caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
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Résultats-Discussion : Etude du rôle de Pofut1 dans la différenciation de cellules C2C12 __________________________________________________________________________________________ Figure 68 : Principe de la PCR semi-quantitative en temps réel avec une sonde TaqMan. La méthode de détection à partir de la sonde TaqMan est basée sur l’utilisation de l’activité exonucléasique 5’-3’ de l’enzyme Taq polymérase. Les sondes sont marquées par un « Reporter » qui émet de la florescence uniquement s’il est suffisamment loin d'un « Quencher ». En effet, le Quencher a la propriété d'absorber l'énergie émise par le Reporter, par un mécanisme appelé FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfert). Lorsque l'enzyme synthétise un nouveau brin, la sonde est hydrolysée; le reporter se retrouve alors en solution et il émet dans sa longueur d’onde caractéristique. Cette technique présente l'avantage d'être plus spécifique par rapport à une PCR classique, de par la présence de la sonde supplémentaire, et de permettre la détection de plusieurs cibles simultanément en utilisant des Reporters qui émettent à des longueurs d’onde différentes. Etant donné la forte homologie entre les enzymes Pofut1 bovine et murine, des expériences de western blot avec l’anticorps anti-Pofut1, nous permettront également de vérifier l’expression de la protéine Pofut1 dans les cellules C2C12 transfectées et non transfectées. 204
Résultats-Discussion : Etude du rôle de Pofut1 dans la différenciation de cellules C2C12 __________________________________________________________________________________________ 3.2.3 Premiers résultats obtenus 3.2.3.1 Surexpression de Pofut1 dans les cellules C2C12 3.2.3.1.1 Transfection et induction de la différenciation Dans le but d’appréhender le rôle de l’enzyme Pofut1 dans la différenciation des cellules C2C12, 11 millions de cellules ont été nucléoporées avec la construction pcDNA/TOPO3.1-Pofut1 murin, puis remises en culture dans 11 flasques de culture cellulaire de 25cm 2 , à raison de 1 million de cellules par flasque. En parallèle, des cellules non transfectées, sont remises en culture de la même façon. La mise en milieu de différenciation s’effectue 24 heures après la transfection. Au même moment, des cellules transfectées et des cellules non transfectées sont décollées et congelées, elles représentent le temps zéro de l’expérience noté T0. De même, des cellules transfectées et des cellules non transfectées sont collectées et congelées à différents temps après la mise en milieu de différenciation. Les différents points, T6, T12, T18, T24, T48, T72, T96, T120, T192 et T264 heures, on été choisi de façon à couvrir les différentes étapes de la différenciation de 0% à 100% de myotubes. 3.2.3.1.2 Vérification de l’expression de Pofut1 Dans un premier temps, les ARN totaux sont extraits des cellules C2C12 (RNeasy Mini Kit, QIAGEN, Les Ulis, France). La qualité et la concentration des ARN sont vérifiées grâce au system Agilent, technologie dont le principe est la microphorèse capillaire sur puce. Dix microgrammes de ces ARN sont ensuite rétro-transcrits (High capacity cDNA Archive Kit, Applied Biosystems, Norwalk, USA). L’expression des transcrits Pofut1 est vérifiée par RT-PCR semi-quantitative en temps réel. L’analyse est effectuée, en triplicat, sur les 11 points des deux cinétiques (Fig.69.). 205
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Figure 68 : Principe de la PCR semi-quantitative en temps réel avec une sonde TaqMan.<br />
La méthode de détection à partir de la sonde TaqMan est basée sur l’utilisation de<br />
l’activité exonucléasique 5’-3’ de l’enzyme Taq polymérase. Les son<strong>des</strong> sont marquées par un<br />
« Reporter » qui ém<strong>et</strong> de la florescence uniquement s’il est suffisamment loin d'un<br />
« Quencher ». En eff<strong>et</strong>, le Quencher a la propriété d'absorber l'énergie émise par le Reporter,<br />
par un mécanisme appelé FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfert). Lorsque<br />
l'enzyme synthétise un nouveau brin, la sonde est hydrolysée; le reporter se r<strong>et</strong>rouve alors en<br />
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l'avantage d'être plus spécifique par rapport à une PCR classique, de par la présence de la<br />
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utilisant <strong>des</strong> Reporters qui ém<strong>et</strong>tent à <strong>des</strong> longueurs d’onde différentes.<br />
Etant donné la forte homologie entre les <strong>enzymes</strong> Pofut1 bovine <strong>et</strong> murine, <strong>des</strong><br />
expériences de western blot avec l’anticorps anti-Pofut1, nous perm<strong>et</strong>tront également de<br />
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