caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ... caractérisation des enzymes bovines et étude préliminaire du rôle ...
Résultats-Discussion : Annexe II __________________________________________________________________________________________ Intron 1 ↓ Bos taurus *******PGQ SAADIL*SGA ********** ********AS RRRYLLYDVN PPEGFN**LR 59 Rattus norvegicus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Mus musculus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Homo sapiens *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Pan troglodytes *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59 Gallus gallus SLPTALRA-H A-TSLSAAA- ********** ********-P HT-------- ------**-- 68 Xenopus tropicalis *******--H --SSLQVGT- ********** ********-F E--------- ------**-- 65 Danio rerio *******A-- -MFSPV*AA- ********** ********SR DV-------- ------**-- 74 Oryzias latipes *******A-H KSTAPI*A*- ********** ********-K DL-------- ------**-- 50 Takifugu rubripes ********** ********** ********** ********** ***------- ------**-- 15 Ciona intestinalis ********** ********** ********** *******P-G NK------C- -G----**-- 49 Ciona savignyi *********V ********** ********** ********P- NK------C- -G----**-- 48 Caenorhabditis briggsae SHVDSNKYSI ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 56 Caenorhabditis elegans SRVDSNRYSV ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 57 Anopheles gambiae *****TSAHL RELCEKRDIF FEPYRCQLVD LDLLDDP*** *VL------- -S----**-- 68 Bombyx mori *******VSK DSCAETKNT* ********** ********S- DKKW-F---- ------**-- 57 Drosophila melanogaster GTAKREIGDS RGSSGTCVKG FLQEILPLPA TCPPEVLGMR GAV-I----- IS----**-- 87 Drosophila pseudoobscura NRTESHRTAV RSNSNVCKSR QFWQTIPLVD TCSPGILPLR GTV-I----- IS----**-- 92 Drosophila yakuba GTARPANGAS RGSSATCAKR VLQEILPLPE TCPPEVLGLR GTV-I----- IS----**-- 87 Plasmodium berghei *****SSL** **ICNKNDIY LNDKFY**** *******FLK KKK-I----- IG----YS-Q 64 Plasmodium falciparum *******L** **ICLKEDVY LGDFFF**** *******FLK -KK-IM---- IG----**-Q 62 Plasmodium vivax LDKDVSS-** **VCRTDDVY TGDAFY**** *******PFK KKK-V----H IG----**-Q 65 Cryptosporidium hominis NILNSWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DVCWII---K DG----**-Q 75 Cryptosporidium parvum NILNRWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DV-WII---K DG----**-Q 75 ** **** * Bos taurus RDVYIRIASL LKTLLKT*E* ***EW**VLV LPPWGRL*YH WQSPDIHQVR IPWSDFFDLP 111 Rattus norvegicus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Mus musculus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Homo sapiens ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Pan troglodytes ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111 Gallus gallus ---------- M-----S*-* ***N-**--- -------*-- ------L--- ----E----- 120 Xenopus tropicalis ------V--- ------S*S* ***N-**--- -------*-- ---------- ---AE----D 117 Danio rerio ------M-T- ----R-E*G* ***D-**--- -------*-- ----E---L- ---GE--SIT 126 Oryzias latipes ------M--- V---R-EGG* ***D-**--- -------*-- ---S--D-T- ---GE--SIT 103 Takifugu rubripes ------M--- V---T-DGD* ***D-**--- -------*-- ------Y-L- ---GE--S-T 68 Ciona intestinalis ----M-V-N- V-S-RESKSC KGDD-**--- ------IS-- -KEHGME-SL ----M--NVK 107 Ciona savignyi ----M---N- V-N-RERK-C KGDD-**--- ------IG-- -KER-LE-SM ----T----K 106 Caenorhabditis briggsae ----M-V-NT VRL-RESG-* ***N-**I-- -------*H- --***RM--A LS-RL----E 106 Caenorhabditis elegans ----M-V-NT VRS-RDSG-* ***NY**I-- -------*H- -K***RME-A LS-RL----E 107 Anopheles gambiae ------L-VF VQF-RTQRGY RR**T**R-- ----SS-*V- -R-GN-D-QQ LL-GN----- 123 Bombyx mori ----M-F-I- -SNEQ-RGKL KE**F**G-- ----YK-*-- -KT*TKKREP ---GN---IE 111 Drosophila melanogaster ------M-VF VRR-QRRRRF RH**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-SG L---H----A 142 Drosophila pseudoobscura ------L-VF VRR-RRRKRF QN**V**R-- ---FP--*-- -H-HHLK-ND VA-GH----D 147 Drosophila yakuba ------V-VF VRR-QRRRRF RQ**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-AG L---H----D 142 Plasmodium berghei KE-LY-MSLV IYQ-N-RDKE YI**Y**Y-- ----CY-*S- -*-*NKRHDN LQ-NI-LNMN 117 Plasmodium falciparum KEIFY-LSLV IYN-N-KDKI NI**Y**Y-- ----CYV*T- -NI**RKGNN LR-EF--NTD 115 Plasmodium vivax KE-LY-V-LA VYY-NQEERT HV**H**Y-- ----CYV*T- -GR*ERTNA- -K--I--N-K 119 Cryptosporidium hominis -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNENKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132 Cryptosporidium parvum -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNEDKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132 * * *** * * * * 162
Résultats-Discussion : Annexe II __________________________________________________________________________________________ Intron 2 ↓ Bos taurus SLNRNIPVIE YEQFIAESGG ********PF ***IDQVYIL QGY**TEGWK EG****AWEE 154 Rattus norvegicus ---K------ ---------- ********-- ***-----V- ---**A---- --****T--- 154 Mus musculus ---K------ ---------- ********-- ***-----V- ---**A---- --****T--- 154 Homo sapiens ---K------ ---------- ********-- ***-----V- -S-**A---- --****T--- 154 Pan troglodytes ---K------ ---------- ********-- ***-----V- -S-**A---- --****T--- 154 Gallus gallus ---K------ ----L----- ********-- ***-E-I-V- ---**E---- --****T--- 163 Xenopus tropicalis --YQ------ --D-L----- ********-- ***-E---V- ---**A---- --****T--- 160 Danio rerio --QA------ --E------- ********-- ***---ILV- -S-**A---T D-****K--- 169 Oryzias latipes --QA-V--V- --E----N-- ********-- ***----LV- -N-**A---T D-****K--- 146 Takifugu rubripes --QV-V---- --E----N-- ********-- ***----LV- -N-**A---T D-****K--- 111 Ciona intestinalis -MSGFV---- --DY-E-V-E ********AV ***--ELWY- -N-**A---S S-****T--- 150 Ciona savignyi ---EFV--M- --DY-E-I-E ********AS ***--ELWY- -N-**A---T S-****V--- 149 Caenorhabditis briggsae ----F---M- F-D-LD-NRP ********** ***----IY- -H-**E---G T*****EYVR 146 Caenorhabditis elegans ----F----- F-D-LD-NRP ********** ***----IY- -H-**A---G T*****EYVR 147 Anopheles gambiae -MRLYTD-LD MDE-F--Y-R LHGPGATTVV ***L-E--K- KHF**EQMFE N-****VFVD 174 Bombyx mori --KSFA--V- LYEIFEK-LQ KQ******LI ***--TI-V- -N-**DNPFE N-****LF-D 156 Drosophila melanogaster --R-YA--LD --E-L--QRL F-NPGAPLVH ***VGHAFR- -H-**EVMLE Q-****IFRD 193 Drosophila pseudoobscura --R-YA--LD -SE-L--YRM F-MPAPPYVH ***-S--FR- MH-**EIMLE Q-****IFRD 198 Drosophila yakuba --R-YA--LD -DE-L--QRI F-NPGAPLVH ***VAHAFR- -H-**KVMLE H-****IFRD 193 Plasmodium berghei IIKNV--I-- FSDYKKLY-* *D******VT DFI-SFK-L- DSNAQKA*** ********** 156 Plasmodium falciparum IMKKV--I-- --EYEKLY-* *N******YS DIM-NSK--- DN-**K-*** ********** 152 Plasmodium vivax A-QNV---M- -AEYEGQF-* *P******HT DYILSYRH-I ********** **GEWPK*** 156 Cryptosporidium hominis **QNGL-TL- -DIYKRLT-I ********VN ***-GAEVVG LNF**DWNN- SL****QSST 173 Cryptosporidium parvum **QNGL-TL- -DIYKRLT-I ********VN ***-GAEVVG LNF**DWNN- SF****QSST 173 Bos taurus KIDSR***** **PCIE**** PPL**YS*** ********** ********** ********** 168 Rattus norvegicus -V-E-***** **---D**** -L-**--*** ********** ********** ********** 168 Mus musculus -V-A-***** **---D**** -L-**--*** ********** ********** ********** 168 Homo sapiens -V-E-***** **---D**** QL-**--*** ********** ********** ********** 168 Pan troglodytes -V-E-***** **---D**** QL-**--*** ********** ********** ********** 168 Gallus gallus ---E-***** **---D**** QLM**--*** ********** ********** ********** 177 Xenopus tropicalis -V-Q-***** **---D**** QLM**--*** ********** ********** ********** 174 Danio rerio -V-D-***** **----**** KLM**--*** ********** ********** ********** 183 Oryzias latipes ---E-***** **--FD**** KLM**--*** ********** ********** ********** 160 Takifugu rubripes -V-K-***** **----**** KLI**--*** ********** ********** ********** 125 Ciona intestinalis -MHE-***** **D---**** N-V**-E*** ********** ********** ********** 164 Ciona savignyi -MHE-***** **D--D**** S-V**-E*** ********** ********** ********** 163 Caenorhabditis briggsae -F-E-***** **R-LP**** -ADSH-R*** ********** ********** ********** 162 Caenorhabditis elegans -FEK-***** **S-LP**** -AESH-K*** ********** ********** ********** 163 Anopheles gambiae -FEEH***** **V-PKGHDG ALA******* ********** ********** ********** 190 Bombyx mori -WEVQ***** **EECP**** ********** ********** ********** ********** 165 Drosophila melanogaster -FERV***** **TDKP**** CSEGSL-G** ********** ********** ********** 210 Drosophila pseudoobscura -YERV***** **APKLDNNS CNEYSTAG** ********** ********** ********** 219 Drosophila yakuba -FERV***** **TDKP**** CSEGSL-G** ********** ********** ********** 210 Plasmodium berghei ****KYYHVL PFDKCYIEDY KFKIVC*KNC DYKYSVTYSG NCTNIKGKNT LCYSDYIVTN 211 Plasmodium falciparum ****KSFLIL PFEECNINVN RFKQFC*KKC EHKYNVLYSG YCTTINTKQS ECYSYNMISN 207 Plasmodium vivax RG-KKSFQVL KLDKCQVKGY KLKKNLRKNC DHKYSVEYSG KCTNVKGKKM ECLEFFFITS 216 Cryptosporidium hominis SIEYY***** **NSFK**** ISESRHLNSK CF******** ********** ********** 187 Cryptosporidium parvum SIEYY***** **NSF-**** ISESRHLNSK CF******** ********** ********** 187 163
- Page 141 and 142: Exposé bibliographique : Effecteur
- Page 143 and 144: Exposé bibliographique : Effecteur
- Page 145 and 146: Exposé bibliographique : La myogen
- Page 147 and 148: Résultats-Discussion 117
- Page 149 and 150: Cette nouvelle partie concerne les
- Page 151 and 152: 1 Evolution des gènes de O- fucosy
- Page 153 and 154: Afin d’examiner le lien entre la
- Page 155 and 156: 1.1 Publication 1 Molecular evoluti
- Page 157 and 158: Tables in supplementary data Table
- Page 159 and 160: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 161 and 162: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 163 and 164: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 165 and 166: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 167 and 168: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 169 and 170: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 171 and 172: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 173 and 174: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 175 and 176: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 177 and 178: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 179 and 180: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 181 and 182: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 183 and 184: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 185 and 186: Résultats-Discussion : Annexe I __
- Page 187 and 188: Résultats-Discussion : Annexe I __
- Page 189 and 190: Résultats-Discussion : Annexe I __
- Page 191: Résultats-Discussion : Annexe II _
- Page 195 and 196: Résultats-Discussion : Annexe II _
- Page 197 and 198: Résultats-Discussion : Annexe II _
- Page 199 and 200: 2 Conservation des sites de N- glyc
- Page 201 and 202: Lors de notre précédente étude,
- Page 203 and 204: 2.1 Publication 2 The two N-glycans
- Page 205 and 206: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 207 and 208: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 209 and 210: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 211 and 212: Résultats-Discussion : Résultats
- Page 213 and 214: 3 Pofut1 : un rôle dans la différ
- Page 215 and 216: Les cellules satellites sont consid
- Page 217 and 218: Résultats-Discussion : Mise en pla
- Page 219 and 220: Résultats-Discussion : Mise en pla
- Page 221 and 222: Résultats-Discussion : Mise en pla
- Page 223 and 224: Résultats-Discussion : Mise en pla
- Page 225 and 226: Résultats-Discussion : Mise en pla
- Page 227 and 228: Résultats-Discussion : Mise en pla
- Page 229 and 230: Résultats-Discussion : Etude du r
- Page 231 and 232: Résultats-Discussion : Etude du r
- Page 233 and 234: Résultats-Discussion : Etude du r
- Page 235 and 236: Résultats-Discussion : Etude du r
- Page 237 and 238: Résultats-Discussion : Etude du r
- Page 239 and 240: Résultats-Discussion : Etude du r
- Page 241 and 242: Figure 73 : Analyse en RT-PCR semi-
Résultats-Discussion : Annexe II<br />
__________________________________________________________________________________________<br />
Intron 1<br />
↓<br />
Bos taurus *******PGQ SAADIL*SGA ********** ********AS RRRYLLYDVN PPEGFN**LR 59<br />
Rattus norvegicus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />
Mus musculus *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />
Homo sapiens *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />
Pan troglodytes *******--- ------*--- ********** ********-- ---------- ------**-- 59<br />
Gallus gallus SLPTALRA-H A-TSLSAAA- ********** ********-P HT-------- ------**-- 68<br />
Xenopus tropicalis *******--H --SSLQVGT- ********** ********-F E--------- ------**-- 65<br />
Danio rerio *******A-- -MFSPV*AA- ********** ********SR DV-------- ------**-- 74<br />
Oryzias latipes *******A-H KSTAPI*A*- ********** ********-K DL-------- ------**-- 50<br />
Takifugu rubripes ********** ********** ********** ********** ***------- ------**-- 15<br />
Ciona intestinalis ********** ********** ********** *******P-G NK------C- -G----**-- 49<br />
Ciona savignyi *********V ********** ********** ********P- NK------C- -G----**-- 48<br />
Caenorhabditis briggsae SHVDSNKYSI ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 56<br />
Caenorhabditis elegans SRVDSNRYSV ********** ********** ********-A EKKF------ FG----**-- 57<br />
Anopheles gambiae *****TSAHL RELCEKRDIF FEPYRCQLVD LDLLDDP*** *VL------- -S----**-- 68<br />
Bombyx mori *******VSK DSCAETKNT* ********** ********S- DKKW-F---- ------**-- 57<br />
Drosophila melanogaster GTAKREIGDS RGSSGTCVKG FLQEILPLPA TCPPEVLGMR GAV-I----- IS----**-- 87<br />
Drosophila pseudoobscura NRTESHRTAV RSNSNVCKSR QFWQTIPLVD TCSPGILPLR GTV-I----- IS----**-- 92<br />
Drosophila yakuba GTARPANGAS RGSSATCAKR VLQEILPLPE TCPPEVLGLR GTV-I----- IS----**-- 87<br />
Plasmodium berghei *****SSL** **ICNKNDIY LNDKFY**** *******FLK KKK-I----- IG----YS-Q 64<br />
Plasmodium falciparum *******L** **ICLKEDVY LGDFFF**** *******FLK -KK-IM---- IG----**-Q 62<br />
Plasmodium vivax LDKDVSS-** **VCRTDDVY TGDAFY**** *******PFK KKK-V----H IG----**-Q 65<br />
Cryptosporidium hominis NILNSWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DVCWII---K DG----**-Q 75<br />
Cryptosporidium parvum NILNRWDLR- GMENKCPNWV V********* ********** DV-WII---K DG----**-Q 75<br />
** **** *<br />
Bos taurus RDVYIRIASL LKTLLKT*E* ***EW**VLV LPPWGRL*YH WQSPDIHQVR IPWSDFFDLP 111<br />
Rattus norvegicus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />
Mus musculus ------V--- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />
Homo sapiens ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />
Pan troglodytes ---------- -------*-* ***--**--- -------*-- ---------- ----E----- 111<br />
Gallus gallus ---------- M-----S*-* ***N-**--- -------*-- ------L--- ----E----- 120<br />
Xenopus tropicalis ------V--- ------S*S* ***N-**--- -------*-- ---------- ---AE----D 117<br />
Danio rerio ------M-T- ----R-E*G* ***D-**--- -------*-- ----E---L- ---GE--SIT 126<br />
Oryzias latipes ------M--- V---R-EGG* ***D-**--- -------*-- ---S--D-T- ---GE--SIT 103<br />
Takifugu rubripes ------M--- V---T-DGD* ***D-**--- -------*-- ------Y-L- ---GE--S-T 68<br />
Ciona intestinalis ----M-V-N- V-S-RESKSC KGDD-**--- ------IS-- -KEHGME-SL ----M--NVK 107<br />
Ciona savignyi ----M---N- V-N-RERK-C KGDD-**--- ------IG-- -KER-LE-SM ----T----K 106<br />
Caenorhabditis briggsae ----M-V-NT VRL-RESG-* ***N-**I-- -------*H- --***RM--A LS-RL----E 106<br />
Caenorhabditis elegans ----M-V-NT VRS-RDSG-* ***NY**I-- -------*H- -K***RME-A LS-RL----E 107<br />
Anopheles gambiae ------L-VF VQF-RTQRGY RR**T**R-- ----SS-*V- -R-GN-D-QQ LL-GN----- 123<br />
Bombyx mori ----M-F-I- -SNEQ-RGKL KE**F**G-- ----YK-*-- -KT*TKKREP ---GN---IE 111<br />
Drosophila melanogaster ------M-VF VRR-QRRRRF RH**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-SG L---H----A 142<br />
Drosophila pseudoobscura ------L-VF VRR-RRRKRF QN**V**R-- ---FP--*-- -H-HHLK-ND VA-GH----D 147<br />
Drosophila yakuba ------V-VF VRR-QRRRRF RQ**V**R-- ----P--*-- -H-QGLQ-AG L---H----D 142<br />
Plasmodium berghei KE-LY-MSLV IYQ-N-RDKE YI**Y**Y-- ----CY-*S- -*-*NKRHDN LQ-NI-LNMN 117<br />
Plasmodium falciparum KEIFY-LSLV IYN-N-KDKI NI**Y**Y-- ----CYV*T- -NI**RKGNN LR-EF--NTD 115<br />
Plasmodium vivax KE-LY-V-LA VYY-NQEERT HV**H**Y-- ----CYV*T- -GR*ERTNA- -K--I--N-K 119<br />
Cryptosporidium hominis -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNENKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132<br />
Cryptosporidium parvum -N-FD-M-LV VSS-NEIMYK KNEDKFA--I ---FCNI*A- -TY*NSKR*- L---T--SIK 132<br />
* * *** * * * *<br />
162