caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ... caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
Résultats-Discussion : Annexe II __________________________________________________________________________________________ Intron 8 ↓ Bos taurus TWEE*LELYK DGGVAIVDQW ICAHARFFIG TSVSTFSFRI HEEREILGLD *****PKTTY 408 Rattus norvegicus ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408 Mus musculus ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408 Homo sapiens ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408 Pan troglodytes ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408 Gallus gallus ----*----- ---M-VI--- ------Y--- ---------- --------F- *****----- 417 Xenopus tropicalis ----*----- ------I--- ------Y--- ---------- -------SFN *****----- 414 Danio rerio SL-D*---L- ------I--- ---------- ---------- --------F- *****----- 423 Oryzias latipes SR-D*---L- ------I--- --S------- ---------- --------F- *****----- 400 Takifugu rubripes SI-D*---L- ------I--- ---------- ---------- --------F- *****----- 365 Ciona intestinalis -KT-*KSEF- M-----I--I --S-----M- -KE------- Q-----MCFP *****KH--F 404 Ciona savignyi SKA-*-NNF- M-----I--I L-S---Y-M- -KE------- Q-----MCFP *****KH--F 403 Caenorhabditis briggsae RFTD*TQK-N --QI--I--Y L----AH--- SYE---T--- Q-D-----FP *****ISS-F 402 Caenorhabditis elegans RFTD*TQKLN --QI--I--Y L----AY--- SYE---T--- Q-D---I-FP *****IS--F 403 Anopheles gambiae SY-Q*RAEL- ---------I V-S---Y--- -YE---TY-- Y-----I-FP *****KDL-F 428 Bombyx mori NIA-*VTEFD --TI--LE-I --S--A--V- -HE---T--- Q----L--FP *****SD--F 385 Drosophila melanogaster SNVQ*RREL- -----V---L V--Y--Y-V- -YE---TY-- Y-------FT *****QAS-F 455 Drosophila pseudoobscura SNLQ*RQKL- ---------L V-SY--Y--- -YE---TY-- Y-------FS *****KTS-F 464 Drosophila yakuba SNAQ*RRAL- -----V---L V--Y--Y-V- -YE---TY-- Y-------FN *****QAS-F 455 Plasmodium berghei YFY-NKDN-H E-Q---IE-- ---NSST-V- NIF-R-TMH- IW--YLITKG KEHQNID*** 400 Plasmodium falciparum YFYNNQNNLH E-EFS-IE-- --TRSYI--- NIF-R-TMN- NW--HLINKG QINQNID*** 395 Plasmodium vivax FFY-*N-KLH T-Q------- ---RSGT-V- NIF-R--MH- KW--SLI-KG GPDHNLD*** 404 Cryptosporidium hominis ***NIKDHLD --IISA-S-V -LLNGEY--- -KE-R---SV IWDCILSVMN DFKNDISRNF 428 Cryptosporidium parvum ***NIKDHLD --IISA-S-V -LLNGEY--- -KE-R---SV IWDCILSVMN DFKDDISRNF 428 * * * * * * Bos taurus NR****FCG* DKEK*ACEQP THWRI***** ********** ***AY***** ********** 429 Rattus norvegicus --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***--***** ********** 429 Mus musculus --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***--***** ********** 429 Homo sapiens --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***T-***** ********** 429 Pan troglodytes --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***T-***** ********** 429 Gallus gallus --****---* E---*N---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 438 Xenopus tropicalis --****---* ----*N---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 435 Danio rerio --****---* -V-Q*E---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 444 Oryzias latipes --****---* -A--*E---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 421 Takifugu rubripes --****---* -S--*E---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 386 Ciona intestinalis --****I-S* -EGSDD---- AK-K-***** ********** ***VWKSDSE IWD******* 434 Ciona savignyi --****I-A* -NA-DD---- AK-K-***** ********** ***VWNSDSE IWD******* 433 Caenorhabditis briggsae --****L-P* -NIP*D---- PK-K-***** ********** ***V-K**** ********** 424 Caenorhabditis elegans --****L-P* -T-P*T---- AK-K-***** ********** ***V-***** ********** 424 Anopheles gambiae -T****--KS E-DM*N--KN -V-P-***** ********** ***V-H**** ********** 451 Bombyx mori --****L-P* --G**N--K- SR-TV***** ********** ***VN***** ********** 405 Drosophila melanogaster -T****--K* ALGG*S-SRN AV-P-***** ********** ***VWADGDS DSEEDSDPY* 490 Drosophila pseudoobscura -T****I-K* VVGG*N-PRN AV-P-***** ********** ***VWDDDSD NDTPY***** 495 Drosophila yakuba -T****--K* ALGG*S-SRN AV-P-***** ********** ***VWADGDN DSGEDSDPY* 490 Plasmodium berghei ******L--* YSIN**NNEQ LKN-YKKIQY IYDHS*SIEK LNNI-NTYSE IDKKYIITLC 450 Plasmodium falciparum ******L-S* YHINDDND-D IKNSYKKIVH IFNHK*ALQK IKNI-DNYSD RDKKYINTIC 447 Plasmodium vivax ******L--* YSIS**TNHE LRKKYSDVQD AHLDEEALQK LRPL-MRLSQ KDRDFLRTIC 455 Cryptosporidium hominis -KCNEV---* KANE*KSSIC REHPD***** ********** ***RLPKFNI DAA******* 461 Cryptosporidium parvum -KCNEV---* KANE*KSSIC REHPD***** ********** ***RLPKFNI DAA******* 461 * 166
Résultats-Discussion : Annexe II __________________________________________________________________________________________ Bos taurus ********** ********** ****** 429 Rattus norvegicus ********** ********** ****** 429 Mus musculus ********** ********** ****** 429 Homo sapiens ********** ********** ****** 429 Pan troglodytes ********** ********** ****** 429 Gallus gallus ********** ********** ****** 438 Xenopus tropicalis ********** ********** ****** 435 Danio rerio ********** ********** ****** 444 Oryzias latipes ********** ********** ****** 421 Takifugu rubripes ********** ********** ****** 386 Ciona intestinalis ********** ********** ****** 434 Ciona savignyi ********** ********** ****** 433 Caenorhabditis briggsae ********** ********** ****** 424 Caenorhabditis elegans ********** ********** ****** 424 Anopheles gambiae ********** ********** ****** 451 Bombyx mori ********** ********** ****** 405 Drosophila melanogaster ********** ********** ****** 490 Drosophila pseudoobscura ********** ********** ****** 495 Drosophila yakuba ********** ********** ****** 490 Plasmodium berghei FGFPSHFPSN LSIYRKKYIP FA**** 472 Plasmodium falciparum YNFLSHFPNN RSIYRKEYIT NT**** 469 Plasmodium vivax YDFAHYYPQN VSIYRRGERR EEGRLM 481 Cryptosporidium hominis ********** ********** ****** 461 Cryptosporidium parvum ********** ********** ****** 461 167
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Résultats-Discussion : Annexe II<br />
__________________________________________________________________________________________<br />
Intron 8<br />
↓<br />
Bos taurus TWEE*LELYK DGGVAIVDQW ICAHARFFIG TSVSTFSFRI HEEREILGLD *****PKTTY 408<br />
Rattus norvegicus ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408<br />
Mus musculus ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408<br />
Homo sapiens ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408<br />
Pan troglodytes ----*----- ------I--- ---------- ---------- ---------- *****----- 408<br />
Gallus gallus ----*----- ---M-VI--- ------Y--- ---------- --------F- *****----- 417<br />
Xenopus tropicalis ----*----- ------I--- ------Y--- ---------- -------SFN *****----- 414<br />
Danio rerio SL-D*---L- ------I--- ---------- ---------- --------F- *****----- 423<br />
Oryzias latipes SR-D*---L- ------I--- --S------- ---------- --------F- *****----- 400<br />
Takifugu rubripes SI-D*---L- ------I--- ---------- ---------- --------F- *****----- 365<br />
Ciona intestinalis -KT-*KSEF- M-----I--I --S-----M- -KE------- Q-----MCFP *****KH--F 404<br />
Ciona savignyi SKA-*-NNF- M-----I--I L-S---Y-M- -KE------- Q-----MCFP *****KH--F 403<br />
Caenorhabditis briggsae RFTD*TQK-N --QI--I--Y L----AH--- SYE---T--- Q-D-----FP *****ISS-F 402<br />
Caenorhabditis elegans RFTD*TQKLN --QI--I--Y L----AY--- SYE---T--- Q-D---I-FP *****IS--F 403<br />
Anopheles gambiae SY-Q*RAEL- ---------I V-S---Y--- -YE---TY-- Y-----I-FP *****KDL-F 428<br />
Bombyx mori NIA-*VTEFD --TI--LE-I --S--A--V- -HE---T--- Q----L--FP *****SD--F 385<br />
Drosophila melanogaster SNVQ*RREL- -----V---L V--Y--Y-V- -YE---TY-- Y-------FT *****QAS-F 455<br />
Drosophila pseudoobscura SNLQ*RQKL- ---------L V-SY--Y--- -YE---TY-- Y-------FS *****KTS-F 464<br />
Drosophila yakuba SNAQ*RRAL- -----V---L V--Y--Y-V- -YE---TY-- Y-------FN *****QAS-F 455<br />
Plasmodium berghei YFY-NKDN-H E-Q---IE-- ---NSST-V- NIF-R-TMH- IW--YLITKG KEHQNID*** 400<br />
Plasmodium falciparum YFYNNQNNLH E-EFS-IE-- --TRSYI--- NIF-R-TMN- NW--HLINKG QINQNID*** 395<br />
Plasmodium vivax FFY-*N-KLH T-Q------- ---RSGT-V- NIF-R--MH- KW--SLI-KG GPDHNLD*** 404<br />
Cryptosporidium hominis ***NIKDHLD --IISA-S-V -LLNGEY--- -KE-R---SV IWDCILSVMN DFKNDISRNF 428<br />
Cryptosporidium parvum ***NIKDHLD --IISA-S-V -LLNGEY--- -KE-R---SV IWDCILSVMN DFKDDISRNF 428<br />
* * * * * *<br />
Bos taurus NR****FCG* DKEK*ACEQP THWRI***** ********** ***AY***** ********** 429<br />
Rattus norvegicus --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***--***** ********** 429<br />
Mus musculus --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***--***** ********** 429<br />
Homo sapiens --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***T-***** ********** 429<br />
Pan troglodytes --****---* -Q--*----- ---K-***** ********** ***T-***** ********** 429<br />
Gallus gallus --****---* E---*N---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 438<br />
Xenopus tropicalis --****---* ----*N---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 435<br />
Danio rerio --****---* -V-Q*E---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 444<br />
Oryzias latipes --****---* -A--*E---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 421<br />
Takifugu rubripes --****---* -S--*E---- ---K-***** ********** ***V-***** ********** 386<br />
Ciona intestinalis --****I-S* -EGSDD---- AK-K-***** ********** ***VWKSDSE IWD******* 434<br />
Ciona savignyi --****I-A* -NA-DD---- AK-K-***** ********** ***VWNSDSE IWD******* 433<br />
Caenorhabditis briggsae --****L-P* -NIP*D---- PK-K-***** ********** ***V-K**** ********** 424<br />
Caenorhabditis elegans --****L-P* -T-P*T---- AK-K-***** ********** ***V-***** ********** 424<br />
Anopheles gambiae -T****--KS E-DM*N--KN -V-P-***** ********** ***V-H**** ********** 451<br />
Bombyx mori --****L-P* --G**N--K- SR-TV***** ********** ***VN***** ********** 405<br />
Drosophila melanogaster -T****--K* ALGG*S-SRN AV-P-***** ********** ***VWADGDS DSEEDSDPY* 490<br />
Drosophila pseudoobscura -T****I-K* VVGG*N-PRN AV-P-***** ********** ***VWDDDSD NDTPY***** 495<br />
Drosophila yakuba -T****--K* ALGG*S-SRN AV-P-***** ********** ***VWADGDN DSGEDSDPY* 490<br />
Plasmodium berghei ******L--* YSIN**NNEQ LKN-YKKIQY IYDHS*SIEK LNNI-NTYSE IDKKYIITLC 450<br />
Plasmodium falciparum ******L-S* YHINDDND-D IKNSYKKIVH IFNHK*ALQK IKNI-DNYSD RDKKYINTIC 447<br />
Plasmodium vivax ******L--* YSIS**TNHE LRKKYSDVQD AHLDEEALQK LRPL-MRLSQ KDRDFLRTIC 455<br />
Cryptosporidium hominis -KCNEV---* KANE*KSSIC REHPD***** ********** ***RLPKFNI DAA******* 461<br />
Cryptosporidium parvum -KCNEV---* KANE*KSSIC REHPD***** ********** ***RLPKFNI DAA******* 461<br />
*<br />
166