CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

A ce jour, il n’y a aucune méthode validée permettant la détection des E. coli autres que O157
et les industriels ne disposent pas de méthode simple d’utilisation pour la détection de telles
bactéries. Etant donné les évènements de ces dernières années (épidémies, résultats des plans
de surveillance) il devenait urgent pour les industriels du lait notamment d’avoir à disposition
un test destiné à détecter les E. coli O26 dans les fromages.
Le VIDAS EES mis au point par la société BioMérieux a été évalué. Ce test permet la
détection conjointe des E. coli O157 et O26 sans distinction. Les données obtenues au cours
de nos travaux ont montré que le VIDAS EES autorise la détection de E. coli O26
ensemencées à un faible niveau (1-10 UFC/25g) dans différents fromages. Précisons que nous
avions sélectionné des types de fromage et des technologies fromagères ayant des
caractéristiques pouvant avoir un impact sur la détection. Toutefois, nous ne l’avons évalué
que sur les fromages au lait cru et le lait. Par conséquent il serait intéressant de l’évaluer
notamment sur des fromages au lait pasteurisé, mais également sur d’autres matrices comme
la viande hachée.
Soulignons également qu’il n’existe pas d’autres méthodes immunologiques de détection des
autres sérogroupes excepté l’IMS. L’IMS permet la détection et l’isolement des cinq
sérogroupes de E. coli mais seules les billes magnétiques ciblant les E. coli O157 sont
validées. Les billes ciblant les autres sérogroupes ont été utilisées pour différentes études et
ont montré des performances variables en fonction de l’enrichissement choisi et du type
d’aliment analysé (Safarikova et Safarik, 2001 ; Urdahl et al., 2002 ; O’Hanlon et al., 2005).
• Méthodes génétiques
La méthode choisie par le projet de spécification technique en cours d’évaluation à l’ISO du
CEN TC275/WG6 est destinée à détecter des souches STEC qui peuvent être hautement
pathogènes, c’est-à-dire présentant les caractéristiques des souches «EHEC typiques
majeures» proposées et recommandées par l’EFSA. Pour mémoire, cette méthode séquentielle
comprend :
- une première étape d’enrichissement
- une seconde étape de détection par technique de PCR en temps réel, à partir des acides
nucléiques extraits de ce bouillon d’enrichissement, des principaux marqueurs des souches
STEC hautement pathogènes (gènes stx, gènes eae, puis gènes associés aux 5 principaux
sérogroupes d’EHEC). Cette étape de détection est séquentielle: ce n’est que si les gènes stx
(stx1 et/ou stx2) et eae sont présents simultanément que les gènes spécifiques des 5 principaux
sérogroupes d’EHEC sont recherchés ;
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