CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

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Verstraete K., De Zutter L., Messens W., Herman L., Heyndrickx M., De Reu K.(2010) Effect of the enrichment time and immunomagnetic separation on the detection of Shiga toxin-producing Escherichia coli O26, O103, O111, O145 and sorbitol positive O157 from artificially inoculated cattle faeces. Veterinary Microbiology. Volume 145, Issues 1-2, Pages 106-112. Vial, P. A., Robins-Browne R., Lior H., Prado V., Kaper J. B., Nataro J. P., Maneval D., Elsayed A. and Levine M. M. (1988) Characterization of enteroadherentaggregative Escherichia coli, a putative agent of diarrheal disease. J Infect Dis 158:70-79. Vimont, A.., Vernozy-Rozand, C., Delignette-Muller, M.L. (2006) Isolation of E. coli O157:H7 and non-O157 STEC in different matrices: review of the most commonly used enrichment protocols. Letters in applied Microbiologie 42 102-108. Vimont A., Vernozy-Rozand C., Montet M.P., Bavai C., Fremaux B. and Delignette-Muller M.-L. (2007) Growth of Shiga-Toxin producing Escherichia coli (STEC) and bovine feces background microflora in various enrichment protocols. Veterinary Microbiology, Volume 123, Issues 1-3, Pages 274-281. Vold, L., Holck A., Wasteson Y. and Nissen H. (2000) High levels of background flora inhibits growth of Escherichia coli O157:H7 in ground beef. International Journal of Food Microbioliology 56:219-225. Wadolkowski, E. A., Sung L. M., Burris J. A., Samuel J. E., and O'Brien A. D. (1990) Acute renal tubular necrosis and death of mice orally infected with Escherichia coli strains that produce Shiga-like toxin type II. Infect Immun 58:3959-3965. Watarai, M., Sato T., Kobayashi M., Shimizu T., Yamasaki S., Tobe T., Sasakawa C., and Takeda Y. (1998) Identification and characterization of a newly isolated shiga toxin 2-converting phage from shiga toxin- producing Escherichia coli. Infect Immun 66:4100-4107. Waterman, S. R. & Small, P. (1996) Identification of ss-dependent genes associated with the stationary-phase acid-resistance phenotype of Shigella flexneri. Mol Microbiol 21, 925–940. Weaver, J.W., Kilpatrick, D.J., McNamara, A.M. (1996) Evaluation of recovery protocols for heat-stressed enterovirulent Escherichia coli. Int. J. Food Microbiol. 13, 257-263. Whittam, T. S., Wolfe M. L., Wachsmuth I. K., Orskov F., Orskov I. and Wilson R. A. (1993) Clonal relationships among Escherichia coli strains that cause hemorrhagic colitis and infantile diarrhea. Infect Immun 61:1619-1629. 196
Wieler, L. H., McDaniel T. K., Whittam T. S. and Kaper J. B. (1997) Insertion site of the locus of enterocyte effacement in enteropathogenic and enterohemorrhagic Escherichia coli differs in relation to the clonal phylogeny of the strains. FEMS Microbiol Lett 156:49-53. Willford, J., Mills, K. and Goodridge, L.D. (2009) Evaluation of three commercially available enzyme-linked immunosorbent assay kits for detection of Shiga toxin. J Food Prot 72, 741-747. Wilson, J. B., McEwen S. A., Clarke R. C., Leslie K. E., Wilson R. A., Waltner-Toews D. and Gyles C. L. (1992) Distribution and characteristics of verocytotoxigenic Escherichia coli isolated from Ontario dairy cattle. Epidemiol Infect 108:423-439. Yoder, J.S., Blackburn, B.G., Craun, G.F., Hill, V., Levy, D.A., Chen, N., Lee, S.H., Calderon, R.L. et Beach, M.J. (2004) Surveillance for waterborne-disease outbreaks associated with recreational water--United States, 2001-2002. MMWR Surveill Summ 53: 1-22. Zadik, P. M., Chapman P. A. and Siddons C. A. (1993) Use of tellurite for the selection of verocytotoxigenic Escherichia coli O157. J Med Microbiol 39:155-158. Zhao, T., Doyle M. P. and Besser R. E. (1993) Fate of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 in apple cider with and without preservatives. Appl Environ Microbiol 59:2526-2530. Zhao, T., Doyle M. P. (1994) Fate of enterohemorrhagic Escherichia coli O157;H7 in commercial mayonnaise. J. Food Prot. 57: 780-783. 197
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UNIVERSITE DE BOURGOGNE THÈSE Pour
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Je remercie… Monsieur Vincent Atr
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Résumé Les Escherichia coli produ
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Liste des tableaux ................
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CHAPITRE 2: Optimisation de la phas
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Liste des tableaux Tableau 1 : Prin
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Figure 23 : Protocole de recherche
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INTRODUCTION 15
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dans les aliments (NF EN ISO 16654)
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Mémoire bibliographique 19
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(+), positif pour la majorité des
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Les E. coli Entéroaggrégatifs (EA
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• elle doit appartenir aux sérot
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Figure 3 : Modèle hypothétique de
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et in vivo ont été réalisées af
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2.4. Autres facteurs de virulence L
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diverses origines (toxique, auto-im
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Plusieurs études ont également ra
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• Populations sensibles Les perso
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Tableau 3 : Fréquences observées
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cultures épithéliales mammaires p
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Figure 5 : Flux potentiels de STEC.
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(Pavia et al., 1990). Ce mode de tr
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Pendant les années 80, la plupart
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non-O157 n’est validée à ce jou
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actéries. En l’absence de flore
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Dans notre étude, nous nous sommes
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augmente à hauteur de 95% avec une
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Néanmoins, quelques études ont mi
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la bactérie recherchée. Enfin, il
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Systèmes immuno-chromatographiques
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sur les E. coli cibles, eux mêmes
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Notons toutefois qu’une préparat
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Révélation lors de la RT-PCR : Il
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Un grand nombre de tests de PCR en
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L’automate Genesystems: L’autom
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spécifiques d’E. coli O157:H7. L
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Ltd, Norvège). Toutefois, les souc
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Figure 17 : Projet de normalisation
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(Figure 19). Ces milieux sont des m
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Isolement des STEC non-O157:H7 En c
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Figure 23 : Protocole de recherche
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Tableau 9 : Méthodes validées AFN
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Comme il a été décrit précédem
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1. Les souches Des souches de diver
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Tableau 10 : Souches utilisées lor
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été réalisés (1 à 10 UFC/ml) (
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de l’automate. C’est elle qui p
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) Pour la détection des gènes eae
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Tableau 13 : Les séquences des amo
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Résultats 101
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habitant, dont 16,9 kilos de fromag
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O26 a été évaluée. Par conséqu
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délai d’analyse oblige les indus
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Cette étude a finalement montré q
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2. Etude préalable à l’élabora
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concentrations : des souches spéci
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expérimentalement ensemencées ava
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virulence status means that absence
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Strains reference origin E. coli O2
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For analysis, 800µL of enrichment
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E. coli strains O26 O103 O111 O145
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IMS sensitivity may also be affecte
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Morgan, D., Newman, C.P., Hutchinso
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