Thèse Correia Daniela version de diffusion - Université de Bourgogne
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permettent d’explorer le polymorphisme aux différents niveaux (genre, espèce, souche). Ces<br />
techniques sont rapi<strong>de</strong>s et présentent une bonne reproductibilité.<br />
Afin d’être le plus discriminant possible, il est nécessaire <strong>de</strong> choisir <strong>de</strong>s régions cibles<br />
d’ADN, comportant <strong>de</strong>s séquences conservées chez tous les micro-organismes, avec une<br />
variabilité spécifique pour un genre ou une espèce. Bien que l’ADNr 18S présente ces<br />
caractéristiques et permette <strong>de</strong> différencier <strong>de</strong>s champignons <strong>de</strong> groupes taxonomiques<br />
différents, cette région ne semble pas appropriée pour une bonne différenciation <strong>de</strong>s espèces<br />
au sein du même genre (Bruns et al., 1991). La région ITS (Internal Transcribed Spacer) est<br />
préférentiellement utilisée par les taxonomistes pour l’i<strong>de</strong>ntification <strong>de</strong>s espèces fongiques<br />
(Bruns et al., 1991 ; Hibbett et al., 2005).<br />
Plus récemment, d’autres régions cibles ont été utilisées pour une discrimination au<br />
sein <strong>de</strong> genres tels que Penicillium ou Aspergillus (Samson et al., 2004a) ; notamment <strong>de</strong>s<br />
séquences du gène <strong>de</strong> la β-tubuline, riches en introns ou le taux <strong>de</strong> variabilité semble<br />
approprié.<br />
1. III. 2. 1. Généralités sur les tubulines<br />
Les tubulines constituent une famille <strong>de</strong>s protéines : α (alpha)-, β (beta)-, γ (gamma)-,<br />
δ (<strong>de</strong>lta)-, ε (epsilon)-, ζ (zeta)- et η (eta)-tubulines (McKean et al., 2001). Les tubulines α et<br />
β sont les plus répandues dans les cellules eucaryotes car elles entrent dans la composition <strong>de</strong>s<br />
microtubules. Ensemble, elles ont une masse moléculaire <strong>de</strong> 110 kDa. Les <strong>de</strong>ux<br />
hétérodimères sont alignés avec une alternance αβ pour former <strong>de</strong>s protofilaments (structures<br />
<strong>de</strong> base <strong>de</strong>s microtubules) (Figure 11).<br />
Non libre <strong>de</strong> droit <strong>de</strong> <strong>diffusion</strong><br />
Figure 11. Structure d’un microtubule<br />
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