CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

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6. Les méthodes validées En raison des besoins croissants de rapidité, de praticabilité et de fiabilité d’analyse, de nombreux kits commerciaux sont utilisés sur le marché de l’analyse microbiologique. Or les utilisateurs de ces kits ont besoin de garanties quant à leurs performances. C’est pourquoi l’AFNOR Certification a mis en place un système de validation de ces méthodes commerciales, qui assure, via une procédure très sérieuse de certification, que les résultats obtenus avec les kits commerciaux sont équivalents aux résultats obtenus avec les méthodes normalisées. La marque AFNOR VALIDATION, largement reconnue en France depuis les années 1990, bénéficie aujourd’hui d’une notoriété importante au niveau européen et international. C'est une certification européenne à part entière, à côté des systèmes de Validation techniques constitués par NordVal (Validation intergouvernementale des 5 pays nordiques) et l'AOAC (Validation technique nord-américaine). 6.1. Pour E. coli O157 Le premier protocole (Figure 23) à avoir été normalisé pour la recherche des E. coli O157 dans les aliments est celui de la norme NF EN ISO 16654 qui repose sur la technique d’immunoséparation magnétique (IMS) décrite précédemment (Chapitre 2, 4.a). 82
Figure 23 : Protocole de recherche des E. coli O157 dans les aliments suivant la norme NF EN ISO 16654. D’autres méthodes ont ensuite vu le jour afin d’améliorer la praticabilité des analyses. Les industriels de l’agroalimentaire ont donc à leur disposition de nombreux outils immunologiques de détection de E. coli O157:H7 dans les aliments mais une préférence doit toutefois être accordée à des tests officiellement validés (i.e. AFNOR, ISO, AOAC) afin de prendre un risque minimum dans la gestion du devenir de lots considérés suspects. En France, les méthodes validées AFNOR de détection de E. coli O157:H7 dans l’aliment sont répertoriées dans le tableau qui suit : 83
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Je remercie… Monsieur Vincent Atr
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(+), positif pour la majorité des
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Strains reference origin E. coli O2
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For analysis, 800µL of enrichment
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DuPont Lateral Flow System E. coli
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Références bibliographiques 171
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Barwick, R.S., Levy, D.A., Craun, G
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Bosilevac, J.M., Guerini, M.N., Bri
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Chapman, P.A., Siddons, C.A., Cerda
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Donnenberg, M. S., Tzipori S., McKe
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Grau, F. H., and Vanderline P.B. (1
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Jarvis, K. G., and Kaper J. B.. (19
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Levine, M. (1987) Escherichia coli
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Meyer-Broseta, S., Bastian, S.N., A
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Ogden, I.D., Hepburn, N.F., MacRae,
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Reid, S. D., Herbelin C. J., Bumbau
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Shukla, R., Slack, R., George, A.,
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Trabulsi. (1998) Characterization o
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Wieler, L. H., McDaniel T. K., Whit
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