CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne
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Les Escherichia coli font partie <strong>de</strong> la famille <strong>de</strong>s Enterobacteriacae. Ce sont <strong>de</strong>s hôtes<br />
communs <strong>de</strong> la microflore intestinale <strong>de</strong> l’homme et <strong>de</strong>s animaux à sang chaud (mammifères<br />
et oiseaux). La majorité <strong>de</strong>s souches d’E. coli sont commensales, mais certaines ont toutefois<br />
été associées à <strong>de</strong>s pathologies intestinales (Levine, 1987) ou extra-intestinales (Pohl , 1993).<br />
Parmi celles-ci, les Escherichia coli producteurs <strong>de</strong> Shiga-toxines (STEC) sont considérés<br />
comme <strong>de</strong>s pathogènes émergents importants en santé publique. Ils peuvent être à l’origine <strong>de</strong><br />
diarrhées souvent sanglantes. Dans certains cas, <strong>de</strong>s complications peuvent apparaître telles<br />
qu’un syndrome hémolytique et urémique parfois mortel, notamment chez les enfants en bas<br />
âge, ou un purpura thrombotique thrombocytopénique chez l’adulte.<br />
Depuis 1982, les STEC ont été à l’origine <strong>de</strong> nombreux cas d’infections humaines à travers le<br />
mon<strong>de</strong>, essentiellement consécutives à la consommation d’aliments contaminés d’origine<br />
animale (e.g. vian<strong>de</strong> hachée, lait et fromages au lait cru, …). Toutefois, l’épidémiologie <strong>de</strong>s<br />
infections à STEC a évolué durant ces dix <strong>de</strong>rnières années, et l’ingestion <strong>de</strong> légumes et fruits<br />
contaminés ainsi que le contact avec les animaux et leur environnement sont <strong>de</strong> plus en plus<br />
impliqués en clinique humaine.<br />
Le sérotype O157:H7 est le plus communément retrouvé en clinique humaine mais d’autres<br />
sérogroupes comme O26, O103, O111 et O145 sont <strong>de</strong> plus en plus incriminés lors<br />
d’épidémies. Ils représentent donc un danger pour la santé publique, avec un impact important<br />
pour les industries agro-alimentaires.<br />
Dernièrement, la France a fait face à <strong>de</strong>ux toxi-infections alimentaires collectives (TIAC)<br />
importantes : une première en octobre 2005, liée à E. coli O157:H7 incriminant <strong>de</strong> la vian<strong>de</strong><br />
hachée <strong>de</strong> boeuf (Mailles et al., 2006), et une secon<strong>de</strong> en décembre 2005, due à la<br />
consommation <strong>de</strong> fromages au lait cru contaminés par E. coli O26 (Espié et al., 2006). Cette<br />
année, une épidémie liée à E. coli O26 dans <strong>de</strong> la vian<strong>de</strong> <strong>de</strong> bœuf est survenue au Etats-Unis<br />
ainsi qu’une autre liée à E. coli O145 dans <strong>de</strong> la laitue (CDC, 2010).<br />
Ainsi, l’avis <strong>de</strong> l’AFSSA <strong>de</strong> juillet 2008, et plus récemment, l’avis <strong>de</strong> janvier 2011 (2010-SA-<br />
0031) définit comme souche STEC pathogène, les souches appartenant aux sérotypes O26<br />
:H11, O103 :H2, O111 :H8, O145 :H28 et O157 :H7 et ayant <strong>de</strong>s caractéristiques génétiques<br />
particulières (elles doivent possé<strong>de</strong>r au moins <strong>de</strong>ux facteurs <strong>de</strong> virulence précis).<br />
Cependant, en dépit <strong>de</strong>s différents éléments soulignés dans les lignes précé<strong>de</strong>ntes, il n’existe à<br />
l’heure actuelle, qu’un protocole officiel <strong>de</strong>stiné à rechercher E. coli O157 dans les <strong>de</strong>nrées<br />
alimentaires : il s’agit <strong>de</strong> la métho<strong>de</strong> horizontale pour la recherche <strong>de</strong>s Escherichia coli O157<br />
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