CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne
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La comparaison <strong>de</strong>s <strong>de</strong>ux formats <strong>de</strong> cône a permis <strong>de</strong> mettre en évi<strong>de</strong>nce que les protéines <strong>de</strong><br />
phage ont une sensibilité meilleure ou égale à celle <strong>de</strong>s anticorps. De plus, les expériences ont<br />
permis <strong>de</strong> déterminer les concentrations optimales d’utilisation en protéines <strong>de</strong> phage <strong>de</strong><br />
chaque sérogroupe : <strong>de</strong> 0.3 à 1.25 µg/ml. A ces concentrations, les limites <strong>de</strong> détection par<br />
concentration <strong>de</strong>s bactéries sont comprises <strong>de</strong> 10 2 -10 3 UFC/ml en fonction du sérogroupe<br />
(Tableau 14).<br />
Concernant la spécificité <strong>de</strong> ces protéines <strong>de</strong> phage, elle est assez bonne puisque seulement le<br />
Citrobacter en petite quantité est apparu sur les géloses et une <strong>de</strong>s souches <strong>de</strong> E. coli non<br />
spécifiques testées. Ces résultats se sont répétés pour toutes les protéines <strong>de</strong> phage testées sauf<br />
celles ciblant les E. coli O157. Ce phénomène peut s’expliquer par le fait que ces souches<br />
étaient extrêmement concentrées (≥ 10 8 UFC/mL).<br />
Une fois les concentrations optimales définies et les tests <strong>de</strong> spécificité terminés, une nouvelle<br />
série <strong>de</strong> cônes coatés avec les 5 types <strong>de</strong> phage a été fabriquée et évaluée au cours <strong>de</strong> mes<br />
travaux.<br />
3. Evaluation du nouveau test <strong>de</strong> concentration<br />
3.1. Résumé<br />
Escherichia coli O26, O103, O111, O145 et O157 sont les cinq sérogroupes majeurs définis<br />
par l’AFSSA comme étant les plus souvent associés aux infections d’origine alimentaire. Les<br />
contaminations par les E. coli entérohémorragiques (EHEC) sont la première cause<br />
d’insuffisance rénale chez l’enfant. A l’origine <strong>de</strong>s épidémies les plus connues, la vian<strong>de</strong> <strong>de</strong><br />
bœuf hachée peu cuite est le plus souvent incriminée. Il est donc essentiel pour les industriels<br />
<strong>de</strong> la filière d’avoir à leur disposition un protocole <strong>de</strong> détection efficace <strong>de</strong>s 5 sérogroupes <strong>de</strong><br />
E. coli pointés du doigt.<br />
L’objectif <strong>de</strong> cette étu<strong>de</strong> était l’évaluation d’un nouveau test <strong>de</strong> concentration automatisé<br />
(VIDAS ESPT). L’originalité <strong>de</strong> ce test repose sur l’utilisation <strong>de</strong> protéines recombinantes <strong>de</strong><br />
phage.<br />
Dans un premier temps, la spécificité du cône au format 5 sérogroupes a été évaluée sur un<br />
panel <strong>de</strong> 50 bouillons <strong>de</strong> cultures pures <strong>de</strong> E. coli O26, O103, O111, O145, O157, STEC et<br />
non-STEC. La sensibilité <strong>de</strong>s cônes a également été évaluée sur <strong>de</strong>s cultures pures ou non <strong>de</strong><br />
E. coli. Puis ce nouveau test a été employé sur <strong>de</strong>s matrices <strong>de</strong> vian<strong>de</strong>s bovines<br />
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