Revue internationale d'écologie méditerranéenne International ...

DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE DE POPULATIONS NATURELLES DE ROSMARINUS OFFICINALIS L. EN TUNISIE ◆
Using Arithmetic Average), établi à partir de ces distances,
a été construit pour l’ensemble des populations.
La corrélation entre flux de gènes et éloignement géographique
des populations a été testée selon la méthode
de Slatkin (1993) par le programme Genepop (Raymond
& Rousset, 1995).
RÉSULTATS
1. Variabilité génétique intra-population
Pour les huit systèmes enzymatiques analysés, 13 loci
ont été détectés. Dix d’entre eux (Icd-1, Icd-2, Pgd-1, Pgd-
2, Pgm-1, Pgm-3, Pgi-1, Lap-1, Got-1 et Est-1) se sont
avérés polymorphes (tableau 2). Les loci Adh-1, Pgm-2
et Pgm-4 sont monomorphes.
Les fréquences alléliques sont variables selon les populations
(tableau 2). Des allèles rares (Pgm-3b et Pgi-1a)
caractérisent certaines populations. L’allèle Pgm-3b n’a
été retrouvé que chez les populations 18 (Toujène) et 19
(Matmata), géographiquement proches (éloignées de 20
km l’une de l’autre) et appartenant à l’étage bioclimatique
aride supérieur. L’allèle Pgi-1a, en plus des populations 18
et 19, a été rencontré chez la population 14 (Touiref).
L’allèle Pgm-1a n’a pas été retrouvé chez les populations
1 (Dj.Abderrahmane), 4 (Korbous), 13 (Kbouch),
18 (Toujène) et 19 (Matmata), tandis que l’allèle Pgm-1c
est absent chez les populations 18 et 19.
L’espèce présente un niveau de diversité génétique
intrapopulation élevé (tableau 3). Le nombre moyen
d’allèles par locus polymorphe (Ap) varie de 1,6 (population
1, Dj. Abderrahmane) à 2,2 (population 12, El
Ayoun) et le nombre moyen d’allèles (Ap) pour l’ensemble
des populations est de 1,85. Le pourcentage de
loci polymorphes (P) est compris entre 50, (populations
1, 3, 4 et 11) et 80% (populations 9, 12,13 et 14). Le
pourcentage moyen pour toutes les populations est égal
à 65,26%. Les moyennes d’hétérozygotie observée (Ho)
et attendue (He) sous l’équilibre de Hardy-Weinberg sont
respectivement 0,246 et 0,263.
2. Structure génétique et divergence
entre les populations
Les valeurs des F IS pour chaque locus et chaque
population et leur signification (après 3800 randomisations)
figurent dans les tableaux 3 et 4. Pour l’ensemble
ecologia mediterranea, tome 29, fascicule 2, 2003, p. 199-216
des populations le F IS moyen est de 0,079. Un déficit
significatif en hétérozygotes caractérise les populations
3 (Béja), 4 (Korbous), 7 (El Amayem), 9 (Bargou), 13
(Kbouch), 16 (Ksar Lemsa), 18 (Toujène) (tableau 3).
Le niveau d’homozygotie au niveau du groupe des populations
de l’aride supérieur est plus élevé (F IS = 0,125).
Les loci, accusant un défaut d’hétérozygotie, sont Pgm-1
(populations 18 et 19), Pgm-2 et Lap-1 (pour l’ensemble
des populations excepté la population 14) (tableau 4).
L’excès en hétérozygotie n’a été observé qu’au niveau de
la population 1 (Dj Abderrahmane) (tableau 3).
Pour l’ensemble des populations la valeur de F ST
est de 0,113 (tableau 4). Elle témoigne d’un niveau de
différenciation significatif, résultant de la variation des
fréquences alléliques observées.
La comparaison des valeurs de F ST entre paires de
populations met en évidence des variations significatives
(P = 0,0003 après 3420 permutations) (tableau 5),
particulièrement entre paires de populations géographiquement
éloignées et n’appartenant pas souvent au
même étage bioclimatique. C’est le cas par exemple de
tous les couples associant la population 18 ou 19 (de
l’aride supérieur). Au sein de chaque groupe écologique,
la différenciation génétique des populations est significative
(tableau 4). Les valeurs de F ST sont respectivement
de 0,042, 0,051 et 0,114 pour les populations du semiaride
supérieur, l’aride supérieur et le sub-humide. Les
populations de l’aride supérieur sont ouvertes (absence
de barrières topographiques ou forestières) et peu éloignées
géographiquement (20 km). Les populations du
sub-humide sont distantes et trois d’entre elles (1, 2, 5)
sont situées dans des forêts.
Le F ST entre les trois groupes, englobant chacun les
populations d’un même étage climatique, est de 0,109.
Une structuration éco-géographique importante semble
donc caractériser les populations.
La différenciation entre les groupes écologiques prises
deux à deux est significative (tableau 4). Toutefois,
le niveau de structuration observé entre populations
appartenant à deux étages climatiques contigus est moins
important (F ST = 0,117 et 0,061 1 ) que celui calculé entre
groupes éloignés (F ST = 0,209 ; entre le sub-humide et
l’aride supérieur) (tableau 4).
La comparaison des matrices des F ST et des distances
géographiques, par le test de Mantel, pour l’ensemble
des populations montre une corrélation significative entre
ces deux paramètres (r = 0,76 ; P = 0,002 après 1000
permutations).
1. Les valeurs ne s’écartent pas signifi cativement de celles calculées par la formule F ST =1/(4Nm +1) où = (n/(n-1)) 2 et n est le nombre des populations (Gao et al., 2000) pour
les petits nombres de populations.
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