caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...

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Résultats-Discussion : Annexe II __________________________________________________________________________________________ Intron 1 ↓ Bos taurus *******PGQ SAADIL*SGA ********** ********AS RRRYLLYDVN PPEGFN**LR 59 Rattus norvegicus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Mus musculus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Homo sapiens *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Pan troglodytes *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Gallus gallus SLPTALRA-H A-TSLSAAA- ********** ********-P HT-------- ------**-- 68 Xenopus tropicalis *******--H --SSLQVGT- ********** ********-F E--------- ------**-- 65 Danio rerio *******A-- -MFSPV*AA- ********** ********SR DV-------- ------**-- 74 Oryzias latipes *******A-H KSTAPI*A*- ********** ********-K DL-------- ------**-- 50 Takifugu rubripes ********** ********** ********** ********** ***------- ------**-- 15 Ciona intestinalis ********** ********** ********** *******P-G NK------C- -G----**-- 49 Ciona savignyi *********V ********** ********** ********P- NK------C- -G----**-- 48 Caenorhabditis briggsae SHVDSNKYSI ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 56 Caenorhabditis elegans SRVDSNRYSV ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 57 Anopheles gambiae *****TSAHL RELCEKRDIF FEPYRCQLVD LDLLDDP*** *VL------- -S----**-- 68 Bombyx mori *******VSK DSCAETKNT* ********** ********S- DKKW-F---- ------**-- 57 Drosophila melanogaster GTAKREIGDS RGSSGTCVKG FLQEILPLPA TCPPEVLGMR GAV-I----- IS----**-- 87 Drosophila pseudoobscura NRTESHRTAV RSNSNVCKSR QFWQTIPLVD TCSPGILPLR GTV-I----- IS----**-- 92 Drosophila yakuba GTARPANGAS RGSSATCAKR VLQEILPLPE TCPPEVLGLR GTV-I----- IS----**-- 87 Plasmodium berghei *****SSL** **ICNKNDIY LNDKFY**** *******FLK KKK-I----- IG----YS-Q 64 Plasmodium falciparum *******L** **ICLKEDVY LGDFFF**** *******FLK -KK-IM---- IG----**-Q 62 Plasmodium vivax LDKDVSS-** **VCRTDDVY TGDAFY**** *******PFK KKK-V----H IG----**-Q 65 Cryptosporidium hominis NILNSWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DVCWII---K DG----**-Q 75 Cryptosporidium parvum NILNRWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DV-WII---K DG----**-Q 75 ** **** * Bos taurus RDVYIRIASL LKTLLKT*E* ***EW**VLV LPPWGRL*YH WQSPDIHQVR IPWSDFFDLP 111 Rattus norvegicus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Mus musculus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Homo sapiens ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Pan troglodytes ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Gallus gallus ---------- M-----S*-* ***N-**--- -------*-- ------L--- ----E----- 120 Xenopus tropicalis ------V--- ------S*S* ***N-**--- -------*-- ---------- ---AE----D 117 Danio rerio ------M-T- ----R-E*G* ***D-**--- -------*-- ----E---L- ---GE--SIT 126 Oryzias latipes ------M--- V---R-EGG* ***D-**--- -------*-- ---S--D-T- ---GE--SIT 103 Takifugu rubripes ------M--- V---T-DGD* ***D-**--- -------*-- ------Y-L- ---GE--S-T 68 Ciona intestinalis ----M-V-N- V-S-RESKSC KGDD-**--- ------IS-- -KEHGME-SL ----M--NVK 107 Ciona savignyi ----M---N- V-N-RERK-C KGDD-**--- ------IG-- -KER-LE-SM ----T----K 106 Caenorhabditis briggsae ----M-V-NT VRL-RESG-* ***N-**I-- -------*H- --***RM--A LS-RL----E 106 Caenorhabditis elegans ----M-V-NT VRS-RDSG-* ***NY**I-- -------*H- -K***RME-A LS-RL----E 107 Anopheles gambiae ------L-VF VQF-RTQRGY RR**T**R-- ----SS-*V- -R-GN-D-QQ LL-GN----- 123 Bombyx mori ----M-F-I- -SNEQ-RGKL KE**F**G-- ----YK-*-- -KT*TKKREP ---GN---IE 111 Drosophila melanogaster ------M-VF VRR-QRRRRF RH**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-SG L---H----A 142 Drosophila pseudoobscura ------L-VF VRR-RRRKRF QN**V**R-- ---FP--*-- -H-HHLK-ND VA-GH----D 147 Drosophila yakuba ------V-VF VRR-QRRRRF RQ**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-AG L---H----D 142 Plasmodium berghei KE-LY-MSLV IYQ-N-RDKE YI**Y**Y-- ----CY-*S- -*-*NKRHDN LQ-NI-LNMN 117 Plasmodium falciparum KEIFY-LSLV IYN-N-KDKI NI**Y**Y-- ----CYV*T- -NI**RKGNN LR-EF--NTD 115 Plasmodium vivax KE-LY-V-LA VYY-NQEERT HV**H**Y-- ----CYV*T- -GR*ERTNA- -K--I--N-K 119 Cryptosporidium hominis -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNENKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132 Cryptosporidium parvum -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNEDKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132 * * *** * * * * 162

Résultats-Discussion : Annexe II __________________________________________________________________________________________ Intron 2 ↓ Bos taurus SLNRNIPVIE YEQFIAESGG ********PF ***IDQVYIL QGY**TEGWK EG****AWEE 154 Rattus norvegicus ---K------ ---------- ********-- ***-----V- ---**A---- --****T--- 154 Mus musculus ---K------ ---------- ********-- ***-----V- ---**A---- --****T--- 154 Homo sapiens ---K------ ---------- ********-- ***-----V- -S-**A---- --****T--- 154 Pan troglodytes ---K------ ---------- ********-- ***-----V- -S-**A---- --****T--- 154 Gallus gallus ---K------ ----L----- ********-- ***-E-I-V- ---**E---- --****T--- 163 Xenopus tropicalis --YQ------ --D-L----- ********-- ***-E---V- ---**A---- --****T--- 160 Danio rerio --QA------ --E------- ********-- ***---ILV- -S-**A---T D-****K--- 169 Oryzias latipes --QA-V--V- --E----N-- ********-- ***----LV- -N-**A---T D-****K--- 146 Takifugu rubripes --QV-V---- --E----N-- ********-- ***----LV- -N-**A---T D-****K--- 111 Ciona intestinalis -MSGFV---- --DY-E-V-E ********AV ***--ELWY- -N-**A---S S-****T--- 150 Ciona savignyi ---EFV--M- --DY-E-I-E ********AS ***--ELWY- -N-**A---T S-****V--- 149 Caenorhabditis briggsae ----F---M- F-D-LD-NRP ********** ***----IY- -H-**E---G T*****EYVR 146 Caenorhabditis elegans ----F----- F-D-LD-NRP ********** ***----IY- -H-**A---G T*****EYVR 147 Anopheles gambiae -MRLYTD-LD MDE-F--Y-R LHGPGATTVV ***L-E--K- KHF**EQMFE N-****VFVD 174 Bombyx mori --KSFA--V- LYEIFEK-LQ KQ******LI ***--TI-V- -N-**DNPFE N-****LF-D 156 Drosophila melanogaster --R-YA--LD --E-L--QRL F-NPGAPLVH ***VGHAFR- -H-**EVMLE Q-****IFRD 193 Drosophila pseudoobscura --R-YA--LD -SE-L--YRM F-MPAPPYVH ***-S--FR- MH-**EIMLE Q-****IFRD 198 Drosophila yakuba --R-YA--LD -DE-L--QRI F-NPGAPLVH ***VAHAFR- -H-**KVMLE H-****IFRD 193 Plasmodium berghei IIKNV--I-- FSDYKKLY-* *D******VT DFI-SFK-L- DSNAQKA*** ********** 156 Plasmodium falciparum IMKKV--I-- --EYEKLY-* *N******YS DIM-NSK--- DN-**K-*** ********** 152 Plasmodium vivax A-QNV---M- -AEYEGQF-* *P******HT DYILSYRH-I ********** **GEWPK*** 156 Cryptosporidium hominis **QNGL-TL- -DIYKRLT-I ********VN ***-GAEVVG LNF**DWNN- SL****QSST 173 Cryptosporidium parvum **QNGL-TL- -DIYKRLT-I ********VN ***-GAEVVG LNF**DWNN- SF****QSST 173 Bos taurus KIDSR***** **PCIE**** PPL**YS*** ********** ********** ********** 168 Rattus norvegicus -V-E-***** **---D**** -L-**--*** ********** ********** ********** 168 Mus musculus -V-A-***** **---D**** -L-**--*** ********** ********** ********** 168 Homo sapiens -V-E-***** **---D**** QL-**--*** ********** ********** ********** 168 Pan troglodytes -V-E-***** **---D**** QL-**--*** ********** ********** ********** 168 Gallus gallus ---E-***** **---D**** QLM**--*** ********** ********** ********** 177 Xenopus tropicalis -V-Q-***** **---D**** QLM**--*** ********** ********** ********** 174 Danio rerio -V-D-***** **----**** KLM**--*** ********** ********** ********** 183 Oryzias latipes ---E-***** **--FD**** KLM**--*** ********** ********** ********** 160 Takifugu rubripes -V-K-***** **----**** KLI**--*** ********** ********** ********** 125 Ciona intestinalis -MHE-***** **D---**** N-V**-E*** ********** ********** ********** 164 Ciona savignyi -MHE-***** **D--D**** S-V**-E*** ********** ********** ********** 163 Caenorhabditis briggsae -F-E-***** **R-LP**** -ADSH-R*** ********** ********** ********** 162 Caenorhabditis elegans -FEK-***** **S-LP**** -AESH-K*** ********** ********** ********** 163 Anopheles gambiae -FEEH***** **V-PKGHDG ALA******* ********** ********** ********** 190 Bombyx mori -WEVQ***** **EECP**** ********** ********** ********** ********** 165 Drosophila melanogaster -FERV***** **TDKP**** CSEGSL-G** ********** ********** ********** 210 Drosophila pseudoobscura -YERV***** **APKLDNNS CNEYSTAG** ********** ********** ********** 219 Drosophila yakuba -FERV***** **TDKP**** CSEGSL-G** ********** ********** ********** 210 Plasmodium berghei ****KYYHVL PFDKCYIEDY KFKIVC*KNC DYKYSVTYSG NCTNIKGKNT LCYSDYIVTN 211 Plasmodium falciparum ****KSFLIL PFEECNINVN RFKQFC*KKC EHKYNVLYSG YCTTINTKQS ECYSYNMISN 207 Plasmodium vivax RG-KKSFQVL KLDKCQVKGY KLKKNLRKNC DHKYSVEYSG KCTNVKGKKM ECLEFFFITS 216 Cryptosporidium hominis SIEYY***** **NSFK**** ISESRHLNSK CF******** ********** ********** 187 Cryptosporidium parvum SIEYY***** **NSF-**** ISESRHLNSK CF******** ********** ********** 187 163

Résultats-Discussion : Annexe II<br />

__________________________________________________________________________________________<br />

Intron 1<br />

↓<br />

Bos taurus *******PGQ SAADIL*SGA ********** ********AS RRRYLLYDVN PPEGFN**LR 59<br />

Rattus norvegicus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />

Mus musculus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />

Homo sapiens *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />

Pan troglodytes *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />

Gallus gallus SLPTALRA-H A-TSLSAAA- ********** ********-P HT-------- ------**-- 68<br />

Xenopus tropicalis *******--H --SSLQVGT- ********** ********-F E--------- ------**-- 65<br />

Danio rerio *******A-- -MFSPV*AA- ********** ********SR DV-------- ------**-- 74<br />

Oryzias latipes *******A-H KSTAPI*A*- ********** ********-K DL-------- ------**-- 50<br />

Takifugu rubripes ********** ********** ********** ********** ***------- ------**-- 15<br />

Ciona intestinalis ********** ********** ********** *******P-G NK------C- -G----**-- 49<br />

Ciona savignyi *********V ********** ********** ********P- NK------C- -G----**-- 48<br />

Caenorhabditis briggsae SHVDSNKYSI ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 56<br />

Caenorhabditis elegans SRVDSNRYSV ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 57<br />

Anopheles gambiae *****TSAHL RELCEKRDIF FEPYRCQLVD LDLLDDP*** *VL------- -S----**-- 68<br />

Bombyx mori *******VSK DSCAETKNT* ********** ********S- DKKW-F---- ------**-- 57<br />

Drosophila melanogaster GTAKREIGDS RGSSGTCVKG FLQEILPLPA TCPPEVLGMR GAV-I----- IS----**-- 87<br />

Drosophila pseudoobscura NRTESHRTAV RSNSNVCKSR QFWQTIPLVD TCSPGILPLR GTV-I----- IS----**-- 92<br />

Drosophila yakuba GTARPANGAS RGSSATCAKR VLQEILPLPE TCPPEVLGLR GTV-I----- IS----**-- 87<br />

Plasmodium berghei *****SSL** **ICNKNDIY LNDKFY**** *******FLK KKK-I----- IG----YS-Q 64<br />

Plasmodium falciparum *******L** **ICLKEDVY LGDFFF**** *******FLK -KK-IM---- IG----**-Q 62<br />

Plasmodium vivax LDKDVSS-** **VCRTDDVY TGDAFY**** *******PFK KKK-V----H IG----**-Q 65<br />

Cryptosporidium hominis NILNSWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DVCWII---K DG----**-Q 75<br />

Cryptosporidium parvum NILNRWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DV-WII---K DG----**-Q 75<br />

** **** *<br />

Bos taurus RDVYIRIASL LKTLLKT*E* ***EW**VLV LPPWGRL*YH WQSPDIHQVR IPWSDFFDLP 111<br />

Rattus norvegicus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />

Mus musculus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />

Homo sapiens ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />

Pan troglodytes ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />

Gallus gallus ---------- M-----S*-* ***N-**--- -------*-- ------L--- ----E----- 120<br />

Xenopus tropicalis ------V--- ------S*S* ***N-**--- -------*-- ---------- ---AE----D 117<br />

Danio rerio ------M-T- ----R-E*G* ***D-**--- -------*-- ----E---L- ---GE--SIT 126<br />

Oryzias latipes ------M--- V---R-EGG* ***D-**--- -------*-- ---S--D-T- ---GE--SIT 103<br />

Takifugu rubripes ------M--- V---T-DGD* ***D-**--- -------*-- ------Y-L- ---GE--S-T 68<br />

Ciona intestinalis ----M-V-N- V-S-RESKSC KGDD-**--- ------IS-- -KEHGME-SL ----M--NVK 107<br />

Ciona savignyi ----M---N- V-N-RERK-C KGDD-**--- ------IG-- -KER-LE-SM ----T----K 106<br />

Caenorhabditis briggsae ----M-V-NT VRL-RESG-* ***N-**I-- -------*H- --***RM--A LS-RL----E 106<br />

Caenorhabditis elegans ----M-V-NT VRS-RDSG-* ***NY**I-- -------*H- -K***RME-A LS-RL----E 107<br />

Anopheles gambiae ------L-VF VQF-RTQRGY RR**T**R-- ----SS-*V- -R-GN-D-QQ LL-GN----- 123<br />

Bombyx mori ----M-F-I- -SNEQ-RGKL KE**F**G-- ----YK-*-- -KT*TKKREP ---GN---IE 111<br />

Drosophila melanogaster ------M-VF VRR-QRRRRF RH**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-SG L---H----A 142<br />

Drosophila pseudoobscura ------L-VF VRR-RRRKRF QN**V**R-- ---FP--*-- -H-HHLK-ND VA-GH----D 147<br />

Drosophila yakuba ------V-VF VRR-QRRRRF RQ**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-AG L---H----D 142<br />

Plasmodium berghei KE-LY-MSLV IYQ-N-RDKE YI**Y**Y-- ----CY-*S- -*-*NKRHDN LQ-NI-LNMN 117<br />

Plasmodium falciparum KEIFY-LSLV IYN-N-KDKI NI**Y**Y-- ----CYV*T- -NI**RKGNN LR-EF--NTD 115<br />

Plasmodium vivax KE-LY-V-LA VYY-NQEERT HV**H**Y-- ----CYV*T- -GR*ERTNA- -K--I--N-K 119<br />

Cryptosporidium hominis -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNENKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132<br />

Cryptosporidium parvum -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNEDKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132<br />

* * *** * * * *<br />

162

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