CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

Comme il a été décrit précédemment, la plupart des méthodes pour la recherche des E. coli
concernent le sérogroupe O157.
Pour les autres sérogroupes, O26, O103, O111 et O145, il n’existe à ce jour aucune méthode
de détection validée par les autorités. Bien évidement, la communauté scientifique utilise des
méthodes telles que la PCR ou l’IMS afin de détecter et d’isoler ces bactéries dans les
bouillons d’enrichissement de matrices alimentaires. Cependant ces méthodes non validées
restent à améliorer et semblent difficiles à mettre en œuvre par les industriels ou les
laboratoires de routine.
Pourtant l’avis de l’AFSSA du 15 juillet 2008, et plus récemment celui du 11 janvier 2011
(2010-SA-0031) recommandent de rechercher les cinq sérogroupes dans les aliments à risque
puisque tous ont été impliqués dans des épidémies ou des cas sporadiques d’infection à STEC.
Il est donc urgent de mettre en place des méthodes de détection destinées aux industriels des
filières les plus pointées du doigt (viande et fromage) ainsi qu’aux laboratoires d’analyses de
routine.
L’ampleur de la tâche étant considérable, l’objectif de ce travail était donc d’optimiser
certaines étapes des protocoles de détection en fonction des attentes et des impératifs des
industriels mais aussi des évènements récents tels que les épidémies et autres cas observés de
contamination liés aux STEC.
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