d’autres banques de données Biocean Oui : .... 

19 Transmission à d’autres équipes Oui : .... 

20 Considérez-vous l’exploitation en cours 

Rubrique 1: Publications dans des revues scientifiques avec comité de lecture 

Bettencourt Raul, Paul Dando Valentina Costa, Domitília Rosa, Virginie Riou, Ana Colaço, Jozée Sarrazin, Pierre- 

Marie Sarradin, and Ricardo Serrão Santos. Changes in gill tissues of the vent mussel Bathymodiolus azoricus 

held for 6 months in aquaria at atmospheric pressure. (2008). Comparative Biochemistry and Physiology - Part 

A: Molecular & Integrative Physiology. Volume 150, Issue 1, Pages 1-7 

Byrne Nathalie, Marc Strous, Valentin Crépeau, Boran Kartal, Jean-Louis Birrien, Markus Schmid, Françoise 

Lesongeur, Stefan Schouten, Andrea Jaeschke, Mike Jetten, Daniel Prieur and Anne Godfroy. Presence and 

activity of anaerobic ammonium-oxidizing bacteria at deep-sea hydrothermal vents, ISME Journal advance 

online publication, July 31, 2008; doi:10.1038/ismej.2008.72 

De Busserolles F, Sarrazin J, Gauthier O , Gélinas Y, Fabri MC, Sarradin PM, Desbruyères D, Are spatial dietary 

variations of hydrothermal fauna linked to local environmental conditions? 2009, Deep Sea Research part II, 

accepted with revisions. 

Ondréas H., M. Cannat, Y. Fouquet, A. Normand, P.M Sarradin and J. Sarrazin. Recent volcanic events and the 

distribution of hydrothermal venting at the Lucky Strike hydrothermal field, Mid-Atlantic Ridge. Geochem. 

Geophys. Geosyst., doi:10.1029/2008GC002171, in press, 2009. 

Sarradin Pierre-Marie, Matthieu Waeles, Solène Bernagout, Christian Le Gall, Jozée Sarrazin, Ricardo Riso. 

Speciation of dissolved copper within an active hydrothermal edifice on the Lucky Strike vent field (MAR, 

37°N). (2009) Science of the Total Environment 407 (2) 869 

61



SHILLITO B., G. HAMEL, C. DUCHI, D. COTTIN, J. SARRAZIN, P.-M. SARRADIN, J. RAVAUX, and F. GAILL. 

Live capture of macrofauna from 2300m depth, using a newly-designed pressure recovery device. (2008). 

Deep-Sea Research I 55 881– 889. 

Vuillemin R., D. Le Roux, P. Dorval, K. Bucas, J.P. Sudreau, M. Hamon, C. Le Gall, P.M. Sarradin. CHEMINI: a 

new in situ CHEmical MINIaturized analyzer. 2009, Deep Sea Research part I. Instruments and methods, sous 

presse. 

Soumises 

Bonnivard Eric, Olivier Catrice, Juliette Ravaux, Spencer Brown, Dominique Higuet. Survey of genome size in 28 

hydrothermal vent species covering 10 families. Submitted to Genome, December 2008. 

Cuvelier, D., Sarrazin, J., Colaço, A., Copley, J., Desbruyères, D., Tyler, P., Serrão Santos, R. Distribution and 

patchiness of hydrothermal faunal assemblages on Eiffel Tower edifice: a study based on video image 

analyses. Submitted to DSR, December 2008. 

Piednoël Mathieu, Eric Bonnivard. DIRS1-like retrotransposons are widely distributed among Decapoda and are 

particularly present in hydrothermal vent organisms. Submitted to BMC Evolutionary Biology, December 2008. 

Sarrazin J., Rodier P., Tivey M.K., Singh H., Schultz A., Sarradin P.M. A dual sensor device to estimate fluid flow 

velocity at diffuse hydrothermal vents. Submitted to DSR I Instruments and methods, January 2009. 

Rubrique 2 : Publications dans d’autres revues scientifiques 

Sarrazin, J., Sarradin, P.M. and the MoMareto cruise participants, 2006, MoMARETO: a cruise dedicated to the 

spatio-temporal dynamics and the adaptations of hydrothermal vent fauna on the Mid-Atlantic Ridge. 

InterRidge News, v15, 24-33. 

Vuillemin Renaud, Dominique Le Roux, Philippe Dorval, Karenn Bucas, Agathe Laës-Huon, Michel Hamon, Jean 

Pierre Sudreau, Pierre Marie Sarradin. CHEMINI CHEmical MINIaturized Analyzer : Une nouvelle génération 

d’analyseurs chimiques in situ pour le milieu marin. Publication acceptée aux “Techniques de l’ingénieur”, 

2008. 

Rubrique 3: Publications sous forme de rapports techniques 

Sarrazin, J et Sarradin, PM. (2008) Rapport de campagne Momareto. DEEP/LEP 08/10, 380 pages. 

Ivanenko, S., Sarrazin, J. et Morineaux, M. (2008). Etude de la diversité et de la microdistribution des copépodes 

(Crustacea) dans les écosystèmes profonds associés à la chimiosynthèse. Rapport interne suite à subvention 

accueil de chercheurs étrangers Ifremer. DEEP/LEP 08/09, 36 pages. 

RUBRIQUE 4 : Presse et média 

Cette rubrique est commune à MoMARETO et EXOCET/D. 

Conférence de presse 

Sarrazin, J., Sarradin, PM (2006). Conférence de Presse de la campagne MoMARETO à l’Institut océanographique. 

Paris, le 29 juin 2006. 

Communiqués de presse. 

GRAVILUCK et MOMARETO, deux campagnes océanographiques sur la dorsale médio-Atlantique. Paris, le 29 juin 

(dossier de presse). 

Suivre la campagne océanographique MOMARETO ? Direction... la toile !. Paris le 2 août. 

Technologie : premier "direct" des grands fonds réussi. Paris le 1 er septembre. 

Dépêches AFP. 

Deux campagnes pour étudier les écosystèmes des geysers sous-marins. Paris le 29 juin. 

A la découverte des écosystèmes des geysers sous-marins, par Frédéric Garlan. Paris le 29 juin. 

Presse. 

2006 

Une mission part observer la formation de la croûte terrestre au fond de l'océan. Christiane Galus, Le Monde, 9 

août. 

Les Ecosystèmes sous-marins au peigne fin. Caroline de Malet, Le Figaro, 22-23 juillet 

Plongée visuelle dans les abysses. Libération, 4 septembre. 

Plongée au coeur des abysses. Bruno D. Cot, L'Express, 21-27 septembre. 

Voyage au centre de la mer. Vahé Ter Minassian, L'Express, 3-9 août. 

Plongée dans les abysses. Marine Cygler, Ushuaïa, 6 novembre. 

En direct des grands fonds. Fabien Grufier, Le Nouvel Observateur, 7-13 septembre. 

Momar, le premier observatoire sous-marin européen. Science et Avenir, septembre. 

Ifremer : de nouveaux outils pour conquérir les grands fonds marins. Caroline Martinat, Var-matin, 8 août. 

La campagne d'Ifremer en direct sur Internet. Ouest France, 21 août. 

A la rencontre du peuple secret des abysses. Sébastien Panou, Ouest France, 1 er septembre. 

62



Ifremer plonge sur les oasis des abysses. Sébastien Panou, Ouest France, 1 er septembre. 

L'exploration c'est leur vie. Le Monde des ados, juillet. 

Des robots à l'assaut des fonds marins. L. Salamon, Mon Quotidien, 23 août. 

Des chercheurs a-cce-ssibles ! Nathalie Blanc, Sciences Ouest, septembre. 

En direct avec les chercheurs du Pourquoi-Pas ?. Les internautes plongés dans les abysses. Sciences Ouest, 

septembre. 

Abstracts for the international issue. Sciences Ouest, septembre. 

Momar : Quelques lieux sous les mers. Mathieu Ravau, Le Journal du CNRS, 8 septembre. 

Sous l'eau. Sciences Frontières, août-septembre. 

Thalassa. Une saison dans les îles : les Açores, depuis la route du rhum. Laurent Thévenin, Télérama, 25 octobre. 

A la découverte des écosystèmes des geysers sous-marins. Affiches Parisiennes et Départementales, 25-26 juillet. 

2008 

En route pour les abysses. VIP, automne 2008. 

"Really deep-sea fishing", BBC Focus Magazine, October 2008, page 20. 

Télévision. 

Le Nautile est un sous-marin. L'Ifremer va aller scruter la croûte océanique au large des Açores. Itw de Jean-Paul 

Justiniano, pilote du Nautile. France 2, journal de 20h00, le 18 août. 

L'Ifremer a transmis des images en direct depuis le fond de l'océan. Itw de Jacques Binot responsable de la flotte 

Ifremer et de Pierre Cochonat, responsable des grands fonds. TF1, journal de 20h00, le 5 septembre. 

Après un mois passé dans l'Océan Atlantique, la campagne océanographique Momareto s'est achevée le 6 

septembre dernier. (reportage à bord du Pourquoi Pas ?). LCP-AN / Public Sénar, Le Journal des Sciences, le 28 

septembre. 

J. Sarrazin et PM Sarradin (2006). Thalassa. Interview de J. Sarrazin et de PM Sarradin. Reportage de 9 minutes 

consacré à la campagne Momareto, 3 novembre 2006. 

Radio. 

L'Ifremer va mener deux campagnes dans le Sud des Açores pour y étudier la faune et la flore des fonds marins. 

Reportage. Itw de J. Sarrazin, chef de mission. RF1 Actualités, le 1 er juillet. 

C'est arrivé demain. Itw de P.M. Sarradin et J. Sarrazin, chercheurs à l'Ifremer. Europe 1, le 13 août. 

Tout s'explique. Itw de M. Héral, directeur scientifique de l'Ifremer et de J. Sarrazin en direct du Pourquoi Pas ? 

France Inter, le 22 août. 

Reportage Itw de P.M. Sarradin chef de l'expédition Momareto, de J. Sarrazin, co-chef de mission et de D. 

Desbruyères, directeur de la mission. RFI, le 21 septembre. 

Grand reportage. Deux expéditions de l'Ifremer se sont déroulées sur le Pourquoi Pas ? RFI, le 21 septembre. 

Reportage sur la mission Momareto de l'Ifremer en direct du Grand Pavois à La Rochelle. Itw de D. Desbruyères, 

directeur de la mission et de J. Sarrazin, chef de la mission. RFI Soir, le 21 septembre. 

Des chercheurs de l'Ifremer ont réussi à retransmettre en direct des images vidéo du fond des mers. NRJ Brest, 

journal régional de 12h30, le 6 septembre. 

Web. 

Science de la terre. Un mois d'août au fond des mers (http://sciences.nouvelobs.com) 

Campagnes océanographiques jumelées (http://scienceetviejunior.fr) 

Observer la vie animale sous 800 à 2 300 m d'eau pourquoi pas ? (http://espace-sciences.org) 

Brancher les abysses sur le haut débit : pourquoi pas ? (http://espace-sciences.org) 

Campagne GRAVILUCK (http://ynet.co.il) 

L'inconcevable vie des abysses (Radio-Canada.ca) 

Exocetd/ifremer.fr 

MoMARETO/ifremer.fr 

Site internet de la BBC : http://news.bbc.co.uk/1/hi/sci/tech/7525552.stm, "Live fish caught at record depth" by Anna- 

Marie Lever, July 2008 

Rubrique 5: Publication de résumés de colloques 

*Brandou V., A. G. Allais, M. Perrier, E. Malis, P. Rives, J. Sarrazin, P. M. Sarradin. 3D Reconstruction of Natural 

Underwater Scenes Using the Stereovision System IRIS. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, Aberdeen 

Scotland. Proceedings #061215-051 

*Sarradin P.-M., J. Sarrazin, A.G. Allais, D. Almeida, V. Brandou, A. Boetius, E. Buffier, E. Coiras, A. Colaço, A. 

Cormack, S. Dentrecolas, D. Desbruyères, P. Dorval, H. du Buf, J. Dupont, A. Godfroy, M. Gouillou, J. 

Gronemann, G. Hamel, M. Hamon, U. Hoge, D. Lane, C. Le Gall, D. Leroux, J. Legrand, P. Léon, J.P. Lévèque, 

M. Masson, K. Olu, A. Pascoal, E. Sauter, L. Sanfilippo, E. Savino, L. Sebastião, R. Serrão Santos, B. Shillito, P. 

63



Siméoni, A. Schultz, J.P. Sudreau, P. Taylor, R. Vuillemin, C. Waldmann, F. Wenzhöfer, F. Zal. (2007). EXtreme 

ecosystem studies in the deep OCEan : Technological Developments. European Geophysical Union, April 2007, 

Vienna, Austria. 





Siméoni, A. Schultz, J.P. Sudreau, P. Taylor, R. Vuillemin, C. Waldmann, F. Wenzhöfer, F. Zal. EXtreme 

ecosystem studies in the deep OCEan : Technological Developments. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, 

Aberdeen Scotland. Proceedings #061215-044 

*Sarrazin J., J. Blandin, L. Delauney, S. Dentrecolas, P. Dorval, J. Dupont, J. Legrand, D. Leroux, P. Léon, J.P. 

Lévèque, P. Rodier, R. Vuillemin, P.M. Sarradin. (2007). TEMPO: a new ecological module for studying deep-sea 

community dynamics at hydrothermal Vents. MARTECH07, Conference proceedings, Instrumentation viewpoint, 

6, p. 23. 

*Sarrazin J., J. Blandin, L. Delauney, S. Dentrecolas, P. Dorval, J. Dupont, J. Legrand, C. Le Gall, D. Le Roux, M. 

Hamon, J.P. Sudreau, P. Léon, J.P. Lévèque, P. Rodier, R. Vuillemin, P.M. Sarradin. (2007) TEMPO: a new 

ecological module for studying deep-sea community dynamics at hydrothermal vents. Abstract et poster 

présenté au congrès Martech, Barcelone, novembre 2007. 


Lévèque, P. Rodier, R. Vuillemin, P.M. Sarradin. TEMPO: a new ecological module for studying deep-sea 

community dynamics at hydrothermal Vents. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, Aberdeen Scotland. 

Proceedings #061215-042 

*Sarrazin J., P.M. Sarradin, E. Buffier, A. Christophe, G. Clodic, D. Desbruyères, Y. Fouquet, M. Gouillou, M. 

Jannez, Y. Le Fur, J. Le Rest, F. Lecornu, O. Lefort, S. Lux, B. Millet, P. Guillemet. A real-time dive on active 

hydrothermal vents. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, Aberdeen Scotland. Proceedings #061215-068 

*Simeoni, P., Sarrazin, J., Nouzé, H., Sarradin, PM, Ondreas, H., Scalabrin, C., & Sinquin, JM. (2007). Victor 6000: 

New High Resolution Tools for Deep Sea Research. «Module de Mesures en Route». OCEANS07 IEEE 

Aberdeen, June 2007, Aberdeen Scotland. Proceedings #061212-006 

*Vuillemin R., D. Le Roux, P. Dorval, M. Hamon, J. P. Sudreau, C. Le Gall and P.M. Sarradin (2007). CHEMINI : 

CHEmical MINIaturised analyser : A new generation of in situ chemical analysers for marine applications. 

MARTECH07, Conference proceedings, Instrumentation viewpoint, 6, p.9. 

Rubrique 6: Communications dans des colloques internationaux 

Communications orales 

*Brandou V., A. G. Allais, M. Perrier, E. Malis, P. Rives, J. Sarrazin, P. M. Sarradin. 3D Reconstruction of Natural 

Underwater Scenes Using the Stereovision System IRIS. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, Aberdeen 

Scotland. Oral presentation. 

Byrne Nathalie, Marc Strous, Valentin Crépeau, Boran Kartal, Jean-Louis Birrien, Markus Schmid, Françoise 

Lesongeur, Stefan Schouten, Andrea Jaeschke, Mike Jetten, Daniel Prieur and Anne Godfroy. Presence and 

activity of anaerobic ammonium-oxidizing bacteria at deep-sea hydrothermal vents. Extremophiles 2008, Cape 

Town South Africa 

Colaço Ana, Pierre Marie Sarradin. MoMAR-D: ESONET demonstration mission, All regions workshop- 5,6,7 

september, Barcelona Spain. 

Cuvelier D., Sarrazin J., Colaço A., Copley J., Desbruyères D., Tyler P., Serrão Santos R. Distribution of faunal 

assemblages on the Eiffel Tower hydrothermal structure (Lucky Strike) based on image analyses. MarBEF 

General Assembly Gdansk Poster presentation (May 2007) 


assemblages on the Eiffel Tower hydrothermal structure (Lucky Strike) based on image analyses. 

Rocks&N&beasts ? Interdisciplinary conference on vent systems - Leeds (June 2007) Oral Presentation 

Halary S, Riou V, Frébourg G, Boudier T, Gaill F, Duperron S. Investigating symbiont densities and localization in 

hydrothermal vent and cold seep mytilids using fluorescence hybridization techniques and image analysis. 

Geophysical Research Abstracts, Vol. 9, 03840, 2007 © European Geosciences Union 2007 

Legendre, P. 2007. Momareto: exploration of hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge. Symposium on 

Quantitative Ecology, Academia Sinica, Taipei, Taiwan. August 3, 2007. Oral 

Martins I., Colaço A., Lesongeur F., Godfroy A., Sarradin P-M., Cosson R.P. & Serrao Santos R. Metal exposure and 

physiological condition of mussel Bathymodiolus azoricus from Eiffel Tower hydrothermal vent site. PRIMO 14 

Meeting (Pollutants Responses In Marine Organisms), Florianopolis, Brazil, May 2007. 

64







Siméoni, A. Schultz, J.P. Sudreau, P. Taylor, R. Vuillemin, C. Waldmann, F. Wenzhöfer, F. Zal. EXtreme 

ecosystem studies in the deep OCEan : Technological Developments. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, 

Aberdeen Scotland. Oral presentation. 

Sarradin P.M., The French MoMAR project. InterRidge Theoretical Institute, September 2007, Woods Hole USA. 

Sarradin Pierre-Marie, Jozée Sarrazin, Yves Fouquet, Daniel Desbruyères, FEED BACKS : 3 multidisciplinary cruises 

on the Pourquoi pas ? TSM 2007, Décembre 2007, La Londe les Maures, Fr. 



community dynamics at hydrothermal Vents. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, Aberdeen Scotland. Oral 

presentation. 



community dynamics at hydrothermal Vents. MARTECH07,Conference proceedings, Instrumentation 

viewpoint, 6, p. 23. 

*Sarrazin J., P.M. Sarradin, E. Buffier, A. Christophe, G. Clodic, D. Desbruyères, Y. Fouquet, M. Gouillou, M. 

Jannez, Y. Le Fur, J. Le Rest, F. Lecornu, O. Lefort, S. Lux, B. Millet, P. Guillemet. A real-time dive on active 

hydrothermal vents. OCEANS07 IEEE Aberdeen, June 2007, Aberdeen Scotland. Oral presentation. 

Sarrazin, J. Momareto : a cruise to study the mysteries of deep-sea hydrothermal vents. 8ème congrès des étudiants du 

GEOTOP, Pohénégamook, Québec, Canada. 8-10 février 2008. (De Cian et al.). 

*Simeoni, P., Sarrazin, J., Nouzé, H., Sarradin, PM, Ondreas, H., Scalabrin, C., & Sinquin, JM. (2007). Victor 6000: 

New High Resolution Tools for Deep Sea Research. «Module de Mesures en Route». OCEANS07 IEEE 

Aberdeen, June 2007, Aberdeen Scotland. 

*Vuillemin R., D. Le Roux, P. Dorval, M. Hamon, J. P. Sudreau, C. Le Gall and P.M. Sarradin. CHEMINI : CHEmical 

MINIaturised analyser : A new generation of in situ chemical analysers for marine applications. 

MARTECH07,Conference proceedings, Instrumentation viewpoint, 6, p.9. 

Posters 

Bruneaux M., Leize E., Lallier F.H., Zal F., Short term adaptive response and phenotypic plasticity of crustacean 

hemocyanins : study of Carcinus maenas and Segonzacia mesatlantica, poster, Society for Experimental 

Biology annual main meeting, 3-14 th April 2007, Glasgow 

Bruneaux M., Pasquier J., Terrier P., Leize E., Lallier F.H., Zal F., Respiratory adaptations of a deep-sea 

hydrothermal crustacean, the crab Segonzacia mesatlantica, poster, Society for Experimental Biology 

annual main meeting, 6-10 th July 2008, Marseille 

Byrne, N., F. Lesongeur, D. Prieur, and A. Godfroy. (2007) Diversity of thermophilic microbial populations in deep 

sea hydrothermal vent chimney: cultural approach in bioreactor. Thermophiles, Bergen (Norvège). 


assemblages on the Eiffel Tower hydrothermal structure (Lucky Strike) based on image analyses. InterRidge 

Theoretical Institute on Biogeochemical interactions at Deep-sea vents. Woods Hole (September 2007) Poster 

Presentation 

Dutertre M., Rosa P. & Cosson R.P. Is there a relationship between Bathymodiolus azoricus gill size and its 

environmental conditions? Journées du GDR ECCHIS, Roscoff, France, Avril 2007 (P). 

Piednoël Mathieu, Dominique Higuet, Eric Bonnivard. DIRS-like retrotransposons are common among 

hydrothermal shrimps. ICTE International Congress on transposable Elements, April 20-23, 2008, Saint Malo, 

France. 

Riou V, Halary S, Martins I, Korntheuer M, Costa V, Laranjo M, Pires L, Leal C, Duperron S, Colaço A, Bouillon S, 

Serrão Santos R, Dehairs F. Nutrition study of Bathymodiolus azoricus from Menez Gwen: development of 

stable isotope enrichment techniques to follow the assimilation pathways by symbiosis versus filter-feeding. 

Geophysical Research Abstracts, Vol. 9, 04445, 2007 © European Geosciences Union 2007 

*Vuillemin R., D. Le Roux, P. Dorval, M. Hamon, J. P. Sudreau, C. Le Gall and P.M. Sarradin. CHEMINI : 

CHEmical MINIaturised analyser : A new generation of in situ chemical analysers for marine applications. 

European Geophysical Union, April 2007, Vienna, Austria. 

Rubrique 7: Communications dans des colloques nationaux 

Communications orales 

65



Legendre, P. 2006. Momareto : exploration des sources hydrothermales de la dorsale médio-atlantique. Séminaire, 

Laboratoire de biologie marine, Université des Antilles et de la Guyane, Pointe-à-Pitre. 24 octobre 2006. 


Département de chimie-biologie, Université du Québec à Trois-Rivières, 16 novembre 2006. 


Département de biologie, Université Laval, Québec, 24 novembre 2006. 

Legendre, P. 2007. Momareto : exploration des sources hydrothermales de la dorsale médio-atlantique. 

Conférence dans le cadre du cours Bio 1803 Écologie et environnement, Université de Montréal, 22 mars 2007. 

Legendre, P. 2007. Momareto : exploration des sources hydrothermales de la dorsale médio-atlantique. Séminaire 

d'écologie aquatique, Département de sciences biologiques, Université de Montréal. 1er octobre 2007. 


Master 2 Biodiversité tropicale, Université des Antilles et de la Guyane, Pointe-à-Pitre. 22 octobre 2007. 

Legendre, P. 2007. Momareto : exploration des sources hydrothermales de la dorsale médio-atlantique. 

Conférence dans le cadre du cours Bio 1803s Écologie et environnement, Université de Montréal, 14 novembre 

2007. 

Legendre, P. 2008. MoMARETO: exploration of hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge. Public lecture, 

School of Environmental Systems Engineering and Institute of Advanced Studies, University of Western 

Australia, Perth, Australia, March 10, 2008. 

Legendre, P. 2008. MoMARETO: exploration of hydrothermal vents on the Mid-Atlantic Ridge. UWA Albany 

Skywest Lecture, University of Western Australia Albany Centre, Albany, Western Australia, March 17, 2008. 

Anne Godfroy, Nathalie Byrne, Anne Postec et Françoise Lesongeur. Cultures de communautés microbiennes 

thermophiles des écosystèmes hydrothermaux en bioréacteur. Workshop "Méthodes de culture et bactéries non 

cultivables". Association Francophone d’Ecologie Microbienne Banyuls juin 2008 

Cuvelier, D.; Sarrazin J.; Colaço A.; Copley J. ; Desbruyères, D. ; Tyler, P.; Serrão Santos, R. (2008 ). Distribution 

et variation des assemblages de faune sur l’édifice hydrothermal Tour Eiffel – Extraction des données 

biologiques basée sur les images de MoMARETO 2006. Journées Ecchis (Biologie des ecosystèmes 

chimiosynthetiques profonds), Roscoff, France, 7-8 January 2008 

Enseignement 

Legendre, P. 2007. “Momareto : Exploration des sources hydrothermales de la dorsale médio-atlantique”. 

Conférence dans le cadre du cours Écologie et environnement, Bio 1803, à l’Université de Montréal. 22 mars 

2007. 

Legendre, P. 2008. “Momareto : Exploration des sources hydrothermales de la dorsale médio-atlantique”. 

Conférence dans le cadre du cours Écologie et environnement, Bio 1803, à l’Université de Montréal. 12 

novembre 2008. 

Posters 

Bruneaux M., Terrier P., Legendre P., Pasquier J., Lallier F.H., Zal F., Leize E., Analyse statistique multivariable de 

données obtenues en ESI-MS : l’exemple de la plasticité phénotypique de l’hémocyanine de Crustacé chez 

les crabes Carcinus maenas et Segonzacia mesatlantica, poster, 25 èmes Journées Françaises de Spectrométrie 

de Masse, 8-10 th September 2008, Grenoble 

Byrne N., V. Crepeau, J-L. Birrien, M. Strous, M. Schmid, B. Kartal, F. Lesongeur, D. Prieur, A. Godfroy. (2007) 

Recherche de bactéries Anammox dans les ecosystèmes hydrothermaux profonds de la dorsale médio 

atlantique. 3éme Congrès d’Ecologie Microbienne de l’association Francophone d’Ecologie Microbienne 

Montpellier 

Byrne, N., F. Lesongeur, D. Prieur, A. Godfroy. (2007) Diversité métabolique des micro-organismes des édifices 

hydrothermaux actifs: cultures d’enrichissement en bioréacteur. 3éme Congrès d’Ecologie Microbienne de 

l’association Francophone d’Ecologie Microbienne Montpellier 

Terrier P., Bruneaux M., Zal F., Potier N., Leize-Wagner E., Analyse par spectrométrie de masse supramoléculaire 

des pigments respiratoires d’invertébrés marins: apport du suivi de leur dénaturation, poster, 24 ème Journées 

Françaises de Spectrométrie de Masse, 16-20 th September 2007, Pau 

Rubrique 8: Rapports de contrats (CEE, FAO, Convention, Collectivités …) 

Marie Curie Actions RTN Periodic Activity Report for MOMARNET from 01/09/2005 to 31/08/2006 (Monitoring deep 

seafloor hydrothermal environments on the Mid-Atlantic Ridge No.: 505026) for the EUROPEAN 

COMMISSION, RESEARCH DG HUMAN RESOURCES AND MOBILITY. Dr. Mathilde Cannat, INSTITUT DE 

PHYSIQUE DU GLOBE DE PARIS. 

Marie Curie Actions RTN Mid-Term Activity Report for MOMARNET from 01/09/2004 to 31/08/2006. 

*Sarradin P.M., EXOCET/D periodic management report, DEEP/LEP 07-26, 2007. 

*Sarradin P.M., EXOCET/D periodic activity report, DEEP/LEP 07-17, 2007. 

66



Rubrique 10: Brevets - Enveloppes Soleau 

*D. Le Roux, R. Vuillemin, 09 septembre 2004. Réalisation d’un circuit hydraulique gravé en PMMA. Enveloppe 

Soleau 206598 170904 registered at the INPI 

*Zal, F., Enveloppe Soleau n°210573 déposée le 29 octobre 2004 « Conception et réalisation d'un respiromètre 

haute pression pour l'étude d'organismes marins abyssaux : système DESEARE « Deep-Sea Respirometer »» 

Rubrique 12: Documents vidéo-films 

Reportage sur la chaîne de télévision locale portugaise RTP Açores dans le documentaire “Mar à vista”. Filmé par 

José Serra durant la campagne MOMARETO. 

MoMARETO : morceaux choisis. M. Gouillou, J. Sarrazin et P.M. Sarradin. Ifremer. 

Rubrique 13: Publications électroniques sur le réseau Internet 

*Tous les résultats du projet européen EXOCET/D sont publiés sur le site Exocetd/ifremer.fr 

MoMARETO/ifremer.fr 

Rubrique 14: Stagiaires ayant utilisé les données de la campagne 

Master 2 

de Busserolles, Fanny. Master 2, Sciences de la Mer et du Littoral, mention Sciences Biologiques Marines. 

Comparaison de différents microhabitats colonisés par Bathymodiolus azoricus sur le site hydrothermal Tour 

Eiffel (Lucky Strike, dorsale médio-Atlantique). (Supervisé par Jozée Sarrazin) Rapport de Master 2, 

IUEM/UBO, Brest. Juin 2007. 

*Bernagout Solène. Spéciation du cuivre dissous sur le site hydrothermal Tour Eiffel, Lucky Strike (MAR, 37°N) 

Master 2 Sciences Chimiques de l’Environnement Marin. DEEP/LEP 07/10, 2007. Brest, Juin 2007. Supervisé 

par P.M. Sarradin et R. Riso. 

Crépeau Valentin M2 UBO Recherche de micro-orgaismes Anammox dans les écosystèmes hydrothermaux 

océaniques profonds. (Supervisé par A. Godfroy et N. Byrne) juin 2007. 

Master 1 

Leroy Mathilde M1 UBO Isolement de microorganismes ferroreducteur ddes édifices hydrothermaux 

actifs.(Supervisé par A. Godfroy et J. Holden University of Massachusetts, Amherst, USA) 2008. 

Serre Martin M1 Contribution à l'étude de la diversité dans les tapis microbiens associées aux assemblages de 

moules sur le site hydrothermal Lucky Strike. Approches moléculaires (taxonomique) et culturales de la 

diversité (supervisé par A. Godfroy), 2007. 

Floc’h, Estelle. Master 1 de l'Université de LaRochelle. Extraction de données biologiques à partir de l’imagerie 

vidéo : jusqu’où peut-on aller ? (supervisé par J. Sarrazin et PM Sarradin) Janvier-Février 2008. 

DUT 

Cornec Clément, IUT (Brest). Contribution à l’étude des variations temporelles de la diversité microbienne dans un 

édifice hydrothermal actif. (Supervisé par N. Byrne et F. Lesongeur) 2008. 

Rubrique 15: Thèse et post-doctorat ayant utilisé les données de la campagne 

Thèses 

Brandou, Vincent. Stéréovision locale et reconstruction 3D/4D. Soutenue le 9 décembre 2008. 

Bruneaux Matthieu, Equipe Ecophysiologie CNRS/UPMC, UMR7144, « Adaptations respiratoires à court terme et 

plasticité phénotypique des hémocyanines de crustacés », soutenance décembre 2008 

Byrne Nathalie. Diversité métabolique des communautés microbiennes des édifices hydrothermaux actifs. 

(Supervisé par A. Godfroy et D. Prieur) soutenue Décembre 2008. 

Crepeau Valentin. Les micro-organismes des tapis microbiens des écosystèmes hydrothermaux sous-marins 

profonds. Interactions avec le biotope. (supervisé par A. Godfroy) soutenance prévue 2010 

Cuvelier, Daphne. Dynamique temporelle du champ hydrothermal Lucky Strike dans le cadre du réseau européen 

MARBEF. (Co-supervision Ifremer –J. Sarrazin et D. Desbruyères, SOC et Université des Açores. 2005-2008. 

Halary, Sébastien. Thèse réalisée au laboratoire d’Adaptation aux Milieux Extrêmes de Université Pierre et Marie 

Curie à Paris. 

Martins, Inès, IMAR/DOP, Ecotoxicology response of mussel Bathymodiolus azoricus within the fauna of Lucky 

Strike hydrothermal vent: microenvironment biotic and abiotic influence”. 

Piednoël, Mathieu. Génétique comparée des éléments transposables des crustacés décapodes des sources 

hydrothermales. (supervisé par E. Bonnivard) soutenance prévue 2010 

67



Riou, Virginie. Thèse financée par le Marie Curie Research Training Network MoMARnet et réalisée à l’Université 

des Açores, et à la Vrije Universiteit Brussel. 

Post-doctorat 

Barnay, Anne-Sophie. Post-doctorat Ifremer, Janvier-Août 2007. Développement d’une approche statistique et 

d’une stratégie d’échantillonnage pour l’étude des communautés chimiosynthétiques des écosystèmes 

marins profonds. Au cours de son séjour Anne-Sophie a surtout traité les données de température acquises 

lors de la campagne Momareto à l’aide d’une méthode statistique innovante, les Coordonnées Principales des 

Matrices de Voisinage, données qui devraient être publiées au cours de 2008. Supervision J. Sarrazin, PM 

Sarradin 

Gauthier, Olivier. Post-doctorat financé par l’ANR DEEP OASES sur le développement d’une approche statistique et 

d’une stratégie d’échantillonnage pour l’étude des communautés chimiosynthétiques des écosystèmes 

marins profonds. Analyses et optimisation d’indices de diversité de faune. (2008) En cours. Supervision J. 

Sarrazin 

Rubrique 16: Conférences grand-public 

*J. Sarrazin et P.M. Sarradin (2006) MoMARETO, une campagne pour étudier les mystères des sources 

hydrothermales. Océanopolis, Brest, 03/11/2006, Festival du film d’aventure océanographique. 

*J. Sarrazin (2007) MoMARETO, une campagne pour étudier les mystères des sources hydrothermales. Centre 

Ifremer de Nantes, 23/01/2007, Séminaire des nouveaux embauchés. 

*J. Sarrazin (2007) MoMARETO, une campagne pour étudier les mystères des sources hydrothermales. Conférence 

grand public, 07/02/2007, Cœur des Sciences, Université du Québec à Montréal, Québec, Canada. 

*J. Sarrazin (2007) MoMARETO, une campagne pour étudier les mystères des sources hydrothermales. Conférence 

grand public, 12/02/2007, Université de Sherbrooke, Québec, Canada. 

*J. Sarrazin et PM Sarradin (2007) MoMARETO, une campagne pour étudier les mystères des sources 

hydrothermales. Conférence grand public, 20/02/2007, Espace des Sciences, Rennes. 

*J. Sarrazin et PM Sarradin (2007) Conférence grand public "Quoi de neuf sous la mer ?". 22/11/2007, Centre 

Ifremer de Nantes. 

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BioBaz Campagnes Couv - Station Biologique de Roscoff

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