Master de Physique ou de Nanosciences Nanotechnologie - UFR ...

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Master de Physique ou de Nanosciences Nanotechnologie - UFR Phitem
Sujet de stage proposé
Laboratoire : Institut de Biologie Structurale Jean-Pierre Ebel
Directeur : Eva Pebay-Peyroula
Intitulé de l'équipe : CHANNELS
Responsable : Michel VIVAUDOU
Nom et Qualité du Responsable du Stage : Christophe MOREAU
HDR (oui ou non) : non
Adresse : Institut de Biologie Structurale – 41 rue Jules Horowitz – 38027 Grenoble Cedex 1
Tél : 04.38.78.48.67
Email : christophe.moreau@ibs.fr
Spécialité MASTER (à choisir parmi Exploration du Vivant et de l’Environnement (EVE),
Nanophysique, Nanostructures (NN), Physique de la Matière Condensée et du Rayonnement
(PMCR)): EVE
Titre du sujet : Structure-function studies of Biosensors Engineered by Assembly of Receptors and Ion
Channels
Objectifs visés du stage (5 lignes max) :
Ce stage aura pour objectif de mieux comprendre les mécanismes moléculaires gouvernant une protéine
de fusion entre un récepteur membranaire et un canal ionique en utilisant une approche structurefonction.
Intérêts pédagogiques et compétences visées (5 lignes max) :
L'intérêt pédagogique de ce stage est de réaliser un sujet de la conception des protéines modifiées par
génie génétique à leur caractérisation physiologique. L'étudiant(e) acquerra une compétence technique
dans ces domaines et développera son autonomie en évoluant au sein d'une équipe internationale.
Résumé du sujet de stage :
We have devised a novel type of bio-inspired sensors, Ion-Channel Coupled Receptors (ICCR), based on
the fusion of receptors with an ion channel serving as an electrical probe. Binding of a ligand to the receptor
triggers opening of the associated ion channel and an increased ion flux that is easily detectable using
existing electrophysiological techniques. This concept was validated by the creation of ICCRs between a
potassium channel and several G-protein coupled receptors (GPCR). The Master internship shall concern
the structure-function study of receptor-channel interactions in existing ICCRs. Work will involve molecular
engineering and biophysics (electrophysiology). It should establish the foundation of high-performance
bioelectrical sensors while providing a better understanding of the molecular mechanisms of GPCR
activation and ion channel gating. Although this project has a strong biotechnological flavor, the approach
shall remain very fundamental with a strong focus on the structure and function of membrane proteins and
on their interactions.
Références afférentes au sujet de stage :
- Moreau CJ et al. (2008) Nature Nanotech., 3:620-5.
- Caro LN et al. (2011) PloS ONE, 6:e18226.
Approches & matériels utilisés (5 lignes max) :
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L'équipe possède une expertise dans l'ingénierie des protéines par génie génétique et la caractérisation
électrophysiologique des canaux ioniques. Les techniques utilisées incluent la mutagenèse dirigée et la
fusion de gènes par PCR classiques et particulières (avec megaprimers), ainsi que la synthèse in vitro
d'ARNm, la micro-injection des ARNm dans les ovocytes de Xénope et la caractérisation fonctionnelle des
canaux ioniques par les techniques de double-electrode et de patch-clamp.
Domaines de compétences souhaitées du candidat (3 lignes max):
Le ou la candidat(e) devra faire preuve de beaucoup de rigueur dans la réalisation et le suivi des
expériences et être capable de communiquer à l'écrit et à l'oral en anglais (l'équipe d'accueil est
composée de membres non francophones).
Le sujet peut-il donner lieu à une poursuite en thèse ? oui
Dates du stage : Mars-Juin 2013
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