CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

1. Les matrices alimentaires .......................................................................................... 50
1.1. Les produits laitiers ............................................................................................... 50
1.2. La viande de bœuf ................................................................................................. 51
2. L’échantillonnage....................................................................................................... 52
3. L’enrichissement des matrices alimentaire.............................................................. 56
3.1. Généralités............................................................................................................. 56
3.2. Le volume du bouillon d’enrichissement .............................................................. 56
3.3. Les différents milieux utilisés ............................................................................... 57
3.4. Les températures et la durée d’incubation............................................................. 58
4. Les différentes méthodes de détection...................................................................... 59
4.1. La détection des E. coli O157 :H7 ........................................................................ 59
4.2. La détection des autres STEC ............................................................................... 73
5. L’étape de confirmation............................................................................................. 77
5.1. L’immuno-séparation magnétique (IMS).............................................................. 77
5.2. L’immuno-concentration E. coli (ICE) ................................................................. 78
5.3. Les différents milieux d’isolement........................................................................ 78
6. Les méthodes validées ................................................................................................ 82
6.1. Pour O157 ............................................................................................................. 82
6.2. Les autres............................................................................................................... 84
Mémoire expérimental...............................................86
CHAPITRE 1 : Matériel et méthodes...............................................88
1. Les souches.................................................................................................................. 89
2. Les matrices alimentaires utilisées au cours de l’étude .......................................... 91
2.1. Les produits laitiers ............................................................................................... 91
2.2. Les produits carnés................................................................................................ 92
2.3. Ensemencement expérimental des matrices.......................................................... 92
3. Les milieux sélectifs.................................................................................................... 94
4. Les différents kits VIDAS utilisés............................................................................. 94
5. La Real Time PCR (RT-PCR)................................................................................... 95
6. L’IMS ........................................................................................................................ 100
Résultats..........................................................................................101
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