CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

(+), positif pour la majorité des souches ; +/-, positif ou négatif selon les souches; LDC,
Lysine Décarboxylase ;
ODC, Ornithine Décarboxylase.
Escherichia coli fait partie de la microflore commensale intestinale de l’homme et de
nombreux animaux à sang chaud. Il représente près de 80% de la microflore aérobie (Ghebru,
1988). A ce titre Escherichia coli, et plus largement les coliformes thermotolérants, sont
recherchés dans les aliments comme indicateurs de contamination fécale ; leur présence
fournit ainsi une indication sur une éventuelle contamination de l’aliment par des bactéries
pathogènes d’origine digestive (e.g. Salmonella typhimurium, E. coli O157 :H7…).
Bien que la majorité des souches d’E. coli soient commensales, certaines d’entre elles sont
associées à des pathologies intestinales (Levine, 1987) ou extra-intestinales (Pohl., 1993) bien
connues des médecins. Différents pathotypes intestinaux ont été mis en évidence en fonction
des facteurs de pathogénicité et des signes cliniques engendrés. Ils seront décrits dans le
paragraphe qui suit.
1.2. Classification des E. coli responsables des troubles intestinaux
A l’heure actuelle, il n’existe pas de classification standardisée des souches appartenant à
l’espèce E. coli. Les médecins utilisent une classification basée sur la pathogénie des
syndromes diarrhéiques comprenant 6 groupes (Figure 1):
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