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CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

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Ltd, Norvège). Toutefois, les souches isolées par cette métho<strong>de</strong> doivent être confirmées pour<br />

la présence du gène stx avant d’être considérées comme <strong>de</strong>s souches <strong>de</strong> STEC. Ces billes<br />

magnétiques n'ont pas été certifiées ISO comme l'IMS pour E. coli O157:H7, mais ont été<br />

employées pour ai<strong>de</strong>r à récupérer <strong>de</strong>s souches <strong>de</strong> STEC à partir d'échantillons alimentaires<br />

(Auvray et al. 2007).<br />

Il n’existe pas <strong>de</strong> métho<strong>de</strong> validée normalisée pour la recherche <strong>de</strong>s STEC non-O157 dans les<br />

aliments. Toutefois, quelques métho<strong>de</strong>s sont disponibles sur le marché. Il existe par exemple,<br />

une métho<strong>de</strong> génétique : la société Genesystems a mis au point un « GeneDisc » qui permet la<br />

détection simultanément <strong>de</strong>s gènes ciblant les sérotypes d’E. coli O26, d’E. coli O103, d’E.<br />

coli O111, d’E. coli O145 et du gène ciblant FliC H7. Ce système utilise les amorces validées<br />

et décrites par Perelle et al. (2004).<br />

Il existe un grand nombre <strong>de</strong> tests en PCR conventionnelle pour la détection <strong>de</strong>s gènes wzx et<br />

wzy impliqués dans la constitution <strong>de</strong>s antigènes somatiques O26, O103, O111 et O145<br />

(Wang et al., 1998 ; Debroy et al., 2004 ; Fratamico et al., 2005, Fratamico et al., 2009). Des<br />

modèles <strong>de</strong> détection par PCR en temps réel <strong>de</strong>s gènes wzx <strong>de</strong> O26, wbdI <strong>de</strong> O111, wzy <strong>de</strong><br />

O145 ont également été conçus (Perelle et al., 2004, Fratamico et al., 2009). Les PCR en<br />

temps réel pour la détection <strong>de</strong> wzx-O26, wzx-O103, wbd1-O111 et rfbE-O157 ont été<br />

combinés avec le marqueur ihp1-O145 au sein d’une multiplex pour réaliser le criblage<br />

d’échantillons alimentaires d'origine bovine (Perelle et al., 2007).<br />

Une métho<strong>de</strong> immunologique, le VIDAS EES est également disponible. Celle-ci permet la<br />

détection simultanée <strong>de</strong>s E. coli O157 et O26 sans pouvoir faire la distinction entre les <strong>de</strong>ux.<br />

La <strong>de</strong>man<strong>de</strong> se faisant <strong>de</strong> plus en plus forte et l’apparition <strong>de</strong>s sérogroupes autres que O157<br />

étant <strong>de</strong> plus en plus fréquente dans les épiso<strong>de</strong>s épidémiques, un projet <strong>de</strong> normalisation d’un<br />

protocole visant à leur détection est actuellement à l’étu<strong>de</strong> (Figure 16).<br />

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