CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

genesystems). Les deuxièmes sont eux dit « ouverts ». Ce type d’automate se trouve
essentiellement dans les laboratoires de recherche. Ces automates contiennent des logiciels
qui permettent de créer des programmes de PCR spécifiques en employant leurs propres
amorces. L’interprétation des résultats est réalisée par le manipulateur. Ce type d’automate
nécessite une bonne connaissance en biologie moléculaire et est inadapté aux analyses de
routine. Par exemple, l’automate Lightcycler de Roche ou encore l’automate Stepone
d’Applied Biosystems permettent ce type d’analyses.
Les appareils « ouverts » étant plus connus, nous détaillerons par la suite le principe et le
fonctionnement des appareils dits fermés employés pour détecter E. coli O157:
L’automate BAX :
BAX est un automate de détection microbienne pour la recherche des pathogènes et des flores
d’altération (Figure 12) dans les aliments. BAX® System Q7 est un système de détection
PCR en temps réel. La détection en temps réel de l’ADN se fait grâce à un fluorochrome, le
SYBER-Green. La quantification est basée sur l’augmentation de fluorescence générée par le
mélange SYBER-Green lorsqu’il est intercalé dans le double brin d’ADN. Il est important de
souligner un abus de langage, l’automate BAX Q7 ne permet pas une détection en temps
réelle mais plutôt une détection en point finale. En effet, la mesure de la fluorescence dûe au
SYBER-Green n’est pas mesurée tout au long du cycle de la PCR mais à la fin du programme
d’amplification. L’automate BAX® System Q7 permet donc en 3h30 de détecter
simultanément des bactéries. Ce temps comprend 2h30 de cycle de PCR et 1h de détection.
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Figure 12 : Automate BAX® system Q7
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