THS-6596.pdf

La comparaison des séquences complétes des souches du sous-groupe 6 avec celle de
Leuconostocfructosus montre une vingtaine de bases différentes.
Gène 16S de Leuconostoc sp. 227
1 AGU UUG AUC AU- AGC UCA GGA UGA ACG CUG GGC GGC UGC CUA AUA CAU GCA AGU CGU ACG
61 A-A CAG C - - - - - -GG AAA GUG CUU GCA CUU UCC - - - - - - - - - - - A AGU AAG -UG GCG AAC
121 GGG UGA GUA ACA CGU GAA UAA CCU ACC UCA AAG ACU GGG AUA ACC AUU GGA AAC AGU GAC
181 UAA UAC CGG AUA AAA CCC AGU AGC ACA UGC UAC AAG GUU AAA AGC UGC -GU UUG CAG CGC
241 UUU AAG AUG GAU UCG CGG UGC AUU AGU UAG UUG GUG AGG UAA AGG CUC ACC AAG ACA AUG
301 AUG CAU AGC CGA GUU GAG AGA CUG ACC GGC CAC AUU GGG ACU NAG ACA CGG CCC AAA CUC
361 CUA CGG GAN GCU GCA GUA GGG AAU CUU CCA CAA UGG GCG CAA GCC UGA UGG AGC AAC GCC
421 GCG UGU GUG AUG AAG GCU UUC GGG UCG UAA AGC ACU GUU GUA UGG GAA GAA CGG GUU UAA
481 GAG GAA A-U GCU UAA GCA GUG ACG GUA CCA UAC CAG AAA GGG ACG GCU AAA UAC GUG CCA
541 GCA GCC GCG GUA AUA CGU AUG UCC CGA GCG UUA UCC GGA UUU AUU GGG CGU AAA GCG AGC
601 GCA GAC GGU UCG AUA AGU CUG AAG UGA AAG CCC ACA GCU CAA CUG UGG AAU GGC UUU GGA
661 AAC UGU CGA ACU UGA GUG CAG UAG AGG UAA GUG GAA CUC CAU GUG UAG CGG UGG AAU GCG
721 UAG AUA UAU GGA AGA ACA CCA GUG GCG AAG GCG GCU UAC UGG ACU GCA ACU GAC GUU GAG
781 GCU CGA AAG UGU GGG UAG CAA ACA GGA UUA GAU ACC CUG GUA GUC CAC ACC GUA AAC GAU
841 GGA UAC UAG UUG UUA GAG GGU UUC CGC CCU UUA GUG ACG AAG CAA ACG CAU UAA GUA UCC
901 CGC CUG GGG AGU ACG ACC GCA AGG UUG AAA CUC AAA GAA AUU GAC GGG GAC CCG CAC AAG
961 CGG UGG AGC AUG UGG UUU AAU UCG AAG CAA CGC GAA GAA CCU UAC CAG GUC UUG ACA UC-
1021 CUU UGA AGG UAC UA- GAG AUA GUG CUG -UC UUC UUC GGA AGC AAA GUG ACA GGU GGU GCA
1081 UGG CCG UCG UCA GCU CGU GUC GUG AGA UGU UGG GUU AAG UCC CGC AAC GAG CGC AAC CCU
1141 UAU GUU UAG UUG CCA GCA UUC AGU UGG GCA CUC UAG ACA GAC UGC CGG UGA CAA ACC GGA
1201 GGA AGG CGG GGA CGA CGU CAG GUC AUC AUG CCC CUU AUG GUG AAG GUG AGC GAA UCU CUU
1261 AAA GUA CGU CUC AGU UCG G N NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN .AA UCG CUA
1321 GUA AUC GCG GAU CGA GCA UGC GGC GGU GAA UAC GUU CCC GGG UCU UGU ACA CAC CGC CCG
1381 UCA CAC CAU GGG AGU UGG UAA UGC CCA AAG CCG GUG GCC UAA CC- UUC G-G GAA GGA GCC
1441 GUA UAA GGC AGG ACU GA- UGA CUG GGG UGA AGU CGU AAC AAG GUA GCC GUA GGA GAA CCU
1501 GCG GCU GGA UCA CCU CCU UU
Figure 27: Alignement de la séquence complète du gène d'ARNr 16S chez Leuconostoc_sp.
227. Les symboles sont les mêmes que ceux sur la figure 17.
peR fingerprinting des leuconostocs
La comparaison des profils obtenus après électrophorèse des produits résultants de
l'amplification de l'ADN avec une amorce arbitraire (figure 28) permet de faire plusieurs
constats.
Les souches 2ü9b, 218, 275, 278 et 292 ont des profils semblables.
Les souches 245, 261,226 et 228 présentent des profils assez proches entre.
Il n'y a aucune identité entre les profils des Leuconostocs isolées de nos échantillons et
celles des souches de Leuconsotocs connues.
La souche 227 et Leuconostoc fructosus n'ont pas de profils identiques ce qui rend
nécessaire une comparaison des séquences ARNr 16S complètes de ces deux souches.
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