CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

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Annexe 2 : Méthodes validées AOAC pour la recherche des E. coli et autres coliformes. (http://www.aoac.org/testkits/testedmethods.html) Compact Dry EC RAPID'E. coli 2 Agar Combined E. coli and Total Coliform Test DOX 60F/30F Coliforms & E.coli Chromocult® Coliform Agar Sanita-kun E.coli & Coliform Sheet Medium and RIDA Count E.coli /Coliform Nissui Pharmaceutical Co.,Ltd Bio-Rad Laboratories Pathogen Detection Systems, Inc. Manufactured by Bio-Theta, Ltd. Developed by Daikin Industries, Ltd. Merck KGaA Chisso Corporation November 18 2004 May 10, 2006 January 7, 2008 December 30, 2008 February 27, 2009 July 24 , 2009 Coliforms & E. coli E. coli and total coliforms Escherichia coli and Total Coliforms E.coli & Total Coliforms Coliforms & E.coli E.coli and Coliforms Raw ground pork, raw pork, raw lamb, raw veal & raw ground beef Variety of Foods Tap water, well water, lake water, vegetable wash water, bottled water, sugar-free lemon iced tea Raw beef, raw ground beef, chicken carcass rinses Frankfurters, cooked chicken & nonfat dried milk Raw beef, raw pork, frozen raw ground beef, frozen raw ground pork and ham 162
Annexe 3: Souches utilisées au cours de l’étude concernant le VIDAS ESPT Souches spécifiques Souches non spécifiques O103 O157 O145 O26 O111 référence origine gènes de virulence eae stx c stx1 stx 2 85.56.11 + + 272.1. roquefort - - 561.3 roquefort - - 182.1 roquefort - + 30/61 roquefort + + 3925-C fromage au lait cru + + + PIC1 Selles issues SHU adultes + + + 09340 Fromage Laguiole - - 1 1-1 steak haché-SHU Rouen - - 5609-1 Pâte à gâteau cru + + 721.4 roquefort + + - + 40.36.1 roquefort + + 130/42 roquefort + + A33.35 Fecès bovins + + LS27 Aliments (St Louis) + + LS32 Humain (France) + + 071011-35238-1 viande hachée bœuf + + + - 44*12-26 1 viande hachée bœuf + + - + 76234 ECO O157H7 Fromage Chèvre + + - + 26EC9-2 viande hachée surgelée + + + + 181.3 roquefort + - - - PH27 B.Possé + - F95.320 fromage + - 13042010 C08 étude interlabo + + 0145-2007 ? 4811 ? + - 18981-1 ? + - 64.36 roquefort + - 191.2 roquefort B.Possé + - - - 52.4 Fromage blanc + + 60.1 Lait + - 84.3 Vaches + - 864-11-2-1 Camembert lait cru + - - - 261-11 lait maturé + - - - 4198-6 Fromage cours affinage + - 9003-2 camenbert + - 13042010 C08 étude interlabo + + B.possé + - O111-2007 ? 54159 ? O113 V2 treatment clarifier - + O76 V4 plant aerator + + O? V11 feces de porc - + + O? V17 bouse + + O? V18 bouse + + O174 360A/1 fromage au lait cru - + V1 - + Staph - - Citro - - 484 - + V21 - + 163
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UNIVERSITE DE BOURGOGNE THÈSE Pour
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Je remercie… Monsieur Vincent Atr
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Résumé Les Escherichia coli produ
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Les E. coli Entéroaggrégatifs (EA
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• elle doit appartenir aux sérot
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et in vivo ont été réalisées af
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2.4. Autres facteurs de virulence L
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diverses origines (toxique, auto-im
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Plusieurs études ont également ra
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• Populations sensibles Les perso
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cultures épithéliales mammaires p
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(Pavia et al., 1990). Ce mode de tr
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non-O157 n’est validée à ce jou
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actéries. En l’absence de flore
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Dans notre étude, nous nous sommes
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augmente à hauteur de 95% avec une
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Néanmoins, quelques études ont mi
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la bactérie recherchée. Enfin, il
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Systèmes immuno-chromatographiques
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sur les E. coli cibles, eux mêmes
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Notons toutefois qu’une préparat
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Révélation lors de la RT-PCR : Il
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Un grand nombre de tests de PCR en
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L’automate Genesystems: L’autom
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spécifiques d’E. coli O157:H7. L
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Ltd, Norvège). Toutefois, les souc
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(Figure 19). Ces milieux sont des m
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Isolement des STEC non-O157:H7 En c
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1. Les souches Des souches de diver
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été réalisés (1 à 10 UFC/ml) (
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de l’automate. C’est elle qui p
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) Pour la détection des gènes eae
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Tableau 13 : Les séquences des amo
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Résultats 101
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habitant, dont 16,9 kilos de fromag
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