Vol. 32 – 2006 - Ecologia Mediterranea

Les chapitres 1, 2 et 3 présentent respectivement le
contexte de la thèse (AFIDOL, INRA, IMEP) ainsi que les obligations
vis-à-vis de l’AFIDOL du fait de la convention
CIFRE, le modèle d’étude au travers du complexe botanique
Olea europaea, et le matériel collecté et les méthodes utilisées.
Le chapitre 4 est consacré à la caractérisation du matériel
sauvage, à l’étude des populations, et à la recherche des
lignées ancestrales de l’oléastre. Nous décrivons la diversité
génétique actuelle de l’oléastre afin d’inférer les migrations
de l’oléastre et d’inclure les lignées ancestrales
reconstruites, par notamment une méthode statistique bayésienne,
dans un schéma de recolonisation de l’oléastre
depuis les dernières glaciations.
Le chapitre 5 décrit les relations du complexe sauvage pour
deux îles : Chypre à l’est, et la Corse à l’ouest du bassin
méditerranéen. Bien qu’elles ne soient pas les plus distantes
géographiquement, ces deux îles abritent les individus
qui sont les plus différenciés d’un point de vue génétique.
Les analyses de diversité mettent en exergue les
conséquences des flux de gènes depuis le continent, dont
les conséquences sur la différenciation des populations sont
analysées.
Le chapitre 6 aborde l’impact de la domestication sur la
diversité génétique des formes cultivées. Les 882 cultivars
sont issus de plusieurs lignées domestiquées reconstruites
par la méthode bayésienne. Afin de proposer des foyers de
domestication, la correspondance entre les lignées domestiquées
et les zones ancestrales d’oléastre sera donc testée.
Les objectifs appliqués sont ici de renseigner sur l’origine
locale éventuelle des variétés pouvant mener à argumenter
de manière optimale les dossiers de demande d’AOC * ou
d’IGP * (Indication géographique protégée, produits d’une
région bénéficiant d’un label géographique) avec des cultivars
d’origine locale.
Le chapitre 7 sera consacré aux relations entre individus
des sites assez peu perturbés par l’homme (« naturels ») et
ceux des zones cultivées. Le mécanisme inverse de la
domestication, la dédomestication, est décrit ainsi que ses
conséquences génétiques et écologiques sur les écosystèmes.
Mon étude s’est penchée sur le département du Var
où une cinquantaine de variétés est cultivée. Dans ce même
département, sur la côte et au sein du Parc national de Port-
Cros, le statut (sauvage ou féral) de nombreux individus
poussant en conditions « naturelles » reste indéterminé.
L’origine locale de cultivars dans des oléastres locaux est
une hypothèse à vérifier.
Le modèle de la féralité de l’olivier en Australie paraît intéressant
à étudier dans ce contexte car la date d’introduction
des variétés d’olivier est connue. Les formes spontanées
échappées correspondent à des formes sauvages de
subsp. europaea et parfois de subsp. cuspidata. Ainsi, les
événements sont datés et il sera possible d’estimer le
nombre de générations, ce qui n’est pas faisable dans le
Var. Cette confrontation nous permettra de proposer une
explication au phénomène de dédomestication.
Enfin, le chapitre 8 est consacré à la synthèse des différentes
parties. Un scénario de diffusion postglaciaire de
ecologia mediterranea – Vol. 32 – 2006
Résumés de thèses
l’oléastre est proposé. Afin d’étudier l’évolution de la
forme sauvage de l’olivier, il faut rechercher la localisation
de zones où le processus de domestication s’est probablement
déroulé. L’examen des lignées ancestrales d’olivier
en sélection sera donc développé. La comparaison de ces
travaux sera effectuée avec les résultats obtenus par
l’équipe de J.-F. Terral (université de Montpellier).
Pour cette étude, 960 oléastres ont été échantillonnés tout
autour du bassin méditerranéen, ils représentent ainsi 76
peuplements. En outre, 882 cultivars ont été choisis afin de
représenter l’ensemble de la diversité basée sur les marqueurs
RAPD. Nous avons estimé l’étendue de la diversité
génétique sans aucune classification a priori. Chaque
échantillon est anonyme, ils ne présentent aucun statut. Les
populations primaires d’oléastres ont été définies en utilisant
une méthode d’agrégation bayésienne permettant
d’identifier les flux de gènes et les hybrides cryptiques avec
les formes cultivées. La méthode d’assignation (admixture)
sépare les oléastres de chaque région en différents groupes
qui constituent finalement 9 populations primaires. Les
autres oléastres sont le résultat d’une hybridation entre
formes sauvages et formes cultivées à partir des populations
primaires. La structure des oléastres révèle différents
lignages en accord avec les aires géographiques qui correspondraient
à des zones refuges pendant les dernières glaciations.
Ces populations établissent un schéma complexe
de la répartition géographique comme étant la conséquence
des flux de gènes par les graines. La Corse et la Sicile ont
joué un rôle majeur dans la différenciation des oléastres
puisque 3 sur 9 des populations existantes dans le bassin
méditerranéen sont présentes sur ces îles.
L’olivier, une des espèces emblématiques du bassin méditerranéen
avec le figuier et la vigne, est associé aux rites
sacrés par l’onction et à la vie économique moderne par les
compléments de revenus et le développement touristique
et culturel qu’il engendre. Pourtant son histoire est mal
connue. Associée aux mythes fondamentaux de l’histoire
de nos civilisations, les auteurs ont laissé vaguer leur imagination
pour retracer l’histoire de l’olivier. Les preuves
historiques manquent et les écrits anciens grecs et romains
sont souvent des compilations ou des réécritures auxquelles
on ne peut accorder confiance quand les sources font
défaut.
L’histoire de vie d’une espèce est marquée dans le génome
des individus et leur distribution actuelle permet de dessiner
les diagrammes de la répartition passée lors d’événements
géologiques et historiques majeurs. L’impact des
dernières glaciations pour les espèces sauvages et celui de
la domestication pour la forme cultivée ont marqué le
génome. Les dogmes ont une large place dans l’histoire de
l’olivier, et l’introduction de celui-ci à Massilia par les Phocéens,
il y a 2 500 ans, laissent supposer qu’il n’existait
pas. Nous savons maintenant que c’est faux, et que le sens
de cette affirmation est à considérer comme représentative
des échanges et des déplacements des peuples. Dans cette
thèse nous avons effectué un relevé aussi représentatif que
possible de la diversité de l’oléastre méditerranéen et nous
avons considéré quelques centaines de variétés de la plupart
des pays oléicoles méditerranéens. Nous avons
93