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On remarque donc, comme d'autres auteurs qui ont travaillé avec des séqunces
complètes (Staeckbrand et al. , 1988; Schleifer et al., 1989), que les genres lactobacillus et
Pediococcus ne sont pas génétiquement aussi distincts.
-Chez Leuconostoc et Weissella
L'ancien genre Leuconostoc a été recemment divisé en trois lignées génétiques
distinctes comme l'ont suggéré certains auteurs (Collins et al., 1993; Thunel, 1995). On aura
leuconostoc sensu stricto, le groupe leuconostoc paramesenteroides constitué des
lactobacillus atypiques (Lactobacillus confusus, Lactobacillus minor, Lactobacillus kandleri,
Lactobacillus halotolerante, et Lactobacillus viridescens) et Leuconostoc oenos qui à elle
seule forme un groupe distinct.
L'étude des séquences 16S et la détermination d'autres caractères a permis de reclasser
les lactobacillus atypiques dans le nouveau genre Weissella et Leuconostoc oenos dans un
autre genre dénommé Oenococcus (Schleifer et al., 1995).
La comparaison des séquences 16S chez les leuconostocs sensu stricto laisse paraître
que ce genre est relativement hétérogène.
Les leuconostocs sensu stricto isolés de nos échantillons peuvent être répartis dans trois
lignées distinctes.
La première lignée est constituée des souches proches de Leuconostoc mesenteroides et
de Leuconostoc pseudomesenteroides. Les souches de cette lignée ne différent que sur deux
bases au maximum dans la région de 1'hélice 6 et elles ne sont pas non plus identiques en ce
qui concerne les caractères biochimiques et les traits morphologiques. Des investigations plus
poussées à savoir une comparaison des séquences complètes 16S et 23S et 1'hybridation avec
les sondes génétiques spécifiques à LeuconoSIOC mesenteroides méritent d'être menées sur
cette 1ignée.
La seconde lignée est constituée par les espèces référence Leuconostoc amelibiosum,
Leuconostoc citreum, Leuconostoc lactis, Leuconostoc gelidum, Leuconostoc carnosum et les
souches 209a, 202 et 260.
La troisième lignée est constituée par Leuconostoc fructosus (ex Lactobacillus
fructosus) et les souches 227, 250 et 251. Ces souches, identiques au niveau de la région de
l'hélice 6 présentent des séquences complètes 16S avec un nombre important de nucléotides
différents (quinze nucléotides).
L'arbre phylogénétique dressé à partir des séquences de l'hélice 6 du gène ARNr 16S
des leuconostocs de nos échantillons et des souches de référence montre, tout comme la
comparaison directe de ces séquences, que Leuconostoc fallax aussi constitue un groupe à
part dans cette lignée et devrait faire l'objet d'une reclassification comme ce fut le cas avec
Leuconostoc oenos (figure 49).
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