CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne
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Comme il a été décrit précé<strong>de</strong>mment, la plupart <strong>de</strong>s métho<strong>de</strong>s pour la recherche <strong>de</strong>s E. coli<br />
concernent le sérogroupe O157.<br />
Pour les autres sérogroupes, O26, O103, O111 et O145, il n’existe à ce jour aucune métho<strong>de</strong><br />
<strong>de</strong> détection validée par les autorités. Bien évi<strong>de</strong>ment, la communauté scientifique utilise <strong>de</strong>s<br />
métho<strong>de</strong>s telles que la PCR ou l’IMS afin <strong>de</strong> détecter et d’isoler ces bactéries dans les<br />
bouillons d’enrichissement <strong>de</strong> matrices alimentaires. Cependant ces métho<strong>de</strong>s non validées<br />
restent à améliorer et semblent difficiles à mettre en œuvre par les industriels ou les<br />
laboratoires <strong>de</strong> routine.<br />
Pourtant l’avis <strong>de</strong> l’AFSSA du 15 juillet 2008, et plus récemment celui du 11 janvier 2011<br />
(2010-SA-0031) recomman<strong>de</strong>nt <strong>de</strong> rechercher les cinq sérogroupes dans les aliments à risque<br />
puisque tous ont été impliqués dans <strong>de</strong>s épidémies ou <strong>de</strong>s cas sporadiques d’infection à STEC.<br />
Il est donc urgent <strong>de</strong> mettre en place <strong>de</strong>s métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong> détection <strong>de</strong>stinées aux industriels <strong>de</strong>s<br />
filières les plus pointées du doigt (vian<strong>de</strong> et fromage) ainsi qu’aux laboratoires d’analyses <strong>de</strong><br />
routine.<br />
L’ampleur <strong>de</strong> la tâche étant considérable, l’objectif <strong>de</strong> ce travail était donc d’optimiser<br />
certaines étapes <strong>de</strong>s protocoles <strong>de</strong> détection en fonction <strong>de</strong>s attentes et <strong>de</strong>s impératifs <strong>de</strong>s<br />
industriels mais aussi <strong>de</strong>s évènements récents tels que les épidémies et autres cas observés <strong>de</strong><br />
contamination liés aux STEC.<br />
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