CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne
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A ce jour, il n’y a aucune métho<strong>de</strong> validée permettant la détection <strong>de</strong>s E. coli autres que O157<br />
et les industriels ne disposent pas <strong>de</strong> métho<strong>de</strong> simple d’utilisation pour la détection <strong>de</strong> telles<br />
bactéries. Etant donné les évènements <strong>de</strong> ces <strong>de</strong>rnières années (épidémies, résultats <strong>de</strong>s plans<br />
<strong>de</strong> surveillance) il <strong>de</strong>venait urgent pour les industriels du lait notamment d’avoir à disposition<br />
un test <strong>de</strong>stiné à détecter les E. coli O26 dans les fromages.<br />
Le VIDAS EES mis au point par la société BioMérieux a été évalué. Ce test permet la<br />
détection conjointe <strong>de</strong>s E. coli O157 et O26 sans distinction. Les données obtenues au cours<br />
<strong>de</strong> nos travaux ont montré que le VIDAS EES autorise la détection <strong>de</strong> E. coli O26<br />
ensemencées à un faible niveau (1-10 UFC/25g) dans différents fromages. Précisons que nous<br />
avions sélectionné <strong>de</strong>s types <strong>de</strong> fromage et <strong>de</strong>s technologies fromagères ayant <strong>de</strong>s<br />
caractéristiques pouvant avoir un impact sur la détection. Toutefois, nous ne l’avons évalué<br />
que sur les fromages au lait cru et le lait. Par conséquent il serait intéressant <strong>de</strong> l’évaluer<br />
notamment sur <strong>de</strong>s fromages au lait pasteurisé, mais également sur d’autres matrices comme<br />
la vian<strong>de</strong> hachée.<br />
Soulignons également qu’il n’existe pas d’autres métho<strong>de</strong>s immunologiques <strong>de</strong> détection <strong>de</strong>s<br />
autres sérogroupes excepté l’IMS. L’IMS permet la détection et l’isolement <strong>de</strong>s cinq<br />
sérogroupes <strong>de</strong> E. coli mais seules les billes magnétiques ciblant les E. coli O157 sont<br />
validées. Les billes ciblant les autres sérogroupes ont été utilisées pour différentes étu<strong>de</strong>s et<br />
ont montré <strong>de</strong>s performances variables en fonction <strong>de</strong> l’enrichissement choisi et du type<br />
d’aliment analysé (Safarikova et Safarik, 2001 ; Urdahl et al., 2002 ; O’Hanlon et al., 2005).<br />
• Métho<strong>de</strong>s génétiques<br />
La métho<strong>de</strong> choisie par le projet <strong>de</strong> spécification technique en cours d’évaluation à l’ISO du<br />
CEN TC275/WG6 est <strong>de</strong>stinée à détecter <strong>de</strong>s souches STEC qui peuvent être hautement<br />
pathogènes, c’est-à-dire présentant les caractéristiques <strong>de</strong>s souches «EHEC typiques<br />
majeures» proposées et recommandées par l’EFSA. Pour mémoire, cette métho<strong>de</strong> séquentielle<br />
comprend :<br />
- une première étape d’enrichissement<br />
- une secon<strong>de</strong> étape <strong>de</strong> détection par technique <strong>de</strong> PCR en temps réel, à partir <strong>de</strong>s aci<strong>de</strong>s<br />
nucléiques extraits <strong>de</strong> ce bouillon d’enrichissement, <strong>de</strong>s principaux marqueurs <strong>de</strong>s souches<br />
STEC hautement pathogènes (gènes stx, gènes eae, puis gènes associés aux 5 principaux<br />
sérogroupes d’EHEC). Cette étape <strong>de</strong> détection est séquentielle: ce n’est que si les gènes stx<br />
(stx1 et/ou stx2) et eae sont présents simultanément que les gènes spécifiques <strong>de</strong>s 5 principaux<br />
sérogroupes d’EHEC sont recherchés ;<br />
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