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CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

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phénomène mais il serait surtout important <strong>de</strong> travailler sur la mise au point <strong>de</strong> géloses à<br />

utiliser pour l’isolement.<br />

L’efficacité <strong>de</strong> ces métho<strong>de</strong>s <strong>de</strong> confirmation pourrait être améliorée par la mise au point et<br />

l’utilisation <strong>de</strong> géloses spécifiques. A ce jour, les géloses les plus performantes, sont conçues<br />

pour l’isolement du sérogroupe O157. Les autres sérogroupes n’ont pas <strong>de</strong> gélose qui leur soit<br />

réellement spécifique. Des progrès restent donc à faire sur ce point.<br />

Pourtant le milieu mis au point par Possé et al. (2008) pourrait apporter un plus en terme <strong>de</strong><br />

spécificité à notre nouvelle métho<strong>de</strong>. Il permet l’isolement sur une même gélose <strong>de</strong>s cinq<br />

sérogroupes <strong>de</strong> STEC avec <strong>de</strong>s caractéristiques morphologiques <strong>de</strong>s colonies, spécifiques à<br />

chacun d’eux. Nous avons constaté en revanche que sa préparation est complexe et rend<br />

difficilement envisageable son utilisation pour <strong>de</strong>s analyses <strong>de</strong> routine.<br />

Une autre métho<strong>de</strong> d’isolement <strong>de</strong>s souches <strong>de</strong> STEC non-O157 est basée sur la détection <strong>de</strong><br />

la production d’entérohémolysine. Beutin et al. (1989) ont mis en évi<strong>de</strong>nce une association<br />

entre la production d’entérohemolysine et la production <strong>de</strong> Shiga-toxines dans 89% <strong>de</strong>s<br />

souches d’E. coli appartenant à neuf sérotypes différents. L’activité entérohémolytique peut<br />

être détectée après une nuit d'incubation sur gélose au sang contenant <strong>de</strong>s globules rouges <strong>de</strong><br />

moutons lavés additionnés <strong>de</strong> calcium. Les colonies isolées avec une activité<br />

entérohémolytique doivent être ensuite confirmées pour la présence <strong>de</strong>s gènes stx car<br />

certaines souches non STEC produisant l’entérohémolysine peuvent également être détectées.<br />

Il est donc important d’approfondir les recherches sur ces milieux et <strong>de</strong> les retravailler pour<br />

les rendre plus « accessibles ». De tels milieux permettraient d’améliorer cette étape <strong>de</strong><br />

confirmation qui est très discutée, mais qui reste indispensable pour éliminer les faux résultats<br />

positifs<br />

Rappelons également que l’isolement d’une colonie caractéristique du sérogroupe suspecté<br />

nécessite encore une validation par <strong>de</strong>s techniques comme les tests latex, les galeries Api mais<br />

également les analyses génétiques par PCR. Ces analyses complémentaires sont nécessaires<br />

pour s’assurer que la bactérie trouvée est bien celle recherchée et qu’elle possè<strong>de</strong> bien les<br />

gènes nécessaires à sa virulence.<br />

Pour conclure…<br />

Les travaux décrits dans ce mémoire ont permis d’apporter <strong>de</strong>s améliorations au protocole <strong>de</strong><br />

détection <strong>de</strong>s STEC grâce à l’optimisation <strong>de</strong> certaines étapes, notamment en élaborant un<br />

enrichissement permettant la croissance <strong>de</strong>s E. coli O26 dans les fromages au lait cru en vue<br />

<strong>de</strong> leur détection par une métho<strong>de</strong> immunologique automatisée : le VIDAS EES. Nous avons<br />

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