CHAPITRE 1 - Université de Bourgogne

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AFNOR = Association Française de NORmalisation AFSSA = Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments AOAC = Association of Official Analytical Chemists A/E = attaching and effacing BET = Bromure d’Ethidium BHI = Brain Heart Infusion (bouillon coeur-cervelle) CT = Céfixime-Tellurite DGAL = Direction Générale de l’Alimentation EFSA = European Food Safety Authority EHEC = Escherichia coli entero-hemorrhagique ELFA = Enzyme Linked Fluorescent Assay ELISA = Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay EPT = Eau Peptonnée Tamponnée FDA = Food and Drug Administration ICE = Immuno-Concentration E.coli O157 ICMSF = International Commission on Microbial Specifications for Foods IMS = Immunomagnetic separation ISO = Organisation Internationale de Normalisation PCR = Réaction de polymerisation en chaîne (Polymerase Chain Reaction) PTT = purpura thrombotique thrombocytopénique RFV = Relative Fluorescence Value RT-PCR = PCR en temps réel SHU = Syndrome Hémolytique et Urémique STEC = Escherichia coli productrices de Shiga-toxines TSB = Tryptone Soya Broth UFC = Unité Formant Colonie VTEC = verotoxin producing E. coli 10
Liste des tableaux Tableau 1 : Principaux caractères permettant la différenciation des espèces du genre Escherichia (E. coli, E. hermanii, E. vulneris, E. fergusonii).................................................. 20 Tableau 2 : Fréquences observées de produits contaminés par des STEC. ............................ 38 Tableau 3 : Fréquences observées de produits contaminées par E. coli O157 :H7. ............... 39 Tableau 4 : Fréquences de carcasses de bovins contaminées par E. coli O157 :H7 et niveaux de contamination (Vimont, 2007). ........................................................................................... 40 Tableau 5 : Fréquences observées de laits et fromages contaminés par des STEC (Vimont, 2007)......................................................................................................................................... 41 Tableau 6 : Les principales épidémies à STEC....................................................................... 45 Tableau 7 : Probabilité de détecter E. coli O157:H7 dans un hachoir en fonction de la prise d’essai réalisée.......................................................................................................................... 55 Tableau 8 : Méthodes validées AFNOR pour la détection des E. coli O157.......................... 84 Tableau 9 : Méthodes validées AFNOR pour la détection des E. coli. .................................. 85 Tableau 10 : Souches utilisées lors des études 1 et 2............................................................. 91 Tableau 11 : Technologies fromagères et matrices fromagères utilisées ............................... 92 Tableau 12 : Composition du mix de RT-PCR ...................................................................... 96 Tableau 13 : Les séquences des amorces et des sondes utilisées pour la RT-PCR (Nielsen and Andersen, 2003 ; Perelle et al., 2004) ...................................................................................... 99 Tableau 14 : Performances des protéines de phage aux concentrations choisies. ................ 129 11
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Notons toutefois qu’une préparat
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Ltd, Norvège). Toutefois, les souc
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O26 a été évaluée. Par conséqu
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être utilisés en fonction de la m
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A ce jour, il n’y a aucune métho
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DuPont Lateral Flow System E. coli
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Barwick, R.S., Levy, D.A., Craun, G
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Bosilevac, J.M., Guerini, M.N., Bri
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Chapman, P.A., Siddons, C.A., Cerda
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Donnenberg, M. S., Tzipori S., McKe
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Grau, F. H., and Vanderline P.B. (1
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Jarvis, K. G., and Kaper J. B.. (19
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Levine, M. (1987) Escherichia coli
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Meyer-Broseta, S., Bastian, S.N., A
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Ogden, I.D., Hepburn, N.F., MacRae,
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Reid, S. D., Herbelin C. J., Bumbau
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Shukla, R., Slack, R., George, A.,
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Trabulsi. (1998) Characterization o
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Wieler, L. H., McDaniel T. K., Whit
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